BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G30842.1
Length=4221
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg484753 jgi|Araly1|484753|fgenesh2_kg.5__745__AT3G30842.1 3378 0.0
> Ahg484753 jgi|Araly1|484753|fgenesh2_kg.5__745__AT3G30842.1
Length=4164
Score = 3378 bits (1829), Expect = 0.0
Identities = 2063/2178 (95%), Gaps = 7/2178 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCACATTACAGAGTAAGCTCAGAGGTAGAGAACATAATGAACAGAGACAGGAGTCAC 60
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |
Sbjct 1 ATGGCACATTACAGAGCAAGCTCAGAGGTAGAGAACATGATGATCAGAGACAATAGTCGC 60
Query 61 CGAAAAAACGAAGAAGAAGACGAAGAGGAAGCTTTGAAATTAGCGGCTATGGAGAAGTTG 120
|| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CGGAGAAACCAAGAAGAAGACGAAGAGGAAGCCATGAAATTAGCGGCTATGGAGAAGTTG 120
Query 121 CAGCGTCTTCCAACGTATGACCGGGCGAGAAAGGCCGTGTTAAAAGGGATCACAGGAGGT 180
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 121 CAGCGTCTTCCAACGTACGACCGTGCGAGAAAGGCCGTGTTAAGAGGGATCACAGGAGGT 180
Query 181 TTCAAGGAGATTGACATGAAAGACCTTGGCCTCGCGGAGAGAAGAGAGTTATTCGATAGA 240
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTCAAGGAGATTAACATGAAAGATATTGGCCTCGTGGAGAGAAGAGAGTTATTCGATAGA 240
Query 241 GTTATGACGATGGATGATGAAGATTGGCATGGAGAGTATCTAAGGAGGCTAAAGAGTCGT 300
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 241 GTAATGACGATGGATGATGAAGATTGGCATGGAGAGTATCTACGGAGGCTAAAGAGTCGT 300
Query 301 TTTGATAGAGTCTCTCTGCATCTGCCGACGATAGAAGTCCGATTTGAAGATTTAAACGTG 360
|| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 TTCGATAGAGTCTCTCTGAATCTGCCAACAATAGAAGTCCGATTTGAGGATTTAAACGTG 360
Query 361 ACTGCCGAAGCTTATGCGGGAAGCAAAACCGTTCCCACAGTCCTGAACTCATACGTCAAC 420
||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 361 ACTGCCGAAGCCTATGAGGGAAGCAAAGCTGTTCCCACTGTCTTGAACTCATACGTCAAC 420
Query 421 CTTTTAAAAGGTATTGGAACTAAAATCAGAGTTCTTCCGGATCGGAAAAAGAGAATCTCC 480
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||
Sbjct 421 GTTGTAAAAGGTATTGGAACTAAAATCAGAGTTCTTCCGGTTTTGAAAAAGAGAGTATCC 480
Query 481 ATTCTTAACGATGTTAGTGGAATCATCAAGCCTGGCAGATTGACTCTACTATTGGGACCA 540
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 481 ATTCTTAAGGATGTTAGTGGAATCATCAAGCCCGGCAGATTGACTCTACTTTTGGGACCA 540
Query 541 CCGGGCTCTGGAAAATCGACACTACTAAAAGCATTGTCTGGAAAGACAGAAACTGGACTA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 541 CCGGGCTCTGGAAAATCGACACTACTAAAAGCATTGTCTGGAAAGACAGAAGCTGGACTA 600
Query 601 AGATCTACAGGGAAAGTGACATACAATGGTCATGAACTGCATGAGTTTGTGCCTGAAAGA 660
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AAATCTACAGGGAAAGTGACATACAATGGTCATGAACTGCATGAGTTTGTGCCTGAAAGA 660
Query 661 ACTGCGGGATACATCGACCAATATGATGTTCACTTGCCGGACCTAACAGTTCGAGAAACA 720
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 661 ACTGCGGGCTACATCGACCAATATGATGTTCACTTGCCGGACTTAACAGTTCGAGAAACA 720
Query 721 TTAAAGTTTTCCGCAAAATGCCAAGGAGTTGGCACAGGCTACGATATGCTTGCTGAGTTA 780
