BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G21430.2
Length=3739
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg479664 jgi|Araly1|479664|fgenesh2_kg.3__2365__AT3G21430.2 6072 0.0
> Ahg479664 jgi|Araly1|479664|fgenesh2_kg.3__2365__AT3G21430.2
Length=3734
Score = 6072 bits (3288), Expect = 0.0
Identities = 3595/3744 (96%), Gaps = 17/3744 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CAATCTCTCTTTCGATCGCTCAAAAAACCCGAAGAAGCTCTGATCTGTTCATATTCCGAT 62
||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CAATCGCTCCTTCGATCGCTC--AAAACCCGCAGAAGCTCTGATCTGTTCATATTCCGAT 58
Query 63 CTCTTACCGGATTTCTCTAATTTCTCTCTGTAATTTCTTCTTCAAGTCCCGGCGATGGCT 122
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 CTCTTCCCGGATTTCTCCAATTTCTCTCTGTAATTTATTCTTCAAGTCCCGGCGATGGCT 118
Query 123 TCCGAGTGATTTTGGATT-TGTGTAGGTAACAGAAGAGCTTTAACTTATGGCGCCCTCAA 181
||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 119 TCCAAGTGATTTTGGATTCT-TGTAGGTAACAGAAGAAC-TTAACTTATGGCGCCCTCAA 176
Query 182 GATCAAAGAAATCTAAGTACAAGAAGAAGCCTCGTGCTAAAGCTGTTTCTCCTCACAAAG 241
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 GATCAAAGAAATCTAAGTACAAGAAAAAGCCCCGTGCCAAAGCTGTTTCTCCTCACAAAG 236
Query 242 ACGAAGAAAGTATGAGCAAAACTAAACAACGGAAGAGGAAGTTGTCGGACATGTTAGGTC 301
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 237 ACGAAGATAGTATGAGCAAAACCAAACAACGGAAGAGGAAGCTGTCAGATATGTTAGGTC 296
Query 302 CTCAGTGGAGCAAGGAAGAGTTAGAGCGCTTTTATGAAGGATACCGCAAATTCGGAAAAG 361
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTCAGTGGAGCAAGGAAGAGTTGGAGCGCTTTTATGAAGGATACCGCAAATTCGGAAAAG 356
Query 362 AATGGAAAAAGGTTGCTGGATTTGTACATAGCCGTTCTGCAGAAATGGTAGAGGCCTTAT 421
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 357 AATGGAAAAAGGTGGCTGCATTTGTACATAGCCGTTCTGCAGAAATGGTAGAGGCCCTAT 416
Query 422 ACACTATGAATAAGGCTTACTTGTCTCTTCCGGAAGGCACTGCATCTGTGGTTGGCCTAA 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 417 ACACTATGAATAAGGCTTACTTGTCTCTTCCGGAAGGCACTGCTTCTGTGGTTGGCCTAA 476
Query 482 CTGCAATGATGACGGATCACTACTCTGTTCTGCATGGAGGAAGTGACAGTGAGCAGGAAA 541
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 ATGCAATGATGACGGATCACTACTCTGTTTTGCATGGAGGAAGTGACAGTGAGCAGGAAA 536
Query 542 ATAATGAAGGCATTGAAACTCCGAGGTCAGCCCCTAAGCGCTCTAGAGTAAAATCCTCAG 601
| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 ACAATGAAGGTATTGAAACTCTGAGGTCAGCCCCTAAGCGCTCTAGAGTAAAATCCTCAG 596
Query 602 ATCATCCCTCTATAGGACTAGAGGGTCTGTCTGACCGCTTACAATTTAGGTCCTCCTCAG 661
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 597 ATAATCCCTCTATAGGACTAGAGGGTCTGTCTGACCGCTTGCAATTTAGGTCCTCCTCAG 656
Query 662 GCTTCATGCCATCGCTGAAGAAGAGACGTACTGAGACTATGCCTCGTGCTGTTGGAAAAA 721
