BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G33035.1
Length=3435
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg485271 jgi|Araly1|485271|fgenesh2_kg.5__1263__AT3G33035.1 4041 0.0
Ahg484607 jgi|Araly1|484607|fgenesh2_kg.5__599__AT3G33035.1 4041 0.0
> Ahg485271 jgi|Araly1|485271|fgenesh2_kg.5__1263__AT3G33035.1
Length=3331
Score = 4041 bits (2188), Expect = 0.0
Identities = 3058/3455 (89%), Gaps = 152/3455 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 9 GGGATCCGTACATACTAGCCTCTCAAGCAAAACAAGT-TTTTAACCTAAGAGAAGATGAC 67
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||
Sbjct 3331 GGGATCCGTATATACTAGCCTCTCAAGCAAAACAAGTGTTTT-ACCTAAGGGAAGATGAC 3273
Query 68 TCAACACCTTGGTATGTTGCATTGAGAGGAT-CTTCAAGAAGATTCTGTCAGAAAGAGTT 126
||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3272 TCATCACCTTGGTATGTTGCATTGAGAGG-TCCTTCAAGAAGATTCAGTCAGAAAGAGTT 3214
Query 127 TGTATATTCAATTGCAGCCATTGGCACATTCCCACCAAATGTTGACATAGACGCTGACTT 186
| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||
Sbjct 3213 TCTAGATTCAGTTGCAGACATTGGCACATTGCCACCAAATATTGACATCGACGTTGACTT 3154
Query 187 GGATGACGCTGAGAATGAGAGGA-CTGATTGTGAAGGAATATATGTTTGTGAAATGTAGt 245
|||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3153 GGATGAAGCTGAGAATGAGA-GATCTGATTGTGAAGGGATATATGTTTGTGAAATGTAG- 3096
Query 246 ttttttttGTTTCATTTTCATTCCTTGTTGTCTTCTCTATGTTTTATGTCTG-TTTCCCA 304
|||||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||| | ||||||| ||| |||
Sbjct 3095 TTTTTTTT-TATCATTTTCATTCTTTGTTGCCTGCTCTATGTCTGATGTCTGATTT-CCA 3038
Query 305 CAGTGTGTTCAATGTCTTATCTGCATCCG-GTGTACTTAACCCTTTAC-TCTTTCATTTT 362
|||||||| ||||||||| | || | | |||||||| |||| | |||||||||||
Sbjct 3037 TAGTGTGTTTGATGTCTTAT-T--TTCAGTATATACTTAACTCTTT-CTTCTTTCATTTT 2982
Query 363 TCTCAGGTGATTTAAGATGGGACAACAGAAGAAAAGGCGAGGTAGAAGTAAC-aaaaaaa 421
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||
Sbjct 2981 TCTCAGGTGATTTAAAATGGGACAACAGAAGAAAAAGCGATGCAGAAGTAACAAAAAAAA 2922
Query 422 GGTCAATGCAAAGAATGTCAATGATGAGGTCGAGTATATTGGTACAATTGAACCACAAGT 481
|| || |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 2921 GG--AA-GCAAAGCATGCCAATGAGGAGGTCGAGTATATGGGTACAGTTGAACCACAAGT 2865
Query 482 CAATGATGA-G--GAACATGTAGAACCAGCTGAAGTTCAAGTATCAGATGCAAATAAGGT 538
||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |
Sbjct 2864 CAATGATGAGGTCGAACATGTAGCACCAGCTGAAGTTCAAGTAGCAGATTCAAGT-A--- 2809
Query 539 GAATGGTGAAGATCATTTGGAACCAGATCAAGTAGCAGATCCAGATCAGGTGGTTGATGG 598
| | | | |||||| ||| | || || || || || ||| | | | |
Sbjct 2808 GCA-GATCCAGATCAAGTGG-A--AG----AG--GCTGA---AGTTCA---AG-T-A-GC 2768
Query 599 AGATCCGGATAAGGTCAATGAGGAAGAACCTTAAGGAGAGCTTGTTTTATCTGAGGGTCA 658
|||||| | || |||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |
Sbjct 2767 AGATCC--A-AA--TCAA-GTGGAAGAGGCTGAAGGAGAGCTTGTATTATCTGAGGATTA 2714
Query 659 TGAATATGTTGAGCCAAAGCGTAAGAGACATCGAGGACCAACTAGGCTGAAGGATATTGC 718
||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 TGATTGTGCTGATCCAAAGCGTAAGAGACATCGAGGACCAACTAGGCTGAAGGATATTGC 2654
Query 719 CAAGGATCCAAATGCGAGAGTAAGAGTAGAGTTCAGTAACATGGGAGAGTCTATTGATAA 778
