BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G20440.2
Length=3178
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg905049 jgi|Araly1|905049|Al_scaffold_0003_2177 4449 0.0
Ahg951859 jgi|Araly1|951859|scaffold_21900003.1 1808 0.0
> Ahg905049 jgi|Araly1|905049|Al_scaffold_0003_2177
Length=2712
Score = 4449 bits (2409), Expect = 0.0
Identities = 2619/2718 (96%), Gaps = 24/2718 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 73 ATGGTGTCCCTCTCTAATCAAACCAGATTCTCTTTCCACCCAAACAATCTTGTCGTTTCC 132
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||
Sbjct 1 ATGGTTTCCCTCTCTAATCAAACCAGATTCTCTTTCCACCCAAACAACCTTTTCCTTTCC 60
Query 133 GAGAA-ACGGCGCCTGGGAATCTCAGGAGTCAATTTTCCCAGGAAGATCAAGT-TGAAAA 190
||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||
Sbjct 61 GAGAATA-GGCGTCTGGGAATCTCAGGAGTCAATTTTCCCAGGAAAATCAA-TGTGAAAA 118
Query 191 TCACTTGCTTCGCCGCCGAGAGACCACGCCAGGAGAAACAGAAAAAGAAGAGTCAGAGCC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 TCACTTGCTTCGCCGCCGAGAGACCACGCCAGGAGAAACAGAAAAAGAAGAGTCAGAGCC 178
Query 251 AGAGCACTAGCGACGCTGAGGCTGGAGTTGACCCTGTTGGGTTTCTCACCAGACTCGGAA 310
|||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 179 AGAGCACTAGTGACGCTGAAGCTGGAGTCGACCCAGTTGGGTTTCTCACCAGACTGGGAA 238
Query 311 TTGCTGACAGAATCTTTGCTCAATTTCTCCGGGAAAGGCATAAAGCTTTGAAAGACCTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 TTGCTGACAGAATCTTTGCTCAATTTCTCCGAGAAAGGCATAAAGCTTTGAAAGACCTTA 298
Query 371 AAGATGAGATTTTCAAACGCCATTTCGATTTCAGAGATTTTGCTTCAGGATTTGAGTTA- 429
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 299 AAGATGAGATTCTCAAACGCCACTTCGATTTCAGAGATCTTGCTTCAGGATTTGAGTTAC 358
Query 430 TTGGGGATGCATCGACATATGGAACACCGGGTTGACTTTATGGACTGGGGTCCAGGTTCT 489
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 359 TT-GGGATGCATCGACATATGGAACACCGGGTTGACTTCATGGACTGGGGTCCAGGTGCT 417
Query 490 CGTTATGGGGCTATAATCGGAGATTTCAATGGATGGTCGCCTACAGAAAATGCAGCTAGA 549
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||
Sbjct 418 CGTTATGGTGCTATAATCGGAGATTTTAATGGATGGTCACCTACAGAAAATTCAGCCAGA 477
Query 550 GAGGGCCTATTTGGCCATGATGATTATGGGTATTGGTTCATTATTCTTGAAGATAAGTTA 609
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 478 GAGGGCCTATTTGGCCATGATGATTTTGGGTATTGGTTCATTATTCTTGAGGATAAGTTA 537
Query 610 AGAGAGGGTGAAGAACCAGATGAACTATACTTTCAGCAGTATAACTATGTCGATGACTAT 669
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 AGAGAGGGTGAAGAACCAGACGAACTATACTTCCAGCAGTATAACTATGTCGATGACTAT 597
Query 670 GATAAGGGTGATAGTGGTGTATCAGCTGAAGAAATCTTCCAGAAAGCTAATGATGAGTAT 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 GATAAGGGTGATAGTGGTGTATCAGCTGAAGAAATCTTCCAGAAAGCTAATGATGAGTAT 657
Query 730 TGGGAACCTGGTGAGGATCGGTTTATTAAAAACCGCTTTGAAGTTCCTGCCAAACTATAC 789
