BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G23780.1
Length=3955
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg929675 jgi|Araly1|929675|scaffold_302132.1 5714 0.0
Ahg930428 jgi|Araly1|930428|scaffold_302885.1 1554 0.0
Ahg946817 jgi|Araly1|946817|scaffold_703046.1 255 1e-66
Ahg897537 jgi|Araly1|897537|Al_scaffold_0005_1503 106 1e-21
> Ahg929675 jgi|Araly1|929675|scaffold_302132.1
Length=3553
Score = 5714 bits (3094), Expect = 0.0
Identities = 3412/3565 (96%), Gaps = 24/3565 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 183 GTGTGTTTTGAGGTATGCCAGATATGGACATTGATGTGAAGGATCTTGAAGAGTTCGAGG 242
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||| ||| |||| |
Sbjct 1 GTGTGTTTTGAGGTATACCAGAGATGGACATTAATGAGATGGATATTGACGAGATCGA-G 59
Query 243 CTACTACTGGGGAGATCAATCTATCTGAGCTAGGAGAAGGTTTTCTGCAGAGTTTCTGCA 302
||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||
Sbjct 60 --ACTGCTGGGCAGATGAATCTTTCTGAGCTAGGAGAAAGTTTTCTCCAAAGTTTCTGCA 117
Query 303 AAAAAGCTGCAACTTCTTTCTTTGATA-AGTATGGACTTATAAGTCATCAGCTCAACTCC 361
|||||||||| || || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 AAAAAGCTGCTACATCCTTCTTTGA-AGAGTATGGGCTTATAAGTCATCAGCTCAACTCC 176
Query 362 TACAACTACTTCATTGAACACGGGCTTCAGAATGTGTTTC-AATCCTTTGGTGAGATGCT 420
||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||
Sbjct 177 TACAACTTCTTCATCAAACACGGGCTTCGGAATGTG-TTCGAGTCCTTTGGTGAGATGCT 235
Query 421 TGTGGAACCGTCTTTTGATGTTGTAAAGAAGAAGGATAATGATTGGAGATACGCAACGGT 480
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 236 TGTGGAACCGTCTTTTGATGTAATAAAGAAGAAGGATGGCGATTGGAGATACGCAACAGT 295
Query 481 GAAGTTCGGAGAAGTCACTGTGGAGAAGCCTACTTTCTTTTCGGATGACAAGGAGCTTGA 540
||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 GAAATTCGGAGAAGTCACTTTTGAGAAGCCCACATTCTTTTCGGATGACAAGGAGCTTGA 355
Query 541 GTTTCTCCCATGGCATGCTAGGCTTCAGAACATGACATACTCTGCAAGGATCAAAGTCAA 600
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 356 GTTTCTCCCATGGCATGCCAGGCTTCAGAACATGACATACTCAGCAAGGATCAAAGTGAA 415
Query 601 TGTCCAAGTTGAGGTGTTCAAGAATACTGTTGTTAAAAGCGACAAATTCAAGACAGGACA 660
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 416 TGTCCAAGTTGAGGTGTTCAAAAAAACTGTTGTTAAAAGCGACAAATTCAAGACGGGACA 475
Query 661 AGA-CAACTATGTCGAGAAGAAGATACTGGATGTCAAAAAGCAGGACATTCTAATTGGTA 719
||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 AGATGAA-TATGTCGAGAAGGAGATACTGGATGTCAAAAAGCAGGACATTCTAATTGGTA 534
Query 720 GCATTCCTGTCATGGTGAAATCTATCCTTTGCAAAACAAGCGAGAAAGGGAAAGAAAACT 779
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 535 GCATTCCTGTCATGGTGAAATCTGTCCTTTGCAAAACAAGCGAGAAAGGAAAAGAAAACT 594
Query 780 GCAAAAAGGGGGATTGTGCCTTTGATCAGGGTGGATATTTCGTGATAAAGGGGGCTGAGA 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 595 GCAAAAAGGGGGATTGTGCCTTTGATCAGGGTGGTTATTTTGTGATAAAGGGGGCTGAGA 654
