BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G21250.2
Length=4894
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg905146 jgi|Araly1|905146|Al_scaffold_0003_2274 3254 0.0
Ahg478682 jgi|Araly1|478682|fgenesh2_kg.3__1383__AT3G13080.1 108 5e-22
Ahg926495 jgi|Araly1|926495|scaffold_202056.1 86.1 2e-15
> Ahg905146 jgi|Araly1|905146|Al_scaffold_0003_2274
Length=3888
Score = 3254 bits (1762), Expect = 0.0
Identities = 1939/2024 (96%), Gaps = 13/2024 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2641 GTTATGGAGGAAGGAACAATCACTCAGTCAGGAAAATATGAGGAGCTCTTAATGATGGGG 2700
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 GTTATGGAGGAAGGAAGAATCACTCAGTTAGGAAAATATGAGGAGCTCTTAATGATGGGG 1932
Query 2701 ACTGCATTCCAACAGCTGGTAAATGCTCATAATGATGCAGTAACTGTATTACCTTTAGCG 2760
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 ACTGCATTCCAACAGCTGGTGAATGCTCATAATGATGCAGTAACTGTATTACCTTTAGCG 1992
Query 2761 AGTAACGAAAGCCTCGGAGATCTTAGGAAAGAGGGCAAG-GACAGAGAGATAAGAAACAT 2819
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 AGTAACGAAAGCCTCGGAGATCTTAGGAAAGAGGG-TAGAGACAGAGAGATAAGAAACAT 2051
Query 2820 GACGGTTGTCGAAAAAATCGAAGAAGAGATCGAAAAAACGGATATTCCAGGGGTACAACT 2879
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2052 GGCGGTTGTCGAAAAAATCGAAGAAGAGATCGAAAAAACGGATATTCCAGGGGTACAACT 2111
Query 2880 TACACAAGAAGAAGAAAAAGAGAGCGGTTATGTTGGGATGAAACCTTTCTTGGACTATAT 2939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2112 TACACAAGAAGAAGAAAAAGAGAGCGGTTATGTTGGGTTGAAACCTTTCTTGGACTATTT 2171
Query 2940 CGGTGTCTCTCGAGGATGGTGTCTTCTATGGTCAAGCGTATTGGGTCAGGTTGGCTTTGT 2999
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2172 CCGTGTCTCTCGAGGATGGTGTCTTCTATGGTCAAGCGTATTGGGTCAGGTTGGATTTGT 2231
Query 3000 AGTTTTTCAGGCTGCATCAACATACTGGCTGGCTTTTGCCATCGGGATCCCTAAAATCAC 3059
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2232 AGTTTTTCAGGCTGCATCAACATACTGGCTGGCTTTTGCCATTGGGATCCCTAATCTCAC 2291
Query 3060 GAATACAATGCTTATTGGAGTCTATAGCATTATATCAACTCTTAGTGCTGGTTTTGTATA 3119
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 TAATACAATGCTTATTGGAGTCTATAGCATTATCTCAACTCTTAGTGCTGGTTTTGTATA 2351
Query 3120 TGCGAGAGCTATTACGACTGCCCATCTTGGACTAAAAGCTTCCAAAGCCTTCTTCTCTGG 3179
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2352 CGCGAGAGCTATTACGACTGCTCATCTTGGACTAAAAGCTTCCAAAGCCTTCTTCTCTGG 2411
Query 3180 TTTCACAAATGCAGTCTTCAAAGCCCCGATGCTTTTCTTTGATTCTACTCCAGTTGGCCG 3239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2412 TTTCACAAATGCAGTCTTCAAAGCCCCGATGCTTTTCTTCGATTCTACTCCAGTTGGGCG 2471
Query 3240 CATTCTCACCCGAGCTTCGTCTGATTTGAACGTGTTGGACTATGACGTTCCATTTGCCTT 3299
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||
Sbjct 2472 CATTCTCACCCGAGCTTCATCTGATTTGAACGTCTTGGACTTTGACATTCCATTTGCATT 2531
