BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT3G46960.1

Length=4175
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg323324 jgi|Araly1|323324|fgenesh1_pm.C_scaffold_5000868          6460    0.0  
  Ahg485072 jgi|Araly1|485072|fgenesh2_kg.5__1064__AT3G46950.1         152    2e-35


> Ahg323324 jgi|Araly1|323324|fgenesh1_pm.C_scaffold_5000868
Length=4110

 Score = 6460 bits (3498),  Expect = 0.0
 Identities = 3919/4112 (95%), Gaps = 70/4112 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGAACAAAGTCGAAGCAGGCAATGAGCTCGGCTTCCGGGTCGGATTCTCCGGTCATGGT  60
             ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGAACAGAGTCCAAGCAGGCAATGAGCTCGGCTTCCGTGTCGGATTCTCCGGTCATGGT  60

Query  61    GGTCACCTCCGCGTCGAGCCTTTTTACACGGCCGAGAGAGACGACGCAC-TGAACTCACT  119
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct  61    GGTCACCTCCGCGTCGAGCCTCTTTACACGGCCGAGAGAGACGACGC-CGTGAACTCACT  119

Query  120   TCCCGATTTTGTATCCCCTCCTGCATTTGCCAAGGAAACAAAAGAATCAATAAAGAAACA  179
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120   TCCCGATTTCGTATCCCCTCCTGCATTTGCCAAGGAAACAAAAGAATCAATAAAGAAACA  179

Query  180   TATTGAGGAGAAGTATCTCATCCCGAGACTGGAACCGGATCAGTTTTCTGCTGAAAAAGC  239
             |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  180   TATTGAGGAGAAATATCTCCTACCAAGACTGGAACCGGATCAATTTTCTGCTGAAAAAGC  239

Query  240   TGAGAATCAGTGGGATTTTGATTGGTTTTCCAGGGTGAAGATGCCCCTTCAACCCTCTTT  299
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  240   TGAGAATCAGTGGGATTTTGATTGGTTTTCCAGGGTGAAGGTGCCCCTTCAACCCTCTTT  299

Query  300   GCCAAGGTCCGTTGTGGTTCCGACTTGGGAGTTGCCATTCAGGCGTCAAAAAGAGGATAC  359
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  300   GCCAAGGCCCGTTGTGGTTCCGACTTGGGAGTTGCCATTCAGGCGTCAAAAAGTGGATAC  359

Query  360   TGAGAACGGAGCATGGGAGCCAAAATCAGTGGAGGTGGATTTGTCAGAACAAATGTATGG  419
             |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  360   TGAGAATGGAGCGTGGGAGCCAAAATCAGTGGAGGTGGATTTGTCAGACCAAATGTATGG  419

Query  420   GGATCAAGATTCTGGATTTTTTCCACGAATGGTAGGACCTCCGAAGGATTTTCTGAGAGG  479
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420   AGATCAAGATTCTGGATTTTTTCCACGAATGGTAGGACCTCCGAAGGATTTTCTGAGAGG  479

Query  480   AAGTGTCAACAATCGCCCTTTCCGTCCAGGTGGCTTGGAGGATTCACAGTCTTCAGAGAG  539
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   AAGTGTCAACAATCGCCCTTTCCGTCCAGGTGGCTTGGAGGATTCACAGTCTTCAGAGAG  539

Query  540   AGTCCTTCCAGAGGGTGTCTCTAGTGGCCAATGGGTACAGGAATTGCTCAATGGGGGTCC  599
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  540   AGTCCTTCCAGAGGGTGTCTCTAGCGGCCAATGGGTACAGGAATTGCTAAATGGGGGTCC  599

Query  600   TGCTCAAACTGTTCCTCCTAGTTTTAAGCAGAGTTTAGATCTTGGAGATCTGATGCCATA  659
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   TGCTCAAACTGTTCCTCCTAGTTTTAAGCAGAGTTTAGATCTTGGAGATCTGATGCCATA  659

Query  660   TCCCCAAACATGGAGCGTTTATGAGGATCATAGTTCACATGGCAATGCTTCAGATGAAAA  719
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  660   TCCCCAAACATGGAGCGTTTATGAGGATCAGAGTTCACATGGCAATGCTTCTGATGAAAA  719

Query  720   ---------T---TC---G--A---G-CAAGTTGTCTATTCAGTTTGACGATCTGTTCAA  758
                      |   ||   |  |   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  720   TTCGGTCTGTAGATCAATGTCACTGGTCAAGTTGTCTATTCAGTTTGACGATCTGCTCAA  779

