BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT3G27670.1

Length=5865
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg484555 jgi|Araly1|484555|fgenesh2_kg.5__547__AT3G27670.1         9116    0.0  


> Ahg484555 jgi|Araly1|484555|fgenesh2_kg.5__547__AT3G27670.1
Length=5806

 Score = 9116 bits (4936),  Expect = 0.0
 Identities = 5537/5825 (95%), Gaps = 49/5825 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  45    GGGTCGGTTCGGTTTCTCTA--TTATCTTATTGGGCCAAATCG-GACGGCCCATTATCTA  101
             ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1     GGGTCGGTTCGGTTTCTCTAGCTTAACTTATTGGGCCAAATCGAGACGGCCCATTATCTA  60

Query  102   GCTCCGGCTTATCGGACTTCCTCTTCCCCGGCGCTGTAAATTCCAAGTCCCTCCGTTCAC  161
             || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  61    GCACCGGCTTATCGGACTTCCTC-TACCCGGCGCTGTAAATTCCAAATCCCTCCGTTCAC  119

Query  162   GTCTCCAAACTAGCCGTTGCCTTCTCTCTCTCCAGCCAAAGCGATGGCCTCATACGCTAC  221
             ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   GTCTCCAAACTAGCCGTTGCC-T-TCTCTCTCCGGTCAAAGCGATGGCCTCATACGCTAC  177

Query  222   GTTACTGGAGAAAACTCGCGTACCTCAACCTTCTATACAAAGATTCGCAGTAATCTCCGT  281
             |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  178   GTTACTGGAGAAAACTCGCGTTGCTCAACCTTCTATACAAAGATTCGCAGTAATTTCCGT  237

Query  282   CTTCTCCAAGTTACGATCTGCTCCAGAACAATTTGGATCAGAAGCCGAAGCCGGAAGAGA  341
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct  238   CTTCTCCAAGTTACGATCTGCTCCAGAACAATTAGGATCAGAATCTGAAGCCGGAAGAGA  297

Query  342   AGCTATCTCCTTCTGCCTCACTTCTGAATCTATCACTGTCGTTGATCAATCCGTTCATGA  401
             ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct  298   AGCTATCTCCTTCTGTCTCACTTCTGAATCTGTCACTGTAGTTGATCAATCCGTTCGTGA  357

Query  402   GCTATGTCGATTAGTATCAGACTCAGTTTTAGACCTCTCTCGTGGTTTGCTAGAACTTCA  461
             |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  358   GCTATGTCGATTAGTATCAGACTCTGTCTTAGACCTCTCTCGTGGTTTGTTAGAACTTCA  417

Query  462   ATCAGCTCTCGAAGGATGCGATTCGAAATTGGTTTCGCTGTTCGTGAAAGGGTTAGGGTT  521
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  418   ATCAGCTCTCGAAGGATGCGATTCGAAATTGGTTTCGCTGTTTGTGAAAGGGTTAGGGTT  477

Query  522   TTTGATTCGTATTGGTTATGAACGGAATAATGGGAACTGGAAGTTTAATTCGACGGAGAA  581
             ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  478   TTTGATTCGTATTGGTTATGAACGGAATTCTGGGAATTGGAAGTTTAATTCGACGGAGAA  537

Query  582   TCATCCGTTTGTTAGGATTCAATCTAGCCGAGTGGAGACACAGACGGAGCTTCTTCATCA  641
             ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538   TCATCCGTTTGTTAGGATTCTTTCTAGCCGAGCGGAGACACAGACGGAGCTTCTTCATCA  597

Query  642   AGTATCACTCTTTGTGATGCATAATCGAAGATTAGGAATGGTGGGAGTATGTGAATTCTT  701
             |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598   AGTATCACTCTTTGTGATGCATAATCGGCGATTAGGAATGGTGGGAGTATGTGAATTCTT  657

