BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G47890.1
Length=4952
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg485153 jgi|Araly1|485153|fgenesh2_kg.5__1145__AT3G47890.1 7563 0.0
Ahg897634 jgi|Araly1|897634|Al_scaffold_0005_1600 4601 0.0
> Ahg485153 jgi|Araly1|485153|fgenesh2_kg.5__1145__AT3G47890.1
Length=4920
Score = 7563 bits (4095), Expect = 0.0
Identities = 4642/4905 (95%), Gaps = 41/4905 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTCAGAAGAAAAAAGCTCCCGCGCCGTTGGATTCGGCTCTGATCAAGCTCGAATGC 60
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTCAGAAGAAGAAAGCCCCCGCGCCGTTGGATTCGGCTGTGATCAAGCTCGAATGC 60
Query 61 GAGAAGGCACTGAAGTCATTCGGTCGTGGGAGCTACAACAAAGCGATTCGTCTCATTAAG 120
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 61 GAGAAGGCACTCAAGTCATTCGGGCGGGGGAGCTACAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAG 120
Query 121 GATTCATGCTCTCGCCATCAAGACTCTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGC 180
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 121 GATTCATGCTCTCGTCATCAAGACTCTGCCCTAATCCACCGTGTTCAAGGAACTATCTGC 180
Query 181 GTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAAGATCTAGCTACGAAACAGAAGTATCTCCGGAATGCA 240
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTCAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGGATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTCCGGAATGCA 240
Query 241 ATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGTTGTCTCCTG-ATTCGATTGAGTTTGGGCATTT 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGTTGTCTCC-GAATTCGATTGAGTTTGGGCATTT 299
Query 300 TTATGCCAACTTGCTTTACGAGGCTGCTAATGATGGAAAGAGAGAGTACGACGAAGTTGT 359
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 300 TTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTGCTAATGATGGGAAGAGAGAGTATGACGAAGTTGT 359
Query 360 GCAAGAGTGTCATCGTGCTCTCTCTATCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGTTT 419
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GCAAGAGTGTCAACGTGCTCTCTCTATCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGTTT 419
Query 420 GCAGGATGAAACTCAGCTT-AAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGG 478
||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GCATGATGAGACTCAG-TTGAAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGG 478
Query 479 ATGAGCTCAGGTCACTAATACAGAAATCCAACATTAGTTCATTGTCCACTTGGATGAATA 538
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 479 ATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAATCTAACATTGGTTCATTGTCTACTTGGATGAATA 538
Query 539 ATCTGGGAAAAGGTGAAGAGAAGTTTCGGTTGATACCTATTAGGAGAATGGCTGAGGATC 598
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 ATCTGGGAAAAGGTGAAGAAAAGTTTCGGTTGATACCGATTAGGAGAATGGCTGAGGATC 598
Query 599 CTATTGAGAGTAACTTGGTTCAGACCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAGGCTAACAAGA 658
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 599 CTATTGAGAGTAACTTGATTCAGACCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAAGCTAACAAAA 658
Query 659 GTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGGTTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGCTAGGTTGTTGCAGC 718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 CTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGGTTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGCTAGGTTGTTGCAGC 718
Query 719 AGAAGTCAG-A--GT----G-T-GAGAATGTAGGCGCTGTTGACAACAAGGGATCAGATG 769
||||||||| | | | | || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 719 AGAAGTCAGAATCTTCCCCGTTGGAAAATGTAGGAGCTGTTGGCAACAAGGGATCAGATC 778
Query 770 CAACATTAGGTTCGGGGAAGAGAAGCGGTGAGAGGAGAAAGCATGGGAA-TGCAAGGAGA 828
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |
Sbjct 779 CAACTTTAGGTTCGGGGAAGAGAAGCGGAGAGAGGAGAAAGCAT-GGAAGTGCAAGGAAA 837
Query 829 AACGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGGGTTAAGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAA 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 AACGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAA 897
Query 889 GAAATGAAGAAACAATTGCTTAGAGTTAAGCTTAGCGATCTTAAGAGTCATTTTAGTGCT 948
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 898 GAAATGAAGAAACAATTGCTTAGAGTTAAGGTTAGTGATCTTACGAGTCACTTTAGTGCT 957
Query 949 TCAAAGGATGGGAATGAAAATGAGATTATTAGTGAAGCTCTTTCCTTTTGTGAGGCCAAT 1008
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 958 TCAAAGGATGGGAATGCAAATGAGATTATAAGTGAAGCTCTGTCCTTTTGTGAGGCCAAT 1017
Query 1009 AAGACTTGGAGGTTCTGGGTTTGCTGCCAGTGTAGCGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCT 1068
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 AAGACTTGGAGGTTCTGGGTTTGCTGCCGGTGTAGTGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCT 1077
Query 1069 TATATGCATCATATTGTGCAGGTGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTT 1128
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 CATATGCATCATATTGTGCAGGAGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTT 1137