Query 840 AGGTGTTTATAGCTCAAGAACAGATGTGCACAAAGAGACTGTGGATTTCTAATTCACCAT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 AGGTGTTTATAGCTCAAGAACAGATGTGCACAAAGAGACTGTGGATTTCTAATTCACCAT 714
Query 900 GGACAGTCTCCTTCAGGTCCGAAAATAAAAGAAATAGATTCATTGTGCGCCTCTCGGAGA 959
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 GGACTGTCTCCTTCAGGTCCGAAACTAAAAGAAATAGGTTCATTGTGCGCCTCTCGGAGA 774
Query 960 ATGAGAAAGCAGAAGACTATAAGAGAAGGGAGAAAGTACTGACAGTGTACTTCTTGTCGA 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 ATGAGAAAGCAGAAGACTATAAGAGAAGGGAGAAAGTACTGACAGTGTACTTCTTGTCGA 834
Query 1020 CTGAGATTCCAGTCTGGCTCCTCTTCTTTGCGCTAGGTGTTTCGTCAGACAAAGAAGCCA 1079
| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 CGGAGATTCCAGTCTGGCTCTTGTTCTTTGCGCTGGGTGTTTCGTCAGACAAAGAAGCCA 894
Query 1080 TGGATCTAATTGCTTTTGATGGTGATGATGCAAGCATTACCAACAGTCTCATAGCTTCTA 1139
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 TGGATCTAATTGCTTTTGATGGTGTTGATGCAAGCATTACCAACAGTCTCATAGCTTCTA 954
Query 1140 TCCATGTAGCTGATGCAGTTTGTGAAGCTTTTCGCTGTGGGAACAATGCTTTAACATATG 1199
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 955 TCCATGAAGCTGATGCAGTTTGTGAAGCTTTTCGCTGTGGGAACAATGCCCTAACATATG 1014
Query 1200 TTGAACAGCAGATCAAAAGCACCAAATTCCCTCCTGCTGAAAGTGTGGATGAGTGCCTCC 1259
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1015 TTGAACATCAGATCAAAAGCACCAAATTCCCTCCTGCTGAAAGTGTGGATGATTGCCTCC 1074
Query 1260 ATCTGTATTTGTTTCCAGGCCTCCAAAGTTTGAAGAAGAAAGCTCGATTCCTGGGCTATA 1319
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1075 GTCTGTATTTGTTTCCAGGCCTCCAAGGTTTGAAGAAGAAAGCCCGATTCCTGGGCTATA 1134
Query 1320 TGGTGAAGTGCCTTCTGAACT-CGTATGCGGGAAAAAGAAAATGCGAAAACAGGGACAGT 1378
||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1135 TGGTGAAGTGCCTTCTG-AGTGCGTATGCGGGAAAACGAAAATGTGAAAACAGGGACAGT 1193
Query 1379 TTCCGGAATAAGCGAATTGAGCTCGCTGGAGAACTATTGGAGAGGGAGATAAGGGTGCAT 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1194 TTCCGGAATAAGCGAATTGAGCTCGCTGGAGAACTGTTGGAAAGGGAAATAAGGGTGCAT 1253
Query 1439 CTGGCACATGCTAGAAGAAAGATGACCAGGGCCATGCAGAAACACCTCTCAGGCGATGGT 1498
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1254 CTGGCACATGCTAGGAGAAAGATGACAAGGGCCATGCAGAAACAACTCTCAGGCGAGGGA 1313
Query 1499 GATTTGAAGCCTATTGAGCATTATTTGGATGCTTCTGTTATCACAAATGGGCTTAGTAGA 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1314 GATTTGAAGCCTATTGAGCATTATTTGGATGCTTCTGTTATCACAAATGGGCTTAATCGA 1373
Query 1559 GCCTTCTCTACTGGAGCATGGTCTCATCCTTTCAGGAAGATGGAAAGGGTTTCAGGTGTT 1618
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 GCCTTCTCCACTGGAGCATGGTCTCATCCTTTCAGGAAGATGGAAAGGGTTTCAGGTGTT 1433
Query 1619 GTGGCTAATTTGGGTCGTGCAAATCCATTGCAGACTCTGATTGATCTGAGGAGAACGCGA 1678
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 GTAGCTAATTTGGGTCGTGCAAATCCATTGCAGACTCTGATTGATCTGAGGAGAACGCGA 1493
