BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G24240.1
Length=3771
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg479903 jgi|Araly1|479903|fgenesh2_kg.3__2604__AT3G24240.1 5618 0.0
> Ahg479903 jgi|Araly1|479903|fgenesh2_kg.3__2604__AT3G24240.1
Length=3718
Score = 5618 bits (3042), Expect = 0.0
Identities = 3426/3614 (95%), Gaps = 15/3614 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGTTTAATTCAAGCAAGAAACAGATTTCGAGAGAAGAGTAAGCACAGAGATAGAGAGAA 60
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 GAGTTTAATTCAAGCAAGAAACAGATATCGAGAGAAGAGTAAGCACAGAGATTGAGAGAA 60
Query 61 AGAAGGCACCAAACCCTAAATGGGTCTAAACCCAAGATTTTAATCTTCTTTTCGTATTTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 AGAAGGCACCAAACCCTAAATGGGTCTAAACCCAAGATTTTAAACTTCTTTTCGTATTTT 120
Query 121 GAGGCAAATGtctcttcattccttaatcttcttctcctcctcttcttcttcacttctctt 180
|||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||
Sbjct 121 GAGGCAAATGTCTCTTCATTCCTTAA---TCTTCT--T-CTCTTCTTCTTCATTTCTCTT 174
Query 181 ctctttcttctt-tatcttcatcttctgtttctctctctctGATGCAGAGCAGAACCCGG 239
|||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 175 CTCTTTCTTCTTCT-TCTTCATCTTTTGTTTCTCTCTCTCTGATGCAGAGCAAAACCCGG 233
Query 240 AAGCTTCTATCCTTTACTCATGGcttcactcttcttctcctacaccttcttctctttctc 299
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 234 AAGCTTCTATTCTCTACTCATGGCTTCACTCTTCTTCTCCTACACCTTCTTCTCTTCCTC 293
Query 300 tcttcAACTGGAACTCTATAGACAACACTCCTTGCAACAACTGGACATTTATCACATGTT 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 294 TCTTCAACTGGAACTCTATAGACAACACTCCTTGCGACAACTGGACTTTTATTACTTGTT 353
Query 360 CTTCTCAAGGTTTCATCACCGACATAGACATTGAATCTGTCCCTCTTCAGCTCTCCTTAC 419
|| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 354 CTCCTCAAGGTTTCGTCACCGACATCGACATTGAATCTGTCCCTCTTCAGCTCTCTTTAC 413
Query 420 CGAAGAATCTCCCAGCGTTTCGTTCTCTCCAGAAACTCACTATCTCCGGGGCCAATCTCA 479
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||
Sbjct 414 CGAAGAATCTCCCGGCGTTACGTTCTCTCCAGAAACTCACTATCTCTGGCGCTAATCTCA 473
Query 480 CCGGAACTTTACCGGAAAGTCTTGGTGACTGCCTCGGCCTCAAGGTTCTTGATCTTAGCT 539
||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||
Sbjct 474 CCGGAACTTTACCTGAGAGTCTCGGTGACTGCCTTGGTCTCACGGTTCTTGATCTTAGCT 533
Query 540 CCAACGGCTTAGTTGGTGACATTCCTTGGAGTTTAAGCAAGCTACGTAACCTAGAAACGC 599
| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 534 CTAATGGTTTAGTTGGTGACATTCCTTGGAGTTTAAGCAAGCTACGTAACCTAGAAACCC 593
Query 600 TAATCCTCAACTCAAACCAACTCACCGGAAAAATCCCACCGGATATCAGCAAATGTTCGA 659
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||
Sbjct 594 TAATCCTCAACTCTAACCAACTCACCGGAAAAATCCCACCAGATATCAGCAAGTGTTTGA 653
