BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G21430.2 Length=3739 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg479664 jgi|Araly1|479664|fgenesh2_kg.3__2365__AT3G21430.2 6072 0.0 > Ahg479664 jgi|Araly1|479664|fgenesh2_kg.3__2365__AT3G21430.2 Length=3734 Score = 6072 bits (3288), Expect = 0.0 Identities = 3595/3744 (96%), Gaps = 17/3744 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3 CAATCTCTCTTTCGATCGCTCAAAAAACCCGAAGAAGCTCTGATCTGTTCATATTCCGAT 62 ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CAATCGCTCCTTCGATCGCTC--AAAACCCGCAGAAGCTCTGATCTGTTCATATTCCGAT 58 Query 63 CTCTTACCGGATTTCTCTAATTTCTCTCTGTAATTTCTTCTTCAAGTCCCGGCGATGGCT 122 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 59 CTCTTCCCGGATTTCTCCAATTTCTCTCTGTAATTTATTCTTCAAGTCCCGGCGATGGCT 118 Query 123 TCCGAGTGATTTTGGATT-TGTGTAGGTAACAGAAGAGCTTTAACTTATGGCGCCCTCAA 181 ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct 119 TCCAAGTGATTTTGGATTCT-TGTAGGTAACAGAAGAAC-TTAACTTATGGCGCCCTCAA 176 Query 182 GATCAAAGAAATCTAAGTACAAGAAGAAGCCTCGTGCTAAAGCTGTTTCTCCTCACAAAG 241 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 177 GATCAAAGAAATCTAAGTACAAGAAAAAGCCCCGTGCCAAAGCTGTTTCTCCTCACAAAG 236 Query 242 ACGAAGAAAGTATGAGCAAAACTAAACAACGGAAGAGGAAGTTGTCGGACATGTTAGGTC 301 ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| Sbjct 237 ACGAAGATAGTATGAGCAAAACCAAACAACGGAAGAGGAAGCTGTCAGATATGTTAGGTC 296 Query 302 CTCAGTGGAGCAAGGAAGAGTTAGAGCGCTTTTATGAAGGATACCGCAAATTCGGAAAAG 361 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 297 CTCAGTGGAGCAAGGAAGAGTTGGAGCGCTTTTATGAAGGATACCGCAAATTCGGAAAAG 356 Query 362 AATGGAAAAAGGTTGCTGGATTTGTACATAGCCGTTCTGCAGAAATGGTAGAGGCCTTAT 421 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 357 AATGGAAAAAGGTGGCTGCATTTGTACATAGCCGTTCTGCAGAAATGGTAGAGGCCCTAT 416 Query 422 ACACTATGAATAAGGCTTACTTGTCTCTTCCGGAAGGCACTGCATCTGTGGTTGGCCTAA 481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 417 ACACTATGAATAAGGCTTACTTGTCTCTTCCGGAAGGCACTGCTTCTGTGGTTGGCCTAA 476 Query 482 CTGCAATGATGACGGATCACTACTCTGTTCTGCATGGAGGAAGTGACAGTGAGCAGGAAA 541 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 477 ATGCAATGATGACGGATCACTACTCTGTTTTGCATGGAGGAAGTGACAGTGAGCAGGAAA 536 Query 542 ATAATGAAGGCATTGAAACTCCGAGGTCAGCCCCTAAGCGCTCTAGAGTAAAATCCTCAG 601 | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 537 ACAATGAAGGTATTGAAACTCTGAGGTCAGCCCCTAAGCGCTCTAGAGTAAAATCCTCAG 596 Query 602 ATCATCCCTCTATAGGACTAGAGGGTCTGTCTGACCGCTTACAATTTAGGTCCTCCTCAG 661 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 597 ATAATCCCTCTATAGGACTAGAGGGTCTGTCTGACCGCTTGCAATTTAGGTCCTCCTCAG 656 Query 662 GCTTCATGCCATCGCTGAAGAAGAGACGTACTGAGACTATGCCTCGTGCTGTTGGAAAAA 