BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G43610.1
Length=3876
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg484805 jgi|Araly1|484805|fgenesh2_kg.5__797__AT3G43610.1 5862 0.0
> Ahg484805 jgi|Araly1|484805|fgenesh2_kg.5__797__AT3G43610.1
Length=3840
Score = 5862 bits (3174), Expect = 0.0
Identities = 3591/3788 (95%), Gaps = 46/3788 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 33 CTCATCATCACCATTCTCAGCTTTTTGGCTTGT--G----GGAATGACGAAAGATCTCTC 86
|||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||
Sbjct 1 CTCATCATCATCATACTCAGCTTTTTGGCTTGTGGGTATCGGAATGACGAAAGAGGTCTC 60
Query 87 CTTTCTGGGATCCGAGAAGCAACTCGACGAAACCCTTTTCCGCTAAAACCATTCCAGTCA 146
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 61 CTTTCTGGGATCCGAGAAGCAACTCGACGAAACCCTTTGCCGCTAAAACCATTCCAGTAA 120
Query 147 AGGCAGTAGTAATAATGCCGGTGCTGGCGACGAGTCTCG--T---TTC-------GCTTA 194
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||
Sbjct 121 AGGCAGTAGTAATAATGCCGGTGGTGGCGACGAGTCTCGTTTCGCTTCAGGAGAAGCTTA 180
Query 195 AAGTGGAGGAGCCATACCTTCCTCCGCGAAATTGGGAATCTTTACCGTCTCAAAGCGGCC 254
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||
Sbjct 181 AAGTGGAGGAGCCATACCTTCCTCCGCGCAATTGGGAATCTTTACCTTCTCAGAGCCGCC 240
Query 255 GATTTCTTCCTCCAACTCGttcttctgcttcttcttcttcatcttcttccttTGTCTCTG 314
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || | | | ||||||||
Sbjct 241 GATTTCTTCCTCCAACTCCTTCTTCTG---CTTCTTC-T--TC--C-T-C--TGTCTCTG 288
Query 315 AATCGAGCTTGGTCAGGTTGGCGCTGAATGCTCTGCAAGGAGTTGAGTCTTCTCTTATTA 374
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 289 AATCGAGCTTGGTCAGGTTGGCGCTGAATGCCCTGCAAGGTGTTGAGTCTTCTCTTATTA 348
Query 375 GTATAGAACAGCTCTCTTCTGCATTTTGTTCTGAGCCAGCTGACAGGACCTTCCACAAAA 434
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 349 GCATAGAACAGCTCTCTTCTGCATTATGTTCTGAGCCAGCTGACAGGACCCTCCACAAAA 408
Query 435 TTCCGAGCTTGTGGCATCGGTTGTCAAGCACTGATGCGTTGGGACAGATTCTTAGAGATA 494
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 409 TTCCAAGCTTGTGGCATCGGTTGTCAAGCACTGATGCGTTGGGACAGATTCTTAGAAATA 468
Query 495 TAGGCTGCTTCGGTTCTTTGGTATTTCTTCTCCATAAGTTCGTTGACCATTTCACAAGAT 554
| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 469 TTGGCTGCTTTGGTTCTTTGGTCTTTCTTCTCCATAAGTTCGTAGACCATTTCACAAGCT 528
Query 555 TGAATTTGGATGTGGAATCAGCTGTTGAGGGACAGGGGAGCTGTAAAATTGGTGAAAATG 614
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 529 TGAATTTGGATGTGGAAACAGCTGTTGAGAGACAGGGGAGCTATAAAATTGGTGAAAATG 588
Query 615 AAGAAGTCAATAACAAAAGCTGCTATACTCTTGTTAATCAGGCTTTTGCTATTGCTGTGA 674
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 AAGAAGTCAATAACAGAAGCTGCTATACTCTTGTTAATCAGGCTTTTGCTATTGCTGTGA 648