Query 1129 CTGCCTCAAAGTTTTGACACTGAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCG 1188
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 CTGCCTCAAAGTGTCGACACTGAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCA 1197
Query 1189 TTGGATCTCTCTGCTGCGGTAAAATGGCTTCGCAGTCGGCAGAAAATCCAAAACTCTGAG 1248
|||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1198 TTGGATCTCTCTGCTGCGATGAAATTGCTTCGCGGTCAGCAGAAAATCCAAAATTCTGAG 1257
Query 1249 TTTAG-TGAGTTTCACGCTGGAGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCAAGGATGC 1307
||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1258 TTT-GATAAATTTCACTCTGGAGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCACGGATGC 1316
Query 1308 ACGGAATGATACTTCACCAGAGAAAGAAAGCCTTGGAGACTCTTGCAAGGGTTGTGATGA 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||
Sbjct 1317 ACGGAATGATACTTCACCAGAGAAAGAAAGCCTTGGATACACTTGCAACGGTTGTAATGA 1376
Query 1368 GAATGACCCAGAAGAAGG-TAAGCTGTCAATCACATTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTA 1426
|||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1377 GAATGAACAAGAAG-AGGTTAAGCTGTCGATCGCATTTCCTCCTCCTGATGGCTGGCCTA 1435
Query 1427 TATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTAC 1486
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1436 TATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTGC 1495
Query 1487 TGATCAGACACAAATATTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAGTTTACGCTGG 1546
| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1496 TTATTAGACACAAATACTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGG 1555
Query 1547 ATGAACTTCAGAATCTTGCCTCGGTGTCACAATTCTTAAATCGTAGCTTGAACCAGTCAC 1606
|||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 ATGAACTTCAGAATCTAGCTTCGGTTTCACAATTCTTAAGTCGTAGCTTGAACCAGTCAC 1615
Query 1607 CCATATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTCCCAGCTCAGAAAAATTCTCAAATTCCTGCAGG 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1616 CCATATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTCCCAGCTCAGGAAAATTCTCATATTCCTGCAAG 1675
Query 1667 ACTTGTCTCAGGCCTGTGGATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCAACGATGAAT 1726
||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1676 ACTTGACTCAGGCCTGTGGATTGAATCAATATTCTGAACAAAGTAACTCCAATGATGAAA 1735
Query 1727 TTAATTTTGGGGCCCTGTGTAGAGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATT 1786
|||||| ||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 TTAATTCTGGCGACCTGAGTCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATT 1795
Query 1787 CATGTCTTCTTTTGGATGAAAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGATATATATGG 1846
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1796 CATGTCTTCTTTTGGATGAAAAAGTACTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGAAATATATGG 1855
Query 1847 GCTCAGCA-TTGCATAATGTAGCTGTAGCAAGTTCTGGGGATATTGCTAATGGAAATGAT 1905
||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||
Sbjct 1856 TCTCAGCATTTG-ATAATGTAGCTATAGTAAGTTCTGGAGATATTGCTAACGGCAATAAT 1914
Query 1906 GTGTCTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAGCGAGGAA 1965
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||
Sbjct 1915 GTGTCTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTTGCAGGACCCTCTACCGGGGAA 1974
Query 1966 CAAGTTGTGTCATGGATGCGCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATG 2025
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 CAAGTTGTGTCATGGATGTGCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATG 2034
Query 2026 CAACATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCAC 2085
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 CAGCATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCAC 2094
Query 2086 TTAAGCTACGAGGGAGCACTGCAGACTGTTGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAAG-CCGGAA 2144
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2095 TTAAGCTACGAGGGAGCACTGCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAG-AAGCCCGGAA 2153
Query 2145 GAGGGAGACTTCAGCAGAGTTTACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGCTGAGGAAACGAAG 2204
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2154 GAGGGAGACTTCAGCAGAGTTTACCCATGAAAGTTATGAATCTTTGCTGAGGAAACGAAG 2213
Query 2205 AGAAGAGCTAAATGAAAATGACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGA 2264
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 ACAAGAGCTAAATGAGAATGACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGA 2273
Query 2265 TGCTTTAACAAATGTGTTGAAAGATGCTGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGGATATGA 2324
|||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 TGCTATAACAAATGTTTTGAAAGATGCTGAAACCCTCAACCACAATCAATTTGGATATGA 2333
Query 2325 AGAATCATATGGCTGCACGAGTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGA 2384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2334 AGAATCATATGGCTGCACGAGTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGA 2393
Query 2385 ATGGGGGATGAAAGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAGAA 2444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2394 ATGGGGGATGAAAGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAAAA 2453
Query 2445 ACAAAAAGAGCAATTGTCTGCAGAGCTTAGCAGAATTGACGCGCAAATGATGCGAAATGT 2504
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||
Sbjct 2454 ACAAAAAGAGCAGCTGTCTGCAGAGCTTAGCAAAATCGATGCTCAAATGATGCGGAATGT 2513
Query 2505 CACTGGGATGCAGCAATTAGAGCTAAAGCTTGGACCGGTTTCCTCCAACGATTATCAGAT 2564
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2514 CACTGGGATGCAGCAATTAGAACTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTTCAACGATTATCAGAT 2573
Query 2565 AGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGTGCACATTTGGAGGCGTTGGCAGAGAA 2624
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2574 AGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAA 2633
Query 2625 AGATGCCACTGAGAAGTCTGATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTTTTGAGCTAGCTCTTGA 2684
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2634 AGATGCCACTGAGAAGTCGGATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTGTTGAGCTCGCTCTTGA 2693
Query 2685 TTCTAAGAAGGAGGGTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAACACACGCTGGAAAAGTCGAA 2744
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 2694 TTCTAAGAAGGAGGCTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAA 2753
Query 2745 GGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAACTGAAGAATTTGAAGGCTACTATTGGAAA 2804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2754 GGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCTACTATTGGAAA 2813
Query 2805 CGACCATCGCTTCAATGGTGACTCAATTGAGCACAGCCTCCTTTCGGTTGCATCTTTTGG 2864
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2814 CGACCATCGCTTCAATGTTGACTCAATTGAACACAGCCTCCCTTCGGTTGCATCTTTTGT 2873
Query 2865 TGATCATTCAGAGGCTGACGTTGTTTCTGAAGCCATTGAAGCGTTAAGTGATGAGGAAGA 2924
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2874 TGATCATTCAGAGGCTGACGTTGTTTCTGAAGCCGTTGAAGCGTTAAAAGATGAGGAAGA 2933
Query 2925 GGAATACAGACGTTGTAACGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGCAAAAACTCTAGA 2984
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2934 GGAATACAGACGCCGTATCGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGAAAAAACTCTAGA 2993
Query 2985 GTATCAAAGAAGAATTGAGAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACaaaaaaaGAA 3044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 GTATCAAAGAAGAATTGAGAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACAAAAAAAGAA 3053
Query 3045 ATACAGCTGTTCAGATCCGATGAATGTGACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAA 3104
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3054 ATACAGCTGTTTACATCCGATGAATGTGACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAA 3113
Query 3105 TTTCTTTGATGATGCT-GATTTACAAGAACAAGAAAAACCCATAAATCAGGAGAAATGGA 3163
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3114 ATTCTTTGATGATG-TAGATTTACAAGAACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGA 3172
Query 3164 ATAAACAACTTGATGACTTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATGGAGTTTTCCCGTCAA 3223
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 3173 ATGGACAACTTGATGACTTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATTGTGTTTTCCCGTCAA 3232
Query 3224 CAAATCATTGTGTGATATCTGATACTGCAAAGGTGCTGGATGTAATATCCCAAGAAGTAG 3283
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3233 CAAATCATTGTGTGATATCTGATACTGGAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAGAAGTAG 3292
Query 3284 TGCCTAACGGTATAGCTATTCAAGCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGA 3343
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 TGCCTAACGGTATAGCTATTCAATCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGA 3352
Query 3344 GGGGTAGACGCCAAAAAGCTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCACACTTT 3403
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 3353 GGGGTAGACGCCAAAAAGGTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCATACCTT 3412
Query 3404 CTGAGAGCGAGGATAGTAAATCTCAGAGGTCAGGCACCG-ACAGTGAGAGACAATCTGAA 3462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 3413 CTGAGAGCGAGGATAGTAAATCTCAGAGGTCAGGCACCGTA-AGTGAGAGACAATCTGAA 3471
Query 3463 ACTCTACGTAGCAATGGTGATGCGGGACCAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGAC 3522
| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3472 ATTCTACGTAGCAATGGTGATGCGGGAATAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGAC 3531
Query 3523 GATGAAGAAGAAAGATTTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAAAACTTCAAAGCCTTGATGTG 3582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3532 GATGAAGAAGAAAGATTTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGATGTG 3591
Query 3583 TACCGAGGTCGTAGAAATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAGACAACAATGAT 3642
