BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G49600.1
Length=3719
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg485317 jgi|Araly1|485317|fgenesh2_kg.5__1309__AT3G49600.1 3947 0.0
Ahg949372 jgi|Araly1|949372|scaffold_801259.1 2870 0.0
> Ahg485317 jgi|Araly1|485317|fgenesh2_kg.5__1309__AT3G49600.1
Length=3612
Score = 3947 bits (2137), Expect = 0.0
Identities = 2386/2500 (95%), Gaps = 41/2500 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1205 AGTCTTCTCAAAACAAATTGACATACGATCTCTCTGCTGTGTTAATCCACAAAGGAAGCG 1264
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 AGTCTTCTCAAAACAAGTTGACATACGATCTCTCTGCTGTGTTAATCCACAAAGGAAGCG 1188
Query 1265 CTGTTAACAGCGGACATTATGTTGCTCACATAAAAGATGAAAAGACTGGCTTGTGGTGGG 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 CTGTTAACAGCGGACATTATGTTGCTCACATAAAAGATGAAAAGACTGGCTTGTGGTGGG 1248
Query 1325 AATTTGATGATGAACATGTGTCAGAACTGGGTAAACGTCCATGT-AATGAAGCTTCTTCT 1383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1249 AATTTGATGATGAACATGTGTCAGAACTGGGTAAACGTCCAT-TCAATGAAGCTTCTTCT 1307
Query 1384 TCAACTCCACAATCTGAGAGTAATGGTACGGCTAGTAGTGGGAATATCACAGATGGCATT 1443
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1308 TCAACTCCACAATCTGAGAGTAATGGTACGGCTAGTAGTGAGAATATCACAGATGTCATT 1367
Query 1444 CAATCAGGCTCTTCAGACTGTAGGTCTGCTATTAAGTCAGAGGTTTTCTCATCCAGTGAT 1503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 CAATCAGGCTCTTCAGACTGTAGGTCTGCTATTAAGTCAGAGGTTTTCTCATCCAGTGAT 1427
Query 1504 GCTTATATGCTGATGTATAGTCTTAGATGCGATAAACAGGAAAATCAGGAAGGACAAAAA 1563
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1428 GCTTATATGCTGATGTATAGTCTTAGATGCGATAAACAGGAAAATCAGGAAGGACAGAAA 1487
Query 1564 GAAAATCCTATTGACATTA-CTAAAGGAGAAG-T--TA------AACAGCTTAAAGGTGG 1613
|||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||
Sbjct 1488 GAAAATCCTATTGACA-TATCTAAAGGAGAAGTTGATAGTGTTCAACAGCTTAAAGGTGG 1546
Query 1614 TTATCTTCCAAAACATCTTTCTGAATGGATCAATAACATGAATGCAGTATTCCTTGAGAG 1673
||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 TTATCTTCCGTTACATCTTTATGAATGGATCAATAATATGAATGCAGTATTCCTTGAGAG 1606
Query 1674 TTGCAAGCAATATAATTTAAGAAAGGAAAAAGAATTGAATGCTTTGACTGAAAGGAGGCA 1733
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1607 TTGCAAGCAATATGATTTAAGAAAGGAAAAAGAATTGAGTGCTTTGACTGAAAGGAGGCA 1666
Query 1734 AGAAGTACGGACAATCCTTTCAGAAGCTGCTGTTCAGTCACTTGAAGAACAATATTTTTG 1793
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 AGAAGTACGGACTATCCTTTCAGAAGCTGCTGTTCAGTCACTTGAAGAACAATATTTTTG 1726
Query 1794 GATCTCCACAGATTGGCTTCGTCTATGGGCTGATACCACTTTACCTCCCGCTTTGGACAA 1853
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1727 GATCTCCACAGATTGGCTTCGTCTATGGGCTGATACCACTTTGCCTCCCGCTTTGGACAA 1786
Query 1854 CACCCCTTTACTGTGTTCCCATGGGAAAGTTCATGCCTCAAAAGTGAATTGCATGAAGCG 1913
