BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G27670.1 Length=5865 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg484555 jgi|Araly1|484555|fgenesh2_kg.5__547__AT3G27670.1 9116 0.0 > Ahg484555 jgi|Araly1|484555|fgenesh2_kg.5__547__AT3G27670.1 Length=5806 Score = 9116 bits (4936), Expect = 0.0 Identities = 5537/5825 (95%), Gaps = 49/5825 (1%) Strand=Plus/Plus Query 45 GGGTCGGTTCGGTTTCTCTA--TTATCTTATTGGGCCAAATCG-GACGGCCCATTATCTA 101 |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1 GGGTCGGTTCGGTTTCTCTAGCTTAACTTATTGGGCCAAATCGAGACGGCCCATTATCTA 60 Query 102 GCTCCGGCTTATCGGACTTCCTCTTCCCCGGCGCTGTAAATTCCAAGTCCCTCCGTTCAC 161 || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 61 GCACCGGCTTATCGGACTTCCTC-TACCCGGCGCTGTAAATTCCAAATCCCTCCGTTCAC 119 Query 162 GTCTCCAAACTAGCCGTTGCCTTCTCTCTCTCCAGCCAAAGCGATGGCCTCATACGCTAC 221 ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 GTCTCCAAACTAGCCGTTGCC-T-TCTCTCTCCGGTCAAAGCGATGGCCTCATACGCTAC 177 Query 222 GTTACTGGAGAAAACTCGCGTACCTCAACCTTCTATACAAAGATTCGCAGTAATCTCCGT 281 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 178 GTTACTGGAGAAAACTCGCGTTGCTCAACCTTCTATACAAAGATTCGCAGTAATTTCCGT 237 Query 282 CTTCTCCAAGTTACGATCTGCTCCAGAACAATTTGGATCAGAAGCCGAAGCCGGAAGAGA 341 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 238 CTTCTCCAAGTTACGATCTGCTCCAGAACAATTAGGATCAGAATCTGAAGCCGGAAGAGA 297 Query 342 AGCTATCTCCTTCTGCCTCACTTCTGAATCTATCACTGTCGTTGATCAATCCGTTCATGA 401 ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct 298 AGCTATCTCCTTCTGTCTCACTTCTGAATCTGTCACTGTAGTTGATCAATCCGTTCGTGA 357 Query 402 GCTATGTCGATTAGTATCAGACTCAGTTTTAGACCTCTCTCGTGGTTTGCTAGAACTTCA 461 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 358 GCTATGTCGATTAGTATCAGACTCTGTCTTAGACCTCTCTCGTGGTTTGTTAGAACTTCA 417 Query 462 ATCAGCTCTCGAAGGATGCGATTCGAAATTGGTTTCGCTGTTCGTGAAAGGGTTAGGGTT 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 418 ATCAGCTCTCGAAGGATGCGATTCGAAATTGGTTTCGCTGTTTGTGAAAGGGTTAGGGTT 477 Query 522 TTTGATTCGTATTGGTTATGAACGGAATAATGGGAACTGGAAGTTTAATTCGACGGAGAA 581 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 478 TTTGATTCGTATTGGTTATGAACGGAATTCTGGGAATTGGAAGTTTAATTCGACGGAGAA 537 Query 582 TCATCCGTTTGTTAGGATTCAATCTAGCCGAGTGGAGACACAGACGGAGCTTCTTCATCA 641 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 TCATCCGTTTGTTAGGATTCTTTCTAGCCGAGCGGAGACACAGACGGAGCTTCTTCATCA 597 Query 642 AGTATCACTCTTTGTGATGCATAATCGAAGATTAGGAATGGTGGGAGTATGTGAATTCTT 701 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 AGTATCACTCTTTGTGATGCATAATCGGCGATTAGGAATGGTGGGAGTATGTGAATTCTT 