BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G45830.1
Length=4174
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg484963 jgi|Araly1|484963|fgenesh2_kg.5__955__AT3G45830.1 6564 0.0
> Ahg484963 jgi|Araly1|484963|fgenesh2_kg.5__955__AT3G45830.1
Length=4165
Score = 6564 bits (3554), Expect = 0.0
Identities = 3973/4173 (95%), Gaps = 38/4173 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGATCGAGAAGAGTAACGTCAAGGTTTCGAGGTTTGATCTAGAGTACTCTCATGGT 60
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGGCGATCGAGAAGAGTAACGTCAAGGTTACGAGGTTTGATCTAGAGTACTCACATGGT 60
Query 61 AGTGGTGATTCTATGTCAAGTTACGAAGAAAGACGTAAAAACTCAGTGG-TGAATAATGT 119
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 61 AGTGGTGAATCTATGTCAAGTTATGAAGAAAGACGTAAAAACTCAGTGGCT-AATAATGT 119
Query 120 TGATTCGGAGgatgaagatgatgattttgatgaagatgattctggagcaggttctgatga 179
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TGATTCTGAGGATGAAGATGATGATTTTGATGAAGATGATTCTGGAGCAGGTTCTGATGA 179
Query 180 ttttgatttgcttgaATTGGCGGAAACTGGTGCTGAGTTTTGTCAAGTTGGGAATGTTAC 239
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTTTGATTTGCTTGAATTAGCGGAAACTGGTGCTGAGTTTTGTCAAGTTGGGAATGTTAC 239
Query 240 TTGTAGTATTCCTTTTGAGTTGTATGATCTCCCTAGTCTT-GAAGATATACTCTCTGTTG 298
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 240 TTGTAGTATTCCTTTTGAGTTGTATGATCTCTCTAGT-TTGGAAGATATACTCTCTGTTG 298
Query 299 ATGTTTGGAATGAGTGTCTCACTGAGAAAGAGAGGTTTAGTCTCTCGAGTTATCTACCTG 358
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 ATGTTTGGAATGAGTGTCTCACTGAGGAAGAGAGGTTTAGTCTCTCGAGTTATCTACCTG 358
Query 359 ATGTTGATCAGCTTACGTTTATGCGTACTTTGAAAGAGCTTTTCGAGGGTTGCAATTTCC 418
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 359 ATGTCGATCAGCTTACTTTTATGCGTACTTTGAAAGAGCTTTTCGAGGGTCGGAATTTCC 418
Query 419 ACTTTGGTAGTCCTGTTAAGAAACTGTTTGATATGTTGAAGGGTGGGCAGTGTGAACCCA 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 419 ACTTTGGTAGTCCTGTTAAGAAACTGTTTGATATGTTAAAGGGTGGGCAGTGTGAACCGA 478
Query 479 GGAATACGCTTTATCTTGAAGGACGTAGTTTGTTTCTACGAACCAAACATTATCATAGTT 538
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 479 GGAATACGCTTTATCTCGAAGGACGTAGTTTGTTTCTAAGAATTAAACATTATCATAGTT 538
Query 539 TGAGGAAGTATCATAATGACATGGTGGTGAATCTTTGTCAGACGAGGGATGCTTGGACAA 598
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 539 TGAGGAAGTATCATAATGATATGGTGGTGAATCTTTGTCAGACGAGGGATGCTTGGGCAA 598
Query 599 GTTGTAAAGGGTATAGTATCGATGAGAAGCTCCGTGTCCTGAATATTGTGAAAAGCCAAA 658
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 GTTGTAAAGGGTATAGTATTGACGAGAAGCTTCGTGTACTGAATATTGTGAAAAGCCAAA 658
Query 659 AGACTCTGATGCGTGAGAAAAAGGATGATTTTGAGGATGATTCATCAGAGAAGGACGAAC 718
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 659 AGACTTTGATGCGTGAGAAAAAGGATGATTTTGAGGAGGATTCATCAGAGACGGAAGAAC 718
Query 719 CTTTTGATAAGCCTTGGGGAAGAAAGGGAAAGGATAGGAAGTCTACGCAAAAGAAATTGG 778
||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||