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3592 TACCGAGGAGGTAGAAATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAGACAACAATGAT 3651
Query 3643 TGGGTTTTATCTGATGTCACAAAGGAATCTCAGAGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGC 3702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3652 TGGGTTTTATCTGATGTCACAAAGGAATCTCAGAGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGC 3711
Query 3703 ACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCT 3762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3712 ACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCT 3771
Query 3763 CTGTGGAATCTGGGGATGTTTCGGGCTGAGTTCTTGCGGAGCTCAACACTAGAGCACCAT 3822
|| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3772 CTATGGAATCTGGGGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTGCGGAGTTCAACACTAGAGCACCAT 3831
Query 3823 CACTTTGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGCGATTTTTACAGCTTTAAGTACT 3882
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 3832 CACGTTGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGAGATTTTTACTGCTTTAAGTGCT 3891
Query 3883 GCTTCGAGTGAAACACGAAAAGAACCTGTTGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTAAGT 3942
||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3892 GCTACGAGTGAAACACGAAAAGAACCTGTGGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTGAGT 3951
Query 3943 AACTTGTATCCTGATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCAGAAGTA 4002
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3952 AACTTGTATCCAGATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAATGATGCTTCAGAAGTA 4011
Query 4003 TTGGCCGTAATCTTCGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGAC 4062
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4012 TTGGCCGTAATCTTCGAATGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGAC 4071
Query 4063 ACAGAATCTGCTGAGAGCAACAGTACGGGCTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATT 4122
||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4072 ACAGAATCTACTGAGAGCAACAGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATT 4131
Query 4123 GCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATGTTTCTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTG 4182
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4132 GCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTG 4191
Query 4183 GAGTCCAGGCATTTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCCCTACGC 4242
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4192 GAGTCCAGGCATTTGAAATACACATCCTTTTTCCATAACATCAATGCTAGTGCCCTACGC 4251
Query 4243 ACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATG 4302
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4252 ACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATG 4311
Query 4303 AACCATCAACTAGCTTGTGATCGCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAACGCAA-CCATATCCA 4361
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 4312 AACCATCAACTAGCTTGTGATCCCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAAC-CAAACCATATCCA 4370
Query 4362 CCATATTCTCACCACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATG 4421
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4371 CCACATTCTCACCACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATG 4430
Query 4422 TGAGACTGTAGAAGACATAGCCGCTACTCTTGCAGCTTTGAATACAGAGATAGACATCAG 4481
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 4431 TGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACCCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGATATCAG 4490
Query 4482 CATCATGTACCGTGGTGTGGACCCTAAGAACACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTA 4541
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4491 CATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTA 4550
Query 4542 TTATGGACAGCATTATCACTGTTTTGCATATAGTCATGAGCACGATCAGTGGATCATGTA 4601
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4551 TTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTAATGAGCACGATCGGTGGATCATGTA 4610
Query 4602 CGATGACCAAA-ACGTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGTGATGTTCTTTCTATGTGTAAGA 4660
| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 4611 CAATGACCAAACA-GTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGTGATGTACTTTCTATGTGTGAGA 4669
Query 4661 GAGGACATTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAAAAGAAACTTTAAATTAGAAAACAAA 4720
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4670 GAGGACATTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACAAAAAGAAACTTTAAATCAGAAAACAAA 4729
Query 4721 AGTAAAAACAGAGCAAGTAGAGTTACGTTGCGACAG------A--TCTCCCAAAGTACAA 4772
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||
Sbjct 4730 AGAAAAAACAGAGCAAGTAGAGTTACGTTGCAACAGTTTTGGAGATCTCCCAA-GTACAA 4788
Query 4773 ACTGCAAAGAAAGTAAGTACTATTTTTTGATAATCGAAAACTC-GAGAGGAAGAAATGTG 4831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 4789 ACTGCAAAGAAAGTAAGTACTATTTTTTGATAATCGAAAACTCAGAGAGGAAGGAATGTG 4848
