BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G50370.1
Length=7163
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg485388 jgi|Araly1|485388|fgenesh2_kg.5__1380__AT3G50370.1 1.098e+04 0.0
> Ahg485388 jgi|Araly1|485388|fgenesh2_kg.5__1380__AT3G50370.1
Length=7106
Score = 1.098e+04 bits (5945), Expect = 0.0
Identities = 6758/7138 (95%), Gaps = 106/7138 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 12 TTTTCCCGACGATTCGTTCCCTCGCGCTTCGTCGTCTGACATCAGCGCACGTTAGCCACC 71
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 TTTT-CCGACGATTCGTTCCCTCGCGCTTCGTCGTCTGACATCAGCGCACGTTAGCCACC 62
Query 72 GTCGTCGATATCATACGCCCACCACCGCCGTAGGGGA---GATTCTTGGATTGATTTTCC 128
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||
Sbjct 63 GTCGTCGATATCATACGCCCACCACCGCCGGAGGTAATCTTATTCGTGTATTGA--TTCC 120
Query 129 AGTTTTTGATCAATTCGTCACTCTAGTAGATCTGAGGCAATACACTGCGAACAAATTTGA 188
| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||
Sbjct 121 A-ATTTTGATCAATTCGTCACTGTAGTAGATCTGA-G---------GC--A-AAATTTGA 166
Query 189 CTGGGAGAAGAATCAGATCTAGGTTTAAGGTTTGATGCGTTGGGGATGTTCAGTGACCGG 248
|| || | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 167 CT-GG-G-AGAACCAGATCTAGGTTTAGGGTTTGATGCGTTGGCGATGTTCAGTGATCGG 223
Query 249 CGGAAGCGGGAAATGGCTAATCATGGAGATGGAAACAAGTACGCGTCTGTGAATCTGAAT 308
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 CGGAAGCGGGATATGGCTAATCATGGAGATGGAAACAAGTACGCGTCTGTGAATCTGAAT 283
Query 309 AAGTCTTATGGATATCAATCTCATCATCAGTATAATCAATCTGGAGGTTATGGGCGGGGG 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 AAGTCTTATGGATATCAATCTCATCATCAGTATAATCAATCTGGAGGTTATGGGCGGGGG 343
Query 369 AGAGGAGGTGGTGGATATGGCGGTGGAGC-A--TG----A-GCGAGTTGATTCGTCTGGT 420
||||||||||||||||||||||||| ||| | || | | |||| | | | |
Sbjct 344 AGAGGAGGTGGTGGATATGGCGGTGAAGCTATCTGTTCCACCCCCCTTGA-ACCT-TCCT 401
Query 421 TCGAGT---TTTCATTCCGGTGGAGGGATCGCTGGGAGTGGAACTAGACCTGCTTCATCT 477
|| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 402 TC-ACTCCCTTTCATTCCGGTGGAGGAATCGCTGGGAGTGGAACGAGACCTGCTTCATCT 460
Query 478 GGTATTGGGTGGAGTAAGCCTGCTGCTACAGCTACTGATGGTGATATTGGTAACCATACT 537
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 461 GGTATGGGGTGGAGTAAGCCTGCTGCTACAGCTACTGATGGTGATATTGCTAACCATACT 520
Query 538 GGTGAAGGTGTTACTAGGGGGAGTAATGGGTTGAATACGTCTCTTGCTTCTCGGGTTGGT 597
| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 521 GCTGAAGGTGTTACCGGGGGGAGTAATGGGTTGAATACGTCTCTTACTTCTCGGGTTGGT 580
Query 598 GCAGCTGAGCCTATGGAACGGGCTTTTCATCATGTAGAGAAAGTGGCAACTTTGAGGGGT 657
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 581 GCAGCTGAGCCTATGGAGCGGGCTTTTCAGCATGTAGAGAAAGTTGCAACTTTGAGGGGT 640
Query 658 GAAGATTTTCCGTCCCTAAAGGCTTCTTTGCCTTCAGCTTCTGTGTCTGGGCAGAAACAG 717
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 GAAGATTTTCCGTCCCTTAAGGCTTCTTTGCCTTCAGCTTCTGTGTCTGGGCAGAAACAG 700
Query 718 AAAGAGGGTCTGAATCAGAAGCAGAAGCAAGCTGCAGGTGAGGATTTTTCAAAAGAGCCG 777
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||
Sbjct 701 AAGGAGGGTTTGAATCAGAAGCAGAAGCAAGCTGCAAGTGAAGAATTTTCAAAAGAGCCG 760
Query 778 AGAGGTGTCTCTGGTATGAGCAGTTCACTTGTAGATATGAGACCCCAAAACCAGTCTGGG 837