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1787 CACCCCTTTACTGTGTTCCCATGGGAAAGTTCTTGCCTCAAAAGTGAATTGCATGAAGCG 1846
Query 1914 GATATCTGAACTTGCATGGATCAAGTTAGAATCAAAGTTCAATGGCGGACCAAAGTTAGG 1973
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1847 GATATCTGAACTTGCATGGACCAAATTAGAATCAAAGTTCAATGGTGGACCAAAGTTAGG 1906
Query 1974 GAAAGGGGACTACTGCAGGGACTGCCTTATGGATGGTGCTCGCATGGTTGTGTCTTCTGA 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 GAAAGGGGACTACTGCAGGGACTGCCTTATGGATGGTGCTCGCATGGTTGTGTCTTCTGA 1966
Query 2034 CAGTTATAGGGATCGAAGAACATTCATGAAAAGCATAGCAAATGATGTTCTTTCGGGAAA 2093
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967 CAGTTATAGGGATCGAAGAACTTTCATGAAAAGCATAGCAAATGATGTTCTTTCGGGAAA 2026
Query 2094 GTGCGAGGACGGAATGTATTATATCTCTAGAGCATGGTTACAGCAATGGATAAAAAGGAA 2153
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2027 GTGTGAGGACGGAATGTATTATATCTCTAGAGCATGGTTGCAGCAATGGATAAAAAGGAA 2086
Query 2154 AAATCTTGATGCTCCTACTGAAGCAGATGCGGGGCCCACAAATGCTATTACGTGCAATCA 2213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 AAATCTTGATGCTCCTACTGAAGCAGATGCGGGGCCCACAAATGCTATTACGTGCAATCA 2146
Query 2214 TGGTGAGCTGATGCCAGAGCAAGCACCAGGGGCCAAAAGAGTTGTAGTTCCAGAGAATTT 2273
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGGAGAGCTGATGCCAGAGCAAGCACCAGGGGCCAAAAGAATTGTAGTTCCAGAGAATTT 2206
Query 2274 CTGGTCATTCCTTTTTGAAGATGCTCTAAAAGTGATGTCAGAAGATACTTTGGATTGTAC 2333
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||
Sbjct 2207 CTGGTCATTCCTTGTTGAAGATGCTCTAAAAGTGATGCCAGAAGATGCTTCGGATTGTAC 2266
Query 2334 TTGTTTTCCTGTGGACTCCAGCCAATGTTGTCATTGCACAGAGGTACTTTCTGAGGTTGC 2393
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2267 TTGTTTCCCTGTGGACTCCAGCCAATGTTGTCATTGCACAGAGGAACTTTCTGAGGTTGC 2326
Query 2394 ATG-CTTCGAGGATTCACTAAGAACATTGAAGGTCAAGCAGCGCCAAAATCACGAGAAGT 2452
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2327 ATGCCTT-GAGGATTCACTAAGAACATTGAAGGTCAAGCAGCGCCAAAATCACGAGAAGT 2385
Query 2453 TAGCCACGGGAAAGGGTATACCATTAACGCCACAAAGCCGATATTTCTTGTTGCCTTCTC 2512
||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2386 TAGCCACAGGAAAGAATATACCCTTAACGCCACAAAGCCGATATTTCTTGTTGCCTTCTC 2445
Query 2513 CGTGGCTAGTGCAATGGAGAATCTATATTAACATGACTGGAAAAAATAGTTCTTCAGCAC 2572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2446 CGTGGCTAGTGCAATGGAGAATCTATATTAACATGACTGGAAAAAATAGTTCTTCAGCAC 2505
Query 2573 CAGAGCCTGAACGTCTTGATGGAGTCATTAATACTCTCAAATGCAAAAAGCATACACGAC 2632
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2506 CAGAGCCTGAACGTCTTGATGGAGTCATTAATACTCTCAAATGCAAAAAGCACACACGAC 2565
Query 2633 TCCTTGAAAGGCTCCCTGAACTTGTCTGCAGACGTGGCTCGTATTTTCAGAAAAATCCAT 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2566 TCCTTGAAAGGCTCCCTGAACTTGTCTGCAGACGTGGCTTGTATTTTCAGAAAAATCCAT 2625
Query 2693 CTACAGACAAGCTAACAATCATCCCTGAGCTTGATTGGAAATATTTCTGTGACGAGTGGG 2752
