BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G51120.1
Length=4129
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg937974 jgi|Araly1|937974|scaffold_502165.1 6268 0.0
> Ahg937974 jgi|Araly1|937974|scaffold_502165.1
Length=3922
Score = 6268 bits (3394), Expect = 0.0
Identities = 3753/3929 (96%), Gaps = 14/3929 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 102 TTTTTTCAAATTCTTCACTAATCATGGAGAATCAACAGAAGCAACTCCAGCAAGGCGTGC 161
||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTTTTCGAATTCTTGACTAATCATGGACAATCAACAGAAGCAACTCCAGCAAGGCGTGC 60
Query 162 CGGAGTTGGCTTCTTTGGCTGGTCGCGAAGAGAGTTCCGTCAGAGGAATCGATCTTATGA 221
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 61 CGGAGTTGGCTTCTTTGGCTGGTCGCGAAGAGAGTTCCGTCAGAGGGATCGATCTTATGA 120
Query 222 GAGTTGATCAATGTGAAGAGATCGGTGTTAACCAAGTTCCTGCTCTCTCTGTACCTGCCT 281
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAGTTGATCAATGTGAAGAGATCGGTGTTAAACAAGTTCCTGCTCTCTCTGTACCTGCCT 180
Query 282 CCACGGTTGCTGGGGCGGTTGCTGTGCCTATGTCCAATGAGCAAGAGGTTAAAGTTATTG 341
|||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 181 TGTCGGTGGCTGGGACGGTTGCTGTACCTGTGTCCATTGAGCAAGAGGTTAAAGTTGTTG 240
Query 342 ATGAAGCTGCCCCAATAAAACGAAAACGGGGGAGGCCTCCAAGGGCACAGGCTAATACGC 401
||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 241 ATGAAGCTGCCCCTGTGAAACGAAAACGGGGTCGTCCTCCGAGGGCACAGGCTAAGACGC 300
Query 402 CGTTGCATATTCGTCCACCCCCACCGCCGCCGAAGAAGGAAGACAAGGAAGAAGATGTTT 461
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 301 CGTTGCATATTCGGCCACCCCCACCGCCGCCGCGGAAGGACGACAAGGAAGAAGATGTTT 360
Query 462 GCTTTATTTGCTTCGACGGTGGAGACCTTGTTCTCTGTGATCGCCGGAATTGCCCCAAGG 521
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCTTCATTTGCTTCGACGGTGGAGACCTCGTTCTCTGTGATCGCCGGAATTGCCCCAAGG 420
Query 522 CATACCATCCAGCTTGTATTAAGAGAGATGAGGCATTCTTTCGAACAACGGCCAAATGGA 581
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 421 CATACCATCCAGCTTGTATTAAGAGAGATGAGGCATTCTTCCGAACAACGGCTAAATGGA 480
Query 582 ATTGTGGGTGGCACATATGTGGTACATGCCAAAAAGCTTCCAGTTACATGTGTTATACAT 641
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATTGTGGTTGGCACATATGTGGTACATGCCAAAAGGCTTCCAGTTACATGTGTTATACAT 540
Query 642 GCACTTTTTCTGTTTGTAAGCGGTGCATTAAAGATGCTGACTATGTGATTGTGAGAGGTA 701
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCACTTTTTCCGTTTGTAAGCGGTGCATTAAAGATGCCGACTATGTGATTGTGAGAGGTA 600
Query 702 ACATGGGTCTTTGTGGCACATGTATTAAGCCTATAATGCTGATTGAGAATATTGCTCAAG 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ACATGGGTCTTTGTGGCACATGTATTAAGCCTATAATGCTGATTGAGAATATTGCTCAAG 660
Query 762 GAGATAATGAAGCGGTTAAGGTGGATTTCGATGACAAGCTTAGTTGGGAGTATCTATTCA 821
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 661 GAGATAATGAAGCAGTTAAGGTGGATTTTGATGACAAGCTTAGTTGGGAATATCTATTCA 720
Query 822 AGGTATATTGGCTTTGCCTGAAGGAAGAGCTGTCTCTAACTGTTGATGAGCTTACTAGAG 881
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 721 AGGTATATTGGCTTTGCCTGAAGGAAGATCTATCTCTAACTGTCGATGAGCTTACTAAAG 780
Query 882 CAAATAATCCTTGGAAGGAGGTTCCTAACACTGCTCCCAAAGTGGAGTCACAAAATGATC 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||
Sbjct 781 CAAATAATCCTTGGAAGGAGGTTCCTAACACTGCTCCTAACGTGGAGTCACGAAATGATC 840