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 GCTTCATGCCGTCACTGAAGAAGAGACGTACTGAGACTATGCCTCGTGCTGTTGGAAAAA 716
Query 722 GGACTCCTAGAATTCCTATCTCATACACCCTTGAGAAGGATACTAGGGAAAGATATTTAT 781
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 GGACACCTAGAATTCCTATCTCATATACCCTTGAGAAGGATACTAGGGAAAGATATTTAT 776
Query 782 CACCTGTTAAGAGAGGTTTAAATCAGAAGGGGGATGATACTGATGATGATATGGAACATG 841
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 777 CACCTGTTAAGAGAGGTCTAAATCAGAAGGGGGATGATACTGATGACGATATGGAACATG 836
Query 842 AGATAGCATTAGCATTGGCTGAGGCTTCACAACGAGGTGGCTCTACAAAGAACTCCCACA 901
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 837 AGATAGCATTAGCATTGGCTGAGGCTTCACAACGAGGTGGCTCTACAAAGAATTCCCACA 896
Query 902 CACCAAATAGAAAAGCAAAGATGTACCCCCCTGATAAAAAGGGTGAAAGAATGCGTGCCG 961
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 897 CACCAAATAGAAAAGCAAAGATGTACCCCCCTGATAAAAAGGGTGAAAGAATGCGTGCTG 956
Query 962 ATATTGACTTGGCGATTGCCAAGCTTCATGCCACTGATATGGAAGATGTCCGCTGTGAAC 1021
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 957 ATATTGACTTGGCGATTGCCAAGCTTCATGCCACTGATATGGAAGATGTCCGATGTGAAC 1016
Query 1022 CAAGCTTAGGAAGCACTGAAGCTGATAATGCGGATTATTCTGGAGGTAGAAATGACTTGA 1081
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 CAAGCTTAGGAAGCACTGAAGCTGATAATGGGGATTATTCTGGAGGTAGAAATGACTTGA 1076
Query 1082 CACATGGAGAAGGTTCTAGTGCCGTGGAAAAGCAGCAAAAAGGAAGAACATACTATAGGA 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 TGCATGGAGAAGGTTCTAGTGCCGTGGAAAAGCAGCAAAAAGGAAGAACATACTATAGGA 1136
Query 1142 GGAGAGTAGGCATTAAAGAAGAAGATGCAAAAGAAGCCTGCAGTGGTACAGATGAAGCAC 1201
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1137 GGAGATTAGGCATTAAAGAAGAAGATGCAAAAGAAGCCTGCAGTGGTACAGACGAAGCAC 1196
Query 1202 CAAGCTTAGGCGCTCCCGATGAGAAATTTGAACAAGAAAGGGAAGGGAAGGCTTTGAAAT 1261
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 1197 CAAGCTTAGGGGCTCCCGATGAGAAATTTGAACCAGAAAGGGATGGGAAGTCTTTGAAAT 1256
Query 1262 TCACATATAAAGTTTCAAGGAGaaaaagtaaaaaaaGTCTTTTTACTGCAGATGAAGACA 1321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1257 TCACATATAAAGTTTCAAGGAGAAAAAGTAAAAAAAGTCTCTTTACTGCAGATGAAGACA 1316
Query 1322 CAGCATGTGATGCTCTCCATACGCTGGCAGATCTATCGCTGATGATGCCTGAAACTGCCA 1381
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 CAGCATGTGATGCTCTCCAGACGCTGGCAGATTTATCGCTGATGATGCCTGAAACTGCCA 1376
Query 1382 CTGATACTGAGTCATCAGTTCAAGCTGAGGAAAAGAAAGCTGGAGAAGCTTATGTTTCAG 1441
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1377 CAGATACTGAGTCATCAGTTCAAGCTGAGGAAAAGAGAGCTGGAAAAGCTTATGTTTCAG 1436
Query 1442 ATTTTAAAGGGACTGATCCGGCATCCATGTCTAAAAGTAGTTCTCTTAGAAACTCCAAAC 1501