Query  702   GGAGCCGTTCTTGAATTTCACTATACTGCGGATTCCGCTTTCAGATTCGTCTTCATCGTT  761
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||
Sbjct  658   GGAGCCGTTCTTGAATTTCACAATACTGCGGATTCCACTTGCAGATTCGTCGTCATCGTT  717

Query  762   GTTTGCGAGGGAGTTGATTTCATCAATGGCTTCCCTTTGTTGCTCATCCCGCCACGAAGC  821
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct  718   GTTTGCGAGGGAGTTGATTTCATCAATGGCTTCCCTTTGTTGCTCATCCCGCAAAGAAGC  777

Query  822   ACTACCGATATTCAGATTGCTTA-TGCGATGTCTAAAATATATCCCGGGAAATAATCT--  878
             ||| ||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||||||||| |||||  
Sbjct  778   ACTTCCGATATTCAGGTTGC-TATTGCGTTGCCTAAAATATATCCCGGGAAAAAATCTGG  836

Query  879   --G------G--A----AG-TA-ATTGTCAAGATC-CTAGTGGATGCCTACACTGTGGTT  921
               |      |  |    || || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837   AAGACAATAGAAATTTCAGCTACATTGTCAAGA-CTCTAGTGGATGCCTACACTGTGGTT  895

Query  922   GTGAGAGACTTGGTTGGAACCGGATTGGAAGTAACAGAAGTTCATTTGCTCGGTGTGCAA  981
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct  896   GTGAGAGACTTGGTTGGAACTGGATTGGAAGTAACAGAAGTTCATCTGCTCGGCGTGCAA  955

Query  982   CTGGTGGATGGCGTACTTTTTCTTTGCGCTTCTCCTCATGTACAAACAACCGAACAAGAG  1041
             ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956   CTGGTAGATGGTGTACTTTTTCTTTGCGCTTCTCCTCATGTACAAACAACCGAACAAGAG  1015

Query  1042  TCTGTTATCGAATCTTTGAAGCACTTGTTGGCTGTTCAGAAAGACCTTGGATTAGCATAT  1101
             |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1016  TCTGTTATCGAATCTTCGAAGCATTTGTTGGCTGTTCAGAAAGACCTTGGATTACCATAT  1075

Query  1102  TCACATGATTTATCCTTGGTGGTTCTCTCGCTAGTTTTCATGCTTGCCAAATCTACTGTC  1161
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct  1076  TCACGTGATTTATCCTTGGTGGTTCTCTCGCTAGTTTTCATGCTTGCCAAATCCAGTGTC  1135

Query  1162  GAGCATGAACAACTCTGTATTCTAAAGTTTCTGCTTTTTCTGCTCAAATGGAAAACTGAA  1221
             |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1136  GAGCATGAACAACTCTCTATTCTAAAGTTCCTGCTTTTTCTGCTCAAATGGAAAACTGAA  1195

Query  1222  AGTGAAAACTTGTCGGTTAAGGATGCGGCTGGTTCAAGTGTGGAGTCTCTATTATTGTTC  1281
             |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1196  AGTGAAAACTTGTCGGTTAAAGATGCGGCCGGTTCAAGTGTGGAGTCTCTATTATTGTTC  1255

Query  1282  CCTATCACCGCACTGATGTCTTCTCCTTCTAAATCAATCAAAGTAGCAGCAAGTAAGGTT  1341
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1256  CCTATCATCGCACTGATGTCTTCTCCTTCTAAATCAATCAAAGTAGCAGCAAGTAAGGTT  1315

Query  1342  CTTTCCATCGTAGAAAATTTCTTGGTAACAGTGTCAAATGCACCAAAGATTGAGGTCCAC  1401
             ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1316  CTTTCCATCATAGAAAATGTCTTGGTAACAGTGTCAAATGCACCAAAGATTGGGGTCCAC  1375

Query  1402  ACAAGTAAGGGAGATTCACCACTCAGCAGGGTGGGCTCTGTCGTATTTAGGTTCATGCAG  1461
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1376  ACAAGTAAGGGAGATTCACCACTCAGCAGGGTGGGCTCTGTCGTATTTAGGGTCATGCAG  1435