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2626 CTACAGACAAGCTGACAATCATCCCTGAGATTGATTGGAAATATTTCTGTGAGGAGTGGG 2685
Query 2753 GAGGGCTCATGGAGAATGGAATATCTGCTTTTATTGAGGTTGG---CAATACAGACCAAA 2809
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2686 GAGGGCTCATGGAGAATGGAATATCTGCTCTTATTGAGGTTGGTAACAATACAGACCAAA 2745
Query 2810 GTTCATCCCCAGACGTCATTGACCTTGAGAAGGATTCTTCTCCGGATGATAATATGGACG 2869
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2746 GTTCATCCCCAGACATCATTGACCTTGAGAAGCATTCTTCTCCGGATGATAATATGGAGG 2805
Query 2870 TTGATGCTCAACAGCTTATTCTCAGGGCATCCCCAGAGATTTGCGAGGAATGCATAGGAG 2929
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806 TTGATGCTCAGCAGCTTATTCTCAGGGCATCCCCAGAGATTTGCGAGGAATGCATAGGAG 2865
Query 2930 AGAGAGAAAGCTGTGAGTTGATGCAGAAACTTAGTTACTCTGAGGGAGATGTATTTGTCT 2989
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2866 ACAGAGAAAGCTGTGAGTTGATGCAGAAACTTAGTTACTCTGAGGGAGATGTATTTGTCT 2925
Query 2990 GTTTTGTGCGTGGAAAGGAAGCTCCAAAAGCAATGTTAGAGGCATCTGACTCTAGCTTTG 3049
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2926 GTCTTGTGCGTGGAAAGGAAGCTCCAAAAGCAATGTTAGAGGCATCTGACTCTAGCTTTG 2985
Query 3050 AGGTGGATCGGCGTACTTCAAAGCGATCTCGGAGAACAAATTATGGAAACCTGACAAGCC 3109
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2986 AGGTGGATCGGCGTACTTCAAAGCGATCTCGGAGGACAAATTATGGAAACCTGACAAGTC 3045
Query 3110 TGAAAGTGTCTGCGACAACGACTGTATACCAATTAAAGATGATGATATGGGAATTACTTG 3169
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3046 TGAAAGTGTCAGCGACAACGACTGTGTACCAATTAAAGATGATGATATGGGAGTTACTTG 3105
Query 3170 GGGTGATGAAGGAAAACCAGGAACTCCACAAAGGCTCAAAAGTGATTGATCAGGAATCTG 3229
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3106 GGGTGATGAAGGAAAACCAAGAACTTCACAAAGGCACAAAAGTTATTGATCAGGAATCTG 3165
Query 3230 CAACCCTTGCAGACATGAACATATTCCCCGGCGACAGGCTTTGGGTGAGAGATACAGAGA 3289
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3166 CTACCCTTGCAGACATGAACATATTCCCTGGCGACAAGCTTTGGGTGAGAGATACCGAGA 3225
Query 3290 TGCATGAACACCGCGATATTGCTGATGAGTTATGTGAAAAGAAACCGGGGGCTCAAGATA 3349
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3226 TGCATGAACACCGTGATATTGCTGATGAGTTATGCGAAAAGAAAACGGGGGCTCAAGATA 3285
Query 3350 TCGAAGAAGGGTTTCGAGGGACGCTATTGACTGGGAATATCTCTTCTGAAGCCTGCTAGA 3409
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3286 TCGAAGAAGGGTTTCGAGGGACGCTATTGACTGGGGATATCTCTTCTGAAGCCTGCTAGA 3345
Query 3410 AATTGTAACTTTGTGATCAAAGTGTAAAAACAGAATGCGTGAGAACTGAGAAAGAGTCAT 3469
||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||
Sbjct 3346 AATTGTAT-TTTGAGATCAGAGTGTAAAAACAAAATGCGTGAGAA---AGA--G--TCAT 3397
Query 3470 TGG---ACCATCTAGAGGAGTAGTTGTGCAGGAGACGGACGACACATTTTTTGGGTCAGt 3526
||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3398 TGGCGGATCATCTAGAG---TAGTTGTGCAGGAGACGGATGACACATTTTTTGGGTCAGT 3454
