BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G32340.1
Length=2667
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg490208 jgi|Araly1|490208|fgenesh2_kg.6__3342__AT3G32340.1 4078 0.0
Ahg494901 jgi|Araly1|494901|fgenesh2_kg.8__717__AT3G32340.1 4043 0.0
> Ahg490208 jgi|Araly1|490208|fgenesh2_kg.6__3342__AT3G32340.1
Length=2667
Score = 4078 bits (2208), Expect = 0.0
Identities = 2520/2673 (94%), Gaps = 12/2673 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACAAATTGTATGAATCAAACCTTCCTGA-ATACTTGGAAGATCTGGAGAAGAAGAAAAC 59
||||||||| ||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2667 GACAAATTGAATGGATCAAACCCTCTTGACA-ACTTGGAAGATCTGGAGAAGAAGAAAAC 2609
Query 60 ATTCAATATTTCTTCTTCGGGTATCTATGTTATAGAAGTAAATGTTACTACATCTGGTTC 119
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2608 ATTCAAGGTCTCTTCTTCGGGTATCTATGTTATAGAAGTAAATGTTACTACTTCTGGTTC 2549
Query 120 TACTCCTTGGGTATTGGATACCGGTTGTGGTGCTCACATTTGTGTAAATGTGCATGGCCT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2548 TACTCCTTGGGTATTGGATACCGGTTGTGGTGCTCACATTTGTGTAAATGTGCATGGCCT 2489
Query 180 AAACAACAGTAGAACTTTCGAGGAAGGACAAGTGGACCTACGTGTGGCTAATGGAGCAAA 239
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2488 AAACAACAGTAGAACTTTGGAGGAAGGACAAGTGGACCTACGTGTGGCTAATGGAGCAAA 2429
Query 240 AGTCTCTGCATTGGCCGTGGGAACATATTCGTTGTCTTTACCTTCAGGCATGGTTTTGGA 299
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 AGTTTCTGCATTAGCCGTGGGAACATATTCGTTGTCTTTACCTTCAGGCATGGTTTTGGA 2369
Query 300 GCTTAAGAACTGCTACTATGTTCCTGCTATAAACAAGAATATTGTCTCCGTTTCATGTTT 359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2368 GCTTAAGAACTGCTACTATGTTCCTGCTATAAACAAGAATATCATCTCTGTTTCATGTTT 2309
Query 360 GGACATGGAAGGTTTTCACTTTTCGATCAAGAACAAATGTTGTTCATTTGATCGAGATGA 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2308 GGACATGGAAGGTTTTCACTTTTCGATCAAGAACAAATGTTGTTCATTTGATCGAGATGA 2249
Query 420 TATGTTTTATGGTAGCGCTCCATTAGAGAATGGGCTCTATGTTCTAAACCAAAGCATGCC 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2248 TATGTTTTATGGTAGCGCTCCATTAGAGAATGGGCTTTATGTTCTAAACCAAAGCATGCC 2189
Query 480 AGTCTATAACATACGTACAAAAATATTTAAGTCTAATGACTTGAATCCAACTTTTCTCTG 539
|||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2188 AGTCTATAACATTCGTACCAAGAGATTTAAGTCTAATGACTTGAATCCAACTTTTCTCTG 2129
Query 540 GCATTGTCGTTTGGGCCATATAAACGAGAAACGCATTCAAAAGCTTCATAGTGATGGACT 599
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2128 GCATTGTCGTTTGGGCCATATAAACGAGAAACGAATTCAAAAACTTCATAGTGATGGACT 2069
Query 600 TTTGAACTCATTTGATTATGAATCTTATGAGACATGTGAATCTTGTTTGTTGGGAAAAAT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2068 TTTGAACTCATTTGATTATGAATCTTATGAGACTTGTGAATCTTGTTTGTTGGGAAAGAT 2009
Query 660 GACTAAAGCCCCGTTTAGTGGACACAGTGAGAGGGCTGGTGACTTATTGGGCCTTATACA 719