Query  1462  CAACTCTGGCATCAGAATGATTACACACCTTCCACGTCTTCCTTCCTCAGAGTGGCTTAC  1521
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct  1436  CAACTCTGGCATCAGAATGATTACGCACCTTCCACGCCCTCCTTCCTCAGAGTGGCTTAC  1495

Query  1522  ACCAATGGAAGTGAAAAACAGGAAACTTAT-CTAGGACCAGTGACTTGGAATTCACTACT  1580
             | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1496  ATCAATGGAAGTGAAAAACAGGAAACTTATAC-AGGACCAGTGACTTGGAATTCACTACT  1554

Query  1581  TAGGGAACACGCTGAACGGTTTTGGGATaaaaaaaaGTTGTCTGCGTCGTTTTGTCTTTC  1640
             ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1555  TAGGGAACATGCTGAACGGTTTTGGGATAGAAAAAAGTTGTCTGCGTCGTTTTGTCTTTC  1614

Query  1641  ACAAGAGATACCTATTTTACTTGGTGCTGTTGCTGGTGTCATGGTGATGCACCCGTCACT  1700
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1615  ACAAGAGATACCTATTTTACTTGGTGCTGTTGCTGGTGTCATGGTGATGCACCCGTCCCT  1674

Query  1701  AGGAGCTGATGCTATTGGTTCTTTGACTATTATTGGTGGCATTGATTCTAAGATGAGTGT  1760
             ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||
Sbjct  1675  AGGAGCTGATGCTGTTAGTTCTTTGACTATTATTGGTGGCATCGATCCTAAGATGTGTGT  1734

Query  1761  CCCGCTGTTGCTAGCTGTTCTATATTTCAGCAACTTGTTATCTCGAACTAACGTCCCTTG  1820
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1735  CCCGCTGTTGCTAGCTGTTCTATATTACAGCAACTTGTTATCTCGAACTAACGTCCCTTG  1794

Query  1821  TCAGAGTCTATTGTCAAAACTTCTGGGGTTGCTCCCATCACTAGCTGCACAACAGGTGAT  1880
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1795  TCAGGGTCTATTGTCAAAACTTCTGGGGTTGCTCCCATCACTAGCTGCCCAACAGGTGAT  1854

Query  1881  GATTCCACTTGTAGTTCAGACTATTACTCCAATGCTACGCAAGGATGCCAAAGGTCTGTT  1940
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct  1855  GATTCCACTTGTAGTTCAGACTATTACTCCAATGCTACACAAGGATGCGAAAGGTCTGTT  1914

Query  1941  GTATGCTACAGCTATTAGATTACTTTGCCAGACCTGGGTAGTCAATGACCGTGCCTTTTC  2000
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1915  GTATGCTACAGCAATTAGATTACTTTGCCAGACCTGGGTAGTCAATGACCGTGCCTTTTC  1974

Query  2001  GAGTTTGCAAGAGGTGTTACGCCCGCAAGGATTTATAGAATATATTTCAGAGAGACATAT  2060
              |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1975  AAGTTTGCAAGAGGTGTTACGCCCAAAAGGATTTATAGACTATATTTCAGAGAGACATAT  2034

Query  2061  CTGCATTAGTATGGCTGCTTCCATCCATGATGTATGCAAGAGACACCCTGATAGAGGAGT  2120
             |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct  2035  CTGCATTAGTATGGCTGCTTCCATTCACGATGTATGCAAGAGACACCCTGATAGGGGGGT  2094

Query  2121  AGACCTAATCTTGTCCGTTCAGGCCTGTATAGAAAGCCAAAACTGTCCAGTTAGAGCCCT  2180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||
Sbjct  2095  AGACCTAATCTTGTCCGTTCAGGCCTGTATAGAAAACCAAGACTATCCAGTTCGAGCACT  2154

