BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G21180.1
Length=3771
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg479638 jgi|Araly1|479638|fgenesh2_kg.3__2339__AT3G21180.1 6093 0.0
> Ahg479638 jgi|Araly1|479638|fgenesh2_kg.3__2339__AT3G21180.1
Length=3734
Score = 6093 bits (3299), Expect = 0.0
Identities = 3621/3770 (96%), Gaps = 47/3770 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTTCTCttttttttCTCTGTGATTGACAGAGAGGTAAGAGaaaaaaaaGAGAGAAAGT 60
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGTTTCTCTTTTTTTTCTCTGTAATTGACAGAGAGGTAAGAGAAAAAAAAGAGAGAAAGT 60
Query 61 G-TTTCGGTTTTTGTTGCCTTCTCTCGAGTTAGGCCTTCTCTCTTCCGTCACACCATCA- 118
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 61 GTTTTCGGTTTTTGTTGCCTTCTCTTGAGTTAGGCCTTCTCTCTTCCGTCCCACCATCAT 120
Query 119 -ttttttttCTCCATAACGACCAAATCATAAAACCGGTCGTTCCTAttttttctttctct 177
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||
Sbjct 121 TTTTTTTTTTTCCATAACGACCAAATCATAAAACAGGTCGTTCCTA-TTTTTC-TT-TCT 177
Query 178 gcgttttttgtttCGAATTCTTCAATAGAATTTTAAAAGAAAGAAGAAAGCTGGGTGAGA 237
| || || | | |||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 178 -C------TG---CG------T---T----TTTTGAAAG-AAGAAGAAAGCTGGGTGAGA 213
Query 238 CGAAGGAAGGAAGAATGAGCACTTCGTCGAGCAACGGATTGCTTCTGACGTCAATGTCAG 297
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 214 CGAAGGAAGGAAGAATGAGCACTTCGTCGAGCAATGGATTGCTCCTGACGTCAATGTCAG 273
Query 298 GACGTCATGACGACATGGAAGCTGGTTCTGCTAAAACTGAAGAACATTCTGATCATGAAG 357
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 GTCGTCATGACGACATGGAAGCTGGTTCTGCTAAAACTGAAGAACATTCTGATCATGAAG 333
Query 358 AGCTTCAACATGATCCTGATGATCCTTTTGATATTGATAACACCAAGAACGCTTCTGTTG 417
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 334 AGCTTCAACATGATCCTGATGATCCTTTTGACATTGATAACACCAAGAATGCTTCTGTTG 393
Query 418 AATCTCTTCGTCGTTGGAGACAAGCCGCTCTTGTGTTGAACGCATCGCGTCGGTTTCGAT 477
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 394 AATCTCTTCGTCGTTGGAGGCAAGCGGCTCTTGTGTTGAACGCATCTCGTCGGTTTCGAT 453
Query 478 ACACTTTGGATCTTAATAAAGAAGAACATTATGATAATCGAAGGAGGATGATCAGAGCTC 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 454 ACACTTTGGATCTTAATAAAGAAGAACATTATGATAATCGAAGGAGGATGATCAGAGCTC 513
Query 538 ATGCTCAAGTCATTAGGGCAGCATTGCTTTTTAAACTGGCTGGTGAACAACAAATTGCGT 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 514 ATGCTCAAGTCATTAGGGCAGCATTGCTTTTTAAATTGGCTGGTGAACAACAACTTGCGT 573
Query 598 TTGG---ATCATCAACACCAGCAGCTTCTACTGGTAACTTTGACATTGATCTTGAAAAGC 654
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 TTGGATCATCATCAACACCAGCAGCTTCAACTGGTAACTTTGACATTGATCTTGAAAAGC 633
Query 655 TTGTGTCTATGACAAGGAACCAGAACATGTCCAATTTGCAGCAATATGGAGGGGTCAAAG 714