Query 942 ATACCAATAACAGAGCTTTAGATGTAGCAGTAAATGGAACAAAAAGAAGAAGGACCAGTG 1001
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 841 ATACCAATAACAGAGCTTTAGATGTAGCAGTGAATGGAACAAAAAGAAGAAAGACCAGTG 900
Query 1002 ATTCCCCTACCTTACCCAACAAGTTGGATGGCAAAAATCCAAGTAATATCCTAAAGAAGG 1061
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 901 ATTCCCCCACCTTACCCAACAAGTTGGATGGCAAAAATTCAAATAATATCCTAAAGAAGG 960
Query 1062 CTCCTGGAGATACGAGCTGGGCAACAAAAGAACTCCTCGAGTTTGTGTCGTTCATGAAAA 1121
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTCCTAGAGATACGAGCTGGGCAACAAAAGAACTCCTCGAGTTTGTGTCGTTCATGAAAA 1020
Query 1122 ATGGCGATACATCTGTTCTATCTCAGTTTGACGTGCAGGGTCTTCTGCTTGACTATATCA 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ATGGCGATACATCTGTTCTATCTCAGTTTGACGTGCAGGGTCTTCTGCTTGACTATATCA 1080
Query 1182 AGaaaaaaaaTCTTAGGGATCCTCTTCAGAAGTCTCAAGTTCTTTGTGACCAGATGCTTG 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1081 AGAAAAAAAATCTTAGGGATCCTCTTCAGAAGTCTCAAGTTCTTTGTGACCTGATGCTTG 1140
Query 1242 TGAAGTTGTTTGGAAAACAGCGAGTGGGTCACTTTGAAATGCTTAAGCTTCTAGAGTCTC 1301
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1141 TGAAGTTGTTTGGAAAACAGCGAGTGGGTCACTTTGAAATGCTTAAGCTTCTCGAGTCTC 1200
Query 1302 ATGTCCTTATTCAAGAGAAACCGAAAGGCGCTAAGACCACGAATGGTGAAACTACTCATG 1361
| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 ACGTCCTTATTCAAGAGAAACCGAAAGGTGATAAGACCACGAATGGTGAAACTACTCATG 1260
Query 1362 CTGTACCTAGCCAAATAGAGGAGGATAGTGTTCATGATCCAATGGTCAGGGATAGAAGAC 1421
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1261 CCGTACCTAGCCAAATAGAGGAGGATAGTGTTCATGATCCAGCGGTCAGGGATAGAAGAC 1320
Query 1422 GGAAGATGCGTAGGAAAACTGATGGCAGAGTACAAAATGAAAATCTGGATGCATACGCAG 1481
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1321 GTAAGATGCGCAGGAAAACTGATGGCAGAGTACAAAATGAAAATCTGGATGCATATGCAG 1380
Query 1482 CCATTGATGTTCACAATATCAACCTGATTTATTTGAGACGTAAATTTTTGGAGTCTCTTC 1541
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1381 CCATTGATGTTCACAATATCAACCTGATTTATTTGAGACGTAAATTTTTGGAGTCTCTAC 1440
Query 1542 TTGATGATATCAACAAAGTTGACGAAAAGGTGGTAGGCACAATTTTGAGAATCAAGGTAT 1601
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 TTGATGATATCAACAAAGTTCACGAAAAGGTGGTAGGCACAATTTTGAGAATCAAGGTAT 1500
Query 1602 CTGGCAGCGACCAGAAGCTGGATATTCACAGGCTTGTTCAAGTTGTAGGTACAAGCAAGG 1661
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CTGGCAGCGACCAGAAGGTGGATATTCACAGGCTTGTTCAAGTTGTAGGTACAAGCAAGG 1560
Query 1662 CAATAGCATCCTACCAACTTGGCGCAAAGACTACAGATGTTATGCTTGAAATACTGAATT 1721
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1561 CAACAGCATCCTACCAACTTGGCGCAAAGACTACAGATGTTATGCTAGAAATACTGAATT 1620
Query 1722 TAGACAAGAGAGAAGTCATCTCGATTGATCAATTATCAGACCAGAATATCACAGAGGATG 1781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TAGACAAGAGAGAAGTCATCTCGATTGATCAATTATCAGACCAGAATATCACAGAGGATG 1680
Query 1782 AGTGCAAACGGCTGCGCCAGAGCATAAAATGTGGCCTCAATAAACGTTTGACTGTGGTTG 1841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1681 AGTGCAAACGGCTGCGCCAGAGCATAAAATGTGGCCTCAATAAACGTTTGACTGTGGGTG 1740
Query 1842 ACATCTTGAAGACGGCAGCAACACTGCAAGCCATGAGAATCAATGAGGCTCTGGAAGCTG 1901