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 721 TTAAAGTTTTCCGCAAAATGTCAAGGAGTTGGCACAGGCTATGATATGCTTGCGGAATTA 780
Query 781 CTGAGACGAGAGAAAGACTTGAATATCAAGCCGGATCCTTACCTCGATGCGTTAATGAAG 840
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTGAGACGGGAGAAAGAGTTGAATATCAAGCCGGATCCTTATCTCGATGCGTTAATGAAG 840
Query 841 GCATCGGTTATAAAAGGACACAAGGAGTATGTGGTTACAGATTACGTTTTAAAAGTCTTA 900
|| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCCTCGGTTATGAAAGGGCACAAGGAGTATGTGGTTACAGATTACGTTTTAAAAGTCTTA 900
Query 901 GGACTTGAGATATGTGCTGATACGATAGTTGGGAATCATATGAAGAGAGGCATCTCTGGT 960
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 901 GGACTTGAGATTTGTGCTGATACGATAGTTGGGAATCATATGAAAAGAGGCATCTCTGGT 960
Query 961 GGGCAAAAGAAACGCGTAACGACTGGCGAAATGTTGGTCGGTCCAGTTGGAGCTTTCTTC 1020
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||
Sbjct 961 GGGCAAAAGAAACGCGTAACGACTGGTGAGATGTTGGTCGGGCCAGTCGGAGCTTTTTTC 1020
Query 1021 ATGGACAACATATCAGATGGTTTAGATAGCTCGACGACGTTTCAGATTGTCAAGAGCATC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ATGGACAACATATCAGATGGTTTAGATAGCTCGACGACGTTTCAGATTGTCAAGAGCATC 1080
Query 1081 AAGCAAATGATCCATGTTTTCGATAAAACCGCTCTTATTTCTCTTCTCCAGCCTCCTCCA 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AAGCAAATGATCCATGTTTTCGATAAAACCGCTCTTATTTCTCTTCTCCAGCCTCCTCCG 1140
Query 1141 GAGACATTTGAGCTCTTCGATGATGTCATCATTCTTGGAGAAGGCCACATTGTTTACCAA 1200
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GAGACATTCGAGCTCTTCGATGATGTCATCATTCTTGGAGAAGGCCACATTGTTTACCAA 1200
Query 1201 GGCCCTCGAGAAGACGTCCTCGAGTTTTTTGAATTTATGGGGTTTAAGTGTCCTGAAAGA 1260
|||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GGCCCTCGGGAAGACGTCCTCGAGTTTTTCGAATCTATGGGGTTTAAGTGTCCTGAAAGA 1260
Query 1261 AAAGGGATTGCTGATTACTTGCAAGAAATTTTATCCAAAAAAGATCAAGAACAATATTGG 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AAAGGGATTGCTGATTACTTGCAAGAAATTTTGTCCAGAAAAGATCAAGAACAATATTGG 1320
Query 1321 GCTAATCCAGAGCTGCCATATCGTTATGTAACCGCaaaaaaaTTCGAGGAAGGCTTCAAA 1380
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GCTAATCCAGAGCTGCCATATCGTTATGTTCCCGCAAAACAATTCGAGGAAGGCTTCAAA 1380
Query 1381 ATTCATCATTTCGGGAG-AGCAATGCGGTCTCAGCTTGCAACGCCATTTGATCGACT-AA 1438
|| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
Sbjct 1381 ATGCACCATTTCGGGAGCA-CAATGCGGTCTCAGCTTGCAACGCCATTTGTTCGA-TGGA 1438
Query 1439 AGAATCACAGAGCAGCCCTGACAAGGAC-AACATATGGAGCTAGCAAGTTGGAACTACTA 1497
||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1439 AGAATCACAGAGCAGCCCTAACAAGGACTAA-ATATGGAGCTAGCAAGTTGGAGCTACTA 1497
Query 1498 AAGGCATGCTTAGAACGAGAAAGCATTCTAATGAAGAGGAACTTACGCACTTTCGTCTTG 1557
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 AAGGCATGCTTAGAACGAGAAAGTATTCTAATGAAGAGGAACTTACGCACTTTCGTCTTG 1557
Query 1558 AAGTCACTTCAGCTAATTATCAATGCCATTCTAATCGGAGTTGTGTTTTGGCAACAAAAG 1617
|||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1558 AAGTCACTTCAGCTGATTTTCAATGCCTTTCTAATCGGAGTTGTGTTTTGCCAACAAAAG 1617