Sbjct 719 CTTTTGATAAGCCTTGGAGTAGAAAGGAAAAAGATAGGAAGTCTACACAACACAAATTGG 778
Query 779 CCCGTCATGCTGGTTATGGTGTTGATTCAGGTTTGGAATTTCCTA---GGCGGCAGCTGG 835
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 779 CCCGTCATTCTGGTTATGGTGTTGATTCAGGTTTGGAATTTCCTAGCCGGCGGCAGCTGG 838
Query 836 CGGCTGTAGAACAGGATTTATATGGTAA-ACCGAAGTCAAAACCGAAGTTTCCTTTTGCT 894
||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 839 CGGCTGTTGAACAGGATAGATATGG-AACACCAAAGTCGAAACCGAAGTTTCCTTTTACC 897
Query 895 AAAACGTCTGTTGGGCCATATGCTACAGGTTATAATGGGTATGGTATGAATTCTGCATAC 954
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 898 AAAACGTCTGTTGGGCCGTATGCTTCAGGTTATAATGGGTATGGTATGAATTCTGGATAC 957
Query 955 AACCCCTCTTCTCTCGTTAGGCAGAGGTATGGTTCAGAAGATAATATTGACGATGATGAT 1014
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 AACCCCTCTTCTCTTGTTAGGCAGAGGTATGGTTCAGAAGATAATATTGACGATGATGAT 1017
Query 1015 CAGGATCCACTCTTTGGAATGGGTTCTCGACGAGACCGTGAGAAACCTGGATATTCAAGG 1074
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||
Sbjct 1018 CAGGATCCACTCTTTGGAATGGGTTCTCGACGAGACCGGGATAAATCTGGATACTCAAGG 1077
Query 1075 CCTGGAAAGAAACACAAATCTTCAAGAGATGGAGAACCAATTTCTGAACATTTTATGGGT 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 CCTGGAAAGAAACACAAATCTTCAAGAGATGGAGAACCAATTTCTGAACATTTTATGGGT 1137
Query 1135 CCACCATATTCATCAAGGCAGTACCACAGCAATTACTCAAAATCGAGTAGATATGCTAAT 1194
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1138 CCACCATATTCATCAAGGCAGTCCCACAGCAATTACGCAAAATCGAGTAGATATGCAAAT 1197
Query 1195 AATATTCAGCCTCACGCATTTGCCGACCAGATGAAGCCTGTAAAAGGTAGTCTAGCAGAC 1254
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 AATATTCATCCTCATGCATTTGCCGACCAGATGAAGCCTGTAAAAGGTAGTCTAGCAGAC 1257
Query 1255 CTTCGTGGTGACTTATATCGGCATGGGAAGAATCATGGAGATGGCTTTTCTGTTGATCCC 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1258 CTTCGTGGTGACTTATATCGGCATGGGAAGAATCATGGAGATGCCTTTTCTGTTGATCCC 1317
Query 1315 AGATATATATCTGATGACTTGAATAGTAAAAGCAAAAAGTTGAAGTCTGAGAGGGACTCA 1374
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 AGATATATATCTGATGACTTGTCTGGTAAAAGCAAAAAGTTGAAGTCTGAGAGGGACTCA 1377
Query 1375 CCTGATACTAGTTTGAGATCTTATAGAGCTTCTATGCAACAAATGAACGAGAGGTTCTTA 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 CCTGATACTAGTTTGAGATCTTATAGAGCTTCTATGCAACAAATGAACGAGAGGTTCTTA 1437
Query 1435 AATTCTGATTTTGGCGAGAACCATGTGCAGGAAAAGATTAGGGTGAATGTGGTACCCAAT 1494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1438 AATTCTGATTTTGGCGAGAACCATGTGCAGGAAAAGATTAGGGTGAATGTGGTACCAAAT 1497
Query 1495 GCAAGGTCTGGTGTTGCGGCTTTCAGAGATAGCAGGATGTTCATGGGAAATGATGATACA 1554
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 GCGAGGTCTGGTGTTGCGGCATTCAGAGATAGCAGGATGTTCATGGGAAATGATGATACA 1557
Query 1555 GAGTCGGATTCATCCCATGGCTATGATGATGAGGAGGAGAGAAATCGCTTAATGCGGAAC 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||
Sbjct 1558 GAGTCGGATTCATCCCATGGCTATGATGATGAGGAAGAGAGAAACCGCGTAATACGGAAC 1617
Query 1615 AAATCTTCTGTCTCAGTTGGTGGGATGAATAATTCTCATTTTCCAATACTCAAATCCAGA 1674
