BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G47910.2
Length=5422
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg485153 jgi|Araly1|485153|fgenesh2_kg.5__1145__AT3G47890.1 6359 0.0
Ahg897634 jgi|Araly1|897634|Al_scaffold_0005_1600 5600 0.0
> Ahg485153 jgi|Araly1|485153|fgenesh2_kg.5__1145__AT3G47890.1
Length=4920
Score = 6359 bits (3443), Expect = 0.0
Identities = 4437/4912 (90%), Gaps = 88/4912 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 425 GCCGTTGGATTCATCTGTCG-TCAAGCTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGAC 483
|||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |
Sbjct 27 GCCGTTGGATTCGGCTGT-GATCAAGCTCGAATGCGAGAAGGCACTCAAGTCATTCGGGC 85
Query 484 GGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCACCAAGACT 543
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 86 GGGGGAGCTACAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAGGATTCATGCTCTCGTCATCAAGACT 145
Query 544 CTGCCCTAATTCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGCGTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGG 603
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 CTGCCCTAATCCACCGTGTTCAAGGAACTATCTGCGTCAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGG 205
Query 604 ATCTCGCTACGAAACAGAAGTATCTCCGAAATGCAATCGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 663
|||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 ATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTCCGGAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 265
Query 664 AGCTGTCTCCTAACTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTG 723
|| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 AGTTGTCTCCGAATTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTG 325
Query 724 CTAACGAAGGGAAGAGAGAGTACGAGGAGGTTGTGCAAGAGTGCCACCGTGCTCTCTCCA 783
|||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |
Sbjct 326 CTAATGATGGGAAGAGAGAGTATGACGAAGTTGTGCAAGAGTGTCAACGTGCTCTCTCTA 385
Query 784 TCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGAGAGAGTCTT-CAGGATGAGACTCAGCTGAAGATA 842
||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||||||
Sbjct 386 TCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGT-TTGCATGATGAGACTCAGTTGAAGATA 444
Query 843 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGCTCATTTCCAGGATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAG 902
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGGATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAA 504
Query 903 TCTAACATTTATTCATTGTCCACTTGGATGCA-GACCTTGGGAAATGGTGAAGAGAAA-T 960
||||||||| ||||||||| ||||||||| | | | ||||||| |||||||| ||| |
Sbjct 505 TCTAACATTGGTTCATTGTCTACTTGGATGAATAATC-TGGGAAAAGGTGAAGA-AAAGT 562
Query 961 TTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCCGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGT 1020
|| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563 TTCGGTTGATACCGATTAGGAGAATGGCTGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGA 622
Query 1021 CCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAATCTACCAAGACTAATGAAGAGAGGAGGAAGGAGA 1080
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||
Sbjct 623 CCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAAGCTAACAAAACTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGG 682
Query 1081 TTGAAGTGAGGGTAGCTGC-GCATAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCAGAGTCTTCCCCGTCG 1139
||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 683 TTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGC-TAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCAGAATCTTCCCCGTTG 741
Query 1140 GAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGATCAGATTCAGCATTAGCCGCGGGGCCA-AG 1198
|| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||| | ||
Sbjct 742 GAAAATGTAGGAGCTGTTGGCAACAAGGGATCAGATCCAACTTTAGGTTCGGGG-AAGAG 800
Query 1199 AAGCGGGGAGAGAAGAAAGCATGGGAA-TGCAAGGAAAAATGGCTCCACAGCGGATAGAA 1257
|||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 801 AAGCGGAGAGAGGAGAAAGCAT-GGAAGTGCAAGGAAAAACGGCTCCACAGCGGATAGAA 859
Query 1258 GGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTGAGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAA 1317
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |
Sbjct 860 GGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAAGAAATGAAGAAACAATTGCTTA 919
Query 1318 GAGTTAAGTTTAGTGATCTTAAGAGTCACTTTAGTGGTTCAAAGGATGGGCAA-GCATAT 1376
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||
Sbjct 920 GAGTTAAGGTTAGTGATCTTACGAGTCACTTTAGTGCTTCAAAGGATGGG-AATGCAAAT 978
Query 1377 GAGATTGTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCT 1436
|||||| | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 979 GAGATTATAAGTGAAGCTCTGTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGTT 1038
Query 1437 TGCTGCCGGTGTAGTCAAAACTTCATAGAGTCTGAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAG 1496
||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 TGCTGCCGGTGTAGTGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAG 1098
Query 1497 GCGCACATGGGTAACGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTTTTGCCACAAATTGTCGACACT 1556
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||
Sbjct 1099 GAGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTTCTGCCTCAAAGTGTCGACACT 1158
Query 1557 GAGAGGATTGATATGCTTTTTAAGTCCCCATGGAAACCATTGGATCTCTCTGCTAC-ACT 1615
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |
Sbjct 1159 GAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCATTGGATCTCTCTGCTGCGA-T 1217
Query 1616 GAAATTGCTTCGAAGTCAGCAGAAAATACAAAATTCTGAGTTTGATGAATTTCACTCTGG 1675
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1218 GAAATTGCTTCGCGGTCAGCAGAAAATCCAAAATTCTGAGTTTGATAAATTTCACTCTGG 1277
Query 1676 AGATAATATGGATGGTGGTGACGATTGCTTCAAGGATGCATGGAATGATACTACACC--- 1732
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1278 AGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCACGGATGCACGGAATGATACTTCACCAGA 1337
Query 1733 ---AG--A----TGGAGATACTTGCAACGGTTGGAATGAGAATGAATCTGAAGAGGAGGT 1783
|| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||
Sbjct 1338 GAAAGAAAGCCTTGGATACACTTGCAACGGTTGTAATGAGAATGAA-C--AAGAAGAGGT 1394
Query 1784 TAAGCTATCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTATATCTGATGATCCTGAACG 1843
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 TAAGCTGTCGATCGCATTTCCTCCTCCTGATGGCTGGCCTATATCTGATGATCCTGAACG 1454
Query 1844 TGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCAACTGATCAGACACAAATATTT 1903
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||
Sbjct 1455 TGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTGCTTATTAGACACAAATACTT 1514
Query 1904 AGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGGATGAACTCCAGAATCTACC 1963
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1515 AGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGGATGAACTTCAGAATCTAGC 1574
Query 1964 CTCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAACAAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTT 2023
|||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1575 TTCGGTTTCACAATTCTTAAGTCGTAGCTTGAACCAGTCACCCATATGCATCTGCTTTTT 1634
Query 2024 GGGAGCTTCCCATCTCAGCAAAATCCTCAAATTCCTGCAGGACTT-ATCTCAGGCCTGTG 2082
|||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||
Sbjct 1635 GGGAGCTTCCCAGCTCAGGAAAATTCTCATATTCCTGCAAGACTTGA-CTCAGGCCTGTG 1693
Query 2083 GATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCCACGATGAGATTAATTTTGGTGACCTGG 2142
|||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||| ||||||
Sbjct 1694 GATTGAATCAATATTCTGAACAAAGTAACTCCAATGATGAAATTAATTCTGGCGACCTGA 1753
Query 2143 GTCGTGAAGTCACAGAGGAGATTCTTCTTGATAGTGAAGATTCATGTCTTCTTATGGATG 2202
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1754 GTCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATG 1813
Query 2203 AAAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAAAAATATATGGGCTCAGCATTTAATAATG 2262
||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1814 AAAAAGTACTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGAAATATATGGTCTCAGCATTTGATAATG 1873
Query 2263 TAACTATAGCAAGTTCTGGAGATATTGCTAATGGAAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATG 2322
|| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1874 TAGCTATAGTAAGTTCTGGAGATATTGCTAACGGCAATAATGTGTCTTCTGGTGCGGATG 1933
Query 2323 GATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAGCGAGGAACAAGTTGTGTCATGGATGC 2382
||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1934 GATTTCTTTCATGGATCTTTGCAGGACCCTCTACCGGGGAACAAGTTGTGTCATGGATGT 1993
Query 2383 GCACAAAGGAAGATAAAACTAATCAAGGACTGGAGATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGT 2442
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 GCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGT 2053
Query 2443 TCTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTATGAGGGAGCAC 2502
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2054 TCTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCAC 2113
Query 2503 TGCAGACTGTCGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAGGCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAAT 2562
|||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2114 TGCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAGAAGCCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGT 2173
Query 2563 TTACCCATGAAAGCTATGAAACTGTGCTGAGGAAACGAAGAGAAGAGCTAAATGAGAGTG 2622
||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 2174 TTACCCATGAAAGTTATGAATCTTTGCTGAGGAAACGAAGACAAGAGCTAAATGAGAATG 2233
Query 2623 ACCATGAGTTGTTGTTTATCAGTAGCAGGTTTGAGTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGA 2682
||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234 ACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGA 2293
Query 2683 AAGATGCCGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACTA 2742
||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2294 AAGATGCTGAAACCCTCAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACGA 2353