Query  2181  TGGTTTTCAGAGTCTTTCGCATCTGTGTGAAGCCGATGTCATTGATTTCTATACTGCATG  2240
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2155  TGGTTTTCAGAGTCTTTCCCATCTGTGTGAAGCCGATGTCATTGATTTCTATACTGCATG  2214

Query  2241  GGATGTCATTAAGAAACATGCTCAACATATCAAACTGGATCCTCTCCTTGCTTATAGTGT  2300
             || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2215  GGGTGTCGTTAAGAAACATGCTCAACACATCAAACTGAATCCTCTCCTTGCTTATAGTGT  2274

Query  2301  ATGCCATCTTCTAAAGTGGGGTGCCATGGATGCCGAAGCATATCCTGAAGATGCAGAAAA  2360
             ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2275  ATGCCTTCTTCTAAAGTGGGGTGCAATGGATGCCGAAGCATATCCTGAAGATGCAGAAAA  2334

Query  2361  CGTTTTGAACATTTTGTGGGAAATTGGGAGCTCTATGCAGAAGCCTCATGATTCCCAATG  2420
             |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2335  CGTTCTGAACATTTTATGGGAAATTGGGAGCTCTATGCAGATGCCTCATGATTCCCAATG  2394

Query  2421  GACAAAGGCAAGAGTCTCTGCCATAGTGGCCCTGGGTCAATATGAGGTATCATTTATGGA  2480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2395  GACAAAGGCAAGAGTCTCTGCCATAGTGGCCCTGGGTCAATATGAGGTATCATTTATGGA  2454

Query  2481  -AAACAAGTTTTCTGACTTCAACAAGAATTGTACATATTTACTCTTCTCGGAGACAAATG  2539
              ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2455  GAAA-AAGTTTTCTGATTTCAACAAGAATTGTACATATTTGCTCTTCTCGGAGACAAATG  2513

Query  2540  CGGAAATTCTGAATGCTTTAGAAGACCTTTCAATCAAAATCATGATTCACGAGCACAGCG  2599
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2514  CGGAAATTTTGAATGCTTTAGAAGACCTTTCAATCAAGATCATGATTCACGAGCACAGCA  2573

Query  2600  TCCGGCGTAGATATGTAAGAGAGAAGAAAGTTCCTGGTAGTAAGATTGAAAAGCTGCTTG  2659
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2574  TCCGGCGTAGATATGTTAGAGAGAAGAAAGTTCCTGGTAGTAAGATTGAAAAGCTGCTTG  2633

Query  2660  ATGTGATACCTCAGGTCATCTTCCCTGCAGGGAAAGAAATAAAGACTGGAGAACTACCTG  2719
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2634  ATGTGATACCTCAGGTCATCTTCCCTGCAGGGAAAGAAATAAAGACTGGAGAACTACCTG  2693

Query  2720  GTGCGGCATTACTATGTCTATCTTATAACCCCAGAGATGTGAAGTTTGGGTCATCAAGAA  2779
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2694  GTGCGGCATTACTATGTCTATCTTATAACCCCAGAGATGTGAAGTTTGGGTCATCAAGAA  2753

Query  2780  GCTTTCATGATGTTCATTTTCAATACGAGGAGGCATTTAGAGTAGTAGTCAAATCTCTCC  2839
             |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2754  GCTTTCGTGATGTTCATAGTCAATACGAGGAGGCATTTAGAGTAGTAGTCAAATCTCTCC  2813

Query  2840  AGCTCTCAAGAAATATTTCCCTTGCTCTTATTTCCTTGCAATCACTGAAAGCTTTTATGC  2899
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2814  AGCTGTCAAGAAATATTTCCCTTGCTCTTATTTCCTTGCAATCACTGAAAGCATTTATGC  2873