Query 1618 AACTATCCCAGCACGGTCGAGGATGGAATCATCTACATGGGAGCTATCTACTTGGAAGTG 1677
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1618 AAATATCCCAGCACGGTAGAGGATGGAATCATCTACATGGGAGCTATCTATTTGGAAGTT 1677
Query 1678 CAAATGATTGTGTTCTCGGGGTTTTTCGAACTTCCAATGACTATCGATAAGCTTCCAGTG 1737
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1678 CAAATGATTGTATTCTCGGGGTTCTTCGAACTTCCGATGACTATTGATAAGCTTCCAGTG 1737
Query 1738 TTCTACAAGCAACGTCATTTTAGCTTTTACCCGTCATGGGCATTCTCGTTACCAACGTCA 1797
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1738 TTCTACAAGCAACGTCATTTCAGCTTTTACCCGTCATGGGCATTCTCATTACCAACGTCA 1797
Query 1798 ATCATCACCTTCCCTTTATCCTTCGTTGAAGTCTTCATTGTGGTCTTAATAACTTATTTC 1857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 ATCATCACCTTCCCTTTATCCTTCGTTGAAGTCTTCATTGTGGTCTTAATAACTTATTTC 1857
Query 1858 ACCATTGGATATGATCTAACCGTCCCATCGTTCCTGAAACATTACTTAGTTCTAGCATTG 1917
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1858 ACCATTGGATATGATCAAACCGTCTCATCGTTCCTTAAACATTATTTAGTTCTAGCATTG 1917
Query 1918 TGCGGACAAATGTCGTATGGGCTTTTTCGATGTATCGCTGCAGTGACTCGAAATCATGTG 1977
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 TGCGGACAAATGTCGTATGGACTTTTTCGGTGTATCGCTGCAGTGACTCGAAATCATGTG 1977
Query 1978 GTTTCAAACACAATGGGATGTCTTGCTGTGATGTGGCTGATGACATTCAGCGGATATGTG 2037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 GTTTCAAACACAATGGGATGTCTTGCTGTGATGTGGCTGATGACATTCAGCGGATATGTG 2037
Query 2038 TTGTCCCGAAATCAAGTGCATAAATGGTTGACATGGGCGTACTGGACATCACCAATGATG 2097
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2038 TTGTCCCGAAATCAAGTGCATAAGTGGTTGACATGGGCGTATTGGACATCACCAATGATG 2097
Query 2098 TATATCCAAACAGCTGTTTCGGTTAACGAATTCCGCAGCGAGTCTTGGAAAGATGTAATT 2157
||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2098 TATATTCAGACAGCTATTTCGGTTAACGAATTCCGCAGCGAGTCCTGGAAAGATGTAATT 2157
Query 2158 TCTAAGAAAC-CTTTCTT 2174
||| ||||| || ||||
Sbjct 2158 TCTTGGAAACTCTCTCTT 2175
Score = 2898 bits (1569), Expect = 0.0
Identities = 1802/1916 (94%), Gaps = 9/1916 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2312 AAGCTGATAGCAACAATACG---ACCGGCAGAGACTATACAGGAACTACGATGGAACGAT 2368
||||| |||||||||||| | || |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||
Sbjct 2252 AAGCTAATAGCAACAATATGATAACAGGCATAGACTATACAAGAACTACGATGCAACCAT 2311
Query 2369 TCTTTGATAGAGTTGTAACAACAAGAACTTGCAACGACAAAAAACTGCGTATACCTTTCA 2428
|| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 TCGTTGACAGAGCGGTAACAACAAGAACTTGCAACGACAAAAAACTGCGTATACCTTTCA 2371
Query 2429 AACCTCTATATATGACGTTCGAGAACATCACATATTCTGTAGACACCCCAAAGGAAATGA 2488
| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||
Sbjct 2372 AGCCTCTATACATGACGTTTGAGAACATCACATATTCTGTTGATACTCCAAAGGAAATGA 2431
Query 2489 AAGAAAAAGGCATAAGAGAGAATAAACTAGTACTATTGAATGGATTAAGCGGTGCTTTTA 2548
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2432 AAGAAAAGGGCATAAGAGAGGATAAACTAGTACTATTGAATGGATTAAGTGGTGCTTTTA 2491