Query 2743 GTTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGAT-AAAGGATTCC 2801
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2354 GTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGATGAAA-GATTCC 2412
Query 2802 TTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGATTCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCT 2861
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||
Sbjct 2413 TTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAAAAACAAAAAGAGCAGCTGTCT 2472
Query 2862 GCAGAGCTTAGCAGAATCGATGCACAAATGATGCGAAATGTCACTGGGATGCAGCAATTA 2921
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2473 GCAGAGCTTAGCAAAATCGATGCTCAAATGATGCGGAATGTCACTGGGATGCAGCAATTA 2532
Query 2922 GAGCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTG 2981
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533 GAACTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTTCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTG 2592
Query 2982 AAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCT 3041
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2593 AAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCG 2652
Query 3042 GATGCTGCAAGAGAAGCCTTACTTGTTGAGCTAGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGA 3101
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 GATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTGTTGAGCTCGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGA 2712
Query 3102 GGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAA 3161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 GGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAA 2772
Query 3162 GACACTAGGAAAGTGAAGGATATGAAGGCAACTATTGGAAGCGACCATCGCTCCAATGCT 3221
|||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |
Sbjct 2773 GACACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCTACTATTGGAAACGACCATCGCTTCAATGTT 2832
Query 3222 GATTCAGTTGAACACAGCC-CCCTTCCGGTTGCACCTGTCGGCGATCATTCAGAGGCTGA 3280
|| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||
Sbjct 2833 GACTCAATTGAACACAGCCTCCCTTC-GGTTGCATCTTTTGTTGATCATTCAGAGGCTGA 2891
Query 3281 CATTGTTTCTGAAGCTGTTGAAGCTTTAAAAGAAGAGGAAGAGGAATATAAACGCCAAAT 3340
| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||
Sbjct 2892 CGTTGTTTCTGAAGCCGTTGAAGCGTTAAAAGATGAGGAAGAGGAATACAGACGCCGTAT 2951
Query 3341 AGAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAACCCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGA 3400
||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2952 CGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGAAAAAACTCTAGAGTATCAAAGAAGAATTGA 3011
Query 3401 GGATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAACAAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCC 3460
| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || | |||
Sbjct 3012 GAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACAAAAAAAGAAATACAGCTGTTTACATCC 3071
Query 3461 CATGAATGTTG-CAAAGACAGTGTATAATGGGTGCACAGATAA-TGAAGTTGATTATTTA 3518
|||||||| | || || |||||||| ||| |||| ||| || | ||||| || ||
Sbjct 3072 GATGAATGT-GACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAAATTCT-TTGATGATGTA 3129
Query 3519 GTTTTACAAGGACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGAATGGACGACTTGATGAC 3578
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3130 GATTTACAAGAACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGAATGGACAACTTGATGAC 3189
Query 3579 CTGGAAGGAGCCAGTGTGAATACAAATGGAGTTTTCCCGTCAACAAATCATTCTGCGATA 3638
|||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3190 TTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATTGTGTTTTCCCGTCAACAAATCATTGTGTGATA 3249
Query 3639 TCTGATACTGCAAAGGTGCAGAATGTAAAATCCCAAAAAGTAGTGCCTAACGGCACAGCT 3698
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3250 TCTGATACTGGAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAGAAGTAGTGCCTAACGGTATAGCT 3309
Query 3699 ATGCAAGCTGGTATTTTCCAATCTGATCAACGAACTGGGAGGAGAACTAGACGCCAAAAA 3758
|| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3310 ATTCAATCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGAGGGGTAGACGCCAAAAA 3369
Query 3759 GCTTCAAACAAGTTAGCTGATGGAAAATATCCGGTCACACCTCCTGAGACCGAAAATAGT 3818
| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||
Sbjct 3370 GGTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCATACCTTCTGAGAGCGAGGATAGT 3429
Query 3819 AAATCTCAGTTGTCAGGCACC--AACGGCGAGAGACATTCTGAAACTCTACGTAACAATG 3876
||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3430 AAATCTCAGAGGTCAGGCACCGTAA-GT-GAGAGACAATCTGAAATTCTACGTAGCAATG 3487
Query 3877 GTGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGACGAAGAAAGGT 3936
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3488 GTGATGCGGGAATAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGAAGAAGAAAGAT 3547
Query 3937 TTCAAGCTGACATGCAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGACGTGTACCAAGGAGGTAGAA 3996
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 3548 TTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGATGTGTACCGAGGAGGTAGAA 3607