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 761 AGAGGTGTCTCTGGTATGAGCAGTTCGCTTGTAGATATGAGACCTCAAAACCAGTCTGGG 820
Query 838 CGTAGCCGGCTTGGTAATGAGCTCAGCGAGAGTCCTAGTTTCTCTGATGGATTACATTCA 897
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 821 CGTAGCCGGCTCGGTAATGAGCTCGGCGAGAGTCCTAGTTTCTCAGATGGATTACATTCA 880
Query 898 TCTGAACATGTGAGGAAAAAGGAGTATTTTGCAGGGCCACTGCCTCTTGTTCGTTTGGCC 957
|||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TCTGAACAGGTGAGGAAAAGGGAGTATTTTCCAGGGCCACTGCCTCTTGTTCGTTTGGCC 940
Query 958 CCACGATCTGATTGGGCTGATGATGAACGTGATACTAGTCATGGCTTAAGAGATCGGGAC 1017
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 CCACGATCTGATTGGGCTGATGATGAGCGTGACACTAGTCATGGCTTAAGAGATCGGGAC 1000
Query 1018 AGGGATCATGGCTATTCAAAGAATGAACCATTTTGGGATAGGGGTTTTGATC-T--GAGG 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||
Sbjct 1001 AGGGATCATGGCTATTCAAAGAATGAACCATTTTGGGATAGGGGTTTCGATCATCCGAGG 1060
Query 1075 CCTCATGTCCTGCCCCAGAAGCATGCTGCTTCTAATGTTTTTGACAAACCAGGACAGCGT 1134
||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1061 CCTCATGTCCTACCCCAGAAGCATACTGCTCCTAGTCTTTTTGATAAACCAGGACAGCGT 1120
Query 1135 GAAAATGAAATTGCAAAGTCCTCTTTGACTCAAGTAAGACCTGTCAGTGGAGGAGGAAGG 1194
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1121 GAAAACGAAATTGCAAAGTCCTCTTTGACTCAAGTAAGACCACTCAGTGGAGGAGGAAGG 1180
Query 1195 GAGGCCAACGCTTGGAGAGTCTCCTCACCACTCCAAAATGAAGGTGCAAATCATAAT--- 1251
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1181 GAGGCCAACGCTTGGAGAGTCTCCCCACCACTCCAAAATGAAGGTGCAAATAATAATAAA 1240
Query 1252 AA---TTATGGAGCAAGGCCCTCTAGTAGGGGCAGAGAAGCTGCTAAGAAAAGTAACTAC 1308
|| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||
Sbjct 1241 AATGTTTATGGAGCAAGGCCGTCTAGTCGGGGCAGAGAAACTACTAAGAAAAGTAATTAC 1300
Query 1309 GTCTTGTCATCATCAAGGGAAAATGTTTGGAATAATAGTGGAGCTAGAGAGGCTCCATAT 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 GTCTTGTCATCATCAAGGGAAAATGTTTGGAATAATAGTGGAGCTAGAGAGGCTCCATAT 1360
Query 1369 CAGCATGGAGGAAGACAGCCATGGAATAATAATATGGATAGTTCCAGCAACAGGGGAACT 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361 CAGCATGGAGGAAGACAGCCATGGAATAATAATATGGATAGTTCCAGCAACAGGGGAACT 1420
Query 1429 TATAATCGGGATGGGTATGGAATTGAACATCAGAATAGGGATAAACGCTCC-TTCTTCAA 1487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||
Sbjct 1421 TATAATCGGGATGGGTATGGAATTGAACATCAGAATAGGGACAAACGC-CCATTCTTCAA 1479
Query 1488 GAGTGACAAACCTCATGTGGAAGATCCTTTTATGAAAGACTTTGGTGACTCTGGTTTTGA 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 GAGTGACAAACCTCATGTGGAAGATCCTTTTATGAAAGACTTTGGTGACTCTGGTTTTGA 1539
Query 1548 TGTTCATGATCCATTCCCAGTACTTGGTGTTACTAAGAAGAAGAAAGAGGCTTTAAAGCA 1607
||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540 TGTCCATGATCCATTCCCAGTACTTGGTGTTGCTAAAAAGAAGAAAGAGGCTTTAAAGCA 1599
Query 1608 AACAGAGTTTCATGATCCTGTCAGGGAGTCATTTGAGGCTGAACTTGAGAGAGTTCAAAA 1667
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1600 AACAGAGTTTCACGATCCTGTCAGGGAATCATTTGAGGCTGAACTTGAGCGAGTTCAAAA 1659
Query 1668 GATGCAGGAAGAGGAACGCCGGCGGATTATTGAGGAACAGGAAAGGGTGATAGAACTAGC 1727