Query 1679 CAGCAAGTCTTATATACCGGCAAGGTTGGAGATGCTAGATATCCGCACCCCTCTCACTGG 1738
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1494 CAGCAAGTCCTATATACCGGCAAGGTTGGAGATGCTAGATATCCGCATCCCTCTCACTGG 1553
Query 1739 GGCAGAGTATGCTTTTTGTCAACTCCAGACGGTGAAAATTGTGGTCTTGTGAAGAACATG 1798
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GGCAGAGTATGCTTTTTGTCAACTCCAGATGGTGAAAATTGTGGTCTTGTGAAGAACATG 1613
Query 1799 TCTCTTCTGGGACTTGTGAGCACCCAAAG-TTTGGAGTCTGTGGTGGAAAAGCTCT-TCG 1856
|||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |
Sbjct 1614 TCTCTTCTTGGACTTGTTAGCACTC-AAGTTTTGGAGTCTGTGGTGGAAACGCTCTAT-G 1671
Query 1857 CTTGTGGAATGGAAGAGCTGATGGATGATA-CATGCACACCATTGTTTGGCAAACATAAA 1915
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 1672 CTTGTGGAATGGAAGAGCTGATGGATGATACCA-GCACACCATTGTGTGGCAAACACAAA 1730
Query 1916 GTTCTTCTCAATGGAGACTGGGTTGGATTATGTGCAGATTCTGAATCCTTTGTCGCGGAG 1975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 GTTCTTCTCAATGGAGACTGGGTTGGATTATGTGCAGATTCTGAATCCTTTGTCGCGGAG 1790
Query 1976 TTAAAAAGCAGGCGGCGCCAAAGTGAATTACCTCGTGAGATGGAAATCAAGCGAGATAAA 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 TTAAAAAGCAGGCGGCGCCAAAGTGAATTACCTCGTGAGATGGAAATCAAGCGAGATAAA 1850
Query 2036 GATGACAATGAGGTAAGAATTTTCACTGATGCTGGTAGACTACTCCGACCTCTCTTGGTT 2095
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GATGACAATGAGGTGAGAATTTTCACTGACGCTGGTAGACTACTCCGACCTCTCTTGGTT 1910
Query 2096 GTGGAAAATCTCCAAAAGTTGAAGCAAGAAAAACCTTCACAGTATCCTTTTGACCATCTT 2155
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||
Sbjct 1911 GTGGAAAATCTCCACAAGTTGAAGCAAGACAAACCTACACAGTATCCTTTTAAGCATCTT 1970
Query 2156 CTTGACCATGGGATTCTCGAGCTGATCGGGATTGAGGAAGAAGAAGACTGTAATACAGCA 2215
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 CTTGACCAAGGGATTCTCGAGCTGATCGGGATTGAGGAAGAAGAAGACTGTAATACAGCA 2030
Query 2216 TGGGGAATCAAACAGCTTCTGAAGGAACCAAAG-ATATACACACATTGCGAATTGGACCT 2274
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2031 TGGGGAATCAAACAGCTTCTGAAGGAACCAAAGAAT-TACACGCATTGCGAATTGGACCT 2089
Query 2275 GTCATTCTTGTTGGGTGTGAGCTGTGCAGTTGTCCCATTTGCAAATCACGACCATGGGAG 2334
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2090 GTCATTCCTGTTGGGTGTGAGCTGTGCAATTGTCCCATTTGCAAATCACGATCATGGGAA 2149
Query 2335 AAGAGTTCTCTACCAGTCCCAGAAGCACTGCCAACAAGCCATTGGATTCTCATCAACGAA 2394
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2150 AAGAGTTCTCTACCAGTCCCAGAAGCATTGCCAACAAGCCATTGGATTCTCATCAACGAA 2209
Query 2395 CCCTAACATCCGCTGCGATACGCTGTCCCAGCAGCTGTTCTATCCTCAGAAGCCACTGTT 2454
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2210 CCCTAACATCCGCTGCGATACTCTGTCCCAGCAGCTGTTCTATCCCCAGAAGCCACTGTT 2269
Query 2455 CAAGACATTGGCGTCGGAGTGTCTTAAAAAAGAAGTGCTGTTCAATGGCCAGAACGCAAT 2514