Query 2549 GGCCCGGGGTTCTTACAGCACTTATGGGCGTGAGTGGTGCGGGCAAAACTACTTTGATGG 2608
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2492 GGCCCGGGGTTCTTACCGCACTTATGGGCGTGAGTGGCGCGGGAAAAACTACTTTGATGG 2551
Query 2609 ATGTCTTAGCCGGACGTAAGAACACAGGATACATCCAAGGGGAAATATATGTCTCTGGAT 2668
|||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||
Sbjct 2552 ATGTTTTAGCCGGGCGTAAGAACACAGGATACATTCAAGGGAAAATCCATGTTTCTGGAT 2611
Query 2669 TTCCTAAAAAACAGGATAGCTTTGCTCGTGTTTCGGGTTATTGCGAACAATCTGACATCC 2728
|||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2612 TTCCTAAAAAGCAGAACAGCTTTGCCCGTGTTTCGGGTTATTGTGAACAATCTGACATCC 2671
Query 2729 ATTCCCCTCTTTTAACTGTTTATGAGTCTCTTCTTTATTCTGCATGGTTGAGGTTGCCTC 2788
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2672 ATTCCCCTCTTTTAACTGTCTATGAGTCTCTTCTTTATTCGGCATGGTTGAGGTTGCCCC 2731
Query 2789 CTGATATCGACACACATACTCGAGAGGTGATGGAATTGATAGAGTTAAAAGCATTGAGGG 2848
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 2732 CTGATATTGACACACATACTCGAGAGGTAATGGAATTGATAGAGTTGAAACCATTGAGGG 2791
Query 2849 AGATGTTGGTAGGATATGTGGGAATTAGTGGGCTTTCGACCGAGCAAAGAAAAAGAATGA 2908
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2792 AGATGTTGGTAGGATATGTGGGAATTAGTGGGCTTTCGACGGAGCAAAGAAAAAGAATGA 2851
Query 2909 CAATCGCAGTAGAGCTTGTAGCCAATCCTTCTATTCTTTTCATGGATGAGCCTACATCCG 2968
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2852 CAATCGCAGTAGAGCTTGTAGCCAATCCTTCTATTCTTTTCATGGATGAGCCAACATCCG 2911
Query 2969 GCTTGGATGCTAGAGCTGCCGCGATTGTCATGAGGACAGTTCGAAACACTGTTGACACTG 3028
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2912 GCTTGGATGCAAGAGCTGCCGCGATTGTCATGAGAACCGTTAGAAACACTGTTGACACTG 2971
Query 3029 GAAGAACTGTTGTATGCACCATTCACCAGCCAAGTATTGATATTTTTGAATCCTTTGATG 3088
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2972 GAAGAACGGTTGTATGCACCATTCACCAGCCGAGTATCGATATTTTTGAATCCTTTGATG 3031
Query 3089 AGCTTTTCTTGTTGACAAGAGGAGGCGAAGAGATCTATGTTGGTCCAATAGGCCACCATT 3148
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 3032 AGCTTTTCTTGTTGGCAAGAGGAGGAGAAGAGATCTATGTTGGTCCAATTGGACACCATT 3091
Query 3149 CCTCTCAACTAATCGA-ATACTTTGAGGGAATAAGAGGAGTAGGAAAAATAAAGGAAGGT 3207
|||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3092 CCTCTCAACTAATC-ACATATTTTGAGGAAATAAGAGGAGTAGGAAAAATAAAGGAAGGT 3150
Query 3208 TATAATCCAGCAACATGGGCCCTTGAAGTAACAACAAGGGCACAAGAAGATGTTCTTGGT 3267
|| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 3151 TACAATCCAGCAACATGGGCTCTTGAAGTGACAACAATGGCACAAGAAGATGTTCTAGGT 3210
Query 3268 GTCACATTTGCGCAAGTATACAAGAAGTCAAACCTCTATAGGAGAAACAAAGATCTGATT 3327
|||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3211 GTCAGATTTTCTCAAGTATACAAAAACTCAAACCTCTATAGGAGAAACAAAGATCTTATT 3270
Query 3328 AAGGAACTGAACAAT-ATT-CCTCCTCATGCACAAGACATTCATTTCTCAACAAAATATT 3385
||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3271 AAGGAGCTGAAC-ATGGTTCCCT-CTCATGCACAAGACATTCATTTCTCAACAAAATATT 3328
Query 3386 CACAATCCTACCTCTCTCAATTCCAAGCTTGCTTGTGGAAGCAACACAAATCATATTGGA 3445