657 Query 702 GGAGCCGTTCTTGAATTTCACTATACTGCGGATTCCGCTTTCAGATTCGTCTTCATCGTT 761 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| Sbjct 658 GGAGCCGTTCTTGAATTTCACAATACTGCGGATTCCACTTGCAGATTCGTCGTCATCGTT 717 Query 762 GTTTGCGAGGGAGTTGATTTCATCAATGGCTTCCCTTTGTTGCTCATCCCGCCACGAAGC 821 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 718 GTTTGCGAGGGAGTTGATTTCATCAATGGCTTCCCTTTGTTGCTCATCCCGCAAAGAAGC 777 Query 822 ACTACCGATATTCAGATTGCTTA-TGCGATGTCTAAAATATATCCCGGGAAATAATCT-- 878 ||| ||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 778 ACTTCCGATATTCAGGTTGC-TATTGCGTTGCCTAAAATATATCCCGGGAAAAAATCTGG 836 Query 879 --G------G--A----AG-TA-ATTGTCAAGATC-CTAGTGGATGCCTACACTGTGGTT 921 | | | || || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 837 AAGACAATAGAAATTTCAGCTACATTGTCAAGA-CTCTAGTGGATGCCTACACTGTGGTT 895 Query 922 GTGAGAGACTTGGTTGGAACCGGATTGGAAGTAACAGAAGTTCATTTGCTCGGTGTGCAA 981 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct 896 GTGAGAGACTTGGTTGGAACTGGATTGGAAGTAACAGAAGTTCATCTGCTCGGCGTGCAA 955 Query 982 CTGGTGGATGGCGTACTTTTTCTTTGCGCTTCTCCTCATGTACAAACAACCGAACAAGAG 1041 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 956 CTGGTAGATGGTGTACTTTTTCTTTGCGCTTCTCCTCATGTACAAACAACCGAACAAGAG 1015 Query 1042 TCTGTTATCGAATCTTTGAAGCACTTGTTGGCTGTTCAGAAAGACCTTGGATTAGCATAT 1101 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1016 TCTGTTATCGAATCTTCGAAGCATTTGTTGGCTGTTCAGAAAGACCTTGGATTACCATAT 1075 Query 1102 TCACATGATTTATCCTTGGTGGTTCTCTCGCTAGTTTTCATGCTTGCCAAATCTACTGTC 1161 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 1076 TCACGTGATTTATCCTTGGTGGTTCTCTCGCTAGTTTTCATGCTTGCCAAATCCAGTGTC 1135 Query 1162 GAGCATGAACAACTCTGTATTCTAAAGTTTCTGCTTTTTCTGCTCAAATGGAAAACTGAA 1221 |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1136 GAGCATGAACAACTCTCTATTCTAAAGTTCCTGCTTTTTCTGCTCAAATGGAAAACTGAA 1195 Query 1222 AGTGAAAACTTGTCGGTTAAGGATGCGGCTGGTTCAAGTGTGGAGTCTCTATTATTGTTC 1281 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1196 AGTGAAAACTTGTCGGTTAAAGATGCGGCCGGTTCAAGTGTGGAGTCTCTATTATTGTTC 1255 Query 1282 CCTATCACCGCACTGATGTCTTCTCCTTCTAAATCAATCAAAGTAGCAGCAAGTAAGGTT 1341 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1256 CCTATCATCGCACTGATGTCTTCTCCTTCTAAATCAATCAAAGTAGCAGCAAGTAAGGTT 1315 Query 1342 CTTTCCATCGTAGAAAATTTCTTGGTAACAGTGTCAAATGCACCAAAGATTGAGGTCCAC 1401 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1316 CTTTCCATCATAGAAAATGTCTTGGTAACAGTGTCAAATGCACCAAAGATTGGGGTCCAC 1375 Query 1402 ACAAGTAAGGGAGATTCACCACTCAGCAGGGTGGGCTCTGTCGTATTTAGGTTCATGCAG 