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2270 CAAGACATTGGCGTCGGAGTGTCTAAAAAAAGAAGTGCTGTTTAATGGCCAGAACGCAAT 2329
Query 2515 TGTTGCTGTGAATGTTCATCTCGGGTACAACCAAGAGGATTCCATTGTGATGAACAAGGC 2574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 TGTTGCTGTGAATGTTCATCTCGGGTACAACCAAGAGGATTCCATTGTGATGAACAAGGC 2389
Query 2575 TTCATTGGAACGTGGTATGTTCCGTTCAGAGCAGATTAGAAGCTACAAAGCAGAGGTTGA 2634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 TTCATTGGAACGTGGTATGTTCCGTTCAGAGCAGATTAGAAGCTACAAAGCAGAGGTTGA 2449
Query 2635 TGCTAAAGACTCAGAGAAGAGGAAGAAGATGGATGAGCTTGTTCAGTTTGGAAAGACACA 2694
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2450 TACTAAAGACTCGGAGAAGAGGAAGAAGATGGATGAGCTTGTTCAGTTTGGAAAGACATA 2509
Query 2695 CAGCAAAATCGGCAAAGTAGACAGCCTTGAAGATGACGGGTTTCCTTTCATTGGTGCTAA 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 CAGCAAAATCGGCAAAGTAGACAGCCTTGAAGATGACGGGTTTCCTTTCATTGGTGCTAA 2569
Query 2755 CATGAGTACTGGCGATATTGTCATTGGCAGATGCACCGAGTCTGGGGCTGATCACAGTAT 2814
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 CATGAGTACTGGAGATATTGTCATTGGCAGATGCACCGAGTCTGGGGCTGATCACAGTAT 2629
Query 2815 AAAGCTCAAGCACACTGAGAGAGGAATTGTGCAAAAAGTGGTATTATCATCTAATGATGA 2874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 AAAGCTCAAGCACACTGAGAGAGGAATTGTGCAAAAAGTGGTATTATCATCTAATGATGA 2689
Query 2875 AGGGAAGAATTTTGCTGCGGTTTCTCTGAGACAGGTTCGTTCTCCATGCCTTGGAGATAA 2934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 AGGGAAGAATTTTGCTGCGGTTTCTCTGAGACAGGTTCGTTCTCCATGCCTTGGAGATAA 2749
Query 2935 GTTTTCCAGTATGCATGGCCAGAAGGGTGTTTTAGGCTACCTAGAGGAACAGCAGAATTT 2994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 GTTTTCCAGTATGCATGGCCAGAAGGGTGTTTTAGGCTATCTAGAGGAACAGCAGAATTT 2809
Query 2995 TCCTTTCACGATCCAAGGCATAGTTCCTGATATTGTGATAAACCCGCACGCTTTCCCTTC 3054
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 TCCTTTCACGATCCAAGGCATAGTTCCTGATATTGTTATAAACCCGCACGCTTTCCCTTC 2869
Query 3055 TAGGCAAACACCAGGTCAACTCTTGGAGGCTGCTCTCTCCAAAGGAATCGCTTGTCCTAT 3114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2870 TAGGCAAACACCAGGTCAACTCTTGGAGGCTGCTCTCTCCAAAGGAATCGCTTGTCCTAT 2929
Query 3115 ACAAAAG--G-AGGGTAGCTCTGCTGCATACACCAAATTGACACGTCATGCCACTCCTTT 3171
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2930 ACAAAAGAAGGAGGGTAGCTCTGCTGCATACACCAAATTGACACGTCATGCCACTCCTTT 2989
Query 3172 CTCCACTCCGGGTGTCACTGAAATCACCGAGCAGCTTCACAGGGCCGGCTTTTCAAGATG 3231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 CTCCACTCCGGGTGTCACTGAAATCACCGAGCAGCTTCACAGGGCCGGCTTTTCAAGATG 3049
Query 3232 GGGAAACGAAAGGGTCTACAACGGTAGATCAGGTGAGATGATGCGTTCTATGATATTCAT 3291
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3050 GGGAAACGAAAGGGTCTACAATGGTAGATCGGGTGAGATGATGCGTTCTCTGATATTCAT 3109