Query  759   GAAGGCATGGGAAGAAGATACTTTCTCTGAACTTGAG-G-GA------G-------A-T-  801
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||      |       | | 
Sbjct  780   GAAGGCATGGGAAGAAGATACTTTCTCCGAACTTGAGAGAGATGGTGTGTTTAATCATTC  839

Query  802   -GATCATACAGCTGGATCTGAGTCTCCAAAGGCGGAAGCTGAACCCGATGCTAAAGCGAG  860
               ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  840   ATATCATACAGCTGGATCTGAGTCTCCAAAGGCAGAAGCTGAACCCGAAGCTAAAGCGAG  899

Query  861   CATAAGCAATGAAGTCAGCAAAGGACTAGAGACTGACGTCACTGTGCTGGATGAGATTTT  920
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900   CATAAGCAATGAAGTCAGCAAGGGACTAGAGACTGACGTCACTGTGCTGGATGAGATTTT  959

Query  921   GTCATCAGCAAAAACAGCAATAATGTCTGAAGAGGCAGTTACTGGGAGCAGCGATAAACA  980
             |||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  960   GTCATCAGCAAAAACAGCAATATTGACGGACGAGGCAGTTACTGGGAACAGCGATAAACA  1019

Query  981   ACTACGGAAAGAGGGATGGGCCACTAAAGGAGATAGCCAAGACATTGCAGACCGGTTTTA  1040
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1020  ACTACGGAAAGAGGGATGGGCCACGAAAGGAGATAGCCAAGACATTGCAGACCGGTTTTA  1079

Query  1041  TGAGCTTGTTCCTGACATGGCGATTGAATTCCCTTTCGAATTGGACAACTTTCAGAAGGA  1100
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1080  TGAGCTTGTTCCTGACATGGCGATTGAATTCCCTTTCGAATTAGACAACTTTCAGAAGGA  1139

Query  1101  GGCTATCTGTTGTTTAGAAAAGGGAGAGTCTGTTTTTGTAGCAGCACATACATCGGCGGG  1160
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1140  GGCTATCTGTTGTTTAGAAAAGGGGGAGTCTGTTTTTGTAGCAGCACATACATCAGCGGG  1199

Query  1161  GAAGACAGTTGTTGCAGAATATGCATTCGCTTTGGCCACCAAGCACTGTACACGAGCGGT  1220
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1200  GAAGACAGTTGTTGCAGAATATGCATTCGCTTTGGCCACCAAGCACTGTACACGAGCTGT  1259

Query  1221  TTATACTGCTCCAATTAAAACCATCAGCAACCAAAAATACAGAGATTTTTGTGGGAAGTT  1280
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1260  TTACACTGCTCCAATTAAAACCATCAGCAACCAAAAATACAGAGATTTTTGTGGGAAATT  1319

Query  1281  TGATGTAGGACTTCTCACAGGTGATGTTAGCATAAGGCCAGAGGCATCTTGTCTGATCAT  1340
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1320  TGATGTAGGACTTCTCACAGGTGATGTTAGCATAAGGCCAGAGGCATCTTGTCTGATCAT  1379

Query  1341  GACAACTGAAATATTAAGGTCAATGCTTTATCGTGGTGCTGATATCATACGTGATATAGA  1400
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1380  GACTACTGAAATATTAAGGTCAATGCTTTATCGTGGTGCTGATATCATACGTGATATAGA  1439

Query  1401  ATGGGTTATATTTGATGAAGTTCACTATGTCAATGACGTAGAGAGAGGGGTTGTTTGGGA  1460
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1440  ATGGGTTATATTTGATGAAGTTCACTATGTCAATGACGTAGAGAGAGGGGTTGTTTGGGA  1499

Query  1461  AGAAGTCATCATCATGTTGCCAAGGCATATAAATTTTGTCCTCCTTTCTGCAACGGTGCC  1520
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1500  AGAAGTCATCATCATGTTGCCAAGGCATATAAATTTTGTCCTCCTTTCTGCAACGGTGCC  1559

Query  1521  AAACACATTTGAATTTGCTGATTGGATTGGCCGAACAAAACAAAAGGAGATACGTGTTAC  1580
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1560  AAACACATTTGAATTTGTTGATTGGATTGGCCGAACAAAACAAAAAGAGATACGTGTTAC  1619

Query  1581  TGGCACGACAAAAAGACCAGTTCCCCTAGAGCATTGTCTTTTTTACTCTGGAGAACTCTA  1640
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct  1620  TGGCACGACAAAAAGACCAGTTCCCCTAGAGCATTGTCTATTTTATTCTGGAGAACTCTA  1679

