BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G48430.1
Length=4373
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg485204 jgi|Araly1|485204|fgenesh2_kg.5__1196__AT3G48430.1 6540 0.0
Ahg937600 jgi|Araly1|937600|scaffold_501791.1 2832 0.0
> Ahg485204 jgi|Araly1|485204|fgenesh2_kg.5__1196__AT3G48430.1
Length=4358
Score = 6540 bits (3541), Expect = 0.0
Identities = 4113/4387 (94%), Gaps = 48/4387 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGGTTTCAGAGCAGAGTCAAGATGTGTTTCCATGGCTTAAATCGTTACCGGTTGCT 60
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGTTTCAGAGCAGAGTCAAGACGTGTTTCCATGGCTTAAATCGTTACCGGTTGCT 60
Query 61 CCAGAGTTCAGACCTACTCTAGCAGAGTTTCAAGATCCGATCGCTTACATTTTGAAGATT 120
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCAGAGTTCAGACCTACTTTAGCAGAGTTTCAAGATCCGATCGCTTACATTTTGAAGATT 120
Query 121 GAAGAAGAAGCTTCTAGATATGGAATCTGTAAAATTCTGCCTCCACTGCCTCCTCCTTCC 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAAGAAGAAGCTTCTAGATATGGAATCTGTAAAATTCTTCCTCCACTGCCTCCTCCTTCT 180
Query 181 aaaaaaaCCTCGATTTCTAATCTCAACCGTTCTCTGGCGGCAAGAGCGGCGGCGAGGGTT 240
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AAGAAAACCTCGATTTCTAACCTCAACCGTTCTCTGGCGGCAAGAGCGGCGGCGAGGGTT 240
Query 241 CGTGACGGCGGCTTTGGCGCGTGTGATTATGACGGTGGTCCCACATTCGCCACGCGCCAG 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 241 CGTGACGGCGGCTTTGGCGCGTGTGATTATGACGGTGGTCCCACATTCGCCACGCGGCAA 300
Query 301 CAGCAGATCGGGTTTTGCCCTAGGAAACAGCGTCCAGTGCAGAGACCTGTGTGGCAGAGT 360
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CAGCAGATCGGGTTTTGCCCTAGGAAGCAGCGTCCGGTGCAGAGACCTGTGTGGCAGAGT 360
Query 361 GGAGAGGAGTACTCTTTTGGTGAGTTCGAGTTTAAAGCTAAGAACTTTGAGAAGAATTAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGAGAGGAGTACTCTTTTGGTGAGTTCGAGTTTAAAGCTAAGAACTTTGAGAAGAATTAT 420
Query 421 CTCAAGAAATGTGGTAAAAAGAGTCAACTCTCTGCCCTTGAAATTGAAACACTTTACTGG 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct 421 CTCAAGAAATGTGGTAAAAAGAGTCAACTCTCTGCCCTAGAAATCGAAACCCTTTACTGG 480
Query 481 AGAGCCACTGTGGATAAACCCTTCTCTGTTGAGTATGCCAATGACATGCCTGGCTCGGCT 540
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 481 AGAGCAACAGTGGATAAACCCTTCTCTGTTGAGTATGCCAATGATATGCCTGGCTCTGCT 540
Query 541 TTTATCCCTCTGAGTCTGGCTGCTGCGAGGAGGAGAGAGTCTGGTGGTGAAGGAGGAACA 600
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 541 TTTATCCCTCTGAGTCTGGCTGCTGCCAGGAGGAGAGAGTCTGGTGGTGACGGAGGAACA 600
Query 601 GTTGGTGAGACCGCTTGGAACATGAGGGCAATGTCTAGAGCCGAAGGATCATTGCTTAAG 660
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTTGGTGAGACTGCTTGGAACATGAGGGCAATGTCTAGAGCCGAAGGATCATTGCTTAAG 660
Query 661 TTCATGAAGGAAGAGATCCCTGGAGTTACATCACCAATGGTGTATGTTGCTATGATGTTT 720
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 661 TTCATGAAAGAGGAGATCCCTGGAGTTACATCACCAATGGTGTATATTGCTATGATGTTT 720
Query 721 AGTTGGTTTGCTTGGCATGTGGAGGACCATGACCTTCATAGTCTCAATTACTTGCATATG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AGTTGGTTTGCTTGGCATGTGGAGGACCATGACCTTCATAGTCTCAATTACTTGCATATG 780
Query 781 GGTGCTGGTAAGACTTGGTACGGTGTGCCAAAGGATGCTGCTCTGGCTTTTGAGGAGGTT 840
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 781 GGTGCTGGTAAGACTTGGTATGGCGTGCCAAAGGATGCTGCTGTGGCTTTTGAGGAGGTG 840
Query 841 GTTAGGGTTCATGGTTACGGTGAAGAGCTCAATCCTCTTGTGACATTTTCTACTCTTGGT 900
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GTTAGGGTTCATGGTTATGGTGGAGAGCTCAATCCTCTTGTGACATTTTCTACTCTTGGT 900
Query 901 GAGAAGACAACTGTGATGTCTCCTGAAGTATTTGTTAAAGCCGGAATACCGTGTTGCAGG 960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 901 GAGAAGACAACTGTGATGTCTCCTGAAGTATTTGTTAAAGCCGGAATACCATGTTGCAGA 960