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 GATGCAGGAAGAGGAACGCCGGCGGATCATCGAGGAACAGGAAAGGGTGATAGAACTAGC 1719
Query 1728 TCGAACAGAAGAAGAAGAGAGACTACGGCTGGCTCGTGAACAAGATGAGCGGCAGAGAAG 1787
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1720 TCGAACAGAAGAAGAAGAGAGACTACGGCTGGCTCGCGAACAAGATGAGCGGCATAGAAG 1779
Query 1788 ATTAGAAGAAGAGGCCAGAGAAGCTGCTTTCAGAAACGAGCAGGAGAGACTAGAGGCTAC 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780 ATTAGAAGAAGAGGCCAGAGAAGCTGCTTTCAGAAACGAGCAGGAGAGACTAGAGGCTAC 1839
Query 1848 AAGGAGGGCAGAAGAGTTGAGGAAGTCAAAAGAAGAGGAGAAACATAGGTTGTTCATGGA 1907
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 AAGGAGGGCAGAAGAGTTGAGAAAGTCAAAAGAAGAGGAGAAACATAGGTTGTTCATGGA 1899
Query 1908 AGAAGAAAGGAGGAAGCAAGCTGCTAAGCAAAAGCTTCTAGAGTTGGAAGAAAAGATTTC 1967
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1900 AGAAGAAAGGAGGAAGCAGGCTGCTAAGCAAAAGCTTCTAGAGTTGGAAGAAAAGATTTC 1959
Query 1968 CAGGAGACAGGCTGAAGCTGCCAAAGGTTGCAGCAGCTCTTCAACTATTTCAGAGGATAA 2027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1960 CAGGAGACAGGCTGAAGCTGCCAAAGGTTGCAGCAGCTCTTCAACTATTTCAGAGGAGAA 2019
Query 2028 ATTCTTAGATATTGTTAAAGAAAAAGACTCTGCAGATGTTGTTGATTGGGAAGACAGCGA 2087
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2020 ATTCTTAGATATTGGTAAAGAAAAAGAATCTGCAGATGTTGTTGACTGGGAAGACAGCGA 2079
Query 2088 AAGAATGGTGGATAGAATTACTACGTCATCAACTTTAGATCTATCAGTACCCATGAGATC 2147
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2080 AAGAATGGTGGATAGAATTACTACCTCATCAAATTTAGATCTATCAGTACCCATTAGATC 2139
Query 2148 ATTTGAGAGCAATGCCACGTCTCAATTTTCTAGGGATGGTTCTTTTGGGTTCCCTGATAG 2207
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2140 ATTTGAGAGCAGTGCAACGTCTCAATTTTCTAGAGATGGTTCTTTTGGGTTCCCTGGTAG 2199
Query 2208 ACAAAAGCCTACGTGGAGAAAGGAAGATATTGAGAGTGGAAGCAATTCAAGGTTTATTCC 2267
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2200 ACAAAAGCCTACTTGGAGAAAGGAAGATATTGAGAGTGGAAGCAATTCGAGGTTTATTCC 2259
Query 2268 ACAAAATTTGGAGAATGTTCCACATAGCCCACAGGAAGAATTCTTTGGGACAGCTGGATA 2327
||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2260 ACAAAATATGGAGAATGTTCCACCTAGCCCGCAGGAAGAATTCTTTGGAACAGCTGGATA 2319
Query 2328 TCTCAGTGCCCCTTCCTACTTCAAACCAGGATTCCCGGAGCATTCAATTGATCAGAGTTG 2387
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2320 TCTCAGTGCCCCTTCCTACTTCAAACCAGGGTTCCCAGAGCATTCAGTTGATCAGAGTTG 2379
Query 2388 GAGAATTCCTGGAGATGGAAGGACGCATGGTAGGAACTATGGAATGGAATCTGAATCTCG 2447
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2380 GAGAATTCCTGGAGATGGAAGGACCCATGGTAGGAACTATGGAATGGAATCTGAATCTCG 2439
Query 2448 TGAAAATTTTGGAGAGCAATATGGTGATCCTGGATGGGGGCAAAGCCAGGGCCGTCCTCG 2507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2440 TGAAAATTTTGGAGAGCAATATGGTGATCCTGGATGGGGACAAAGCCAGGGCCGTCCACG 2499
Query 2508 TCATGGTCCATATTCTCCTTATCCTGAAAAGTTGTATCAGAATCCCGAGGGGGATGACTA 2567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2500 GCATGGTCCATATTCTCCTTATCCTGAAAAGTTGTATCAGAATCCCGAGGGGGATGACTA 2559
Query 2568 TTACCCTTTTGGAAGACCAAGATATTCAGTAAGGCAGCCACGTGTTCTTCCCCCTCCCCA 2627
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2560 TTACCCTTTTGGAAGATCAAGGTATTCAGTAAGGCAGCCGCGTGTTCTTCCCCCTCCCCA 2619