Query 4832 ATTTTTACTCATCTCAGTAGTTTAAAGAGGATGGGGAAGAAGATT 4876
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4849 ATTTTTACTCATCTCAGTAGTTCAAAGAGGATGGGGAAGAAGATT 4893
> Ahg897634 jgi|Araly1|897634|Al_scaffold_0005_1600
Length=4908
Score = 4601 bits (2491), Expect = 0.0
Identities = 3217/3562 (90%), Gaps = 72/3562 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 27 GCCGTTGGATTCGGCTCT-GATCAAGCTCGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCATTCGGTC 85
|||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |
Sbjct 153 GCCGTTGGATTCAGCTGTCG-TCAAGCTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGAC 211
Query 86 GTGGGAGCTACAACAAAGCGATTCGTCTCATTAAGGATTCATGCTCTCGCCATCAAGACT 145
| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 212 GGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCATCAAGACT 271
Query 146 CTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGCGTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAAG 205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 272 CTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGCGTCAAGGTTGCTGCTGTGTACGAGG 331
Query 206 ATCTAGCTACGAAACAGAAGTATCTCCGGAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 265
|||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 ATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTGCGAAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 391
Query 266 AGTTGTCTCCTGATTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTACGAGGCTG 325
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 392 AGCTGTCTCCAAATTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTG 451
Query 326 CTAATGATGGAAAGAGAGAGTACGACGAAGTTGTGCAAGAGTGTCATCGTGCTCTCTCTA 385
| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 452 CCAACGATGGGAAGAGAGAGTACGAGGAGGTTGTGCAAGAGTGCCATCGTGCTCTTTCCA 511
Query 386 TCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGT-TTGCAGGATGAAACTCAGCTTAAGATA 444
||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 512 TCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGGGAGAGTCTT-CAGGATGAGACTCAGCTGAAGATA 570
Query 445 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGGATGAGCTCAGGTCACTAATACAGAAA 504
|||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 571 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGCACATTTCCAGGATGAGCTCAGATCACTGATACAGAAG 630
Query 505 TCCAACA-TTAGTTCATTGTCCACTTGGATGAATAATC-TGGGAAAAGGTGAAGAGAAGT 562
|| |||| ||| ||||||||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||| |
Sbjct 631 TCTAACATTTA-TTCATTGTCCACTTGGATGCAGAA-CTTGGGAAATGGTGAAGAGAAAT 688
Query 563 TTCGGTTGATACCTATTAGGAGAATGGCTGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGGTTCAGA 622
|| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 689 TTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCCGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGA 748
Query 623 CCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAGGCTAACAAGAGTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGG 682
|||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||
Sbjct 749 CCAGGAGGCCGAATGAGATTAAAAAAGCTACCAAGACTCTTGAAGAGAGGAGGAAGGAGG 808
Query 683 TTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGC-TAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCAGAG---T----GT-- 732
||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |
Sbjct 809 TTGAAGTGAGGGTAGCTGCA-CATAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCTGAGTCTTCCCCATCG 867
Query 733 GAGAATGTAGGCGCTGTTGACAACAAGGGATCAGATGCAACATTAGGTTCGGGG-AAGAG 791
|||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||
Sbjct 868 GAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGGTCAGATCCAACATTAGGAGCGGGGCCA-AG 926
Query 792 AAGCGGTGAGAGGAGAAAGCATGGGAATGCAAGGAGAAACGGCTCCACAGCGGATAGAAG 851
||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 AAGTGGGGAGAGAAGAAAGCATGGAAATGCAAGGAAAAACGGCTCCACAGCGGATAGAAG 986
Query 852 GGATCGGGTTAAGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAAGAAATGAAGAAACAATTGCTTAG 911
|||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||
Sbjct 987 GGATCGTGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTGAGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAAG 1046
Query 912 AGTTAAGCTT-AGCGATCTTAAGAGTCATTTTAGTGCTTCAAAGGATGGG-AATGAAAAT 969
||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||
Sbjct 1047 AGTTAAG-TTCAGTGATCTTAAGAGTCACTTTAGTGCTTCAAAGGATGGGCAA-GCATAT 1104
Query 970 GAGATTATTAGTGAAGCTCTTTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGTT 1029
|||||| |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1105 GAGATTCTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCT 1164
Query 1030 TGCTGCCAGTGTAGCGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCTTATATGCATCATATTGTGCAG 1089
||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 TGCTGCCGGTGTAGTGAAAACTTCATAGAGCCTGAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAG 1224