Query  1641  CAAAGTTTGTGAGAACGAAGTTTTTCTTTCAAAAGGGATAAAGGATGCTAAAGATTCACA  1700
             ||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1680  CAAAGTTTGTGAGGATGAAGTTTTTATTCCTAAAGGGATAAAGGATGCTAAAGATTCACA  1739

Query  1701  AAAGAAGAAGAATTCAAATGCAGTTAGTGTTGCACCTAAACAACAAATGGGATCTTCAGC  1760
             |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | | ||||||||||||
Sbjct  1740  AAAGAAGAAGAATTCAAATGCAGTTAGTGTCGCTCCTAAACAGTATACGGGATCTTCAGC  1799

Query  1761  TCATCAAGATGGGAGCAAATCTCAGAAACATGAAGCTCATTCTCGTGGCAAGCAGAATAA  1820
             |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1800  TCATCAAGATGGGAACAAATCTCAGAAACATGTAGCTCATTCTCGTGGCAAGCAGAATAA  1859

Query  1821  ACACTCAAGTGTAAAAGATGTGGGAAAATCCTCTTACAGTGGTAACAGTCAGAACAATGG  1880
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1860  ACACTCAAGTGCAAAAGATGTGGGAAAATCCTCTTACAGTGGTAACAGTCAGAACAATGG  1919

Query  1881  GGCATTTAGACGATCAGCAGCTTCAAATTGGTTACTGCTTATCAACAAGCTTTCAAAAAT  1940
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| 
Sbjct  1920  GGCATTTAGACGATCAGCAGCTTCAAATTGGTTACTGCTTATCAACAAGCTCTCAAAAAA  1979

Query  1941  GTCCCTATTACCTGTGGTTGTCTTCTGTTTCTCGAAGAATTATTGTGATAGGTGTGCCGA  2000
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1980  GTCCCTGTTACCTGTGGTTGTCTTCTGTTTCTCGAAGAATTATTGTGATAGGTGTGCCGA  2039

Query  2001  CGCCTTGACTGGGACCGACCTCACCAGTAGCTCTGAGAAAAGTGAAATCCGTGTCTTTTG  2060
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2040  CGCCTTAACTGGGACCGACCTCACCAGTAGCTCTGAGAAAAGTAAAATCCGTGTCTTTTG  2099

Query  2061  CGATAAAGCGTTTTCAAGATTGAAAGGGTCTGATCGGAATTTACCTCAGGTTCTCAGACT  2120
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2100  CGATAAAGCATTTTCAAGATTGAAAGGGTCTGATCGGAATTTACCTCAGGTTCTCAGACT  2159

Query  2121  CCAAAGCTTACTTCATAGAGGAATTGGTGTTCATCATGCTGGGCTGCTTCCAATTGTAAA  2180
              ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2160  TCAAAGCTTACTTCATAGAGGAATCGGTGTTCATCATGCTGGGCTGCTTCCAATTGTAAA  2219

Query  2181  GGAAGTTGTTGAAATGCTTTTTTGCCGTGGTGTTATTAAGGTGCTATTTTCAACGGAGAC  2240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2220  GGAAGTTGTTGAAATGCTTTTTTGCCGTGGTGTTATTAAGGTGCTATTTTCAACGGAGAC  2279

Query  2241  ATTTGCCATGGGGGTTAATGCTCCAGCTAGAACGGTCGTTTTTGATGCTTTGAGGAAGTT  2300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2280  ATTTGCCATGGGGGTTAATGCTCCAGCTAGAACGGTCGTTTTTGATGCTTTGAGGAAGTT  2339

Query  2301  TGATGGCAAGGAATTTAGACAATTGCTTCCTGGAGAGTACACTCAAATGGCAGGACGTGC  2360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2340  TGATGGCAAGGAATTTAGACAATTGCTTCCTGGAGAGTACACTCAAATGGCAGGACGTGC  2399

Query  2361  TGGCAGAAGAGGACTTGACAAAACGGGCACAGTTGTTGTCATGTGTCGCGATGAAGTTCC  2420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2400  TGGCAGAAGAGGACTTGACAAAACGGGCACAGTTGTTGTCATGTGTCGCGATGAAGTTCC  2459

Query  2421  AGATGAGAGTGATCTGAGGCGTGTAATTGTTGGAAGCGCAACAAGACTAGAATCTCAGTT  2480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2460  AGATGAGAGTGATCTGAGGCGTGTAATTGTTGGAAGCGCAACAAGACTAGAATCTCAGTT  2519

