BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G32340.1 Length=2667 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg490208 jgi|Araly1|490208|fgenesh2_kg.6__3342__AT3G32340.1 4078 0.0 Ahg494901 jgi|Araly1|494901|fgenesh2_kg.8__717__AT3G32340.1 4043 0.0 > Ahg490208 jgi|Araly1|490208|fgenesh2_kg.6__3342__AT3G32340.1 Length=2667 Score = 4078 bits (2208), Expect = 0.0 Identities = 2520/2673 (94%), Gaps = 12/2673 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 GACAAATTGTATGAATCAAACCTTCCTGA-ATACTTGGAAGATCTGGAGAAGAAGAAAAC 59 ||||||||| ||| |||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2667 GACAAATTGAATGGATCAAACCCTCTTGACA-ACTTGGAAGATCTGGAGAAGAAGAAAAC 2609 Query 60 ATTCAATATTTCTTCTTCGGGTATCTATGTTATAGAAGTAAATGTTACTACATCTGGTTC 119 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2608 ATTCAAGGTCTCTTCTTCGGGTATCTATGTTATAGAAGTAAATGTTACTACTTCTGGTTC 2549 Query 120 TACTCCTTGGGTATTGGATACCGGTTGTGGTGCTCACATTTGTGTAAATGTGCATGGCCT 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2548 TACTCCTTGGGTATTGGATACCGGTTGTGGTGCTCACATTTGTGTAAATGTGCATGGCCT 2489 Query 180 AAACAACAGTAGAACTTTCGAGGAAGGACAAGTGGACCTACGTGTGGCTAATGGAGCAAA 239 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2488 AAACAACAGTAGAACTTTGGAGGAAGGACAAGTGGACCTACGTGTGGCTAATGGAGCAAA 2429 Query 240 AGTCTCTGCATTGGCCGTGGGAACATATTCGTTGTCTTTACCTTCAGGCATGGTTTTGGA 299 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2428 AGTTTCTGCATTAGCCGTGGGAACATATTCGTTGTCTTTACCTTCAGGCATGGTTTTGGA 2369 Query 300 GCTTAAGAACTGCTACTATGTTCCTGCTATAAACAAGAATATTGTCTCCGTTTCATGTTT 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 2368 GCTTAAGAACTGCTACTATGTTCCTGCTATAAACAAGAATATCATCTCTGTTTCATGTTT 2309 Query 360 GGACATGGAAGGTTTTCACTTTTCGATCAAGAACAAATGTTGTTCATTTGATCGAGATGA 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2308 GGACATGGAAGGTTTTCACTTTTCGATCAAGAACAAATGTTGTTCATTTGATCGAGATGA 2249 Query 420 TATGTTTTATGGTAGCGCTCCATTAGAGAATGGGCTCTATGTTCTAAACCAAAGCATGCC 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2248 TATGTTTTATGGTAGCGCTCCATTAGAGAATGGGCTTTATGTTCTAAACCAAAGCATGCC 2189 Query 480 AGTCTATAACATACGTACAAAAATATTTAAGTCTAATGACTTGAATCCAACTTTTCTCTG 539 |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2188 AGTCTATAACATTCGTACCAAGAGATTTAAGTCTAATGACTTGAATCCAACTTTTCTCTG 2129 Query 540 GCATTGTCGTTTGGGCCATATAAACGAGAAACGCATTCAAAAGCTTCATAGTGATGGACT 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2128 GCATTGTCGTTTGGGCCATATAAACGAGAAACGAATTCAAAAACTTCATAGTGATGGACT 2069 Query 600 TTTGAACTCATTTGATTATGAATCTTATGAGACATGTGAATCTTGTTTGTTGGGAAAAAT 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2068 TTTGAACTCATTTGATTATGAATCTTATGAGACTTGTGAATCTTGTTTGTTGGGAAAGAT 2009 Query 660 GACTAAAGCCCCGTTTAGTGGACACAGTGAGAGGGCTGGTGACTTATTGGGCCTTATACA 