||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2653 CAAGGATCCAAATACCAGAGTAAGAGTAGAGTTCACTAACATGGGAGAGCCTATTGGTAA 2594
Query 779 AGGCTCAGTTAAGCTGGCAGCATTTGTAGGGGCATTAGTAAGAGAACACGTTCCAATCAC 838
|||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2593 AGGCTCAGTTAAACTAGCATCATATGTAGGCGCATTGGTAAGAGAACACGTTCCAATCAC 2534
Query 839 AATTGAACGTTGGACTAAAATTGGTGAAGAACTCAGGACTGTTCTCTGGAAATCTGTTCA 898
|||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2533 AATTGATCGTTGGACAAAAATAGGTGAAGAAGTCAGGACAGTTCTCTGGAAATCTGTCCA 2474
Query 899 GGTAAGCTTTGTGTAAAATTTACAAGTTTATTAGATATT-G-GTGAGTACTTAACTGCTT 956
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||
Sbjct 2473 GGTAAGATTTGTGTAAAATTTACAAGTTTATTATATATTGGTGTGAGTACTTAGCTGTTT 2414
Query 957 TGTTTTTGATTGCAAACAAGGTTTGAACTAGATGAAGAGTACCAAAAGGTTACATTGCTT 1016
||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2413 TGTTTTTGAGTGCAGGCAAGGTTTGAACTAGATGAAGAGTACCAAAAGGTTACAGTGCTT 2354
Query 1017 AGGCGGATGGGATGTTTGTGGAGCTCCTGGAAATCAAGGCCAGTTACAAACATTAGAGAA 1076
| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2353 AAGCAGATGGGATGCTTGTGGAGGTCCTGGAAATCAAGGCAAGTTACAAACATTAGAGAA 2294
Query 1077 GCTAAGACTAACCAAGAGAGGATGAACATGCGACCTAAAAACATTTCTCCTTTTGATTGG 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2293 GCTAAGACTAACCAAGAGAGGATGAACATGCGACCTAAAAATATTTCTCCATTTGATTGG 2234
Query 1137 CGTAAATTTGTGAAGCTCAAAACTAGCCAAGAATTTAAGCTATGCATTTGGAATTTGTAA 1196
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2233 CGTAAATTTGTGAAGCTCAAAACTAGCAAAGAATTTAAGGTATGCATTTGGAATTTGTAA 2174
Query 1197 ATTTATCTATA---TACAATAGAAATTAACATTCATCTGTTAGGTTGTAAGCGATAGCCA 1253
||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2173 ATTTATCTATATCTTTCCTTAGAAATTAACATTCATCTGTTAGGTTGTAAGCGATAGCTA 2114
Query 1254 CAAGGAAAGAAGGCGCAATCAGATTTCACACACTTGTAGTCGCAGGGGAATGGTTAGACT 1313
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 CAAGGAAAGAAGGCGCAATCAGATTCCACACACTTGTAGTCGCAGGGGAATGGTTAGACT 2054
Query 1314 TGCCGAAGACATGGTAAAACTTGTAC-ACACTTATATTGTTCATATTGCTCAGCCTTTTT 1372
|| ||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 AGCAGAAGATATGGTAATA-TTG--CTACACTTATATTGTTCATATTGCTCAGCCTTTTC 1997
Query 1373 CCAAAGTCCAAACACTTATGTATTAACTGAGATCAtttttttGGTTTAGAAAACTGGTAG 1432
||||||||||||||| | || | | | | |||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 1996 CCAAAGTCCAAACAC-T-TG-------T--G-T-A-TTTTTT-GTTTAGAAAACTGCTAG 1952
Query 1433 TGCAGACCCATCTGAAGTGACAAGGCTAAAGGTTTGGGTTAAGTCACGTACTAAGAAAGA 1492
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 TGCAGACCCATCTGAAGTGACACGCCTAAAGGTTTGGGTTAAGTCACGTACTAAGAAAGA 1892
Query 1493 TGGTACACAAGTGAATACGAATGCTGCTGAAAAGATTGTGAGTTattttgttttgt-ttg 1551
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||
Sbjct 1891 TGGTACACCAGTGAATACGAATGCTGCTGAAAAGATTGTGAGTTATTTTG-CTTCTAATG 1833
Query 1552 atttgcattttggcattttgAATCACACTTGATATTTTAAAATGTATCTTATGAGTTTCA 1611
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1832 ATTTGCATTTTGGCA-TTTGAATCACACTTGATATTTTAATATGTATCTTATGAGTTTCA 1774
Query 1612 GAAAAAGGCAGAAGAGATTGTTAACAATGAT-A---ATC-CAT-CAACAAATGAAGCACA 1665
