BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT3G43300.1

Length=5616
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg897087 jgi|Araly1|897087|Al_scaffold_0005_1053                   8709    0.0  


> Ahg897087 jgi|Araly1|897087|Al_scaffold_0005_1053
Length=5277

 Score = 8709 bits (4716),  Expect = 0.0
 Identities = 5107/5294 (96%), Gaps = 34/5294 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGCGGCTGGTGGATTTTTGACTCGAGCATTTGATACGATGCTTAAGGAGTCTGGAGGA  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1     ATGGCGGCTGGTGGATTTTTGACTCGAGCATTTGATACGATGCTTAAGGAGTCCGGAGGA  60

Query  61    AAGAAGTTTCCTGATCTCCAGAAAGCTATTCAAGCTTATCAAGATGGTTCAAAGGTTGTT  120
             ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  61    AAGAAGTATCCTGATCTCCAGAAAGCTATTCAGGCTTATCAAGATGGTTCGAAGGTTGTT  120

Query  121   ACGCAGGCTGCACCCTCGAGCATAGTGGAGAGTTCACAAGCTGAAGGTGGAGGTGAAAAA  180
             || ||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  121   ACACAGGCTGCATCCTCGAGTGTAGACGAGAGTTCACAAGCTGAAGTTGGAGGTGAAAAA  180

Query  181   ACTGGGGTAGAAGCAGATGAACCGCAAAAAGTCACGAGTGCTGAAGTAG-CGCAGCAGGC  239
             ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| | || |||||||
Sbjct  181   ACTGGGGGAGAAACAGATGAACCGAAAAAAGTCCCAAGTTCTGAAGTGGCCG-AGCAGGC  239

Query  240   TAGCCAGTCAAAAAGTGAGACTATAAACGTTTCCTTAGCAAATGCTGGACACACATTAGG  299
             |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240   TAGCCAGTTAAAAAATGAGACTATAAATGTTTCCTTAGCAAATGCTGGACACACATTAGG  299

Query  300   GGGAGCGGAAGTGGAGCTTGTGCTGAAACCTCTACGCCTTGCATTTGAGACAAAGAACTT  359
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300   GGGAGCGGAAGTGGAGCTTGTTCTGAAACCTCTACGCCTTGCATTTGAGACAAAGAACTT  359

Query  360   AAAAATATTTGATGCTGCTTTGGATTGTCTTCATAAACTCATTGCCTATGATCATTTGGA  419
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360   AAAAATATTTGATGCTGCTTTGGATTGTCTTCATAAACTCATTGCCTATGATCATTTGGA  419

Query  420   AGGGGATCCGGGGTTGGATGGTGGAAAAAATTCTGCACCTTTCACCGACATTCTGAACAT  479
              ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420   GGGGGATCCGGGATTGGATGGTGGAAAAAACTCTGCACCTTTCACCGACATTCTGAACAT  479

Query  480   GGTTTGCAGCTGTGTTGATAATTCATCACCAGACAGCACTGTACTCCAAGTACTGAAGGT  539
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  480   GGTTTGCAGCTGTGTTGATAATTCATCACCAGACAGCACTGTACTCCAAGTGCTGAAGGT  539

Query  540   TCTTCTTACAGCTGTTGCTTCAGGAAAGTTCAAAGTGCATGGGGAGCCATTGCTGGGAGT  599
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540   TCTTCTTACAGCTGTTGCTTCAGGAAAGTTCAAAGTGCATGGGGAGCCATTGCTGGGAGT  599

Query  600   TATTAGAGTTTGCTATAACATTGCTCTAAACAGCAAGAGCCCAATTAACCAAGCAACTTC  659
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   TATTCGAGTTTGCTATAACATTGCTCTAAACAGCAAGAGCCCAATTAACCAAGCAACTTC  659

Query  660   TAAAGCAATGCTGACTCAGATGATAAGCATTGTATTCAGGAGAATGGAGACTGACATTGT  719
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   TAAAGCAATGCTGACTCAGATGATAAGCATTGTATTCAGGAGAATGGAGACTGACATTGT  719

