BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G21290.1
Length=4025
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg479648 jgi|Araly1|479648|fgenesh2_kg.3__2349__AT3G21290.1 6143 0.0
> Ahg479648 jgi|Araly1|479648|fgenesh2_kg.3__2349__AT3G21290.1
Length=4029
Score = 6143 bits (3326), Expect = 0.0
Identities = 3819/4052 (94%), Gaps = 54/4052 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GAAGAAGAAGAAGAACAGAAGCGCTCTTTGGGTCCctctctctctctctctttcttcaaa 61
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1 GAAGAAGAAGAAGAACAGAAGCGCTCTTTGGGTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTAA 60
Query 62 tcatcgtctctcgtctctcttctctgctcgcgcgtctcaatcagttcaatctctACAATA 121
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCATCGTCTCTCTTCGCTCTTCTCTGCTCGCGCGTCTCAATCAGTTCAATCTCTACAATA 120
Query 122 CACGTATGCATCAATACAT-GTTGGTAACGCAATTGCAGTGACGGCGGAGTAATTTTGAC 180
||| ||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||
Sbjct 121 CACATATGCCTCAATACATGGTT-GTTACGAAATTGCAGTGACGTCGGCGCAATTGTGAC 179
Query 181 CGGAATTATGTTCAAAGGATCGTCGAAACGTGGCGGTAGAGGAGGAAGTGGTGGTGGGGG 240
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
Sbjct 180 CGGAATTATGTACAAAGGATCGTCGAAACGTGGCGGTAGAGGGGGAACCGGTGGTGGTAG 239
Query 241 CAGTGGACCTTCCCGTAACCGTAATTCATTCCCTCCTCCTACAAACCGACATCCTTCTCC 300
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 240 CGGTGGACCGTCCCGTAACCGTAATTCATTCCCTCCTCCTACTAACCGACATCCTTCTCC 299
Query 301 CATCGGGAGGATGTCTTCtggtggtggtggtggtggC-TCCGCCGCTCCACGCCAGCGGA 359
| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CGTCGGGAGGATGTCTTCTGGTGGTGGTGGTGGT-TCAGCCGCCGCTCCACGCCAGCGGA 358
Query 360 GTAATTCTACTAGCGTTAAGGCGGCTGCGTCGACTACGGTGTCGTCGCGGACGGTTGAGG 419
|||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 359 GTAATTCTACTAACGGTAAGGCGGCTGCGGCGACTACGGTGTCGTCACGGACGGTTGAGG 418
Query 420 AAACGTTTAATCTTGTTCCGAGGGAGAGTTCTTCGGCTTTTGGAATGATTATAAGGTTAT 479
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 AAACGTTTAATCTTGTTCCGAGGGAGAGTTCTTTGGCTTTTGGAATGATTATAAGGTTAG 478
Query 480 CTCCTGATTTGGTGGATGAGATCAAGCGTGTGGAGGCACAAGGTGGAGCTGCCAAGATCA 539
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 479 CTCCTGATTTGGTCGAGGAGATCAAGCGTGTGGAGGCACAAGGTGGAGCTGCGAAGATCA 538
Query 540 AGTTCGATGCGTTTCCTAACAATAGCACTGAGAATATAATTAATGTTGGTGGAAAGGAGT 599
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 AGTTCGATGCGTATCCTAACAATAGCACTGGGAATATAATTAATGTTGGTGGAAAGGAGT 598
Query 600 TCAAATTTACTTGGTCTGGGGAGAAAGGTGAGTTATGTGATATATATGAAGAACATCAAA 659
||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 599 TCAGATTTACTTGGTCTAGGGAGCGTGGTGATTTATGTGATATATATGAAGAACATGAAA 658
Query 660 GTGGTGAAGATGGAAATGGTTTGCTGATTGAGGCTGGATGTGCTTGGCGAAAATTGAACG 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GTGGTGAAGATGGAAATGGTTTGCTGATTGAGGCTGGATGTGCTTGGCGAAAATTGAACG 718
