BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G41768.1
Length=1808
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg932010 jgi|Araly1|932010|scaffold_304467.1 2612 0.0
Ahg932004 jgi|Araly1|932004|scaffold_304461.1 2612 0.0
Ahg931989 jgi|Araly1|931989|scaffold_304446.1 2604 0.0
Ahg931996 jgi|Araly1|931996|scaffold_304453.1 2172 0.0
Ahg931998 jgi|Araly1|931998|scaffold_304455.1 1637 0.0
Ahg931990 jgi|Araly1|931990|scaffold_304447.1 968 0.0
> Ahg932010 jgi|Araly1|932010|scaffold_304467.1
Length=2881
Score = 2612 bits (1414), Expect = 0.0
Identities = 1435/1445 (99%), Gaps = 2/1445 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT 243
Query 61 AAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 AAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTG 303
Query 121 TTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 TTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAA 363
Query 181 CCCCGACTTATGGAAGGGACGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGTT 240
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 CCCCGACTTCTGGAAGGGGTGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGTT 423
Query 241 GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTCTGTGCTGGCGACGCATCAT 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 424 GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCAT 483
Query 301 TCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 TCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGG 543
Query 361 GTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 GTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCA 603
Query 421 AGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 AGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT 663
Query 481 AACAATACCGGGCTCTT-TCGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAA 539
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AACAATACCGGGCTCTTAT-GAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAA 722
Query 540 CGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 CGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG 782
Query 600 CGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCCG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 CGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCCG 842
Query 660 GTCCGCCTTTGGTGTGCATTGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGCGATACGCTCCTGGTCT 719
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 843 GTCCGCCTTTGGTGTGCACCGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGTGATACGCTCCTGGTCT 902
Query 720 TAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 TAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCA 962
Query 780 AGCCTACGCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGT 839
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCCTACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGT 1022
Query 840 TGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAG 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAG 1082
Query 900 TCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 TCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGA 1142
Query 960 TGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 TGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGT 1202
Query 1020 CTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCTGGC 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 CTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCTGGC 1262
Query 1080 ACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACT 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 ACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACT 1322
Query 1140 TAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAAC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 TAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAAC 1382
Query 1200 ACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 ACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTG 1442
Query 1260 ATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443 ATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATT 1502
Query 1320 CCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGCC 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503 CCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGCC 1562
Query 1380 GGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTG 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 GGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTG 1622
Query 1440 TGATG 1444
|||||
Sbjct 1623 TGATG 1627
> Ahg932004 jgi|Araly1|932004|scaffold_304461.1
Length=2848
Score = 2612 bits (1414), Expect = 0.0
Identities = 1435/1445 (99%), Gaps = 2/1445 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151 TACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT 210
Query 61 AAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 AAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTG 270
Query 121 TTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 TTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAA 330
Query 181 CCCCGACTTATGGAAGGGACGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGTT 240
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 CCCCGACTTCTGGAAGGGGTGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGTT 390
Query 241 GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTCTGTGCTGGCGACGCATCAT 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 391 GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCAT 450
Query 301 TCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 TCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGG 510
Query 361 GTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 GTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCA 570
Query 421 AGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 AGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT 630
Query 481 AACAATACCGGGCTCTT-TCGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAA 539
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 AACAATACCGGGCTCTTAT-GAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAA 689
Query 540 CGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 690 CGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG 749
Query 600 CGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCCG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 750 CGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCCG 809
Query 660 GTCCGCCTTTGGTGTGCATTGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGCGATACGCTCCTGGTCT 719
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 810 GTCCGCCTTTGGTGTGCACCGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGTGATACGCTCCTGGTCT 869
Query 720 TAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 TAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCA 929
Query 780 AGCCTACGCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGT 839
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 AGCCTACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGT 989
Query 840 TGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAG 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 TGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAG 1049
Query 900 TCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 TCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGA 1109
Query 960 TGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGT 1169
Query 1020 CTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCTGGC 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 CTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCTGGC 1229
Query 1080 ACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACT 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230 ACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACT 1289
Query 1140 TAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAAC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 TAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAAC 1349
Query 1200 ACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 ACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTG 1409
Query 1260 ATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410 ATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATT 1469
Query 1320 CCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGCC 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470 CCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGCC 1529
Query 1380 GGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTG 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1530 GGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTG 1589
Query 1440 TGATG 1444
|||||
Sbjct 1590 TGATG 1594
> Ahg931989 jgi|Araly1|931989|scaffold_304446.1
Length=1623
Score = 2604 bits (1410), Expect = 0.0
Identities = 1431/1441 (99%), Gaps = 2/1441 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT 243
Query 61 AAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 AAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTG 303
Query 121 TTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 TTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAA 363
Query 181 CCCCGACTTATGGAAGGGACGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGTT 240
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 CCCCGACTTCTGGAAGGGGTGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGTT 423
Query 241 GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTCTGTGCTGGCGACGCATCAT 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 424 GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCAT 483
Query 301 TCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 TCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGG 543
Query 361 GTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 GTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCA 603
Query 421 AGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 AGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAAT 663
Query 481 AACAATACCGGGCTCTT-TCGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAA 539
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AACAATACCGGGCTCTTAT-GAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAA 722
Query 540 CGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 CGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG 782
Query 600 CGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCCG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 CGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCCG 842
Query 660 GTCCGCCTTTGGTGTGCATTGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGCGATACGCTCCTGGTCT 719
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 843 GTCCGCCTTTGGTGTGCACCGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGTGATACGCTCCTGGTCT 902
Query 720 TAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 TAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCA 962
Query 780 AGCCTACGCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGT 839
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCCTACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGT 1022
Query 840 TGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAG 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAG 1082
Query 900 TCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 TCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGA 1142
Query 960 TGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 TGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGT 1202
Query 1020 CTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCTGGC 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 CTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCTGGC 1262
Query 1080 ACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACT 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 ACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACT 1322
Query 1140 TAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAAC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 TAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAAC 1382
Query 1200 ACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 ACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTG 1442
Query 1260 ATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443 ATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATT 1502
Query 1320 CCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGCC 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503 CCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGCC 1562
Query 1380 GGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTG 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 GGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTG 1622
Query 1440 T 1440
|
Sbjct 1623 T 1623
> Ahg931996 jgi|Araly1|931996|scaffold_304453.1
Length=1202
Score = 2172 bits (1176), Expect = 0.0
Identities = 1196/1205 (99%), Gaps = 4/1205 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 237 CGTTGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTCTGTGCTGGCGACGCA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1202 CGTTGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCA 1143
Query 297 TCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTA 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 TCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTA 1083
Query 357 ACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACA 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 ACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACA 1023
Query 417 TCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAAT 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 TCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAAT 963
Query 477 AAATAACAATACCGGGCTCTT-TCGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCC 535
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AAATAACAATACCGGGCTCTTAT-GAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCC 904
Query 536 TTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCA 595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 TTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCA 844
Query 596 ATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCG 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 ATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCG 784
Query 656 GCCGGTCCGCCTTTGGTGTGCATTGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGCGATACGCTCCTG 715
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 783 GCCGGTCCGCCTTTGGTGTGCACCGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGTGATACGCTCCTG 724
Query 716 GTCTTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAA 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 GTCTTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAA 664
Query 776 AGCAAGCCTACGCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATT 835
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 AGCAAGCCTACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATT 604
Query 836 GTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTC 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 GTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTC 544
Query 896 ATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCA 955
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 ATAGTCAGAGGTG-AATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCA 485
Query 956 AGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCC 1015
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 AGGATGTTTTCA-TAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCC 426
Query 1016 TAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGC 1075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 TAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGC 366
Query 1076 TGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGA 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 TGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGA 306
Query 1136 AACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACT 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 AACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACT 246
Query 1196 CAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTT 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 CAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTT 186
Query 1256 CTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTT 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 CTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTT 126
Query 1316 AATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCAC 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 AATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCAC 66
Query 1376 GGCCGGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGG 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 GGCCGGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGG 6
Query 1436 TCTGT 1440
|||||
Sbjct 5 TCTGT 1
> Ahg931998 jgi|Araly1|931998|scaffold_304455.1
Length=901
Score = 1637 bits (886), Expect = 0.0
Identities = 897/902 (99%), Gaps = 1/902 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 539 ACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATA 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATA 842
Query 599 GCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCC 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCC 782
Query 659 GGTCCGCCTTTGGTGTGCATTGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGCGATACGCTCCTGGTC 718
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 781 GGTCCGCCTTTGGTGTGCACCGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGTGATACGCTCCTGGTC 722
Query 719 TTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGC 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGC 662
Query 779 AAGCCTACGCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTG 838
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAGCCTACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTG 602
Query 839 TTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATA 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATA 542
Query 899 GTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGG 958
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATG-AAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGG 483
Query 959 ATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAG 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 ATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAG 423
Query 1019 TCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCTGG 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 TCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCTGG 363
Query 1079 CACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAAC 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 CACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAAC 303
Query 1139 TTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAA 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 TTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAA 243
Query 1199 CACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 CACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTT 183
Query 1259 GATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAAT 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 GATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAAT 123
Query 1319 TCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGC 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 TCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGC 63
Query 1379 CGGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCT 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 CGGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCT 3
Query 1439 GT 1440
||
Sbjct 2 GT 1
> Ahg931990 jgi|Araly1|931990|scaffold_304447.1
Length=1153
Score = 968 bits (524), Expect = 0.0
Identities = 532/536 (99%), Gaps = 0/536 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 644 TGGGATGGGTCGGCCGGTCCGCCTTTGGTGTGCATTGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGC 703
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGGGATGGGTCGGCCGGTCCGCCTTTGGTGTGCACCGGTCGGCTTGTCCCTTCGGTCGGT 60
Query 704 GATACGCTCCTGGTCTTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAAT 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GATACGCTCCTGGTCTTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGCGCTGTTACTTTGAAGAAAT 120
Query 764 TAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGAT 823
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGAT 180
Query 824 TTCGATCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGG 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTCGATCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGG 240
Query 884 CATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGA 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGA 300
Query 944 AAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGAT 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGAT 360
Query 1004 CAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTT 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCAGCGGATGTTGCTT 420
Query 1064 ATAGGACTCCGCTGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGG 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATAGGACTCCGCTGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGG 480
Query 1124 TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCT 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCT 536
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 67876816590
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5