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3329 CACAATCATATCTCTCTCAATTCCAAGCTTGCTTGTGGAAGCAACACAAATCATATTGGA 3388
Query 3446 GAAATGTTCCTTATAACGCGGTGCGTTTCAGTTTCGGGGCTGCTGTTGGAATCATGTATG 3505
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3389 GAAATGTTCCTTATAACGCGGTGCGTCTCAGTTTCGGGGCTGCTGTTGGAATCATGTATG 3448
Query 3506 GAATCATCTTTTGGAGCCTCGGAAAACGAAAAGGAACAAGGCAAGATATCTTCAATAGTG 3565
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3449 GAATAATCTTTTGGAGCCTCGGAAAAAGAAAAGGAACAAGACAAGATATCTTCAACAGTG 3508
Query 3566 TAGGCGCGATGTCAACCGTTGTTGGCTTCTTAAGTTCACAAAGTGCGGCTACTGTACGTC 3625
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 3509 TAGGCGCTATGTCAACTGTTGTTGGCTTCTTAAGCTCACAAAGTGCTGCTACTATACGTC 3568
Query 3626 CAGTTGTAATCGCTGAACGTACTGTTTTTTATCGAGAAGCCGGTGCTGGAATGTACTCCG 3685
| || | ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |
Sbjct 3569 CTGTCGCAATCGCTGAACGTACAGTTTTCTACCGAGAAAACGGTGCTGGGATGTACTCAG 3628
Query 3686 CTCTACCCTATGCATTTTCACAGGTGATAATCGAGATCCCATATACAATGGCTCAAGCTT 3745
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3629 CTCTACCCTATGCATTTTCACAAGTGATAATCGAGATTCCATATACAATGGCTCAAGCTT 3688
Query 3746 GCATCTATGGAGTTATTGTCTATGGGATGATAGGATACGAATGGACAGCTTCCAAGtttt 3805
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3689 GCATCTATGGAGTTATTGTCTATGGGATGATAGGATACGAATGGACTGCTTCCAAGTTTT 3748
Query 3806 ttttGAACATATTCTTTACCTTCATCAGCATCCTCTACTCTATATACACTGGTATTATGG 3865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3749 TTTTGAACATATTCTTTACCTTCATCAGCATCCTCTACTCTATATACACTGGTATTATGG 3808
Query 3866 TCATTTCCGTAAGCCCTAATCAAGAAATCGCTTCGATACTCAATGGTGTCATATCCACAT 3925
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3809 TCATTTCCGTAAGTCCTAATCAAGAAATCGCTTCGATACTCAATGGTGTCATATCCACAT 3868
Query 3926 CGTGGAACGTCTTTTCAGGATTCACTATTCCTCGTCCCAGAATGCATGTATGGTTGAGAT 3985
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3869 CGTGGAACGTCTTTTCAGGATTCACCATTCCTCGTCCCAGAATGCATGTATGGTTGAGAT 3928
Query 3986 GGTTCACCTACGTGTGTCCCGGGTGGTGGGGGTTGTACGGACTGACGATAGCTCAATACG 4045
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3929 GGTTCACCTACGTGTGTCCAGGGTGGTGGGGGTTGTACGGATTGACGATAGCTCAATACG 3988
Query 4046 GAGATGTGGAGACAAGGCTCGATACGGGTGAGACGGTTGTTGAGTTCATGAAGAATTATT 4105
||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3989 GAGATGTAGAAACGAGGCTCGATACGGGTGAGACGGTTGTTGAGTTCATGAAGAATTATT 4048
Query 4106 ATGGTTATGAATACAACTTCTTGTGGGTTGTCTCACTTACCCTCATTGCTTTCTCTATGT 4165
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4049 ATGGTTATGAATACAACTTCTTGTGGGTTGTCTCACTTACCCTCATTGCTTTCTCTTTGT 4108
Query 4166 TTTTTGTATTTATCTATGCTTTCTCTGTTAAGATTCTGAATTTCCAAAAGAGGTGA 4221
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4109 TTTTTGTATTTATTTATGCTTTCTCTGTTAAGATTCTGAATTTCCAGAAGAGGTGA 4164
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 159613461162
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5