Query  2481  TCGACTAACCTACATAATGATCCTCCATCTTTTACGTGTTGAAGAATTAAAGGTGGAGGA  2540
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  2520  TCGACTAACCTACATAATGATCCTCCATCTTTTACGTGTTGAAGAATTGAAGGTGGAGGA  2579

Query  2541  CATGCTGAAAAGAAGTTTTGCTGAATTTCATGCCCAGAAGAAACTACCCGAGAAACAACA  2600
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2580  CATGCTGAAAAGAAGTTTTGCTGAATTCCATGCTCAGAAGAAACTGCCCGAGAAACAACA  2639

Query  2601  GCTTCTCATGATAAAACGTTCTCTACCAA-C-----TA---AA-C--AT--ATTGA---A  2643
             ||||||||||| ||||||||||||||||| |     ||   || |  ||  |||||   |
Sbjct  2640  GCTTCTCATGAGAAAACGTTCTCTACCAATCAAAAATATCGAAGCTGATCTATTGATTTA  2699

Query  2644  T-------G-T--ATTAAAGGTGAACCGGCAATTGAAGATTACTATGACATGTACATGGA  2693
             |       | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2700  TTCATCCAGATGTATTAAAGGTGAACCGGCAATTGAAGATTACTATGACATGTATATGGA  2759

Query  2694  AGCAAATGAATATAACAACAAGATGTCGGAAGCGGTCATGCAGTCTCCTTATGCCCAGAG  2753
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2760  AGCAAATGAATATAACAGCAAGATGTCGGAAGCGGTCATGCAGTCTCCTTATGCCCAGAG  2819

Query  2754  TTTTCTTGTACAAGGAAGAGTAGTGGTCATGAAATCTGGAATGGGCATAGACAATTTACT  2813
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2820  TTTTCTTGTACCAGGAAGAGTAGTGGTCATGAAATCTGGAACGGGCATAGACAATTTACT  2879

Query  2814  CGGAATCGTTCTGAAGGGACCTTCCAACACTAACAGACAATATGTTGTTTTGGTGATAAA  2873
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2880  CGGAGTCGTTCTGAAGGGACCTTCCAACACTAACAGACAATATGTTGTTTTGGTGAAAAA  2939

Query  2874  ATCTGAAATACCGCCACCGGAGAAAAATATGGTCAGCATTGGCAAGAAAAGTTCAGATCC  2933
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct  2940  ATCTGAAATACCGCCACCAGAGAGAAATATGGTGAGCATTGGCAAGAAAAGCTCAGAGCC  2999

Query  2934  TTCTCAAGGTTATTTTATTGCGCCTAAATCAAAACGTGGTTTTGAAGAAGAATTTTATAC  2993
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3000  TTCTCAAGGTTATTTTATTGCGCCCAAATCAAAACGTGGTTTTGAAGAAGAATTTTATAC  3059

Query  2994  AAAGCCGAGCTCTCGTAAAGGTCCCGTTGTAATAAAGATAGAGCTCCCGTACCATGGGGT  3053
              ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  3060  GAAGCCGAGCTCTCGTAAAGGTTCCGCTGTGATAAAGATAGAGCTCCCGTACCATGGAGT  3119

Query  3054  TGCTGCTGGTGTAGGTTACGAGGTTAAAGGGTTTGATAACAAAGAATTTTTGTGCATATG  3113
              |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3120  CGCTGCTGGCGTAGGTTACGAGGTTAAAGGGTTTGATAACAAAGAATTTTTGTGCATATG  3179

Query  3114  CGATAGCAAGATAAAGATTGATCAGGTGCGCCTACTCGAGGATGGGAACAAGGCAGCTTT  3173
             |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3180  CGATAGCAAGATAACGATTGATCAGGTGCGTCTACTCGAGGATGGGAACAGGGCAGCTTT  3239

Query  3174  TTCTCAGACGGTTCAACAGCTTCTGGATCTGAAATCAGACGGAAACAAATTTCCTCCTGC  3233
             ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct  3240  TTCGCAGACGGTTCAACAGCTTTTGGATCTGAAATCAGACGGAAACAAGTATCCTCCTGC  3299

Query  3234  TCTAGACCCAGTAAAAGATTTGAAGCTGAAAGATGCTGAGCTTGTGGAGACATACTATAA  3293
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct  3300  TCTAGACCCAGTAAAAGATTTGAAGCTGAAAGATGTTGAGCGTGTGGAGACGTACTATAA  3359

Query  3294  ATGGACCAACCT-ATTGCAAAAGATGTCCATGAATAAGTGCCACGGTTGTGTCAAATTGG  3352
             |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  3360  ATGGAC-AAGCTTATTGCAAAAGATGTCCATGAATAAGTGCCAAGGTTGTGTCAAATTGG  3418