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TGGGAACCTGGTGAGGACCGGTTTATTAAAAACCGCTTTGAAGTTCCTGCCAAACTATAC 717
Query 790 GAGCAGATGTTTGGCCCGAACAGTCCACAAACGTTAGAAGAGCTT-GGAGATATACCAGA 848
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 718 GAGCAGATGTTTGGCCCGAACAGTCCACAAACTTTAGAAGAG-TTAGGAGATATACCAGA 776
Query 849 TGCAGAAACGAGATATAAACAGTGGAAAGAGGAGCATAAAGATGACCCGCCAAGTAATCT 908
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 777 TGCAGAAACGAGATATAAACAGTGGAAAGAGGAGCATAAAAATGATCCGCCAAGTAATCT 836
Query 909 ACCTCCATGCGACATCATTGATAAAGGTCAAGGAAAGCCATATGATATTTTTAATGTCGT 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 ACCTCCATGCGACATCATTGATAAAGGTCAAGGAAAGCCATATGATATTTTTAATGTCGT 896
Query 969 GACATCTCCAGAATGGACAAAGAAATTTTATGAGAAAGAACCTCCGATTCCATATTGGTT 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 897 GACATCTCCAGAATGGACAAAGAAATTTTATGAGAAAAAACCTCCAATTCCATATTGGTT 956
Query 1029 AGAGACACGTAAAGGAAGAAAGGCATGGTTGCAAAAATATATTCCAGCTGTTCCACATGG 1088
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 957 AGAGACACGTAAAGGAAGAAAGGCATGGTTAAAAAAATACATTCCAGCTGTTCCACATGG 1016
Query 1089 AAGCAAGTATAGATTGTATTTCAATACTCCTGATGGACCGCTTGAACGAGTGCCTGCTTG 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 AAGCAAGTATAGATTGTATTTCAATACTCCTGATGGACCGCTTGAACGAGTGCCTGCTTG 1076
Query 1149 GGCTACATATGTGCAACCAGAGGATGAAGGAAAGCAAGCTTACGCAATTCATTGGGAACC 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1077 GGCTACATATGTGCAACCAGAGGATGAAGGAAAGCAAGCTTACGCAATTCACTGGGAACC 1136
Query 1209 TTCTCCTGAAGCTGCATACAAGTGGAAATATTCCAAGCCAAAAGTTCC-AGAGTCCTTGC 1267
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1137 TTCTCCTGAAGCTGCATACAAGTGGAAAAACTCCAAGCCAAAAGTTCCCA-AGTCCTTGC 1195
Query 1268 GCATATACGAATGTCATGTTGGAATCAGTGGGTCCGAGCCAAAAGTTTCAACTTTCGAAG 1327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 1196 GCATATACGAATGTCATGTTGGAATCAGTGGGTCCGAGGCAAAAATTTCAACTTTCGAAG 1255
Query 1328 AATTTACTAAGAAGGTCCTTCCTCATGTGAAAAGAGCTGGATACAATGCAATCCAGTTGA 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1256 AATTTACTAAGAAGGTCCTTCCTCATGTGAAAAGAACTGGATACAATGCAATTCAGCTGA 1315
Query 1388 TTGGTGTCCCTGAGCACAAGGATTATTTTACTGTTGGTTATAGGGTTACGAACTTCTTTG 1447
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1316 TTGGTATCCCTGAGCACAAGGATTATTTTACTGTTGGTTATAGGGTTACTAATTTCTTTG 1375
Query 1448 CTGCCAGTAGCCGATATGGCACGCCAGATGATTTCAAACGGTTGGTTGATGAGGCACATG 1507
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1376 CTGCTAGTAGCCGATATGGCACGCCAGATGATTTCAAACGGTTGGTTGATGACGCACATG 1435
Query 1508 GCCTAGGACTTCTTGTCTTTTTGGACATCGTGCATTCTTATGCAGCAGCTGATCAGATGG 1567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 GCCTAGGACTTCTTGTCTTTTTGGACATCGTGCATTCTTATGCAGCAGCTGATCAGATGG 1495