Query 3527 ttttttGTAAAGGCAGGCAAGGC-----TTTGGAGCTTTATTTTGTGTAAAAAACAAACG 3581
||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3455 TTTTT-GTAAAGGCAGGCAAGGCAAGGCTTTGGAGCTTCATTTTGTGTAAAAAACAAACG 3513
Query 3582 CAAAGATTTGGAGA-AAGCTTA-GCACAAGCTGAATTTGTGTAGATGCAAAGGCTTATTG 3639
| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3514 CTATGATTTGGA-ACAAGCTTTTGCACAAGCTGAATTTGTGTAGATTCAAAGGCTTATTG 3572
Query 3640 TGGATGGCTATTTGAAGCTGACTTTTGTGTGTGTGTTTTT 3679
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3573 TGGATGGCTATTTGAAGCTGACTTTTGTGTGTGTATTTTT 3612
Score = 1770 bits (958), Expect = 0.0
Identities = 1078/1134 (95%), Gaps = 15/1134 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 9 aaaaaaaaaGGTGAAATAGAATTAACAAGGaaaaaaaaaaaaGATTTCGCTGTGGagaag 68
||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1 AAAAAAAAAAGTGAAATAGAATTAAGAA--AAAAAAAAAAAAAAATTCGCTGTGGAGAAG 58
Query 69 aagaagacgaaggag-t-aa-aag-aagaagacggagaagTTTGAGCTTGTGAAGCTCTC 124
||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 59 AAGAAGACGAAGGAGTTGAAGAAGAAAGAAGACGGAGAAGCTTGAGCTTGTGAAGCTCTC 118
Query 125 TCTACTTGCTAAACT-TTTCTTTGTAGATTCTC---TCAGGGTTTTCGATTGTTACTGGG 180
||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 TCTACTTGCTAAACTGGTTC-TTGTAGATTCTCAGGTTAGGGTTTTCGATTGTTACTGGG 177
Query 181 GAAATTTCTGGTGGTGGTGACACAATGAGTAGACCTAACACCCGAAACAAAAACAAGAGA 240
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 178 GAAATTT-TGTTGGTGGTGACACAATGAGTAGACCTAACACCCGAAACAAGAACAAAAGG 236
Query 241 CAAAGACCAGACGCTGTTGATTCTTCTTCTCAGATTCTCCGGAAAATTCACGAGGCTAAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 CAAAGACCAGACGCTGTTGATTCTTCTTCTCAGATTCTCCGGAAAATTCACGAGGCTAAT 296
Query 301 GATGTAACTGATGATGACATTAACCAACTTTTCATGATTTGGAAGCCAGTTTGTCAAGGT 360
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATGTAACTGATGATGACATAAACCAACTTTTCATGATATGGAAGCCAGTTTGTCAAGGC 356
Query 361 TGTCGTGTAAACACTCGTGACAATCCTAACTGCTTTTGTGGCTTGGTTCCACCGCTTAAT 420
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 357 TGTCGTGTAAACTCTCGTGACAATCCTAACTGCTTTTGTGGGTTGGTTCCACCGGTTAAT 416
Query 421 GGAAGCCGGAAATCTGGTTTGTGGCAGAAAACGTCGGAGATTATTCAGTCTCTTGGTCCA 480
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||
Sbjct 417 GGAAGCCGGAAATCGGGTTTGTGGCAGAAAACGTCTGAAATTATTTTGTCTCTAGGTCCA 476
Query 481 GATCCGACCTTGGACCGTCGTGATTCTGAATCTACACCCGCTGGTCTGACTAATTTGGGT 540
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 477 GATCCGACCTTGGACCGTCGTGATTCTGACTCTACACCGGCTGGTCTGACCAATTTGGGT 536
Query 541 GCTACTTGTTATGCCAACAGTATACTTCAGTGTTTGTACATGAATACTGCTTTCCGAGAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 537 GCTACTTGTTATGCCAACAGTATACTTCAGTGTTTGTACATGAATACTGCTTTTCGAGAA 596
Query 601 GGAGTTTTTTCTGTTGAGGTTCATGTCTTGAAGCAGAATCCAGTCTTGGATCAGATTGCT 660