|||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 1773 GAAAAAGGCAGAGGAGATTGTTAACAGTGATAATCCATCACATGCAACAAATGAAGCACA 1714
Query 1666 AGATTCACTACGGTAACTGTTAGGGCCTGACAATCCTGGTAGGTAGAATGAGAGCAATGG 1725
|||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 1713 AGATTCACTAAGCCAACTGTTAGGGCCTGACAATCC---T-GGTAGAATGAGAGCAATGG 1658
Query 1726 GTCGCAATATGAATAAGACCAAGTTAGCTTGTTTCCAAGTGAAGCACAAGTGTATGACTG 1785
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1657 GTCGCAATATGAATAAGACCAAGTTAGCTTGTTTCCAAGTGAAGCACAAGTGTATGGCTG 1598
Query 1786 AAATGCTAGAGAATCAGCTTCGTCTACAAAAGAAGGTCAATGAGCTACAAGAAATAATTG 1845
|||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1597 AAATGCAAGAGAATCAGCTTCATCTCCAGAAGAAGGTCAATGAGCTACAAGATGTAATTG 1538
Query 1846 AGAAAATGAAGAACCAGGTTAGTGCACTTATCTATTTATATATAAAGACTTACAGCTCAA 1905
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |
Sbjct 1537 AGAAAATGAAGAACCAGGTTAGTGCACTTAACTATTTATATAT----A---ACA--T--- 1490
Query 1906 TTAGTACATAAGATTTGACTTTGTTTTTCTCTTTTTGTAACAGATACAATCACCTGAAGT 1965
|| | || || |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1489 TT-G-AC-------TT--CTTT-TCTTT-T-TTTTTGTAACAGAGACAATCACCTGAAGT 1444
Query 1966 AGGTGAAAACTCAGCTTCAAGAGTAAGTCACTCATATCATATGCTTTGATTTGCTCTAAC 2025
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1443 AGGTGAAAACTCAGCTGCAAGAGTAAGTCACTCATATCAGATGCTTTGATTTATTCTAAC 1384
Query 2026 AGATACACTCACTTAATACTTTGTCTATCT-TTTTCTTTTACAGAGTGTGAACAAAAGGA 2084
||||||| |||| | ||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1383 AGATACAATCACCTGATATTTTGTCTACCTATTGT-TTTTACAGAGTGTGAACAAAA-AA 1326
Query 2085 -CACAACCAAAATGTGTCTTACTTGATTGGGCTGGTTCGT-ATGCAAAAATTGCTGAGGG 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||
Sbjct 1325 TCACAACCAAAATGTGTCTTACTTGATTGGGCTGGTTC-TAATGTAAAAGTTGCTGAGGG 1267
Query 2143 ATGTATTATTCCTTATGATCTGGGTGAATTAGTGAATGACTGTCGCTTAGGTCCTACCGA 2202
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||
Sbjct 1266 ATGTATTATTTCTTCTGATCCGGGTGAATTAGTTAATGACTGTCCCTTAGGCCCTACGGA 1207
Query 2203 TGTTAAAGTCTTGATTGACACTGATATTGAACCAGAAGCATTCCTTTGGAGACCTGCGGC 2262
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 TGTTAAAGTCTTGATTGACACTGCTATTGAACCAGAAGCATTCCTTTGGAGACCTGCGGC 1147
Query 2263 TAACATGTTCACCATTGAGAAAGCCGTTGAACATATGATTGCATGGCCTGCTGCTATGTG 2322
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 TAACATGTTCACCATTGAGAAAGCTGTTGGACATATGATTGCATGGCCTGCTGCTATGTG 1087
Query 2323 TGTTAGCCTAGAAGAGGATCTCCAATAAGAAGACATTGTAGGCCAGGTAAAGTTTATTAT 2382
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1086 TGTTAACCTAGAAGAGGATCTCCAACAAGAAGACATTGAAGCCCAGGTAAAGTTTATTAT 1027
Query 2383 TCAGTCTCATTCTCATATATAGAGTAATGATCTTCTATTAACATAATGTATTTCCGGGTT 2442
||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1026 TCATTCTCATACTCATATATAGAATAATGATCTTCTATTAACACAATGTATTTTTGGGTT 967
Query 2443 TCAATATTTTTGACAGGGACCAAAT-AACAAATGCCAGCTTTTTGATTTGTCTTCAAATG 2501
||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | || | |||||||||||| |||
Sbjct 966 TCAATGTTTTTGATAGGGACCAAGTGAACAAATGCAAACTACTGGATTTGTCTTCAGATG 907
Query 2502 ATGTTGTTGTTGCAGAAGGACGTTGGCAGACACAAGAACAAAATGCATTAGTCAATGGGA 2561