721 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 657 GCTTCATGCCGTCACTGAAGAAGAGACGTACTGAGACTATGCCTCGTGCTGTTGGAAAAA 716 Query 722 GGACTCCTAGAATTCCTATCTCATACACCCTTGAGAAGGATACTAGGGAAAGATATTTAT 781 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 717 GGACACCTAGAATTCCTATCTCATATACCCTTGAGAAGGATACTAGGGAAAGATATTTAT 776 Query 782 CACCTGTTAAGAGAGGTTTAAATCAGAAGGGGGATGATACTGATGATGATATGGAACATG 841 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 777 CACCTGTTAAGAGAGGTCTAAATCAGAAGGGGGATGATACTGATGACGATATGGAACATG 836 Query 842 AGATAGCATTAGCATTGGCTGAGGCTTCACAACGAGGTGGCTCTACAAAGAACTCCCACA 901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 837 AGATAGCATTAGCATTGGCTGAGGCTTCACAACGAGGTGGCTCTACAAAGAATTCCCACA 896 Query 902 CACCAAATAGAAAAGCAAAGATGTACCCCCCTGATAAAAAGGGTGAAAGAATGCGTGCCG 961 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 897 CACCAAATAGAAAAGCAAAGATGTACCCCCCTGATAAAAAGGGTGAAAGAATGCGTGCTG 956 Query 962 ATATTGACTTGGCGATTGCCAAGCTTCATGCCACTGATATGGAAGATGTCCGCTGTGAAC 1021 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 957 ATATTGACTTGGCGATTGCCAAGCTTCATGCCACTGATATGGAAGATGTCCGATGTGAAC 1016 Query 1022 CAAGCTTAGGAAGCACTGAAGCTGATAATGCGGATTATTCTGGAGGTAGAAATGACTTGA 1081 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 CAAGCTTAGGAAGCACTGAAGCTGATAATGGGGATTATTCTGGAGGTAGAAATGACTTGA 1076 Query 1082 CACATGGAGAAGGTTCTAGTGCCGTGGAAAAGCAGCAAAAAGGAAGAACATACTATAGGA 1141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 TGCATGGAGAAGGTTCTAGTGCCGTGGAAAAGCAGCAAAAAGGAAGAACATACTATAGGA 1136 Query 1142 GGAGAGTAGGCATTAAAGAAGAAGATGCAAAAGAAGCCTGCAGTGGTACAGATGAAGCAC 1201 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1137 GGAGATTAGGCATTAAAGAAGAAGATGCAAAAGAAGCCTGCAGTGGTACAGACGAAGCAC 1196 Query 1202 CAAGCTTAGGCGCTCCCGATGAGAAATTTGAACAAGAAAGGGAAGGGAAGGCTTTGAAAT 1261 |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct 1197 CAAGCTTAGGGGCTCCCGATGAGAAATTTGAACCAGAAAGGGATGGGAAGTCTTTGAAAT 1256 Query 1262 TCACATATAAAGTTTCAAGGAGaaaaagtaaaaaaaGTCTTTTTACTGCAGATGAAGACA 1321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1257 TCACATATAAAGTTTCAAGGAGAAAAAGTAAAAAAAGTCTCTTTACTGCAGATGAAGACA 1316 Query 1322 CAGCATGTGATGCTCTCCATACGCTGGCAGATCTATCGCTGATGATGCCTGAAACTGCCA 1381 ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 CAGCATGTGATGCTCTCCAGACGCTGGCAGATTTATCGCTGATGATGCCTGAAACTGCCA 1376 Query 1382 CTGATACTGAGTCATCAGTTCAAGCTGAGGAAAAGAAAGCTGGAGAAGCTTATGTTTCAG 1441 | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1377 CAGATACTGAGTCATCAGTTCAAGCTGAGGAAAAGAGAGCTGGAAAAGCTTATGTTTCAG 1436 Query 1442 ATTTTAAAGGGACTGATCCGGCATCCATGTCTAAAAGTAGTTCTCTTAGAAACTCCAAAC 