Query 720 TCCTACGAACTCTAGATGAGTCAACCACAAGCCATATGAAGATGCGCTCAGTTGAAGCTG 779
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TCCTGCGAACTCTAGATGAGTCAACCACAAGCCATATGAAGATGCGCTCAGTTGAAGCTG 778
Query 780 AACAGAGAACCAAATCACGCAAGGCCATTGTTTTAGATCCTGGGAATCCATCAGTAACGA 839
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 779 AACAGAGAACCAAATCACGCAAGGCAATTGTTTTAGATCCTGGGAATCCATCATTAACGA 838
Query 840 AGCAGTTAGCTCATGCTGAAGGAAGTCCATGGAGAATGTCAAATAAACAGAAGAAGGAAC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AGCAGTTAGCTCATGCTGAAGGAAGTCCATGGAGAATGTCAAATAAACAGAAGAAGGAAC 898
Query 900 CTCCACCTAAGAAGCGGAAAGTTGATCCACCACCAGTTCCAGTCGGAGGTCCAAAGCCTT 959
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 CTCCACTTAAGAAGCGGAAAGTTGATCCACCTCCAGTTCCAGTCGGAGGTCCAAAGCCTT 958
Query 960 CTTTCAGACCAGGGGCTTCTACCCCTACTATGAAAAATAGGCTATCAGCTTCACCCGGAC 1019
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 959 CTTTCAGACCAGGGGCTTCTACTCCTACTGTGAAAAATAGGCTATCAGCTTCACCGGGAC 1018
Query 1020 CGTCTCCTAGTAATCAATACAATACCCCTCCATATGGGATTGGGAATATGGCTAAAACTC 1079
| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1019 CCTCTCCTAGTAATCAATTTAATACCCCTCCATTTGGGATTGGGAATATTGCTAAAACTC 1078
Query 1080 ATGCAGCTAACGAGAATGTCACACCAGTCCAGACAAAGGGCAGAGTGAACATGATCGAAA 1139
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||
Sbjct 1079 ATACAGCTAACGAGAATGTCACACCAGTCCAGACAAAGGGCAGAGAGAAGATGCTTGAAA 1138
Query 1140 AAGAACCATCAGCCTGGAAAAATAATGTATTAAGGGACACATCTGGGCGCGAAGCAATTA 1199
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1139 GAGAACCATCAACCTGGAAAAATAATGCATTAAGGGACACATCTGGGCGCGAAGCAACCA 1198
Query 1200 ATGTTAATAAAGAAATTGACTTGCAGTCACTGCTCGTTGATATCCTAAAAGAGGCTCCAA 1259
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 ATGTTAGTAAAGAAATTGACTTGCAGTCACTGCTGGTTGATATCCTAAAAGAGGCTCCAA 1258
Query 1260 TGAGCTTGAAGGCTTTAGAGAAAGCTGTTGGAGATA-AAGTTCCTAATCCCGCAAAGAAG 1318
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||
Sbjct 1259 TGAGCTTGAAGGCTTTAGAGAAAGCAGTTGGAGATAGAA-TCCCTAATGCCGCAAAGAAG 1317
Query 1319 ATTGAACCAATTTTGAAAAGGATCGCAAATTTCCAAGCTCCAAGGTATTTCTTAAAACCA 1378
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 ATTGAACCAATTTTGAAAAAAATCGCAAATTTCCAAGCTCCAAGGTATTTCTTAAAACCA 1377
Query 1379 GAAGCAGAGTTGGAAAGCTATAAAAAACATTCACCTGATAGCGGAAGTTCACCTGAACAC 1438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1378 GAAGCAGAGTTGGAAAGCTATAAAAAACATTCACCTGATAACGGAAGTTCACCTGAACAC 1437
Query 1439 CAACAATTGCTGCCAG-TCACTGAGTGCAGTCGCGATCAGTTACCTGTTCCAGGAAGAAA 1497
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1438 CAACAATTGCTGCC-GATCACTGAGTGCAGTCGCGATCAGTTACCTGTTCCAGGGGGAAA 1496
Query 1498 TAACACAGAGAAATTTTCTTTGTGCGAGCAGAACGGAGAAGGTTCACTAGACTGTTTACC 1557
||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1497 TAACATGGAGAAAATTTCTTTGTGCAAGCAGAACGGAGAAGGTTCACTAGACTGTTTAGC 1556
Query 1558 TGTGCATCTAGTAGAGCAACTGAGTACGCAGGAAAATGTTGACATTGAGCATCATTCACC 1617