Query 2628 GGAGTCTAGGCAAAAGACTTCCTTTAGAAGCGAGGTTGAGCATCCTGGTCCCTCAACGTC 2687
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2620 GGAGTCTAGGCAAAAGGCATCCTTTAGAAGCGAGGTTGAGCATCCTGGTCCCTCAACTTC 2679
Query 2688 TATTGGAGGGATTAACTACAGCCATAAAGGTAGGACTAATTCGACTGTTCTAGCCAATTA 2747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2680 TATTGGAGGGATTAACTACAGCCATAAAGGTAGGACTAATTCGACTGTTCTAGCCAATTA 2739
Query 2748 TATTGA-G--------GATCATCATGTGCTGCCTGGAAGTGGTATCGATGAACATCGCCG 2798
||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 2740 TATAGAGGATCTTCAAGATCATCATGTGCTGCCCGGAAGTGGTATTGATGAACATCATCG 2799
Query 2799 GTTCGATACCAAGCTGACTGGAAGATGTGACTCTCAATCTTCACTTTCCGTTACTAGCCC 2858
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2800 GTTCGATAGCAAGCTGACTGGAAGATGTGACTCTCAATCTTCACTTTCCGTTACTAGCCC 2859
Query 2859 ACCTGATTCCCCTGTTCATCTCTCTCATGATGACTTGGATGAATCAGCAGATTCAACTGT 2918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 2860 ACCTGATTCCCCTGTTCATCTCTCTCATGATGACTTGGATGAATCAGCAGATTTATCTGT 2919
Query 2919 CCTACCTACTTCCAGAATGGGAGAAGATGCTGGTTTACTAGAGAAGGGGGGAGCACCAAT 2978
| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2920 CTTAGCTGCTTCCAGAATGGGAGAAGATGCTGGTTTGTTAGAGAAGGGGGGAGCACCAAT 2979
Query 2979 TATTTCTAGTGATATTGGAAAGGATAGTTTGATGATGGCGACAGGCTCTGTGTCTTGCTG 3038
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2980 TACCTCTAGTGATACTGGAAAGGATAGTTTGATGATTGCTACAGGCTCTGTGTCTTGCTG 3039
Query 3039 GGATAATGAAGAGTGGACTCTTGACAGTAATGAACGGTTGCAGGAACAAGAAGAATACGA 3098
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3040 GGATAATGAAGAATGGACTCTTGACAGTAATGAACGGTTGCAGGAACAAGAAGAATACGA 3099
Query 3099 CGAAGATGAAGATGGATACCAGGAGGAGGATAAAATACACGGGGTTGATGAGAACATAGA 3158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3100 CGAAGATGAAGATGGATACCAGGAGGAGGATAAAATACACGGGGTTGATGAGAACATAGA 3159
Query 3159 TCTCGCCCAAGAGTTAGAAGAAATGCATCTCGATGATAAAGACTCTAATCTAGTCTTAGG 3218
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3160 TCTCGCCCAAGAGTTAGAAGAAATGCATCTCGAGGATAAAGACTCTAATCTAGTCTTAGG 3219
Query 3219 CTTTAATGAAGGAGTGGAGGTTGAAATACCCAGCGATGACTTTGAAAAATGTCAACGGAA 3278
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3220 ATTTAATGAAGGAGTGGAGGTTGAAATACCCAGCGATGACTTTGAAAAATGTCAACGGAA 3279
Query 3279 CTCCGAATCTACATTTCCACTTCATCAGCATACTGTCGATTCTTTAGATGATGAAAGACC 3338
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3280 CTCCGAAGCTACATTTCCACTTCATCAGCATACTGTCGATTCTTTAGATGATGAAAGACC 3339
Query 3339 TTCTATTGAGACAAGCCGTGGTGAACAAGCCGCCCAACCTGCTGTCGTTTCTGATCCCTT 3398
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 3340 TTCTATTGAGACAAGCCTTGGTGAACAAGTCGCCCAACCTGCTGACGTTTCTGATCCGTT 3399
Query 3399 GGGCATGCATAATGCGTCTAGGACCTTCCAGGGTGCTGAAACCACGATGCAGAACTTGAC 3458
| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3400 GAGCATGCATAATGCATCTAGGAGCTTCCAGGCTGCTGAAACCACGATGCAGAACATGAC 3459
Query 3459 AGTTCACCCAAATATTGGTCGCCAGTCATTTGAGGTGGCCAGTAAAGTAGACTCCACAAG 3518
| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 3460 AATTCACCCAAATAGTGGTCGGCAGTCATTTGAGGTGGGCAATAAAGTAGACTCCATAAG 3519