Query 3300 CATATTTGTGGTAGCACCGGCTGTTGAGCTCACTGCAGCTCTTCTCATCATGACGTATGT 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 2532 CATATTTGTGGTAGCACCGGCTGTTGAGCTCACTGCAGCTCTTATCATCATGACATATGT 2591
Query 3360 CACATGGCAAGTAATTATCATAGCCCTTCTTGCTTTGGCAGCCACGAAAGTTGTTCAGGA 3419
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2592 CACATGGCAAGTAATTATCATAGCTCTTCTTGCTTTGGCAGCCACGAAAGTTGTTCAGGA 2651
Query 3420 TTACTATTTAGCCTCTGCAAGGGAGCTGATTAGGATCAATGGAACAACCAAAGCTCCAGT 3479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2652 TTACTATTTAGCCTCTGCAAGGGAGCTGATTAGGATCAATGGAACAACCAAAGCTCCAGT 2711
Query 3480 GATGAATTATGCTGCAGAAACCTCACTTGGGGTGGTGACAATTCGAGCTTTTGGAACCGC 3539
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2712 GATGAATTATGCTGCAGAAACCTCACTTGGAGTGGTGACAATACGAGCTTTTGGAACAGT 2771
Query 3540 AGAGAGATTCTTCAAAAACTACTTAAACCTAGTTGATGCAGATGCCGTGCTATTCTTTCT 3599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2772 AGAGAGATTCTTCAAAAACTACTTAAACCTAGTTGATGCAGATGCCGTACTATTCTTTCT 2831
Query 3600 GTCTAATGCAGCCATGGAGTGGGTGATTTTGAGGATAGAGACTCTGCAGAATGTGACTTT 3659
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||
Sbjct 2832 GTCTAATGCAGCCATGGAGTGGGTGATTCTGAGGATTGAAACTATGCAGAATGTGACTTT 2891
Query 3660 GTTCACTTGTGCACTTCTTCTTATCCTTATTCCCAAGGGCTACATAGCTCCAGGCCTCGT 3719
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2892 GTTCACTTGTGCACTTCTGCTTATCCTTATTCCCAAGGGATACATAGCTCCAGGCCTCGT 2951
Query 3720 TGGACTTTCGCTCTCCTATGCATTAACACTGACACAAACTCAGGTGTTTCTGACCCGATG 3779
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2952 CGGGCTTTCACTCTCCTATGCATTAACACTGACACAAACTCAGGTGTTTCTGACCCGATG 3011
Query 3780 GTATTGTACTTTGTCGAATTCCATCATTTCAGTAGAGAGGATCAAACAATATATGAACAT 3839
|||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3012 GTATTGCACCTTATCGAATTCAATCATTTCAGTAGAGAGGATAAAACAATATATGAACAT 3071
Query 3840 ACCAGAAGAACCTCCTGCAATTATAGATGATAAAAGACCACCTTCCTCATGGCCTTCCAA 3899
|||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3072 ACCAGAAGAACCTCCTGCAATTGTGGATGATAGAAGACCACCTTCCTCATGGCCTTCCAA 3131
Query 3900 TGGTACAATTCATTTGCAGGAGCTTAAGATAAGATATCGACCCAATGCTCCGTTGGTTCT 3959
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3132 TGGTACAATTCACTTGCAGGAGCTTAAGATAAGATATCGCCCCAATGCTCCGTTGGTTCT 3191
Query 3960 CAAAGGAATCTCTTGCACATTCAGGGAAGGGACAAGAGTAGGAGTTGTCGGGAGGACGGG 4019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3192 CAAAGGAATCTCTTGCACATTCAGGGAAGGGACAAGAGTAGGAGTTGTCGGGAGGACGGG 3251
Query 4020 AAGCGGAAAAAGCACATTGATCAGCGCATTGTTTCGCTTGGTAGAACCAGCAAGTGGTTG 4079
|||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3252 AAGCGGGAAAAGCACTTTAATCAGTGCTTTGTTTCGCTTGGTAGAACCAGCAAGTGGTTG 3311