Query 3997 ATATGGCGTCATGTTTGAGGACACCGCTGGAAGTA-AACAATGATGGGGGTTTATCTGAT 4055
||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3608 ATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAG-ACAACAATGATTGGGTTTTATCTGAT 3666
Query 4056 GACACAATGGAGTCT-AGGAGCTCAACAGGAGTTACCATATTTGGCACAGGTCTTCAGAA 4114
| ||||| ||| ||| || || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3667 GTCACAAAGGAATCTCAG-AGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGCACAGGTCTTCAGAA 3725
Query 4115 TGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCTCTATGGAATTTGGA 4174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3726 TGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCTCTATGGAATCTGGG 3785
Query 4175 GCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACGGAGTTCAACACGAGAGCACCATCACGTGGGAGATCC 4234
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3786 GCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTGCGGAGTTCAACACTAGAGCACCATCACGTTGGAGATCC 3845
Query 4235 TTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATCTTTACCGCTTTGAGCGCTGCTTCAAGTGAAAA 4294
||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||||||
Sbjct 3846 TTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGAGATTTTTACTGCTTTAAGTGCTGCTACGAGTGAAAC 3905
Query 4295 AC-AAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTAAGTAATTTGTATCCAG 4353
|| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3906 ACGAAAA-GAACCTGTGGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTGAGTAACTTGTATCCAG 3964
Query 4354 ATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCAGAAGTACTGGCTGTGATCT 4413
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||
Sbjct 3965 ATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAATGATGCTTCAGAAGTATTGGCCGTAATCT 4024
Query 4414 TTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGATGTGGATTCCT-CA 4472
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |
Sbjct 4025 TCGAATGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGACACAGAATC-TACT 4083
Query 4473 GACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCACATGTATTGCCCATTCTTTG 4532
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 4084 GAGAGCAACAGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATTGCCCATTCTCTG 4143
Query 4533 TTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTCCAGGCAT 4592
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4144 TTTGGAATGGATATTTTTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTCCAGGCAT 4203
Query 4593 TTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCCCTACGCACCATGAAGGTT 4652
||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4204 TTGAAATACACATCCTTTTTCCATAACATCAATGCTAGTGCCCTACGCACCATGAAGGTT 4263
Query 4653 ACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTTAACCTTGTCGAGATGAACCATCAACTA 4712
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4264 ACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATGAACCATCAACTA 4323
Query 4713 GCCTGTGATCCCGAAACCGGTGGGTGTGGGAAACTCAA-CCATATCCACCATATTCTCAC 4771
|| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 4324 GCTTGTGATCCCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAAC-CAAACCATATCCACCACATTCTCAC 4382
Query 4772 TACTCCACCACATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATGTGAGACTGTAGA 4831
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4383 CACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATGTGAGACTGTAGA 4442
Query 4832 AGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGACATCAGCATCATGTACCG 4891
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4443 AGACATAGCAGCTACCCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGATATCAGCATCATGTACCG 4502
Query 4892 TGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCTGTGGTTTGTTATTATGGACAGCA 4951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4503 TGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTATTATGGACAGCA 4562
Query 4952 TTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGATCATGTACGATGACAAAAC 5011
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 4563 TTATCATTGTTTTGCACATAGTAATGAGCACGATCGGTGGATCATGTACAATGACCAAAC 4622
Query 5012 CGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGA-TCGATGTTCTTTCAATGTGTGAAAGAGGACACTTGC 5070
|||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||
Sbjct 4623 AGTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGT-GATGTACTTTCTATGTGTGAGAGAGGACATTTGC 4681
Query 5071 AGCCACAGGTTCTTCTCTACGAGA-GA--CGTTAAA--ATAAAA-AAGAAGCAAAACAAA 5124
| |||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||| || ||| |||| ||
Sbjct 4682 AACCACAGGTTCTTCTCTACAAAAAGAAACTTTAAATCAGAAAACAA-AAG-AAAA-AA- 4737
Query 5125 TGCAGACCAAGTAGAGTT-CTGTTGCTACAATTTAGGAGATCTCGTAAGTACATACTACA 5183
|||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||
Sbjct 4738 --CAGAGCAAGTAGAGTTAC-GTTGCAACAGTTTTGGAGATCTCCCAAGTACAAACTGCA 4794
Query 5184 AAGGAAGTAAGTACGt-ttttttGACAAGCAGAAGTAAACTC-GAGAGGAAAGAATGTGA 5241
||| |||||||||| | |||||||| || | ||| || ||| |||||||| ||||||||