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 906 AGGTTGTTGTTGCAGAAGGACGTTGGCAGACACAAGAACACAACGCATTAGTCAATGGGC 847
Query 2562 ATCCTCTCGGACCTCCAATAGTGAAGATATATGTCGATGCAATTCTTCAACCAGAGACAT 2621
||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 846 TTCCTCTCGGGCCAGCAGCAGTAAAGATATTTGTCGATGCAGTTCTTCAACCAGAGACTT 787
Query 2622 TTATATGGAGGTCAACGATGGATGTGACTTACCTTGAGGACTGTTTAATGACTTACCTTT 2681
||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 786 TTATATGGAGGCCAACGATGGATGTGACATACTTTGAGGACTGTTTAATGTCTTATGTAG 727
Query 2682 CCATGGCCTGTCAACAAAGTTATCTTTGAAAACCCTGCAGATGCAACATGCCACATATCT 2741
| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||
Sbjct 726 C-ATGGCCTGTCCACAAAGTGATCTTTGAAAACCATACAGATGCAACATGTCAGAAATCT 668
Query 2742 CCACTTCACAATTCTGCGGCAAGAGGAAAATCACCATTGGAAGCAGTAGCATCGGTAGGC 2801
|||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 667 CCACTTCAGACTTCTGCTGCAAGAGGAAAATCACCATTGGAAGCAGCAGCATCAGTAGGA 608
Query 2802 AAGTCGgcagcatcagtaggcaagtcagcagcatcagtaggcaagtcagcaggatcagag 2861
|| || |||||||||| ||| || ||||||| | || ||||||| |||
Sbjct 607 AAATCAGCAGCATCAGCAGGGAA---AGCAGCA---G----CA--TCAGCAG---CAG-- 565
Query 2862 aaagcagcagcgtccaggaaagcagcagcaTCAGGTTCACAAACTGCAACAGTAGGTTAT 2921
|| ||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 564 ----CATCAG-G----G-AAAGCAGCAGGATCAGGTTCACAAACTGCAGCAGCAGGTTAT 515
Query 2922 AAGCCATCCCCTGAGATATCTACAGCAAAAAGTACAAAATCCGTTGCAACAGTTTCAAAG 2981
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 AAGCCATCCCTTGAGATATCTACAACAAAAGGTACAAAATCCGTTGCAACAGTTTCAAAA 455
Query 2982 GG-CATAGCTAAGAAGTCCACAGCTACAGGTTCAAAGTCTCTTGTCAAGAAAATTCAACT 3040
| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||
Sbjct 454 GCTC-TAGCTGAGAAGTCCACAGCTACAGGTTCAAAGTCTTTTGTCAAGAAAAGTCAGCT 396
Query 3041 GCTGGATTCACAACTCCCTCTGAGAAGATCTCCGGTATTTTGTTTGTTGTTATTACGTAT 3100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||
Sbjct 395 GCTGGATTCACAACTCCCTCTGAGAAGATCTCCGGTATTTTGTTTATTGTTTTTACCTAT 336
Query 3101 TGAATCTGATTATTTTTCTACATACATTAAAACTGGTTTATATTGTAACATGGCAGCGTA 3160
|||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 335 TGAATCTGGTTATTTTTCTACATGCATTAAACCTGGTTTATATTGTAACATTGCAGCGTA 276
Query 3161 AAGGTGTAGCTGAAGTTATCAAGGCCAATCAGAAGTGTAAGTTAATGGATATCAGTGGAA 3220
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 275 AAAGTGTAGCTGAAGTTATCAAGGCCAATCAGAAGTGTAAGTTAATGGATATTAGTGGAA 216
Query 3221 GGAAGCAGGTGGTTGCTAAAGGACGTGTGCATCCAGTCGACCCAGACCAAAAGGTACACA 3280
|||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 215 AGAAGCAGGTGGTTGCTGAAGGACGTGTGCATTCAATCGACCCAGACCTAAAGGTACACC 156
Query 3281 ATGTTCGCTTGGGAGCTAATGTAGCTAGAGTTTGGGTGGATATAGTGAAAATAGATGATG 3340
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 ATGTTCGCTTGGGGGCTAATGCAGCTAGAGTTTGGGTGGATATAGTGAAAATAGATGATG 96
Query 3341 CAACAGTTTGGAGGGCATCAGATGAAATCGATTATATGAGAGATTCACTTGGTTCATCTA 3400
|| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 95 CAGCAGTTTGGAGGCCATCAGATGAAATCGAGTATATGAGAGATTCACTTGGTTCAGCTA 36
Query 3401 TTGCATGGCCAATGGATAAGTTTGTCATCTATTGA 3435