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 TGTGCATCTAGCAGAGCAATTGAGTACGCAGGAAAATGTTGACATTGAGCATCATTCACC 1616
Query 1618 TGGTATTTTTCATGAGGAAAAACGATCTGAGAATAGAGAAGCCCAGGCTCGTAGCTCTAG 1677
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1617 TGGTCTTTTTCATGAGGAAAAACGATCCGAGAATAGTGAAGGCCAGGCTCGTAGCTCTAG 1676
Query 1678 TGATAGTGACAGTGATAGTGATAACAGTGACAGTGGGAGTGACAGTAAAAGTGCAGCTGG 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 TGATAGTGACAGTGATAGTGATAACAGTGACAGTGGGAGTGACAGTAAAAGTGCAGCTGG 1736
Query 1738 AAGTGACAGTGGGAGCAGCAGTGATAGTGAGGCTTCTTCTAACAGTAAGGACGGTTCTGA 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 AAGTGACAGTGGGAGCAGCAGTGATAGTGAGGCTTCTTCTAACAGTAAGGACGGTTCTGA 1796
Query 1798 TGAGGACGTGGATATCATGAGTGATGGTGACAGAGAGCCTCTACTGACAACACAGTCC-C 1856
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1797 TGAGGACGTGGATATCATGAGTGATGGTGACAGAGAGCCTCTACTGACAATACAGTCCGC 1856
Query 1857 TTGAACAGG-ATGCAATTGATCTCCCAGGTCATGGTTCTAGTGCAGTTGAAATCGAGGGT 1915
| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 T-GAACAGGGA-GCAATTGATCTCCCAGGTCATGGTTCTAGTGCAGTTGAAATCGAGGGT 1914
Query 1916 CATAATTCTGATGCTGTTGACATTGACGGTCATGATTCTGATGCAGTTGATATTGATGGT 1975
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1915 CATGATTCTGATGCTGTTGACATTGACGGTCATGATTCTGATGCTGTTGATATTGATGGT 1974
Query 1976 CATGGGTCTGATACAGTTGATGTCGAGGGGAACAGTTCAGATGAGGGTCATGGTTCTGAC 2035
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 CATGGGTCTGATGCAGTTGATGTCGAGGGGAACAGTTCAGATGAGGGTCATGGTTCTGAA 2034
Query 2036 GCTGACAGaaaaaaaaaT-TCTGATAATAACTGGAAAATGGAAACAACAACTGGTACCAG 2094
||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 2035 GCTGACAGAAAAAAAC-TCTCTGGTAATAGCTGGAAAACAGAAACAGCAACTGGTACCAG 2093
Query 2095 TCCCACTGCAAATGGAGAAGTTGGCATTTCAGGGCAGGAACATTTTACTTCTGGTCACGA 2154
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2094 TCCCCCTGCAAATGAAGAAGTTGGCATTTCAGGGCAGGAACATTTTGCTTCTGGTCACGA 2153
Query 2155 CAACCTACGAGAACGCCAAAATTTTATTGGACAGTTGTTTGATGACACAGAGAATACAAC 2214
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154 CAACCTACGAGAGCGCCAAAATTTTATTGGACAGTTGTTTGATGACACAGAGAATACAAC 2213
Query 2215 AAAGAATAACTTTAAAAATGACAAACGTGACATCTCCGAGAGGCTGGGGAAAGACCAGAA 2274
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2214 AAAGGATAACTTTAAAAATGACAAACGTGACATCTCCGAGAGGCTGGCAAAAGACCAGAA 2273
Query 2275 CCAAAAAGCCCTTGATTTTGAGCACTACAGTCAGAAATCAGCAC-ATGAGAAAAATAGAA 2333
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2274 CCAAAAAGCCCTTGATTTTGAGCACTACAGTCAGAAATCAGCACGA-GAGAAAAATAGAA 2332
Query 2334 AATCCCAGAGCTGCAATCAGTTATCTGCCGTAAGTAAAGATTCACAGCATTCAGAGCTCA 2393
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2333 AATCCCAGAGCTGCAATCAGTTACCTGCCATAAGTAAAGATTCACAGCGTTTAGAGCTCA 2392
Query 2394 AGTATGATGCCGAACTTCGCAACGCTTCTGCCAGTCAAACGATCGATCCACTTAGAGGAC 2453