Sbjct 4795 AAGAAAGTAAGTAC-TATTTTTTGATAATC-GAA--AA-CTCAGAGAGGAAGGAATGTGA 4849
Query 5242 TTTTACACTCATCTCAGTGGTTCTAACTTCTAAGAGGATGGGGAAGACGATT 5293
|||| |||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||
Sbjct 4850 TTTTT-ACTCATCTCAGTAGTTC-AA-----A-GAGGATGGGGAAGAAGATT 4893
> Ahg897634 jgi|Araly1|897634|Al_scaffold_0005_1600
Length=4908
Score = 5600 bits (3032), Expect = 0.0
Identities = 3493/3709 (94%), Gaps = 58/3709 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 279 ATGGGCCAGAAGAAGAAAACCTCCGCGTCTCGCTCCAAACAACCGCCGTCTTCTACGGC- 337
||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1 ATGGGTCAGAAGAAGAAAACCT-C-CG-CTCGTTCCAAACAATCGCCGTCTTCTGCGGCG 57
Query 338 -TG-TGACGGT-G--GT---AGAGGTGGAGCCGTCTGAGATTTCCGCTTGTAGCTTCAAC 389
|| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 GTGACGACGGTGGCTGTGGCAGAGGTGGAGCCGTCTGAGATTTCCGCTTGTAGCTTCAAC 117
Query 390 GATGGGGGTTTTTCCGGACCAGACGCTAATGGTGAGCCGTTGGATTCATCTGTCGTCAAG 449
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 118 GATGGGGGTTTTTCTGGACCAGACGCTAATGTTGAGCCGTTGGATTCAGCTGTCGTCAAG 177
Query 450 CTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGACGGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGT 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 CTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGACGGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGT 237
Query 510 CTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCACCAAGACTCTGCCCTAATTCACCGTGTTCAGGGA 569
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 238 CTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCATCAAGACTCTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGA 297
Query 570 ACTATCTGCGTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGGATCTCGCTACGAAACAGAAGTATCTC 629
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 298 ACTATCTGCGTCAAGGTTGCTGCTGTGTACGAGGATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTG 357
Query 630 CGAAATGCAATCGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGCTGTCTCCTAACTCGATTGAGTTT 689
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 358 CGAAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGCTGTCTCCAAATTCGATTGAGTTT 417
Query 690 GGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTGCTAACGAAGGGAAGAGAGAGTACGAG 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 418 GGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTGCCAACGATGGGAAGAGAGAGTACGAG 477
Query 750 GAGGTTGTGCAAGAGTGCCACCGTGCTCTCTCCATCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGA 809
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 GAGGTTGTGCAAGAGTGCCATCGTGCTCTTTCCATCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGG 537
Query 810 GAGAGTCTTCAGGATGAGACTCAGCTGAAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGCTCAT 869
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 538 GAGAGTCTTCAGGATGAGACTCAGCTGAAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGCACAT 597
Query 870 TTCCAGGATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAGTCTAACATTTATTCATTGTCCACTTGG 929
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 TTCCAGGATGAGCTCAGATCACTGATACAGAAGTCTAACATTTATTCATTGTCCACTTGG 657
Query 930 ATGCAGACCTTGGGAAATGGTGAAGAGAAATTTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCC 989
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ATGCAGAACTTGGGAAATGGTGAAGAGAAATTTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCC 717
Query 990 GAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGTCCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAATCT 1049
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 718 GAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGACCAGGAGGCCGAATGAGATTAAAAAAGCT 777
Query 1050 ACCAAGACTAATGAAGAGAGGAGGAAGGAGATTGAAGTGAGGGTAGCTGCGCATAGGTTG 1109
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 778 ACCAAGACTCTTGAAGAGAGGAGGAAGGAGGTTGAAGTGAGGGTAGCTGCACATAGGTTG 837
Query 1110 TTGCAGCAGAAGTCAGAGTCTTCCCCGTCGGAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGA 1169
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 TTGCAGCAGAAGTCTGAGTCTTCCCCATCGGAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGG 897
Query 1170 TCAGATTCAGCATTAGCCGCGGGGCCAAGAAGCGGGGAGAGAAGAAAGCATGGGAATGCA 1229
|||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 898 TCAGATCCAACATTAGGAGCGGGGCCAAGAAGTGGGGAGAGAAGAAAGCATGGAAATGCA 957
Query 1230 AGGAAAAATGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTG 1289
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 AGGAAAAACGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGTGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTG 1017
Query 1290 AGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAAGAGTTAAGTTTAGTGATCTTAAGAGTCACTTT 1349
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 AGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAAGAGTTAAGTTCAGTGATCTTAAGAGTCACTTT 1077
Query 1350 AGTGGTTCAAAGGATGGGCAAGCATATGAGATTGTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAG 1409