Query  720   TTCCGCATCATCCACAGTGTCTCAAGAAGAACATGTTTCAGGTGACACTTCAAGCCCTAA  779
             ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct  720   TTCCGCACCATCCACAGTGTCTCAGGAAGATCATGTTTCAGGCGACAGTTCAAGCCCTAA  779

Query  780   AAATGAAGAAATAACTGCAGCTGACGAAAATGAGAAAGAAATGACCTTAGGAGATGCACT  839
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780   AAATGAAGAAATAACTGCAGCTGACGAAAATGAGAAAGAAATGACCTTAGGAGATGCACT  839

Query  840   CACTCAGGCTAAAGACACAACTCTTGCATCTGTTGAAGAGCTGCATACCCTTGTGGGCGG  899
             ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840   CACTCAGGCAAAAGACACAACTCTTGCTTCTGTTGAAGAGCTGCATACCCTTGTGGGCGG  899

Query  900   TGCTGATATTAAGGGTTTAGAAGCCGCCCTTGACAAAGCTGTGCATCTTGAAGATGGCAA  959
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900   TGCTGATATTAAGGGTTTAGAAGCTGCCCTTGACAAAGCTGTGCATCTTGAAGATGGCAA  959

Query  960   GAAGATAAAACGGGGCATCGAGCTGGAGAGCATGAGTATTGGACAGCGTGATGCATTGCT  1019
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960   GAAGATAAAACGGGGCATCGAGCTGGAGAGCATGAGTATTGGACAGCGTGATGCATTGCT  1019

Query  1020  TGTTTTCCGTACCCTTTGCAAGATGGGTATGAAAGAAGATAGTGATGAAGTCACAACCAA  1079
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1020  TGTTTTCCGTACCCTTTGCAAGATGGGTATGAAAGAAGATAGTGATGAAGTCACAACCAA  1079

Query  1080  GACCCGTATATTGTCTCTTGAGCTTCTTCAGGGTATGTTAGAAGGAGTTAGTCACTCATT  1139
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct  1080  GACCCGTATATTGTCTCTTGAGCTTCTTCAGGGTATGTTAGAAGGAGTTAGTCATTCGTT  1139

Query  1140  TACAAAGAACTTTCACTTTATAGATTCAGTGAAAGCCTACCTCTCATATGCATTGTTGCG  1199
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1140  TACAAAGAACTTTCACTTTATAGATTCAGTGAAAGCCTACCTCTCATATGCATTGTTGCG  1199

Query  1200  GGCGTCGGTTTCTCAGTCTTCTGTCATATTTCAGTATGCATCTGGTATCTTCTCCGTGCT  1259
             ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1200  GGCTTCAGTATCTCAGTCTTCTGTCATATTTCAGTATGCATCTGGTATCTTCTCCGTGCT  1259

Query  1260  TTTGCTGCGGTTCAGAGACAGTTT-AAA---AGTAA--GC----A---T--GGATTGTTA  1304
             ||| |||||||||||||||||||| |||   || ||   |    |   |  |||||||||
Sbjct  1260  TTTACTGCGGTTCAGAGACAGTTTAAAATTTAGAAATTCCTTTTATTGTGGGGATTGTTA  1319

Query  1305  CCTTTCACCATATTTTTCTGATCCTAAATCTCACTCTCAGGGTGAAATTGGTATATTTTT  1364
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1320  CCTTTCACCATATTTTTCTGATCCTAAATCTCACTTTCAGGGTGAAATTGGTATCTTTTT  1379

Query  1365  CCCCATCATCGTCTTAAGATCATTAGATAACTCCGAGTGTCCCAATGACCAAAAGATGGG  1424
             |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1380  CCCCATCATCATCTTAAGATCATTAGATAGCTCCGAGTGTCCCAATGACCAAAAGATGGG  1439

Query  1425  TGTTCTTAGGATGCTTGAGAAAGTCTGCAAAGATCCTCAGATGCTTGTTGATGTGTATGT  1484
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1440  TGTTCTTAGGATGCTTGAGAAAGTCTGCAAAGATCCGCAGATGCTTGTTGATGTGTATGT  1499