Query 675 GGAGGGTCCTAGAAGGCTATATATCTGGGCTTGATACATTATGTGCATCGATAGAACTGA 734
| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 GAAAGGTCCTTCAAGGCTATATATCTGGGCTGGATACATTATGTGCATCGATAGAACTGA 708
Query 735 GGCGTTCATCAAACATTGTTGATGGGTCTGACCATGGTTCTTCTCGGTTAGGCAGCCTTA 794
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||
Sbjct 709 GGCGTTCGTCAAACATTGTTGATGGGTCTGACCATGGTTCCTCTTGGTCAGGCTGCCTTA 768
Query 795 CAAACGTCGTTCATCCAAAGATAACATTATTGGAAGTTTTTCTGCATACTAGAGAGTTAA 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 CAAACGTCGTTCATCCAAAGATAACATTATTGGAAGTTTTTCTGCATACTAGAGAGTTAA 828
Query 855 GAACACAGATTGAAGCTCTGGCAAACATATGTGATTTGTATGATATAGCCCTTTCTTACT 914
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 GAACACAGATTGAAGCTCTTGCAAACATATGCAATTTGTATGATATAGCCCTTTCTTACT 888
Query 915 GTGCCTCTCCTTGGGAATGTCTCATTACTGAAGCAACCACGCGATTTCATGGGTTCTACA 974
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGCCTCTCCTTGGGAATGTCTGATTACTGAAGCAACCACGCGATTTCATGGGTTCTACA 948
Query 975 GAGGAAGTGACCTTCTTACTTACTTATATTCACAACTACAGGTTGCTGATCCTACTCACA 1034
| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 949 GTGGAAGCGACCTGCTTACTTACTTATATACACAACTACAGGTTGCTGATCCTGCTCACA 1008
Query 1035 GTGCTATGCTGAAGTTTTTGTTCCTCAAAACATGTGAGCCATATTGTGAGTTTATAAGAT 1094
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 GTGCTATGCTTAAGTTTTTGTTCCTCAAAACATGTGAGCCATATTGTGAGTTTATAAGAT 1068
Query 1095 CTTGGATGTTTAAAGCCGAACTTAACGATCCTCACAAGGAGTTCATTGTGGAATGTCGCA 1154
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1069 CTTGGATGTTTAAAGCCGAACTTAACGACCCTCACAAGGAGTTCATTGGGGAATGTCTCA 1128
Query 1155 GTGAGTCAACATCTTTTTCTTGGAATAAGCCTGGCATCTCCCCATTGAAGAGCGTAAGGG 1214
| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 GCGAATCGACATCTTTTTCTTGGAATAAGCCTGGCACCTCCCCATTGAAGAGCGTAAGGG 1188
Query 1215 AGCGAGGAGGGCTTGTTCCGTGTTTCTTAAACGGCTTCTTGGAACCTATAGTAAGGGCTG 1274
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1189 AGCAAGGAGGGCTTGTTCCGTGTTTCTTGAACGGCTTCTTGGAACCTATACTAAGGGCTG 1248
Query 1275 GTCAACAGCTTCAAGTAATTACAAAACTTCTGGAACTGTGTAATCTTCCTGCGTCTGGAC 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 1249 GTCAACAGCTTCAAGTAATTACAAAACTTCTGGAACTGTGTAATCCTCCTGCATCTGGAC 1308
Query 1335 ACAAAAATTACACAGATCTTCTTCCGTGTTGGACCTATTTTTCTACCACTAGTCCAGGGT 1394
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1309 ACAAAAATTACACAGATCTTCTTCCGTGTTGGACGTATTTTTCTACTTCTAGTCCAGGGC 1368
Query 1395 ACCCATCTCCAATAACTTTCAGCAAATTACATATAGAAGTGATGATAAAGAAAAGAGACG 1454
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1369 ACCCATCTCCAATAACTTTCAGCAAATTACAAATAGAAGTGATGGTAAAGAAAAGAGACG 1428
Query 1455 ATTACTACAGAATGATGCAAGAAAAACTTGGTGACTTTTCAGAAAAGTTTGAAG-TGTTC 1513