1501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 ATTTTAAAGGGACTGATCCAGCATCCATGTCTAAAAGTAGTTCTCTTAGAAACTCCAAAC 1496 Query 1502 AGAGAAGATACGGCAGCAATGACCTTTGTAACCCTGAACTCGAGAGAAAAAGTCCAAGTA 1561 ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||| |||||||||| Sbjct 1497 AGAGAAGATCCGGCACCAATGACCTTTGTGATACTGAACCCGAGCGAAAGAGTCCAAGTA 1556 Query 1562 GTTCTTTAATCCAAAAGAGACGGCAGAAAGCATTACCAGCTAAAGTAAGAGAAAATGTTC 1621 | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1557 GCTCTTTAATCCGAAAGAGACGGCAGAAAGTATTACCAGCTAAAGTAAGAGAAGATGTTC 1616 Query 1622 TTAAAGATGAGCTTGCTGCAAGCTCACAAGTCATAGAGCCTTGTAATAGCAAGGGAATAG 1681 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 1617 TTAAAGATGAGCTTGCTGCAAGCTCAAAAGTCATAGAGCCTAGTAATAACAAGGGAATAG 1676 Query 1682 GTGAGGAATATAAGCCTGTTGGGAGAGGTAAACGGTCCGCAAGTATTCGAAACTCACATG 1741 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 GTGAGGAAAATAAGCCTGTTGGTAGAGGTAAACGGTCCGCAAGTATTCGAAACTCACATG 1736 Query 1742 AAAAGAAATCTGCCAAATCTCATGATCATACTTCGTCAAGTAACAACATAGTAGAAGAAG 1801 ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1737 AAAAGAAGTCTGTCAAACCTCATGATCGTACTTCGTCAAGTAACAACATAGTAGAAGAAG 1796 Query 1802 ATGAGTCAGCTCCATCAAATGCAGTCATTAAAAAACAAGTTAACTTGCCAACTAAAGTTA 1861 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1797 ATGAGTCAGCTCCATCAAATGCAGTCATTAAAAAACAAGTTAACTTGCCAACTAAAGTTA 1856 Query 1862 GGAGCAGAAGAAAGATAGTAACTGAGAAACCTCTAACTATTGATGACGGGAAAATTTCTG 1921 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1857 GGAGCAGAAGAAAGATAGTAACTGAGAAACCTCTAACTATTGATGACGGGAAAATTTCTG 1916 Query 1922 AGACTATAGAGAAGTTTTCGCATTGCATTTCTAGTTTCCGAGCACGGAGATGGTGTATTT 1981 ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct 1917 AGACTCTAGAGAAGTTTTCGCATTACACATCTAGTTTCCGAGCACGAAGATGGTGTCTTT 1976 Query 1982 TTGAGTGGTTCTACAGTGCAATTGACTATCCATGGTTTGCCAGACAAGAGTTTGTTGAGT 2041 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1977 TTGAGTGGTTCTACAGTGCAATTGACTATCCATGGTTTGCCAGACAAGAGTTTGTTGAGT 2036 Query 2042 ATTTGGATCATGTAGGGTTGGGTCATGTTCCTAGATTAACTCGCGTTGAATGGGGTGTCA 2101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2037 ATTTGGATCATGTAGGGTTGGGTCATGTTCCTAGATTAACTCGCGTTGAATGGGGTGTCA 2096 Query 2102 TAAGGAGTTCTCTTGGGAAACCAAGGCGATTTTCTGAACAGTTTTTGAAGGAGGAAAAAG 2161 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2097 TAAGGAGTTCTCTTGGGAAACCGAGGCGATTTTCTGAACAGTTTTTGAAGGAGGAAAAAG 2156 Query 2162 AAAAGCTATACCTATACAGGGACTCTGTAAGAAAACATTATGATGAACTAAACACGGGCA 2221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2157 AAAAGCTATACCTATACAGGGACTCTGTAAGAAAACATTATGATGAACTAAACACGGGCA 2216 Query 2222 TGAGGGAAGGACTTCCAATGGATTTGGCCCGGCCTCTAAATGTTTCACAGAGAGTCATTT 