BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G44050.1
Length=3861
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg484830 jgi|Araly1|484830|fgenesh2_kg.5__822__AT3G44050.1 3094 0.0
> Ahg484830 jgi|Araly1|484830|fgenesh2_kg.5__822__AT3G44050.1
Length=3713
Score = 3094 bits (1675), Expect = 0.0
Identities = 1843/1925 (96%), Gaps = 8/1925 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1875 TGAGGAAGGGGAACGGGATATCTTAAATCAACAGATTCAAGCGTTACAAGCCAAGTTGCT 1934
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1779 TGAGGAAGGAGAACGGGATATCTTAAATCAACAGATTCAAGCGTTACAAGCCAAGTTGCT 1838
Query 1935 AGAAGCTCTTGACTGGAAACTCATGCACGAGTCAGATTCCTCCATGGTTAAAGAAGATGG 1994
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 AGAAGCTCTTGACTGGAAACTCATGCACGAATCAGATTCCTCCATGGTTAAAGAAGATGG 1898
Query 1995 TAACATCAGCAATATGTTCTGCTCAAACCAGAATCAGGAATCAAAGAAACTTTCGTCTAT 2054
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1899 TAACATCAGCAATATGTTCTGCTCAAACCAGAATCAGGAATCAAAGAAACTTTCATCGAT 1958
Query 2055 CCAAGATGAGAATGAATTTCTCCGGATGCAGGCTATTCAAAACCGGGCAGAAATGGAATC 2114
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1959 CCAAGATGAGAATGAATTCCTCCGGATGCAGGCTATTCAAAACCGGGCAGAAATGGAATC 2018
Query 2115 TCTTCAGAAGTCCTTAAGTTTTTCACTTGACGAGAAAGAGAGATTGCAAAAGCTTGTCGA 2174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2019 TCTTCAGAAGTCCTTAAGTTTTTCACTTGACGAGAAAGAGAGATTGCAAAAGCTTGTCGA 2078
Query 2175 CAATTTGTCTAATGAACTTGAGGGAAAAATAAGATCCTCAGGCATGGTTGGTGATGATGA 2234
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 CAATTTGTCTAAGGAACTTGAGGGAGGAATAAGATCCTCAGGCATGGTTGGTGATGATGA 2138
Query 2235 TCAGATGGAGGTTAAAACAATGGTTCAAGCCATTGCATGTGTTAGTCAAAGAGAAGCTGA 2294
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139 TCAGACGGAGGTTAAAAAAATGGTTCAAGCCATTGCATGTGTTAGTCAAAGAGAAGCTGA 2198
Query 2295 AGCTCACGAGACAGCAATCAAATTGTCGAAAGAAAATGATGATTTGCGCCAGAAAATAAA 2354
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199 AGCTCACGAGACAGCAATCAAGTTGTCGAAAGAAAATGATGATTTGCGCCAGAAAATAAA 2258
Query 2355 GGTCTTGATTGAGGACAACAACAAGCTTATAGAGCTGTATGAACAAGTAGCCGAAGAAAA 2414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2259 GGTCTTGATTGAGGACAACAACAAGCTTATAGAGCTGTATGAACAAGTAGCCGCAGAAAA 2318
Query 2415 CAGTTCCAGAGCTT-GGGGAAAGATCGAGACAGATTCGTCAAGTAATAATGCGGACGCTC 2473
|| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2319 TAGCTCCAGAGCTTCGGGG-AAGATCGAGAAAGATTCGTCAAGTAATAATGCTGAAGCTC 2377
Query 2474 AGAACAGTGCTGAAATTGCTTTAGAGGTTGAAAAAAGTGCAGCTGAAGAACAGAAGAAAA 2533
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 2378 AGAACAGTGCTGAAATTGCTTTGGAGGTTGAGAAAAGTGCAGTTGAGGAACAGAAGAAAA 2437
