BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G46960.1 Length=4175 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg323324 jgi|Araly1|323324|fgenesh1_pm.C_scaffold_5000868 6460 0.0 Ahg485072 jgi|Araly1|485072|fgenesh2_kg.5__1064__AT3G46950.1 152 2e-35 > Ahg323324 jgi|Araly1|323324|fgenesh1_pm.C_scaffold_5000868 Length=4110 Score = 6460 bits (3498), Expect = 0.0 Identities = 3919/4112 (95%), Gaps = 70/4112 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAACAAAGTCGAAGCAGGCAATGAGCTCGGCTTCCGGGTCGGATTCTCCGGTCATGGT 60 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGAACAGAGTCCAAGCAGGCAATGAGCTCGGCTTCCGTGTCGGATTCTCCGGTCATGGT 60 Query 61 GGTCACCTCCGCGTCGAGCCTTTTTACACGGCCGAGAGAGACGACGCAC-TGAACTCACT 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 61 GGTCACCTCCGCGTCGAGCCTCTTTACACGGCCGAGAGAGACGACGC-CGTGAACTCACT 119 Query 120 TCCCGATTTTGTATCCCCTCCTGCATTTGCCAAGGAAACAAAAGAATCAATAAAGAAACA 179 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 TCCCGATTTCGTATCCCCTCCTGCATTTGCCAAGGAAACAAAAGAATCAATAAAGAAACA 179 Query 180 TATTGAGGAGAAGTATCTCATCCCGAGACTGGAACCGGATCAGTTTTCTGCTGAAAAAGC 239 |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 180 TATTGAGGAGAAATATCTCCTACCAAGACTGGAACCGGATCAATTTTCTGCTGAAAAAGC 239 Query 240 TGAGAATCAGTGGGATTTTGATTGGTTTTCCAGGGTGAAGATGCCCCTTCAACCCTCTTT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 240 TGAGAATCAGTGGGATTTTGATTGGTTTTCCAGGGTGAAGGTGCCCCTTCAACCCTCTTT 299 Query 300 GCCAAGGTCCGTTGTGGTTCCGACTTGGGAGTTGCCATTCAGGCGTCAAAAAGAGGATAC 359 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 300 GCCAAGGCCCGTTGTGGTTCCGACTTGGGAGTTGCCATTCAGGCGTCAAAAAGTGGATAC 359 Query 360 TGAGAACGGAGCATGGGAGCCAAAATCAGTGGAGGTGGATTTGTCAGAACAAATGTATGG 419 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 360 TGAGAATGGAGCGTGGGAGCCAAAATCAGTGGAGGTGGATTTGTCAGACCAAATGTATGG 419 Query 420 GGATCAAGATTCTGGATTTTTTCCACGAATGGTAGGACCTCCGAAGGATTTTCTGAGAGG 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 AGATCAAGATTCTGGATTTTTTCCACGAATGGTAGGACCTCCGAAGGATTTTCTGAGAGG 479 Query 480 AAGTGTCAACAATCGCCCTTTCCGTCCAGGTGGCTTGGAGGATTCACAGTCTTCAGAGAG 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 AAGTGTCAACAATCGCCCTTTCCGTCCAGGTGGCTTGGAGGATTCACAGTCTTCAGAGAG 539 Query 540 AGTCCTTCCAGAGGGTGTCTCTAGTGGCCAATGGGTACAGGAATTGCTCAATGGGGGTCC 599 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 540 AGTCCTTCCAGAGGGTGTCTCTAGCGGCCAATGGGTACAGGAATTGCTAAATGGGGGTCC 599 Query 600 TGCTCAAACTGTTCCTCCTAGTTTTAAGCAGAGTTTAGATCTTGGAGATCTGATGCCATA 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 TGCTCAAACTGTTCCTCCTAGTTTTAAGCAGAGTTTAGATCTTGGAGATCTGATGCCATA 659 Query 660 TCCCCAAACATGGAGCGTTTATGAGGATCATAGTTCACATGGCAATGCTTCAGATGAAAA 719 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 660 TCCCCAAACATGGAGCGTTTATGAGGATCAGAGTTCACATGGCAATGCTTCTGATGAAAA 719 Query 720 ---------T---TC---G--A---G-CAAGTTGTCTATTCAGTTTGACGATCTGTTCAA 758 | || | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 720 TTCGGTCTGTAGATCAATGTCACTGGTCAAGTTGTCTATTCAGTTTGACGATCTGCTCAA 