Query 660 AACTCAAGAGCCTGATTCTCTTCGACAATCTTCTCACCGGAAGTATCCCCAC-GGAGCTA 718
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||
Sbjct 654 AACTCAAGAGCTTGATTCTCTTCGACAATCTTCTCACCGGACCTAT-CCCGCTGGAGCTA 712
Query 719 GGGAAGCTCTCTGGTCTCGAAGTAATAAGAATAGGAGGAAACAAAGAAATCTCCGGCCAA 778
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 GGGAAGCTCTCTGGCCTCGAAGTGATAAGAATAGGAGGAAACAAAGAAATCTCCGGCCAA 772
Query 779 ATCCCATCAGAGATCGGAGATTGTTCCAATCTAACAGTTCTTGGTTTAGCCGAGACAAGC 838
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 773 ATCCCACCGGAGATCGGAGATTGTTCCAATCTAACAGTTCTTGGTTTAGCTGAAACAAGC 832
Query 839 GTCTCAGGAAACTTGCCTTCTTCCTTAGGTAAGCTCAAGAAGCTAGAAACACTCTCGATA 898
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 833 GTCTCCGGAAACTTGCCTTCTTCCTTAGGTAAGCTCAAGAAGCTACAAACACTCTCGATA 892
Query 899 TACACAACAATGATAAGTGGTGAGATTCCTTCTGATTTAGGGAATTGCTCTGAGCTTGTT 958
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 TACACAACAATGATAAGTGGAGAGATTCCTTCAGATTTAGGGAATTGCTCTGAGCTTGTT 952
Query 959 GATCTCTTCTTGTACGAGAATAGCTTGTCTGGTTCCATCCCTCGAGAAATCGGACAGCTA 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 953 GATCTCTTCTTGTACGAGAATAGCTTGTCTGGTTCAATCCCTCGAGAAATCGGAAAGCTT 1012
Query 1019 ACGAAACTGGAACAGCTGTTTCTATGGCAGAACAGTCTCGTTGGTGGTATCCCTGAAGAA 1078
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 TCTAAACTCGAACAGCTGTTTCTATGGCAGAACAGTCTCGTTGGTGGTATCCCTGAAGAA 1072
Query 1079 ATAGGAAACTGCAGCAATCTCAAAATGATAGATTTGTCTTTAAACCTCCTCTCTGGTTCG 1138
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1073 ATAGGAAACTGCAGCAATCTCAAAATGATAGATTTGTCTTTAAATCTCCTCTCTGGTTCC 1132
Query 1139 ATTCCAAGCTCCATTGGTCGTTTGTCTTTTCTTGAAGAGTTTATGATCAGTGACAACAAG 1198
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 ATTCCAACCTCCATTGGGCGTTTGTCTTTTCTTGAAGAGTTTATGATCAGTGACAACAAA 1192
Query 1199 TTCTCCGGTTCAATACCAACAACAATCTCAAACTGCTCGAGTCTTGTCCAGTTACAGCTC 1258
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 ATCTCCGGTTCAATACCAACAACAATCTCGAACTGTTCGAGTCTTGTCCAGTTACAGCTC 1252
Query 1259 GATAAGAATCAGATTTCAGGTCTAATACCGTCCGAGCTTGGAACACTCACAAAGCTTACT 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GATAAGAATCAGATTTCAGGTCTAATACCGTCCGAGCTTGGAACACTCACAAAGCTTACT 1312
Query 1319 CTGTTCTTTGCTTGGTCTAATCAGCTAGAAGGAAGTATCCCTCCTGGTTTAGCAGATTGT 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1313 CTGTTCTTTGCTTGGTCTAATCAGCTAGAAGGAAGCATCCCTCCCGGTTTAGCAGAATGT 1372
Query 1379 ACTGATCTTCAAGCATTGGATTTGTCGCGCAATTCGCTAACCGGAACAATCCCTTCCGGT 1438
|||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1373 ACTGATCTCCAAGCATTAGATTTGTCGCGTAATTCGCTAACCGGGACAATCCCTTCCGGT 1432