Query 2534 TGATAGGAAACCTGGAGAATCAGCTAACCGAGATGCACGATGAGAACGAGAAGCTAATGA 2593
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2438 TGATAGGAAACCTGGAGAATCAGCTAAGTGAGATGCACGATGAGAACGAGAAGCTAATGA 2497
Query 2594 GTCTGTACGAAAATGCGATGAAGGAAAAGGATGAATTGAAAAGACTTCTCTCTTCTCCTG 2653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498 GTCTGTACGAAAATGCGATGAAGGAAAAGGATGAATTGAAAAGACTTCTCTCTTCTCCTG 2557
Query 2654 ACCAAAAGAAGCCTATTGAAGCTAATTCCGATACTGAAATGGAGCTGTGTAACATTTCTT 2713
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2558 ACCAAAAGAAGCCTATTGAAGCTGATTCTGATACTGAAATGGAGCTGTGTAACATTTCTT 2617
Query 2714 CTGAAAAGTCCACAGAAGATTTAAACTCAGCAAAGCTGAAACTTGAACTGGCGCAGGAAA 2773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2618 CTGAAAAGTCCACAGAAGATTTAAACTCAGCAAAGCTGAAACTTGAATTGGCTCAGGAAA 2677
Query 2774 AGCTTTCAATATCTGCGAAAACTATTGGAGTGTTCTCTTCGCTTGAAGAGAATATTTTGG 2833
|||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2678 AGCTTTCAGTCTCTGCTAAAACTATTGGAGTGTTCTCTTCGCTTGAAGATAATATTTTGG 2737
Query 2834 ACATCATCAAGCTGTCAAAGGAAAGCAAAGAGACCGAAGAAAAAGTTAAGGAGCACCAGT 2893
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2738 ACATCATCAAGCTGTCAAAGGAAAGCAAAGAGGCCGAAGACAAAGTTAAGGAGCACCAGT 2797
Query 2894 CTGAGCTAGGATCTATCAAAACTGTTTCTGATCAAACTAATGCAAGAAAGGAAGTTGCAG 2953
|||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 ATGAGTTAGGATCAATCAAAACTGTCTCTGATCAAACTAATGCAAGAAAGGAAGTTGCAG 2857
Query 2954 AGAAAAAATTGGCCGCTCTCAGATGCTCACTATCAAACTTTGCATCATCAGCAGTTTACT 3013
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2858 AGAAAAAGTTGTCCGCTCTCAGATGCTCACTATCAAACTTTGCATCATCAGCAGTTTACT 2917
Query 3014 TTCAACAGCGAGAAGAACGAGCAAGGGCGCATGTAAACTCATTTTCCGGTTATCTAAACC 3073
||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2918 TTCAACAGCGAGAAGAAAGGGCAAAGGCGCATGTAAACGCATTTTCCGGTTATCTAAACC 2977
Query 3074 AGAAAAATGAAGAACTCGATGTTATCCGTTCTCACAAAAGAGAAATCGATGCTGCTATGG 3133
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2978 AGAAAAATGAAGAACTCGATGTTCTCCGTTCTCACAAAAGAGAAATTGATGCTGCTATGG 3037
Query 3134 GTAAGATCCAACAATCTGAGGCAGAGCTGAAGAGTAACATTGTAATGCTGAAAATAAAAG 3193
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3038 GTAAGATCCAACAATCCGAGGCAGAGCTGAAGAGTAACATTGTAATGCTGAAAATAAAAG 3097
Query 3194 TGGATGAAGAGAACAAGAGGCATGAGGAAGAGGGTGTTCTTTGCACGATAGATAACATTC 3253
|||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3098 TGGATGAAGAGAACAAGAGGTATGAGGAGGAGAGTGTTCTTTGCACGATAGATAACACTC 3157
Query 3254 TGCGTACAGGAAAAGCCACAGATTTGCTGAAATCCCAGGAAGAAAAAACAAAGCTCCAAT 3313
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3158 TGCGTACAGGCAAAGCCACAGATTTGCTGAAATCCCAGGAAGAACAAACAAAGCTCCAAT 3217