779 Query 759 GAAGGCATGGGAAGAAGATACTTTCTCTGAACTTGAG-G-GA------G-------A-T- 801 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | | | Sbjct 780 GAAGGCATGGGAAGAAGATACTTTCTCCGAACTTGAGAGAGATGGTGTGTTTAATCATTC 839 Query 802 -GATCATACAGCTGGATCTGAGTCTCCAAAGGCGGAAGCTGAACCCGATGCTAAAGCGAG 860 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 840 ATATCATACAGCTGGATCTGAGTCTCCAAAGGCAGAAGCTGAACCCGAAGCTAAAGCGAG 899 Query 861 CATAAGCAATGAAGTCAGCAAAGGACTAGAGACTGACGTCACTGTGCTGGATGAGATTTT 920 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 CATAAGCAATGAAGTCAGCAAGGGACTAGAGACTGACGTCACTGTGCTGGATGAGATTTT 959 Query 921 GTCATCAGCAAAAACAGCAATAATGTCTGAAGAGGCAGTTACTGGGAGCAGCGATAAACA 980 |||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 960 GTCATCAGCAAAAACAGCAATATTGACGGACGAGGCAGTTACTGGGAACAGCGATAAACA 1019 Query 981 ACTACGGAAAGAGGGATGGGCCACTAAAGGAGATAGCCAAGACATTGCAGACCGGTTTTA 1040 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 ACTACGGAAAGAGGGATGGGCCACGAAAGGAGATAGCCAAGACATTGCAGACCGGTTTTA 1079 Query 1041 TGAGCTTGTTCCTGACATGGCGATTGAATTCCCTTTCGAATTGGACAACTTTCAGAAGGA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1080 TGAGCTTGTTCCTGACATGGCGATTGAATTCCCTTTCGAATTAGACAACTTTCAGAAGGA 1139 Query 1101 GGCTATCTGTTGTTTAGAAAAGGGAGAGTCTGTTTTTGTAGCAGCACATACATCGGCGGG 1160 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1140 GGCTATCTGTTGTTTAGAAAAGGGGGAGTCTGTTTTTGTAGCAGCACATACATCAGCGGG 1199 Query 1161 GAAGACAGTTGTTGCAGAATATGCATTCGCTTTGGCCACCAAGCACTGTACACGAGCGGT 1220 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1200 GAAGACAGTTGTTGCAGAATATGCATTCGCTTTGGCCACCAAGCACTGTACACGAGCTGT 1259 Query 1221 TTATACTGCTCCAATTAAAACCATCAGCAACCAAAAATACAGAGATTTTTGTGGGAAGTT 1280 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1260 TTACACTGCTCCAATTAAAACCATCAGCAACCAAAAATACAGAGATTTTTGTGGGAAATT 1319 Query 1281 TGATGTAGGACTTCTCACAGGTGATGTTAGCATAAGGCCAGAGGCATCTTGTCTGATCAT 1340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1320 TGATGTAGGACTTCTCACAGGTGATGTTAGCATAAGGCCAGAGGCATCTTGTCTGATCAT 1379 Query 1341 GACAACTGAAATATTAAGGTCAATGCTTTATCGTGGTGCTGATATCATACGTGATATAGA 1400 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1380 GACTACTGAAATATTAAGGTCAATGCTTTATCGTGGTGCTGATATCATACGTGATATAGA 1439 Query 1401 ATGGGTTATATTTGATGAAGTTCACTATGTCAATGACGTAGAGAGAGGGGTTGTTTGGGA 1460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1440 ATGGGTTATATTTGATGAAGTTCACTATGTCAATGACGTAGAGAGAGGGGTTGTTTGGGA 1499 Query 1461 AGAAGTCATCATCATGTTGCCAAGGCATATAAATTTTGTCCTCCTTTCTGCAACGGTGCC 1520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1500 AGAAGTCATCATCATGTTGCCAAGGCATATAAATTTTGTCCTCCTTTCTGCAACGGTGCC 1559 Query 1521 AAACACATTTGAATTTGCTGATTGGATTGGCCGAACAAAACAAAAGGAGATACGTGTTAC 1580 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1560 AAACACATTTGAATTTGTTGATTGGATTGGCCGAACAAAACAAAAAGAGATACGTGTTAC 1619 Query 1581 TGGCACGACAAAAAGACCAGTTCCCCTAGAGCATTGTCTTTTTTACTCTGGAGAACTCTA 1640 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 1620 