719 |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2008 GACTAAGGCCCCATTTACTGGGCACAGTGAGAGGGCTAGTGACTTATTGGGCCTTATACA 1949 Query 720 TACAGATGTATGTGGGCCAATGAGTACAAGTGCTAGAGGAAACTATCAGTATTTCATTAC 779 ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1948 TACAGATGTATGTGGGCTAATGAGTACAAGCGCCAGAGGAAACTATCAGTACTTCATTAC 1889 Query 780 ATTTACTGATGACTTCAGTAGATATAGTTATGTTTATCTAATGAAACATAAATCGGAATC 839 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1888 ATTTACTGATGACTTCAGTAGATATGGTTATGTTTATCTAATGAAACATAAGTCGGAATC 1829 Query 840 CTTTGAAAAATTCAAGGAGTTCCAGAATGAAGTACAAAATCAACTTGGCAAATCAATTAA 899 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1828 TTTTGAAAAGTTCAAGGAGTTCCAGAATGAAGTACAAAATCAACTTGGCAAATCAATAAA 1769 Query 900 GGCTCTTCGATCAGATCGTGGAGGAGAATATTTGAGCCAAGTTTTTAGTGGTCATCTTAG 959 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||| || Sbjct 1768 AGCTCTTCGATCAGATCGTGGAGGAGAATATTTGAGCCAAGCTTTCATTGATCATCTCAG 1709 Query 960 AGAATGTGGAATTGTTTCACAGCTCACTTCTCCGGGAACACCACAATGGAATGGTGTGTC 1019 ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 1708 AGAGTGTGGAATTGTTTCACAGCTCACTCCTCCAGGAACACCATAGTGGAATGGTGTGTC 1649 Query 1020 TAAAAGGAGAAATCGAACTTTATTGGATATGTTTCGATCTATGATGAGTCACACAGATCT 1079 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 1648 CGAAAGGAGAAATCGAACTTTATTGGATATGGTTCGATCGATGATGAGTCACACTGATCT 1589 Query 1080 TGCACCATCCTTTTGGGGATATGCTCTAGAGACGTGTGCGTTTATGCTCAACAGATGTCC 1139 | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1588 TCCAATATCCTTTTGGGGATATGCTCTAGAGACGTCTGCGTTTATGCTAAACAGATGTCC 1529 Query 1140 -ATCAAAATAAGTTGAGAAGACACCATATGAGATATGGACTGGAAAGGTTCCTAATTTGT 1198 | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1528 GA-CAAAATCAGTTGAAAAGACACCATATGAGATATGGACTGGAAAGGTTCCTAATTTAT 1470 Query 1199 CTTTTGTGAAAGTTTGGGGTTGTGAAACTTATGTCAAACGATTGATTAGTGATAAGCTTG 1258 ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| Sbjct 1469 CTTTTCTCAAAATTTGGGGTTGTGAAGCTTATGTCAAACGGTTGATTACTGATAATCTTG 1410 Query 1259 GACCCAAGTATGATAAGTGCTACTTCGTAGGTTATCCGAAAGAGACCAAAGGTTATTACT 1318 ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct 1409 GACCCAAATCTGATAAATGCTACTTCGTAGGTTATCCTAAAGAGACCAAAAGTTATTACT 1350 Query 1319 TTTACCA-CCTAATTGACAACAACGTGTTTGTTGCTCGAAATGGTGCCTTTTTGGAAA-G 1376 | ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1349 TCTACCATCCTACT-GACAACAAAGTGTTTGTTGCTCGAAATGGTGCCTTTTTGGAAATG 1291 Query 1377 AGAGTTTCTTTCAAAAGGAACTAGTGGGAGTAAAGTATTACTCGAAGAAGTTCGAGAACC 1436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1290 -GAGTTTCTTTCAAAAGGAACTAGTGGGAGTAAAGTGTTACTCGAAGAAGTTCGAGAACC 1232 Query 1437 ACAGGGTGA-TGTTTCAACTTCTCAGGAAGAACATAAGTTGGATCTACGAAGAGTCGTAG 1495 ||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1231 