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 ATTTTAAAGGGACTGATCCAGCATCCATGTCTAAAAGTAGTTCTCTTAGAAACTCCAAAC 1496
Query 1502 AGAGAAGATACGGCAGCAATGACCTTTGTAACCCTGAACTCGAGAGAAAAAGTCCAAGTA 1561
||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||||
Sbjct 1497 AGAGAAGATCCGGCACCAATGACCTTTGTGATACTGAACCCGAGCGAAAGAGTCCAAGTA 1556
Query 1562 GTTCTTTAATCCAAAAGAGACGGCAGAAAGCATTACCAGCTAAAGTAAGAGAAAATGTTC 1621
| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1557 GCTCTTTAATCCGAAAGAGACGGCAGAAAGTATTACCAGCTAAAGTAAGAGAAGATGTTC 1616
Query 1622 TTAAAGATGAGCTTGCTGCAAGCTCACAAGTCATAGAGCCTTGTAATAGCAAGGGAATAG 1681
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 1617 TTAAAGATGAGCTTGCTGCAAGCTCAAAAGTCATAGAGCCTAGTAATAACAAGGGAATAG 1676
Query 1682 GTGAGGAATATAAGCCTGTTGGGAGAGGTAAACGGTCCGCAAGTATTCGAAACTCACATG 1741
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 GTGAGGAAAATAAGCCTGTTGGTAGAGGTAAACGGTCCGCAAGTATTCGAAACTCACATG 1736
Query 1742 AAAAGAAATCTGCCAAATCTCATGATCATACTTCGTCAAGTAACAACATAGTAGAAGAAG 1801
||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 AAAAGAAGTCTGTCAAACCTCATGATCGTACTTCGTCAAGTAACAACATAGTAGAAGAAG 1796
Query 1802 ATGAGTCAGCTCCATCAAATGCAGTCATTAAAAAACAAGTTAACTTGCCAACTAAAGTTA 1861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 ATGAGTCAGCTCCATCAAATGCAGTCATTAAAAAACAAGTTAACTTGCCAACTAAAGTTA 1856
Query 1862 GGAGCAGAAGAAAGATAGTAACTGAGAAACCTCTAACTATTGATGACGGGAAAATTTCTG 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 GGAGCAGAAGAAAGATAGTAACTGAGAAACCTCTAACTATTGATGACGGGAAAATTTCTG 1916
Query 1922 AGACTATAGAGAAGTTTTCGCATTGCATTTCTAGTTTCCGAGCACGGAGATGGTGTATTT 1981
||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 1917 AGACTCTAGAGAAGTTTTCGCATTACACATCTAGTTTCCGAGCACGAAGATGGTGTCTTT 1976
Query 1982 TTGAGTGGTTCTACAGTGCAATTGACTATCCATGGTTTGCCAGACAAGAGTTTGTTGAGT 2041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 TTGAGTGGTTCTACAGTGCAATTGACTATCCATGGTTTGCCAGACAAGAGTTTGTTGAGT 2036
Query 2042 ATTTGGATCATGTAGGGTTGGGTCATGTTCCTAGATTAACTCGCGTTGAATGGGGTGTCA 2101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 ATTTGGATCATGTAGGGTTGGGTCATGTTCCTAGATTAACTCGCGTTGAATGGGGTGTCA 2096
Query 2102 TAAGGAGTTCTCTTGGGAAACCAAGGCGATTTTCTGAACAGTTTTTGAAGGAGGAAAAAG 2161
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 TAAGGAGTTCTCTTGGGAAACCGAGGCGATTTTCTGAACAGTTTTTGAAGGAGGAAAAAG 2156
Query 2162 AAAAGCTATACCTATACAGGGACTCTGTAAGAAAACATTATGATGAACTAAACACGGGCA 2221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 AAAAGCTATACCTATACAGGGACTCTGTAAGAAAACATTATGATGAACTAAACACGGGCA 2216