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 35 TTGCATGGCCAATGGATAAGTTGGTCATCTATTGA 1
> Ahg484607 jgi|Araly1|484607|fgenesh2_kg.5__599__AT3G33035.1
Length=3331
Score = 4041 bits (2188), Expect = 0.0
Identities = 3058/3455 (89%), Gaps = 152/3455 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 9 GGGATCCGTACATACTAGCCTCTCAAGCAAAACAAGT-TTTTAACCTAAGAGAAGATGAC 67
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||
Sbjct 3331 GGGATCCGTATATACTAGCCTCTCAAGCAAAACAAGTGTTTT-ACCTAAGGGAAGATGAC 3273
Query 68 TCAACACCTTGGTATGTTGCATTGAGAGGAT-CTTCAAGAAGATTCTGTCAGAAAGAGTT 126
||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3272 TCATCACCTTGGTATGTTGCATTGAGAGG-TCCTTCAAGAAGATTCAGTCAGAAAGAGTT 3214
Query 127 TGTATATTCAATTGCAGCCATTGGCACATTCCCACCAAATGTTGACATAGACGCTGACTT 186
| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||
Sbjct 3213 TCTAGATTCAGTTGCAGACATTGGCACATTGCCACCAAATATTGACATCGACGTTGACTT 3154
Query 187 GGATGACGCTGAGAATGAGAGGA-CTGATTGTGAAGGAATATATGTTTGTGAAATGTAGt 245
|||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3153 GGATGAAGCTGAGAATGAGA-GATCTGATTGTGAAGGGATATATGTTTGTGAAATGTAG- 3096
Query 246 ttttttttGTTTCATTTTCATTCCTTGTTGTCTTCTCTATGTTTTATGTCTG-TTTCCCA 304
|||||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||| | ||||||| ||| |||
Sbjct 3095 TTTTTTTT-TATCATTTTCATTCTTTGTTGCCTGCTCTATGTCTGATGTCTGATTT-CCA 3038
Query 305 CAGTGTGTTCAATGTCTTATCTGCATCCG-GTGTACTTAACCCTTTAC-TCTTTCATTTT 362
|||||||| ||||||||| | || | | |||||||| |||| | |||||||||||
Sbjct 3037 TAGTGTGTTTGATGTCTTAT-T--TTCAGTATATACTTAACTCTTT-CTTCTTTCATTTT 2982
Query 363 TCTCAGGTGATTTAAGATGGGACAACAGAAGAAAAGGCGAGGTAGAAGTAAC-aaaaaaa 421
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||
Sbjct 2981 TCTCAGGTGATTTAAAATGGGACAACAGAAGAAAAAGCGATGCAGAAGTAACAAAAAAAA 2922
Query 422 GGTCAATGCAAAGAATGTCAATGATGAGGTCGAGTATATTGGTACAATTGAACCACAAGT 481
|| || |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 2921 GG--AA-GCAAAGCATGCCAATGAGGAGGTCGAGTATATGGGTACAGTTGAACCACAAGT 2865
Query 482 CAATGATGA-G--GAACATGTAGAACCAGCTGAAGTTCAAGTATCAGATGCAAATAAGGT 538
||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |
Sbjct 2864 CAATGATGAGGTCGAACATGTAGCACCAGCTGAAGTTCAAGTAGCAGATTCAAGT-A--- 2809
Query 539 GAATGGTGAAGATCATTTGGAACCAGATCAAGTAGCAGATCCAGATCAGGTGGTTGATGG 598
| | | | |||||| ||| | || || || || || ||| | | | |
Sbjct 2808 GCA-GATCCAGATCAAGTGG-A--AG----AG--GCTGA---AGTTCA---AG-T-A-GC 2768
Query 599 AGATCCGGATAAGGTCAATGAGGAAGAACCTTAAGGAGAGCTTGTTTTATCTGAGGGTCA 658
|||||| | || |||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |
Sbjct 2767 AGATCC--A-AA--TCAA-GTGGAAGAGGCTGAAGGAGAGCTTGTATTATCTGAGGATTA 2714
Query 659 TGAATATGTTGAGCCAAAGCGTAAGAGACATCGAGGACCAACTAGGCTGAAGGATATTGC 718
||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 TGATTGTGCTGATCCAAAGCGTAAGAGACATCGAGGACCAACTAGGCTGAAGGATATTGC 2654
Query 719 CAAGGATCCAAATGCGAGAGTAAGAGTAGAGTTCAGTAACATGGGAGAGTCTATTGATAA 778
||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2653 CAAGGATCCAAATACCAGAGTAAGAGTAGAGTTCACTAACATGGGAGAGCCTATTGGTAA 2594
Query 779 AGGCTCAGTTAAGCTGGCAGCATTTGTAGGGGCATTAGTAAGAGAACACGTTCCAATCAC 838