ACATGA-GAATGTTCCAACTTCTCAGGAAGAACATCAGTTGGATCTACGAAGAGTCGTAG 1173 Query 1496 AACCTATACCTGTGGAACCTGAGGTACGTAGGTCCGAAAGGAGTCGTCACGAACCCGATA 1555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1172 AACCTATACCTGTGGAACCTGAGGTACGTAGGTCCGAAAGGAACCGTCACGAACCCGATA 1113 Query 1556 GATTCGGAGATTGGGTGATGGATGATCATGCTCTATTTATTATAGAAAGTCATGAACCTA 1615 |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| Sbjct 1112 GATTTGGAGATTGGGTGACGGATGATCATGATCTATTGATTATAGAGAGTGATGAACCTA 1053 Query 1616 CGTCATACGAAGAAGCACTGATGGGCCCCGATTCCGATAATTGGTTAGAGGCCGCGAAAT 1675 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1052 CGTCATACGAAGAAGCATTGATGGGCCCCGATTCCGTTAAGTGGTTAGAGGCCGCGAAAT 993 Query 1676 CCGAAATGGAATCCATGTCACAAAACAAAGTATGGACTTTGGTTGATTTACCTGATGGTG 1735 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 992 CCGAGATGGAATCCATGTCACAAAACAAAGTATGGACTTTGGTTGATTTACCTGATGGTG 933 Query 1736 TAAAAGCCATAGAGTGTAAATGGCTATTCAAGAAGAAAGACATGGGTGAAGCTGCCTATA 1795 |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 932 TAAAAGCCATTGAGTGTAAATGGATTTTCAAGAAGAAAGACTTGGGAGAAGCTGCCTATA 873 Query 1796 TTCTTGGAATACGAATCTATAGAGATAGATTAAACAAAATAATTGGACTAAGTTAGGATA 1855 ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 872 TTCTTGGAATAAGGATCTATAGAGATAGATTGAACAAAATAATTGGACTAAGTCAAGATA 813 Query 1856 CTTATATTGATAAGGTCTTGCACAGGTTCAATATGCATGATTCTAAGAAAGGCTTAATAC 1915 ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 812 CTTATATAGATAAGGTCTTGCATAGGTTTAATATGCATGATTCTAAGAAAGGCTTTATAC 753 Query 1916 CAATGTCTCATGGCATAACTCTTAGCAAGACTCAGTGTCTTTCGACGCATGATGAGCGAG 1975 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| Sbjct 752 CAATGTCTCATGGCATAACTCTTAGCAAGACTCAGTGTCCTTCGACACAAGATGAGCGAG 693 Query 1976 AGCGGATGAGTAAGATTCCATATGCTTCTGCTATAGGATCTATCATGAATGCTATGCTCT 2035 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 692 AGCGGATGAGTAAGATTCCATATGCTTCTGCTATAGGATCTATCATGTATGCTATGCTCT 633 Query 2036 GGACTCGCCCAGATGTTGCATGTGCTTTGAGCATGACGAGCAGATACCAATCTGATCCAG 2095 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 632 GCACTCGCCCAGATGTTGTTTGTGCTTTGAGCATGACGAGCAGATACCAGTCTGATCCAG 573 Query 2096 GTGAAAGTCACTAGATAGTAGTCAAGAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACGAAGGATA 2155 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 572 GTGAAAGTCACTGGATAGTAGTCAAGAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACTAAGGATA 513 Query 2156 AGTTTTTGGTCTATGGAGGAAGTGAGGAACTTGTTGTGAGTGGTTATACTGATGCCAGCT 2215 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 512 AGTTTTTGGTTTATGGAGGAAGTGAGGAACTTGTTGTGAGTGGTTATACCGATGCCAGCT 453 Query 2216 TTCAGACAGACAAAGATGATTTCCGATCTTAATCAGGATTTGTCTTTTGTCCCAACGGAG 2275 |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 