TGGCACGACAAAAAGACCAGTTCCCCTAGAGCATTGTCTATTTTATTCTGGAGAACTCTA 1679 Query 1641 CAAAGTTTGTGAGAACGAAGTTTTTCTTTCAAAAGGGATAAAGGATGCTAAAGATTCACA 1700 ||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 CAAAGTTTGTGAGGATGAAGTTTTTATTCCTAAAGGGATAAAGGATGCTAAAGATTCACA 1739 Query 1701 AAAGAAGAAGAATTCAAATGCAGTTAGTGTTGCACCTAAACAACAAATGGGATCTTCAGC 1760 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||| Sbjct 1740 AAAGAAGAAGAATTCAAATGCAGTTAGTGTCGCTCCTAAACAGTATACGGGATCTTCAGC 1799 Query 1761 TCATCAAGATGGGAGCAAATCTCAGAAACATGAAGCTCATTCTCGTGGCAAGCAGAATAA 1820 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1800 TCATCAAGATGGGAACAAATCTCAGAAACATGTAGCTCATTCTCGTGGCAAGCAGAATAA 1859 Query 1821 ACACTCAAGTGTAAAAGATGTGGGAAAATCCTCTTACAGTGGTAACAGTCAGAACAATGG 1880 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1860 ACACTCAAGTGCAAAAGATGTGGGAAAATCCTCTTACAGTGGTAACAGTCAGAACAATGG 1919 Query 1881 GGCATTTAGACGATCAGCAGCTTCAAATTGGTTACTGCTTATCAACAAGCTTTCAAAAAT 1940 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1920 GGCATTTAGACGATCAGCAGCTTCAAATTGGTTACTGCTTATCAACAAGCTCTCAAAAAA 1979 Query 1941 GTCCCTATTACCTGTGGTTGTCTTCTGTTTCTCGAAGAATTATTGTGATAGGTGTGCCGA 2000 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1980 GTCCCTGTTACCTGTGGTTGTCTTCTGTTTCTCGAAGAATTATTGTGATAGGTGTGCCGA 2039 Query 2001 CGCCTTGACTGGGACCGACCTCACCAGTAGCTCTGAGAAAAGTGAAATCCGTGTCTTTTG 2060 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2040 CGCCTTAACTGGGACCGACCTCACCAGTAGCTCTGAGAAAAGTAAAATCCGTGTCTTTTG 2099 Query 2061 CGATAAAGCGTTTTCAAGATTGAAAGGGTCTGATCGGAATTTACCTCAGGTTCTCAGACT 2120 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2100 CGATAAAGCATTTTCAAGATTGAAAGGGTCTGATCGGAATTTACCTCAGGTTCTCAGACT 2159 Query 2121 CCAAAGCTTACTTCATAGAGGAATTGGTGTTCATCATGCTGGGCTGCTTCCAATTGTAAA 2180 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2160 TCAAAGCTTACTTCATAGAGGAATCGGTGTTCATCATGCTGGGCTGCTTCCAATTGTAAA 2219 Query 2181 GGAAGTTGTTGAAATGCTTTTTTGCCGTGGTGTTATTAAGGTGCTATTTTCAACGGAGAC 2240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2220 GGAAGTTGTTGAAATGCTTTTTTGCCGTGGTGTTATTAAGGTGCTATTTTCAACGGAGAC 2279 Query 2241 ATTTGCCATGGGGGTTAATGCTCCAGCTAGAACGGTCGTTTTTGATGCTTTGAGGAAGTT 2300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2280 ATTTGCCATGGGGGTTAATGCTCCAGCTAGAACGGTCGTTTTTGATGCTTTGAGGAAGTT 2339 Query 2301 TGATGGCAAGGAATTTAGACAATTGCTTCCTGGAGAGTACACTCAAATGGCAGGACGTGC 2360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2340 TGATGGCAAGGAATTTAGACAATTGCTTCCTGGAGAGTACACTCAAATGGCAGGACGTGC 2399 Query 2361 TGGCAGAAGAGGACTTGACAAAACGGGCACAGTTGTTGTCATGTGTCGCGATGAAGTTCC 2420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2400 TGGCAGAAGAGGACTTGACAAAACGGGCACAGTTGTTGTCATGTGTCGCGATGAAGTTCC 2459 Query 2421 AGATGAGAGTGATCTGAGGCGTGTAATTGTTGGAAGCGCAACAAGACTAGAATCTCAGTT 2480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2460 AGATGAGAGTGATCTGAGGCGTGTAATTGTTGGAAGCGCAACAAGACTAGAATCTCAGTT 2519 Query 2481 TCGACTAACCTACATAATGATCCTCCATCTTTTACGTGTTGAAGAATTAAAGGTGGAGGA 