Query 1568 TTGGGCTTTCTCTCTTCGATGGTTCAAATGATTGCTATTTTCATTATGGTAAAAGGGGGC 1627
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 CTGGGCTTTCTCTTTTCGATGGTTCAAATGACTGCTATTTTCATTATGGTAAAAGGGGGC 1555
Query 1628 ATCACAAACACTGGGGCACCCGGATGTTCAAATACGGTGATTTGGATGTTCTTCATTTTC 1687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 ATCACAAACACTGGGGCACCCGGATGTTCAAATACGGTGATTTGGATGTTCTTCATTTTC 1615
Query 1688 TAATATCAAATTTGAACTGGTGGATTACAGAGTATCAAGTTGATGGT-TACCAATTTCAC 1746
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||
Sbjct 1616 TCATATCAAATTTGAACTGGTGGATTACAGAGTATCAAGTTGATGGTCT-CCAGTTTCAC 1674
Query 1747 TCGCTTGCCTCGATGATTTACACGCACAATGGGTTTGCTTCATTTAACAACGATTTGGAT 1806
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 TCGCTTGCCTCGATGATTTACACGCACAATGGTTTTGCTTCATTTAACAACGATTTGGAC 1734
Query 1807 GACTATTGCAATCAGTATGTTGACCGAGATGCTCTGATGTACCTCATTTTGGCCAATGAA 1866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 GACTATTGCAATCAGTATGTTGACCGAGATGCTCTGATGTACCTCATTTTGGCCAATGAA 1794
Query 1867 ATCCTGCACGTTCAACATCCAAATATAATAACAATTGCTGAGGATGCAACATATTACCCT 1926
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 ATCCTGCACGTTCTACATCCAAATATAATAACAATTGCTGAGGATGCAACATATTACCCT 1854
Query 1927 GGGTTGTGTGAGCCAGTTTCTCAAGGTGGACTTGGATTTGATTATTATGTGAATCTTTCT 1986
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1855 GGGTTGTGTGAGCCAGTTTCTCAAGGTGGACTTGGATTTGATTATTATGTGAATCTCTCT 1914
Query 1987 GCGTCAGAAATGTGGGTTTCTCTCCTCGACAATGTACCGGATAATGAATGGAGCATGAGC 2046
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 GCGTCAGAAATGTGGGTTTCTCTCCTCGACAGTGTACCGGATAATGAATGGAGCATGAGC 1974
Query 2047 AAG--A-T--TG----T---CAGTACATTGGTGGCTAACAAAGAGTATGCAGACAAGATG 2094
||| | | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 AAGCCAGTGCTGCAGATTGTCAGTACATTGGTGGCTAACAAAGAGTATGCAGACAAGATG 2034
Query 2095 CTCAGCTATGCCGAAAATCACAACCAATCCATATCAGGAGGGCGTTCATTTGCTGAAATC 2154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 GTCAGCTATGCCGAAAATCACAACCAATCCATATCAGGAGGGCGTTCATTTGCTGAAATC 2094
Query 2155 TTATTCGGTGGAGTCGATAATGGTTCTCCTGGAGGAAAAGAATTGCTAGACAGGGGAATT 2214
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2095 TTGTTTGGTGGAGTCGATAATGGTTCTCCTGGAGGAAAAGAATTGCTAGACAGGGGAGTT 2154
Query 2215 TCACTACATAAGATGATTAGACTGATTACTTTTACAAGTGGTGGCCGTGCATACCTCAAT 2274
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2155 TCACTACATAAGATGATTAGACTGATTACTTTTACAAGTGGTGGGCGTGCTTACCTCAAT 2214
Query 2275 TTCATGGGAAATGAATTTGGACATCCTGAGAGGGTTGAGTTTCCAACGCAGAGCAATAAC 2334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2215 TTCATGGGAAATGAATTTGGACATCCTGAGAGGGTTGAGTTTCCAACACAGAGCAATAAC 2274