1461 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1376 ACAAGTAAGGGAGATTCACCACTCAGCAGGGTGGGCTCTGTCGTATTTAGGGTCATGCAG 1435 Query 1462 CAACTCTGGCATCAGAATGATTACACACCTTCCACGTCTTCCTTCCTCAGAGTGGCTTAC 1521 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1436 CAACTCTGGCATCAGAATGATTACGCACCTTCCACGCCCTCCTTCCTCAGAGTGGCTTAC 1495 Query 1522 ACCAATGGAAGTGAAAAACAGGAAACTTAT-CTAGGACCAGTGACTTGGAATTCACTACT 1580 | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1496 ATCAATGGAAGTGAAAAACAGGAAACTTATAC-AGGACCAGTGACTTGGAATTCACTACT 1554 Query 1581 TAGGGAACACGCTGAACGGTTTTGGGATaaaaaaaaGTTGTCTGCGTCGTTTTGTCTTTC 1640 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1555 TAGGGAACATGCTGAACGGTTTTGGGATAGAAAAAAGTTGTCTGCGTCGTTTTGTCTTTC 1614 Query 1641 ACAAGAGATACCTATTTTACTTGGTGCTGTTGCTGGTGTCATGGTGATGCACCCGTCACT 1700 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1615 ACAAGAGATACCTATTTTACTTGGTGCTGTTGCTGGTGTCATGGTGATGCACCCGTCCCT 1674 Query 1701 AGGAGCTGATGCTATTGGTTCTTTGACTATTATTGGTGGCATTGATTCTAAGATGAGTGT 1760 ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| Sbjct 1675 AGGAGCTGATGCTGTTAGTTCTTTGACTATTATTGGTGGCATCGATCCTAAGATGTGTGT 1734 Query 1761 CCCGCTGTTGCTAGCTGTTCTATATTTCAGCAACTTGTTATCTCGAACTAACGTCCCTTG 1820 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1735 CCCGCTGTTGCTAGCTGTTCTATATTACAGCAACTTGTTATCTCGAACTAACGTCCCTTG 1794 Query 1821 TCAGAGTCTATTGTCAAAACTTCTGGGGTTGCTCCCATCACTAGCTGCACAACAGGTGAT 1880 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1795 TCAGGGTCTATTGTCAAAACTTCTGGGGTTGCTCCCATCACTAGCTGCCCAACAGGTGAT 1854 Query 1881 GATTCCACTTGTAGTTCAGACTATTACTCCAATGCTACGCAAGGATGCCAAAGGTCTGTT 1940 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct 1855 GATTCCACTTGTAGTTCAGACTATTACTCCAATGCTACACAAGGATGCGAAAGGTCTGTT 1914 Query 1941 GTATGCTACAGCTATTAGATTACTTTGCCAGACCTGGGTAGTCAATGACCGTGCCTTTTC 2000 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1915 GTATGCTACAGCAATTAGATTACTTTGCCAGACCTGGGTAGTCAATGACCGTGCCTTTTC 1974 Query 2001 GAGTTTGCAAGAGGTGTTACGCCCGCAAGGATTTATAGAATATATTTCAGAGAGACATAT 2060 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1975 AAGTTTGCAAGAGGTGTTACGCCCAAAAGGATTTATAGACTATATTTCAGAGAGACATAT 2034 Query 2061 CTGCATTAGTATGGCTGCTTCCATCCATGATGTATGCAAGAGACACCCTGATAGAGGAGT 2120 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 2035 CTGCATTAGTATGGCTGCTTCCATTCACGATGTATGCAAGAGACACCCTGATAGGGGGGT 2094 Query 2121 AGACCTAATCTTGTCCGTTCAGGCCTGTATAGAAAGCCAAAACTGTCCAGTTAGAGCCCT 2180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| || Sbjct 2095 