452 TTCAGACAGACAAAGATGATTTTCGATCTCAATCAGGATTTGTCTTTTGTCTCAACGGAG 393 Query 2276 GAGCAGTGAGTTGGAAGAGTTCCAAACAGAGCATTGTGGCAGACTCTACAATTGAAGCTG 2335 |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| Sbjct 392 GAGCAGTGAGCTGGAAGAGTTCCAAACAGAGCACTGTGGCAGATTCTACAACTGAGGCTG 333 Query 2336 AGTATATAGCTGCTTCTGAAGCGGCTAAGGAGGCTGCTTGGATTAGGAAGTTCATTACTG 2395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 332 AGTATATAGCTGCTTCTGAAGCGGCTAAGGAGGCTGTTTGGATTAGGAAGTTCATTACTG 273 Query 2396 AACTTGGTGTGGTTCCTAGTATTTCTGACCCCATTGATCTTTACTGTGATAACAATGGTG 2455 ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 272 AACTTGGTGTGGTTCCTAGTATTTCTGGCCCCATCGATCTTTACTGTGATAACAATGGAG 213 Query 2456 CCATGGCGCAAGCAAAAGAACCTAGATCACACCAGAAATCCAAACACATACAAAGGCGAT 2515 |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 212 CCATCGCTCAAGCGAAAGAACCTAGATCACACCAGAAATCCAAACACATACAAAGGCGAT 153 Query 2516 ATTACCTCATTCGTGAGATTATTGATAGAGGTGATGTGAAGACTAGAAGAGTTTCAACGG 2575 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | Sbjct 152 ATCACCTCATTCGTGAGATTATTGATAGAGGTGATGTGAAGATTAGCAGAGTTCCAACAG 93 Query 2576 ATGCAAATGTTGCTGATCC-TCTTACTAAACCTCTTCCGCAGCCGAAGCATGAGAGTCAT 2634 ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 92 ATGCAAATGTTGCTGATCCGT-TTACTAAACCTCTTCCACAGCCTAAGCATGAGAGTCAT 34 Query 2635 ACTGCTGCGATTGGCATTAGATTTATAAAGATG 2667 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33 ACTGCTGCGATTGGCATTAGATTTATAAAGATG 1 > Ahg494901 jgi|Araly1|494901|fgenesh2_kg.8__717__AT3G32340.1 Length=2665 Score = 4043 bits (2189), Expect = 0.0 Identities = 2512/2671 (94%), Gaps = 10/2671 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 GACAAATTGTATGAATCAAACCTTCCTGAATACTT-GGAAGATCTGGAGAAGAAGAAAAC 59 ||||||||| ||| |||||||| || |||| | || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2665 GACAAATTGAATGGATCAAACCCTCTTGAA-AATTCGGAAGATCTGGAGAAGAAGAAAAT 2607 Query 60 ATTCAATATTTCTTCTTCGGGTATCTATGTTATAGAAGTAAATGTTACTACATCTGGTTC 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2606 ATTCAATATTTCTTCTTCGGGTATCTATGTTATAGAAGTAAATGTTACTACTTCTGGTTC 2547 Query 120 TACTCCTTGGGTATTGGATACCGGTTGTGGTGCTCACATTTGTGTAAATGTGCATGGCCT 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2546 TACTCCTTGGGTATTGGATACCGGTTGTGGTGCTCACATTTGTGTATATGTGCATGGCCT 2487 Query 180 AAACAACAGTAGAACTTTCGAGGAAGGACAAGTGGACCTACGTGTGGCTAATGGAGCAAA 239 || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2486 AACCAACAGTAGAACTTTGGAGGAAGGACAAGTGGACCTACGTGTGGCTAATGGAGCAAA 2427 Query 240 AGTCTCTGCATTGGCCGTGGGAACATATTCGTTGTCTTTACCTTCAGGCATGGTTTTGGA 299 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2426 AGTTTCTGCATTAGCCGTGGGAACATATTCGTTGTCTTTACCTTCAGGCATGGTTTTGGA 2367 Query 300 GCTTAAGAACTGCTACTATGTTCCTGCTATAAACAAGAATATTGTCTCCGTTTCATGTTT 