Query 2335 TTCTCGTTTTCACTTGCTAACCGCCGCTGGGACCTGCTGGAAAGTGGAGTGCATCATCAC 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 TTCTCGTTTTCACTTGCTAACCGCCGCTGGGACCTGCTGGAAAGTGGAGTGCATCATCAC 2334
Query 2395 TTGTTTTCCTTTGACAAGGAGCTAATGGACTTGGATAAAAGCAAGGGTATCCTTTCAAGA 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 TTGTTTTCCTTTGACAAGGAGCTAATGGACTTGGATAAAGGCAAGGGTATCCTTTCAAGA 2394
Query 2455 GGTCTGCCCAGCATCCACCATGTGAATGATGCAAATATGGTGATTTCTTTCTCAAGGGGT 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2395 GGTCTGCCCAGCATCCACCATGTGAATGATGCAAATATGGTGATTTCGTTCTCGAGGGGT 2454
Query 2515 CCTTTCCTATTTATCTTTAACTTCCACCCATCAAATTCATATGAAAAGTATGATGTCGGT 2574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2455 CCTTTCCTATTTATCTTTAACTTCCACCCATCAAATTCATATGAAAAGTATGATGTTGGT 2514
Query 2575 GTAGAGGAAGCTGGTGAATATACCATGATACTGAACTCCGATGAAGTAAAGTATGGGGGT 2634
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 GTAGAGGAAGCTGGTGAATATACTATGATACTGAACTCCGATGAAGTAAAGTATGGGGGT 2574
Query 2635 CAAGGGATTGTAACAGAAGACCACTATCTTCAACGGTCAATTAGCAAGAGAATTGATGGT 2694
|||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 CAAGGGCTTGTAACGGAGGACCAGTATCTTCAACGGTCAATTAGCAAGAGAATTGATGGT 2634
Query 2695 CAAAGAAATTGCTTAGAGGTGTTTTTGCCTAGCCGGACTGCCCAAGTTTACAAGTTGACC 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 CAAAGAAATTGCTTAGAGGTGTTTTTGCCTAGCAGGACTGCCCAAGTTTACAAGTTGACC 2694
Query 2755 CGGATCCTCCGAATATGA 2772
||||||||||||||||||
Sbjct 2695 CGGATCCTCCGAATATGA 2712
> Ahg951859 jgi|Araly1|951859|scaffold_21900003.1
Length=1250
Score = 1808 bits (979), Expect = 0.0
Identities = 1072/1117 (96%), Gaps = 5/1117 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 61 GCACCAACAAAAATGGTGTCCCTCTCTAATCAAACCAGATTCTCTTTCCACCCAAACAAT 120
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 GCACCAACAAAAATGGTTTCCCTCTCTAATCAAACCAGATTCTCTTTCCACCCAAACAAC 70
Query 121 CTTGTCGTTTCCGAGAA-ACGGCGCCTGGGAATCTCAGGAGTCAATTTTCCCAGGAAGAT 179
||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 71 CTTTTCCTTTCCGAGAATA-GGCGTCTGGGAATCTCAGGAGTCAATTTTCCCAGGAAAAT 129
Query 180 CAAGT-TGAAAATCACTTGCTTCGCCGCCGAGAGACCACGCCAGGAGAAACAGAAAAAGA 238
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 CAA-TGTGAAAATCACTTGCTTCGCCGCCGAGAGACCACGCCAGGAGAAACAGAAAAAGA 188
Query 239 AGAGTCAGAGCCAGAGCACTAGCGACGCTGAGGCTGGAGTTGACCCTGTTGGGTTTCTCA 298
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 189 AGAGTCAGAGCCAGAGCACTAGTGACGCTGAAGCTGGAGTCGACCCAGTTGGGTTTCTCA 248
Query 299 CCAGACTCGGAATTGCTGACAGAATCTTTGCTCAATTTCTCCGGGAAAGGCATAAAGCTT 358
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 249 CCAGACTGGGAATTGCTGACAGAATCTTTGCTCAATTTCTCCGAGAAAGGCATAAAGCTT 308
Query 359 TGAAAGACCTTAAAGATGAGATTTTCAAACGCCATTTCGATTTCAGAGATTTTGCTTCAG 418