Query 4080 TATATTGATTGATGGGATTGACATAAGTAAGATTGGCCTTAAAGACCTGAGAATGAAACT 4139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 3312 CATATTGATTGATGGGATTGACATAAGTAAGATTGGCCTAAAAGACTTGAGAATGAAACT 3371
Query 4140 GAGCATCATTCCTCAAGAACCAACTCTTTTCCGTGGCTGCATAAGGACAAACCTTGATCC 4199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3372 CAGCATCATTCCTCAAGAACCAACTCTTTTCCGTGGCTGCATAAGGACAAACCTTGATCC 3431
Query 4200 TTTAGGTGTTTACTCCGACGATGAAATATGGAAGGCTCTAGAGAAGTGTCAGCTCAAGAC 4259
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3432 TTTAGGTGTTTACTCTGACGATGAAATATGGAAGGCTCTAGAGAAGTGTCAGCTCAAGAC 3491
Query 4260 AACGATTAGCAATCTTCCTAATAAACTTGATTCTTCAG---TGAGTGATGAAGGAGAAAA 4316
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3492 AACGATTAGCAATCTGCCAAATAAACTTGATTCTTCAGAAGTGAGTGATGAAGGAGAAAA 3551
Query 4317 CTGGAGCGTGGGACAGAGACAACTGTTCTGTCTTGGAAGAGTACTGTTAAAGAGAAACAA 4376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 3552 CTGGAGCGTGGGACAGAGACAACTGTTCTGTCTTGGAAGGGTATTGTTAAAGAGAAACAA 3611
Query 4377 AATATTAGTGTTAGATGAAGCTACAGCTTCCATTGATTCAGCAACTGATGCAATCATTCA 4436
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3612 GATATTAGTGTTAGATGAAGCTACAGCTTCCATTGATTCAGCAACTGATGCAATCATTCA 3671
Query 4437 GAGAATTATAAGAGAAGAGTTTGCAGACTGTACAGTGATAACAGTTGCACATAGAGTACC 4496
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3672 GAGAATTATAAGAGAAGAGTTTGCAGATTGCACAGTGATAACAGTTGCCCATAGAGTACC 3731
Query 4497 AACTGTCATAGACAGTGACATGGTCATGGTTCTCTCTTTTGGTGAT-TTAGTAGAGTACA 4555
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||
Sbjct 3732 AACTGTCATAGACAGTGACATGGTCATGGTTCTCTCCTTTGGTGATCTT-GTGGAATACA 3790
Query 4556 ACGAGCCTTCGAAGCTAATGGAGACTGATTCTTACTTCTCTAAGCTTGTTGCTGAGTATT 4615
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3791 ACGAGCCTTCAAAGCTAATGGAGACTGATTCTTACTTCTCTAAGCTTGTTGCTGAGTATT 3850
Query 4616 GGGCTAGTTGCAGAGGAAACTCTTCTCAGAATCTCCAATTATAA 4659
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 3851 GGGCTAGTTGCAGAGGAA-CTC-----AGAATCTCCAATTATAA 3888
Score = 2987 bits (1617), Expect = 0.0
Identities = 1787/1870 (96%), Gaps = 8/1870 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 745 AGTCTTTTGCTTCTCCTTTGTTCATGGATGAATTTGAGATCTTCTTCTGCAGCAGCTCAA 804
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 AGTCTTTTGCTTCTCCTTTGCTCCTGGATGAATTTGAGATCTTCTTCTGCAGCAGCTCAA 69
Query 805 GATTGTAGTGTAA-CAGGACTTTCTGATCCTCTTTTAACTAAAAATCCTAGAAAAGAATC 863
||||| |||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 GATTGCAGTG-AAGCAGGACTTTCTGATCCTCTATTGACTAAAAATCCTAGAAAAGAATC 128
Query 864 GGCGAGGTTAGCAACAGCTGGATTTTTCAGCATTCTATCTTTCTCTTGGATGAATCCTTT 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 129 GGCGAGGTTAGCAACAGCTGGATTTTTCAGCATTCTATCGTTCTCTTGGATGAATCCTTT 188