Query  1485  AAACTATGATTGTGATCTAGAGGCCCCAAACTTGTTTGAGCGCATGGTAACAACTTTGTC  1544
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1500  AAACTATGATTGTGATCTAGAGGCTCCAAACTTGTTTGAGCGCATGGTAACAACTTTGTC  1559

Query  1545  TAAAATTGCTCAAGGGTCTCAGAGTGCTGATCCAAATCCTGCCATGGCTTCGCAGACAGC  1604
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1560  TAAAATTGCTCAAGGGTCTCAGAGTGCTGATCCAAATCCTGCCATGGCTTCGCAGACAGC  1619

Query  1605  TTCGGTTAAAGGTTCATCCCTTCAGTGCCTGGTCAACGTTCTTAAATCACTAGTTGATTG  1664
             ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1620  TTCAGTTAAAGGTTCATCCCTTCAGTGCCTCGTCAACGTTCTTAAATCACTAGTTGATTG  1679

Query  1665  GGAGAAAATAAGGAGAGAGGCAGAAAATAGTACAAGAAATGCAAACGAGGACTCTGCTTC  1724
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1680  GGAGAAAATAAGGAGAGAGGCAGAAAATAGTACACGAAATGCAAATGAGGACTCTGCTTC  1739

Query  1725  TACTGGAGAGCCAATTGAAACCAAAAGCAGGGAAGATGTCCCAAGCAACTTTGAGAAGGC  1784
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  1740  TGCTGGAGAGCCAATTGAAACCAAAAGCAGGGAAGATATCCCAAGCAACTTTGAGAAGGC  1799

Query  1785  TAAAGCTCATAAATCCACAATGGAGGCTGCCATCTCCGAGTTCAACAGGAATTCAGTGAA  1844
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1800  TAAAGCTCATAAATCCACAATGGAGGCTGCCATCTCCGAGTTCAACAGGAATTCAGTGAA  1859

Query  1845  GGGTGTCGAATATCTAATTGCAAACAAGTTGGTTGAAAGGAATCCTGCTTCAGTTGCACA  1904
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1860  GGGTGTCGAATATCTAATTGCAAACAAGTTGGTCGAAAGGAATCCTGCTTCAGTTGCACA  1919

Query  1905  GTTTCTGAGAAGTACTTCGAGTCTGAGCAAGGTTATGATTGGCGATTACCTGGGCCAACA  1964
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1920  GTTTCTGAGAAGTACTTCGAATCTGAGCAAGGTTATGATTGGCGATTATCTGGGCCAACA  1979

Query  1965  CGAGGAGTTTCCTCTTGCTGTCATGCATGCATATGTTGATTCAATGAAATTTTCAGAAAT  2024
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1980  CGAGGAGTTTCCTCTTGCTGTCATGCACGCATATGTTGATTCAATGAAATTTTCGGAAAT  2039

Query  2025  GAAGTTTCATTCGGCTATTCGTGAATTTCTCAAAGGTTTTAGACTTCCTGGAGAGGCCCA  2084
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  2040  GAAGTTTCATTCAGCTATTCGTGAATTTCTCAAAGGTTTTAGACTTCCAGGAGAGGCCCA  2099

Query  2085  AAAAATTGATCGTATTATGGAAAAGTTCGCAGAAAGATATTGCGCAGACAATCCGGGTCT  2144
             |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2100  AAAAATTGATCGCATTATGGAAAAGTTTGCTGAGAGATATTGCGCAGACAATCCGGGTCT  2159

Query  2145  TTTCAAGAATGCAGATACAGCCTACGTTCTAGCCTATGCAGTTATCATGTTAAATACAGA  2204
             |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2160  TTTCAAGAATGCAGATACTGCATATGTTCTAGCCTATGCAGTTATCATGTTAAATACAGA  2219

