BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G24090.1 Length=2034 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg479923 jgi|Araly1|479923|fgenesh2_kg.3__2624__AT3G24090.1 2222 0.0 Ahg916249 jgi|Araly1|916249|Al_scaffold_0008_1000 1875 0.0 Ahg916257 jgi|Araly1|916257|Al_scaffold_0008_1008 1402 0.0 > Ahg479923 jgi|Araly1|479923|fgenesh2_kg.3__2624__AT3G24090.1 Length=2197 Score = 2222 bits (1203), Expect = 0.0 Identities = 1335/1400 (95%), Gaps = 4/1400 (0%) Strand=Plus/Plus Query 637 GAGCTAGATCAAGGTGAGAGCAATAGTCATGTTTTCCAAGATGCTCACTTTCTATCTAAG 696 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 800 GAGCTAGATCAAGGCAAGAGCAATAGTCATGTTTTTCAAGATGCTCACTTTCTTTCTAAG 859 Query 697 AATGACCATCCCAAGGAGTTTTTCCTATCAAGTGATCCACATGCTCTTGTTGAGCACACA 756 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 860 AATGACCATCCCAAGGAATTTTTCCTATCAAGTGATCCGCATGCTCTTGTTGAGCACACA 919 Query 757 AAGAAAGTTTTGGTGATTGAAGATGGCGAAGTTG-TCAATCTCAAGGATGGAGGTGT-AT 814 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | Sbjct 920 AAGAAAGTTTTGGTGATTGAAGATGGCGAAGTTGTTC-ACCTCAAGGATGGAGGTGTGA- 977 Query 815 CAATACTTAAGTTTGAAAATGAGAGGGGAAGGTGTAATGGTTTATCGAGACCTGCTTCAG 874 | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 978 CTATACTTAAGTCTGAAAACGAGAGGGGAAGGCGTAATGGTATATCGAGAATTGCTTCAG 1037 Query 875 TGGAACGTGCCTTATCTGTTCTAGAGATGGAGGTAGAGCAAATAAGCAAGGGAAAATATG 934 |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1038 TGGAACGTGCATTATCTGTTTTAGAAATGGAGGTGGAGCAAATAAACAAGGGAAAATATG 1097 Query 935 ATCATTACATGCAAAAGGAAATCCACGAGCAGCCAGAATCTTTAACTACTACAATGAGAG 994 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1098 ATCATTACATGCAAAAAGAAATCCACGAGCAGCCGGAATCTTTAACTACCACAATGAGAG 1157 Query 995 GCCGACTTATACGCGGTGGTTCACGTAAAACGAAAACCGTCCTCTTAGGTGGGCTGAAAG 1054 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| Sbjct 1158 GCCGACTTATACGCGGTGGTTCACGCAAAACAAAAACAGTCCTCCTAGGTGGGTTGAAAG 1217 Query 1055 ATCACCTAAAGACCATAAGACGCAGCCGGCGTATAGTTTTTATTGGATGTGGGACAAGTT 1114 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1218 ATCACTTAAAGACCATAAGACGCAGCCGGCGTATAGTTTTTATTGGGTGTGGGACAAGTT 1277 Query 1115 ACAATGCCGCTCTTGCATCAAGACCTATCCTTGAAGAACTCTCTGGTATACCAGTCAGTA 1174 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1278 ACAACGCCGCTCTTGCATCAAGACCTATCCTTGAAGAACTCTCTGGTATACCAGTCAGCA 1337 Query 1175 TGGAGATTGCTAGTGATCTATGGGACCGGCAAGGTCCAATATACAGAGAAGATACCGCGG 1234 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1338 TGGAGATTGCTAGTGATCTCTGGGACCGGCAAGGTCCAATATACAGAGAAGATACTGCGG 1397 Query 1235 TGTTTGTGAGTCAGTCTGGTGAAACTGCAGATACACTACTTGCTTTGGACTATGCTCGAG 1294 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1398 TGTTTGTGAGTCAGTCTGGTGAAACCGCAGATACACTACTTGCTTTGGACTATGCTCGGG 1457 Query 1295 AAAACGGTGCATTATGTGTCGGCATAACTAACACCGTTGGGAGCTCCATAGCTAGAAAAA 1354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1458 