Query 3292 GGGCCCAACTTTCTACCAGCGACTTGTCCACATGTCAGAGGACAAAGTCAAGTTCAGGAA 3351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 GGGCCCAACTTTCTACCAGCGACTTGTCCACATGTCAGAGGACAAAGTCAAGTTCAGGAA 3169
Query 3352 CACTGGACCAGTCCACCCGCTCACACGCCAGCCAGTTGCAGACAGGAAGAGATTTGGCGG 3411
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 3170 CACCGGACCAGTCCACCCGCTCACACGTCAGCCAGTCGCAGACAAGAAGAGGTTTGGCGG 3229
Query 3412 GATAAAATTTGGAGAAATGGAGCGAGACTGCCTAATAGCTCACGGTGCATCAGCTAATCT 3471
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3230 AATAAAATTTGGAGAAATGGAGCGAGACTGTCTAATAGCTCACGGTGCATCCGCTAATCT 3289
Query 3472 GCATGAGCGTCTCTTCACTCTAAGTGACTCTTCTCAGATGCACATCTGCAGAAAATGTAA 3531
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3290 GCACGAGCGTCTCTTCACTCTAAGTGACTCTTCTCAGATGCACATCTGCAGAAAATGTAA 3349
Query 3532 GACCTATGCGAATGTGATCGAGAGGACTCCAAGCAGTGGAAGAAAGATTAGAGGGCCATA 3591
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3350 GACCTATGCGAATGTGATCGAGAGGACTCCAAGCAGTGGAAGAAAGATCAGAGGGCCATA 3409
Query 3592 TTGTAGAGTCTGCGTATCCTCAGACCATGTGGTTAGGGTCTATGTTCCGTATGGAGCTAA 3651
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3410 TTGTAGAGTCTGCGCGTCCTCAGACCATGTGGTTAGGGTCTATGTTCCGTATGGAGCTAA 3469
Query 3652 GCTTCTGTGTCAGGAGCTGTTCAGCATGGGCATCACTCTCAACTTCGACACCAAGCTATG 3711
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3470 GCTTCTGTGTCAGGAGCTGTTCAGCATGGGCATCACTCTCAATTTCGACACCAAGCTCTG 3529
Query 3712 CTGATTCCCC-CTCTTTATTATGTA 3735
|||||||||| | |||| |||||||
Sbjct 3530 CTGATTCCCCGC-CTTTGTTATGTA 3553
> Ahg930428 jgi|Araly1|930428|scaffold_302885.1
Length=1558
Score = 1554 bits (841), Expect = 0.0
Identities = 958/1014 (94%), Gaps = 9/1014 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 206 ATGGACATTGATGTGAAGGATCTTGAAGAGTTCGAGGCTACTACTGGGGAGATCAATCTA 265
||||||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 21 ATGGACATTGATGAGATGGATATTGAAGAGATCGAGG---CTACTGCGGAGATCAATCTA 77
Query 266 TCTGAGCTAGGAGAAGGTTTTCTGCAGAGTTTCTGCAAAAAAGCTGCAACTTCTTTCTTT 325
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 78 TCTGAGCTAGGAGAAAGTTTTCTCCAGAGTTTCTGCAAGAAAGCTGCAACTTCCTTCTTT 137
Query 326 GATAAGTATGGACTTATAAGTCATCAGCTCAACTCCTACAACTACTTCATTGAACACGGG 385
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 138 GATAAGTATGGGCTTATAAGTCATCAGCTCAACTCCTACAACTTCTTCATTCAACACGGG 197
Query 386 CTTCAGAATGTGTTTCAATCCTTTGGTGAGATGCTTGTGGAACCGTCTTTTGATGTTG-T 444
|||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |
Sbjct 198 CTTCAGGATGTGTTTGAATCCTTTGGTGATATGCTTGTGGAACCGTCGTTTGATG-TGAT 256
Query 445 AAAGAAGAAGGATAATGATTGGAGATACGCAACGGTGAAGTTCGGAGAAGTCACTGTGGA 504
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 257 AAAGAAGAAGGATAACGATTGGAGATACGCTACGGTGAAATTCGGAAAAGTCACTGTGGA 316
Query 505 GAAGCCTACTTTCTTTTCGGATGACAAGGAGCTTGAGTTTCTCCCATGGCATGCTAGGCT 564