Query 3314 -CGGAGATGAAGCTTTCTCGGGAGAAGCTTGCTTCGGTTAGAAAAGAAGTTGACGACATG 3372
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3218 TCG-AGATGAAGCTTTCTCGGGAGAAGCTGGCTTCGGTTAGAAAAGAAGTTGACGACATG 3276
Query 3373 ACTAAGAAGTCTTTGAAACTGGAGAAAGAGATCAAAACCATGGAAACAGAGATAGAGAAG 3432
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3277 ACTAAGAAGTCTTTGAAACTAGAGAAGGAGATCAAAACCATGGAAACAGAGATAGAGAAG 3336
Query 3433 AGCTCAAAGACTAGAACCGAATCAGAAATGGAATTGGAGAACACAATTCAAGAGAAGCAA 3492
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3337 AGCTCAAAGACGAGAACCGAATTAGAAATGGAATTGGAGAACACAATTCAAGAGAAGCAA 3396
Query 3493 ACTATTCAGGAGATGGAAGAACAAGGGATGTCTGAAATACAAAACATGATAATCGAGATT 3552
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3397 ACTATTCAGGAGATGGAAGAACAAGGGATGACTGAAATACAAAACATGATAATCAAGATT 3456
Query 3553 CATCAGCTTGTCTTTGAATCGGATCTGAGAAAAGAAGAGGCGATGATTATAAGAGAAGAG 3612
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3457 CACCAGCTTGTCTTTGAATCAGATCTGAGAAAAGAAGAGGCAATGATTATAAGAGAAGAG 3516
Query 3613 CTT-ATTGCAGAGGAGCTTAGAGCCAAAGATGTGCACACGAATATGATCGAGAGAGTCGA 3671
|| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 3517 CTCGAT-GCAGAGGAGTTTAGAGCGAAAGATGTGCACAAGAATATGATCGAAAGAGTCGA 3575
Query 3672 GAATGCGTTGAAGACACTGGAGAATCAAAACAATAGCGTATCAGGCAAGATTGAAGAAGA 3731
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3576 GAATGCGTTGAAGACACTGGAGAATCAGAACAATAGCATATCAGGCAAGATTGAAGAAGA 3635
Query 3732 AGTAGAAAATGTTTTGAGTTTAGTTCACGAAGCCT-CGAGGTTGCTTGAAGTTTCTCACT 3790
|||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3636 AGTAGAAAGCGTTTTGGGATTAGTTCACGAAGC-TACGAGGTTGCTTGAAGTGTCTCACT 3694
Query 3791 GATAG 3795
|||||
Sbjct 3695 GATAG 3699
Score = 2905 bits (1573), Expect = 0.0
Identities = 1714/1783 (96%), Gaps = 6/1783 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCCGTTTATCTCCGAGACTGCTAGTGCCATCAAGCGCCGGTTCGGATTCAACGACCGT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGTTTATCTCCGAGACTGCTAGTGCCATCAAGCGCCGGTTCGGATTCAACGACCGT 60
Query 61 CCCGCTCCGTCGGAATCTCTCCGCTCTGTACCTTGCACGCCAGAAGCTAACACCGTCTCG 120
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||
Sbjct 61 CCCGCTCCGTCGGAATCTCTCCGCTCTGTGCCTTGCACGCCGGAAGCTAGCACCGGCTCG 120
Query 121 AGAGATAATCACACTCATCAGTCTTTGCTTTTCTCTTCCGCCGTTCGAAGCATGCCTGAA 180
||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGAGAGAATCACACTCATCAGTCAACGGTTTTCTCTTCCGCGGTTCGAAGCATGCCTGAA 180
Query 181 TTGGACGAAGATGGTGCGATTTGCGCTGGATCTGCTCAGATATCGAGGTCTCAAAGCTTT 240
||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTGAACGAAGATGAAGAGATTTGCGCTGGATCTGCTCAGATTTCGAGGTCTCAAAGCTTT 240