AAAACGGTGCATTATGTGTCGGCATAACTAACACCGTTGGGAGCTCGATAGCTAGAAAAA 1517 Query 1355 CACACTGTGGTGTCCATATAAACGCAGGAGCTGAGATTGGTGTCGCAAGTACAAAGGCAT 1414 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1518 CACACTGTGGTGTTCATATAAACGCAGGAGCTGAGATTGGTGTCGCAAGTACAAAGGCAT 1577 Query 1415 ATACAAGTCAGATTGTGGTAATGGTAATGCTAGCTTTAGCAATAGGAAGTGACACAATCT 1474 | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1578 ACACAAGTCAGATTGTGGTAATGGTTATGCTAGCTTTAGCAATTGGAAGTGACACAATCT 1637 Query 1475 CCAGCCAAAAGAGACGGGAAGCTATAATCGATGGACTACTTGATTTGCCGTATAAGGTTA 1534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1638 CCAGCCAAAAGAGACGGGAAGCTATAATCGATGGACTACTTGATTTGCCGTATAAGGTTA 1697 Query 1535 AGGAAGTACTAAAGCTAGACGATGAAATGAAAGATCTCGCGCAACTCTTGATAGACGAGC 1594 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| Sbjct 1698 AGGAAGTACTAAAGCTAGACGATGAAATGAAAGATCTCGCACAACTTTTGATAGATGAGC 1757 Query 1595 AGTCACTGCTAGTGTTTGGCAGAGGATACAACTACGCAACAGCTTTAGAAGGAGCATTAA 1654 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1758 AGTCACTGCTTGTGTTTGGCAGAGGATACAACTACGCAACAGCTTTAGAAGGAGCATTGA 1817 Query 1655 AAGTAAAAGAAGTAGCACTTATGCACAGTGAAGGAATACTTGCAGGAGAAATGAAACATG 1714 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1818 AAGTAAAAGAAGTAGCACTTATGCATAGTGAAGGAATACTAGCAGGAGAAATGAAACATG 1877 Query 1715 GACCTTTAGCTTTGGTTGATGAGAATCTCCCCATAGCTGTGATTGCCACTCGTGATGCTT 1774 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1878 GACCTTTAGCTTTAGTTGATGAGAATCTTCCCATTGCTGTGATCGCCACTCGTGATGCTT 1937 Query 1775 GTTTCAGTAAACAACAATCTGTGATTCAGCAACTTCACGCACGCAAAGGGAGACTAATAG 1834 ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1938 GTTTCAGCAAACAACAGTCTGTGATTCAGCAACTTCACGCACGCAAAGGGAGATTAATAG 1997 Query 1835 TAATGTGCTCAAAAGGTGATGCTGCATCGGTAAGCTCGAGTGGTTCTTGTCGAGCTATCG 1894 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 1998 TAATGTGCTCAAAAGGTGATGCTGCATCAGTAAGCTCGAGTGGATCTTGTCGAGCAATCG 2057 Query 1895 AAGTTCCTCAAGTTGAAGATTGTTTACAACCTGTTATTAATATAGTGCCATTACAGTTGT 1954 |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2058 AAGTACCTCAAGTTGAAGATTGTTTACAACCTGTTGTTAATATAGTGCCATTACAGTTGT 2117 Query 1955 TGGCTTATCATCTGACTGTTTTGAGAGGTCACAATGTTGATCAACCGAGGAATCTGGCAA 2014 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2118 TGGCTTATCATCTGACTGTTTTGAGAGGTCACAACGTTGATCAACCGAGGAATCTGGCGA 2177 Query 2015 AGAGTGTGACTACTCAATAG 2034 |||||||||||||||||||| Sbjct 2178 AGAGTGTGACTACTCAATAG 2197 Score = 913 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 595/643 (93%), Gaps = 9/643 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTGTGGAATCTTCGCGTATCTGAATTTTCACGCGAACAAAGAGAGACGATACATTCTC 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 ATGTGTGGAATCTTCGCGTATTTGAATTTTCACGCTAACAAAGAGAGACGATACATTCTC 64 Query 61 GATG-TTCTCTTCAATGGTCTTCGTCGTCTTGAATACAGAGGCTACGATTCTGCTGGAAT 119 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 65 