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 317 GAAGCCCACTTTCTTTTCCGATGACAAGGAGCTTGAGTTTCTCCCATGGCATGCCAGGCT 376
Query 565 TCAGAACATGACATACTCTGCAAGGATCAAAGTCAATGTCCAAGTTGAGGTGTTCA-AGA 623
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 377 TCAGAACATGACATATTCAGCAAGGATCAAAGTCAATGTCCAAGTTGAGGTGTTCATA-A 435
Query 624 ATACTGTTGTTAAAAGCGACAAATTCAAGACAGGACAAGAC-AACTATGTCGAGAAGAAG 682
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 436 AAACTGTTGTTAAAAGCGACAAATTCAAGACGGGACAAGACGAA-TATGTCGAGAAGAAG 494
Query 683 ATACTGGATGTCAAAAAGCAGGACATTCTAATTGGTAGCATTCCTGTCATGGTGAAATCT 742
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 ATACTTGAGGTCAAAAAGCAGGACATTCTAATTGGTAGCATTCCTGTCATGGTGAAATCT 554
Query 743 ATCCTTTGCAAAACAAGCGAGAAAGGGAAAGAAAACTGCAAAAAGGGGGATTGTGCCTTT 802
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 555 GTCCTTTGCAAAACAAGCGAGAAAGGAAAAGAAAACTGCAGAAAGGGGGATTGTGCCTTT 614
Query 803 GATCAGGGTGGATATTTCGTGATAAAGGGGGCTGAGAAGGTGTTTATAGCTCAAGAACAG 862
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 GATCAGGGTGGCTATTTTGTGATAAAGGGGGCTGAGAAGGTGTTTATAGCTCAAGAACAG 674
Query 863 ATGTGCACAAAGAGACTGTGGATTTCTAATTCACCATGGACAGTCTCCTTCAGGTCCGAA 922
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 675 ATGTGCACAAAGAGACTGTGGATTTCTAACTCACCATGGACAGTCTCTTTCAGGTCCGAA 734
Query 923 AATAAAAGAAATAGATTCATTGTGCGCCTCTCGGAGAATGAGAAAGCAGAAGACTATAAG 982
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 735 AACAAAAGAAATAGGTTCATTGTGCGCCTCTCGGAGAATGAGAAATCAGAAGACTATAAG 794
Query 983 AGAAGGGAGAAAGTACTGACAGTGTACTTCTTGTCGACTGAGATTCCAGTCTGGCTCCTC 1042
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 AAAAGGGAGAAAGTACTGACAGTGTACTTCTTGTCGACTGAGATTCCAGTCTGGCTCCTG 854
Query 1043 TTCTTTGCGCTAGGTGTTTCGTCAGACAAAGAAGCCATGGATCTAATTGCTTTTGATGGT 1102
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 855 TTCTTTGCGCTGGGTGTTTCGTCAGACAAAGAAGCCATGAATCTGATTGCTTTTGATGGT 914
Query 1103 GATGATGCAAGCATTACCAACAGTCTCATAGCTTCTATCCATGTAGCTGATGCAGTTTGT 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 915 GATGATGCAAGCATTACCAACAGTCTCATAGCTTCTATCCATGAAGCTGATGCAGTTTGT 974
Query 1163 GAAGCTTTTCGCTGTGGGAACAATGCTTTAACATATGTTGAACAGCAGATCAAA 1216
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 975 GAAGCTTTTCGCTGTGGGAACAATGCTTTAAGTTATGTTGAACAGCAGATCAAA 1028
Score = 880 bits (476), Expect = 0.0
Identities = 508/524 (97%), Gaps = 0/524 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3212 AGGGCCGGCTTTTCAAGATGGGGAAACGAAAGGGTCTACAACGGTAGATCAGGTGAGATG 3271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1035 AGGGCCGGCTTTTCAAGATGGGGAAACGAAAGGGTCTACAATGGTAGATCGGGTGAGATG 1094
Query 3272 ATGCGTTCTATGATATTCATGGGCCCAACTTTCTACCAGCGACTTGTCCACATGTCAGAG 3331