AGACCTAATCTTGTCCGTTCAGGCCTGTATAGAAAACCAAGACTATCCAGTTCGAGCACT 2154 Query 2181 TGGTTTTCAGAGTCTTTCGCATCTGTGTGAAGCCGATGTCATTGATTTCTATACTGCATG 2240 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2155 TGGTTTTCAGAGTCTTTCCCATCTGTGTGAAGCCGATGTCATTGATTTCTATACTGCATG 2214 Query 2241 GGATGTCATTAAGAAACATGCTCAACATATCAAACTGGATCCTCTCCTTGCTTATAGTGT 2300 || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2215 GGGTGTCGTTAAGAAACATGCTCAACACATCAAACTGAATCCTCTCCTTGCTTATAGTGT 2274 Query 2301 ATGCCATCTTCTAAAGTGGGGTGCCATGGATGCCGAAGCATATCCTGAAGATGCAGAAAA 2360 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2275 ATGCCTTCTTCTAAAGTGGGGTGCAATGGATGCCGAAGCATATCCTGAAGATGCAGAAAA 2334 Query 2361 CGTTTTGAACATTTTGTGGGAAATTGGGAGCTCTATGCAGAAGCCTCATGATTCCCAATG 2420 |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2335 CGTTCTGAACATTTTATGGGAAATTGGGAGCTCTATGCAGATGCCTCATGATTCCCAATG 2394 Query 2421 GACAAAGGCAAGAGTCTCTGCCATAGTGGCCCTGGGTCAATATGAGGTATCATTTATGGA 2480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2395 GACAAAGGCAAGAGTCTCTGCCATAGTGGCCCTGGGTCAATATGAGGTATCATTTATGGA 2454 Query 2481 -AAACAAGTTTTCTGACTTCAACAAGAATTGTACATATTTACTCTTCTCGGAGACAAATG 2539 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2455 GAAA-AAGTTTTCTGATTTCAACAAGAATTGTACATATTTGCTCTTCTCGGAGACAAATG 2513 Query 2540 CGGAAATTCTGAATGCTTTAGAAGACCTTTCAATCAAAATCATGATTCACGAGCACAGCG 2599 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2514 CGGAAATTTTGAATGCTTTAGAAGACCTTTCAATCAAGATCATGATTCACGAGCACAGCA 2573 Query 2600 TCCGGCGTAGATATGTAAGAGAGAAGAAAGTTCCTGGTAGTAAGATTGAAAAGCTGCTTG 2659 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2574 TCCGGCGTAGATATGTTAGAGAGAAGAAAGTTCCTGGTAGTAAGATTGAAAAGCTGCTTG 2633 Query 2660 ATGTGATACCTCAGGTCATCTTCCCTGCAGGGAAAGAAATAAAGACTGGAGAACTACCTG 2719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2634 ATGTGATACCTCAGGTCATCTTCCCTGCAGGGAAAGAAATAAAGACTGGAGAACTACCTG 2693 Query 2720 GTGCGGCATTACTATGTCTATCTTATAACCCCAGAGATGTGAAGTTTGGGTCATCAAGAA 2779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2694 GTGCGGCATTACTATGTCTATCTTATAACCCCAGAGATGTGAAGTTTGGGTCATCAAGAA 2753 Query 2780 GCTTTCATGATGTTCATTTTCAATACGAGGAGGCATTTAGAGTAGTAGTCAAATCTCTCC 2839 |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2754 GCTTTCGTGATGTTCATAGTCAATACGAGGAGGCATTTAGAGTAGTAGTCAAATCTCTCC 2813 Query 2840 AGCTCTCAAGAAATATTTCCCTTGCTCTTATTTCCTTGCAATCACTGAAAGCTTTTATGC 2899 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2814 AGCTGTCAAGAAATATTTCCCTTGCTCTTATTTCCTTGCAATCACTGAAAGCATTTATGC 2873 Query 2900 