|||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2008 GACTAAGGCCCCATTTACTGGGCACAGTGAGAGGGCTAGTGACTTATTGGGCCTTATACA 1949
Query 720 TACAGATGTATGTGGGCCAATGAGTACAAGTGCTAGAGGAAACTATCAGTATTTCATTAC 779
||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1948 TACAGATGTATGTGGGCTAATGAGTACAAGCGCCAGAGGAAACTATCAGTACTTCATTAC 1889
Query 780 ATTTACTGATGACTTCAGTAGATATAGTTATGTTTATCTAATGAAACATAAATCGGAATC 839
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1888 ATTTACTGATGACTTCAGTAGATATGGTTATGTTTATCTAATGAAACATAAGTCGGAATC 1829
Query 840 CTTTGAAAAATTCAAGGAGTTCCAGAATGAAGTACAAAATCAACTTGGCAAATCAATTAA 899
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1828 TTTTGAAAAGTTCAAGGAGTTCCAGAATGAAGTACAAAATCAACTTGGCAAATCAATAAA 1769
Query 900 GGCTCTTCGATCAGATCGTGGAGGAGAATATTTGAGCCAAGTTTTTAGTGGTCATCTTAG 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||| ||
Sbjct 1768 AGCTCTTCGATCAGATCGTGGAGGAGAATATTTGAGCCAAGCTTTCATTGATCATCTCAG 1709
Query 960 AGAATGTGGAATTGTTTCACAGCTCACTTCTCCGGGAACACCACAATGGAATGGTGTGTC 1019
||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1708 AGAGTGTGGAATTGTTTCACAGCTCACTCCTCCAGGAACACCATAGTGGAATGGTGTGTC 1649
Query 1020 TAAAAGGAGAAATCGAACTTTATTGGATATGTTTCGATCTATGATGAGTCACACAGATCT 1079
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1648 CGAAAGGAGAAATCGAACTTTATTGGATATGGTTCGATCGATGATGAGTCACACTGATCT 1589
Query 1080 TGCACCATCCTTTTGGGGATATGCTCTAGAGACGTGTGCGTTTATGCTCAACAGATGTCC 1139
| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1588 TCCAATATCCTTTTGGGGATATGCTCTAGAGACGTCTGCGTTTATGCTAAACAGATGTCC 1529
Query 1140 -ATCAAAATAAGTTGAGAAGACACCATATGAGATATGGACTGGAAAGGTTCCTAATTTGT 1198
| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1528 GA-CAAAATCAGTTGAAAAGACACCATATGAGATATGGACTGGAAAGGTTCCTAATTTAT 1470
Query 1199 CTTTTGTGAAAGTTTGGGGTTGTGAAACTTATGTCAAACGATTGATTAGTGATAAGCTTG 1258
||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||
Sbjct 1469 CTTTTCTCAAAATTTGGGGTTGTGAAGCTTATGTCAAACGGTTGATTACTGATAATCTTG 1410
Query 1259 GACCCAAGTATGATAAGTGCTACTTCGTAGGTTATCCGAAAGAGACCAAAGGTTATTACT 1318
||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1409 GACCCAAATCTGATAAATGCTACTTCGTAGGTTATCCTAAAGAGACCAAAAGTTATTACT 1350
Query 1319 TTTACCA-CCTAATTGACAACAACGTGTTTGTTGCTCGAAATGGTGCCTTTTTGGAAA-G 1376
| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1349 TCTACCATCCTACT-GACAACAAAGTGTTTGTTGCTCGAAATGGTGCCTTTTTGGAAATG 1291
Query 1377 AGAGTTTCTTTCAAAAGGAACTAGTGGGAGTAAAGTATTACTCGAAGAAGTTCGAGAACC 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 -GAGTTTCTTTCAAAAGGAACTAGTGGGAGTAAAGTGTTACTCGAAGAAGTTCGAGAACC 1232
Query 1437 ACAGGGTGA-TGTTTCAACTTCTCAGGAAGAACATAAGTTGGATCTACGAAGAGTCGTAG 1495