2281 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2217 TGAGGGAAGGACTTCCAATGGATTTGGCCCGGCCTCTTAATGTTTCACAGAGAGTCATTT 2276 Query 2282 GCCTGCATCCAAAGTCAAGAGAGATTCATGACGGCAATGTCCTAACTGTTGATCACTGTA 2341 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2277 CCCTGCATCCAAAGTCAAGAGAGATTCATGACGGCAGTGTCCTAACTGTTGATCACTGTA 2336 Query 2342 GGTACCGGATTCAGTTTGACAACCCTGAATTAGGGGTAGAATTTGTTAAGGATACTGAAT 2401 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2337 GGTACCGGATTCAGTTTGACCACCCTGAATTAGGGGTAGAATTTGTTAAGGATACTGAAT 2396 Query 2402 GCATGCCACTGAATCCTCTAGAAAACATGCCAGCATCGCTGGCAAGGCACTATGCTTTCT 2461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2397 GCATGCCACTGAATCCTCTAGAAAACATGCCAGCATCGCTGGCAAGGCACTATGCTTTCT 2456 Query 2462 CAAATTATCACATTCAGAATCCCATTGAGGAGAAAATGCATGAACGGGCAAAGGAAAGCA 2521 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2457 CAAATTATCACATTCAGAATCCCGTTGAGGAGAAAATGCATGAGCGGGCAAAGGAAAGCA 2516 Query 2522 TGCTGGAAGGATATCCCAAACTTTCGTGTGAGACAGGCCATCTCTTGTCCTCTCCAAATT 2581 || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| Sbjct 2517 TGTTGGAAGGATATCCCAAACTTTCTTGTGAGACTGGCCATCTCTTACCCTCACCAAATT 2576 Query 2582 ATAACATTAGCAATTCACTAAAGCAGGAAAAGGTAGATATCTCAAGTTCAAATCCACAAG 2641 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2577 ATAACATTAGCAATTCACTAAAGCAGGAAAAGGTAGATATCTCAAGTTCAAATCCACAAG 2636 Query 2642 CTCAAGACGGAGTTGATGAGGCTCTTGCTTTACAATTGTTTAATTCTCAGCCCTCAAGTA 2701 ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2637 CTCAAGATGGAGTCGATGAGGCTCTTGATTTACAATTGTTTAATTCTCAGCCCTCAAGTA 2696 Query 2702 TTGGACAAATCCAGGCAAGAGAAGCTGATGTCCAAGCTCTTTCTGAACTAACGCGTGCGC 2761 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2697 TTGGACATATCCAGGCAAGAGAAGCTGATGTCCAAGCTCTTTCTGAACTAACACGTGCGC 2756 Query 2762 TTGACAAGAAGGAGCTAGTTTTGAGGGAGCTAAAATGCATGAACGACGAGGTTGTGGAAA 2821 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2757 TTGACAAGAAGGAGCTAGTTTTGAGGGAGCTAAAATGCATGAACGACGAGGTTGTGGAAA 2816 Query 2822 GTCAGAAAGATGGACATAATAATGCCCTAAAGGATTCTGAATCTTTTAAGAAACAATATG 2881 |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2817 GTCAGAAAGATGGACATAAT---GCTCTGAAGGATTCTGAATCTTTTAAGAAACAATATG 2873 Query 2882 CAGCAGTTCTCTTTCAGCTAAGCGAAATCAATGAGCAGGTTTCATTGGCACTTCTTGGCT 2941 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2874 CAGCAGTTCTCTTTCAGCTAAGCGAAATCAATGAGCAGGTTTCATTGGCACTTCTTGGCT 2933 Query 2942 TGAGGCAACGAAATACTTACCAGGAGAATGTACCATATTCATCAATAAGACGCATGAGTA 3001 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct 2934 TGAGGCAACGAAATACTTACCAGGAGAATGTACCATATGCATCAATAAAACGCATGAATA 2993 Query 3002 AATCAGGGGAACCTGATGGTCAGTTGACATACGAAGACAATAATGCATCAGACACTAATG 