GGCGTTGGATGAGAGCGAATATATTGTCCATTGATGCAACGACTAAAGAATTATCATCGG 2959 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2874 GGCGTTGGATGAGAGCTAATATCTTGTCCATTGATGCAACGAGTAAAGAATTATCATCGG 2933 Query 2960 ATAAGACCTCTAAAGCTACAAACAACATCATGAAGAGTTTGGTACATATGGCTGAAGAAG 3019 |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2934 ATAAAATTTCTAAAGCTGCAAACAACATCATGAAGAGTCTGGTACATATGGCTGAAGAAG 2993 Query 3020 CTCTTCCCAGGTGTGCAGAAAACATAGCACTGGCGCTGGGTGCACTATGTGCAGCTTTGC 3079 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2994 CTCTTCCCAGGTGTGCAGAAAACATAGCACTGGCACTGGGTGCACTATGTGCAGCTTTGC 3053 Query 3080 CAGCTGCTTCTCATAATATTAAAGCGTCTGCATCAAAATTTCTGTTGAGTTGGTTGTTGG 3139 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3054 CAGCTGCTGCTCATAATATTAAAGCGACTGCATCAAAATTTCTGTTGAGTTGGTTGTTGG 3113 Query 3140 AGCATGAGCATGAACACCGTCAGTGGACGGCTGGTATTTCTCTTGGATTGATTTCGTCGT 3199 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3114 AGCATGAGCATGAACACCGTCAGTGGACAGCTGGTATTTCTCTTGGATTGATTTCGTCGT 3173 Query 3200 CCCTACACGTAACTGACCACAAGCAGAAATTTCAGAATATATCTGGGCTTCTTGAGGTTT 3259 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3174 CCCTACATGTGACTGACCACAAGCAGAAATTTCAGAATATATCTGGGCTTCTTGAGGTTT 3233 Query 3260 TGTGTAGCAGTAAAAGCACTCTTGTAAAAGGAGCCTGTGGGGTTGGATTGGGTTTTTCAT 3319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3234 TGTGTAGCAGTAAAAGCACTCTTGTAAAAGGAGCCTGTGGGGTTGGATTGGGTTTTTCAT 3293 Query 3320 GCCAAGATCTGCTCACTCGGACTGAAGCCTCTGCGAGCTCTGATATAGACAGTGACTCCT 3379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3294 GCCAAGATCTGCTCACTCGGACTGAAGCCTCTGCGAGCTCTGATATAGACAGTGACTCCT 3353 Query 3380 ACAGGAACCAAGAAGAACGGCTCTTGGGAAGGATAGTGAGGTTGCTATCTTCTATATTAC 3439 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 3354 ACAGGAACCAAGAAGAACGGCTCTTAGGAAGGATAGTGAGGTTACTATCTTCAATATTAC 3413 Query 3440 ATGGTTTCCTGCACACTCCGTGTGATATCCTAGAAAGCTTGTCTGCACTGTTCCCCCCTG 3499 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 3414 ATCGTTTCCTGCACACTCCGTGTGATATCCTAGAAAGCTTGTCTGCATTGTTCCCAGCTG 3473 Query 3500 GAGAGGAAGACAACGTTATAGGTTTACCTCAGCTGTTGGATGAGAGTTCTGATGATTTTG 3559 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3474 GAAAGGAAGACAACGTTATAGGTTTACCTCAGCTGTTGGATGATAGTTCTGATGATTTTG 3533 Query 3560 ATGATGATACATGGGGTATTGCTGGACTCATTATAGGTTTGGGGATGTCAGTTGGTGCAA 3619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3534 ATGATGATACATGGGGTATTGCTGGACTCATTATAGGTTTGGGGATGTCAGTTGGTGCAA 3593 Query 3620 TATACAGAGCTGGGAAGAAAGACGCTGTTGTAAAGATTAAAAATCTGATTGTATCATGGA 3679 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 