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 TTGTGTCAATGACAAGGAACCAGAAGATGTCCAATTTGCAGCAATATGGAGGGGTCAAAG 693
Query 715 GTGTTGCAGAGAAGTTGAAGTCAAATATGGAACAAGGAATCAATGAGGATGAGAAAGAGG 774
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 GTGTTGCAGAGAAGCTGAAGTCAAATATGGAACAAGGAATCAATGAGGATGAGAAAGAGG 753
Query 775 TGATAGATAGGAAGAATGCTTTTGGATCTAACACTTACCCAAAAAAGAAGGGGAAAAACT 834
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 754 TGATAGATGGGAAGAATGCTTTTGTATCTAACACATACCCAAAGAAGAAGGGGAAAAACG 813
Query 835 TTTTTATGTTCCTCTGGGAAGCTTGGCAAGATTTAACTCTCATCATCTTGATCATAGCGG 894
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TCTTTATGTTCCTCTGGGAAGCTTGGCAAGATTTAACTCTCATCATCTTGATCATAGCGG 873
Query 895 CTGTAACATC-ATTGGCATTGGGAATAAAGACAGAGGGTTTGAAAGAAGGTTGGCTTGAT 953
|||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 CTGTAACATCGA-TGGCATTGGGAATAAAAACAGAGGGTTTGAAAGAAGGTTGGCTTGAT 932
Query 954 GGTGGAAGCATTGCCTTTGCGGTTTTGCTTGTCATTGTTGTTACAGCTGTTAGTGACTAT 1013
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 GGTGGAAGCATTGCCTTTGCGGTTTTGCTTGTCATTATTGTTACAGCTGTTAGTGACTAT 992
Query 1014 CGCCAATCTCTCCAGTTTCAAAACCTCAACGATGAAAAAAGAAATATACAACTAGAGGTC 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 993 CGCCAATCTCTCCAGTTTCAAAACCTCAACGATGAAAAAAGAAATATACAACTGGAGGTC 1052
Query 1074 ATGAGAGGAGGGAGAACAGTGAAGATATCAATCTATGACGTTGTTGTCGGAGATGTTATA 1133
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 ATGAGAGGAGGGAGAACAGTGAAGATTTCAATCTATGACGTTGTTGTCGGAGATGTTATA 1112
Query 1134 CCTCTTAGGATAGGTGACCAGGTCCCTGCGGATGGAGTGCTAATTAGTGGTCATTCTCTT 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113 CCTCTTAGGATAGGTGACCAGGTCCCTGCGGATGGAGTGCTAATTAGTGGTCATTCTCTT 1172
Query 1194 GCTATTGATGAATCTAGCATGACCGGTGAAAGCAAGATTGTTCACAAGGATCAAAAATCC 1253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 GCTATTGATGAATCTAGCATGACCGGTGAAAGCAAGATTGTTCACAAGGATCAAAAATCA 1232
Query 1254 CCTTTTCTAATGTCTGGCTGTAAAGTAGCTGACGGAGTCGGTAACATGCTGGTTACTGGT 1313
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233 CCTTTTCTAATGTCTGGTTGTAAAGTAGCTGATGGAGTCGGTAACATGCTGGTTACTGGT 1292
Query 1314 GTTGGAATCAACACTGAGTGGGGATTGTTGATGGCAAGTATCTCAGAAGATACTGGTGAA 1373
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1293 GTTGGAATTAACACTGAGTGGGGATTGTTGATGGCAAGTATCTCAGAGGATACTGGTGAA 1352
Query 1374 GAAACTCCATTGCAGGTGAGGTTAAATGGTCTTGCAACCTTCATAGGGATAGTGGGGCTC 1433
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1353 GAAACTCCCGTGCAGGTTCGGTTAAATGGTCTTGCAACCTTCATCGGTATAGTGGGGCTT 1412
Query 1434 TCAGTGGCTCTTGTTGTCCTGGTGGCTCTTCTTGTGAGATATTTTACCGGAACTACTCAA 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413 TCAGTGGCTCTTGTTGTCCTGGTGGCTCTTCTTGTGAGATATTTTACCGGAACTACTCAA 1472