Query  2900  GGCGTTGGATGAGAGCGAATATATTGTCCATTGATGCAACGACTAAAGAATTATCATCGG  2959
             |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2874  GGCGTTGGATGAGAGCTAATATCTTGTCCATTGATGCAACGAGTAAAGAATTATCATCGG  2933

Query  2960  ATAAGACCTCTAAAGCTACAAACAACATCATGAAGAGTTTGGTACATATGGCTGAAGAAG  3019
             |||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2934  ATAAAATTTCTAAAGCTGCAAACAACATCATGAAGAGTCTGGTACATATGGCTGAAGAAG  2993

Query  3020  CTCTTCCCAGGTGTGCAGAAAACATAGCACTGGCGCTGGGTGCACTATGTGCAGCTTTGC  3079
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2994  CTCTTCCCAGGTGTGCAGAAAACATAGCACTGGCACTGGGTGCACTATGTGCAGCTTTGC  3053

Query  3080  CAGCTGCTTCTCATAATATTAAAGCGTCTGCATCAAAATTTCTGTTGAGTTGGTTGTTGG  3139
             |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3054  CAGCTGCTGCTCATAATATTAAAGCGACTGCATCAAAATTTCTGTTGAGTTGGTTGTTGG  3113

Query  3140  AGCATGAGCATGAACACCGTCAGTGGACGGCTGGTATTTCTCTTGGATTGATTTCGTCGT  3199
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3114  AGCATGAGCATGAACACCGTCAGTGGACAGCTGGTATTTCTCTTGGATTGATTTCGTCGT  3173

Query  3200  CCCTACACGTAACTGACCACAAGCAGAAATTTCAGAATATATCTGGGCTTCTTGAGGTTT  3259
             ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3174  CCCTACATGTGACTGACCACAAGCAGAAATTTCAGAATATATCTGGGCTTCTTGAGGTTT  3233

Query  3260  TGTGTAGCAGTAAAAGCACTCTTGTAAAAGGAGCCTGTGGGGTTGGATTGGGTTTTTCAT  3319
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3234  TGTGTAGCAGTAAAAGCACTCTTGTAAAAGGAGCCTGTGGGGTTGGATTGGGTTTTTCAT  3293

Query  3320  GCCAAGATCTGCTCACTCGGACTGAAGCCTCTGCGAGCTCTGATATAGACAGTGACTCCT  3379
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3294  GCCAAGATCTGCTCACTCGGACTGAAGCCTCTGCGAGCTCTGATATAGACAGTGACTCCT  3353

Query  3380  ACAGGAACCAAGAAGAACGGCTCTTGGGAAGGATAGTGAGGTTGCTATCTTCTATATTAC  3439
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct  3354  ACAGGAACCAAGAAGAACGGCTCTTAGGAAGGATAGTGAGGTTACTATCTTCAATATTAC  3413

Query  3440  ATGGTTTCCTGCACACTCCGTGTGATATCCTAGAAAGCTTGTCTGCACTGTTCCCCCCTG  3499
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||
Sbjct  3414  ATCGTTTCCTGCACACTCCGTGTGATATCCTAGAAAGCTTGTCTGCATTGTTCCCAGCTG  3473

Query  3500  GAGAGGAAGACAACGTTATAGGTTTACCTCAGCTGTTGGATGAGAGTTCTGATGATTTTG  3559
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  3474  GAAAGGAAGACAACGTTATAGGTTTACCTCAGCTGTTGGATGATAGTTCTGATGATTTTG  3533

Query  3560  ATGATGATACATGGGGTATTGCTGGACTCATTATAGGTTTGGGGATGTCAGTTGGTGCAA  3619
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3534  ATGATGATACATGGGGTATTGCTGGACTCATTATAGGTTTGGGGATGTCAGTTGGTGCAA  3593

Query  3620  TATACAGAGCTGGGAAGAAAGACGCTGTTGTAAAGATTAAAAATCTGATTGTATCATGGA  3679
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct  3594  TATACAGAGCTGGGAAGAAAGACGCTGTTGTAAAGATTAAAAACCTGATTGTATCGTGGA  3653