Query 924 ACTCTCGCTGGGATTCAAGAAACCATTATCCCCTGAAGATATCCCAAGTGTAGTCCCGGA 983
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 ACTCTCGCTGGGATTCAAGAAACCATTATCCCCTCAAGATATCCCAAGTGTAGTCCCGGA 248
Query 984 GGATGAGGCTCAATTAGCTTACAAG-AAATTTTCTCAAGCATGGGATACTCTTCTTGGAG 1042
|||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 249 GGATGAGGCTGAATTAGCTTAC-AGTAAATTTTCTCAAGCATGGGATACTCTTCTCGCAG 307
Query 1043 ATGAAAGCTCAACTAAGGAAAGAAACTTGGTGTTTAGAGCCGTTGTGAAAGTTTACTTTA 1102
| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 308 AAGGAAGCTCATCGAAGGAAAGAAACTTGGTGTTTAGAGCCGTTGCAAAAGTTTACTTCA 367
Query 1103 AAGAAAACATTTTCATAGCAGTTTTTGCATTTCTCAGAACAT-TTGCTGTTGTTTCTCTT 1161
| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||
Sbjct 368 AGGAGAACATATTCATAGCAGTTTGTGCATTTTTCAGAAC-TCTTGCTGTTGTATCTCTT 426
Query 1162 CCATTAATGCTATATGTCTTTGTGGATTATGCAAACAGTGACCACAGGGATCTCCGCAAT 1221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 427 CCATTAATGCTATATGTCTTTGTGGATTATGCAAACAGTGACCACAGGGATCTCCACAAT 486
Query 1222 GGGTTCTTCAACTTAGCTTGTCTAGTTATGCTGAAACTAGTTGAATCCTTGACAATGAGA 1281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 GGGTTCTTCAACTTAGCTTGTCTAGTTATGCTGAAACTAGTTGAATCCTTGACAATGAGA 546
Query 1282 CATTGGTATTTTGCATCAAGAAGATCAGGAATGAGGATTAGATCAGCGCTAATGGTAGCT 1341
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 547 CATTGGTATTTTGCATCAAGAAGATCAGGAATGAGGATAAGATCAGCACTAATGGTAGCT 606
Query 1342 GCATACAAAAAACAGCTAAAGCTATCAAGTTTAGGGAGGAAAAGGCATTCATCTGGAGAG 1401
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607 GCATACAAAAAGCAGCTAAAGCTATCAAGTTTGGGGAGGAAAAGGCATTCATCTGGAGAG 666
Query 1402 ATTGTGAATTATATCGCGGTGGATGCATATCGTATGGGAGAATTCTTATGGTGGTTCCAC 1461
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTGTGAATTATATCGCAGTGGATGCATATCGTATGGGAGAATTCTTATGGTGGTTCCAC 726
Query 1462 TCGGGATGGAGCCTTTCGCTGCAGCTTTTGCTTTCTACAGCTGTACTTTTTGGAGTGGTT 1521
|| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 TCAGGATGGAGTCTTACACTGCAGCTTTTGCTTTCGACAGCTGTACTTTTTGGAGTGGTT 786
Query 1522 GGTGCAGGAGCTTTTCCAGGTTTAATTCTTCTTCTCCTATGTGGTCTGCTGAATCTACCA 1581
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 787 GGAGCAGGAGCTTTTCCAGGTTTAATTCTTCTTCTCCTATGTGGTCTGCTCAATCTACCA 846
Query 1582 TTTGCAAAGATGCTACAGAACTGCCAGACACAGTTCATGATCGCGCAGGATAAGCGATTG 1641
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 TTTGCAAAGATGCTACAGAACTGCCAGACCCAGTTCATGATCGCGCAGGATAAGCGATTG 906
Query 1642 AGGTCCACCTCAGAGATTTTGAACAGTATGAAAGTCATTAAGCTGCAGTCATGGGAAGAT 1701
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 AGGTCCACCTCAGAGATTTTGAACAGTATGAAAGTCATTAAGCTGCAGTCATGGGAAGAC 966