Query 961 TTAGTGCAAAATCCTGGAGAGTTTGTCGTCACCTTTCCGGGAGCTTATCATTCGGGATTT 1020
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TTAGTGCAAAATCCTGGAGATTTTGTCGTCACCTTTCCGGGAGCTTATCATTCGGGATTT 1020
Query 1021 AGTCATGGATTTAATTTTGGAGAAGCATCTAACATTGCCACTCCCGAATGGTTGAGAATG 1080
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 AGTCATGGATTCAATTTTGGAGAAGCATCGAACATTGCAACTCCCGAATGGTTGAGAATG 1080
Query 1081 GCTAAAGATGCTGCTATCCGGCGAGCTGCTATAAATTACCCTCCAATGGTTTCTCATCTC 1140
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1081 GCTAAAGATGCTGCTATCCGGCGAGCTGCAATAAATTACCCTCCTATGGTTTCACATCTC 1140
Query 1141 CAGCTACTTTATGACTTTGTATTGGCTCTAGGTTCTAGAGTGCCAACAAGCATCAATCCC 1200
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1141 CAGCTACTTTATGACTTTGCATTGGCTCTAGGTTCTAGAGTGCCAACAAGCATCAATGCG 1200
Query 1201 AAACCACGGAGTTCTAGATTAAAAGATAAGGCAAGAAGCGAAGGAGAAAGATTGACCAAA 1260
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 AAACCACGGAGTTCTAGATTAAAAGATAAGTTAAGAAGCGAAGGAGAAAGATTGACCAAA 1260
Query 1261 AAGCTATTTGTGCAAAACATTATCCACAACAACGAATTGCTTTCTTCTCTCGGAAAAGGA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AAGCTATTTGTGCAAAACATTATCCACAACAACGAATTGCTTTCTTCTCTCGGAAAAGGA 1320
Query 1321 TCCCCAGTGGCCCTTCTCCCACAGAGTTCCTCAGATATATCAGTTTGTTCTGACCTGCGA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TCCCCAGTGGCCCTTCTCCCACAGAGTTCCTCAGATATATCAGTTTGTTCTGACCTGCGA 1380
Query 1381 ATTGGATCCCATTTGATAACCAACCAGGAAAACCCAATCC-AGTTAAAGTGTGAGGACTT 1439
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||
Sbjct 1381 ATCGGATCCCATTTGATAACCAACCAGGAAAACCCAATCCTA-TTAAAGTCTGAGGACTT 1439
Query 1440 AAGTTCTGATAGTGTTGTGGTTGATCTCAGTAACGGTTTAAAGGATACAGTTTCAGTGAA 1499
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 AAGTTCTGATAGTGTTATGGTTGGTCTCAGTAACGGTTTAAAGGATACAGTTTCAGTGAA 1499
Query 1500 AGAAAAATTTACATCTTTATGTGAAAGGAGCAGAAATCACCTAGCAAGCACGGAGAAGGA 1559
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1500 AGAAAAATTTACATCCTTATGTGAAAGGAGCAGAAATCACCTAGCAAGCAGGGAGAAGGA 1559
Query 1560 CACTCAAGAAACTCTGTCTGATGCTGAAAGGAGGAAGAATGATGCAGCTGTTGCGCTTTC 1619
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1560 CACTCAAGAAACTCTATCTGATGCCGAAAGGAGGAAAAATGATGGAGCTGTTGCACTTTC 1619
Query 1620 GGATCAAAGGCTTTTCTCTTGTGTTACATGTGGAGTCTTAAGCTTTGATTGTGTAGCTAT 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TGATCAAAGGCTTTTCTCTTGTGTTACATGTGGAGTCTTAAGCTTTGATTGTGTAGCTAT 1679
Query 1680 CGTTCAACCTAAAGAAGCAGCTGCTAGATATCTCATGTCTGCAGATTGTAGCTTCTTCAA 1739
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TGTTCAACCTAAAGAAGCAGCAGCTAGATATCTCATGTCTGCAGATTGTAGCTTCTTCAA 1739
Query 1740 TGATTGGACAGCTGCTTCTGGATCTGCAAATCTTGGTCAGGCTGCAAGATCACTTCATCC 1799
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1740 TGATTGGACAGCTGCTTCCGGATCTGCAAATCTTGGTCAGGCTGCTAGATCACTTCATCC 1799
Query 1800 TCAAAGCAAAGAGAAGCATGATGTAAATTACTTCTACAATGTTCCTGTTCAAACTATGGA 1859
| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1800 GCTAAGCACCGAAAAGCATGATGTAAATTACTTCTACAATGATCCTGTTCAAACTATGGA 1859
Query 1860 TCATTCAGTGAAGACTGGCGATCAAAAAACTTCAACAACTTCCCCGACAATAGCGCATAA 1919
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||
Sbjct 1860 TCATTCAATGAAGACTGGCGATCAAAGAACTTCAACAGCTTCCCTGACAATGGCGCATAA 1919
Query 1920 AGATAATGATGTTCTTGGGATGTTAGCTTCAGCATATGGAGACTCTTCTGATTCCGAGGA 1979
|||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 AGATAATGGTGCTCTTGGGCTGTTAGCTTCAGCATATGGAGACTCTTCTGATTCCGAGGA 1979
Query 1980 AGAAGATCAAAAAGGCTTAGTTACCCCTAGTTCCAAAGGGGAAAC-AAAAACGTATGATC 2038