Query  2205  TGCGCATAATCCTATGGTTTGGCCTAAGATGTCAAAATCAGATTTCACACGTATGAATGC  2264
             ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2220  TGCACATAATCCAATGGTTTGGCCTAAGATGTCAAAATCGGATTTCACACGTATGAATGC  2279

Query  2265  CACTAATGATCCTGAAGATTGTGCTCCAACTGAACTTCTGGAAGAGATCTATGATTCTAT  2324
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2280  CACGAATGATCCTGAAGATTGTGCTCCAACTGAACTTCTGGAAGAGATCTATGATTCTAT  2339

Query  2325  TGTACAAGAAGAAATTAAACTAAAAGACGATGACACCATGAAGAAGCTCAGTAGTCAAAG  2384
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2340  TGTACAAGAAGAAATTAAACTAAAAGATGATGACACCATGAAGAAGCTCAGCAGTCAAAG  2399

Query  2385  GCCAGGAGGAGAAGAAAGAGGTGGTCTTGTCAGCATTCTTAATCTGGGTTTGCCAAAGAG  2444
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2400  GCCAGGAGGAGAAGAAAGAGGTGGTCTTGTCAGTATTCTTAATCTGGGTTTGCCAAAAAG  2459

Query  2445  AATATCAGCAGCTGATGCTAAATCTGAGACTGAGGACATTGTTAGGAAAACACAGGAAAT  2504
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2460  AATATCAGCAGCTGATGCTAAGTCTGAGACTGAGGACATTGTTAGGAAAACACAGGAAAT  2519

Query  2505  TTTCCGAAAGCATGGAGTGAAAAGAGGAGTCTTTCACACGGTTGAGCAAGTGGACATTAT  2564
             |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct  2520  TTTCCGGAAGCATGGAGTGAAACGAGGAGTCTTCCACACTGTTGAGCAAGTCGAAATTAT  2579

Query  2565  AAGGCCCATGGTGGAAGCTGTTGGGTGGCCTCTGCTTGCTGCTTTCTCCGTTACAATGGA  2624
             ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2580  AAGGCCCATGGTGGAAGCTGTTGGGTGGCCTTTACTTGCTGCTTTCTCCGTTACAATGGA  2639

Query  2625  AGTAGGTGATAACAAACCAAGGATTCTTCTCTGCATGGAGGGATTTAAAGCTGGAATACA  2684
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2640  AGTAGGTGATAACAAACCAAGGATTCTTCTCTGCATGGAGGGATTTAAAGCTGGAATACA  2699

Query  2685  TATTGCTTATGTTCTTGGAATGGATACAATGCGATATGCATTTCTAACATCGCTTGTCAG  2744
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2700  TATTGCTTATGTTCTTGGAATGGATACAATGCGATATGCCTTTCTAACATCGCTTGTCAG  2759

Query  2745  GTTCACTTTCTTGCATGCTCCAAAAGAAATGCGGAGCAAAAATGTTGAAGCATTGAGGAT  2804
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2760  GTTCACTTTCTTGCATGCTCCAAAAGAAATGCGGAGCAAAAATGTTGAAGCATTGAGGAT  2819

Query  2805  ATTACTGGGGTTGTGTGACTCAGAACCTGACACCCTTCAAGATACTTGGAATGCAGTTTT  2864
             ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2820  ATTACTGGCTTTGTGTGACTCGGAACCTGATACCCTTCAAGATACTTGGAATGCAGTTTT  2879

Query  2865  AGAATGTGTTTCTAGGCTGGAATTCATTATTTCTACTCCCGGAATTGCTGCAACAGTAAT  2924
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct  2880  AGAATGTGTTTCTAGGCTTGAATTCATTATTTCTACTCCTGGGATTGCTGCAACAGTAAT  2939

Query  2925  GCATGGATCAAACCAGATCTCCAGGGATGGGGTTGTTCAATCATTGAAGGAGTTAGCCGG  2984
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2940  GCATGGATCAAACCAGATCTCCAGGGATGGGGTTGTTCAATCATTGAAGGAGTTAGCCGG  2999