GA-GATTCTCTTCAATGGTCTTCGTCGTCTTGAATACAGAGGCTATGATTCAGCTGGAAT 123 Query 120 CGCCATTGATAATTCTTC-TC-CT-TCTTCTTCTCCTCTCGTGTTTCGTCAAGCAGGAAA 176 ||| |||||| ||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 124 CGCAATTGATGATTCTTCAACAATCTCTTCCCCTCCTCTTGTGTTTCGTCAAGCAGGAAA 183 Query 177 CATTGAATCACTTGTTAATTCCGTTAACGAAGAGATTACGAATACGGATTTGAATC-TAG 235 |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| Sbjct 184 CATTGAATCACTCGTTAATTCTGTAAACGAAGAGATTACGAATACAGATTT-AAACTTAG 242 Query 236 ACGAAGTTTTCTACTTTCATGCTGGAATTGCACATACGAGGTGGGCTACTCATGGTGAGC 295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| Sbjct 243 ATGAAGTTTTCTACTTTCATGCTGGAATTGCACATACTAGATGGGCTACACATGGTGAGC 302 Query 296 CAGCTCCAAGGAATAGTCATCCTCAATCTTCTGGTCCTGGAGATGATTTTTTGGTGGTTC 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 CAGCTCCAAGGAATAGTCATCCTCAATCTTCTGGTCCTGGAGATGATTTTTTGGTGGTTC 362 Query 356 ATAATGGTGTTATCACTAACTATGAGGTATTGAAAGAAACGTTAGTGAGGCATGGATTTA 415 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 363 ATAATGGTGTTATCACTAATTATGAGGTGTTGAAAGAAACTTTAGTGAGGCATGGATTTA 422 Query 416 CTTTTGAATCGGACACAGATACTGAAGTAATTCCTAAGCTTGCTAAGTTTGTTTTTGACA 475 ||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 423 CTTTTGATTCGGATACAGATACTGAGGTTATACCAAAGCTTGCTAAATTTGTTTTTGACA 482 Query 476 AAGCTAATGAAGAAGGTGGACAAACTGTTACA-TTCTGTGAAGTTGTGTTTGAAGTGATG 534 |||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 483 AAGCTAATGAAGAAGGTGAACAGACTGTT-CAATTTTGTGAAGTTGTCTTTGAAGTGATG 541 Query 535 AGGCATCTTGAAGGAGCTTATGCTCTTATATTTAAAAGCTGGCATTATCCGAATGAGTTA 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 542 AGGCATCTTGAAGGAGCTTATGCTCTTATATTTAAAAGCTGGCATTACCCGAACGAGTTG 601 Query 595 ATTGCGTGCAAGCTTGGTAGTCCATTGCTTTTAGGTGTTAAAG 637 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 602 ATTGCGTGCAAGCTTGGTAGCCCGTTGCTTTTAGGTGTTAAAG 644 > Ahg916249 jgi|Araly1|916249|Al_scaffold_0008_1000 Length=1971 Score = 1875 bits (1015), Expect = 0.0 Identities = 1205/1295 (93%), Gaps = 19/1295 (1%) Strand=Plus/Plus Query 44 AGAGACGATACATTCTCGATG-TTCTCTTCAATGGTCTTCGTCGTCTTGAATACAGAGGC 102 ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 65 AGAGACGATACATTCTCGA-GATTCTCTTCAATGGTCTTCGTCGTCTTGAATACAGAGGC 123 Query 103 TACGATTCTGCTGGAATCGCCATTGATAATTCTTC-TC-CT-TCTTCTTCTCCTCTCGTG 159 || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||| ||||||| ||| Sbjct 124 TATGATTCAGCTGGAATCGCAATTGATGATTCTTCAACAATCTCTTCCCCTCCTCTTGTG 183 Query 160 TTTCGTCAAGCAGGAAACATTGAATCACTTGTTAATTCCGTTAACGAAGAGATTACGAAT 219 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 184 TTTCGTCAAGCAGGAAACATTGAATCACTCGTTAATTCTGTAAACGAAGAGATTACGAAT 243 Query 220 ACGGATTTGAATC-TAGACGAAGTTTTCTACTTTCATGCTGGAATTGCACATACGAGGTG 278 || ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 244 ACAGATTT-AAACTTAGATGAAGTTTTCTACTTTCATGCTGGAATTGCACATACTAGATG 302 Query 279 