3594 TATACAGAGCTGGGAAGAAAGACGCTGTTGTAAAGATTAAAAACCTGATTGTATCGTGGA 3653 Query 3680 TCCCATATGCAGATTCTCTGAAGCAAACCTC-GGGTTCTAATAGTAAGGTATCAGTGAGA 3738 ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3654 TCCCATATGCAGATTCTCTTAAGCAAAC-TCCGGGTTCTAATAGTAAGGTATCAGTGAGA 3712 Query 3739 CTGTTTTCAGTCGGTTCCTGCCTTGCACTCCCAATTGTGATAACTTTCTGCCAAAAAGTA 3798 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3713 CTGTTTTCAGTTGGTTCCTGCCTTGCACTCCCAATTGTGATCACTTTCTGCCAAAAAGTT 3772 Query 3799 GAACTGTTTGATGCACATGAGGTAGATGATATAATCGGTTGTTTCAAGGACCTTATTTCC 3858 ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3773 GAACTGTTTGATGCACATGAGGTGGATCATCTAATCGGTTGTTTCAAGGACCTTATTTCC 3832 Query 3859 GAGTTGCTAATCGTTAGAAAGTCTGGTGCTTTACGTAAGAGGTTGTTGATGGCTTCCTGT 3918 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3833 GAGTTGCTGATTGTTAGAAAGTCTGGTGCTTTACGTAAGAGGTTGTTGATGGCTTCCTGT 3892 Query 3919 ATTGGGGCGGGAGACCTCCTTGGTTCTGTAT-TGAATGAAGGTATCCACCCTGTTAAGAT 3977 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3893 ATTGGGGCGGGAGACCTCCTTGGTTCTGT-TCTGAATGAAGGTATCCACCCTGTTAAGAT 3951 Query 3978 TGAGTCTGTAAAAGAGTTACTAGAACTGTTCAAGAAATGTTACTCTGGACTTTACCCACC 4037 |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3952 TGAGTCTGTAAAAGGGTTACTAGAACTATTCAGGACATGTTACTCTGGACTTTACCCACC 4011 Query 4038 GGTTGCTCACTTTGGAGGCATGCTCGGAGTTGTTAATGTTTTAGGAGCAGGTGCTGGGAA 4097 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4012 GGTTGCTCACTTTGGAGGCATGCTCGGAGTTGTTAATGTTTTAGGAGCAGGTGCTGGGAA 4071 Query 4098 TTTGGTGTATTCTC-ATCCTCGACCCCGTGCTCCTCCAGCCAGTTCTGAGGAGAACGAAA 4156 ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4072 TTTGGTGTATT-TCCATCCTTTACCCCGTGCTCCTCCAGCCAGTTCTGAGGAAAACGAAA 4130 Query 4157 TCTCTTATGTATCAGGTCCTTTGCTTTCAAACGCATATTTTACTCAGCAGTTGACGCCAG 4216 | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4131 TATCTTATGTGTCAGGTCCTTTGCTTTCAAACCCATATTTTACTCAGCAGTTGACGCCAG 4190 Query 4217 TTGTGCAAGAAATATTTCTTATCGCACAAAATACCAAGGATCGCCAGCTCCAACATTATG 4276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4191 TTGTGCAAGAAATATTTCTTATCGCACAAAATACCAAGGATCGCCAGCTCCAACATTATG 4250 Query 4277 CTGCATGGGCAATCTCAATTCTTAGAACTTACATGCGGTCAGGGGAATCGTCAAGTCTCA 4336 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| Sbjct 4251 CTGCATGGGCAATATCAATTCTTAGAAATTACATGCGGTCCGGGGAAGCGTCAAGTCTCA 4310 Query 4337 GCAATGAAAACCAATCTGATGACTCTGACCGTAATTCCATCTCTCACAATGTTCCTGAAC 4396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4311 GCAATGAAAACCAATCTGATGACTCTCACCGTAATTCCATCTCTCACAATGTTCCTGAAC 4370 Query 4397 