Query  2985  GAGACCTGCTGAACAAGTTTTTGTAAACAGTGTCAAGCTGCCCAGTGAATCTGTTGTGGA  3044
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3000  GAGGCCTGCTGAACAAGTTTTTGTAAACAGTGTCAAGCTGCCCAGTGAATCTGTTGTGGA  3059

Query  3045  GTTTTTTACTGCGCTATGTGGTGTTTCAGCTGAAGAATTGAAGCAGTCTCCTGCCCGTGT  3104
              || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct  3060  ATTCTTTACTGCTCTATGTGGTGTTTCAGCTGAAGAACTGAAACAGTCTCCTGCCCGTGT  3119

Query  3105  TTTCAGCTTGCAGAAGCTAGTTGAGATCAGTTATTACAATATAGCACGTATCCGAATGGT  3164
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3120  TTTCAGCTTGCAGAAGCTAGTGGAGATCAGTTATTACAATATAGCTCGTATCCGAATGGT  3179

Query  3165  CTGGGCAAGAATATGGTCTGTCCTTGCCGAACATTTCGTATCTGCTGGTAGCCATCATGA  3224
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3180  CTGGGCAAGAATATGGTCTGTCCTTGCCGAACATTTCGTATCTGCTGGTAGCCATCATGA  3239

Query  3225  TGAAAAGATTGCAATGTATGCCATAGATTCTCTGAGACAGCTCGGGATGAAGTATTTAGA  3284
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  3240  TGAAAAAATTGCAATGTATGCCATAGATTCTCTGAGACAGCTCGGGATGAAGTATTTGGA  3299

Query  3285  ACGTGCTGAGCTCACCAATTTCACTTTCCAAAATGATATTCTCAAACCGTTCGTTATTAT  3344
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3300  ACGTGCTGAGCTCACCAATTTCACTTTCCAAAATGATATTCTCAAACCGTTCGTTATTAT  3359

Query  3345  CATGCGGAATACTCAAAGTCAGACCATAAGGAGCCTAATTGTTGACTGCATCGTTCAGAT  3404
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3360  CATGCGGAATACTCAAAGCCAGACCATAAGGAGCCTAATTGTTGACTGCATCGTTCAGAT  3419

Query  3405  GATAAAATCTAAAGTTGGAAGTATCAAATCGGGATGGAGGAGTGTTTTTATGATATTTAC  3464
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3420  GATAAAATCTAAAGTTGGAAGTATAAAATCGGGATGGAGGAGTGTTTTTATGATATTTAC  3479

Query  3465  AGCAGCTGCAGATGACGAAGTTGAATCGATAGTTGAAAAATCATTTGAGAATGTTGAGCA  3524
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3480  AGCAGCTGCAGATGACGAAGTTGAATCGATAGTTGAAAAATCATTTGAGAATGTTGAGCA  3539

Query  3525  AGTTATTCTGGAACACTTTGACCAGGTGATAGGTGACTGCTTCATGGATTGTGTCAATTG  3584
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  3540  AGTTATTCTGGAACACTTTGACCAGGTGATAGGTGACTGCTTCATGGATTGCGTCAATTG  3599

Query  3585  TCTCATCAGGTTTGCCAATAACAAAGCTTCAGACCGGATAAGCCTGAAAGCTATTGCCCT  3644
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3600  TCTCATCAGGTTTGCCAATAATAAAGCTTCAGACCGGATAAGCCTGAAAGCTATTGCCCT  3659

Query  3645  TCTCAGAATATGTGAGGATCGGCTTGCAGAGGGACTTATACCCGGTGGTGTTCTTAAGCC  3704
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct  3660  TCTCAGAATATGTGAGGATCGGCTTGCAGAGGGACTTATACCTGGTGGTGTTCTCAAGCC  3719

Query  3705  CGTTGATGGCAATGAGGATGAAACTTTTGATGTGACAGAGCATTACTGGTTTCCGATGCT  3764
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3720  CGTTGATGGCAATGAGGATGAAACTTTTGATGTGACAGAGCATTACTGGTTTCCGATGCT  3779