Query 1494 GATACTAATGGAGCGACCCAGTTTATCAAAGGGACGACTAGTATCAGTGACATTGTAGAT 1553
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 GATACTAATGGAGCGACTCAGTTTATCAAAGGGACGACTAGTATCAGTGACATTGTAGAT 1532
Query 1554 GATTGTGTAAAGATATTTACAATCGCCGTGACAATTGTGGTTGTAGCAGTGCCTGAGGGA 1613
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 1533 GATTGTGTAAAGATATTTACAATCGCCGTGACAATTGTTGTTGTGGCTGTGCCTGAGGGA 1592
Query 1614 CTTCCCCTAGCAGTTACCCTCACTTTGGCTTACTCAATGCGAAAGATGATGGCAGACAAA 1673
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 CTTCCCTTAGCAGTTACCCTCACTTTGGCTTACTCAATGAGAAAGATGATGGCAGACAAA 1652
Query 1674 GCTTTGGTTAGAAGGCTTTCAGCTTGTGAAACCATGGGATCAGCAACAACAATCTGCAGT 1733
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1653 GCTTTGGTTAGAAGGCTTTCAGCTTGTGAAACCATGGGCTCAGCAACAACAATCTGCAGT 1712
Query 1734 GACAAAACTGGAACTTTAACTTTGAATCAGATGACTGTGGTTGAAACTTATGCTGGAGGA 1793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1713 GACAAAACTGGAACTTTAACTTTGAATCAGATGACTGTGGTTGAAACTTATGCTGGAGGA 1772
Query 1794 TCAAAGATGGATGTAGCAGACAACCCTTCCGGTCTCCACCCTAAACTTGTTGCCTTAATA 1853
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 TCAAAGATGGATGTAGCGGACAACCCTTCTGGTCTCCACCCTAAACTTGTTGCCTTAATA 1832
Query 1854 AGTGAGGGTGTTGCACAAAACACAACAGGAAACATTTTTCATCCCAAGGATGGTGGAGAG 1913
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1833 AGTGAGGGTGTGGCACAAAACACAACAGGAAACGTTTTTCATCCCAAGGAAGGTGGAGAG 1892
Query 1914 GTGGAGATTTCTGGATCTCCCACAGAGAAGGCTATTCT-GTCTTGGGCTTATAAGTTGGG 1972
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||
Sbjct 1893 GTGGAGATTTCTGGATCTCCAACAGAGAAGGCTAT-CTTGTCCTGGGCGTATATGTTGGG 1951
Query 1973 GATGAAGTTTGATACCATCAGGTCGGAGTCTGCTATCATCCATGCCTTCCCTTTCAATTC 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1952 GATGAAGTTTGATACCATCAGGTCGGAGTCTGCTATCATCCATGCTTTCCCTTTCAATTC 2011
Query 2033 AGAGAAAAAGCGTGGTGGTGTTGCTGTGCTTCGAGGTGATTCTGAAGTTTTCATTCACTG 2092
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2012 AGAGAAAAAGCGTGGTGGTGTTGCTTTGCTTCGAGGTGATTCTGAAGTTTCCATTCACTG 2071
Query 2093 GAAGGGAGCAGCAGAGATAGTTTTGGCTTGCTGTACACAATACATGGACTCAAATGGTAC 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 GAAGGGAGCAGCAGAGATAGTTTTGGCTTGCTGTACACAATACATGGACTCAAATGGTAC 2131
Query 2153 TCTGCAGTCCATTGAGAGCCAAAAGGAATTTTTCAGAGTTGCTATCGATAGCATGGCGAA 2212
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 TCTGCAGTCCATTGATAGCCAGAAGGAATTTTTCAGAGTTGCTATCGATAGCATGGCGAA 2191
Query 2213 AAATAGCTTGCGATGTGTTGCTATTGCATGCAGAACACAAGAGCTGAACCAAGTTCCCAA 2272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2192 AAATAGCTTGCGATGTGTTGCTATTGCATGCAGAACACAAGAACTGAACCAAGTTCCCAA 2251