Query 2222 TGAGGGAAGGACTTCCAATGGATTTGGCCCGGCCTCTAAATGTTTCACAGAGAGTCATTT 2281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 TGAGGGAAGGACTTCCAATGGATTTGGCCCGGCCTCTTAATGTTTCACAGAGAGTCATTT 2276
Query 2282 GCCTGCATCCAAAGTCAAGAGAGATTCATGACGGCAATGTCCTAACTGTTGATCACTGTA 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 CCCTGCATCCAAAGTCAAGAGAGATTCATGACGGCAGTGTCCTAACTGTTGATCACTGTA 2336
Query 2342 GGTACCGGATTCAGTTTGACAACCCTGAATTAGGGGTAGAATTTGTTAAGGATACTGAAT 2401
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 GGTACCGGATTCAGTTTGACCACCCTGAATTAGGGGTAGAATTTGTTAAGGATACTGAAT 2396
Query 2402 GCATGCCACTGAATCCTCTAGAAAACATGCCAGCATCGCTGGCAAGGCACTATGCTTTCT 2461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2397 GCATGCCACTGAATCCTCTAGAAAACATGCCAGCATCGCTGGCAAGGCACTATGCTTTCT 2456
Query 2462 CAAATTATCACATTCAGAATCCCATTGAGGAGAAAATGCATGAACGGGCAAAGGAAAGCA 2521
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2457 CAAATTATCACATTCAGAATCCCGTTGAGGAGAAAATGCATGAGCGGGCAAAGGAAAGCA 2516
Query 2522 TGCTGGAAGGATATCCCAAACTTTCGTGTGAGACAGGCCATCTCTTGTCCTCTCCAAATT 2581
|| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2517 TGTTGGAAGGATATCCCAAACTTTCTTGTGAGACTGGCCATCTCTTACCCTCACCAAATT 2576
Query 2582 ATAACATTAGCAATTCACTAAAGCAGGAAAAGGTAGATATCTCAAGTTCAAATCCACAAG 2641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 ATAACATTAGCAATTCACTAAAGCAGGAAAAGGTAGATATCTCAAGTTCAAATCCACAAG 2636
Query 2642 CTCAAGACGGAGTTGATGAGGCTCTTGCTTTACAATTGTTTAATTCTCAGCCCTCAAGTA 2701
||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637 CTCAAGATGGAGTCGATGAGGCTCTTGATTTACAATTGTTTAATTCTCAGCCCTCAAGTA 2696
Query 2702 TTGGACAAATCCAGGCAAGAGAAGCTGATGTCCAAGCTCTTTCTGAACTAACGCGTGCGC 2761
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2697 TTGGACATATCCAGGCAAGAGAAGCTGATGTCCAAGCTCTTTCTGAACTAACACGTGCGC 2756
Query 2762 TTGACAAGAAGGAGCTAGTTTTGAGGGAGCTAAAATGCATGAACGACGAGGTTGTGGAAA 2821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2757 TTGACAAGAAGGAGCTAGTTTTGAGGGAGCTAAAATGCATGAACGACGAGGTTGTGGAAA 2816
Query 2822 GTCAGAAAGATGGACATAATAATGCCCTAAAGGATTCTGAATCTTTTAAGAAACAATATG 2881
|||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 GTCAGAAAGATGGACATAAT---GCTCTGAAGGATTCTGAATCTTTTAAGAAACAATATG 2873
Query 2882 CAGCAGTTCTCTTTCAGCTAAGCGAAATCAATGAGCAGGTTTCATTGGCACTTCTTGGCT 2941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2874 CAGCAGTTCTCTTTCAGCTAAGCGAAATCAATGAGCAGGTTTCATTGGCACTTCTTGGCT 2933
Query 2942 TGAGGCAACGAAATACTTACCAGGAGAATGTACCATATTCATCAATAAGACGCATGAGTA 3001
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||
Sbjct 2934 TGAGGCAACGAAATACTTACCAGGAGAATGTACCATATGCATCAATAAAACGCATGAATA 2993
Query 3002 AATCAGGGGAACCTGATGGTCAGTTGACATACGAAGACAATAATGCATCAGACACTAATG 3061