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct 1429 ATTACTACAGAATGATGCAAGAAAAACTTGGTGACTTTTCAGAAAAGTTTGA-GCTCTTC 1487
Query 1514 CCTGGGCAGGTTCCTGGAGCAATATCTTTACCAATCTCCTATGGCGACGGAGACAAAAAT 1573
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 CCTGGGCAGGTTCCTGGAGCATTATCTTTACCAATATCCTATGGCGACGGAGACAAAAAT 1547
Query 1574 TCCATTTATTTCACACTGGATGAGAGTTTACTAATTCCTTCAACAATGGCAATAGACTTG 1633
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1548 TCTGTTTATTTCACACTGGATGAGAGTTTACTAATTCCTTCAACAGTGGCAATAGACTTG 1607
Query 1634 ACCAGGGACCAGAGTGGCTCTGATTCTGATGATCAGAATACAGAAGACAGATGGTTTTCA 1693
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 ACCAGGGACCAGAGTGGCTCAGATTCTGATGACCAGAATACAGAAGACAGATGGTTTTCA 1667
Query 1694 GAGATAGATGCATCATGCTCATCTGAATGTTCATCGACTAGGGATTCTTTGGAAGCATCC 1753
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 GAGATAGATGCATCATGTTCATCTGAATGTTCATCGACTAGGGATTCTTTGGAAGCATCC 1727
Query 1754 GAGGTTGGACTCCTTGATTCACAAAGTACATTAGTGGGACCTCCACCAAATTATTTATCA 1813
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 GATGTTGGACTCCTTGATTCACAAAGTACATTAGTGGGACCTCCACCAAATTATTTATCA 1787
Query 1814 GCTCTACGTTTCTCTGTTGCCTCTAATGGGAATTGTAATCAGAATCTGGTTCAGCATAGT 1873
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 GCTCTACGTTTCTCTGTTGCCTCTGATGGGAATTGTAATCAGAATCTGGTTCAGCATAGT 1847
Query 1874 GATTCAGGTTATATAGACAATAATCTTGTGAGGCAAGGTGAGAAGGCAGATATTAATCAT 1933
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1848 GATTCAGGTTATATAGACAATAATTTTGTGAAGCAAGGTGAGAAGGCAGATACTAATCAT 1907
Query 1934 CAGTGGGTGGATACTAAGCCAGAAGAGTCAACTGGAGTATGTGAAGATGATAAATTTAGG 1993
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 CAGTGGATGGATACTGAGCCAGAAGAGTCAACTGGAGTATGTGAAGATGATAAATTTAGG 1967
Query 1994 GGCCCTCTTT-TGATTAAGTCATGGCCCCTTGGCGGATTACCTAGAAATCCATTTTGTGT 2052
|| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1968 GGGCCTATTTCT-ATTAAGTCATGGCCCCTTGGCGGATTACCTAGAAATCCGTTTTGTGT 2026
Query 2053 TGATAAGAAGTCTGCAGACGATGACAGCGAAGATCCAAGAAATTATTCAGGAGCTAGGAT 2112
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 2027 TGATAAGAAGTCTGCAGAAGATGACAGAGAAGATCCAAGAAATGATTCAGGAGCTATGAC 2086
Query 2113 GGAACAGAGGCACTTAATGAATACTGATGAAAGAAAACTATTTTTAAACAACATTTCCAC 2172
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 GGAACAGAGGCACTTAATGAATACTGATGAAGGCAAACTATTTTTAAACAACATTTCCAC 2146
Query 2173 CAGTGGCAGCTGTTCAAAGCACGAGAGAAGACATGATGTGCTGGAAAACTGTCTTTCATC 2232
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CAGTGGCAGCTGTTCAAAGCACGAGAGGAGACATGATTTGCTGGAAAACTGTCTTTCATC 2206
Query 2233 GAAATTAGATTTGATGAAAGACACAAAGGTAAACTACCCTAATGATGTCCTCAGTATGAA 2292
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||