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 597 GGAGTTTTTTCTGTTGAGGTTGATGTCTTGAAGCAGTATCCAGTTTTGGATCAGATTGCT 656
Query 661 CGGCTTTTTGCACAGTTGCATGCTAGCCAAAAGTCCTTTGTTGATTCTGATGCTTTTGTC 720
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 657 CGGCTTTTTGCACAGTTGCATGCTAGCAAAAAGTCTTTTGTTGATTCAGATGCTTTTGTC 716
Query 721 AAGACGTTGGAGTTGGATAATGGGGTTCAACAGGATACCCATGAGTTCTTGACATTGCTT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 AAGACGTTGGAGTTGGATAATGGGGTTCAACAGGATACCCATGAGTTCTTGACATTGCTT 776
Query 781 CTTTCCTTGCTTGAGCGTTGCTTACTCCATTCTGGAG--T-CAAAGCCAAAACAATAGTT 837
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 777 CTGTCCTTGCTTGAGCGTTGCTTACGCCATTCTGGAGTTTACAAAGCCAAAACAATAGTT 836
Query 838 CAAGATCTCTTCAGTGGTAGTGTCTCGCATGTCACCACGTGCTCAAAATGTGGGAGGGAT 897
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 CAAGATCTCTTCAGTGGTAGTGTCTCGCATGTGACCACGTGCTCAAAATGTGGGAGGGAT 896
Query 898 TCCGAAGCTTCGTCAAAGATGGAGGATTTTTATGCCCTTGAGTTGAATGTTAAGGGCCTC 957
|||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 TCCGAAGCCTCGTCAAAGGTGGAGGATTTCTATGCCCTTGAGTTGAATGTTAAGGGCCTC 956
Query 958 AAATCGTTGGATGCTAGTTTGAATGATTACCTTAGCTTGGAGCAGCTTAATGGCGATAAT 1017
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 AAAACTTTGGATGCTAGTTTGAATGATTACCTTAGCTTGGAGCAGCTTAATGGCGATAAT 1016
Query 1018 CAATATTTTTGTGGAAGCTGCAATGCTAGAGTAGATGCCACACGCTGCATTAAGCTGCGC 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 CAATATTTTTGTGGAAGCTGCAATGCTAGAGTAGATGCCACACGCTGCATTAAGCTGCGC 1076
Query 1078 ACACTACCTCCGGTTATCACTTTTCAGCTCAAACGATGCATTTTCCTTCCTAAG 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 ACACTACCTCCGGTTATCACTTTTCAGCTCAAACGATGCATTTTCCTTCCTAAG 1130
> Ahg949372 jgi|Araly1|949372|scaffold_801259.1
Length=2320
Score = 2870 bits (1554), Expect = 0.0
Identities = 1766/1861 (95%), Gaps = 43/1861 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1071 GCTGCGCACACTACCTCCGGTTATCACTTTTCAGCTCAAACGATGCATTTTCCTTCCTAA 1130
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 GCTGCGTACACTACCTCCTGTTATCACTTTTCAGCTCAAACGATGCATTTTCCTTCCTAA 508
Query 1131 GACAACGGCGAAGAAGAAAATCACCTCATCATTTTCCTTTCCTCAAGTGCTGGATATGGG 1190
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 509 GACAACGGCTAAGAAGAAAATCACCTCCTCATTTTCCTTTCCTCAAGTGCTAGATATGGG 568
Query 1191 ATCGAGATTGGCAGAGTCTTCTCAAAACAAATTGACATACGATCTCTCTGCTGTGTTAAT 1250
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 ATCGAGATTGGCAGAATCTTCTCAAAACAAGTTGACATACGATCTCTCTGCTGTGTTAAT 628
Query 1251 CCACAAAGGAAGCGCTGTTAACAGCGGACATTATGTTGCTCACATAAAAGATGAAAAGAC 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 CCACAAAGGAAGCGCTGTTAACAGCGGACATTATGTTGCTCACATAAAAGATGAAAAGAC 688
Query 1311 TGGCTTGTGGTGGGAATTTGATGATGAACATGTGTCAGAACTGGGTAAACGTCCATGT-A 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