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 2366 GCTTAAGAACTGCTACTATGTTCCTGCTATAAACAAGAATATCATCTCCATTTCATGTTT 2307 Query 360 GGACATGGAAGGTTTTCACTTTTCGATCAAGAACAAATGTTGTTCATTTGATCGAGATGA 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2306 GGACATGGAAGGTTTTCACTTTTCGATCAAGAACAAATGTTGTTCATTTGATCGAGATGA 2247 Query 420 TATGTTTTATGGTAGCGCTCCATTAGAGAATGGGCTCTATGTTCTAAACCAAAGCATGCC 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2246 TATGTTTTATGGTAGCGCTCCATTAAAGAATGGGCTTTATGTTCTAAACCAAAGCATGCC 2187 Query 480 AGTCTATAACATACGTACAAAAATATTTAAGTCTAATGACTTGAATCCAACTTTTCTCTG 539 |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2186 AGTCTATAACATTCGTACCAAGAGATTTAAGTCTAATGACTTGAATCCAACTTTTCTCTG 2127 Query 540 GCATTGTCGTTTGGGCCATATAAACGAGAAACGCATTCAAAAGCTTCATAGTGATGGACT 599 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2126 GCATTGTCGTTTGGGCCATATAAATGAGAAACGCATTCAAAAGCTTCATAGTGATGGACT 2067 Query 600 TTTGAACTCATTTGATTATGAATCTTATGAGACATGTGAATCTTGTTTGTTGGGAAAAAT 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2066 TTTGAACTCATTTGATTATGAATCTTATGAGACTTGTGAATCTTGTTTGTTGGGAAAAAT 2007 Query 660 GACTAAAGCCCCGTTTAGTGGACACAGTGAGAGGGCTGGTGACTTATTGGGCCTTATACA 719 |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 2006 GACTAAGGCCCCATTTACTGGGCACAGTGAGAGGGCTAGTGATTTATTGGGCCTTATACA 1947 Query 720 TACAGATGTATGTGGGCCAATGAGTACAAGTGCTAGAGGAAACTATCAGTATTTCATTAC 779 ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1946 TACAGATGTATGTGGGCCAATGAATACAAGCGCCAGAGGAAACTATCAGTACTTCATTAC 1887 Query 780 ATTTACTGATGACTTCAGTAGATATAGTTATGTTTATCTAATGAAACATAAATCGGAATC 839 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1886 ATTTACTGATGACTTCAGTAGATATGGTTATGTTTATCTAATGAAACATAAGTCGGAATC 1827 Query 840 CTTTGAAAAATTCAAGGAGTTCCAGAATGAAGTACAAAATCAACTTGGCAAATCAATTAA 899 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1826 CTTTGAAAAGTTCAAGGAGTTCCAGAATGAAGTACAAAATCAACTTGGCAAATCAATAAA 1767 Query 900 GGCTCTTCGATCAGATCGTGGAGGAGAATATTTGAGCCAAGTTTTTAGTGGTCATCTTAG 959 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || Sbjct 1766 AGCTCTTCGATCAGATCGTGGAGGAGAATATTTGAGCCAAGCTTTCAGTGATCATCTCAG 1707 Query 960 AGAATGTGGAATTGTTTCACAGCTCACTTCTCCGGGAACACCACAATGGAATGGTGTGTC 1019 ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1706 AGAGTGTGGAATTGTTTCACAGCTCACTCCTCCAGGAACACCACAGTGGAATGGTGTGTC 1647 Query 1020 TAAAAGGAGAAATCGAACTTTATTGGATATGTTTCGATCTATGATGAGTCACACAGATCT 1079 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 1646 CGAAAGGAGAAATCGAACTTTATTGGATATGGTTCGATCGATGATGAGTCACACTGATCT 1587 Query 1080 TGCACCATCCTTTTGGGGATATGCTCTAGAGACGTGTGCGTTTATGCTCAACAGATGTCC 1139 | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1586 