Query 2273 GGAACAAGAGGACTTGGATAAATGGGCTTTACCTGAAGATGAACTCATTTTGCTTGCTAT 2332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2252 GGAACAAGAGGACTTGGATAAATGGGCTTTACCTGAAGATGAACTGATTTTGCTTGCTAT 2311
Query 2333 CGTTGGCATAAAGGATCCTTGTCGTCCCGGTGTCAGAGAAGCAGTGAGAATCTGTACCAG 2392
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2312 CGTTGGGATAAAGGATCCTTGTCGTCCTGGTGTCAGAGAAGCAGTGAGAATCTGCACTAG 2371
Query 2393 TGCTGGTGTTAAGGTACGAATGGTGACTGGTGACAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATTGC 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 TGCTGGTGTTAAGGTACGAATGGTGACTGGTGACAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATTGC 2431
Query 2453 TTTGGAGTGTGGTATACTTTCTTCAGATACAGAAGCTGTTGAGCCTACTATCATCGAAGG 2512
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2432 TTTGGAGTGTGGTATACTTTGTTCAGATACAGAAGCTGTTGAGCCTACTATCATCGAAGG 2491
Query 2513 AAAAGTGTTCCGTGAGCTATCTGAGAAAGAGAGAGAACAAGTAGCCAAGAAAATAACGGT 2572
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492 AAAAGTGTTCCGTGAGCTATCTGAAAAAGAGAGAGAACAAGTAGCCAAGAAAATAACGGT 2551
Query 2573 GATGGGTAGGTCATCTCCTAACGACAAGCTCTTACTTGTTCAAGCACTACGGAAAAATGG 2632
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2552 GATGGGTAGGTCATCTCCTAATGACAAGCTTTTACTTGTTCAAGCACTACGGAAAAATGG 2611
Query 2633 AGATGTTGTTGCAGTCACTGGTGATGGTACTAATGATGCTCCTGCCCTCCATGAGGCAGA 2692
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2612 AGATGTTGTTGCTGTCACTGGTGATGGTACTAATGATGCTCCTGCACTTCATGAGGCAGA 2671
Query 2693 TATAGGTCTCTCTATGGGTATATCAGGAACTGAAGTTGCAAAAGAGAGTTCTGACATCAT 2752
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2672 CATAGGTCTCTCTATGGGTATATCAGGAACTGAAGTTGCGAAAGAGAGTTCCGACATCAT 2731
Query 2753 TATTTTGGATGACAATTTTGCTTCAGTAGTAAAGGTTGTTCGTTGGGGCCGTTCTGTGTA 2812
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2732 TATTTTGGATGACAATTTTGCTTCAGTAGTAAAGGTTGTTCGCTGGGGCCGTTCTGTGTA 2791
Query 2813 TGCTAACATTCAGAAATTCATACAATTCCAGCTTACTGTGAATGTTGCCGCACTTATAAT 2872
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2792 TGCAAATATTCAGAAATTCATACAATTCCAGCTTACTGTGAATGTTGCAGCACTTATAAT 2851
Query 2873 CAATGTTGTAGCAGCAATGTCTTCTGGTGACGTCCCTCTAAAGGCTGTACAGCTGCTTTG 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2852 CAATGTTGTAGCAGCAATGTCTTCTGGTGACGTTCCTCTAAAGGCTGTCCAGCTGCTTTG 2911
Query 2933 GGTCAACCTTATCATGGATACTCTTGGAGCACTTGCACTAGCTACAGAGCCACCAACCGA 2992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2912 GGTCAACCTTATCATGGATACTCTTGGAGCACTTGCACTCGCTACAGAGCCACCAACCGA 2971