Query 1702 GAGTTCAAGAAAAAGATAGAATCTTGTCGTGATGATGAATTCACATGGTTGGCTAAAGCT 1761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 967 GAGTTCAAGAAAAAGATAGAATCTTGTCGTGATGATGAATTCAAATGGTTGGCTAAGGCT 1026
Query 1762 CAGCTGACAAAGGCCTTTGGTTCTTTCTTGTATTGGATGTCTCCAACAATAGTTTCTTCT 1821
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 CAGCTGACAAAGGCCTTTGGTACTTTCTTGTATTGGATGTCTCCAACAATAGTTTCTTCT 1086
Query 1822 GTTGTTTTCTTGGGATGTGCTCTATTGAAGAGTGCGCCGCTGAACGCAAGCACCATCTTC 1881
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1087 GTTATTTTCTTGGGATGTGCTCTATTGAAGAGTGCGCCGCTGAACGCAAGCACCATTTTC 1146
Query 1882 ACGGTTTTAGCTACACTAAGAGTTATGTCAGAGCCTGTCAAAATTATACCTGATGCAATT 1941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||
Sbjct 1147 ACGGTTTTAGCTACACTAAGAGTTATGTCAGAGCCTGTCAGACTTATACCTGAGGCAATT 1206
Query 1942 TCTGCTATCATCCAAGGCAATGTCTCGTTCCAAAGATTAAACAACTTTTTGCTTGACGAC 2001
|||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1207 TCTGCTATCATCCAAGTCAATGTCTCGTTCGATAGATTAAACAAATTTTTGCTTGACGAC 1266
Query 2002 GAGCTAAAGATGGATGAAATCGAAAGAAGTGGTCTGGATGCATCTGGAACAGCAGTTGAC 2061
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||
Sbjct 1267 GAGCTAAAGATGGATGAAATCGAAAGAAGTGGTCTGGAGGTATATGGAACAGCAGTTGAC 1326
Query 2062 ATACAAGTAGGTAACTTCGGTTGGGAACCAGAAACTAAGATTCCAACTCTTCGGAATATA 2121
||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1327 ATACAAGCAGGTAAATTCAGTTGGGATCCAGAAACTAAGATTCCAACTCTCCGAAATATA 1386
Query 2122 CATCTGGAAATCAAGCATGGGCAAAAAGTTGCAGTTTGTGGACCAGTTGGAGCAGGAAAA 2181
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1387 CATCTGGAAATCAAGCATGGGCAAAAGGTTGCGGTTTGTGGACCAGTTGGGGCCGGAAAA 1446
Query 2182 TCATCGCTGTTGCATGCAGTACTCGGAGAAATACCTAAAGTTTCTGGAACTGTAAAGGTC 2241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 TCATCGCTGTTGCATGCAGTACTCGGAGAAATACCTAAAGTTTCTGGAACTGTAAAGGTC 1506
Query 2242 TTTGGGTCCATCGCTTATGTTTCTCAGACTTCTTGGATCCAAAGTGGTACCATCCGGGAC 2301
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 TCTGGGTCCATCGCTTATGTTTCTCAGACCTCTTGGATCCAAAGTGGTACCATCCGGGAC 1566
Query 2302 AATATCCTCTATGGAAAGCCCATGGAAAG-TAGACGATACAATGCTGCTATTAAAGCATG 2360
|||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1567 AATATCCTTTATGGAAAGCCCATGGAA-GCTAGAAGATACAATGATGCTATTAAAGCATG 1625
Query 2361 TGCGTTGGATAAGGACATGAACGGTTTTGGACATGGTGACCTCACAGAAATAGGACAAAG 2420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 TGCGTTGGATAAGGACATGAACGGTTTTGGACATGGTGACCTCACAGAAATAGGACAAAG 1685
Query 2421 AGGGATTAACTTGAGCGGAGGACAAAAGCAAAGGATTCAGCTGGCCCGTGCTGTCTATGC 2480
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1686 AGGGATTAACTTGAGTGGAGGACAAAAGCAAAGGATTCAGCTGGCCCGTGCTGTCTTTGC 1745
Query 2481 AGACGCCGATGTTTACCTGCTTGATGATCCTTTTAGTGCTGTGGATGCACATACAGCTGG 2540
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1746 CGACGCTGATGTTTACCTCCTTGATGATCCTTTTAGTGCCGTGGATGCACATACAGCTGG 1805