2540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2520 TCGACTAACCTACATAATGATCCTCCATCTTTTACGTGTTGAAGAATTGAAGGTGGAGGA 2579 Query 2541 CATGCTGAAAAGAAGTTTTGCTGAATTTCATGCCCAGAAGAAACTACCCGAGAAACAACA 2600 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2580 CATGCTGAAAAGAAGTTTTGCTGAATTCCATGCTCAGAAGAAACTGCCCGAGAAACAACA 2639 Query 2601 GCTTCTCATGATAAAACGTTCTCTACCAA-C-----TA---AA-C--AT--ATTGA---A 2643 ||||||||||| ||||||||||||||||| | || || | || ||||| | Sbjct 2640 GCTTCTCATGAGAAAACGTTCTCTACCAATCAAAAATATCGAAGCTGATCTATTGATTTA 2699 Query 2644 T-------G-T--ATTAAAGGTGAACCGGCAATTGAAGATTACTATGACATGTACATGGA 2693 | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2700 TTCATCCAGATGTATTAAAGGTGAACCGGCAATTGAAGATTACTATGACATGTATATGGA 2759 Query 2694 AGCAAATGAATATAACAACAAGATGTCGGAAGCGGTCATGCAGTCTCCTTATGCCCAGAG 2753 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2760 AGCAAATGAATATAACAGCAAGATGTCGGAAGCGGTCATGCAGTCTCCTTATGCCCAGAG 2819 Query 2754 TTTTCTTGTACAAGGAAGAGTAGTGGTCATGAAATCTGGAATGGGCATAGACAATTTACT 2813 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2820 TTTTCTTGTACCAGGAAGAGTAGTGGTCATGAAATCTGGAACGGGCATAGACAATTTACT 2879 Query 2814 CGGAATCGTTCTGAAGGGACCTTCCAACACTAACAGACAATATGTTGTTTTGGTGATAAA 2873 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2880 CGGAGTCGTTCTGAAGGGACCTTCCAACACTAACAGACAATATGTTGTTTTGGTGAAAAA 2939 Query 2874 ATCTGAAATACCGCCACCGGAGAAAAATATGGTCAGCATTGGCAAGAAAAGTTCAGATCC 2933 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 2940 ATCTGAAATACCGCCACCAGAGAGAAATATGGTGAGCATTGGCAAGAAAAGCTCAGAGCC 2999 Query 2934 TTCTCAAGGTTATTTTATTGCGCCTAAATCAAAACGTGGTTTTGAAGAAGAATTTTATAC 2993 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3000 TTCTCAAGGTTATTTTATTGCGCCCAAATCAAAACGTGGTTTTGAAGAAGAATTTTATAC 3059 Query 2994 AAAGCCGAGCTCTCGTAAAGGTCCCGTTGTAATAAAGATAGAGCTCCCGTACCATGGGGT 3053 ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3060 GAAGCCGAGCTCTCGTAAAGGTTCCGCTGTGATAAAGATAGAGCTCCCGTACCATGGAGT 3119 Query 3054 TGCTGCTGGTGTAGGTTACGAGGTTAAAGGGTTTGATAACAAAGAATTTTTGTGCATATG 3113 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3120 CGCTGCTGGCGTAGGTTACGAGGTTAAAGGGTTTGATAACAAAGAATTTTTGTGCATATG 3179 Query 3114 CGATAGCAAGATAAAGATTGATCAGGTGCGCCTACTCGAGGATGGGAACAAGGCAGCTTT 3173 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3180 CGATAGCAAGATAACGATTGATCAGGTGCGTCTACTCGAGGATGGGAACAGGGCAGCTTT 3239 Query 3174 TTCTCAGACGGTTCAACAGCTTCTGGATCTGAAATCAGACGGAAACAAATTTCCTCCTGC 3233 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 3240 TTCGCAGACGGTTCAACAGCTTTTGGATCTGAAATCAGACGGAAACAAGTATCCTCCTGC 3299 Query 3234 TCTAGACCCAGTAAAAGATTTGAAGCTGAAAGATGCTGAGCTTGTGGAGACATACTATAA 3293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| Sbjct 3300 TCTAGACCCAGTAAAAGATTTGAAGCTGAAAGATGTTGAGCGTGTGGAGACGTACTATAA 3359 Query 3294 ATGGACCAACCT-ATTGCAAAAGATGTCCATGAATAAGTGCCACGGTTGTGTCAAATTGG 3352 |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3360 ATGGAC-AAGCTTATTGCAAAAGATGTCCATGAATAAGTGCCAAGGTTGTGTCAAATTGG 3418 Query 3353 