Query  3765  TGCCGGTCTATCTGATCTCACATCTGATTATAGGCCCGAAGTTAGAAACTGTGCTCTGGA  3824
             ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3780  TGCCGGTCTGTCTGATCTCACATCTGATTTTAGGCCCGAAGTTAGAAACTGTGCTTTGGA  3839

Query  3825  GGTGTTGTTTGATTTGCTAAATGAAAGGGGAAACAAGTTCTCCACACCTTTCTGGGAGAG  3884
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3840  GGTGTTGTTTGATTTGCTGAATGAAAGGGGAAACAAGTTCTCCACACCTTTCTGGGAGAG  3899

Query  3885  TATCTTCCATCGCATCTTGTTTCCAATTTTTGATCATGTGAGTCATGCTGGAAAGGAAAG  3944
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3900  TATCTTCCATCGCATCTTGTTTCCAATTTTTGATCATGTGAGTCATGCTGGAAAGGAAAG  3959

Query  3945  CTTAATATCTTCCGGGGATGTAAAATTTCGTGAAACAAGCATTCATTCCCTTCAGCTCCT  4004
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  3960  CTTAATATCTTCCGGGGATGTAAAATTTCGTGAAACAAGCATTCATTCCCTCCAGCTCCT  4019

Query  4005  CTGCAATCTCTTCAATACGTTCTACAAGGAAGTATGTTTTATGCTGCCTCCACTTTTAAG  4064
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4020  CTGCAATCTCTTCAATACGTTCTATAAGGAAGTATGTTTTATGCTGCCTCCACTTTTAAG  4079

Query  4065  TTTGCTCCTAGACTGTGCGAAGAAATCAGATCAGACAGTTGTTTCAATTTCATTAGGAGC  4124
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct  4080  TTTGCTCCTAGACTGTGCGAAGAAATCAGATCAGACAGTCGTGTCAATTTCCTTAGGAGC  4139

Query  4125  ATTGGTTCACCTCATCGAGGTTGGAGGCCACCAATTTAGTGAGGGAGACTGGGATATGCT  4184
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4140  ATTGGTTCACCTCATCGAGGTTGGAGGCCACCAATTTAGTGAGGGAGACTGGGATATGCT  4199

Query  4185  CTTGAAAAGCATAAGAGATGCATCATACACAACTCAACCGCTGGAGCTGTTGAATGCTTT  4244
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4200  TTTGAAAAGCATAAGAGATGCATCATACACAACTCAACCGCTGGAGCTGTTGAATGCTTT  4259

Query  4245  GAGTTTTGACAATCCGAAAAAGAACCTAGTTTTGGCAGGAGACATAGAGGCCGATGCCTC  4304
             ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4260  GAGTTTTGACAATCCGAAAAAGAACCTAGTTCTGACAGGAGACATAGAGGCCGATGCCTC  4319

Query  4305  TGATTCTCCACGAGTTGATCGTAATCCGGACGATATTAAAGATAATGGGAAAGTGTCCGC  4364
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4320  TGATTCTCCACGAGTTGATCGTAATCCGGACGATATTAAAGATAATGGGAAAGTTTCCGC  4379

Query  4365  CCAGGCATCTCCAAGGATTGGTACTCATGGTACTTCCCTAGAATCTGGGATACCGCCTAA  4424
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  4380  CCAGGCATCTCCAAGGATTGGTACTCATGGTGCTTCCGTAGAATCTGGGATACCGCCTAA  4439

Query  4425  GGCTGATGGTTCGGAAGGTCGTCCATCGTCATCTGGAAGGGCTCAAAAGGATGTGGATGA  4484
             | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct  4440  GTCTGATGGCTCGGAAGGTCGTCCATCGTCATCTGGAAGAGCTCAAAAGGATGGGGATGA  4499

Query  4485  TGTGAATCTGCAGCGGAGTCAGACTTTTGGCCAAAGATTCATGGACAATCTCTTCCTCCG  4544
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct  4500  TGTGAATTTGCAGCGGAGTCAGACTTTTGGCCAAAGATTCATGGACAATATCTTCCTCAG  4559