Query 1439 TTGTTTATGCTAAGGAACCTCACAAAGCTTCTCTTGATCTCAAACTCTCTGTCTGGTTTT 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 TTGTTTATGCTAAGGAACCTCACAAAGCTTCTTTTGATCTCAAACTCTCTGTCTGGTTTT 1492
Query 1499 ATACCTCAAGAGATTGGTAATTGCAGCTCTTTGGTGAGATTGAGGTTAGGTTTCAACAGG 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 ATACCTCAAGAGATTGGTAATTGCAGCTCTTTGGTGAGATTGAGGTTAGGTTTCAACAGG 1552
Query 1559 ATCACAGGAGAGATTCCTTCGGGTATTGGTTCTCTTAAGAAGATAAACTTTCTCGATTTC 1618
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1553 ATCACAGGAGAGATTCCCTCGGGTATTGGTTCGCTTAAGAAGCTAAACTTTCTCGATTTT 1612
Query 1619 TCGAGTAATAGGCTACATGGAAAGGTTCCTGATGAGATTGGAAGCTGTTCAGAGTTACAG 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1613 TCGAGTAATAGGCTACATGGAAAGGTTCCTGATGAGATTGGAAGCTGCTCGGAGTTACAG 1672
Query 1679 ATGATTGATCTCAGTAATAACTCTCTTGAAGGTTCTTTGCCTAATCCGGTTTCTTCACTC 1738
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1673 ATGATTGATCTCAGTAATAACTCTCTTGAAGGTTCTTTGCCTAATCCGGTTTCTTCTCTC 1732
Query 1739 TCCGGTTTACAAGTACTTGATGTTTCAGCTAACCAGTTTTCAGGCAAGATTCCAGCGAGT 1798
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733 TCCGGTTTACAAGTTCTTGATGTTTCAGCTAACCAGTTTTCAGGCAAGATTCCAGCGAGT 1792
Query 1799 TTAGGACGGCTTGTGTCACTGAACAAACTAATCTTGAGCAAGAACCTGTTCTCAGGATCG 1858
|| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1793 TTGGGGCGGCTTGTGTCACTAAACAAACTAATCTTGAGCAAGAACTTGTTCTCCGGATCG 1852
Query 1859 ATACCTACTTCTCTAGGGATGTGTTCAGGGCTTCAGCTTCTTGATCTTGGAAGCAACGAG 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1853 ATACCTACTTCTCTAGGGATGTGTTCAGGGCTTCAGCTTCTTGATCTTGGAAGCAACGAG 1912
Query 1919 CTCTCTGGTGAGATTCCTTCAGAGCTTGGAGATATCGAGAATCTTGAAATCGCGTTAAAC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 CTCTCTGGTGAGATTCCTTCAGAGCTTGGAGATATCGAGAATCTTGAAATCGCGTTAAAC 1972
Query 1979 TTGAGTAGCAATAGACTCACTGGGAAGATTCCTTCAAAGATTGCGTCTCTCAACAAGCTC 2038
||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973 CTGAGTAGTAACAGACTCACAGGGAAGATTCCTTCAAAGATTGCGTCTCTCAACAAGCTC 2032
Query 2039 TCGATTCTTGATCTCTCTCACAACATGCTTGAAGGAGATCTTGCTCCACTCGCTAATATT 2098
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2033 TCGATTCTTGATCTCTCTCACAACATGCTCGAAGGAGATCTTGCTCCACTCGCCAATATC 2092
Query 2099 GAGAATCTAGTCTCTCTTAACATATCTTACAATAGCTTCTCTGGTTATCTTCCAGACAAC 2158
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 GAGAATCTCGTCTCTCTTAACATCTCTTACAATAGCTTCTCTGGTTATCTTCCAGACAAC 2152
Query 2159 AAGCTTTTCAGACAATTATCTCCTCAAGATCTTGAAGGAAACAAGAAACTCTG-T-T-CT 2215
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||
Sbjct 2153 AAGCTTTTCAGACAATTACCTCTTCAAGATCTTGAAGGAAACAAAAAACTCTGCTCTTCT 2212
Query 2216 TCGACTCAAGATTCTTGCTTTCTCACCTACAGAAAGGGTAATGGACTTGGAGATGATGGT 2275
|| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 TCAACTCAAGATTCTTGCTTTCTCACCTATGGGAAGGGTAATGGACTTGGAGATGATGGT 2272
Query 2276 GATGCTTCTCGTACAAGGAAGCTAAGGTTAACACTCGCACTTTTGATCACCTTGACGGTT 2335
||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 GATTCTTCTCGTACAAGAAAGCTTAGGTTAGCACTCGCTCTTTTGATCACCTTGACGGTT 2332
Query 2336 GTGTTGATGATTCTTGGCGCGGTTGCGGTTATCCGAGCGAGGAGGAATATTGATAATGAA 2395
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || |||
Sbjct 2333 GTGTTGATGATTCTTGGTGCGGTTGCGGTTATTCGAGCCAGAAGGAACATCGAAAACGAA 2392
Query 2396 AGAGATTCAGAGCTTGGAGAAACATATAAATGGCAGTTCACACCGTTTCAGAAGCTGAAT 2455
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2393 AGGGATTCTGAGCTTGGAGAAACATATAAATGGCAGTTCACACCATTTCAGAAGCTGAAT 2452
Query 2456 TTCTCGGTAGATCAAATCATTAGATGTTTAGTTGAACCAAATGTGATTGGTAAAGGATGT 2515
||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 TTCTCTGTAGATCAGATCATAAGATGTTTGGTTGAACCTAATGTGATTGGTAAAGGATGT 2512
Query 2516 TCAGGCGTAGTTTACCGCGCTGATGTGGACAACGGAGAGGTTATAGCCGTGAAGAAGCTT 2575
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 TCAGGCGTAGTTTACCGCGCTGATGTGGACAATGGCGAGGTTATAGCCGTGAAGAAGCTT 2572
Query 2576 TGGCCAGCGATGGTTAACGGTGGTCATGATGAGAAGACCAAAAACGTTAGAGATTCGTTT 2635
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2573 TGGCCAGCGATGGTTAATGGTGGTCACGATGAGAAGACCAAAAACGTGAGAGATTCGTTT 2632
Query 2636 TCAGCTGAAGTTAAGACACTAGGGACGATCAGACACAAGAACATAGTTCGGTTTCTCGGA 2695
||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 TCAGCAGAAGTTAAGACACTTGGGACGATTAGACACAAGAACATAGTTCGGTTTCTCGGA 2692
Query 2696 TGTTGTTGGAACCGAAACACAAGGCTTTTGATGTATGATTACATGCCTAATGGGAGCTTA 2755
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2693 TGTTGTTGGAACCGAAACACGAGGCTTTTGATGTATGATTACATGCCTAATGGAAGCTTA 2752
Query 2756 GGGAGTTTGCTTCACGAGAGACGAGGATCTTCGCTTGATTGGGATCTTAGATACAGAATC 2815
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 GGGAGTTTGCTTCACGAGAGACGAGGGTCTTCGCTTGATTGGGATCTTAGATACAGAATC 2812
Query 2816 TTGCTTGGTGCAGCTCAAGGTTTAGCTTATTTACATCATGATTGCCTCCCACCCATTGTT 2875
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TTGCTTGGTGCAGCTCAAGGTTTAGCTTATTTACACCATGATTGCCTCCCACCCATTGTT 2872
Query 2876 CACCGCGATATCAAAGCCAACAACATCTTGATCGGTTTAGATTTCGAGCCTTACATTGCA 2935
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 CACCGCGATATCAAAGCCAACAACATCTTGATCGGTCTAGATTTCGAGCCTTACATTGCG 2932
Query 2936 GATTTCGGCTTAGCCAAGCTTGTCGATGAAGGTGACATTGGTCGGTGTTCTAATACCGTT 2995
||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2933 GATTTTGGTTTAGCAAAGCTTGTTGATGAAGGTGATATTGGCCGGTGTTCTAATACCGTC 2992
Query 2996 GCTGGATCTTATGGTTACATTGCTCCAGAGTATGGATATAGCATGAAGATTACAGAGAAG 3055