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 ATGCGTTCTCTGATATTCATGGGCCCAACTTTCTACCAGCGACTTGTCCACATGTCAGAG 1154
Query 3332 GACAAAGTCAAGTTCAGGAACACTGGACCAGTCCACCCGCTCACACGCCAGCCAGTTGCA 3391
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1155 GACAAAGTCAAGTTCAGGAACACCGGACCAGTCCACCCGCTCACACGCCAGCCAGTCGCA 1214
Query 3392 GACAGGAAGAGATTTGGCGGGATAAAATTTGGAGAAATGGAGCGAGACTGCCTAATAGCT 3451
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1215 GACAGGAAGAGGTTTGGCGGGATAAGGTTTGGAGAAATGGAGCGAGACTGCCTAATAGCT 1274
Query 3452 CACGGTGCATCAGCTAATCTGCATGAGCGTCTCTTCACTCTAAGTGACTCTTCTCAGATG 3511
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 CACGGTGCATCTGCTAATCTGCACGAGCGTCTCTTCACTCTAAGTGACTCTTCTCAGATG 1334
Query 3512 CACATCTGCAGAAAATGTAAGACCTATGCGAATGTGATCGAGAGGACTCCAAGCAGTGGA 3571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 CACATCTGCAGAAAATGTAAGACCTATGCGAATGTGATCGAGAGGACTCCAAGCAGTGGA 1394
Query 3572 AGAAAGATTAGAGGGCCATATTGTAGAGTCTGCGTATCCTCAGACCATGTGGTTAGGGTC 3631
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1395 AGAAAGATCAGAGGGCCATATTGTAGAGTCTGCGCATCCTCAGACCATGTGGTTAGAGTC 1454
Query 3632 TATGTTCCGTATGGAGCTAAGCTTCTGTGTCAGGAGCTGTTCAGCATGGGCATCACTCTC 3691
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455 TATGTTCCTTATGGAGCTAAGCTTCTGTGTCAGGAGCTGTTCAGCATGGGCATCACTCTC 1514
Query 3692 AACTTCGACACCAAGCTATGCTGATTCCCCCTCTTTATTATGTA 3735
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1515 AACTTCGACACCAAGCTCTGCTGATTACCCCTCTTTATTATGTA 1558
> Ahg946817 jgi|Araly1|946817|scaffold_703046.1
Length=336
Score = 255 bits (138), Expect = 1e-66
Identities = 151/157 (96%), Gaps = 1/157 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2351 TCCCAGAAGCACTGCCAACAAGCCATTGGATTCTCATCAACGAACCCTAACATCCGCTGC 2410
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 173 TCCCAGAAGCATTGCCAACAAGCCATTGGATTCTCATCAACGAATCCTAACATCCGCTGC 232
Query 2411 GATACGCTGTCCCAGCAGCTGTTCTATCCTCAGAAGCCACTGTTCAAGACATTGGCGTCG 2470
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 233 GATACGCTGTCCCAGCAGCTGTTCTATCC-CAGAAGCCACTTTTCAAGACATTGGCGTCG 291
Query 2471 GAGTGTCTTAAAAAAGAAGTGCTGTTCAATGGCCAGA 2507
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 292 GAGTGTCTTAAAAAAGAAGTGATGTTTAATGGCCAGA 328
> Ahg897537 jgi|Araly1|897537|Al_scaffold_0005_1503
Length=1227
Score = 106 bits (57), Expect = 1e-21
Identities = 64/67 (96%), Gaps = 1/67 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 2396 CCTAACATCCGCTGCGATACGCTGTCCCAGCAGCTGTTCTATCCTCAGAAGCCACTGTTC 2455
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 66 CCTAACATCCGCTGCGATACGCTGTCCCAGCAGCTGTTCTATCC-CAGAAGCCACTTTTG 8
Query 2456 AAGACAT 2462
|||||||
Sbjct 7 AAGACAT 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 149490146744
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5