Query 2541 AGTTCTTTTTCATAAATGTGTTGAGGACTCGCTGAAGGAGAAAACTGTTATTCTGGTCAC 2600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1806 AGTTCTTTTTCATAAATGTGTTGAGGACTCGCTGAAGGAGAAAACTGTCATTCTGGTCAC 1865
Query 2601 TCACCAAGTT 2610
||||||||||
Sbjct 1866 TCACCAAGTT 1875
> Ahg478682 jgi|Araly1|478682|fgenesh2_kg.3__1383__AT3G13080.1
Length=4784
Score = 108 bits (58), Expect = 5e-22
Identities = 298/408 (73%), Gaps = 40/408 (10%)
Strand=Plus/Plus
Query 2149 GTTGCAGTTTGTGG-ACCAGTTGGAGCAGGAAAATC-A--TCGCTGTTGCATGCAGTACT 2204
|||||||||||||| ||| || || | || ||||| | | || || ||| | ||||
Sbjct 2023 GTTGCAGTTTGTGGTACC-GTCGGCTCTGGGAAATCGAGTTTACT-TT-CAT-CTTTACT 2078
Query 2205 CGGAGAAATACCTAAAG-TTTCTGGAACTGTAAAGGTCTT-TGGGTCCATCGCTTATGTT 2262
|||||| |||| ||| | ||||||| | | ||||| || |||| | | || ||||||
Sbjct 2079 AGGAGAAGTACC-CAAGATATCTGGAAGTCTTAAGGT-TTGTGGGACAAAAGCGTATGTT 2136
Query 2263 TCTCAGA-CTTCTTGGATCCAAAGTGGTACCATCCG-GGACAATATCCTCTATGG-AAAG 2319
| || | || ||||||| || ||||||| || | ||| || ||| | | ||| |||
Sbjct 2137 GCACA-ATCTCCTTGGATTCAGAGTGGTAAAAT-TGAGGATAACATCTTGTTTGGCAAA- 2193
Query 2320 CCCATGGAAAGTAG-ACGATA-CA-ATGCTGCTATTAAAGCATGTGCGTTGGA-TAAGGA 2375
|| |||||||| || |||||| | | | ||| || |||||||| | || || ||||||
Sbjct 2194 CCTATGGAAAG-AGAACGATATGATAAGGTGC--TTGAAGCATGTTC-TTTGAGTAAGGA 2249
Query 2376 -CATGAACGGT--TTTGGACA-T-GGTGACCTCACAGAAATAGGACAAAGAGGGATTAAC 2430
| || | | | ||| || | ||||| | || | || ||| || | || || ||
Sbjct 2250 TC-TGGA-GATACTTT---CATTCGGTGATCAGACCGTTATTGGAGAACGTGGCATCAAT 2304
Query 2431 TTGAGCGGAGGACAAAAGCAAAGGATTCAGCTGGCCCGTGCTGTCTATGC-AGACGCCGA 2489
||||| || ||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||| | ||| || ||
Sbjct 2305 TTGAGTGGTGGACAAAAGCAAAGGATACAGATTGCACGTGCTCTCTA-CCAAGATGCGGA 2363
Query 2490 TGTTTACCTGCTT-GATGATCCTTTTAGTGCTGTGGATGCACATACAG 2536
| | || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2364 TATCTATCTG-TTCGATGATCCTTTTAGTGCTGTGGATGCACACACAG 2410
> Ahg926495 jgi|Araly1|926495|scaffold_202056.1
Length=3096
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-15
Identities = 88/108 (81%), Gaps = 4/108 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 2431 TTGAGCGGAGGACAAAAGCAAAGGATTCAGCTGGCCCGTGCTGTCTATGC-AGACGCCGA 2489
||||| || |||||||||||||| || ||| | || || ||| |||| | ||| || ||
Sbjct 896 TTGAGTGGTGGACAAAAGCAAAGAATACAGATTGCACGCGCTCTCTA-CCAAGATGCGGA 954
Query 2490 TGTTTACCTGCTT-GATGATCCTTTTAGTGCTGTGGATGCACATACAG 2536
| | || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 955 TATCTATCTG-TTCGATGATCCTTTTAGTGCTGTGGATGCACACACAG 1001
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 185226207791
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5