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2393 AGTATGATGCAGAACTTCGCAACGCTTCTGCGAGTCAAACGATAGATCCACTTAGAGGAC 2452
Query 2454 TTCTGAAGTCATCTATTGAAAAGTCGAATAGACATGGTAAATCAAACAAACATTCTGATG 2513
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 TCCAGAAGTCATCTATTGAAAAGTCGAATAGACATGGTAAATCAAACAAACATTCTGATG 2512
Query 2514 CCTTAGGAAATGTTCGTAAATCTGACAAAGGGGACCATTTTCCACTTGAAATGCTTTCTA 2573
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 2513 CCTTGGGAAATGTTCGTAAATCTGACGAAGGGGACCATTTTCCGCATGAAATGCTTTCTA 2572
Query 2574 GTCGCTCAGGAAAGGCCTTCAGGGACAATCAGAGAGATGATGTTCATTTGAAAAATAAGT 2633
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2573 GTCGGTCAGGAAAGGCCTTCAGGGACAATCAAAGAGATGATGTTCATTTGAAAAATAAAT 2632
Query 2634 TTCCAAGGAATAAAAAAGATGGTGAGTCAGCCATTCGACCTTCATTACCTACCGAGACAT 2693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2633 TTCCAAGGAATAAAAAAGATGGTGAGTCAGCCATTCGACCTTCGTTACCTACCGAGACAT 2692
Query 2694 CCGATAGAAAGCCCGATGAACTGGATGGAAGTGACAAGGATCCCAAGAATGTTTCAGGCT 2753
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2693 CCGATAGAAAGCACGGTGAACTGGATGGAAGTGACAAGGATCCCAAGAATGTTTCAGGCT 2752
Query 2754 TGAGCATAGGTTCTTCTCCCTTAGATAGCCAGAGAACATATTTGGCGAAATTACCTAAGG 2813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2753 TGAGCATAGGTTCTTCTCCCTTAGATAGCCAGAGAACATATTTGGCGAAATCACCTAAGG 2812
Query 2814 GAAATGGACCTGTCCTCCAAAAACAAGTTTCGGAATTGGAGTTGGGTGAACTCCCTGAGC 2873
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AAAATGGATCTGTCCTCCAAAAACAAGTTTCGGAATTGGAGTTGGGTGAACTCCCTGAGC 2872
Query 2874 CATTGGGTGAAGATACAGCATTGAAGCCGA-TCGAAGAGAAAACTTCGTTTAGGCAGTCA 2932
||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 CATTGAGTGAAGATACAGCATTGAAGCC-ACTCGAAGAGAAAACTTCGTTTAGGCAGTCA 2931
Query 2933 AATTTAAAACCAAGCACTTCAGAGAAATTGGGTATTGACTCGGATAAACGAAGGTCTAAA 2992
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 AATTTAAAACCAATCACTTCAGAGAAATCGGGTATTGACACGGATAAACGAAGGTCTAAA 2991
Query 2993 AAATCTGACTCAAAAAAGGCAGCTCCTCCACATACAGTAAATGGTAGC-AA------C-- 3043
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | || |
Sbjct 2992 AAATCTGACTCAAAAAAGGCAGCTCCTCCACATGCAGTCAATTGTATCGAAGAATTGCCC 3051
Query 3044 GAACACGTTGTTGAAGATTCAGAAAGATCCCAAAAGTGGGCTTTGCAGTCACATGGGCAG 3103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3052 GAACACGTTGTTGAAGATTCAGAAAGATCCCAAAAGTGGGCTTTGCAGTCACATGGGCAG 3111
Query 3104 AACCTTACAGGTACAGATACTGAAATCAGCTCACAGAATAAAAATTTAGAAGATGCAGCT 3163
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3112 AACCTTACAGGTACAGATACTGAAATCGGCTCACAGAATAAAAATTTAGAGGATGCAGCT 3171
Query 3164 TATAAATCTAGACAAAAAGATAGTAGAGCAAGAGTAGGGAACAGTGTGGAAGGTTATGGA 3223
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3172 TATAAATCCAGACAAAAAGATAGTAGAGCAAGAGTAGGAAACAGTGTGGAAGGTTATGGA 3231
Query 3224 GAAACAAACaaaaaaaCGCCTGTTGTAAAGCATGGCTCCAAACGAGCATCCACATCCCGC 3283