Query  3680  TCCCATATGCAGATTCTCTGAAGCAAACCTC-GGGTTCTAATAGTAAGGTATCAGTGAGA  3738
             ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3654  TCCCATATGCAGATTCTCTTAAGCAAAC-TCCGGGTTCTAATAGTAAGGTATCAGTGAGA  3712

Query  3739  CTGTTTTCAGTCGGTTCCTGCCTTGCACTCCCAATTGTGATAACTTTCTGCCAAAAAGTA  3798
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
Sbjct  3713  CTGTTTTCAGTTGGTTCCTGCCTTGCACTCCCAATTGTGATCACTTTCTGCCAAAAAGTT  3772

Query  3799  GAACTGTTTGATGCACATGAGGTAGATGATATAATCGGTTGTTTCAAGGACCTTATTTCC  3858
             ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3773  GAACTGTTTGATGCACATGAGGTGGATCATCTAATCGGTTGTTTCAAGGACCTTATTTCC  3832

Query  3859  GAGTTGCTAATCGTTAGAAAGTCTGGTGCTTTACGTAAGAGGTTGTTGATGGCTTCCTGT  3918
             |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3833  GAGTTGCTGATTGTTAGAAAGTCTGGTGCTTTACGTAAGAGGTTGTTGATGGCTTCCTGT  3892

Query  3919  ATTGGGGCGGGAGACCTCCTTGGTTCTGTAT-TGAATGAAGGTATCCACCCTGTTAAGAT  3977
             ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3893  ATTGGGGCGGGAGACCTCCTTGGTTCTGT-TCTGAATGAAGGTATCCACCCTGTTAAGAT  3951

Query  3978  TGAGTCTGTAAAAGAGTTACTAGAACTGTTCAAGAAATGTTACTCTGGACTTTACCCACC  4037
             |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3952  TGAGTCTGTAAAAGGGTTACTAGAACTATTCAGGACATGTTACTCTGGACTTTACCCACC  4011

Query  4038  GGTTGCTCACTTTGGAGGCATGCTCGGAGTTGTTAATGTTTTAGGAGCAGGTGCTGGGAA  4097
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4012  GGTTGCTCACTTTGGAGGCATGCTCGGAGTTGTTAATGTTTTAGGAGCAGGTGCTGGGAA  4071

Query  4098  TTTGGTGTATTCTC-ATCCTCGACCCCGTGCTCCTCCAGCCAGTTCTGAGGAGAACGAAA  4156
             ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  4072  TTTGGTGTATT-TCCATCCTTTACCCCGTGCTCCTCCAGCCAGTTCTGAGGAAAACGAAA  4130

Query  4157  TCTCTTATGTATCAGGTCCTTTGCTTTCAAACGCATATTTTACTCAGCAGTTGACGCCAG  4216
             | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4131  TATCTTATGTGTCAGGTCCTTTGCTTTCAAACCCATATTTTACTCAGCAGTTGACGCCAG  4190

Query  4217  TTGTGCAAGAAATATTTCTTATCGCACAAAATACCAAGGATCGCCAGCTCCAACATTATG  4276
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4191  TTGTGCAAGAAATATTTCTTATCGCACAAAATACCAAGGATCGCCAGCTCCAACATTATG  4250

Query  4277  CTGCATGGGCAATCTCAATTCTTAGAACTTACATGCGGTCAGGGGAATCGTCAAGTCTCA  4336
             ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct  4251  CTGCATGGGCAATATCAATTCTTAGAAATTACATGCGGTCCGGGGAAGCGTCAAGTCTCA  4310

Query  4337  GCAATGAAAACCAATCTGATGACTCTGACCGTAATTCCATCTCTCACAATGTTCCTGAAC  4396
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4311  GCAATGAAAACCAATCTGATGACTCTCACCGTAATTCCATCTCTCACAATGTTCCTGAAC  4370