||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1980 AGAAGGTCAAAAAGGCTTAGATGTCCCTACTTCCGAAGGGGAAACGAAAAA-GTATGATC 2038
Query 2039 AAGAAGGTTCAGATGGCCATGAGGAGGCTAGAGATGGTAGAACTTCTGATTTTAACTGCC 2098
|||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2039 AAGAAGATGCAGATGGCAATGAGGAGGCTAGAGATGGTCGAACTTCTGATTTTAACAGCC 2098
Query 2099 AGAGACTAACCAGCGAACAGAATGGGTTAAGCAAAGGCGGAAAATCATCACTTCTGGAAA 2158
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2099 AGAGACTTACCAGCGAACAGAATAGGTTAAGCAAAGGCGGAAATTCATCACTTCTGGAAA 2158
Query 2159 TAGCTTTACCATTTATTCCAAGATCTGATGACGATTCATGTCGGTTGCACGTGTTTTGTC 2218
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 TAGCTTTACCATTTATTCCAAGATCTGATGATGATTCATGTCGGTTGCACGTGTTTTGTC 2218
Query 2219 TTGAGCATGCTGCGGAAGTGGAACAGCAACTTCGTCCTTTTGGGGGGATTAACTTAATGT 2278
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2219 TTGAGCATGCTGCGGAAGTGGAACAACAACTTCGTCCTTTTGGGGGGATTCACATAATGC 2278
Query 2279 TACTGTGCCATCCAGAGTACCCCAGGATAGAGGCTGAAGCAAAGATAGTTGCCGAAGAGC 2338
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 TACTATGCCATCCAGAGTACCCCAGGATAGAGGCTGAAGCAAAGATAGTTGCCGAAGAGC 2338
Query 2339 TCGTCATCAATCACGAATGGAATGATACTGAATTCAGGAATGTGACCCGAGAGGATGAGG 2398
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 TCGTCATAAATCACGAATGGAATGATACTGAATTCAGGAATGTGACCCGAGAGGATGAGG 2398
Query 2399 AAACGATTCAGGCAGCGTTGGATAATGTTGAAGCTAAGGGTGGGAACAGTGATTGGACCG 2458
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2399 AAACGATTCAGGCAGCCTTGGATAATGTTGAAGCTAAGGGTGGGAACAGTGATTGGACTG 2458
Query 2459 TAAAATTGGGTGTTAACCTTTCTTACAGCGCTATTCTCAGTCGCTCTCCTCTGTACAGTA 2518
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 TAAAATTGGGTATTAACCTTTCTTACAGCGCTATTCTCAGTCGCTCTCCTCTGTACAGTA 2518
Query 2519 AGCAGATGCCGTATAACTCCATCATATACAAGGCGTTCGGTCGCAGCTCTCCAGT-AGCG 2577
||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | | |
Sbjct 2519 AGCAGATGCCGTACAACTCCGTCATATACAATGCATTCGGTCGCAGCTCTCCA-TCAACA 2577
Query 2578 AGCTCACCCTCGAAACCCAAAGTCTCTGGTAAAAGATCGTCCAGACAGAGGAAATATGTT 2637
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 AGCTCACCCTTGAAACCCGAAGTCTCTGGTAAAAGATCTTCCAGACAGAGGAAATATGTT 2637
Query 2638 GTTGGAAAATGGTGTGGTAAGGTTTGGATGTCACATCAGGTGCATCCCTTTTTGCTGGAG 2697
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 GTTGGAAAATGGTGTGGTAAGGTTTGGATGTCGCATCAGGTGCATCCCTTTTTGCTGGAG 2697
Query 2698 CAGGACTTAGAGGGGGAAGAATCTGAAAG-AAGTTGTCATCTTCGAGTTGCTATGGATGA 2756
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||| |||
Sbjct 2698 CAGGACTTAGAGGGGGAAGAATCTGAAAGGAA-TTGTCATCTGCGAGGTGCTCTGGTTGA 2756
Query 2757 GGATGCCACTGGAAAGAGATCGTTTCCTAATAATGTTTCCAGGGATTCGACAACAATGTT 2816
||||| |||| ||| | ||| ||||||| |||||| || || ||| | || ||||||||
Sbjct 2757 GGATGTCACTAGAACGGGATTGTTTCCTTGTAATGTCTCTAGAGATGCAACTACAATGTT 2816
Query 2817 TGGAAGAAAGTATTGTAGGAAGAGAAAGATAAGAGCAAAGGCGGTGCCACGCAAGAAGCT 2876
|||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2817 TGGAAGAAAGTATTGTAGGAAGAGAAAGGTCAGGGCAAAGGCTGTGCCACGCAAGAAGCT 2876
Query 2877 TACTTCTTTTAAGAGGGAAGATGGAGTTTCTGATGACACATCAGAAGATCATTCTTATAA 2936
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 GACTTCTTTTAAGAGGGAAGATGGAGTTTCTGATGACACATCAGAAGATCATTCTTATAA 2936
Query 2937 GCAGCAATGGAGGGCTTCCGGGAATGAGGAAGAGTCTTATTTTGAGACAGGGAACACAGC 2996
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2937 GCAGCAATGGAGGGCTTCCGGGAATGAGGAAGAGTCTTATTTTGAGACAGGGAATACAGT 2996
Query 2997 TTCTGGTGATTCATCAAATCAAATGTCTGATCCGCA-C--AAGGGAATTA-TCAGACATA 3052
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||| |