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3232 GAAACAAACAAAAAAACGCCTGTTATAAAGCATGGCTCCAAACGAGCATCCACATCCCGC 3291
Query 3284 TCTTCAAGGGAGAGCAAAAGACAT-TCGTCTGTCTCAAATTCAATCAATGGACACAAAGA 3342
|| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3292 TCATCAAGGGAGAGCAAAAGACATGT-GTCTGTCTCAAATTCTATCAATGGACACAAAGA 3350
Query 3343 TGCAACTTCAATACCAGGTGGCAGTGTTGTCCGGGAGAAACAAATGACATCTTTCGGTGA 3402
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3351 TGCAACTTCAATACCAGGTGACAGTGTTGTCCGGGAGAAACGAATGACATCTTTCGGTGA 3410
Query 3403 AGAAGACTCTTCTTATTTGAAATACGAGAAAGCTTCTCCTGAGCTTAAGGGACCTATTAG 3462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3411 AGAAGACTCTTCTTATTTGAAATACGAGAAAGCTTCTCCTGAGCTGAAGGGACCCATTAG 3470
Query 3463 TGATCATTTGCAGTATAAAGCCTATATGCAGGAGTATAATGATAAATATGATAGCTACCA 3522
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3471 TGATCATTTGCAGTATAAAGCCTACATGCAGGAATATATTGATAAATATGATAGCTACTG 3530
Query 3523 CTCCATTAACAAGATATTAGAGAGCCACAGAAATGACTTTCAAAAGTTGGGGCAAGACCT 3582
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3531 CTCCATTAACAAGACATTAGAGAGCCACAGAAATGACTTTCAAAAGTTGGGGCAAGACCT 3590
Query 3583 TGGGTTTGCAAAAGGAAGGGATGTGGAGAGATATAACAAAATTGTGGAGCAGATAAAGGA 3642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3591 TGGGTTTGCAAAAGGAAGGGATGTGGAGAGATATAACAAAATTGTGGAGCAGATAAAGGA 3650
Query 3643 ATCTTATTGCAAATATGGGGAGAGACACAAACGTTTGAAGAAAGTATTTGTTGTTCTCCA 3702
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3651 AGCTTATTGCAAATATGGGGAGAGGCACAAACGTTTGAAGAAAGTATTTGTTGTTCTCCA 3710
Query 3703 CGAAGAATTGAAGCACCTGAAACAAAGAATGAGAGACTACGCATCATCTCATGGAAAAGA 3762
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3711 CGAAGAATTGAAGGAACTGAAACAAAGAATGAGAGACTATGCATCATCTCATGGAAAAGA 3770
Query 3763 TTGATGGAAACTGGAACCAAAA-CTCTCCTTTGGTGGAGTCAT-CTT-GTTGAAACATTA 3819
|||||||||||||||||||||| ||||| | || || | | ||||| ||
Sbjct 3771 TTGATGGAAACTGGAACCAAAAACTCTC-T--GGACCTCACACGCAGAGGTGAAA-AT-- 3824
Query 3820 GCTCTGTTTTTCTTTCTTT---CTTGTGAAATTAGAAATGATTCATAGGCCCAATTTTGT 3876
| | | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3825 GTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTTGTGAAATTAGAAATGATTCATAGGCCCAATTTTGT 3884
Query 3877 GTGAGTTGTACTTAGG-AGGACCTTTGGTAGATTTTATTCTTGT-TGCAGTTGGTTTAGT 3934
|||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | || | |||||||||||||
Sbjct 3885 GTGAGTTGTACTTAGGGAGGAGCTTTGATAGATTTT-TG-TTACATACAGTTGGTTTAGT 3942
Query 3935 TGGAGC-GCTCG-ATAAACGAATATGTACATACATGGGTATCAAGATCAATGTAGATTCT 3992
|||||| | ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3943 TGGAGCAG-TCGGATAAACTAAAATGTACAT----GGGTATCAAGATCAATGTAGATTCT 3997
Query 3993 TCTGGCTCT--GCTTTAATTTAACTTTGATAA 4022
||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3998 TCTGGCTCTCTGCTTTAATTTAACTTTGATAA 4029
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 152154176854
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5