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2993 GCTGGATCTTATGGTTACATTGCTCCAGAGTATGGTTATAGCATGAAGATTACAGAGAAG 3052
Query 3056 AGTGATGTTTATAGCTATGGTGTGGTAGTTCTTGAAGTGTTGACTGGGAAACAACCTATA 3115
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3053 AGTGATGTTTATAGCTACGGTGTAGTTGTTCTTGAAGTGTTGACCGGGAAACAACCTATA 3112
Query 3116 GACCCTACGGTACCAGAAGGGATTCACTTAGTGGATTGGGTGAGGCAGAATAGAGGTAGC 3175
|| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 3113 GATCCGACGGTACCAGAAGGGCTTCACTTAGTGGATTGGGTGAGGCAAAATAGGGGTAGC 3172
Query 3176 CTCGAAGTTCTTGACTCGACATTGAGATCAAGAACCGAAGCTGAAGCGGATGAGATGATG 3235
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3173 CTCGAAGTTCTTGATTCGACATTGAGATCAAGAACAGAAGCTGAGGCGGATGAGATGATG 3232
Query 3236 CAAGTGTTGGGCACTGCTTTGCTGTGTGTGAACTCGTCTCCGGATGAGAGACCTACCATG 3295
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 3233 CAAGTGTTGGGAACTGCTTTGCTGTGTGTAAACTCATCTCCAGACGAGAGACCCACCATG 3292
Query 3296 AAAGACGTTGCGGCTATGCTCAAAGAGATTAAGCAAGAGCGTGAGGAGTACGCGAAAGTT 3355
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 AAAGACGTTGCGGCTATGCTGAAAGAGATCAAGCAAGAGCGTGAGGAGTACGCGAAAGTT 3352
Query 3356 GACTTGCTTCTCAAGAAATCTCCTCCGCCAACAACAACAATGCAAGAGGAATGTCGGAAG 3415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 3353 GACTTGCTTCTCAAGAAATCTCCTCCGCCAACAACAACAATGCAAGAGGAAAGTCGTAAG 3412
Query 3416 AATGAGATGATGATGAT-TCCGGCGGCTGCAGCTTCGTCTTCTAAAGAGATGAGACGAGA 3474
|||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3413 AATGAGATGACGATGATCTC-GGCGGCTGCGGCTTCGTCTTCTAAAGAGATGAGACGAGA 3471
Query 3475 AGAAAGATTATTGAAGAGTAACAACACGAGTTTCTCTGCTTCGTCTCTGCTTTACTCTTC 3534
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
Sbjct 3472 AGAAAGATTAGTGAAGAGTAACAACACGAGTTTCTCTGCTTCTTTTCTGCTTTACTCTCC 3531
Query 3535 TTCTTCTTCAATCGAGTGATTTTAAGGTTTGAAGGTTACGTGAGAAGAAAGCTTTTGTGT 3594
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3532 TTCTTCTTCAATCGAGTGATTTTAAGGTTTAAAGGTTACGTGAGAAGAAAGCTTTTGTGT 3591
Query 3595 GTTGTTTGAGAAAA 3608
||||||||||||||
Sbjct 3592 GTTGTTTGAGAAAA 3605
Score = 187 bits (101), Expect = 5e-46
Identities = 110/114 (96%), Gaps = 1/114 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3659 AAAAGAAGAAGAATAGAATGAGAGAA-GTGAGTCAGTAATGTTATGGAATTGTGATTAGT 3717
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3605 AAAAGAAGAAGAATAGAACGAGAGAAGGTGAGTCAGTAATGTTATGGAATTGTGATTAGC 3664
Query 3718 AAAGGGTGACATGATATTGTACCTTTTTGGGCGGTTTGAAATCAATAATTTCTC 3771
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3665 AAAGGGTGACATGATATTGTACCTTTTTGGGTGGTTTGAAATCAATAATTTCTC 3718
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 142487553312
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5