|||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2593 AGGCTCAGTTAAACTAGCATCATATGTAGGCGCATTGGTAAGAGAACACGTTCCAATCAC 2534
Query 839 AATTGAACGTTGGACTAAAATTGGTGAAGAACTCAGGACTGTTCTCTGGAAATCTGTTCA 898
|||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2533 AATTGATCGTTGGACAAAAATAGGTGAAGAAGTCAGGACAGTTCTCTGGAAATCTGTCCA 2474
Query 899 GGTAAGCTTTGTGTAAAATTTACAAGTTTATTAGATATT-G-GTGAGTACTTAACTGCTT 956
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||
Sbjct 2473 GGTAAGATTTGTGTAAAATTTACAAGTTTATTATATATTGGTGTGAGTACTTAGCTGTTT 2414
Query 957 TGTTTTTGATTGCAAACAAGGTTTGAACTAGATGAAGAGTACCAAAAGGTTACATTGCTT 1016
||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2413 TGTTTTTGAGTGCAGGCAAGGTTTGAACTAGATGAAGAGTACCAAAAGGTTACAGTGCTT 2354
Query 1017 AGGCGGATGGGATGTTTGTGGAGCTCCTGGAAATCAAGGCCAGTTACAAACATTAGAGAA 1076
| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2353 AAGCAGATGGGATGCTTGTGGAGGTCCTGGAAATCAAGGCAAGTTACAAACATTAGAGAA 2294
Query 1077 GCTAAGACTAACCAAGAGAGGATGAACATGCGACCTAAAAACATTTCTCCTTTTGATTGG 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2293 GCTAAGACTAACCAAGAGAGGATGAACATGCGACCTAAAAATATTTCTCCATTTGATTGG 2234
Query 1137 CGTAAATTTGTGAAGCTCAAAACTAGCCAAGAATTTAAGCTATGCATTTGGAATTTGTAA 1196
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2233 CGTAAATTTGTGAAGCTCAAAACTAGCAAAGAATTTAAGGTATGCATTTGGAATTTGTAA 2174
Query 1197 ATTTATCTATA---TACAATAGAAATTAACATTCATCTGTTAGGTTGTAAGCGATAGCCA 1253
||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2173 ATTTATCTATATCTTTCCTTAGAAATTAACATTCATCTGTTAGGTTGTAAGCGATAGCTA 2114
Query 1254 CAAGGAAAGAAGGCGCAATCAGATTTCACACACTTGTAGTCGCAGGGGAATGGTTAGACT 1313
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 CAAGGAAAGAAGGCGCAATCAGATTCCACACACTTGTAGTCGCAGGGGAATGGTTAGACT 2054
Query 1314 TGCCGAAGACATGGTAAAACTTGTAC-ACACTTATATTGTTCATATTGCTCAGCCTTTTT 1372
|| ||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 AGCAGAAGATATGGTAATA-TTG--CTACACTTATATTGTTCATATTGCTCAGCCTTTTC 1997
Query 1373 CCAAAGTCCAAACACTTATGTATTAACTGAGATCAtttttttGGTTTAGAAAACTGGTAG 1432
||||||||||||||| | || | | | | |||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 1996 CCAAAGTCCAAACAC-T-TG-------T--G-T-A-TTTTTT-GTTTAGAAAACTGCTAG 1952
Query 1433 TGCAGACCCATCTGAAGTGACAAGGCTAAAGGTTTGGGTTAAGTCACGTACTAAGAAAGA 1492
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 TGCAGACCCATCTGAAGTGACACGCCTAAAGGTTTGGGTTAAGTCACGTACTAAGAAAGA 1892
Query 1493 TGGTACACAAGTGAATACGAATGCTGCTGAAAAGATTGTGAGTTattttgttttgt-ttg 1551
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||
Sbjct 1891 TGGTACACCAGTGAATACGAATGCTGCTGAAAAGATTGTGAGTTATTTTG-CTTCTAATG 1833
Query 1552 atttgcattttggcattttgAATCACACTTGATATTTTAAAATGTATCTTATGAGTTTCA 1611
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1832 ATTTGCATTTTGGCA-TTTGAATCACACTTGATATTTTAATATGTATCTTATGAGTTTCA 1774
Query 1612 GAAAAAGGCAGAAGAGATTGTTAACAATGAT-A---ATC-CAT-CAACAAATGAAGCACA 1665
|||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 1773 GAAAAAGGCAGAGGAGATTGTTAACAGTGATAATCCATCACATGCAACAAATGAAGCACA 1714
Query 1666 AGATTCACTACGGTAACTGTTAGGGCCTGACAATCCTGGTAGGTAGAATGAGAGCAATGG 1725