GGCTACTCATGGTGAGCCAGCTCCAAGGAATAGTCATCCTCAATCTTCTGGTCCTGGAGA 338 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 GGCTACACATGGTGAGCCAGCTCCAAGGAATAGTCATCCTCAATCTTCTGGTCCTGGAGA 362 Query 339 TGATTTTTTGGTGGTTCATAATGGTGTTATCACTAACTATGAGGTATTGAAAGAAACGTT 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct 363 TGATTTTTTGGTGGTTCATAATGGTGTTATCACTAATTATGAGGTGTTGAAAGAAACTTT 422 Query 399 AGTGAGGCATGGATTTACTTTTGAATCGGACACAGATACTGAAGTAATTCCTAAGCTTGC 458 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| Sbjct 423 AGTGAGGCATGGATTTACTTTTGATTCGGATACAGATACTGAGGTTATACCAAAGCTTGC 482 Query 459 TAAGTTTGTTTTTGACAAAGCTAATGAAGAAGGTGGACAAACTGTTAC-ATTCTGTGAAG 517 ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||| Sbjct 483 TAAATTTGTTTTTGACAAAGCTAATGAAGAA-GT-----TACTGTT-CAATTTTGTGAAG 535 Query 518 TTGTGTTTGAAGTGATGAGGCATCTTGAAGGAGCTTATGCTCTTATATTTAAAAGCTGGC 577 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 536 TTGTCTTTGAAGTGATGAGGCATCTTGAAGGAGCTTATGCTCTTATATTTAAAAGCTGGC 595 Query 578 ATTATCCGAATGAGTTAATTGCGTGCAAGCTTGGTAGTCCATTGCTTTTAGGTGTTAAAG 637 |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 596 ATTACCCGAACGAGTTGATTGCGTGCAAGCTTGGTAGCCCGTTGCTTTTAGGTGTTAAAG 655 Query 638 AGCTAGATCAAGGTGAGAGCAATAGTCATGTTTTCCAAGATGCTCACTTTCTATCTAAGA 697 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 656 AGCTAGATCAAGGCAAGAGCAATAGTCATGTTTTTCAAGATGCTCACTTTCTTTCTAAGA 715 Query 698 ATGACCATCCCAAGGAGTTTTTCCTATCAAGTGATCCACATGCTCTTGTTGAGCACACAA 757 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 716 ATGACCATCCCAAGGAATTTTTCCTATCAAGTGATCCGCATGCTCTTGTTGAGCACACAA 775 Query 758 AGAAAGTTTTGGTGATTGAAGATGGCGAAGTTGT-CAATCTCAAGGATGGAGGTGT-ATC 815 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | Sbjct 776 AGAAAGTTTTGGTGATTGAAGATGGCGAAGTTGTTCAC-CTCAAGGATGGAGGTGTGA-C 833 Query 816 AATACTTAAGTTTGAAAATGAGAGGGGAAGGTGTAATGGTTTATCGAGACCTGCTTCAGT 875 |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 834 TATACTTAAGTCTGAAAACGAGAGGGGAAGGCGTAATGGTATATCGAGAATTGCTTCAGT 893 Query 876 GGAACGTGCCTTATCTGTTCTAGAGATGGAGGTAGAGCAAATAAGCAAGGGAAAATATGA 935 ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 894 GGAACGTGCATTATCTGTTTTAGAAATGGAGGTGGAGCAAATAAACAAGGGAAAATATGA 953 Query 936 TCATTACATGCAAAAGGAAATCCACGAGCAGCCAGAATCTTTAACTACTACAATGAGAGG 995 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 954 TCATTACATGCAAAAAGAAATCCACGAGCAGCCGGAATCTTTAACTACCACAATGAGAGG 1013 Query 996 CCGACTTATACGCGGTGGTTCACGTAAAACGAAAACCGTCCTCTTAGGTGGGCTGAAAGA 1055 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| Sbjct 1014 CCGACTTATACGCGGTGGTTCACGCAAAACAAAAACAGTCCTCCTAGGTGGGTTGAAAGA 1073 Query 1056 TCACCTAAAGACCATAAGACGCAGCCGGCGTATAGTTTTTATTGGATGTGGGACAAGTTA 1115 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1074 TCACTTAAAGACCATAAGACGCAGCCGGCGTATAGTTTTTATTGGGTGTGGGACAAGTTA 1133 Query 1116 CAATGCCGCTCTTGCATCAAGACCTATCCTTGAAGAACTCTCTGGTATACCAGTCAGTAT 1175 