||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 ACATGA-GAATGTTCCAACTTCTCAGGAAGAACATCAGTTGGATCTACGAAGAGTCGTAG 1173
Query 1496 AACCTATACCTGTGGAACCTGAGGTACGTAGGTCCGAAAGGAGTCGTCACGAACCCGATA 1555
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1172 AACCTATACCTGTGGAACCTGAGGTACGTAGGTCCGAAAGGAACCGTCACGAACCCGATA 1113
Query 1556 GATTCGGAGATTGGGTGATGGATGATCATGCTCTATTTATTATAGAAAGTCATGAACCTA 1615
|||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||
Sbjct 1112 GATTTGGAGATTGGGTGACGGATGATCATGATCTATTGATTATAGAGAGTGATGAACCTA 1053
Query 1616 CGTCATACGAAGAAGCACTGATGGGCCCCGATTCCGATAATTGGTTAGAGGCCGCGAAAT 1675
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1052 CGTCATACGAAGAAGCATTGATGGGCCCCGATTCCGTTAAGTGGTTAGAGGCCGCGAAAT 993
Query 1676 CCGAAATGGAATCCATGTCACAAAACAAAGTATGGACTTTGGTTGATTTACCTGATGGTG 1735
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 CCGAGATGGAATCCATGTCACAAAACAAAGTATGGACTTTGGTTGATTTACCTGATGGTG 933
Query 1736 TAAAAGCCATAGAGTGTAAATGGCTATTCAAGAAGAAAGACATGGGTGAAGCTGCCTATA 1795
|||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 932 TAAAAGCCATTGAGTGTAAATGGATTTTCAAGAAGAAAGACTTGGGAGAAGCTGCCTATA 873
Query 1796 TTCTTGGAATACGAATCTATAGAGATAGATTAAACAAAATAATTGGACTAAGTTAGGATA 1855
||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 872 TTCTTGGAATAAGGATCTATAGAGATAGATTGAACAAAATAATTGGACTAAGTCAAGATA 813
Query 1856 CTTATATTGATAAGGTCTTGCACAGGTTCAATATGCATGATTCTAAGAAAGGCTTAATAC 1915
||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 812 CTTATATAGATAAGGTCTTGCATAGGTTTAATATGCATGATTCTAAGAAAGGCTTTATAC 753
Query 1916 CAATGTCTCATGGCATAACTCTTAGCAAGACTCAGTGTCTTTCGACGCATGATGAGCGAG 1975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||
Sbjct 752 CAATGTCTCATGGCATAACTCTTAGCAAGACTCAGTGTCCTTCGACACAAGATGAGCGAG 693
Query 1976 AGCGGATGAGTAAGATTCCATATGCTTCTGCTATAGGATCTATCATGAATGCTATGCTCT 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 692 AGCGGATGAGTAAGATTCCATATGCTTCTGCTATAGGATCTATCATGTATGCTATGCTCT 633
Query 2036 GGACTCGCCCAGATGTTGCATGTGCTTTGAGCATGACGAGCAGATACCAATCTGATCCAG 2095
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 632 GCACTCGCCCAGATGTTGTTTGTGCTTTGAGCATGACGAGCAGATACCAGTCTGATCCAG 573
Query 2096 GTGAAAGTCACTAGATAGTAGTCAAGAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACGAAGGATA 2155
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 572 GTGAAAGTCACTGGATAGTAGTCAAGAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACTAAGGATA 513
Query 2156 AGTTTTTGGTCTATGGAGGAAGTGAGGAACTTGTTGTGAGTGGTTATACTGATGCCAGCT 2215
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 512 AGTTTTTGGTTTATGGAGGAAGTGAGGAACTTGTTGTGAGTGGTTATACCGATGCCAGCT 453
Query 2216 TTCAGACAGACAAAGATGATTTCCGATCTTAATCAGGATTTGTCTTTTGTCCCAACGGAG 2275