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 AAATCTTCTGTCTCAGTTGGTGGGATGAATAATTCTCATTTTCCAATACTCAAATCCAGG 1677
Query 1675 CAAGATATTAAAAAGAGCAAATCCAGAAAGAAAGATATGCAGGAGAATGAATTGCTTGAT 1734
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1678 CAAGATAGTAAAAAGAGCAAATCCAGAAAGAAAGATATGCAGGAGACTGAATTGCTTGAT 1737
Query 1735 GGACGGAGTGCGTACTTGAAATATTTAGGCGTATCTGGAGAACACATCTATGCGCCAGGG 1794
||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 GGACGGAGTACTTACTTGAAATATTTAGGCGTACCTGGGGAACACATCTATGCGCCAGGG 1797
Query 1795 ACAGAGAAGCACTCCTTCAAGTCAAAACAGAAGGGTAAGATGCGTGACAGGAGTCCCTTA 1854
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 ACAGAGAAGCACTCCTTTAAGGCAAAACAGAAGGGTAAGATGCGTGACAGGAGTCCCTTA 1857
Query 1855 GAGAACTTTTCCTCTCGAGATTTTGAAGATGGCCCGATCACAAGCTTGAGTGAGTTTCAG 1914
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1858 AATAACTTTTCCTCTCGAGATTTTGAAGATGGCCCGATCACAAGCTTGAGTGAGTTGCAG 1917
Query 1915 GACAGAAACAACAGGAAGGAGTTTTTCAGGTCAAACAGGAATAGCCAGACAAGAGAGCAA 1974
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 GACAGAAACAACAGGAATGAGTTTTTCAGGTCAAACAAGAATAGCCAGACAAGAGAGCAA 1977
Query 1975 ATGATTGATAGAACACTATTTCAGAGACCATCTGCAAAACCAAATTTGTCTGGGAGAAAA 2034
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1978 ATGATTGATAGACCACTGTTTCAGAGACCATCTGCAAAACCATATTTGTCTGGGAGAAAA 2037
Query 2035 AGAGTCTTTGATGAAGATGACGAATCACATGAGATGAGAACATTGGTTAATG------CC 2088
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2038 AGGGGCTTTGATGAAGATGACGAATCACATGAGATGAGAACATTGGTTAATGATAGTGCC 2097
Query 2089 CGTGATAGACTTAGTAGGAAATATCAGGTTTCTGAGGATGATGGTAATAGTGGTGATGAA 2148
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 CGTGGCCGACTTAGTAGGAAATATCAGGTTTCTGAGGATGATGGTAATAGTGGTGATGAA 2157
Query 2149 AATTTAGAGGCCAGGTTGTTTGTTTCTTGCAATGCTCTGTCGAAAAAGAGGAAGACTAGA 2208
|||||||||||||||||||| ||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 AATTTAGAGGCCAGGTTGTTGGTTACATGCAGTACTGTGTCGAAAAAGAGGAAGACTAGA 2217
Query 2209 GAGTCTTTGATGGACATGGAGAGGAGGGAGGATAATGGTGATCTGCAGCTATATCCCGAC 2268
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 2218 GTCTCTTTGATGGACATGGAGAGGAGGGAGGATAATGGTGATCTGCAGCTTTATTCCGAC 2277
Query 2269 ATTCAACTA-CCGGTTGGTGATGTAACTGTCTCGAAGAGAAAGGGAAAGAAGAAAATGGA 2327
||||||| | ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 ATTCAAC-AGCCGGTTGATGATGTAATTGTGTCAAAGAGAAAGGGAAAGAAGAAAATGGA 2336
Query 2328 GGTTGATGTTGGTTTTCTTGATCTGGAAACCTCTGACATACCGAAAGCAAGTGAAGCAGA 2387
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2337 GGTTGATGTTGGTTTTATTGATCTGGAAACCTCTGACATACCGAAAGCAAGTGAAGTAGA 2396
Query 2388 GGTGGAAACCAAACCGCAGAAGAAGCCATTTGTGTTGATCACACCAACAGTTCACACTGG 2447
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2397 GGTGGAAACCAAGCCGCAGAAGAAGCCATTTGTGTTGATCACACCAACAGTTCACACTGG 2456
Query 2448 CTTCTCTTTCTCTATTGTACATCTTCTATCAGCAGTGCGTATGGCAATGACAAGTTTGCG 2507