3061 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||| Sbjct 2994 AATCAGGGGAACCTGATGGTCAGTTGACCTACGTAGACAATTATGTATCTGACACTAATG 3053 Query 3062 GATTCCATGTGTCTGAGATCGTCGAAAGTTCTAGAATAAAAGCACGGAAAATGGTATACA 3121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3054 GATTCCATGTGTCTGAGATCGTCGAAAGTTCTAGAATAAAAGCACGGAAAATGGTAGACA 3113 Query 3122 GAGCTGTACAGGCATTGG-AGTTACTGAGAAAAGACGAAAATAATAATGTAAATATGGAA 3180 |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3114 GAGCTGTACAGGCATTGGCA-TTACTGAGGAAAGACGAAAATAATAATGTAAATATGGAA 3172 Query 3181 GAAGCCATTGATTTTGTAAATAATCAGCTCTCAATAGATCAAACAGAAGGATCATCAGTC 3240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3173 GAAGTCATTGATTTTGTAAATAATCAGCTCTCAATAGATCAAACAGAAGGATCATCAGTC 3232 Query 3241 CAGCAAACACAAGGTGGCCAGGATCAGCGTCTTCCCTCTACACCAAATCCACCTAGCTCA 3300 |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3233 CAGCAAACACAAGGTGCCCAGGATCAGCGCCTTCCATCTACACCAAATCCACCTAGCTCA 3292 Query 3301 ACTCCTGCCAATGATTCCCACCTAAA-CCAACCCGATCAAAATGACCTGCAAGTCCCGTC 3359 |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3293 ACTCCTGCCAATGATTCCCACCTAAATCCA-CCCGATCAAAATGACCTGCAAATCCCGTC 3351 Query 3360 CGATCTTGTGTCCCGATGTATCGCTACATTGCTTATGATTCAGAAATGTACAGAGAGGCA 3419 || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3352 TGAACTTGTGTCCCGATGTATGGCTACATTGCTTATGATTCAGAAATGTACAGAGAGGCA 3411 Query 3420 ATTCCCACCAAGTGAAGTAGCCCAGGTTCTAGACTCGGCAGTGGCGAGTTTACAGCCTTG 3479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 3412 ATTCCCACCAAGTGAAGTGGCCCAGGTTCTAGACTCTGCGGTGGCGAGTTTACAGCCTTG 3471 Query 3480 CTGCTCGCAGAACCTTCCGATCTATACAGAGATTCAGAAGTGCATGGGAATCATAAGAAA 3539 |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3472 CTGCTCACAAAACCTTCCTATCTATACAGAGATTCAGAAGTGCATGGGAATCATAAGAAA 3531 Query 3540 CCAGATTCTAGCCCTCGTACCCTCCTAAAGTAAGAATCCTAAAACCATAACTT-AACCTT 3598 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3532 CCAGATTCTAGCCCTCGTACCCTCCTAAAGTAAGACTCCTAAAACCATAACTTTAACCTT 3591 Query 3599 TGTGTCTCTTCATAATGCTTGTTTCTCTTTGTAAAATCA-ATATCTCCTTATAGAAAATC 3657 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 3592 TGTGTCTCTTCATAGTGCTTGTTTCTCTT-GTAAAATCCCATATCTCCTTATAGGAAATC 3650 Query 3658 CTTTTATATAC-CC-CATTTATTTGGAGTGACTCACAACAGTTTCTCGATTTCACATTTA 3715 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| Sbjct 3651 CTTTTATATATACCTCATTTATTTGGAGTGACTCACAAAACTTTTTCGATTTCACATTTA 3710 Query 3716 TTTATATGTAACACATCATTTGTT 3739 |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3711 TTTATATGTAACACATCATTTGTT 3734 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 141269710976 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5