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 AGATCTTGAAGACAGCAGCAACACTGCAAGCCATGAGAACCAATGAGGCTCTGGAAGCTG 1800
Query 1902 AGATATTAAAGCTCAACCATCTCCGTGATCGGGCAAAAAAGCTGGAGCTTCTAAAATCAC 1961
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 AGATATTAAAGCTCAATCATCTCCGTGATCGGGCCAAAAAGCTGGAGCTTCTAAAATCAC 1860
Query 1962 CTGAGGAACGTCAGCGGCTTCTGCAGGAAGTCCCAGAAGTTCATACAGATCCAAGCATGG 2021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 CTGAGGAACGTCAGCGGCTTCTGCAGGAAGTCCCAGAAGTTCATACAGATCCAAGCATGG 1920
Query 2022 ATCCAAGTCATGCATTATCAGAAGATGCAGGGTTGGGTACAAGGAAACAAGATAATCACG 2081
|||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 1921 ATCCGAGTAATGCATCATCATCAGATGCAGGGTTGGGTACAACAAAACAAGTTAATCACA 1980
Query 2082 TAAAGGCACAAAGTAAAGGTCCACAGAATAAAGGGGTTAACTTGAACAACGTGGGAAATA 2141
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||
Sbjct 1981 TAAAGGCACAAAGTAAAGGTCCGCAGAATAAAGGGGCTATCTTGAACAACGTAGGAAATA 2040
Query 2142 ATGTGCAGAAAAAATATGATGCACCAATTTTGCGAAGCAGAAATAACGTACATGCTGATA 2201
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2041 ATGCGCAGAAAAAATATGATGCACCAATTTTGCGAAGCAGAAATGTCGTGCATGCTGATA 2100
Query 2202 AAGATGATTGTTCTAAGGTCCACAATAACTCATCAAATATCCAGGAAACTGGTAAAGATG 2261
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 AAGATGATTGTTCTAAGGTCCACAACAACTCATCAAATATCCAGGAAACTGGTAAAGATG 2160
Query 2262 ACGAGGAGAGTGAAATATGGCATTATCGAGATCCAACAGGAAAGACCCAGGGACCGTTTT 2321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 ACGAGGAGAGTGAAATATGGCATTATCGAGATCCAACAGGAAAGACCCAGGGACCGTTTT 2220
Query 2322 CTATGGTGCAGCTCCGTAGATGGAAATCTAGTGGCCATTTTCCCCCTTATCTTAGGATAT 2381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTATGGTGCAGCTCCGTAGATGGAAATCTAGTGGCCATTTTCCCCCTTATCTTAGGATAT 2280
Query 2382 GGAGAGCGCATGAGAACCAAGACGAGTCTGTGCTTCTGACTGATGCTCTTGCTGGACGGT 2441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 GGAGAGCGCATGAGAACCAAGACGAGTCTGTGCTTCTGACTGATGCTCTTGCTGGACGGT 2340
Query 2442 TTGATAAAGCAACTACTTTGCCGAGTTCTTCTTCGCTTCCCCAAGAACTAAAACCGTCTC 2501
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||
Sbjct 2341 TTGATAAAGCAACTACTTTGCCAAGTTCTTCTTTGCTTCCCCAAGAACAAAAACCATTTC 2400
Query 2502 CACACGATTCTGGCCGCACTGGCGCGGATGTGAACTGTCTTCAGAAGAACCAGATGCCAG 2561
| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2401 CGCACGATTCTGGCCGCACTGGCGTGGATGTGAACTGTCTTCAGAAGAACCAGACGCCAG 2460
Query 2562 TTAACACCAGTGCAACCTCCTCTTCCTCCTCTACTGTCACTGCCCATTCTAACGATCCTA 2621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 TTAACACCAGTGCAACCTCCTCTTCCTCCTCTACTGTCACTGCCCATTCTAACGATCCTA 2520
Query 2622 AAGAGAAACAAGTTGTGGCTCTTGTAGCTTGCTCTGGAAAAGTTGAGGATGGTAATTCTG 2681
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2521 AAGAGAAACAAGTTGTGGCTCTTGTAGTTTGCTCTGGAAAAGTCGAGGATGGTAATTCTG 2580
Query 2682 TTCGTCCCCAGCCTCAAGTTAGTTGTCCGGCGTCGATCTCTGTGGTTCCTGGACACGTTG 2741
|| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 TTTGTCCCCAGTCTCAAGTTAGTTGTCCGGCGTCAATGTCTGTGGTTCCTGGACACGTTG 2640
Query 2742 TTACTCCTGATGTAAGAGAAACTCCAGGAACTGATCAATACAATACTGTGCGGGCAGATG 2801
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 2641 TTAGTCCTGATGTAAGACAAACTCCAGGAACTGATCAATCCAATGCTGTGCGGGCAGATG 2700