|||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 1713 AGATTCACTAAGCCAACTGTTAGGGCCTGACAATCC---T-GGTAGAATGAGAGCAATGG 1658
Query 1726 GTCGCAATATGAATAAGACCAAGTTAGCTTGTTTCCAAGTGAAGCACAAGTGTATGACTG 1785
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1657 GTCGCAATATGAATAAGACCAAGTTAGCTTGTTTCCAAGTGAAGCACAAGTGTATGGCTG 1598
Query 1786 AAATGCTAGAGAATCAGCTTCGTCTACAAAAGAAGGTCAATGAGCTACAAGAAATAATTG 1845
|||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1597 AAATGCAAGAGAATCAGCTTCATCTCCAGAAGAAGGTCAATGAGCTACAAGATGTAATTG 1538
Query 1846 AGAAAATGAAGAACCAGGTTAGTGCACTTATCTATTTATATATAAAGACTTACAGCTCAA 1905
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |
Sbjct 1537 AGAAAATGAAGAACCAGGTTAGTGCACTTAACTATTTATATAT----A---ACA--T--- 1490
Query 1906 TTAGTACATAAGATTTGACTTTGTTTTTCTCTTTTTGTAACAGATACAATCACCTGAAGT 1965
|| | || || |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1489 TT-G-AC-------TT--CTTT-TCTTT-T-TTTTTGTAACAGAGACAATCACCTGAAGT 1444
Query 1966 AGGTGAAAACTCAGCTTCAAGAGTAAGTCACTCATATCATATGCTTTGATTTGCTCTAAC 2025
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1443 AGGTGAAAACTCAGCTGCAAGAGTAAGTCACTCATATCAGATGCTTTGATTTATTCTAAC 1384
Query 2026 AGATACACTCACTTAATACTTTGTCTATCT-TTTTCTTTTACAGAGTGTGAACAAAAGGA 2084
||||||| |||| | ||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1383 AGATACAATCACCTGATATTTTGTCTACCTATTGT-TTTTACAGAGTGTGAACAAAA-AA 1326
Query 2085 -CACAACCAAAATGTGTCTTACTTGATTGGGCTGGTTCGT-ATGCAAAAATTGCTGAGGG 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||
Sbjct 1325 TCACAACCAAAATGTGTCTTACTTGATTGGGCTGGTTC-TAATGTAAAAGTTGCTGAGGG 1267
Query 2143 ATGTATTATTCCTTATGATCTGGGTGAATTAGTGAATGACTGTCGCTTAGGTCCTACCGA 2202
|||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||
Sbjct 1266 ATGTATTATTTCTTCTGATCCGGGTGAATTAGTTAATGACTGTCCCTTAGGCCCTACGGA 1207
Query 2203 TGTTAAAGTCTTGATTGACACTGATATTGAACCAGAAGCATTCCTTTGGAGACCTGCGGC 2262
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 TGTTAAAGTCTTGATTGACACTGCTATTGAACCAGAAGCATTCCTTTGGAGACCTGCGGC 1147
Query 2263 TAACATGTTCACCATTGAGAAAGCCGTTGAACATATGATTGCATGGCCTGCTGCTATGTG 2322
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 TAACATGTTCACCATTGAGAAAGCTGTTGGACATATGATTGCATGGCCTGCTGCTATGTG 1087
Query 2323 TGTTAGCCTAGAAGAGGATCTCCAATAAGAAGACATTGTAGGCCAGGTAAAGTTTATTAT 2382
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1086 TGTTAACCTAGAAGAGGATCTCCAACAAGAAGACATTGAAGCCCAGGTAAAGTTTATTAT 1027
Query 2383 TCAGTCTCATTCTCATATATAGAGTAATGATCTTCTATTAACATAATGTATTTCCGGGTT 2442
||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1026 TCATTCTCATACTCATATATAGAATAATGATCTTCTATTAACACAATGTATTTTTGGGTT 967
Query 2443 TCAATATTTTTGACAGGGACCAAAT-AACAAATGCCAGCTTTTTGATTTGTCTTCAAATG 2501
||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | || | |||||||||||| |||
Sbjct 966 TCAATGTTTTTGATAGGGACCAAGTGAACAAATGCAAACTACTGGATTTGTCTTCAGATG 907
Query 2502 ATGTTGTTGTTGCAGAAGGACGTTGGCAGACACAAGAACAAAATGCATTAGTCAATGGGA 2561
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 906 AGGTTGTTGTTGCAGAAGGACGTTGGCAGACACAAGAACACAACGCATTAGTCAATGGGC 847
Query 2562 ATCCTCTCGGACCTCCAATAGTGAAGATATATGTCGATGCAATTCTTCAACCAGAGACAT 2621