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 AGTGCTTCAAAGGATGGGCAAGCATATGAGATTCTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAG 1137
Query 1410 GCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCTTGCTGCCGGTGTAGTCAAAACTTCATAGAGTCT 1469
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1138 GCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCTTGCTGCCGGTGTAGTGAAAACTTCATAGAGCCT 1197
Query 1470 GAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAGGCGCACATGGGTAACGTCTTACCTAAGATGCAA 1529
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1198 GAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAGGAGCACATGGGTAACGTGTTACCTAAGATGCAA 1257
Query 1530 ATGGTTTTGCCACAAATTGTCGACACTGAGAGGATTGATATGCTTTTTAAGTCCCCATGG 1589
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1258 ATGGTTTTGCCTCAAATTGTCGACACTGAAAGGATTGATATGCTTTTTAATTCCCCATGG 1317
Query 1590 AAACCATTGGATCTCTCTGCTACACTGAAATTGCTTCGAAGTCAGCAGAAAATACAAAAT 1649
||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1318 AAACCATTGGATCTCTCTGCTGCGGTGAAATTGCTTCTCAGTCAGCAGAAAATCCAAAAT 1377
Query 1650 TCTGAGTTTGATGAATTTCACTCTGGAGATAATATGGATGGTGGTGACGATTGCTTCAAG 1709
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1378 TCTGAGTTTAATGAATTTCACTCTGGAGATAATATCGATGACGGTGACGATTGCTTCAAG 1437
Query 1710 GATGCATGGAATGATACTACACCAGA-----------T-GGAGATACTTGCAACGGTTGG 1757
|||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1438 GATGCATGGAATGATACTACACCAGAGAAAGAAAACCTTGGAGATGCTTGCAACGGTTGG 1497
Query 1758 AATGAGAATGAATCTGAAGAGGAGGTTAAGCTATCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGA 1817
|||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 AATGAGAATGAATCTGAAGA--AGGT-AAGCTGTCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGA 1554
Query 1818 TGGCCTATATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTT 1877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGGCCTATATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTT 1614
Query 1878 GAGCAACTGATCAGACACAAATATTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTT 1937
|||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1615 GAGCTGCTTATTAGACACAAATATTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATTCAATTT 1674
Query 1938 ACGCTGGATGAACTCCAGAATCTACCCTCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAAC 1997
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 ACGGTGGATGAACTCCAGAATCTACCCTCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAAC 1734
Query 1998 AAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTCCCATCTCA-GCAAAATCCTCAAATT 2056
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||
Sbjct 1735 AAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTGCCATCTCAAG-AAAATTCTCAAATT 1793
Query 2057 CCTGCAGGACTTATCTCAGGCCTGTGGATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCCA 2116
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1794 CCTGCAGGACTTGTCTCAGGCCTGTGGATTGAGTCGATATTCCGAACAAAGTAACCCCAA 1853
Query 2117 CGATGAGATTAATTTTGGTGACCTGGGTCGTGAAGTCACAGAGGAGATTCTTCTTGATAG 2176
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1854 CGATGAAATTAATTTTGGTGACCTGGGTCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGG 1913
Query 2177 TGAAGATTCATGTCTTCTTATGGATGAAAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAAAA 2236
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1914 TGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATGAAAAATTGCTTGGAACTGAGTGCATCCAAGAGAT 1973
Query 2237 ATATATGGGCTCAGCATTTAATAATGTAACTATAGCAAGTTCTGGAGATATTGCTAATGG 2296
|||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||| | || | | ||
Sbjct 1974 ATATATGGGCTCAGCACTTAATAATG---CTA-A-----T---GGA-A-AT-G--A-TG- 2014
Query 2297 AAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAG 2356
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2015 ---TG-T----CTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTCGCAGGACCCTCTAG 2066
Query 2357 CGAGGAACAAGTTGTGTCATGGATGCGCACAAAGGAAGATAAAACTAATCAAGGACTGGA 2416
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2067 CGGGGAACAAGTTGTGTCATGGATGTGCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGA 2126
Query 2417 GATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATG 2476
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2127 GATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATG 2186
Query 2477 CGAGCACTTAAGCTATGAGGGAGCACTGCAGACTGTCGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAGG 2536
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2187 CGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCACTGCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAGAAGG 2246
Query 2537 CCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAATTTACCCATGAAAGCTATGAAACTGTGCTGAGGAA 2596
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2247 CCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGTTTACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGTTGAGGAA 2306
Query 2597 ACGAAGAGAAGAGCTAAATGAGAGTGACCATGAGTTGTTGTTTATCAGTAGCAGGTTTGA 2656