Query 3519 TAACTCTACCGTTTCTACTCATCCTGTCATACCACTTCACAGCGCTGCTCTGCATCCATC 3578
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |
Sbjct 3520 TAACTCTACCGTTTCTACTCATCCTGTCATACCACCTCACAGCACTGGTCTGCAT-C--C 3576
Query 3579 ATCTCTTCAGACAGCTATTCCTCCTGTATCTACTACTTCAGCACAGATGGAGGAGCCTGT 3638
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3577 ATCTCTTCAGACAGCTATTCCTCCTGTA--T-CTACTTCAGCACAGATGGAGGAGCCTGT 3633
Query 3639 CAAGTTTCAGTTTGGTTTGTTTTCTGGTCCTTCGCTGATACCTTCTCCTTTCCCTGCCAT 3698
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3634 TAAGTTTCAGTTTGGTTTGTTTTCTGGTCCTTCGCTGATACCTTCTCCTTTCCCTGCCAT 3693
Query 3699 ACAGATTGGTTCCATCCAAATGCCTCTTCCTCTTCATCCCCAATTTGGCTCCTCGCTTAC 3758
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3694 ACAGATTGGTTCCATCCAAATGCCTCTTCCTCTTCATCCCCAATTTGGTTCCTCGCTTAC 3753
Query 3759 CCATATGCAACAGCCCCAGCCTCCTCTCATTCAGTTTGGTCAACTACCG-TATACATCCC 3817
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3754 CCATATCCAACAGCCCCAATCTCCTCTCATTCAGTTTGGTCAACTA-CGATATACATCCC 3812
Query 3818 CAATATCCCAAGGGGTGCTGCCACCGCCACATCATTCAGTTGTCCAAGCGAATGGTTTAT 3877
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3813 CAATATCCCAAGGGGTGCTGCCACCGCCACATCATTCAGTTGTCCAAGCGAATGGTTTAC 3872
Query 3878 CAACTTATGCTTTGAATCAGAATCCTGGATCCTTGGTGACTGTTCAGCTTGGTCAAGGAA 3937
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||
Sbjct 3873 CAACTTATGCTTTGAATCAGAATCCTGGATCCTCGGTGAC---T--G-TTGGTCAAGGAA 3926
Query 3938 ATTCGGCTAACCTGCTCGCTAGAAACGCAGCAACCTCTGTCTCACACCCTCAGCTTAGTG 3997
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3927 ATTCGGCTAACCTGCTTGCTAGAAACGCAGCAACCTCTGTCTCACACCCTCAGCTTAGTG 3986
Query 3998 TTCTTAGAAGACCGACAAATGTTTCTGATGAGGGCACACTGAAGAATGCTAATCTACCTC 4057
|||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3987 TTCTTAGAAGGCCAACGAATGTTTCTGATGGGGGCACACTGAAGAATGCTAATCTACCTC 4046
Query 4058 CAGCGAGAGCGAGCATTGAGGCTGCTGTGTCACCTCAAAAGCAACCAGAGTTGTCTGGTA 4117
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4047 CAGCGAGAGCAAGCATTGAGGCTGCTGTGTCACCTCAAAAGCAACCAGAGTTGTCTGGTA 4106
Query 4118 ATTCGCAATTACCTTCTCGAAAGATGAGTCATGGAAAATCAAATTTTGCTGAAAGACAAT 4177
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4107 ATTCGCTATTACCTTCTCGAAAGATGAGTCATGGAAAATCAAATTTTGTTGAAAGACAAT 4166
Query 4178 CAGGATACCAAGTCCAAACTGACACAAGTGCAGTAAGAAATTCTGGCTTGCGCTCATCTG 4237
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4167 CAGGATACCAAGTCCAAACTGACACAAATGCAGTTAGAAATTCTGGCTTGCGCTCATCAG 4226
Query 4238 GTACTGCTGAGGTTTCTCGGGTAGATTCTGGTGGTAATAGAAGATATCGTCGTCAGAGGG 4297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4227 GTACTGCTGAGGTTTCTCGGGTAGATTCTGGTGGTAATAGAAGATATCGGCGTCAGAGGG 4286
Query 4298 TTGAATTTAGAGTTCGGGAATCAAACTGGCCATCTTCCGATGAAAATCGAAATGGAAATG 4357
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 4287 TTGAATTTAGAGTTCGGGAATCAAACTGGCCATCTTCCGAGGAGAATCGAAATGGCAATG 4346
Query 4358 GAAGGGCACAAACTTCTACAAAAATTGGGAGTAGAAAATATGTTGTGTCCAACAAGTCCC 4417
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4347 GAAGGGCACAAAATTCTACAAAAAATGGGAGTAGAAAATATGTTGTGTCCAACAAGTCCC 4406