Sbjct 2207 GAAATTAGATTTGATGAAAGACACAAAGGTAAACTACCCTTACGAGGTGCTCAGTATGAA 2266
Query 2293 TCCCTTAGTGAGATGTGATTTCTTGCGCAAGCATGGTAACACAAACAAGAGGAACCAGGG 2352
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||
Sbjct 2267 TCCTTTACTGAGATGTGATTTCTTGCGCAAGCATGGAAATACAAACAGGAGGAACCAGGG 2326
Query 2353 GAAATCATTGCCTTGGTTTGATTTTTCCGCGGTGGATGACCCTTCAAAAACATGTATTAC 2412
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2327 GAAATCATTGCCTTGGTTTGATTTTTCTGCGGTGGATGACCCTTCAAAAACATGTATTAC 2386
Query 2413 CAGGATACCTGTACGAGTCCCTATTGATTTTCAGAAAGAATCTCACAGTCCTCAGACTGA 2472
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||
Sbjct 2387 CAGGATACCTGTACGAGTCCCTATTGATTTTCATAAGGAATCTCATAGTTTTCAGACTGA 2446
Query 2473 TAGAAAGAGTCATCGCCATGCCAACCAAGAA------A--G---G-TTTGATGTTGAAGA 2520
|||||| | |||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||
Sbjct 2447 TAGAAACCGCCATCGCCATGTCAACCAAGAATGTGGGATAGATAGGTTTGATGTTGAAGA 2506
Query 2521 TCCTAAAGTTTCTTCCAGTCAGTTATCTTCTGGTATAAAAGGTTGCGCAGAAGaaaaaaa 2580
||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2507 ACCTAAAGTTTCATGCAGTCATTTATCTTCTGGTATAAAAGGTTGCGCTGAAGAAAAAAA 2566
Query 2581 aTCAAATGCATTTGGTGGAGGTAGATGGGAGAGTATGCTTCGTAGATCAAATAACCCTGA 2640
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2567 ATCAAATGCATTTGGTGGAGGTAGATGGGAGGGTATGCTTCGTAGATCAAATAACCCTGA 2626
Query 2641 AACTAGTGCCTTTAGTGATCGCAGACAGGACTCCTCTGGCACATTTGAATTGCCACTTGA 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 AACTAGTGCCTTTAGTGATCGCAGACAGGACTCCTCTGGCACATTTGAATTGCCACTTGA 2686
Query 2701 TTTTGTTATAGACAAGTGTCTACTGCAGGAAATACATCTTCAATATAACTTTGTCAGTAA 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2687 TTTTGTTATAGACAAGTGTCTACTGCAGGAAATACATCTTCAATATAACTTTGTCAGTAA 2746
Query 2761 GCTAGCTATCAAGTTGCTCGAAGAAGGATTTGGCTTGCAAGAACATCTGCTAGCTCTACG 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2747 GCTAGCTATCAAGTTGCTCGAAGAAGGATTTGGCTTGCAAGAACATCTGCTAGCTCTACG 2806
Query 2821 TAGATATCATTTCATGGAACTAGCAGACTGGGCAGATGTATTTGTAGTGTCACTTTGGCA 2880
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2807 TAGATATCATTTCATGGAACTAGCAGATTGGGCAGATGTATTTGTAGTGTCCCTTTGGCA 2866
Query 2881 TCATAAATGGCTTGTTACAGAGGCAGATAAGAGAATTGCAGAAATTCAAGGGTTTCTAGA 2940
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2867 TCATAACTGGCTTGTTACAGAGGCAGATAAGAGAATTGCAGAAATCCAAGGGTTTCTAGA 2926
Query 2941 ATCATCAATTCAGAGATCATCATGTGAACGAGACATTTGTAAGGACAGGATATTTTTGTA 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2927 ATCATCAATTCAGAGATCATCATGTGAACGAGACATTTGTAAGGACAGGTTATTTTTGTA 2986
Query 3001 CAAAAGACAAGGCACAATGCATATCCCACCATCAACCATTGGAGTGCGTTCCTTTGATTT 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2987 CAAAAGACAAGGCACAATGCATATCCCACCATCAACCATTGGAGTGCGTTCCTTTGATTT 3046