Sbjct 2997 TTCTGGTGATTCGTCAAATCAAATGTCTGATCAGCAGCTCAAGGGAATTCGTC-GACACA 3055
Query 3053 AAGGT-TATAAAGAATTTGAGTCAGATGATGAGGTTTCAGACCGTTCACTTGGGGAAGAG 3111
||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 GGGGTGTC-AAAGAATTTGAGTCGGATGATGAGGTTTCAGACCGTTCACTTGGGGAAGAA 3114
Query 3112 TATACTGTACGGGCATGTGCAGCTTCAGAGAGCTCAATGGAGAATGGCTCTCAGCATTCA 3171
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 3115 TATACTGTAAGGGGATGTGCAGCTTCAGAGAGCTCAATGGAGAATGGCTTTCAGCAGTCA 3174
Query 3172 ATGTATGACCatgatgatgatgatgatgatATCGACAGGCAGCCTAGGGGGATTCCAAGG 3231
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3175 ATGTATGATGATGATGATGATGATGATGATATCGACAGGCACCCTAGGGGAATTCCAAGG 3234
Query 3232 AGCCAACAGACAAGAGTTTTTAGGAATCCAGTTTCATATGAGTCAGAAGATAATGGCGTT 3291
||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||
Sbjct 3235 AGCGAACGGATTACAGTTTTTAGGAATCCAGTTTCATATGATTCAGAAGAAAATGGCATT 3294
Query 3292 TATCAGCAAAGCGGAAGAATATCCATAAGTAATAGGCAAGCTAATCGAATGGTTGGTGAA 3351
||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3295 TATCATCAGAGAGGAAGAGTATCCCGAAGTAATAGGCAAGCTAATCGAATGGGTGGTGAA 3354
Query 3352 TATGATTCAGCAGAGAATTCTTTGGAGGAACGAGGCTTTTGCAGTACAGGGAAAAGGCAA 3411
|||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3355 TATGATTCAGAAGAGAATTCTTTGGAGGAACAAGACTTTTGCAGTACAGGGAAAAGGCAA 3414
Query 3412 ACCAGGTCAACAGCCAAACGAATAGCAAAAACCAAGACAGTTCAGAGTTCGAGAGACACA 3471
|||||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 3415 ACCAGGTCCACAGCCAAACGAAAAGTTAAAATCGAGACAGTTCGGAGTCCGAGAGACACA 3474
Query 3472 AAAGGTCGCTTTTTGCAAGAATTTGCATCTGGAAAGAAGAATGAAGAATTGGATTCATAC 3531
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 AAAGGTCGCACTTTGCAAGAATTTGCATCTGGAAAGAAGAATGAAGAATTGGATTCATAC 3534
Query 3532 ATGGAGGGACCTAGCACACGGCTTAGGGTGAGACATCAGAAGCCGTCGAGAG-GGTCTTT 3590
||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||| || |||
Sbjct 3535 ATGGAGGGACCTAGCACACGGCTTAGGGTGAGAAACCTGAAGCCATTGAGAGCGG-CTTC 3593
Query 3591 AGAAACAAAACCAAAGAAGATTGGTAAGAAGAGAAGTGGTAATGCTTCCTTCTCCAGAGT 3650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3594 AGAAACAAAACCAAAGAAGATTGGTAAGAAGAGAAGTGGTAATGCTTCCTTCTCCAGAGT 3653
Query 3651 TGCAACTGAAAAAGATGTGGAGGAAAaagaagaagaagaagaagaagaagagaaTGAGGA 3710
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||
Sbjct 3654 TGCAACTGAAGAAGATGTGGAGGAA---GATGAAGAAGCAGA-GAA--------TGAGGA 3701
Query 3711 AGAGGAATGTGCAGCATACCAATGTAACATGGAGGGTTGCACGATGAGTTTCAGTTCGGA 3770
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3702 AGAGGAATGTGCGGCGTACCAATGTGACATGGAGGGTTGCACAATGAGTTTCAGTTCAGA 3761
Query 3771 AAAACAGTTGATGTTACACAAAAGAAACATATGCCCAATTAAAGGCTGTGGTAAAAACTT 3830
||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3762 AAAACAGTTGACATTGCATAAAAGAAACATCTGCCCTGTTAAAGGCTGTGGTAAAAACTT 3821
Query 3831 CTTCTCACACAAGTATTTGGTTCAACACCAGCGTGTTCACTCAGACGACCGTCCTCTGAA 3890
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3822 CTTCTCACACAAGTATTTGGTTCAACACCAGCGAGTTCACTCAGACGACCGTCCTCTGAA 3881
Query 3891 ATGTCCATGGAAGGGATGTAAGATGACGTTCAAGTGGGCTTGGTCTAGAACCGAGCACAT 3950
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3882 ATGTCCATGGAAAGGCTGTAAGATGACGTTCAAGTGGGCTTGGTCTAGAACCGAGCACAT 3941
Query 3951 AAGGGTTCACACAGGCGCTAGGCCTTATGTTTGCGCTGAACC-GGATTGTGGTCAAACAT 4009
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||
Sbjct 3942 AAGGGTTCACACAGGCGCTAGGCCTTATGTTTGCGCTGAACCAGG-TTGTGGTCAGACAT 4000
Query 4010 TCAGGTTTGTCTCTGACTTCAGCCGGCATAAAAGGAAGACCGGTCATTCGGTTAAGAAGA 4069