Query 4418 AGAAACAAGCCTTAGACAGCTCAGCGTCCGGTTTGAATGCTATGCAGAAAACAGTTAGTG 4477
|||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4407 AGAAACAACCCTTAGACAGCTCAGCTTCTGGTTTGAATGCTATGCAGAAAACAGTTAGTG 4466
Query 4478 GGGGTTCATTTGAGAATAGACTTGGGAAAGATGCTGTCGTGAAGAATCCACTCAGTCCAA 4537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4467 GGGGTTCATTTGAGAATAGACTTGGGAAAGATGCTGTCGTGAAGAATCCACTCAGTCCAA 4526
Query 4538 ATTCTGGACAAGCAAACCTTAAAAGGAATATGGTATCTGAAAAGGAAATTGATGCACCTT 4597
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4527 ATTCTGGACAAGCAAACCTTAAAAGGAATATGATATCTGAAAAGGAAATTGATGCACCTT 4586
Query 4598 TGCAGATTGGAATTGTTCGTGTCTTTGAGCAACAAGGTATTGAAGCTCCTAGTGACGATG 4657
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4587 TGCAGAGTGGAATTGTTCGTGTCTTTGAGCAACATGGTATTGAAGTTCCTAGTGACGATG 4646
Query 4658 ATGATTTTATTGAGGTAAGATCAAAAAGGCAAATGCTTAATGATCGCCGTGAACAGAGAG 4717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4647 ATGATTTTATTGAGGTAAGATCAAAAAGGCAAATGCTTAATGATCGCCGTGAACAGAGAG 4706
Query 4718 AAAAGGAAATTAAAGAGAAGTCTCAGGCAGCCAAGGCATTCCGAAAACCTCGTTCAACTT 4777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4707 AAAAGGAAATTAAAGAGAAGTCTCAGGCAGCCAAGGCATTCCGAAAACCTCGTTCAACTT 4766
Query 4778 TCCAGAACAATACTACTGCAGCCAGGTCCAACAGAAGCCCACCAGCTAGCCGAGCTGCGA 4837
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4767 TCCAGAACAGTACTACTGCAGCCAGGTCCAACAAAAGCCCACCAGCTAGCCGAGTTGCGA 4826
Query 4838 ACAATAAGCAGTTTAATCCAGTCTCCAACAGACAGACGTTAGCCCCAATTGGCACACCTT 4897
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4827 ACAATAAGCAGTTTAATCCCGTTTCCAACAGACAGACGTTAGCCCCAATTGGCACACCTT 4886
Query 4898 CACCTAAAATAGATTCCCATGTTGATGAAAAATCTGGGAGCAACAAGTCCACTCAGGAAA 4957
| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 4887 CCCCTAAAACAGATTCCCATGCTGATGAAAAATCTGGGAGCAACAAGTCCACCCAGGCAA 4946
Query 4958 GTAGTGCTCTTCCAGTTATACCCAAAAATGATCAGAATCCAGCGTCAGGTTTTGTATTCA 5017
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4947 GTAATGCTCTTCCAGTTATACCCAAAAATGATCAGAATCCAGCGTCAGGTTTTGTATTCA 5006
Query 5018 GCAACAAAAATAAGGTTCTCGATAACAGTCATACACCTGTGGGGACTTGGGGTAACCAAC 5077
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5007 GCAACAAAAATAAGGTTCTGGATAACAGTCATACACCTGTGGGGACTTGGGGTAACCAAC 5066
Query 5078 TCACCTATCAGCCGGTTATGGCCCTAACCCAGAGTCAGCTTGATGAAGCCATGAAACCCG 5137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5067 TCACCTATCAGCCGGTTATGGCCCTAACCCAGAGTCAGCTTGATGAAGCCATGAAACCCG 5126
Query 5138 TATCTC-ATCTTTCATGTGTTTCTGTTGAGAATGGTGCCAACCGAATTAGCGAGTCAAAT 5196
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||
Sbjct 5127 TATCTCTA-CTTTCATGTGTTTCTGTTGAGAATGGTGCTAACCGAATCAGTGAGGCAAAT 5185
Query 5197 TCGACATCAACGTCTGTTGTGCCAAAGAACAATACTTTTTCAAGCAGCACAAGTCCAATA 5256
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5186 TCGACATCAACGTCTGTTGTGCCAAAGAACAGTACTTTTTCAAGCAGCACAAGTCCAATA 5245
Query 5257 AATTCATTGCTTGCTGAGGGCAAAATTCAATTTGGTGCAGTTACATCTTCCACTGTTATC 5316
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5246 AATTCATTGCTTGCCGAGGGCAAAATTCAATTTGGTGCAGTTACATCTTCCACTGTTATC 5305
Query 5317 CCTCCCTGTGGTGGGCGTACAGAGAAGGATAGCTCTTTATATTTTGAAAAAGATAACAAA 5376
| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5306 CTTCCATGTGGTGGGCGTACGGAGAACGATAGCTCTTTATATTTTGAAAAAGATAATAAA 5365
Query 5377 CATCGAAATCCATCATCCACTGGCATAGAGATTTGTGAAGCAGAAGCAGAAGCTGCTGCT 5436
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5366 CATCGAAATCCATCATCCACTGGCATGGAGATTTGTGAAGCAGAAGCAGAAGCTGCTGCT 5425
Query 5437 TCAGCTATTGCTGTGGCAGCCATAACTAATGATGAAACCAGTGGGAATGCCTTGAGTACT 5496
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5426 TCAGCTATAGCTGTGGCAGCCATAACTAATGATGAAACCAGTGGGAATGCCTTGAGTACT 5485
Query 5497 GGCTCTGTATTACCTGTTGAAACCAAAATTTATGGAGGAACAGAGTTAGATGATGGGGCA 5556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5486 GGCTCTGTATTACCTGTTGAAACCAAAATTTATGGAGGAACAGAGTTAGATGATGGGGCA 5545
Query 5557 GCAAGTGGTACTGTTGGTGGGCAGACTAGTCGATCAAAAGCTGAGGAATCTCTCATTGTT 5616
||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5546 GCAAGTGGTGCTGTTGGTGGGCAGCCTAGTCTATCAAAAGCTGAGGAGTCTCTCATTGTT 5605
Query 5617 TCTCTACCAGCAGATCTTTCAGTGGACACCCCAATCTCTCTGTGGCCACAATTACCAAGT 5676
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5606 TCTCTCCCAGCAGATCTTTCAGTGGACACCCCAATCTCTGTGTGGCCACAATTACCAAGT 5665
Query 5677 CCACACAACTCAAACCAAATGATCACTCACTTCCCTCCAGGCCCTCCTCATTACCCTTTC 5736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5666 CCACACAACTCAAACCAAATGATCACTCACTTCCCTCCAGGCCCTCCTCATTACCCTTTC 5725
Query 5737 TATGATGTGAATCCCATGTTAAGAGGACCCATTTTTGCTTTTGGCCCGCACCATGACGCA 5796
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5726 TATGATGTGAACCCCATGTTAAGAGGACCCATCTTTGCTTTTGGCCCGCACCATGACGCA 5785
Query 5797 GGAGCAACCCAATCACAGTCCCAGAAAGGTCCAGTAACAGTATCTGGTCCACCTACGACC 5856
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 5786 GGAGCAACCCAGTCACAGTCCCAGAAAGGTCCAGTAACAGTTTCTGGTCCACCTACAACC 5845
Query 5857 TGGCAGCAGCAGGGTCATTCTGGAGTAGATTCCTTCTATGCCCCTCCTGCCGGTTTCACG 5916
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5846 TGGCAGCAGCAGAATCATCCTGGAGTAGATTCCTTCTATGCCCCTCCTGCCGGTTTCACG 5905
Query 5917 GGTCCTTTTCTAACCCCACCCGGTGCTATTCCTGGCGTTCAGGGACCTCCTCACATGTTT 5976
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5906 GGTCCTTTCCTAACCCCACCCGGTGCTATTCCTGGCGTTCAGGGTCCTCCTCACATGTTC 5965
Query 5977 GTTTATAACCACTTTGCACCTGTTGGACAGTTTGGAGGGTTGAGTTTCATGGGAACAACT 6036
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5966 GTTTATAACCACTTTGCACCCGTTGGACAGTTTGGAGGGTTGAGTTTCATGGGGACAACT 6025
Query 6037 TACATCCCATCTGGAAAGCAACCAGATTGGAAACACAACCCAAACGTATCTTCTTCTCCG 6096
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6026 TACATCCCATCTGGAAAACAACCAGATTGGAAACACAACCCAAACGTGTCTTCTTCTCCG 6085
Query 6097 GTTGGAGGAGATGGTGATGTAAACAATCCTAATGTGGCTTCCATGCAATGTAACATTGTA 6156
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 6086 GTTGGAGGAGATAGTGATGTAAACAATCCAAATGTGGCTTCTATGCAATGTAACATTGTA 6145
Query 6157 CCTGCGTCTCTTCAGCACCTTCCTATGCCAATGTTTGATCCATCTCCTTTCCAGTCTTCT 6216
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6146 CCTGCGTCTCTTCAGCACCTTCCTATGCCAATGTTTGATCCATCCCCTTTCCAGTCTTCT 6205
Query 6217 TCTCAGGAGATGCCTATTCGAGCACGGTGGCCTTACATGCCATTTTCGGGTCCTCCAACG 6276