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 452 TTCAGACAGACAAAGATGATTTTCGATCTCAATCAGGATTTGTCTTTTGTCTCAACGGAG 393
Query 2276 GAGCAGTGAGTTGGAAGAGTTCCAAACAGAGCATTGTGGCAGACTCTACAATTGAAGCTG 2335
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct 392 GAGCAGTGAGCTGGAAGAGTTCCAAACAGAGCACTGTGGCAGATTCTACAACTGAGGCTG 333
Query 2336 AGTATATAGCTGCTTCTGAAGCGGCTAAGGAGGCTGCTTGGATTAGGAAGTTCATTACTG 2395
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 AGTATATAGCTGCTTCTGAAGCGGCTAAGGAGGCTGTTTGGATTAGGAAGTTCATTACTG 273
Query 2396 AACTTGGTGTGGTTCCTAGTATTTCTGACCCCATTGATCTTTACTGTGATAACAATGGTG 2455
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 272 AACTTGGTGTGGTTCCTAGTATTTCTGGCCCCATCGATCTTTACTGTGATAACAATGGAG 213
Query 2456 CCATGGCGCAAGCAAAAGAACCTAGATCACACCAGAAATCCAAACACATACAAAGGCGAT 2515
|||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 CCATCGCTCAAGCGAAAGAACCTAGATCACACCAGAAATCCAAACACATACAAAGGCGAT 153
Query 2516 ATTACCTCATTCGTGAGATTATTGATAGAGGTGATGTGAAGACTAGAAGAGTTTCAACGG 2575
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |
Sbjct 152 ATCACCTCATTCGTGAGATTATTGATAGAGGTGATGTGAAGATTAGCAGAGTTCCAACAG 93
Query 2576 ATGCAAATGTTGCTGATCC-TCTTACTAAACCTCTTCCGCAGCCGAAGCATGAGAGTCAT 2634
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 92 ATGCAAATGTTGCTGATCCGT-TTACTAAACCTCTTCCACAGCCTAAGCATGAGAGTCAT 34
Query 2635 ACTGCTGCGATTGGCATTAGATTTATAAAGATG 2667
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 33 ACTGCTGCGATTGGCATTAGATTTATAAAGATG 1
> Ahg494901 jgi|Araly1|494901|fgenesh2_kg.8__717__AT3G32340.1
Length=2665
Score = 4043 bits (2189), Expect = 0.0
Identities = 2512/2671 (94%), Gaps = 10/2671 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACAAATTGTATGAATCAAACCTTCCTGAATACTT-GGAAGATCTGGAGAAGAAGAAAAC 59
||||||||| ||| |||||||| || |||| | || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GACAAATTGAATGGATCAAACCCTCTTGAA-AATTCGGAAGATCTGGAGAAGAAGAAAAT 2607
Query 60 ATTCAATATTTCTTCTTCGGGTATCTATGTTATAGAAGTAAATGTTACTACATCTGGTTC 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2606 ATTCAATATTTCTTCTTCGGGTATCTATGTTATAGAAGTAAATGTTACTACTTCTGGTTC 2547
Query 120 TACTCCTTGGGTATTGGATACCGGTTGTGGTGCTCACATTTGTGTAAATGTGCATGGCCT 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2546 TACTCCTTGGGTATTGGATACCGGTTGTGGTGCTCACATTTGTGTATATGTGCATGGCCT 2487
Query 180 AAACAACAGTAGAACTTTCGAGGAAGGACAAGTGGACCTACGTGTGGCTAATGGAGCAAA 239
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2486 AACCAACAGTAGAACTTTGGAGGAAGGACAAGTGGACCTACGTGTGGCTAATGGAGCAAA 2427
Query 240 AGTCTCTGCATTGGCCGTGGGAACATATTCGTTGTCTTTACCTTCAGGCATGGTTTTGGA 299
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2426 AGTTTCTGCATTAGCCGTGGGAACATATTCGTTGTCTTTACCTTCAGGCATGGTTTTGGA 2367