||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2307 ACGAAGAGACGATCTAAATGAGAATGACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGA 2366
Query 2657 GTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGAAAGATGCCGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGG 2716
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2367 GTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGAAAGATGCTGAAACCCTTAACCACAATCAATTTGG 2426
Query 2717 ATATGAAGAATCATATGGCTGCACTAGTTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGC 2776
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2427 ATATGAAGAATCATATGGCTGCACGAGTTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGC 2486
Query 2777 TGATGAATGGGGGATAAAGGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGAT 2836
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2487 TGATGAATGGGGGATGAATGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGAT 2546
Query 2837 TCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCTGCAGAGCTTAGCAGAATCGATGC-ACAAATGATGC 2895
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||
Sbjct 2547 CCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCTTCAGAGCTTAGCAGAATTGACGCGA-AAATGATGC 2605
Query 2896 GAAATGTCACTGGGATGCAGCAATTAGAGCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATT 2955
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2606 GTACTGTCACTGGGATGCAGCAATTAGAGCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATT 2665
Query 2956 ATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAG 3015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2666 ATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAG 2725
Query 3016 CAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCTGATGCTGCAAGAGAAGCCTTACTTGTTGAGCTAG 3075
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2726 CAGAGAGAGATGCCACTGAGAAGTCTGATGCTGCAAGAGAAGCTTTACTTGTTGAGCTCG 2785
Query 3076 CTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAA 3135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2786 CTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAAAACATGCTGGAAA 2845
Query 3136 AGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAAGTGAAGGATATGAAGGCAACTA 3195
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 2846 AGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCAACTA 2905
Query 3196 TTGGAAGCGACCATCGCTCCAATGCTGATTCAGTTGAACACAGCCCCCTTCCGGTTGCAC 3255
|||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2906 TTGGAAACGACCATCGCTTCAATGCTGATTCTGTTGAACACAGCCCCCTTCCGGTTGCAT 2965
Query 3256 CTGTCGGCGATCATTCAGAGGCTGACATTGTTTCTGAAGCTGTTGAAGCTTTAAAAGAAG 3315
||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2966 CTGTCGGTGATTATTCAGAGGCTGATGTTGTTTCTGAAGCTGTTGAAGCTATAAAAGAAC 3025
Query 3316 AGGAAGAGGAATATAAACGCCAAATAGAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAA 3375
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3026 AAGAAGAGGAATATAAACGCCAAAGAGAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAA 3085
Query 3376 CCCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGAGGATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAAC 3435
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3086 CTCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGAGGATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAAC 3145
Query 3436 AAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCCCATGAATGTTGCAAAGACAGTGTATAATGGGTGCA 3495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 3146 AAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCCCATGAATGTTGCAAAGGCAGTGTATAATGCATGCA 3205
Query 3496 CAGATAATGAAGTTGATTATTTAGTTTTACAAGGACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGA 3555
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3206 CAGATAATGTAGTTGATTATTTAGATTTACAAGGACATGGAAAATCCATAAATCAGGAGA 3265
Query 3556 AAAGGAATGGACGACTTGATGACCTGGAAGGAGCCAGTGTGAATACAAATGGAGTTTTCC 3615
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3266 AAAGGAATGGACGACTTGACGACCTGGAAGGAGCCAGAGTGAATACAAATGGAGTTTTCC 3325
Query 3616 CGTCAACAAATCATTCTGCGATATCTGATACTGCAAAGGTGCAGAATGTAAAATCCCAAA 3675
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3326 CGTCAACAAATTATTCTGCGATATCTGATAGTGCAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAA 3385
Query 3676 AAGTAGTGCCTAACGGCACAGCTATGCAAGCTGGTATTTTCCAATCTGATCAACGAACTG 3735
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3386 AAGTAGTGCCTAATGGCACAGCTATGCAAGCTGGTATGTTCCAATCTGATCAACGAACTG 3445
Query 3736 GGAGGAGAACTAGACGCCAAAAAGCTTCAAACAAGTTAGCTGATGGAAAATATCCGGTCA 3795
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3446 GGAGGAGAGGTAGACGCCAAAAAGCTTCAAACAAGTTAGTTGATGGAAAATATCCGGTCA 3505
Query 3796 CACCTCCTGAGACCGAAAATAGTAAATCTCAGTTGTCAGGCACCAACGGCGAGAGACATT 3855
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 3506 CACCTCCTGAGACCGAAAATAGTAAATCTCAGTGGTCAGGCACCGACGCCGAGAGACATT 3565