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6206 TCTCAGGAGATGCCTGTTCGAGCACGGTGGCCTTACATGCCATTTTCAGGTCCTCCAACG 6265
Query 6277 ATGCAAATGCAGAAACAGCAGGAAGGAACAGATGGCTCCAATCTTCCATCACCTCAGTTT 6336
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6266 ATGCAAATGCAGAAACAGCAGGAAGCAACAGATGGCTCCAATCTTCCATCACCTCAGTTC 6325
Query 6337 AACAACAACATGCTTCCTCCTCCTCCTCCTAACAGATATCCCAACGTTCAAGCATCCACA 6396
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6326 ATCAACAACATGCTTCCTCCTCCTCCTCCTAACAGATATCCCAACGTTCAAGCATCCACA 6385
Query 6397 GTTGTAGACGCAATGGTGGACTCCTCAAACGCTTACAGTTCCACCACTGGTGCTCCACCA 6456
|||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6386 GTTGTAGATGCAATGGTGGACTCTTCAAACGCGTACAGTTCCACCACTTGTGCTCCACCA 6445
Query 6457 GCAAAGCCCACCTCCACGTTATCTGATCCCAACAGCAACAACACTCAGAATCCAAATGGT 6516
|||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6446 GCAAAGCCCACCACCACCTTACCCGATCCCAACAGCAACAACACTCAGAATCCAAGTGGT 6505
Query 6517 CCTGGCTTCAAGCCACCacaacaacaacaacaacaa---------TCTTCTCAGGAGAAG 6567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6506 CCTGGCTTCAAGCCACCACAACAACAACAACAACAACAACAACAATCTTCTCAGGAGAAG 6565
Query 6568 AACACGCAGTCTCAGCATGTTGGTGGGCCCAGCCACCACCACCAACACCAGCACCATCAA 6627
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6566 AACTCGCAGTCTCAGCATGTTGGTGGGTCCAGCCACCACCACCAACACCAGCACCAGCAA 6625
Query 6628 AACCGGAGATCGGGCTACCATGGCAGAAACCAACCCATGGCCAGAGAGAGAGGCTTTCCG 6687
||||||| || | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6626 CACCGGAGGTCAGCCTTCCATGGAAGAAACCAACCCATGGCCAGAGAGAGAGGCTTTCCG 6685
Query 6688 AATAACCCAAAGGTCAAGCAAATCTATGTGGCTAAGCAGACTGGTAACAGCTGTGCCTCT 6747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6686 AATAACCCAAAGGTCAAGCAAATCTATGTGGCTAAGCAGACTGGTAACAGCAATGCCTCT 6745
Query 6748 GCTTCCTCTACTACCACCACCACTTCCCCCTCAATTTGATGATTCTTCACCATCCAGGTC 6807
|||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6746 GCTTCCACCACCACCACCACCACCTCCCCCTCAATTTGATGATTCTTCACCATCCAGGTC 6805
Query 6808 CGTTCAGATATAAACTCATCCCAATAACCCAACCAGCTTTGGCTTCATAAGAAGATTTGG 6867
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6806 CGTTCAGATATAAACTT-TCC-AATAACCCAACCAGCTTTGGCTTCATAAGAAGATCTGG 6863
Query 6868 Actttttttc----ctttcaattttcccatatatcagttagcttcctttttttcttc-tt 6922
||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||
Sbjct 6864 TTTTTTTTTTTTTTCTTTCAATTTTCCCATATATCAATTAGCTTCTTTTTTTTATACCTT 6923
Query 6923 tttATCCTCGTTAGATAATTAGATTTTGT-TCT-CTTTACTCGTTTGGGGATTCATTATA 6980
||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6924 TTTATTCTCATTAGATAATTAGATTTTGTCTCTTCTTTACTCGTTTGGGGGTTCATTATA 6983
Query 6981 TGGGGACTTTGGTAATGCTTAATTTCGTCATGGTTGGTAAAAATATTGTCGTGAGGTTTT 7040
||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 6984 TGGGGACTTTGGTAATG---------GT--TGGT----AAAAATATTGCCGTGAGGTTTT 7028
Query 7041 CGGTGTAGAATACCCAATTCACGGCCCCAATGTATCTGTTGTCAACATTATCTTTATA 7098
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7029 CGGTGTAGAATACCCAATTCACGGCTCCAATGTATCTGTTGTCAACATTATCTTTATA 7086
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 271578840928
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5