|| |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 4001 TCCGGTTTGTCTCAGATTTTAGCCGGCATAAAAGGAAGACAGGTCATTCGGTAAAGAAGA 4060
Query 4070 CCAACAAAAGGTGATTTAGGCTCTAACAT-GGAATCTATCATGAAGAAGATTACTCCATT 4128
|||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4061 CCAAGAAAAGGTAATTTAGGCTCTAACATTGGAATCTTTCATGAAGA-GATTACTCCATT 4119
Query 4129 GATCTATTAGAAGAAAATTGGATTGTACGAATATTAGGGGTTTTCTAAGTGTGTATGTCT 4188
||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4120 GATCTATTAGAAGAAAATTGGATTGTAGGGATTTTAGGGGTTTTCTAAGTGTGTATGTCT 4179
Query 4189 CTCTGGTCCTCTGTCAATTCGGGATTATAA---AGTCAAA-GTCTTAACATTTGGAATAG 4244
|||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 4180 CTCTGGTCCTTTGTCTATTTGGGATTATTATTCAGTCAAAAGTCTTAACATTTGGAAGAG 4239
Query 4245 CCATTGTTTGTTGCAGACGTTTTCACTTTCAGACAGATTCTCTCTTTGTTGTA-T-TC-T 4301
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |
Sbjct 4240 CCATTGTTTGTTGCAG-CATTTTCACTTTCAGACAGATTATCTCTTTGTTGTACTATTGT 4298
Query 4302 CTATTTTTGCAGTTGAATGAATCTGTAACAACAACAAATCCTGGTGTAGGAAAAGCATTG 4361
||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4299 CTACTTT-GCAATTGAATGAATCTGTAGCAA-A-----TCCTGGTGTAGGAAAAGTATTG 4351
Query 4362 TGTTACT 4368
||| |||
Sbjct 4352 TGTCACT 4358
> Ahg937600 jgi|Araly1|937600|scaffold_501791.1
Length=4180
Score = 2832 bits (1533), Expect = 0.0
Identities = 1852/2007 (92%), Gaps = 18/2007 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGGTTTCAGAGCAGAGTCAAGATGTGTTTCCATGGCTTAAATCGTTACCGGTTGCT 60
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 ATGGCGGTTTCAGAGCAGAGTCAAGACGTGTTTCCATGGCTTAAATCGTTACCGGTTGCT 81
Query 61 CCAGAGTTCAGACCTACTCTAGCAGAGTTTCAAGATCCGATCGCTTACATTTTGAAGATT 120
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 82 CCAGAGTTCAGACCTACTTTAGCAGAGTTTCAAGATCCGATCGCCTACATTTTTAAGATC 141
Query 121 GAAGAAGAAGCTTCTAGATATGGAATCTGTAAAATTCTGCCTCCACTGCCTCCTCCTTCC 180
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 GAAGAAGAAGCTTCTAGATACGGAATCTGTAAAATTCTGCCTCCACTGCCTCCTCCTTCT 201
Query 181 aaaaaaaCCTCGATTTCTAATCTCAACCGTTCTCTGGCGGCAAGAGCGGCGGCGAGGGTT 240
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 AAAAAAACCTCAATTTCTAACCTCAACCGTTCTCTGGCGGCAAGAGCGGCGGCGAGGGTT 261
Query 241 CGTGACGGCGGCTTTG-GCGCGTGTGATTATGACGGTGGTCCCACATTCGCCACGCGCCA 299
|||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 262 CGTGACGGCGGC-GAGAGTTCGTTTGATTACGACGGTGGTCCCACATTCGCCACGCGGCA 320
Query 300 GCAGCAGATCGGGTTTTGCCCTAGGAAACAGCGTCCAGTGCAGAGACCTGTGTGGCAGAG 359
||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 ACAGCAGATCGGTTTTTGCCCTAGGAAGCAGCGTCCCGTGCAGAGACCTGTGTGGCAGAG 380
Query 360 TGGAGAGGAGTACTCTTTTGGTGAGTTCGAGTTTAAAGCTAAGAACTTTGAGAAGAATTA 419
|||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 381 CGGAGAGCATTACAGTTTTGGTGAGTTCGAGGCCAAAGCTAAGACCTTTGAGAAGAATTA 440
Query 420 TCTCAAGAAATGTGGTAAAAAGAGTCAACTCTCTGCCCTTGAAATTGAAACACTTTACTG 479
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 441 TCTGAAGAAATGTGGCAAAAAGAGTCAACTCTCTGCCCTAGAAATCGAAACACTTTACTG 500
Query 480 GAGAGCCACTGTGGATAAACCCTTCTCTGTTGAGTATGCCAATGACATGCCTGGCTCGGC 539
|||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 501 GAGAGCAACAGTGGATAAACCTTTCTCTGTTGAGTATGCCAATGACATGCCAGGTTCGGC 560
Query 540 TTTTATCCCTCTGAGTCTGGCTGCTGCGAGGAGGAGAGAGTCTGGTGGTGAAGGAGGAAC 599
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||
Sbjct 561 TTTTATCCCTCTGAGTCTGGCAGCTGCGAGGAGGAGAGAGTATGGTGGCGATGGAGGAAC 620
Query 600 AGTTGGTGAGACCGCTTGGAACATGAGGGCAATGTCTAGAGCCGAAGGATCATTGCTTAA 659
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 AGTTGGTGAGACAGCTTGGAACATGAGGGCAATGTCTAGAGCCGAAGGATCATTGCTTAA 680