Query 300 GCTTAAGAACTGCTACTATGTTCCTGCTATAAACAAGAATATTGTCTCCGTTTCATGTTT 359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2366 GCTTAAGAACTGCTACTATGTTCCTGCTATAAACAAGAATATCATCTCCATTTCATGTTT 2307
Query 360 GGACATGGAAGGTTTTCACTTTTCGATCAAGAACAAATGTTGTTCATTTGATCGAGATGA 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2306 GGACATGGAAGGTTTTCACTTTTCGATCAAGAACAAATGTTGTTCATTTGATCGAGATGA 2247
Query 420 TATGTTTTATGGTAGCGCTCCATTAGAGAATGGGCTCTATGTTCTAAACCAAAGCATGCC 479
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2246 TATGTTTTATGGTAGCGCTCCATTAAAGAATGGGCTTTATGTTCTAAACCAAAGCATGCC 2187
Query 480 AGTCTATAACATACGTACAAAAATATTTAAGTCTAATGACTTGAATCCAACTTTTCTCTG 539
|||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186 AGTCTATAACATTCGTACCAAGAGATTTAAGTCTAATGACTTGAATCCAACTTTTCTCTG 2127
Query 540 GCATTGTCGTTTGGGCCATATAAACGAGAAACGCATTCAAAAGCTTCATAGTGATGGACT 599
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2126 GCATTGTCGTTTGGGCCATATAAATGAGAAACGCATTCAAAAGCTTCATAGTGATGGACT 2067
Query 600 TTTGAACTCATTTGATTATGAATCTTATGAGACATGTGAATCTTGTTTGTTGGGAAAAAT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066 TTTGAACTCATTTGATTATGAATCTTATGAGACTTGTGAATCTTGTTTGTTGGGAAAAAT 2007
Query 660 GACTAAAGCCCCGTTTAGTGGACACAGTGAGAGGGCTGGTGACTTATTGGGCCTTATACA 719
|||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 2006 GACTAAGGCCCCATTTACTGGGCACAGTGAGAGGGCTAGTGATTTATTGGGCCTTATACA 1947
Query 720 TACAGATGTATGTGGGCCAATGAGTACAAGTGCTAGAGGAAACTATCAGTATTTCATTAC 779
||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1946 TACAGATGTATGTGGGCCAATGAATACAAGCGCCAGAGGAAACTATCAGTACTTCATTAC 1887
Query 780 ATTTACTGATGACTTCAGTAGATATAGTTATGTTTATCTAATGAAACATAAATCGGAATC 839
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1886 ATTTACTGATGACTTCAGTAGATATGGTTATGTTTATCTAATGAAACATAAGTCGGAATC 1827
Query 840 CTTTGAAAAATTCAAGGAGTTCCAGAATGAAGTACAAAATCAACTTGGCAAATCAATTAA 899
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1826 CTTTGAAAAGTTCAAGGAGTTCCAGAATGAAGTACAAAATCAACTTGGCAAATCAATAAA 1767
Query 900 GGCTCTTCGATCAGATCGTGGAGGAGAATATTTGAGCCAAGTTTTTAGTGGTCATCTTAG 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||
Sbjct 1766 AGCTCTTCGATCAGATCGTGGAGGAGAATATTTGAGCCAAGCTTTCAGTGATCATCTCAG 1707
Query 960 AGAATGTGGAATTGTTTCACAGCTCACTTCTCCGGGAACACCACAATGGAATGGTGTGTC 1019
||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1706 AGAGTGTGGAATTGTTTCACAGCTCACTCCTCCAGGAACACCACAGTGGAATGGTGTGTC 1647
Query 1020 TAAAAGGAGAAATCGAACTTTATTGGATATGTTTCGATCTATGATGAGTCACACAGATCT 1079
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1646 CGAAAGGAGAAATCGAACTTTATTGGATATGGTTCGATCGATGATGAGTCACACTGATCT 1587
Query 1080 TGCACCATCCTTTTGGGGATATGCTCTAGAGACGTGTGCGTTTATGCTCAACAGATGTCC 1139
| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1586 TCCAATATCCTTTTGGGGATATGCTCTAGAGACGTCTGCGTTTATGCTAAACAGATGTCC 1527