Query 1090 GTGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTTCTGCCTCAAAGTT-TTGACAC 1148
| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||
Sbjct 1225 GAGCACATGGGTAACGTGTTACCTAAGATGCAAATGGTTTTGCCTCAAA-TTGTCGACAC 1283
Query 1149 TGAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCGTTGGATCTCTCTGCTGCGGT 1208
||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 TGAAAGGATTGATATGCTTTTTAATTCCCCATGGAAACCATTGGATCTCTCTGCTGCGGT 1343
Query 1209 AAAATGGCTTCGCAGTCGGCAGAAAATCCAAAACTCTGAGTTTAGTGAGTTTCACGCTGG 1268
|||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||
Sbjct 1344 GAAATTGCTTCTCAGTCAGCAGAAAATCCAAAATTCTGAGTTTAATGAATTTCACTCTGG 1403
Query 1269 AGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCAAGGATGCACGGAATGATACTTCACCAGA 1328
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1404 AGATAATATCGATGACGGTGACGATTGCTTCAAGGATGCATGGAATGATACTACACCAGA 1463
Query 1329 GAAAGAAAGCCTTGGAGACT-CTTGCAAGGGTTGTG-ATGAGAATGACCCAGAAGAAGGT 1386
|||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||
Sbjct 1464 GAAAGAAAACCTTGGAGA-TGCTTGCAACGGTTG-GAATGAGAATGAATCTGAAGAAGGT 1521
Query 1387 AAGCTGTCAATCACATTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTATATCTGATGATCCTGAACGT 1446
|||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522 AAGCTGTCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTATATCTGATGATCCTGAACGT 1581
Query 1447 GCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTACTGATCAGACACAAATATTTA 1506
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct 1582 GCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTGCTTATTAGACACAAATATTTA 1641
Query 1507 GCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAGTTTACGCTGGATGAACTTCAGAATCTTGCC 1566
|||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1642 GCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATTCAATTTACGGTGGATGAACTCCAGAATCTACCC 1701
Query 1567 TCGGTGTCACAATTCTTAAATCGTAGCTTGAACCAGTCACCCATATGCATCTGCTTTTTG 1626
||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1702 TCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAACAAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTTG 1761
Query 1627 GGAGCTTCCCAGCTC-AGAAAAATTCTCAAATTCCTGCAGGACTTGTCTCAGGCCTGTGG 1685
||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 GGAGCTTGCCATCTCAAG-AAAATTCTCAAATTCCTGCAGGACTTGTCTCAGGCCTGTGG 1820
Query 1686 ATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCAACGATGAATTTAATTTTGGGGCCCTGTG 1745
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |
Sbjct 1821 ATTGAGTCGATATTCCGAACAAAGTAACCCCAACGATGAAATTAATTTTGGTGACCTGGG 1880
Query 1746 TAGAGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATGA 1805
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1881 TCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATGA 1940
Query 1806 AAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGATATATATGGGCTCAGCATTGCATAATGT 1865
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | | | |
Sbjct 1941 AAAATTGCTTGGAACTGAGTGCATCCAAGAGATATATAT-GG----GC--T-C---A-GC 1988
Query 1866 AGCTGTAGCAAGTTCTGGGGATATTGCTAATGGAAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATGG 1925
| || | || | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 A-CT-T---AA----T----A-A-TGCTAATGGAAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATGG 2033
Query 1926 ATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAGCGAGGAACAAGTTGTGTCATGGATGCG 1985
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2034 ATTTCTTTCATGGATCTTCGCAGGACCCTCTAGCGGGGAACAAGTTGTGTCATGGATGTG 2093
Query 1986 CACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATGCAACATCTTGAGAAGGAGTT 2045
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2094 CACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGTT 2153
Query 2046 CTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCACT 2105
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154 CTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCACT 2213
Query 2106 GCAGACTGTTGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAAGCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGTT 2165
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 GCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAGAAGGCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGTT 2273
Query 2166 TACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGCTGAGGAAACGAAGAGAAGAGCTAAATGAAAATGA 2225
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 2274 TACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGTTGAGGAAACGAAGAGACGATCTAAATGAGAATGA 2333
Query 2226 CCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGATGCTTTAACAAATGTGTTGAA 2285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 2334 CCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGAA 2393
Query 2286 AGATGCTGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACGAG 2345