Query  3353  AAGAGCACATGAAGTTAGCTAGGGAGATTAAGAAGCATAAGACGGATCTCAAAGATCTTG  3412
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
Sbjct  3419  AAGAGCACATGAAGTTAGCTAGGGAGATTAAGAAGCATAAGAATGATCTCAAAGATCTTG  3478

Query  3413  AATTTCAAATGTCTGATGAAGCCCTATTACAAATGCCTGCCTTTCAGGGCCGGATCGATG  3472
             ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  3479  AATTTCAAATGTCAGATGAAGCCCTATTACAGATGCCTGCGTTTCAGGGCCGGATCGATG  3538

Query  3473  TTCTGAAGAACATTGGGTGTATAGATGATGACCTCGTCGTCCAAATCAAAGGTCGTGTCG  3532
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  3539  TTCTGAAGAACATTGGGTGTATAGATGATGACCTCGTCGTCCAAATCAAAGGCCGTGTCG  3598

Query  3533  CTTGCGAGATGAATTCTGGGGAAGAATTGATTTGCACAGTGTGTCTGTTCGAGAATCAAT  3592
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3599  CTTGCGAGATGAATTCTGGGGAAGAGTTGATTTGCACAGTGTGTCTGTTCGAGAATCAAT  3658

Query  3593  TCGAAGAATTAGAACCAGAAGAAGCAGTGGCTATAATGTCTGCCTTTGTCTTCCAACAGA  3652
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3659  TCGAAGAATTAGAACCAGAAGAAGCAGTGGCTATAATGTCTGCCTTTGTCTTCCAACAGA  3718

Query  3653  AAAACACTTCAGCGCCTACACTAACTCCTAAGCTGGCTAAGGCTAAACAAAGACTCTATG  3712
             ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3719  AAAACACTTCAGCGCCTTCACTTACTCCTAAGCTGGCTAAGGCTAAACAAAGACTCTATG  3778

Query  3713  ATACAGCAATCAGACTTGGTGAACTTCAAGCTCAGTACAATTTACAAATAGACCCTGAAG  3772
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3779  ATACAGCAATCAGACTTGGTGAACTTCAAGCTCAGTACAATTTACAAATAGACCCTGAAG  3838

Query  3773  AATATGCTCAGGAGAATCTCAAATTTGGTCTGGTCGAAGTCGTCTATGAGTGGGCAAAGG  3832
             ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3839  AATATGCCCAGGAGAATCTCAAATTCGGTCTGGTTGAAGTCGTCTATGAGTGGGCAAAGG  3898

Query  3833  GGACTCCATTTGCAGAGATATGTGAACTGACAGATGTCCCGGAAGGTCTGATAGTTCGAA  3892
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3899  GGACTCCATTTGCAGAGATATGTGAACTGACGGATGTCCCGGAAGGTCTGATAGTTCGAA  3958

Query  3893  CCATTGTGAGATTGGATGAGACATGCCGTGAATTCAAGAACGCAGCTGCCATTATGGGGA  3952
             |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  3959  CCATTGTGAGATTGGATGAGACGTGCCGTGAGTTCAAGAACGCAGCCGCCATTATGGGGA  4018

Query  3953  ACTCGGCGTTACACAAGAAAATGGATGCAGCTTCAAATGCCATAAAACGTGACATCGTCT  4012
             |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  4019  ACTCAGCGTTACATAAGAAAATGGATGCGGCTTCAAATGCTATAAAACGTGACATCGTCT  4078

Query  4013  TTGCGGCTAGTCTGTATGTGACCGGAGTGTAA  4044
             |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  4079  TTGCGGCTAGTCTGTATGTGACCGGAGTATAA  4110


> Ahg485072 jgi|Araly1|485072|fgenesh2_kg.5__1064__AT3G46950.1
Length=1474

 Score =  152 bits (82),  Expect = 2e-35
 Identities = 89/92 (97%), Gaps = 1/92 (1%)
 Strand=Plus/Minus

Query  4085  CACTTAACTTGAAATTCAAATCACTAAACATGTCCACA-AATATAGTAGTTAAATTTTTC  4143
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||
Sbjct  1474  CACTTAACTTGAAATTCAAATCACTAAACATGTCCATAGAATATAGTCGTTAAATTTTTC  1415

Query  4144  GTTACGACTATTACAGAAATGGATTTCAGTTT  4175
             ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1414  GTTACGACTATTACAGAAATGGATTTCAGTTT  1383



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 157862812804


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5