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2457 CTTCTCTTTCTCTATTGTACATCTTCTATCAGCCGTACGTATGGCAATGACAAGTTTGCG 2516
Query 2508 TCCTGAAGATTCATTAGATGTTAGCAAATCTGTGGCAGTAGAGAATGCAGAACATGAAAC 2567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2517 TCCTGAAGATTCATTAGATGTTAGCAAATCTGTGGCAGTGGAGAACGCAGAACATGAAAC 2576
Query 2568 TGGAGAAAATGGTGCCTCCGTGCCCGAGGAGGCAGAGGATAACAAGTCGCCACAGCAGGG 2627
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 TGGAGAAAATGGTGCCTCCGTGCCCAAGGAGGCAGAGGATAACAAGTCGCCACAGCAGGG 2636
Query 2628 AAATGGGAACTTGCCATCCCTTACTATCCAGGAAATTGTTAGCTGCGTGAAGTCAAACCC 2687
|| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2637 AATTGGGAACTTGCCATCCCTCACTATCCAGGAGATTGTTAGCTGTGTGAAGTCAAACCC 2696
Query 2688 GGGAGATCCCTGTATCCTTGAGACACAAGAGCCGCTCCAGGATTTGATTAGAGGGGTTCT 2747
||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2697 GGGAGATCCTTGTATCCTTGAGACACAAGAGCCACTTCAGGATTTGATTAGAGGGGTTCT 2756
Query 2748 GAAAATCTTCTCTTCAAAAACCTCGCCTTTAGGGGCAAAGGGTTGGAAGCCACTTGTAAC 2807
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2757 GAAAATCTTCTCTTCGAAAACCTCGCCTTTAGGGGCAAAGGGTTGGAAGCCACTTGTAAC 2816
Query 2808 ATTTGAGAGGTCCACGAAATGCTGGTCTTGGATTGGCCCTGTTCTCGGTCCTTCTGATCA 2867
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2817 ATTTGAGAAGTCCACGAAATGCTGGTCTTGGATTGGCCCTGTTCTCAGTCCTTCTGATCA 2876
Query 2868 GGAGACTGTCGAAGAGGTAACATCGCCTGAAGCCTGGAGTCTCCCGCACAAGATGCTTGT 2927
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 AGAGACTGTTGAAGAGGTAACATCGCCTGAAGCCTGGGGTCTCCCGCACAAGATGCTTGT 2936
Query 2928 CAAGTTGGTTGATTCATTTGCAAATTGGCTGAAAACTGGCCAGGAAACTCTTCAGCAAAT 2987
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2937 CAAGTTGGTTGATTCGTTTGCAAATTGGCTGAAAAATGGCCAGGAAACTCTTCAGCAAAT 2996
Query 2988 AGGAAGTCTTCCTGAACCACCGTTGTCACTCATGCAGTGTAACCTTGATGAGAAAGAAAG 3047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2997 AGGAAGTCTTCCTGAACCACCGTTGTCACTCATGCAGTGTAACCTTGATGAGAAAGAAAG 3056
Query 3048 GTTTAAAGATCTGAGAGCACAAAAGAGCCTTAGTACGATTACCCAGAGTTCTGAAGAAGC 3107
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3057 GTTCAAAGATCTGAGAGCACAAAAGAGCCTTAGTACGATTACCAAGAGTTCTGAAGAAGC 3116
Query 3108 AAGAGCCTATTTCCGCAAAGAGGAATTTCTGAGGTACTCAATTCCGGACAGAGCCTTTGT 3167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3117 AAGAGCCTATTTCCGCAAAGAGGAATTTCTGAGGTACTCAATTCCGGACAGAGCCTTTGT 3176
Query 3168 TTACACAGCTGCTGATGGTAAGAAGTCAATTGTTGCTCCTCTGAGAAGAGGCGGAGGAAA 3227
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3177 GTACACAGCTGCTGATGGTAAGAAGTCAATTGTTGCTCCTCTGAGAAGAGGGGGAGGGAA 3236
Query 3228 GCCAACCTCGAAAGCTCGTGACCATTTCATGTTGAAACGCGAGAGACCACCACATGTCAC 3287
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3237 GCCAACCTCGAAAGCTCGGGATCATTTCATGTTGAAACGCGAGAGACCACCACATGTCAC 3296
Query 3288 AATCCTGTGTCTAGTGAGAGATGCTGCCGCCAGATTGCCTGGTAGTATTGGGACAAGAGC 3347
||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3297 AATTCTGTGTCTTGTGAGAGATGCTGCGGCCAGATTACCTGGTAGTATTGGGACAAGAGC 3356