Query 1140 ATCAAAATAAGTTGAGAAGACACCATATGAGATATGGACTGGAAAGGTTCCTAATTTGTC 1199
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1526 ATCAAAATCAGTTGAAAAGACACCATATGAGATATGGACTGGAAAAGTTCCTAATTTATC 1467
Query 1200 TTTTGTGAAAGTTTGGGGTTGTGAAACTTATGTCAAACGATTGATTAGTGATAAGCTTGG 1259
|||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1466 TTTTCTCAAAATTTGGGGATGTGAAGCTTATGTCAAACGGTTGATTACTGATAAGCTTGG 1407
Query 1260 ACCCAAGTATGATAAGTGCTACTTCGTAGGTTATCCGAAAGAGACCAAAGGTTATTACTT 1319
||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 ACCAAAATCTGATAAATGCTACTTCGTAGGTTATCCTAAAGAGACCAAAGGTTATTACTT 1347
Query 1320 TTACCA-CCTAATTGACAACAACGTGTTTGTTGCTCGAAATGGTGCCTTTTTGGAAAGAG 1378
||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1346 CTACCATCC-AACTGACAACAAAGTGTTTGTTGCTCGAAATGGAGCCTTTTTGGAAAGGG 1288
Query 1379 AGTTTCTTTCAAAAGGAACTAGTGGGAGTAAAGTATTACTCGAAGAAGTTCGAGAACCAC 1438
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 1287 AGTTTCTTTCAAAAGGAACTAGTGGGAGTAAAGTGTTACTCAAAGAAGTTCGAG--CCAC 1230
Query 1439 AGG-GTGATGTTTCAACTTCTCAGGAAGAACATAAGTTGGATCTACGAAGAGTCGTAGAA 1497
||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 AGGAG-GATGTTCCAACTTCTCAGGAAGAACATCAGTTAGATCTACGAAGAGTCGTAGAA 1171
Query 1498 CCTATACCTGTGGAACCTGAGGTACGTAGGTCCGAAAGGAGTCGTCACGAACCCGATAGA 1557
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1170 TCTACACCTGTGGAACCTGAGGTACGTAGGTCCGAAAGGAACCGTCACGAACCCGATAGA 1111
Query 1558 TTCGGAGATTGGGTGATGGATGATCATGCTCTATTTATTATAGAAAGTCATGAACCTACG 1617
|| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1110 TTTGGAGATTAGGTGATGGATGATCATAATCTATTGATTATAGAGAGTGATGAACCTACG 1051
Query 1618 TCATACGAAGAAGCACTGATGGGCCCCGATTCCGATAATTGGTTAGAGGCCGCGAAATCC 1677
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 TCATACGAAGAAGCAATGATGGGCCCCGATTCCGATAAGTGGTTAGAGGCCGCGAAATCC 991
Query 1678 GAAATGGAATCCATGTCACAAAACAAAGTATGGACTTTGGTTGATTTACCTGATGGTGTA 1737
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 GAGATGGAATCCATGTCACAAAACAAAGTATGGACTTTGGTTGATTTACCTGATGGTGTA 931
Query 1738 AAAGCCATAGAGTGTAAATGGCTATTCAAGAAGAAAGACATGGGTGAAGCTGCCTATATT 1797
||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 930 AAAGCTATTGAGTGTAAATGGATTTTCAAGAAGAAAGACTTGGGAGAAGCTGCCTATATT 871
Query 1798 CTTGGAATACGAATCTATAGAGATAGATTAAACAAAATAATTGGACTAAGTTAGGATACT 1857
||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 870 CTTGGAATAAGGATCTATAGAGATAGATTGAACAAAATAATTGGACTAAGTCAAGATACT 811
Query 1858 TATATTGATAAGGTCTTGCACAGGTTCAATATGCATGATTCTAAGAAAGGCTTAATACCA 1917
||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 810 TATATAGATAAGGTCTTGCATAGGTTTAATATGCATGATTCTAAGAAAGGCTTTATACCA 751