Query 2993 TCATCTTATGCATAGAACCCCTGTTGGAAGAAGGGAACCTCTTATAACAAACATCATGTG 3052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2972 TCATCTTATGCATAGAACCCCTGTTGGAAGAAGGGAACCTCTTATAACAAACATCATGTG 3031
Query 3053 GAGGAACTTGCTTGTTCAGTCATTCTATCAAGTGGCTGTTCTCCTAGTTCTCAACTTTGC 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3032 GAGGAACTTGCTTGTTCAGTCATTCTATCAAGTGGCTGTTCTCCTGGTTCTCAACTTTGC 3091
Query 3113 AGGCTTAAGCATTCTTGGCTTGAACCATGAAAACCATGCACATGCTGTGGAAGTGAAGAA 3172
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3092 AGGATTAAGCATTCTTGGCTTGAACCATGAAAACCATGCACATGCTGTGGAAGTGAAGAA 3151
Query 3173 CACTATGATATTCAATGCCTTTGTCATGTGTCAAATATTCAACGAGTTCAACGCAAGAAA 3232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3152 CACTATGATATTCAATGCCTTTGTCATGTGTCAAATATTCAACGAGTTCAATGCAAGGAA 3211
Query 3233 ACCTGATGAAATGAATGTATTCCGGGGAGTAAATAAGAACCCTCTCTTCGTAGCAATTGT 3292
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3212 ACCTGATGAAATGAATGTTTTCCGGGGAGTATCTAAGAACCCTCTCTTCGTAGCAATTGT 3271
Query 3293 TGGAGTCACTTTTATACTTCAGAT-CATCATCGTTACTTTCCTCGGAAAGTTTGCTCACA 3351
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3272 TGGAGTCACTTTTATACTTCAGATAC-TCATCGTTACTTTCCTCGGAAAGTTTGCCCACA 3330
Query 3352 CCGTTAGACTGGGATGGCAGTTATGGCTTGCTTCTATAATCATTGGATTGGTCAGCTGGC 3411
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 CCGTTAGACTGGGATGGCAGCTATGGCTTGCTTCTATTCTCATTGGATTGGTCAGCTGGC 3390
Query 3412 CACTAGCAATTGTTGGGAAACTGATCCCTGTACCCAAGACACCGATGAGCGTCTACTTCA 3471
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3391 CACTAGCAATTGTTGGGAAACTGATTCCTGTACCCAAGACTCCGATGAGCGTCTACTTCA 3450
Query 3472 AGAAACCGTTCCGTAAATACAAAGCTTCAAGAAATGCATAAAACATACA--ACTAGGTTC 3529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 3451 AGAAACCGTTCCGTAAATACAAAGCTTCAAGAAATGCATAAAACATA-AGTACTAGGTTC 3509
Query 3530 TCAGCCTTCCTCATACAGAAGCAATAACAGATATAACCTGTGACAATGGCCTAAACCTCT 3589
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3510 TCA-CCTTCCTCATACAGAAGCAATAACAGATATAACCTGTGACAATGGCCTAAACCTCT 3568
Query 3590 AACCTTTCTTTCTATCTTTTTTAAAAATGGTAAAAGTATTTTCAAATGTATACTGCAATG 3649
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3569 AACCTTTCTTTCTTTCTTTTTTAAA--TGGTAAAAGTATTTTCAAATGTATACTGCATTG 3626
Query 3650 AGATCCAATTCTTTTGTCCCTTTTCATATTTCTTCTTTTTGTATGATGTAAAAGTGCAAC 3709
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 A--TCCAATTCTTTTGTCCCTTTTCATATTTCTTCTTTTTGTATGATGTAAAAGTGCAAC 3684
Query 3710 TGTGAATTGAATTGGATTTGTGGTTGTACTAACGAGAGTTTGGCTCAGTC 3759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3685 TGTGAATTGAATTGGATTTGTGGTTGTACTAACGAGGGTTTGGCTCAGTC 3734
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 142487553312
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5