TCCAATATCCTTTTGGGGATATGCTCTAGAGACGTCTGCGTTTATGCTAAACAGATGTCC 1527 Query 1140 ATCAAAATAAGTTGAGAAGACACCATATGAGATATGGACTGGAAAGGTTCCTAATTTGTC 1199 |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1526 ATCAAAATCAGTTGAAAAGACACCATATGAGATATGGACTGGAAAAGTTCCTAATTTATC 1467 Query 1200 TTTTGTGAAAGTTTGGGGTTGTGAAACTTATGTCAAACGATTGATTAGTGATAAGCTTGG 1259 |||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 1466 TTTTCTCAAAATTTGGGGATGTGAAGCTTATGTCAAACGGTTGATTACTGATAAGCTTGG 1407 Query 1260 ACCCAAGTATGATAAGTGCTACTTCGTAGGTTATCCGAAAGAGACCAAAGGTTATTACTT 1319 ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1406 ACCAAAATCTGATAAATGCTACTTCGTAGGTTATCCTAAAGAGACCAAAGGTTATTACTT 1347 Query 1320 TTACCA-CCTAATTGACAACAACGTGTTTGTTGCTCGAAATGGTGCCTTTTTGGAAAGAG 1378 ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 1346 CTACCATCC-AACTGACAACAAAGTGTTTGTTGCTCGAAATGGAGCCTTTTTGGAAAGGG 1288 Query 1379 AGTTTCTTTCAAAAGGAACTAGTGGGAGTAAAGTATTACTCGAAGAAGTTCGAGAACCAC 1438 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| Sbjct 1287 AGTTTCTTTCAAAAGGAACTAGTGGGAGTAAAGTGTTACTCAAAGAAGTTCGAG--CCAC 1230 Query 1439 AGG-GTGATGTTTCAACTTCTCAGGAAGAACATAAGTTGGATCTACGAAGAGTCGTAGAA 1497 ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1229 AGGAG-GATGTTCCAACTTCTCAGGAAGAACATCAGTTAGATCTACGAAGAGTCGTAGAA 1171 Query 1498 CCTATACCTGTGGAACCTGAGGTACGTAGGTCCGAAAGGAGTCGTCACGAACCCGATAGA 1557 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1170 TCTACACCTGTGGAACCTGAGGTACGTAGGTCCGAAAGGAACCGTCACGAACCCGATAGA 1111 Query 1558 TTCGGAGATTGGGTGATGGATGATCATGCTCTATTTATTATAGAAAGTCATGAACCTACG 1617 || ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 1110 TTTGGAGATTAGGTGATGGATGATCATAATCTATTGATTATAGAGAGTGATGAACCTACG 1051 Query 1618 TCATACGAAGAAGCACTGATGGGCCCCGATTCCGATAATTGGTTAGAGGCCGCGAAATCC 1677 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1050 TCATACGAAGAAGCAATGATGGGCCCCGATTCCGATAAGTGGTTAGAGGCCGCGAAATCC 991 Query 1678 GAAATGGAATCCATGTCACAAAACAAAGTATGGACTTTGGTTGATTTACCTGATGGTGTA 1737 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 990 GAGATGGAATCCATGTCACAAAACAAAGTATGGACTTTGGTTGATTTACCTGATGGTGTA 931 Query 1738 AAAGCCATAGAGTGTAAATGGCTATTCAAGAAGAAAGACATGGGTGAAGCTGCCTATATT 1797 ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 930 AAAGCTATTGAGTGTAAATGGATTTTCAAGAAGAAAGACTTGGGAGAAGCTGCCTATATT 871 Query 1798 CTTGGAATACGAATCTATAGAGATAGATTAAACAAAATAATTGGACTAAGTTAGGATACT 1857 ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct 870 CTTGGAATAAGGATCTATAGAGATAGATTGAACAAAATAATTGGACTAAGTCAAGATACT 811 Query 1858 TATATTGATAAGGTCTTGCACAGGTTCAATATGCATGATTCTAAGAAAGGCTTAATACCA 1917 ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 810 TATATAGATAAGGTCTTGCATAGGTTTAATATGCATGATTCTAAGAAAGGCTTTATACCA 751 Query 1918 