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 AGATGCTGAAACCCTTAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACGAG 2453
Query 2346 TTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGATGAAAGATTCCTT 2405
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2454 TTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGATGAATGATTCCTT 2513
Query 2406 ACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAGAAACAAAAAGAGCAATTGTCTGC 2465
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 2514 ACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGATCCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCTTC 2573
Query 2466 AGAGCTTAGCAGAATTGACGCGCAAATGATGCGAAATGTCACTGGGATGCAGCAATTAGA 2525
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2574 AGAGCTTAGCAGAATTGACGCGAAAATGATGCGTACTGTCACTGGGATGCAGCAATTAGA 2633
Query 2526 GCTAAAGCTTGGACCGGTTTCCTCCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTGAA 2585
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2634 GCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTGAA 2693
Query 2586 GTCCTACATGCGTGCACATTTGGAGGCGTTGGCAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCTGA 2645
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 GTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAGAGATGCCACTGAGAAGTCTGA 2753
Query 2646 TGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTTTTGAGCTAGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGGTCGAGG 2705
||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2754 TGCTGCAAGAGAAGCTTTACTTGTTGAGCTCGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGAGG 2813
Query 2706 AAGAAATGATAATTCAAAACACACGCTGGAAAAGTCGAAGGACAAGAAAAAGATTAAAGA 2765
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2814 AAGAAATGATAATTCAAAAAACATGCTGGAAAAGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAAGA 2873
Query 2766 CACTAGGAAACTGAAGAATTTGAAGGCTACTATTGGAAACGACCATCGCTTCAATGGTGA 2825
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2874 CACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCAACTATTGGAAACGACCATCGCTTCAATGCTGA 2933
Query 2826 CTCAATTGAGCACAGCCTCCTTTCGGTTGCATCTTTTGGTGATCATTCAGAGGCTGACGT 2885
|| |||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2934 TTCTGTTGAACACAGCCCCCTTCCGGTTGCATCTGTCGGTGATTATTCAGAGGCTGATGT 2993
Query 2886 TGTTTCTGAAGCCATTGAAGCGT-TAAGTGATGAGGAAGAGGAATACAGACGTTGTA-AC 2943
|||||||||||| ||||||| | ||| || | ||||||||||| | ||| | |
Sbjct 2994 TGTTTCTGAAGCTGTTGAAGC-TATAAAAGAACAAGAAGAGGAATATAAACGCCAAAGA- 3051
Query 2944 GAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGCAAAAACTCTAGAGTATCAAAGAAGAATTGAG 3003
||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3052 GAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAACTCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGAG 3111
Query 3004 AATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACaaaaaaaGAAATACAGCTGTTCAGATCCG 3063
|||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 3112 GATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAACAAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCCC 3171
Query 3064 ATGAATGT-GACAGAGGCAGTGTATGATG-ATTGCATAGAAAATTTCTTTGATGATGCT- 3120
|||||||| | || ||||||||||| ||| || ||| ||| ||| | ||||| || |
Sbjct 3172 ATGAATGTTG-CAAAGGCAGTGTATAATGCAT-GCACAGATAATGTAGTTGATTATT-TA 3228
Query 3121 GATTTACAAGAACAAGAAAAACCCATAAATCAGGAGAAATGGAATAAACAACTTGATGAC 3180
|||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||
Sbjct 3229 GATTTACAAGGACATGGAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGAATGGACGACTTGACGAC 3288
Query 3181 TTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATGGAGTTTTCCCGTCAACAAATCATTGTGTGATA 3240
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||
Sbjct 3289 CTGGAAGGAGCCAGAGTGAATACAAATGGAGTTTTCCCGTCAACAAATTATTCTGCGATA 3348
Query 3241 TCTGATACTGCAAAGGTGCTGGATGTAATATCCCAAGAAGTAGTGCCTAACGGTATAGCT 3300
||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||
Sbjct 3349 TCTGATAGTGCAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAAAAGTAGTGCCTAATGGCACAGCT 3408
Query 3301 ATTCAAGCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGAGGGGTAGACGCCAAAAA 3360
|| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3409 ATGCAAGCTGGTATGTTCCAATCTGATCAACGAACTGGGAGGAGAGGTAGACGCCAAAAA 3468
Query 3361 GCTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCACACTTTCTGAGAGCGAGGATAGT 3420
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||
Sbjct 3469 GCTTCAAACAAGTTAGTTGATGGAAAATATCCGGTCACACCTCCTGAGACCGAAAATAGT 3528
Query 3421 AAATCTCAGAGGTCAGGCACCGACAGT-GAGAGACAATCTGAAACTCTACGTAGCAATGG 3479
||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3529 AAATCTCAGTGGTCAGGCACCGAC-GCCGAGAGACATTCTGAAACTCTACGTAACAATGG 3587
Query 3480 TGATGCGGGACCAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGAAGAAGAAAGATT 3539
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3588 TGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGAAGAAGAAAGGTT 3647
Query 3540 TCAAGCTGACCTTAAAAGGGCA 3561