Query 241 GAGTTCAATGAAGATCCCGCTTTTTGGAAAGATCACAATGTTCAGGTTATCATAAGAACT 300
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 241 GAGTTCAATGAAGATCCCGCTTTCTGGAAAGATCACAATGTTCAGGTTATTATAAGAACT 300
Query 301 CGTCCACTTAGTAGTTCAGAGATTTCTGTACAAGGCAACAACAAATGTGTAAGGCAAGAC 360
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 301 CGTCCACTTAGTACTTCAGAGATTTCTGTACAAGGCAACAACAAGTGTGTGAGGCAAGAC 360
Query 361 AATGGTCAGGCAATTACTTGGATTGGGAATCCAGAGTCTCGGTTCACATTTGATCTCGTT 420
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 361 AATGGTCAGGCAATCACTTGGATTGGGAATCCAGAGTCTCGATTCACATTTGATCTCGTT 420
Query 421 GCTGATGAGAATGTTAGCCAGGAGCAGATGTTTAAAGTGGCTGGAGTACCTATGGTAGAG 480
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 421 GCTGATGAGAATGTTACCCAGGAGCAGATGTTTAAAGTGGCTGGAGTGCCTATGGTGGAG 480
Query 481 AATGTTGTGGCTGGTTACAATAGCTGTATGTTTGCATATGGCCAGACTGGAAGTGGGAAA 540
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AATGTCGTGGCTGGTTACAATAGCTGTATGTTTGCTTATGGCCAGACTGGAAGTGGGAAA 540
Query 541 ACTCATACTATGCTTGGAGATATCGAGGGAGGAACACGTAGACATAGTGTCAACTGCGGG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ACTCATACTATGCTTGGAGATATCGAGGGAGGAACACGTAGACATAGTGTCAACTGCGGG 600
Query 601 ATGACACCTAGAGTTTTTGAGTATTTGTTCTCAAGGATCCAAAAGGAAAAAGAGGTTCGC 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 601 ATGACACCTAGAGTTTTTGAGTATTTGTTCTCAAGGATCCAAAAGGAAAAAGAGGTCCGC 660
Query 661 AAAGAGGAAAAGCTACATTTCACATGTAGATGCTCATTTCTGGAGATTTACAACGAGCAA 720
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 661 AAAGAGGAAAAGCTACATTTCACTTGTAGATGCTCATTTCTGGAGATATACAACGAGCAA 720
Query 721 ATCCTTGATTTATTAGATCCATCGTCTTATAATTTACAGCTAAGGGAAGACCACAAAAAA 780
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||
Sbjct 721 ATCCTTGATTTATTAGATCCATCATCTTATACTTTACAGCTAAGAGAGGACCACAAGAAA 780
Query 781 GGTATTCATGTTGAGAATCTAAAGGAGATTGAAGTTTCAAGTGCCAGAGACGTGATTCAA 840
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 781 GGTATTCATGTTGAGAATTTAAAGGAGATTGAAGTTTCAAGTGCCAGAGACGTGATCCAA 840
Query 841 CAATTGATGCAGGGTGCTGCAAACAGGAAAGTAGCCGCTACTAATATGAATCGTGCAAGT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CAATTGATGCAGGGTGCTGCAAACAGGAAAGTAGCTGCTACTAATATGAATCGTGCAAGT 900
Query 901 AGTCGATCCCACAGTGTATTTACATGTATCATCGAAAGCAAGTGGGTATCTCAAGGTGTA 960
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 901 AGTCGATCCCACAGTGTCTTTACATGTATCATCGAAAGCAAGTGGGTATCTCAAGGCGTA 960
Query 961 ACTCATCATCGTTTTGCACGGCTTAATCTTGTTGATTTAGCTGGATCTGAAAGGCAAAAG 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 961 ACTCATCATCGTTTTGCACGGCTTAATCTTGTTGATTTAGCTGGCTCTGAAAGGCAAAAG 1020