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1134 CAACGCCGCTCTTGCATCAAGACCTATCCTTGAAGAACTCTCTGGTATACCAGTCAGCAT 1193 Query 1176 GGAGATTGCTAGTGATCTATGGGACCGGCAAGGTCCAATATACAGAGAAGATACCGCGGT 1235 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1194 GGAGATTGCTAGTGATCTCTGGGACCGGCAAGGTCCAATATACAGAGAAGATACTGCGGT 1253 Query 1236 GTTTGTGAGTCAGTCTGGTGAAACTGCAGATACACTACTTGCTTTGGACTATGCTCGAGA 1295 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1254 GTTTGTGAGTCAGTCTGGTGAAACCGCAGATACACTACTTGCTTTGGACTATGCTCGGGA 1313 Query 1296 AAACGGTGCATTATGTGTCGGCATAACTAACACCG 1330 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1314 AAACGGTGCATTATGTGTCGGCATAACTAACACCG 1348 Score = 953 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 589/625 (94%), Gaps = 2/625 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1411 GCATATACAAGTCAGATTGTGGTAATGGTA-ATGCTAGCTTTAGCAATAGGAAGTGACAC 1469 ||||| ||||| ||||||| || | | ||| | | ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1348 GCATACACAAGACAGATTGAGGGACT-GTATAGGGTAGCTTTAGCAATTGGAAGTGACAC 1406 Query 1470 AATCTCCAGCCAAAAGAGACGGGAAGCTATAATCGATGGACTACTTGATTTGCCGTATAA 1529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1407 AATCTCCAGCCAAAAGAGACGGGAAGCTATAATCGATGGACTACTTGATTTGCCGTATAA 1466 Query 1530 GGTTAAGGAAGTACTAAAGCTAGACGATGAAATGAAAGATCTCGCGCAACTCTTGATAGA 1589 ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 1467 GGTTAAGGAAGTACTAAAGCTGGACGAGGAAATGAAAGATCTCGCACAACTTTTGATAGA 1526 Query 1590 CGAGCAGTCACTGCTAGTGTTTGGCAGAGGATACAACTACGCAACAGCTTTAGAAGGAGC 1649 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1527 CGAGCAGTCACTGCTTGTGTTTGGCAGAGGATACAACTACGCAACAGCTTTAGAAGGAGC 1586 Query 1650 ATTAAAAGTAAAAGAAGTAGCACTTATGCACAGTGAAGGAATACTTGCAGGAGAAATGAA 1709 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1587 ATTGAAAGTAAAAGAAGTAGCACTTATGCATAGTGAAGGAATACTAGCAGGAGAAATGAA 1646 Query 1710 ACATGGACCTTTAGCTTTGGTTGATGAGAATCTCCCCATAGCTGTGATTGCCACTCGTGA 1769 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 1647 ACATGGACCTTTAGCTTTAGTTGATGAGAATCTTCCCATTGCTGTGATCGCCACTCGTGA 1706 Query 1770 TGCTTGTTTCAGTAAACAACAATCTGTGATTCAGCAACTTCACGCACGCAAAGGGAGACT 1829 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1707 TGCTTGTTTCAGCAAACAACAGTCTGTGATTCAGCAACTTCACGCACGCAAAGGGAGATT 1766 Query 1830 AATAGTAATGTGCTCAAAAGGTGATGCTGCATCGGTAAGCTCGAGTGGTTCTTGTCGAGC 1889 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1767 AATAGTAATGTGCTCAAAAGGTGATGCTGCATCAGTAAGCTCGAGTGGATCTTGTCGAGC 1826 Query 1890 TATCGAAGTTCCTCAAGTTGAAGATTGTTTACAACCTGTTATTAATATAGTGCCATTACA 1949 ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| Sbjct 1827 TATTGAAGTTCCTCATGTGGAAGATTGTTTACAACCGGTTGTCAATATAGTGCCATTACA 1886 Query 1950 GTTGTTGGCTTATCATCTGACTGTTTTGAGAGGTCACAATGTTGATCAACCGAGGAATCT 2009 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1887 GTTGTTGGCTTATCATCTGACTGTTTTGAGAGGTCACAACGTTGATCAACCGAGGAATCT 