Query 660 GTTCATGAAGGAAGAGATCCCTGGAGTTACATCACCAATGGTGTATGTTGCTATGATGTT 719
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 681 GTTCATGAAGGAGGAGATTCCTGGAGTTACATCACCAATGGTGTATATTGCTATGATGTT 740
Query 720 TAGTTGGTTTGCTTGGCATGTGGAGGACCATGACCTTCATAGTCTCAATTACTTGCATAT 779
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAGTTGGTTTGCTTGGCATGTGGAGGATCATGACCTTCATAGTCTCAATTACTTGCATAT 800
Query 780 GGGTGCTGGTAAGACTTGGTACGGTGTGCCAAAGGATGCTGCTCTGGCTTTTGAGGAGGT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 801 GGGTGCTGGTAAGACTTGGTACGGTGTGCCAAAGGATGCTGCTGTGGCTTTTGAGGAGGT 860
Query 840 TGTTAGGGTTCATGGTTACGGTGAAGAGCTCAATCCTCTTGTGAC-ATTTTCTACTCTTG 898
||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 861 GGTTAGGGTTCATGGTTATGGTGGAGAGCTTAATCCTCTTGTGACCATTT-CTACTCTTG 919
Query 899 GTGAGAAGACAACTGTGATGTCTCCTGAAGTATTTGTTAAAGCCGGAATACCGTGTTGCA 958
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 920 GTGAGAAGACAACTGTGATGTCACCTGAAGTTTTTGTTAAAGCTGGAATACCTTGTTGCA 979
Query 959 GGTTAGTGCAAAATCCTGGAGAGTTTGTCGTCACCTTTCCGGGAGCTTATCATTC-GGGA 1017
||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||
Sbjct 980 GGTTAGTACAAAATCCTGGAGAGTTTGTTGTCACTTTTCCAAGAGCATATCATTCAGGG- 1038
Query 1018 TTTAGTCATGGATTTAATTTTGGAGAAGCATCTAACATTGCCACTCCCGAATGGTTGAGA 1077
|||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1039 TTTAGTCACGGATTCAATTGTGGAGAAGCATCTAACATTGCAACTCCCGAATGGTTGAGA 1098
Query 1078 ATGGCTAAAGATGCTGCTATCCGGCGAGCTGCTATAAATTACCCTCCAATGGTTTCTCAT 1137
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 GTGGCTAAAGATGCTGCTATCCGCCGAGCTGCTATAAATTACCCTCCAATGGTTTCTCAT 1158
Query 1138 CTCCAGCTACTTTATGACTTTGTATTGGCTCTAGGTTCTAGAGTGCCAACAAGCATCAAT 1197
|||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1159 CTCCAGTTACTATATGACTATGCATTGGCTCTAGGTTCTAGAATGCCAACAAGCATCAA- 1217
Query 1198 C-CCAAACCACGGAGTTCTAGATTAAAAGATAAGGCAAGAAGCGAAGGAGAAAGATTGAC 1256
| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218 CACCAAACCACGGAGTTCTAGATTGAAAGATAAGAAAAGAAGCGAAGGAGAAAGATTGAC 1277
Query 1257 CAAAAAGCTATTTGTGCAAAACATTATCCACAACAACGAATTGCTTTCTTCTCTCGGAAA 1316
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1278 CAAAAAGCTGTTTGTGCAAAACATTATCCACAACAATGAATTGCTCTCTTCTCTCGGAAA 1337
Query 1317 AGGATCCCCAGTGGCCCTTCTCCCACAGAGTTCCTCAGATATATCAGTTTGTTCTGACCT 1376
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 AGGATCCCCTGTGGCCCTTCTCCCACAGAGTTCTTCAGATATATCAGTTTGTTCTGACCT 1397
Query 1377 GCGAATTGGATCCCATTTGATAACCAACCAGGAAAACCCAATCCAGTTAAAGTGTGAGGA 1436
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1398 ACGAATTGGATCCAATTTGATAACTAACCAGGAAAACCCAATCCAATTAAAGTCTGAGGA 1457
Query 1437 CTTAAGTTCTGATAGTGTTGTGGTTGATCTCAGTAACGGTTTAAAGGATACAGTTTCAGT 1496
||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1458 CTTAAGTTCTGATAGTGTTATGGTCGGTCTCAACAACGGTTTAAAGAATACAGTTTCAGT 1517
Query 1497 GAAAGAAAAATTTACATCTTTATGTGAAAGGAGCAGAAATCACCTAGCAAGCACG-GAGA 1555
|||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||
Sbjct 1518 AAAAGAAAAGTTTACATCTTTATGTGAAAGGAACAGAAATCATCTGGCAAGCA-GTGAGA 1576
Query 1556 AGGACACTCAAGAAACTCTGTCTGATGCTGAAAGGAGGAAGAATGATGCAGCTGTTGCGC 1615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 1577 AGGACACTCAAGAAACTCTGTCTGATGCTGAAAGGAGGAAAAATGATGGAGCTGTTGCGC 1636
Query 1616 TTTCGGATCAAAGGCTTTTCTCTTGTGTTACATGTGGAGTCTTAAGCTTTGATTGTGTAG 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 TTTCGGATCAAAGGCTTTTCTCTTGTGTTACATGTGGAGTCTTAAGCTTTGATTGTGTAG 1696
Query 1676 CTATCGTTCAACCTAAAGAAGCAGCTGCTAGATATCTCATGTCTGCAGATTGTAGCTTCT 1735