Query 1021 AGTTCAGGAGCTGAAGGTGAACGCCTCAAAGAAGCTACCAACATCAACAAGTCTCTTTCT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 AGTTCAGGAGCTGAAGGTGAACGCCTCAAAGAAGCAACCAACATCAACAAGTCTCTTTCT 1080
Query 1081 ACATTGGGGCTTGTAATCATGAATCTCGTAAGCGTTTCCAATGGAAAATCAGTTCATGTT 1140
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 ACATTGGGGCTTGTGATCATGAATCTCGTAAGCGTTTCCAATGGAAAATCAGTTCATGTT 1140
Query 1141 CCTTATCGAGATTCGAAGCTCACATTTCTGCTTCAGGATTCTCTTGGAGGGAATTCAAAG 1200
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1141 CCTTATCGAGACTCGAAGCTCACATTTCTGCTTCAGGATTCTCTTGGAGGAAATTCAAAG 1200
Query 1201 ACAATTATAATTGCGAATATTAGTCCATCTAGCAGTTGCTCATTGGAGACCCTAAGTACC 1260
||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1201 ACAATAATAATTGCTAATATTAGCCCATCTAGCAGTTGCTCACTGGAGACCCTAAGTACC 1260
Query 1261 TTGAAGTTTGCACAGCGTGCCAAGCTTATTAAGAACAATGCAATTGTCAACGAAGATGCG 1320
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TTGAAGTTTGCCCAGCGTGCCAAGCTTATTAAGAACAATGCAATTGTCAACGAAGATGCA 1320
Query 1321 TCTGGAGATGTTATTGCTATGCGGCTTCAAATTCAACAACTCAAGAAAGAAGTAACCCGC 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TCTGGAGATGTTATTGCTATGCGGCTTCAAATTCAACAACTTAAGAAAGAAGTAACCCGC 1380
Query 1381 TTAAGAGGAATGG-----G-TGGAGTAGACAATCAGGACATGGACACTATCTCAATGGGT 1434
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 TTAAGAGGAATGGTAAACGGTGGAGTAGACAATCAGGACATGGACACTATCTCAATGGGT 1440
Query 1435 TGCCCTGCCTCTCCAATGTCTCTCAAGTGGGATGGGTTCAATGGATCATTCACTCCTCTG 1494
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 TGCCCTGCTTCTCCAATGTCTCTCAAGTGGGATGGGTTCAATGGATCATTCACTCCTCTG 1500
Query 1495 ACAACTCACAAAAGGATGTCTAAGGTAAAAGACTACGAAGTTGCACTTGTGGGTGCTTTC 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1501 ACAACTCACAAAAGGATGTCTAAGGTAAAAGACTACGAAGTTGCACTTGTTGGTGCTTTC 1560
Query 1555 AGGAGAGAGAGGGAAAAGGACGTTGCTTTACAGGCTTTGACTGCTGAAAATGAGGCCTCA 1614
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 AGGAGAGAGAGGGAAAAGGATGCTGCTTTACAGGCTTTGGCTGCTGAAAATGAGGCCTCA 1620
Query 1615 ATGAAGTTGGAAAAGAAAAGAGAGGATGAAATACGAGGGCTGAAAATGATGTTAAAGCTC 1674
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 ATGAAATTGGAAAAGAAAAGAGAGGATGAAATACGAGGGCTGAAAATGATGTTAAAGCTC 1680
Query 1675 CGAGATTCAGCAATCAAGAGTTTACAAGGTGTAACTTCAGGAAAGATCCCTGTTGAAGCT 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1681 CGAGATTCAGCAATCAAGAGTTTACAAGGTGTAGCTTCAGGAAAGATCTCTGTTGAAGCA 1740
Query 1735 CATCTGCAAAAAGAAAAGGGTGACCTTATGAAGGAGATAGAGG 1777
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1741 CATCTGCAAAAGGAAAAGGGTGACCTTATGAAGGAGATTGAGG 1783
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 145912734882
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5