1946 Query 2010 GGCAAAGAGTGTGACTACTCAATAG 2034 ||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 1947 GGCGAAGAGCGTGACTACTCAATAG 1971 > Ahg916257 jgi|Araly1|916257|Al_scaffold_0008_1008 Length=1422 Score = 1402 bits (759), Expect = 0.0 Identities = 827/861 (96%), Gaps = 0/861 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1174 ATGGAGATTGCTAGTGATCTATGGGACCGGCAAGGTCCAATATACAGAGAAGATACCGCG 1233 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 562 ATGGAGATTGCTAGTGATCTCTGGGACCGGCAAGGTCCAATATACAGAGAAGATACTGCG 621 Query 1234 GTGTTTGTGAGTCAGTCTGGTGAAACTGCAGATACACTACTTGCTTTGGACTATGCTCGA 1293 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 622 GTGTTTGTGAGTCAGTCTGGTGAAACCGCAGATACACTACTTGCTTTGGACTATGCTCGG 681 Query 1294 GAAAACGGTGCATTATGTGTCGGCATAACTAACACCGTTGGGAGCTCCATAGCTAGAAAA 1353 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 682 GAAAACGGTGCATTATGTGTCGGCATAACTAACACCGTTGGGAGCTCGATAGCTAGAAAA 741 Query 1354 ACACACTGTGGTGTCCATATAAACGCAGGAGCTGAGATTGGTGTCGCAAGTACAAAGGCA 1413 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 742 ACACACTGTGGTGTTCATATAAACGCAGGAGCTGAGATTGGTGTCGCAAGTACAAAGGCA 801 Query 1414 TATACAAGTCAGATTGTGGTAATGGTAATGCTAGCTTTAGCAATAGGAAGTGACACAATC 1473 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 802 TACACAAGTCAGATTGTGGTAATGGTTATGCTAGCTTTAGCAATTGGAAGTGACACAATC 861 Query 1474 TCCAGCCAAAAGAGACGGGAAGCTATAATCGATGGACTACTTGATTTGCCGTATAAGGTT 1533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 862 TCCAGCCAAAAGAGACGGGAAGCTATAATCGATGGACTACCTGATTTGCCGTATAAGGTT 921 Query 1534 AAGGAAGTACTAAAGCTAGACGATGAAATGAAAGATCTCGCGCAACTCTTGATAGACGAG 1593 ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 922 AAGGAAGTACTAAAGCTGGACGAGGAAATGAAAGATCTCGCACAACTTTTGATAGACGAG 981 Query 1594 CAGTCACTGCTAGTGTTTGGCAGAGGATACAACTACGCAACAGCTTTAGAAGGAGCATTA 1653 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 982 CAGTCACTGCTTGTGTTTGGCAGAGGATACAACTACGCAACAGCTTTAGAAGGAGCATTG 1041 Query 1654 AAAGTAAAAGAAGTAGCACTTATGCACAGTGAAGGAATACTTGCAGGAGAAATGAAACAT 1713 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1042 AAAGTAAAAGAAGTAGCACTTATGCATAGTGAAGGAATACTAGCAGGAGAAATGAAACAT 1101 Query 1714 GGACCTTTAGCTTTGGTTGATGAGAATCTCCCCATAGCTGTGATTGCCACTCGTGATGCT 1773 |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1102 GGACCTTTAGCTTTAGCTGATGAGAATCTTCCCATTGCTGTGATTGCCACTCGTGATGCT 1161 Query 1774 TGTTTCAGTAAACAACAATCTGTGATTCAGCAACTTCACGCACGCAAAGGGAGACTAATA 1833 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1162 TGTTTCAGCAAACAACAGTCTGTGATTCAGCAACTTCACGCACGCAAAGGGAGATTAATA 1221 Query 1834 GTAATGTGCTCAAAAGGTGATGCTGCATCGGTAAGCTCGAGTGGTTCTTGTCGAGCTATC 1893 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 1222 GTAATGTGCTCAAAAGGTGATGCTGCATCAGTAAGCTCGAGTGGATCTTGTCGAGCAATC 1281 Query 1894 GAAGTTCCTCAAGTTGAAGATTGTTTACAACCTGTTATTAATATAGTGCCATTACAGTTG 1953 