AAGAGCACATGAAGTTAGCTAGGGAGATTAAGAAGCATAAGACGGATCTCAAAGATCTTG 3412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3419 AAGAGCACATGAAGTTAGCTAGGGAGATTAAGAAGCATAAGAATGATCTCAAAGATCTTG 3478 Query 3413 AATTTCAAATGTCTGATGAAGCCCTATTACAAATGCCTGCCTTTCAGGGCCGGATCGATG 3472 ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3479 AATTTCAAATGTCAGATGAAGCCCTATTACAGATGCCTGCGTTTCAGGGCCGGATCGATG 3538 Query 3473 TTCTGAAGAACATTGGGTGTATAGATGATGACCTCGTCGTCCAAATCAAAGGTCGTGTCG 3532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3539 TTCTGAAGAACATTGGGTGTATAGATGATGACCTCGTCGTCCAAATCAAAGGCCGTGTCG 3598 Query 3533 CTTGCGAGATGAATTCTGGGGAAGAATTGATTTGCACAGTGTGTCTGTTCGAGAATCAAT 3592 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3599 CTTGCGAGATGAATTCTGGGGAAGAGTTGATTTGCACAGTGTGTCTGTTCGAGAATCAAT 3658 Query 3593 TCGAAGAATTAGAACCAGAAGAAGCAGTGGCTATAATGTCTGCCTTTGTCTTCCAACAGA 3652 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3659 TCGAAGAATTAGAACCAGAAGAAGCAGTGGCTATAATGTCTGCCTTTGTCTTCCAACAGA 3718 Query 3653 AAAACACTTCAGCGCCTACACTAACTCCTAAGCTGGCTAAGGCTAAACAAAGACTCTATG 3712 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3719 AAAACACTTCAGCGCCTTCACTTACTCCTAAGCTGGCTAAGGCTAAACAAAGACTCTATG 3778 Query 3713 ATACAGCAATCAGACTTGGTGAACTTCAAGCTCAGTACAATTTACAAATAGACCCTGAAG 3772 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3779 ATACAGCAATCAGACTTGGTGAACTTCAAGCTCAGTACAATTTACAAATAGACCCTGAAG 3838 Query 3773 AATATGCTCAGGAGAATCTCAAATTTGGTCTGGTCGAAGTCGTCTATGAGTGGGCAAAGG 3832 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3839 AATATGCCCAGGAGAATCTCAAATTCGGTCTGGTTGAAGTCGTCTATGAGTGGGCAAAGG 3898 Query 3833 GGACTCCATTTGCAGAGATATGTGAACTGACAGATGTCCCGGAAGGTCTGATAGTTCGAA 3892 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3899 GGACTCCATTTGCAGAGATATGTGAACTGACGGATGTCCCGGAAGGTCTGATAGTTCGAA 3958 Query 3893 CCATTGTGAGATTGGATGAGACATGCCGTGAATTCAAGAACGCAGCTGCCATTATGGGGA 3952 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3959 CCATTGTGAGATTGGATGAGACGTGCCGTGAGTTCAAGAACGCAGCCGCCATTATGGGGA 4018 Query 3953 ACTCGGCGTTACACAAGAAAATGGATGCAGCTTCAAATGCCATAAAACGTGACATCGTCT 4012 |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4019 ACTCAGCGTTACATAAGAAAATGGATGCGGCTTCAAATGCTATAAAACGTGACATCGTCT 4078 Query 4013 TTGCGGCTAGTCTGTATGTGACCGGAGTGTAA 4044 |||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4079 TTGCGGCTAGTCTGTATGTGACCGGAGTATAA 4110 > Ahg485072 jgi|Araly1|485072|fgenesh2_kg.5__1064__AT3G46950.1 Length=1474 Score = 152 bits (82), Expect = 2e-35 Identities = 89/92 (97%), Gaps = 1/92 (1%) Strand=Plus/Minus Query 4085 CACTTAACTTGAAATTCAAATCACTAAACATGTCCACA-AATATAGTAGTTAAATTTTTC 4143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| Sbjct 1474 CACTTAACTTGAAATTCAAATCACTAAACATGTCCATAGAATATAGTCGTTAAATTTTTC 1415 Query 4144 GTTACGACTATTACAGAAATGGATTTCAGTTT 4175 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1414 GTTACGACTATTACAGAAATGGATTTCAGTTT 1383 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 157862812804 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5