Query  4397  ATACCATGGTCATGAAACTTGCTCAAGGCCTGACAAATCCAAGTTTTCCTTTGGCGGGTA  4456
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4371  ATACCATGGTCATGAAACTTGCTCAAGGCCTGACAAATCCAAGTTTTCCTTTGGCGGGTA  4430

Query  4457  GCCCTTTGAATATTGGCACAATGGCAAGTGCTTTGCGGTGTTTGTCTCATGCTCCGAGAT  4516
             ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4431  GCCCTCTGAATATTGGCACAATGGAAAGTGCTTTGCGGTGTTTGTCTCATGCTCCGAGAT  4490

Query  4517  TGCCAAACTTGGACTGGGGAGCAACAATAAGGCGTTTAATGAAACAAGAGACTCAGACTG  4576
             ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct  4491  TGCCAAACTTGGACTGGGGGGCAACAATAAGACGATTAATGAAACAAGAGACCCAGACCG  4550

Query  4577  ATGTAACGCAATCAGGCGATGTTCCTAAGGAAATAACTCTTAGGGAAGAGTGCTTCAAAT  4636
             ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4551  ATGTATCGCAATCAGGCGATGTTCCCAAGGAAAGAACTCTTAGGGAAGAGTGCTTCAAAT  4610

Query  4637  TTTCATTAGCCCACGCAAGCGAATTTGATGAACTTCTAGCTTTTCTGGACGAACTGTCGG  4696
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |
Sbjct  4611  TTTCATTAGCCTACGCAAGCGAATTTGATGAACTTCTAGCTTTTCTGGACGAGTTGTCTG  4670

Query  4697  AACTATCGAGATTCAAGGCACTAGAGGAGAGTCTTCAGTCGTGCCTGCTCTGTCATCTAG  4756
             ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct  4671  AACTAGCCAGATTCAAGGCGCTAGAGCAGAGTCTCCAGTCATGCCTGCTTTGTCATCTAG  4730

Query  4757  GGGGTTTAATGAGAATATTCTCAGGTTCAAGAATGAATAAATTGTTTGACGATGTCTCTT  4816
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  4731  GGGATTTAATGAGAATATTCTCAGGTTCAAGAATGAATAAATTATTTGACGATGTCTCTT  4790

Query  4817  GCTTTGTAGTCTCGCTATCATCAGACCAAACATATAGCTGTGATCAGAAGAGCTCACTGA  4876
             |||||||| |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct  4791  GCTTTGTAATCTCACTATCATCAAACCAAGTATATAGCTGTGAACAGAAGAGCTCATTGA  4850

Query  4877  GGGTCTCTTGTTGGAAGGGTCTGAGTCAGTGTCTTGAAGAAACTTCACTTGAATCTTCAG  4936
             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  4851  GGGTCTCTTTTTGGAAGGGTCTGAGTCAGTGTCTTGAAGAAACTTCGCTTGAATCTTCAG  4910

Query  4937  AATACGTCACAAAGATTGAAAAATGCATAGAGTTGCTTTTTGCTGTCTTACCAGTAGCAT  4996
             ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4911  AATACATCACAAAGATTGAAAAATGTATAGAGTTGCTTTTTGCTGTCTTACCAGTAGCAT  4970

Query  4997  CACAATCTCCTAGAGCAGATCAGATGGGTTCGGTGAAAGAGTGGTCAGAGGCAGTTACAT  5056
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||
Sbjct  4971  CACAATCTCCTGGAGCAGATCAGATGGGTTCGGTGCACGAGTGGTCAGAGGCAGTTAGAT  5030

Query  5057  GTTTGCAGAAGTCGCATCGGGATTGGTTATACAAATTCCTACAGGTTTCAAATCTTGAAC  5116
             |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct  5031  GTTTGCAGAAGTCGCCCCGGGATTGGTTATACAAATTTCTTCAGGTTTCAAATCTTGAAC  5090