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||
Sbjct 2994 AATCAGGGGAACCTGATGGTCAGTTGACCTACGTAGACAATTATGTATCTGACACTAATG 3053
Query 3062 GATTCCATGTGTCTGAGATCGTCGAAAGTTCTAGAATAAAAGCACGGAAAATGGTATACA 3121
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3054 GATTCCATGTGTCTGAGATCGTCGAAAGTTCTAGAATAAAAGCACGGAAAATGGTAGACA 3113
Query 3122 GAGCTGTACAGGCATTGG-AGTTACTGAGAAAAGACGAAAATAATAATGTAAATATGGAA 3180
|||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 GAGCTGTACAGGCATTGGCA-TTACTGAGGAAAGACGAAAATAATAATGTAAATATGGAA 3172
Query 3181 GAAGCCATTGATTTTGTAAATAATCAGCTCTCAATAGATCAAACAGAAGGATCATCAGTC 3240
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 GAAGTCATTGATTTTGTAAATAATCAGCTCTCAATAGATCAAACAGAAGGATCATCAGTC 3232
Query 3241 CAGCAAACACAAGGTGGCCAGGATCAGCGTCTTCCCTCTACACCAAATCCACCTAGCTCA 3300
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233 CAGCAAACACAAGGTGCCCAGGATCAGCGCCTTCCATCTACACCAAATCCACCTAGCTCA 3292
Query 3301 ACTCCTGCCAATGATTCCCACCTAAA-CCAACCCGATCAAAATGACCTGCAAGTCCCGTC 3359
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3293 ACTCCTGCCAATGATTCCCACCTAAATCCA-CCCGATCAAAATGACCTGCAAATCCCGTC 3351
Query 3360 CGATCTTGTGTCCCGATGTATCGCTACATTGCTTATGATTCAGAAATGTACAGAGAGGCA 3419
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3352 TGAACTTGTGTCCCGATGTATGGCTACATTGCTTATGATTCAGAAATGTACAGAGAGGCA 3411
Query 3420 ATTCCCACCAAGTGAAGTAGCCCAGGTTCTAGACTCGGCAGTGGCGAGTTTACAGCCTTG 3479
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3412 ATTCCCACCAAGTGAAGTGGCCCAGGTTCTAGACTCTGCGGTGGCGAGTTTACAGCCTTG 3471
Query 3480 CTGCTCGCAGAACCTTCCGATCTATACAGAGATTCAGAAGTGCATGGGAATCATAAGAAA 3539
|||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3472 CTGCTCACAAAACCTTCCTATCTATACAGAGATTCAGAAGTGCATGGGAATCATAAGAAA 3531
Query 3540 CCAGATTCTAGCCCTCGTACCCTCCTAAAGTAAGAATCCTAAAACCATAACTT-AACCTT 3598
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3532 CCAGATTCTAGCCCTCGTACCCTCCTAAAGTAAGACTCCTAAAACCATAACTTTAACCTT 3591
Query 3599 TGTGTCTCTTCATAATGCTTGTTTCTCTTTGTAAAATCA-ATATCTCCTTATAGAAAATC 3657
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 3592 TGTGTCTCTTCATAGTGCTTGTTTCTCTT-GTAAAATCCCATATCTCCTTATAGGAAATC 3650
Query 3658 CTTTTATATAC-CC-CATTTATTTGGAGTGACTCACAACAGTTTCTCGATTTCACATTTA 3715
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||
Sbjct 3651 CTTTTATATATACCTCATTTATTTGGAGTGACTCACAAAACTTTTTCGATTTCACATTTA 3710
Query 3716 TTTATATGTAACACATCATTTGTT 3739
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3711 TTTATATGTAACACATCATTTGTT 3734
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 141269710976
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5