||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 846 TTCCTCTCGGGCCAGCAGCAGTAAAGATATTTGTCGATGCAGTTCTTCAACCAGAGACTT 787
Query 2622 TTATATGGAGGTCAACGATGGATGTGACTTACCTTGAGGACTGTTTAATGACTTACCTTT 2681
||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 786 TTATATGGAGGCCAACGATGGATGTGACATACTTTGAGGACTGTTTAATGTCTTATGTAG 727
Query 2682 CCATGGCCTGTCAACAAAGTTATCTTTGAAAACCCTGCAGATGCAACATGCCACATATCT 2741
| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||
Sbjct 726 C-ATGGCCTGTCCACAAAGTGATCTTTGAAAACCATACAGATGCAACATGTCAGAAATCT 668
Query 2742 CCACTTCACAATTCTGCGGCAAGAGGAAAATCACCATTGGAAGCAGTAGCATCGGTAGGC 2801
|||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 667 CCACTTCAGACTTCTGCTGCAAGAGGAAAATCACCATTGGAAGCAGCAGCATCAGTAGGA 608
Query 2802 AAGTCGgcagcatcagtaggcaagtcagcagcatcagtaggcaagtcagcaggatcagag 2861
|| || |||||||||| ||| || ||||||| | || ||||||| |||
Sbjct 607 AAATCAGCAGCATCAGCAGGGAA---AGCAGCA---G----CA--TCAGCAG---CAG-- 565
Query 2862 aaagcagcagcgtccaggaaagcagcagcaTCAGGTTCACAAACTGCAACAGTAGGTTAT 2921
|| ||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 564 ----CATCAG-G----G-AAAGCAGCAGGATCAGGTTCACAAACTGCAGCAGCAGGTTAT 515
Query 2922 AAGCCATCCCCTGAGATATCTACAGCAAAAAGTACAAAATCCGTTGCAACAGTTTCAAAG 2981
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 AAGCCATCCCTTGAGATATCTACAACAAAAGGTACAAAATCCGTTGCAACAGTTTCAAAA 455
Query 2982 GG-CATAGCTAAGAAGTCCACAGCTACAGGTTCAAAGTCTCTTGTCAAGAAAATTCAACT 3040
| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||
Sbjct 454 GCTC-TAGCTGAGAAGTCCACAGCTACAGGTTCAAAGTCTTTTGTCAAGAAAAGTCAGCT 396
Query 3041 GCTGGATTCACAACTCCCTCTGAGAAGATCTCCGGTATTTTGTTTGTTGTTATTACGTAT 3100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||
Sbjct 395 GCTGGATTCACAACTCCCTCTGAGAAGATCTCCGGTATTTTGTTTATTGTTTTTACCTAT 336
Query 3101 TGAATCTGATTATTTTTCTACATACATTAAAACTGGTTTATATTGTAACATGGCAGCGTA 3160
|||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 335 TGAATCTGGTTATTTTTCTACATGCATTAAACCTGGTTTATATTGTAACATTGCAGCGTA 276
Query 3161 AAGGTGTAGCTGAAGTTATCAAGGCCAATCAGAAGTGTAAGTTAATGGATATCAGTGGAA 3220
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 275 AAAGTGTAGCTGAAGTTATCAAGGCCAATCAGAAGTGTAAGTTAATGGATATTAGTGGAA 216
Query 3221 GGAAGCAGGTGGTTGCTAAAGGACGTGTGCATCCAGTCGACCCAGACCAAAAGGTACACA 3280
|||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 215 AGAAGCAGGTGGTTGCTGAAGGACGTGTGCATTCAATCGACCCAGACCTAAAGGTACACC 156
Query 3281 ATGTTCGCTTGGGAGCTAATGTAGCTAGAGTTTGGGTGGATATAGTGAAAATAGATGATG 3340
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 ATGTTCGCTTGGGGGCTAATGCAGCTAGAGTTTGGGTGGATATAGTGAAAATAGATGATG 96
Query 3341 CAACAGTTTGGAGGGCATCAGATGAAATCGATTATATGAGAGATTCACTTGGTTCATCTA 3400
|| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 95 CAGCAGTTTGGAGGCCATCAGATGAAATCGAGTATATGAGAGATTCACTTGGTTCAGCTA 36
Query 3401 TTGCATGGCCAATGGATAAGTTTGTCATCTATTGA 3435
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 35 TTGCATGGCCAATGGATAAGTTGGTCATCTATTGA 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 129700208784
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5