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 CTATTGTTCAACCTAAAGAAGCAGCAGCTAGATATCTCATGTCTGCAGATTGTAGCTTCT 1756
Query 1736 TCAATGATTGGACAGCTGCTTCTGGATCTGCAAATCTTGGTCAGGCTGCAAGATCACTTC 1795
||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 TCAATGATTGGACAGTTGTTTCCGGGTCTGCAAATCTTGGTCAGGCTGCAAGATCACTTC 1816
Query 1796 ATCCT-CAAAGCAAAGAGAAGCATGATGTAAATTACTTCTACAATGTTCCTGT-TCAAAC 1853
||| | ||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 1817 ATC-TGCAAAGCACGGAAAAGCATGATATGGATTTCTTCTACAATGTTCCT-TCTCAAAC 1874
Query 1854 TATGGATCATTCAGTGAAGACTGGCGATCAAAAAACTTCAACAACT-TCCCCGACAATAG 1912
|| |||||| ||| |||| || || || ||||||||||||||| | || | |||| ||
Sbjct 1875 TACGGATCACTCAATGAATACAGGTGACCAAAAAACTTCAACAG-TGTCTCTAACAACAG 1933
Query 1913 CGCATAAAGATA-ATGATGTTCTTGGGATGTTAGCTTCAGCATATGGAGACTCTTCTGAT 1971
| |||||| | | ||| || |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1934 CTCATAAAAA-AGATGGTGCTCTTAGTTTGTTAGCTTCAGCGTATGGAGATTCTTCTGAT 1992
Query 1972 TCCGAGGAAGAAGATCAAAAAGGCTTA 1998
|| |||||||||| ||| |||| ||||
Sbjct 1993 TCTGAGGAAGAAGGTCACAAAGTCTTA 2019
Score = 1426 bits (772), Expect = 0.0
Identities = 930/1007 (92%), Gaps = 7/1007 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2165 TACCATTTATTCCAAGATCTGATGACGATTCATGTCGGTTGCACGTGTTTTGTCTTGAGC 2224
|||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2264 TACCCTTTGTTCCAAGATCTGATGACGATTCTTCTCGGTTGCACGTGTTTTGTCTAGAGC 2323
Query 2225 ATGCTGCGGAAGTGGAACAGCAACTTCGTCCTTTTGGGGGGATTAACTTAATGTTACTGT 2284
||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||| | |||||||||||||
Sbjct 2324 ATGCTGCAGAAGTGGAACAGAAACTCCTTCCTATTGGGGGAATTCATTTAATGTTACTGT 2383
Query 2285 GCCATCCAGAGTACCCCAGGATAGAGGCTGAAGCAAAGATAGTTGCCGAAGAGCTCGTCA 2344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 2384 CCCATCCAGAGTACCCCAGGATAGAGGCTGAAGCAAAGATAGTTTCCGAAGAGCTCGTTA 2443
Query 2345 TCAATCACGAATGGAATGATACTGAATTCAGGAATGTGACCCGAGAGGATGAGGAAACGA 2404
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 TCAATCACGATTGGAATGATACTGAATTCAGGAATGTGACCCGAGAGGATGAGGAAACGA 2503
Query 2405 TTCAGGCAGCGTTGGATAATGTTGAAGCTAAGGGTGGGAACAGTGATTGGACCGTAAAAT 2464
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2504 TTCAGGCAGCCTTGGATAATGTTGAAGCTAAGGGTGGGAACAGTGATTGGACTGTAAAAT 2563
Query 2465 TGGGTGTTAACCTTTCTTACAGCGCTATTCTCAGTCGCTCTCCTCTGTACAGTAAGCAGA 2524
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 TGGGTATTAACCTTTCTTACAGTGCTATTCTCAGTCGCTCTCCTCTGTACAGTAAGCAGA 2623
Query 2525 TGCCGTATAACTCCATCATATACAAGGCGTTCGGTCGCAGCTCTCCAGTAGCGAGCTCAC 2584
|||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 2624 TGCCTTACAACTCCGTCATATACAATGCATTCGGTCGCAGCTCTCCAGCAACAAGCTCAC 2683
Query 2585 CCTCGAAACCCAAAGTCTCTGGTAAAAGATCGTCCAGACAGAGGAAATATGTTGTTGGAA 2644
||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684 CCTTGAAACCCGAAGTCTTTGGTAGAAGATCTTCCAGACAGAGGAAATATGTTGTTGGAA 2743
Query 2645 AATGGTGTGGTAAGGTTTGGATGTCACATCAGGTGCATCCCTTTTTGCTGGAGCAGGACT 2704
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2744 AATGGTGTGGTAAGGTTTGGATGTCGCATCAGGTGCATCCCTTTTTGCTGGAGCAGGACT 2803
Query 2705 TAGAGGGGGAAGAATCTGAAAGAAGTTGTCATCTTCGAGTTGCTATGGATGAGGATGCCA 2764
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2804 TAGAGGGGGGAGAATCTGAAAGAAGTTGTCATCTCCGAGCTGCTATGGATGAGGATGCCG 2863
Query 2765 CTGGAAAGAGATCGTTTCCTAATAATGTTTCCAGGGATTCGACAACAATGTTTGGAAGAA 2824
|||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 2864 CTGGAAAGAGATTTTTTCCTAATAATGTTTCTAGAGATGCAACAACAATGTTTGGAAGAA 2923