ATACCATGGTCATGAAACTTGCTCAAGGCCTGACAAATCCAAGTTTTCCTTTGGCGGGTA 4456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4371 ATACCATGGTCATGAAACTTGCTCAAGGCCTGACAAATCCAAGTTTTCCTTTGGCGGGTA 4430 Query 4457 GCCCTTTGAATATTGGCACAATGGCAAGTGCTTTGCGGTGTTTGTCTCATGCTCCGAGAT 4516 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4431 GCCCTCTGAATATTGGCACAATGGAAAGTGCTTTGCGGTGTTTGTCTCATGCTCCGAGAT 4490 Query 4517 TGCCAAACTTGGACTGGGGAGCAACAATAAGGCGTTTAATGAAACAAGAGACTCAGACTG 4576 ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 4491 TGCCAAACTTGGACTGGGGGGCAACAATAAGACGATTAATGAAACAAGAGACCCAGACCG 4550 Query 4577 ATGTAACGCAATCAGGCGATGTTCCTAAGGAAATAACTCTTAGGGAAGAGTGCTTCAAAT 4636 ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4551 ATGTATCGCAATCAGGCGATGTTCCCAAGGAAAGAACTCTTAGGGAAGAGTGCTTCAAAT 4610 Query 4637 TTTCATTAGCCCACGCAAGCGAATTTGATGAACTTCTAGCTTTTCTGGACGAACTGTCGG 4696 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 4611 TTTCATTAGCCTACGCAAGCGAATTTGATGAACTTCTAGCTTTTCTGGACGAGTTGTCTG 4670 Query 4697 AACTATCGAGATTCAAGGCACTAGAGGAGAGTCTTCAGTCGTGCCTGCTCTGTCATCTAG 4756 ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 4671 AACTAGCCAGATTCAAGGCGCTAGAGCAGAGTCTCCAGTCATGCCTGCTTTGTCATCTAG 4730 Query 4757 GGGGTTTAATGAGAATATTCTCAGGTTCAAGAATGAATAAATTGTTTGACGATGTCTCTT 4816 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4731 GGGATTTAATGAGAATATTCTCAGGTTCAAGAATGAATAAATTATTTGACGATGTCTCTT 4790 Query 4817 GCTTTGTAGTCTCGCTATCATCAGACCAAACATATAGCTGTGATCAGAAGAGCTCACTGA 4876 |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 4791 GCTTTGTAATCTCACTATCATCAAACCAAGTATATAGCTGTGAACAGAAGAGCTCATTGA 4850 Query 4877 GGGTCTCTTGTTGGAAGGGTCTGAGTCAGTGTCTTGAAGAAACTTCACTTGAATCTTCAG 4936 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4851 GGGTCTCTTTTTGGAAGGGTCTGAGTCAGTGTCTTGAAGAAACTTCGCTTGAATCTTCAG 4910 Query 4937 AATACGTCACAAAGATTGAAAAATGCATAGAGTTGCTTTTTGCTGTCTTACCAGTAGCAT 4996 ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4911 AATACATCACAAAGATTGAAAAATGTATAGAGTTGCTTTTTGCTGTCTTACCAGTAGCAT 4970 Query 4997 CACAATCTCCTAGAGCAGATCAGATGGGTTCGGTGAAAGAGTGGTCAGAGGCAGTTACAT 5056 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct 4971 CACAATCTCCTGGAGCAGATCAGATGGGTTCGGTGCACGAGTGGTCAGAGGCAGTTAGAT 5030 Query 5057 GTTTGCAGAAGTCGCATCGGGATTGGTTATACAAATTCCTACAGGTTTCAAATCTTGAAC 5116 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 5031 GTTTGCAGAAGTCGCCCCGGGATTGGTTATACAAATTTCTTCAGGTTTCAAATCTTGAAC 5090 Query 5117 CTGGAAACGAAAAGACTAACTTCCAAGGTGATCTAAAGAAGATCCAGGCAAAAGCCAAGC 5176 || |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5091 CTCGAAACGGAGAGACGGACTTCAAAGGTGATCTAAAGAAGATCCAGGCAAAAGCCAAGC 5150 Query 5177 TAGCAAAACTTGGCTCAGTTCCATTTTCCGAGTTAGGAAAATTGAAAG-CTATTATATTA 5235 |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 5151 TAGCAAGACTTAGCTCAATTCCATTTTCCGAGTTAGGAAAATT-AAAGGCTATTATATTA 5209 Query 5236 AATTGTGAAGAGTCAGATATCTGGGACGTGTTGATTGAGATAGTAGCGGCTCTGCATCAC 5295 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 5210 AATTGTGAACAGTCAGATATCTGGAACGTGTTGATTGAGATAGTAGCGGCTTTGCATCAC 5269 Query 5296 GCTGAAGGAGGAATCAAGAGACAGTGGCTCATTGATGCAGTTGAAATCAGCTGCGTTTCT 5355 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5270 GCCGAAGGAGGAATCAAAAGACAGTGGCTCATTGATGCAGTTGAAATCAGCTGCGTTTCT 5329 Query 5356 AGCCATCCTTCCACTGCTATTATCTTCGTCGGCCTTCTTTCTAGTATCTGCTGCGAATAC 5415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 5330 AGCCATCCTTCCACTGCTATTATCTTCGTCGGCCTTCTTTCAAGTATCTGCTGCGAATAC 5389 Query 5416 ATGCCGTTTCTCAATTTAGACCGCTCCACGGTGTTGAGCGATATGTCTGTTACCGTAACT 5475 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5390 ATGCCGTTTCTCACTTTAGACCGATCCACGGTGTTGAGCGATATGTCTGTTACCGTAACT 5449 Query 5476 TCTCTCCTTTCTGATCCAAGCTATGAAGTGGTCACAGAGCCTTTCATCTCGTTTCTATGG 5535 |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5450 TCTCTCCTGTCTGATCCCAGCTATGAAGTGGTCGCAGAGCCTGTCATCTCGTTTCTATGG 5509 Query 5536 ACTTCATTGGAACGTGTTTACAGTTTTGCAACTGAATCTGACGCTAATGCAAGGCTAAGC 5595 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5510 ACTTCATTGGAACGTATTTACAGTTTTGCAACTGAATCTGACGCTAATGCAAGGATAAGC 5569 Query 5596 TCACAGCAAATTGCGCAAAGCGAGAGAGATAAAGCACCAATGCTTGTGAAAGTGATGCAT 5655 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 5570 TCACAGCAAATTGCGCAAAGTGAGAGAGATAAAGCATCAATGCTTATGAAAGTGATGCAT 5629 Query 5656 TACATTTGTGTAGCCTTCAGAGATCATTTGCCTCTTGAGAAACAGCTTAGACTTGCTTCT 5715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5630 TACATTTGTGTAGCCTTCAGAGATCATTTGCCTCTTGAGAAACAGCTTAGACTTGCTTCT 5689 Query 5716 ATGGACATGTCTTAATTCCTTA-AAACCtattgtatagtttttatatttaggagtatttt 5774 ||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 5690 ATGGAGATCCCTTGATTCCTTTTAAAC-TATTGTATAATTTTTATATTTAGGTGTATTTT 5748 Query 5775 gttgtatttttaatttttaGCGGGAATTTCATTGCCCACACTGTTGTATTTTTGAAAGAT 5834 |||||||||||| | | || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 5749 GTTGTATTTTTAGT-----G-GG-ATTTTCATTTCCCACATTGTTGTATTTTTGAAAGAT 5801 Query 5835 ATATA 5839 ||||| Sbjct 5802 ATATA 5806 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 222180111174 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5