Query 3061 CCTAAGGTTGGGTTATCGAGTGGATTGGCCAATCAGTATAATTTTAACATGCGATGCCCT 3120
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3047 CCTAAGGTTGGGTTATCGAGTGGACTGGCCAATCAGTATAATTTTAACATGCGATGCCCT 3106
Query 3121 GACAGCGTATGCTGATGTATTTAGTTTCCTGGTTCAAGTGAAACTAGCAGCCTACGTATT 3180
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3107 GAAAGCGTATGCAGATGTATTTAGTTTCCTGGTTCAAGTGAAACTAGCAGCCTATGTATT 3166
Query 3181 AACTGATGTCTGGTGTTCACTGAAGGATGTAAGACATATGATGCATGAGAAGAAAGAGAA 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3167 AACTGATGTCTGGTGTTCACTGAAGGATGTAAGACATATGATGCATGAGAATAAAGAGAA 3226
Query 3241 GATATTGAAGCAAGAACTCCGGTGGTTAAACATATTGATGAAACTAAGGCATCAGGTCAA 3300
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227 GATATTGAAGCAAGAACTCCGGTGGTTGAACATATTGATGAAACTAAGGCATCAGGTCAA 3286
Query 3301 CCATTTTGTAACAGCACTACAGCAATATGTACATTCAGAATTGTCTCACGTATCATGGTC 3360
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3287 CCATTTTGTAACAGCACTACAGCAATATATACATTCGGAATTGTCTCACGTATCATGGTC 3346
Query 3361 CAAGTTCCTTCATTCCCTGAAAAATAAGGTCAAGGATATGATGGATCTTGAATCTGTGCA 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3347 CAAGTTCCTTCATTCCCTGAAAAATAAGGTCAAGGATATGATGGATCTTGAATCTGTGCA 3406
Query 3421 TATGGCTTATCTAAGTGAGGCTTTGCGCATATGCTTCCTATCTGACGAAACCCAAATCAT 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||
Sbjct 3407 TATGGCTTATCTAAGTGAGGCTTTGCGCATATGTTTCCTATGTGACGAAACTCGAGTCAT 3466
Query 3481 ATCTAACATCATAGAGAACATCTTGCAATGCGCACTGGACTTCCGGTCTTGTCTTCCCAG 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3467 ATCTAACATCATAGAGAACATCTTGCAATGCGCACTGGATTTCCGGTCTTGTCTTCCCAG 3526
Query 3541 AGGTATTCAGAGTACAGATCGAGTCCCAAACGATTCATGGACAAAAACATTAGGCATAAA 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 3527 AGGTATTCAGAGTACAGATCGAGTCCCAAACGATTCACAGACAAAAACACTAGGCATAAA 3586
Query 3601 CACATCTCAGGTGATGATGGTGAAGCAGAATTTTGACAAAGAGTTAAAGGAGCTGCATAA 3660
||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3587 CACATCTCAGGTGATGATGGTAAAACAAAATTTTGACAAAGAGTTAAAAGAGCTGCATAA 3646
Query 3661 GTGTCACCTGAGATCACCAAAACATGGGAAATATGGGCTCTCTCGCTTCTGGGACTACCT 3720
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 GTGTCATATGAGATCACCAAAACATGGGAAATTTGGACTCTCTCGCTTCTGGGACTACCT 3706
Query 3721 CAACTTCAACCTTTATTATTCAGATATCCTTCATGACTCTAACATCTTCTCTCTTATTCC 3780
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3707 CAACTTCAACCTTTATTACTCAGATATCCTTCATGACTCTAACATCTTCTTTCTTATTCC 3766
Query 3781 TTAGAAGT 3788
||||||||
Sbjct 3767 TTAGAAGT 3774
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 146483598477
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5