Query  5117  CTGGAAACGAAAAGACTAACTTCCAAGGTGATCTAAAGAAGATCCAGGCAAAAGCCAAGC  5176
             || |||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5091  CTCGAAACGGAGAGACGGACTTCAAAGGTGATCTAAAGAAGATCCAGGCAAAAGCCAAGC  5150

Query  5177  TAGCAAAACTTGGCTCAGTTCCATTTTCCGAGTTAGGAAAATTGAAAG-CTATTATATTA  5235
             |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct  5151  TAGCAAGACTTAGCTCAATTCCATTTTCCGAGTTAGGAAAATT-AAAGGCTATTATATTA  5209

Query  5236  AATTGTGAAGAGTCAGATATCTGGGACGTGTTGATTGAGATAGTAGCGGCTCTGCATCAC  5295
             ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  5210  AATTGTGAACAGTCAGATATCTGGAACGTGTTGATTGAGATAGTAGCGGCTTTGCATCAC  5269

Query  5296  GCTGAAGGAGGAATCAAGAGACAGTGGCTCATTGATGCAGTTGAAATCAGCTGCGTTTCT  5355
             || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5270  GCCGAAGGAGGAATCAAAAGACAGTGGCTCATTGATGCAGTTGAAATCAGCTGCGTTTCT  5329

Query  5356  AGCCATCCTTCCACTGCTATTATCTTCGTCGGCCTTCTTTCTAGTATCTGCTGCGAATAC  5415
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  5330  AGCCATCCTTCCACTGCTATTATCTTCGTCGGCCTTCTTTCAAGTATCTGCTGCGAATAC  5389

Query  5416  ATGCCGTTTCTCAATTTAGACCGCTCCACGGTGTTGAGCGATATGTCTGTTACCGTAACT  5475
             ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5390  ATGCCGTTTCTCACTTTAGACCGATCCACGGTGTTGAGCGATATGTCTGTTACCGTAACT  5449

Query  5476  TCTCTCCTTTCTGATCCAAGCTATGAAGTGGTCACAGAGCCTTTCATCTCGTTTCTATGG  5535
             |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  5450  TCTCTCCTGTCTGATCCCAGCTATGAAGTGGTCGCAGAGCCTGTCATCTCGTTTCTATGG  5509

Query  5536  ACTTCATTGGAACGTGTTTACAGTTTTGCAACTGAATCTGACGCTAATGCAAGGCTAAGC  5595
             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  5510  ACTTCATTGGAACGTATTTACAGTTTTGCAACTGAATCTGACGCTAATGCAAGGATAAGC  5569

Query  5596  TCACAGCAAATTGCGCAAAGCGAGAGAGATAAAGCACCAATGCTTGTGAAAGTGATGCAT  5655
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct  5570  TCACAGCAAATTGCGCAAAGTGAGAGAGATAAAGCATCAATGCTTATGAAAGTGATGCAT  5629

Query  5656  TACATTTGTGTAGCCTTCAGAGATCATTTGCCTCTTGAGAAACAGCTTAGACTTGCTTCT  5715
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5630  TACATTTGTGTAGCCTTCAGAGATCATTTGCCTCTTGAGAAACAGCTTAGACTTGCTTCT  5689

Query  5716  ATGGACATGTCTTAATTCCTTA-AAACCtattgtatagtttttatatttaggagtatttt  5774
             ||||| ||  ||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct  5690  ATGGAGATCCCTTGATTCCTTTTAAAC-TATTGTATAATTTTTATATTTAGGTGTATTTT  5748

Query  5775  gttgtatttttaatttttaGCGGGAATTTCATTGCCCACACTGTTGTATTTTTGAAAGAT  5834
             |||||||||||| |     | || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  5749  GTTGTATTTTTAGT-----G-GG-ATTTTCATTTCCCACATTGTTGTATTTTTGAAAGAT  5801

Query  5835  ATATA  5839
             |||||
Sbjct  5802  ATATA  5806



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 222180111174


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5