Query 2825 AGTATTGTAGGAAGAGAAAGATAAGAGCAAAGGCGGTGCCACGCAAGAAGCTTACTTCTT 2884
|||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2924 AGTACTGTAGGAAGAGAAAGGTCAGGGCAAAGGCTGTGCCACGCAAGAAGCTTACTTCTT 2983
Query 2885 TTAAGAGGGAAGATGGAGTTTCTGATGACACATCAGAAGATCATTCTTATAAGCAGCAAT 2944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2984 TTAAGAGGGAAGATGGAGTTTCTGATGACACATCAGAAGATCATTCTTATAAGCAGCAAT 3043
Query 2945 GGAGGGCTTCCGGGAATGAGGAAGAGTCTTATTTTGAGACAGGGAACACAGCTTCTGGTG 3004
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 3044 GGAGGGCTTCCGGGAATGAGGAAGAGTCTTATTTTGAGACAGGGAATACAGTTTCTGGTG 3103
Query 3005 ATTCATCAAATCAAATGTCTGATCCGCA-C--AAGGGAATTA-TCAGACATAAAGGT-TA 3059
|||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||| | ||| |
Sbjct 3104 ATTCGTCAAATCAAATGTCTGATCAGCAGCTCAAGGGAATTCGTC-GACACAGGGGTGT- 3161
Query 3060 TAAAGAATTTGAGTCAGATGATGAGGTTTCAGACCGTTCACTTGGGGAAGAGTATACTGT 3119
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||
Sbjct 3162 TAAAGAATTTGAGTCCGATGATGAGGTTTCAGATCGTTCACTTGGAGAAGAATATGCTGT 3221
Query 3120 ACGGGCATGTGCAGCTTCAGAGAGCTCAATGGAGAATGGCTCTCAGC 3166
| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||
Sbjct 3222 AAGGGAACGTGCAGTTTCAGAGAGCTCAACGGAGAATAGCTTTCAGC 3268
Score = 771 bits (417), Expect = 0.0
Identities = 528/581 (91%), Gaps = 9/581 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3506 AGAAGAATGAAGAATTGGATTCATACATGGAGGGACCTAGCACACGGCTTAGGGTGAGAC 3565
||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3584 AGACGAATCAAGAATTCGATTCATACATGGAAGGACCTAGCACACGGCTTAGGGTGAGA- 3642
Query 3566 AT--CAGAAGCCGTCGAGAGGGTCTTTAGAAACAAAACCAAAGAAGATTGGTAAG-AAGA 3622
|| || ||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 3643 ATCCCA-AAGCCCTCAAGAGTGTCTTCAGAAACGAAACCAAAGAAAATTGGTAAGAAAG- 3700
Query 3623 GAAGTGGTAATGCTTCCTTCTCCAGAGTTGCAACTGAAAAAGATGTGGAGGAAAaagaag 3682
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 3701 GAAGTCGTAATGCTTCCTTCTCCAGAGTTGCAACTGAAGAAGATGTGGAGG---AAGAAG 3757
Query 3683 aagaagaagaagaagaagagaaTGAGGAAGAGGAATGTGCAGCATACCAATGTAACATGG 3742
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||
Sbjct 3758 AAGAAGAAGAAGAAAAAGAGAATGAGGAAGAGGAATGTGCGGCGTACCAATGTGACATGG 3817
Query 3743 AGGGTTGCACGATGAGTTTCAGTTCGGAAAAACAGTTGATGTTACACAAAAGAAACATAT 3802
|||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| || || ||||||||||| |
Sbjct 3818 AGGGTTGCACAATGAGTTTTAGGTCGGAAAAACAGTTGACATTGCATAAAAGAAACATCT 3877
Query 3803 GCCCAATTAAAGGCTGTGGTAAAAACTTCTTCTCACACAAGTATTTGGTTCAACACCAGC 3862
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3878 GCCCTGTTAAAGGCTGTGGTAAAAACTTCTTCTCACACAAGTATTTGGTTCAACACCAGC 3937
Query 3863 GTGTTCACTCAGACGACCGTCCTCTGAAATGTCCATGGAAGGGATGTAAGATGACGTTCA 3922
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 3938 GAGTTCACTCAGACGACCGTCCTCTGAAATGTCCATGGAAGGGCTGTAACATGACGTTTA 3997
Query 3923 AGTGGGCTTGGTCTAGAACCGAGCACATAAGGGTTCACACAGGCGCTAGGCCTTATGTTT 3982
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3998 AGTGGGCTTGGTCTAGAACTGAGCACATAAGAGTTCACACAGGCGCTAGGCCTTATGTTT 4057
Query 3983 GCGCTGAACCGGATTGTGGTCAAACATTCAGGTTTGTCTCTGACTTCAGCCGGCATAAAA 4042
|||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 4058 GCGCTGAACCGGGTTGTGGTCAAACATTCAGATTCGTCTCTGACTTCAGCAGGCACAAAC 4117
Query 4043 GGAAGACCGGTCATTCGGTTAAGAAGACCAACAAAAGGTGA 4083
| || ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||
Sbjct 4118 GAAAAACCGGTCATTCAGTTAAAAAGACCCAGAAAAGGTGA 4158
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 165398212258
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5