Sbjct 689 TGGCTTGTGGTGGGAATTTGATGATGAACATGTGTCAGAACTGGGTAAATGTCCAT-TCA 747
Query 1370 ATGAAGCTTCTTCTTCAACTCCACAATCTGAGAGTAATGGTACGGCTAGTAGTGGGAATA 1429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 748 ATGAAGCTTCTTCTTCAACTCCACAATCTGAGAGTAATGGTACAGCTAGTAGTGAGAATA 807
Query 1430 TCACAGATGGCATTCAATCAGGCTCTTCAGACTGTAGGTCTGCTATTAAGTCAGAGGTTT 1489
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 TCACAGATGTCATTCAATCAGGCTCTTCAGACTGTAGGTCTGCTATTAAGTCAGAGGTTT 867
Query 1490 TCTCATCCAGTGATGCTTATATGCTGATGTATAGTCTTAGATGCGATAAACAGGAAAATC 1549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 TCTCATCCAGTGATGCTTATATGCTGATGTATAGTCTTAGATGCGATAAACAGGAAAATC 927
Query 1550 AGGAAGGACAAAAAGAAAATCCTATTGACATTA-CTAAAGG---A---GA-AG--TTAAA 1599
|||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | || || || ||
Sbjct 928 AGGAAGGACAGAAAGAAAATCCTATTGACA-TATCTAAAGGAAAAGTTGATAGTCTTCAA 986
Query 1600 CAGCTTAAAGGTGGTTATCTTCCAAAACATCTTTCTGAATGGATCAATAACATGAATGCA 1659
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 987 CAGCTTAAAGGTGGTTATCTTCCGTTACATCTTTATGAATGGATCAATAATATGAATGCA 1046
Query 1660 GTATTCCTTGAGAGTTGCAAGCAATATAATTTAAGAAAGGAAAAAGAATTGAATGCTTTG 1719
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1047 GTATTCCTTGAGAGTTGCAAGCAATATGATTTAAGAAAGGAAAAAGAATTGAGTGCTTTG 1106
Query 1720 ACTGAAAGGAGGCAAGAAGTACGGACAATCCTTTCAGAAGCTGCTGTTCAGTCACTTGAA 1779
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 ACTGAAAGGAGGCAAGAAGTACGGACTATCCTTTCAGAAGCTGCTGTTCAGTCACTTGAA 1166
Query 1780 GAACAATATTTTTGGATCTCCACAGATTGGCTTCGTCTATGGGCTGATACCACTTTACCT 1839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1167 GAACAATATTTTTGGATCTCCACAGATTGGCTTCGTCTATGGGCTGATACCACTTTGCCT 1226
Query 1840 CCCGCTTTGGACAACACCCCTTTACTGTGTTCCCATGGGAAAGTTCATGCCTCAAAAGTG 1899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1227 CCCGCTTTGGACAACACCCCTTTACTGTGTTCCCATGGGAAAGTTCTTGCCTCAAAAGTA 1286
Query 1900 AATTGCATGAAGCGGATATCTGAACTTGCATGGATCAAGTTAGAATCAAAGTTCAATGGC 1959
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||
Sbjct 1287 AATTGCATGAAGCTGATATCTGAACTTGCATGGACCAAGTTAGAATC--A----AA---- 1336
Query 1960 GGACCAAAGTTAGGGAAAGGGGACTACTGCAGGGACTGCCTTAT-GGATGGTGCTCGCAT 2018
| | | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1337 -G------G--A---AAAGCGGACTACTGCAGGGACTGCCTTATGGGATGGTGCTCGCAT 1384
Query 2019 GGTTGTGTCTTCTGACAGTTATAGGGATCGAAGAACATTCATGAAAAGCATAGCAAATGA 2078
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1385 GGTTGTCTCTTCTGACAGTTATAGGGATCGAAGAACATTCATGAAAAGCGTAGCAAATGA 1444
Query 2079 TGTTCTTTCGGGAAAGTGCGAGGACGGAATGTATTATATCTCTAGAGCATGGTTACAGCA 2138
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1445 TGTTCTTTCGGGAAAGTGTGAGGACGGAATGTATTATATCTCTAGAGCATGGTTGCAGCA 1504