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 309 TGAAAGACCTTAAAGATGAGATTCTCAAACGCCACTTCGATTTTAGAGATCTTGCTTCAG 368
Query 419 GATTTGAGTTATTGGGGATGCATCGACATATGGAACACCGGGTTGACTTTATGGACTGGG 478
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GATTTGAGTTACTGGGGATGCATCGACATATGGAACACCGGGTTGACTTTATGGACTGGG 428
Query 479 GTCCAGGTTCTCGTTATGGGGCTATAATCGGAGATTTCAATGGATGGTCGCCTACAGAAA 538
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 429 GTCCAGGTGCTCGTTATGGTGCTATAATCGGAGATTTCAACGGATGGTCCCCTACAGAAA 488
Query 539 ATGCAGCTAGAGAGGGCCTATTTGGCCATGATGATTATGGGTATTGGTTCATTATTCTTG 598
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 ATGCAGCCAGAGAGGGCCTATTTGGCCATGATGATTTTGGGTATTGGTTCATTATTCTTG 548
Query 599 AAGATAAGTTAAGAGAGGGTGAAGAACCAGATGAACTATACTTTCAGCAGTATAACTATG 658
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549 AGGATAAGTTAAGAGAGGGTGAAGAACCAGACGAACTATACTTTCAGCAGTATAACTATG 608
Query 659 TCGATGACTATGATAAGGGTGATAGTGGTGTATCAGCTGAAGAAATCTTCCAGAAAGCTA 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 TCGATGACTATGATAAGGGTGATAGTGGTGTATCAGCTGAAGAAATCTTCCAGAAAGCTA 668
Query 719 ATGATGAGTATTGGGAACCTGGTGAGGATCGGTTTATTAAAAACCGCTTTGAAGTTCCTG 778
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 ATGATGAGTATTGGGAACCTGGTGAGGACCGGTTTATTAAAAACCGCTTTGAAGTTCCTG 728
Query 779 CCAAACTATACGAGCAGATGTTTGGCCCGAACAGTCCACAAACGTTAGAAGAGCTTGGAG 838
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 729 CTAAACTATACGAACAGATGTTTGGCCCGAACAGTCCACAAACATTAGAAGAGCTAGGAG 788
Query 839 ATATACCAGATGCAGAAACGAGATATAAACAGTGGAAAGAGGAGCATAAAGATGACCCGC 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
Sbjct 789 ATATACCAGATGCAGAAACGAGATATAAACAGTGGAAAGAGGAGCATAAAAATGATCCAC 848
Query 899 CAAGTAATCTACCTCCATGCGACATCATTGATAAAGGTCAAGGAAAGCCATATGATATTT 958
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 CTAGTAATCTACCTCCATGCGACATCATTGATAAAGGTCAAGGAAAGCCATATGATATTT 908
Query 959 TTAATGTCGTGACATCTCCAGAATGGACAAAGAAATTTTATGAGAAAGAACCTCCGATTC 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 909 TTAATGTCGTGACATCTCCAGAATGGACAAAGAAATTTTATGAGAAAAAACCTCCAATTC 968
Query 1019 CATATTGGTTAGAGACACGTAAAGGAAGAAAGGCATGGTTGCAAAAATATATTCCAGCTG 1078
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 969 CATATTGGTTAGAGACACGTAAAGGAAGAAAGGCATGGTTAAAAAAATACATTCCAGCTG 1028
Query 1079 TTCCACATGGAAGCAAGTATAGATTGTATTTCAATACTCCTGATGGACCGCTTGAACGAG 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TTCCACATGGAAGCAAGTATAGATTGTATTTCAATACTCCTGATGGACCGCTTGAACGAG 1088
Query 1139 TGCCTGCTTGGGCTACATATGTGCAACCAGAGGATGA 1175
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1089 TGCCTGCTTGGGCTACATATGTGCAACCAG-GTATGA 1124
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 120060452240
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5