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 1282 GAAGTACCTCAAGTTGAAGATTGTTTACAACCTGTTCTTAATATAGTACCATTACAGTTA 1341 Query 1954 TTGGCTTATCATCTGACTGTTTTGAGAGGTCACAATGTTGATCAACCGAGGAATCTGGCA 2013 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1342 TTGGCTTATCATCTGACTGTTTTGAGAGGTCACAACGTTGATCAACCGAGGAATCTGGCG 1401 Query 2014 AAGAGTGTGACTACTCAATAG 2034 ||||||||||||||||||||| Sbjct 1402 AAGAGTGTGACTACTCAATAG 1422 Score = 553 bits (299), Expect = 2e-156 Identities = 363/393 (92%), Gaps = 7/393 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTGTGGAATCTTCGCGTATCTGAATTTTCACGCGAACAAAGAGAGACGATACATTCTC 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGTGTGGAATCTTCGCGTATTTGAATTTTCACGCTAACAAAGAGAGACGATACATTCTC 60 Query 61 GATG-TTCTCTTCAATGGTCTTCGTCGTCTTGAATACAGAGGCTACGATTCTGCTGGAAT 119 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 61 GA-GATTCTCTTCAATGGTCTTCGTCGTCTTGAATACAGAGGCTATGATTCAGCTGGAAT 119 Query 120 CGCCATTGATAATTCTTC-TC-CT-TCTTCTTCTCCTCTCGTGTTTCGTCAAGCAGGAAA 176 ||| |||||| ||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 120 CGCAATTGATGATTCTTCAACAATCTCTTCCCCTCCTCTTGTGTTTCGTCAAGCAGGAAA 179 Query 177 CATTGAATCACTTGTTAATTCCGTTAACGAAGAGATTACGAATACGGATTTGAATC-TAG 235 |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| Sbjct 180 CATTGAATCACTCGTTAATTCTGTAAACGAAGAGATTACGAATACAGATTT-AAACTTAG 238 Query 236 ACGAAGTTTTCTACTTTCATGCTGGAATTGCACATACGAGGTGGGCTACTCATGGTGAGC 295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| Sbjct 239 ATGAAGTTTTCTACTTTCATGCTGGAATTGCACATACTAGATGGGCTACACATGGTGAGC 298 Query 296 CAGCTCCAAGGAATAGTCATCCTCAATCTTCTGGTCCTGGAGATGATTTTTTGGTGGTTC 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 CAGCTCCAAGGAATAGTCATCCTCAATCTTCTGGTCCTGGAGATGATTTTTTGGTGGTTC 358 Query 356 ATAATGGTGTTATCACTAACTATGAGGTATTGA 388 ||||||||||||||||||| |||||| || ||| Sbjct 359 ATAATGGTGTTATCACTAATTATGAGATACTGA 391 Score = 189 bits (102), Expect = 7e-47 Identities = 116/123 (94%), Gaps = 0/123 (0%) Strand=Plus/Plus Query 514 GAAGTTGTGTTTGAAGTGATGAGGCATCTTGAAGGAGCTTATGCTCTTATATTTAAAAGC 573 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 439 GAAGTTGTCTTTGAAGTGATGAGGCATCTTGAAGGAGCTTATGCTCTTATATATAAAAGC 498 Query 574 TGGCATTATCCGAATGAGTTAATTGCGTGCAAGCTTGGTAGTCCATTGCTTTTAGGTGTT 633 |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 499 TGGCATTACCCGAACGAGTTGATTGCGTGCAAGCTTGGTAGCCCGTTGCTTTTAGGTGTT 558 Query 634 AAA 636 ||| Sbjct 559 AAA 561 Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-13 Identities = 54/60 (90%), Gaps = 1/60 (2%) Strand=Plus/Plus Query 432 AGATACTGAAGTAATTCCTAAGCTTGCT-AAGTTTGTTTTTGACAAAGCTAATGAAGAAG 490 ||||||||| || || || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 383 AGATACTGAGGTTATACCAAAGCTTGCTAAAATTTGTTTTTGACAAAGCTAATGAAGAAG 442 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 76485211960 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5