Query 1918 ATGTCTCATGGCATAACTCTTAGCAAGACTCAGTGTCTTTCGACGCATGATGAGCGAGAG 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||
Sbjct 750 ATGTCTCATGGCATAACTCTTAGCAAGACTCAGTGTCCTTCGACACAAGATGAGCGAGAG 691
Query 1978 CGGATGAGTAAGATTCCATATGCTTCTGCTATAGGATCTATCATGAATGCTATGCTCTGG 2037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 690 CGGATGAGTAAGATTCCATATGCTTCTGCTATAGGATCTATCATGTATGCTATGCTCTGC 631
Query 2038 ACTCGCCCAGATGTTGCATGTGCTTTGAGCATGACGAGCAGATACCAATCTGATCCAGGT 2097
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 630 ACTCGCCCAGGTGTTGCTTGTGCTTTGAGCATGACGAGCAGATACCAGTCTGATCCAGGT 571
Query 2098 GAAAGTCACTAGATAGTAGTCAAGAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACGAAGGATAAG 2157
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 570 GAAAGTCATTGGATAGTAGTCAAGAACATCCTTAAGTACTTGAAAAGAACTAAGGATAAG 511
Query 2158 TTTTTGGTCTATGGAGGAAGTGAGGAACTTGTTGTGAGTGGTTATACTGATGCCAGCTTT 2217
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 510 TTTTTGGTTTATGGAGGAAGTGAGGAACTTGTTGTGAGTGGTTATACCGATGCCAGCTTT 451
Query 2218 CAGACAGACAAAGATGATTTCCGATCTTAATCAGGATTTGTCTTTTGTCCCAACGGAGGA 2277
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 450 CAGACAGACAAAGATGATTTTCGATCTCAATCAGGATTTGTCTTTTGTCTCAACGGAGGA 391
Query 2278 GCAGTGAGTTGGAAGAGTTCCAAACAGAGCATTGTGGCAGACTCTACAATTGAAGCTGAG 2337
|||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||
Sbjct 390 GCAGTGAGCTGGAAGAGTTCCAAACAGAGCACTATGGCAGACTCTGCAACTGAGGCTGAG 331
Query 2338 TATATAGCTGCTTCTGAAGCGGCTAAGGAGGCTGCTTGGATTAGGAAGTTCATTACTGAA 2397
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 TATATAGCTGCTTCTGAAGCGGCTAAGGAGGCTGTTTGGATTAGGAAGTTCATTACTGAA 271
Query 2398 CTTGGTGTGGTTCCTAGTATTTCTGACCCCATTGATCTTTACTGTGATAACAATGGTGCC 2457
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 270 CTTGGTGTGGTTCCTAGTATTTCTGGCCCCATCGATCTTTACTGTGATAACAATGGAGCC 211
Query 2458 ATGGCGCAAGCAAAAGAACCTAGATCACACCAGAAATCCAAACACATACAAAGGCGATAT 2517
|| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 ATCGCTCAAGCGAAATAACCTAGATCACACCAGAAATCCAAACACATACAAAGGCGATAT 151
Query 2518 TACCTCATTCGTGAGATTATTGATAGAGGTGATGTGAAGACTAGAAGAGTTTCAACGGAT 2577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||
Sbjct 150 CACCTCATTCGTGAGATTATTGATAGAGGTGATGTGAAGATTAGCAGAGTTCCAACGGAT 91
Query 2578 GCAAATGTTGCTGATCCTCTT-ACTAAACCTCTTCCGCAGCCGAAGCATGAGAGTCATAC 2636
|||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 90 GCAAATGTTGCTGATC-TATTTACTAAACCTCTTCCGCAGCCTAAGCATGAGAGTCATAC 32
Query 2637 TGCTGCGATTGGCATTAGATTTATAAAGATG 2667
|||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 31 TGCTGCGATTGGTATTAGATTTATAAAGATG 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 100596337045
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5