Query 2139 ATGGATAAAAAGGAAAAATCTTGATGCTCCTACTGAAGCAGATGCGGGGCCCACAAATGC 2198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1505 ATGGATAAAAAGGAAAAATCTTGATGCTCCTACTGAAGCAGATGCGGGGCCCACAAATGC 1564
Query 2199 TATTACGTGCAATCATGGTGAGCTGATGCCAGAGCAAGCACCAGGGGCCAAAAGAGTTGT 2258
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1565 TATTACGTGCAATCATGGAGAGCTGATGCCAGAGCAAGCACCAGGGGCCAAAAGAATTGT 1624
Query 2259 AGTTCCAGAGAATTTCTGGTCATTCCTTTTTGAAGATGCTCTAAAAGTGATGTCAGAAGA 2318
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1625 AGTTCCAGAGAATTTCTGGTCATTCCTTGTTGAAGATGCTCTAAAAGTGATGCCAGAAGA 1684
Query 2319 TACTTTGGATTGTACTTGTTTTCCTGTGGACTCCAGCCAATGTTGTCATTGCACAGAGGT 2378
| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685 TGCTTCGGATTGTACTTGTTTCCCTGTGGACTCCAGCCAATGTTGTCATTGCACAGAGGA 1744
Query 2379 ACTTTCTGAGGTTGCATG-CTTCGAGGATTCACTAAGAACATTGAAGGTCAAGCAGCGCC 2437
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745 ACTTTCTGAGGTTGCATGCCTT-GAGGATTCACTAAGAACATTGAAGGTCAAGCAGCGCC 1803
Query 2438 AAAATCACGAGAAGTTAGCCACGGGAAAGGGTATACCATTAACGCCACAAAGCCGATATT 2497
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1804 AAAATCACGAGAAGTTAGCCACGGGAAAGAATATACCATTTACGCCACAAAGCCGATATT 1863
Query 2498 TCTTGTTGCCTTCTCCGTGGCTAGTGCAATGGAGAATCTATATTAACATGACTGGAAAAA 2557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1864 TCTTGTTGCCTTCTCCGTGGCTAGTGCAATGGAGAATCTATATTAACATGACTGGAAAAA 1923
Query 2558 ATAGTTCTTCAGCACCAGAGCCTGAACGTCTTGATGGAGTCATTAATACTCTCAAATGCA 2617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 ATAGTTCTTCAGCACCAGAGCCTGAACGTCTTGATGGAGTCATTAATACTCTCAAATGCA 1983
Query 2618 AAAAGCATACACGACTCCTTGAAAGGCTCCCTGAACTTGTCTGCAGACGTGGCTCGTATT 2677
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984 AAAAGCACACACGACTCCTTGAAAGGCTCCCTGAACTTGTCTGCAGACGTGGCTCGTATT 2043
Query 2678 TTCAGAAAAATCCATCTACAGACAAGCTAACAATCATCCCTGAGCTTGATTGGAAATATT 2737
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2044 TTCAGAAAAATCCATCTACAGACAAGCTGACAATCATCCCTGAGATTGATTGGAAATATT 2103
Query 2738 TCTGTGACGAGTGGGGAGGGCTCATGGAGAATGGAATATCTGCTTTTATTGAGGTTGG-- 2795
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2104 TCTGTGAGGAGTGGGGAGGACTCATGGAGAATGGAATATCTGCTCTTATTGAGGTTGGTA 2163
Query 2796 -CAATACAGACCAAAGTTCATCCCCAGACGTCATTGACCTTGAGAAGGATTCTTCTCCGG 2854
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2164 ACAATACAGACCAAAGTTCATCCCCAGACATCATTGACCTTGAGAAGCATTCTTCTCCGG 2223
Query 2855 ATGATAATATGGACGTTGATGCTCAACAGCTTATTCTCAGGGCATCCCCAGAG--ATTTG 2912
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2224 ATGATAATATGGAGGTTGATGCTCAACAGCTTATTCTCAGGGCATCTCCAGAGGTATTTG 2283
Query 2913 C 2913
|
Sbjct 2284 C 2284
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 140508559516
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5