Query 3856 CTGAAACTCTACGTAACAATGGTGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTG 3915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3566 CTGAAACTCTACGTAACAATGGTGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTG 3625
Query 3916 AAGACGATGACGAAGAAAGGTTTCAAGCTGACATGCAAAGGGCAGTGCT 3964
|||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||
Sbjct 3626 AAGACGATGAAGAAGAAAGGTTTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCACTGCT 3674
Score = 1890 bits (1023), Expect = 0.0
Identities = 1095/1130 (97%), Gaps = 4/1130 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3975 GACGTGTACCAAGGAGGTAGAAATATGGCGTCATGTTTGAGGACACCGCTGGAAGTAAAC 4034
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3781 GACGTGTACCAAGGAGGTAGAAATATGGCTTCATGTTTGAGGACACCTCTGGAAGTAAAC 3840
Query 4035 AATGATGGGGGTTTATCTGATGACACAATGGAGTCTAGGAGCTCAACAGGAGTTACCATA 4094
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 3841 AATGATGGGGGTTTATCTGATGACACAATTGAGTCTAGGAGCTCAACCGGAGTTGCCATA 3900
Query 4095 TTTGGCACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATA 4154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3901 TTTGGCACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTGAATGTTATCATA 3960
Query 4155 CAGTCTCTATGGAATTTGGAGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACGGAGTTCAACACGAGAG 4214
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3961 CAGTCTCTATGGAATCTGGAGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACAGAGTTCAACACAAGAG 4020
Query 4215 CACCATCACGTGGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATCTTTACCGCTTTG 4274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 4021 CACCATCACGTGGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATTTTTACTGCTTTG 4080
Query 4275 AGCGCTGCTTCAAGTGAAAAACAAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCT 4334
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4081 AGCGCTGCTTCGAGTGAAACACAAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCT 4140
Query 4335 TTAAGTAATTTGTATCCAGATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCA 4394
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4141 TTGAGTAATTTGTATCCAGATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCA 4200
Query 4395 GAAGTACTGGCTGTGATCTTTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTG 4454
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4201 GAAGTACTGGCGGTGATCTTTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTG 4260
Query 4455 TCTGATGTGGATTCCTCAGACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCACA 4514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4261 TCTGATGTGGATTCCTCAGACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCACA 4320
Query 4515 TGTATTGCCCATTCTTTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTGT 4574
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4321 TGTATTGCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTGT 4380
Query 4575 GGGCTGGAGTCCAGGCATTTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCC 4634
||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4381 GGGCTAGAATCCAGGCATATGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCC 4440
Query 4635 CTACGCACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTTAACCTTGTC 4694
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 4441 CTACGCACCATGAAGGTTACATGCACTGAGAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGTC 4500
Query 4695 GAGATGAACCATCAACTAGCCTGTGATCCCGAAACCGGTGGGTGTGGGAAACTCAACCAT 4754
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4501 GAGATGAACCATCAACTAGCCTGTGATTCCGAAACGGGTGGATGTGGGAAACTCAACCAT 4560
Query 4755 ATCCACCATATTCTCACTACTCCACCACATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAAC 4814
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4561 ATCCACCATATTCTCACTACTCCACCGCATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAAC 4620
Query 4815 ACATGTGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGAC 4874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4621 ACATGTGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGAC 4680
Query 4875 ATCAGCATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCTGTGGTT 4934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4681 ATCAGCATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTT 4740
Query 4935 TGTTATTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGATC 4994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4741 TGTTATTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGATC 4800
Query 4995 ATGTACGATGACAAAACCGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGA-TCGATGTTCTTTCAATGTG 5053
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||
Sbjct 4801 ATGTACGATGACAAAACCGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGAGT-GATGTTCTTTCTATGTG 4859
Query 5054 TGAAAGAGGACACTTGCAGCCACAGGTTCTTCTCTACGAGA-GACGTTAA 5102
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 4860 TGAAAGAGGACACTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAGAAG-CGTTAA 4908
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 205320606335
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5