ATGTCTCATGGCATAACTCTTAGCAAGACTCAGTGTCTTTCGACGCATGATGAGCGAGAG 1977 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| Sbjct 750 ATGTCTCATGGCATAACTCTTAGCAAGACTCAGTGTCCTTCGACACAAGATGAGCGAGAG 691 Query 1978 CGGATGAGTAAGATTCCATATGCTTCTGCTATAGGATCTATCATGAATGCTATGCTCTGG 2037 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 690 CGGATGAGTAAGATTCCATATGCTTCTGCTATAGGATCTATCATGTATGCTATGCTCTGC 631 Query 2038 ACTCGCCCAGATGTTGCATGTGCTTTGAGCATGACGAGCAGATACCAATCTGATCCAGGT 2097 |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 630 ACTCGCCCAGGTGTTGCTTGTGCTTTGAGCATGACGAGCAGATACCAGTCTGATCCAGGT 571 Query 2098 GAAAGTCACTAGATAGTAGTCAAGAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACGAAGGATAAG 2157 |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct 570 GAAAGTCATTGGATAGTAGTCAAGAACATCCTTAAGTACTTGAAAAGAACTAAGGATAAG 511 Query 2158 TTTTTGGTCTATGGAGGAAGTGAGGAACTTGTTGTGAGTGGTTATACTGATGCCAGCTTT 2217 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 510 TTTTTGGTTTATGGAGGAAGTGAGGAACTTGTTGTGAGTGGTTATACCGATGCCAGCTTT 451 Query 2218 CAGACAGACAAAGATGATTTCCGATCTTAATCAGGATTTGTCTTTTGTCCCAACGGAGGA 2277 |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 450 CAGACAGACAAAGATGATTTTCGATCTCAATCAGGATTTGTCTTTTGTCTCAACGGAGGA 391 Query 2278 GCAGTGAGTTGGAAGAGTTCCAAACAGAGCATTGTGGCAGACTCTACAATTGAAGCTGAG 2337 |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| Sbjct 390 GCAGTGAGCTGGAAGAGTTCCAAACAGAGCACTATGGCAGACTCTGCAACTGAGGCTGAG 331 Query 2338 TATATAGCTGCTTCTGAAGCGGCTAAGGAGGCTGCTTGGATTAGGAAGTTCATTACTGAA 2397 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 330 TATATAGCTGCTTCTGAAGCGGCTAAGGAGGCTGTTTGGATTAGGAAGTTCATTACTGAA 271 Query 2398 CTTGGTGTGGTTCCTAGTATTTCTGACCCCATTGATCTTTACTGTGATAACAATGGTGCC 2457 ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 270 CTTGGTGTGGTTCCTAGTATTTCTGGCCCCATCGATCTTTACTGTGATAACAATGGAGCC 211 Query 2458 ATGGCGCAAGCAAAAGAACCTAGATCACACCAGAAATCCAAACACATACAAAGGCGATAT 2517 || || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 210 ATCGCTCAAGCGAAATAACCTAGATCACACCAGAAATCCAAACACATACAAAGGCGATAT 151 Query 2518 TACCTCATTCGTGAGATTATTGATAGAGGTGATGTGAAGACTAGAAGAGTTTCAACGGAT 2577 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| Sbjct 150 CACCTCATTCGTGAGATTATTGATAGAGGTGATGTGAAGATTAGCAGAGTTCCAACGGAT 91 Query 2578 GCAAATGTTGCTGATCCTCTT-ACTAAACCTCTTCCGCAGCCGAAGCATGAGAGTCATAC 2636 |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 90 GCAAATGTTGCTGATC-TATTTACTAAACCTCTTCCGCAGCCTAAGCATGAGAGTCATAC 32 Query 2637 TGCTGCGATTGGCATTAGATTTATAAAGATG 2667 |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 31 TGCTGCGATTGGTATTAGATTTATAAAGATG 1 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 100596337045 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5