||||||||||||||||||||||
Sbjct 3648 TCAAGCTGACCTTAAAAGGGCA 3669
Score = 1530 bits (828), Expect = 0.0
Identities = 1029/1126 (91%), Gaps = 14/1126 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3580 GTGTACCGAGGTCGTAGAAATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAG-ACAACAA 3638
||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||
Sbjct 3784 GTGTACCAAGGAGGTAGAAATATGGCTTCATGTTTGAGGACACCTCTGGAAGTA-AACAA 3842
Query 3639 TGATTGGGTTTTATCTGATGTCACAAAGGAATCTCA-GAGTTCGCCCGGAGTTGCCATAT 3697
|||| ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||||||||
Sbjct 3843 TGATGGGGGTTTATCTGATGACACAATTGAGTCT-AGGAGCTCAACCGGAGTTGCCATAT 3901
Query 3698 TTGGCACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATAC 3757
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3902 TTGGCACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTGAATGTTATCATAC 3961
Query 3758 AGTCTCTGTGGAATCTGGGGATGTTTCGGGCTGAGTTCTTGCGGAGCTCAACACTAGAGC 3817
||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||
Sbjct 3962 AGTCTCTATGGAATCTGGAGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACAGAGTTCAACACAAGAGC 4021
Query 3818 ACCATCACTTTGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGCGATTTTTACAGCTTTAA 3877
|||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
Sbjct 4022 ACCATCACGTGGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATTTTTACTGCTTTGA 4081
Query 3878 GTACTGCTTCGAGTGAAACACGAAAA-GAACCTGTTGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCT 3936
| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 4082 GCGCTGCTTCGAGTGAAACAC-AAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCT 4140
Query 3937 TTAAGTAACTTGTATCCTGATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCA 3996
|| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4141 TTGAGTAATTTGTATCCAGATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCA 4200
Query 3997 GAAGTATTGGCCGTAATCTTCGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTG 4056
|||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4201 GAAGTACTGGCGGTGATCTTTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTG 4260
Query 4057 TCTGACACAGAAT-CTGCTGAGAGCAACAGTACGGGCTCATGGGACTGTGCCAATCGCTC 4115
||||| || | || | || |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 4261 TCTGATGTGGATTCCT-CAGACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCAC 4319
Query 4116 ATGTATTGCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATGTTTCTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTG 4175
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4320 ATGTATTGCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTG 4379
Query 4176 TGGGCTGGAGTCCAGGCATTTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGC 4235
|||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4380 TGGGCTAGAATCCAGGCATATGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGC 4439
Query 4236 CCTACGCACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGT 4295
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4440 CCTACGCACCATGAAGGTTACATGCACTGAGAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGT 4499
Query 4296 CGAGATGAACCATCAACTAGCTTGTGAT-CGCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAACGCAACC 4354
||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | ||||| |||||||||| |||||
Sbjct 4500 CGAGATGAACCATCAACTAGCCTGTGATTC-CGAAACGGGTGGATGTGGGAAACTCAACC 4558
Query 4355 ATATCCACCATATTCTCACCACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAA 4414
||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4559 ATATCCACCATATTCTCACTACTCCACCGCATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAA 4618
Query 4415 ACACATGTGAGACTGTAGAAGACATAGCCGCTACTCTTGCAGCTTTGAATACAGAGATAG 4474
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 4619 ACACATGTGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAG 4678
Query 4475 ACATCAGCATCATGTACCGTGGTGTGGACCCTAAGAACACATATAGCTTAGTTTCCGTGG 4534
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4679 ACATCAGCATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGG 4738
Query 4535 TTTGTTATTATGGACAGCATTATCACTGTTTTGCATATAGTCATGAGCACGATCAGTGGA 4594
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4739 TTTGTTATTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGA 4798
Query 4595 TCATGTACGATGACCAAAAC-GTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGTGATGTTCTTTCTATG 4653
|||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4799 TCATGTACGATGAC-AAAACCGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGAGTGATGTTCTTTCTATG 4857
Query 4654 TGT-AAGAGAGGACATTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAAAAG 4698
||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4858 TGTGAA-AGAGGACACTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAGAAG 4902
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 187433547025
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5