Query 3348 TGATGTTTGTACCTTAATAAGAGACTCGCAGTATATCGTGGAGGATGTGTCTGATTCACA 3407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3357 TGATGTTTGTACCTTAATAAGAGACTCGCAGTATATCGTGGAGGATGTGTCTGATTCACA 3416
Query 3408 AGTGAATCAAGTCGTGAGTGGGGCCTTGGATCGTTTGCACTATGAGCGGGACCCTTGTGT 3467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3417 AGTGAATCAAGTCGTGAGTGGGGCCTTGGATCGTTTGCACTATGAACGGGACCCTTGTGT 3476
Query 3468 CCAATTCGATTCAGAGAGGAAACTGTGGGTGTATCTACACAGAGACAGAGAACAAGAAGA 3527
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3477 CCAATTCGATTCAGAGAGGAAACTGTGGGTGTATCTACACAGAGACAGAGAAGAAGAAGA 3536
Query 3528 TTTCGAGGATGATGGTACTTCATCCACAAAGAAGTGGAAGAGACCAAAGAAGGAAGCTGC 3587
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3537 TTTCGAGGATGATGGTACTTCATCCACAAAGAAATGGAAGAGACCAAAGAAAGAAGCTGC 3596
Query 3588 GGAGCAAACAGAGGAACAAGAAGCTGTCACTGTAGCTTTCCTTGGGAATGAAGAACAAAC 3647
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3597 AGAGCAAACAGAAGAACAAGAAGCTGTCACTGTAGCTTTCATTGGGAATGAAGAACAACC 3656
Query 3648 CGAAACTGAGATGGGTTCAGAACCAAAGACTGG-TGAGCCCACTGGTTTGGACGGAGATC 3706
|||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3657 CGAAACTGAGATGGGTACAGATCCAAAGAC-GGATGAGCCCACTGGTTTGGACGGAGATC 3715
Query 3707 AAGGTGCAACAGACCAACTGTGTAATGAGACTGAACAAGCTGCAGAGGAGCAAGATGGTG 3766
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3716 AAGGTGCAGCAGACCAACTGTGTAACGAGACTGAACAAGCTGCAGAGGAGCAAGATAATG 3775
Query 3767 AGAACACCGCTCAGGGTAATGAGCCAACGATATGGGAGCCTGATCCTGCTGTTGTTTCCA 3826
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3776 AGAACACCGCTCAGGGTAATGAGCCAACGATATGGGAGCCTGATCCTGCTGTTGTTTCTA 3835
Query 3827 ATCCGGTTGAGGATAACACGTTTATCTGCCAAGAGAACTCAGTGAATGATGATTTCGATG 3886
|||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3836 ATCCGGTTGACGAGAACACATTTATCTGCCAAGAGAACTCAGTGAATGATGATTTCGATG 3895
Query 3887 ATGAAACATGATTGGTGATACCAGGTGAAAATGCCAAGAGGGTATTTGATTAACAGAAAG 3946
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3896 ATGAAACATGATCGGTGATACCAGGTGAAAAGGCCAAGAGGGTATTTGATTAATAGAAAG 3955
Query 3947 AGAAGCTTATGGTG-ATTTGTTGTATAATT----GTTTGGTCTCTCAATAGATGTCAAAA 4001
||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 3956 AGAAGCTTATG-TGGATTTGTTGTATAATTAATTGTTTGGTC-C-CAATAGATGTCAAAA 4012
Query 4002 A-GAGTGAGATCACAGTCTCTCTCCCAAACAG-----A--GG-TTATTCCAATTGTTCTC 4052
| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||||
Sbjct 4013 AAGAGTGAGATCACAGTCTCTCTCACAAACAGCGTTGAAAGGGTTATTCCTATTGTTCTC 4072
Query 4053 ATGCCATGCATGTTTTTT-ATTCTTAAAGaaaaaaaGAATAGAAGTTAGTT-AGTGATCA 4110
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4073 ATGCCATCCATGTTTTTTTATTCTTAAAGAAAAAAAGAATAGAAGTTAGTTTAGTGATCA 4132
Query 4111 GTCTTATTTTGATTAAACATCAATATTTGATAT 4143
|| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4133 GTGTTATTTTGATTAAACATCAATATTTGATAT 4165
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 157824755231
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5