Query  4545  GAATCTCACATCTCAACCAAAAAGCTCTGTTGCAGAAGTGACTGTACCCTCCTCTCCATA  4604
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct  4560  GAATCTCACATCTCAACCAAAAAGCTCTGTTGCAGAAGTGTCTGTACCTTCCTCTCCATA  4619

Query  4605  TAAGCATGAAGATCCTACAGAGCCTGACAGCAGAGAAGAAGAGAGTCCAGCAT-TGGGAG  4663
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct  4620  TAAGCATGAAGATCCTACAGAGCCCGACAGCAGAGAAGAAGAGAGTCCAGC-TCTGGGAG  4678

Query  4664  CTATTAGAGGAAAATGCATCACACAATTACTACTACTTGGTGCTATCAACAGCATCCAGC  4723
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  4679  CTATTAGACGAAAATGCATCACACAATTACTACTACTTGGTGCTATCAACAGCATTCAGC  4738

Query  4724  AAAAATACTGGAGTAATTTGAAAACCCCACAGAAGATTGCGATTATGGACATCTTATTCT  4783
             ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4739  AAAAATACTGGAGTAATTTGAAAACACTACAGAAGATTGCGATTATGGACATCTTATTCT  4798

Query  4784  CTTTCATCGAATTTGCTTCTTCCTACAATTCATATTCTAACCTTAGAACACGTATGAATC  4843
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct  4799  CTTTCATAGAATTTGCTTCTTCCTACAATTCATATTCTAATCTCAGAACACGTATGAATC  4858

Query  4844  ACATTCCCACAGAGAGGCCACCTCTAAACCTTCTCCGGCAAGAGCTGGAAGGAACCACCA  4903
             |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4859  ACATTCCCGCTGAGAGGCCACCTTTAAACCTTCTCCGGCAAGAGCTGGAAGGAACCACCA  4918

Query  4904  TATATTTGGACGTCTTGCAAAAGACAACTTCTGGGCTTGCGGATGATGCATCTAACTCGG  4963
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  4919  TATATTTGGACGTCTTGCAAAAGACAACTTCTGGGCTTGCAGATGATGCATCTAACTCGG  4978

Query  4964  AAGATAGACTAGAAGGTGCAGCAGAAGAAAAATTGGTATCGTTCTGTGAACAGGTTCTGA  5023
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  4979  AAGATAGACTAGAAGGTGCAGCAGAAGAAAAATTGGTATCGTTCTGTGAACAGGTGCTGA  5038

Query  5024  AAGAAACATCTGATCTCCAGTCCACTTTGGGGGAGACTACTAACATGGATGTTCATCGGG  5083
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  5039  AAGAAACATCTGATCTCCAGTCCACTTTGGGGGAGACTACTAACATGGATGTCCATCGGG  5098

Query  5084  TACTGGAGCTACGTTCTCCCGTGATTGTGAAGGTTTTGGAAGGCATGTGCTTCATGAACA  5143
             |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5099  TACTGGAGCTGCGTTCTCCTGTGATTGTGAAGGTTTTGGAAGGCATGTGCTTCATGAACA  5158

Query  5144  ACACAATATTCAGGAAGCACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGCTCACGAGGCTCGTTTGCT  5203
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |  
Sbjct  5159  ACACAATATTCAGGAAACACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGCTCACAAGGCTCAT--G--  5214

Query  5204  GTGAACAGATGGAGATAAGAGGTGCACTAGCCAACCTTTTCAAAGCACAATTGAAGCCAC  5263
             |  | ||  |  | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5215  G--A-CA--T--A-A---GAGGTGCACTAGCCAACCTTTTCAAAGCACAATTGAAGCCAC  5263

Query  5264  TTTTGCAACAGTAA  5277
             ||||||||||||||
Sbjct  5264  TTTTGCAACAGTAA  5277



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 212703775497


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5