Query 2802 GTAACCATAACACAACTAAGACTCTGGAGGATGAAACAAATGGTGGTTCTGTTTCCATAA 2861
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2701 GTAACCATAACACAACTAAGACTCTGGATGATGGAACAAATGGTGGTTCTG---CCATAA 2757
Query 2862 ACGGTTCTGTTCATGCACCAAACCTGAATCAAGAAAGTCATTTCCTTGATTTCCCTAGTC 2921
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 ATGGTTCTGTTCAGGCACCAAACCTGAATCAAGAAAGCCATTTCCTTGATTTCCCTAGTC 2817
Query 2922 CTACACCTAAGTCGAGCCCTGAAGACTTGGAAGCTCAAGCGGCGGAGACTATCCAGTCTC 2981
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2818 CTACGCCTAAGTCGAGCCCTGAGGACTTGGAAGCTCAAGCGGCAGAGACTATTCAGTCTC 2877
Query 2982 TGTCTTCATGTGTTCTGGTCAAAGGGCCATCTGGTGTCACTTGGAGCACCACAACCACAA 3041
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2878 TGTCTTCATGTGTTCTGGTCAAAGGACCATCTGGTGTCACTTGGAGCACCACAACAACA- 2936
Query 3042 G-TACAACCGATGCTGCTACTACCACTTCAAGTGTTGTGGTTACTGGAGGACAGCTTCCT 3100
| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2937 GCTACCACCGATGCTGCTACTACTACTTCAAGTGTTGTGGTCGCTGGAGGACAGCTTCCT 2996
Query 3101 CAAGTAATTCAGCAGAATACTGTTGTTTTAGCTGCACCGTCTGTAAAGCCAATTGAGTTG 3160
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2997 CAAGTAACTCAGCAGAATGCTGTTGTTTTAGCTGCACCGTCTGTAAAGCCAATTGATTTG 3056
Query 3161 GCAGCTGATCACGCCACAGCTACTCAGACTTCAGACAACACCCAAGTGGCTCAAGCATCT 3220
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3057 GCAGCTGATCACGCCACAGCTACGCAGACTTCAGACAACACCCAAGTGGCTCAAGCATCT 3116
Query 3221 GGGTGGCCGGCCATTGTGGCTGACCCCGACGAGTGTGATGAATCAGTTTCAGATCTATTA 3280
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3117 GGGTGGCCGGCCATTGTGGCTGACCCTGACGAGTGTGATGAATCAGTTTCAGATCTATTA 3176
Query 3281 GCTGAAGTTGAAGCAATGGAGCAGAACGGT-TTACCCTCTTCACCCACCTCGACATTTCA 3339
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3177 GCTGAAGTTGAAGCAATGGAGCAGAACGGTCTT-CCCTCTTCACCCACCTCAACGTTTCA 3235
Query 3340 CTGTGATGATGACGATGATTTGA-AA--GGGCCCGAAAAAGATTTCTTTAACCCTGTGGC 3396
||| |||||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3236 CTGCGATGATGATGATGATTTGACAAAAGGGCCAGAGAAAGATTTCTTTAACCCCGTGGC 3295
Query 3397 ACGCATGTCTCTCACACCTGAAACATGTAGATTGGATGTCTCTCAGACGAGTATCCTCGA 3456
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 3296 ACGCATGTCCCTGACACCTGAAACATGTAGATTGGATGTCTCTCAGGCGAGTATTCTCGA 3355
Query 3457 CAATGTCTCTGCCGGGAAAAGCTCAATGCTTACAGAAGCAAAAGACAATACTCCCTTCAG 3516
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 3356 CAATGTCTCTGCCGGGAAAAGCTCAATGGGTACAGAAGCAAAAGACAACACTCCCTTCGG 3415
Query 3517 CCACTGCGGAACTGCTGGTCCAGAGCTCCTGCTTTTTGCACCGCCACCGCCACCGCCAAC 3576
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||
Sbjct 3416 CCACTTCGGAACCGCTGGTCCAGAGCTCCTGCTTTTTGCACCACCAGCGCCAGCGCCAAC 3475
Query 3577 TGCAATAAGTCACGACCTGACTCTAACGACAACGGCTCTCAGACTAGGATCAGAAACCAC 3636
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3476 TTCAATAAGTCACGACCTGACTCTAACGACAACGGCTCTCAGACTAGGATCAGAAACCAC 3535
Query 3637 AGTTGAAGCTGGAACGGTCGAGAGGCTTCCTAAATCTGTTTTGGGAGTAAGTTCGGAACC 3696
||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3536 AGTTGAAGCTGGATCGGTCGAGAGGCTCCCCAAATCTGTTTTGGGAGTAAGTTCGGAACC 3595
Query 3697 AAGCCCTAGATCATT-ATCATCTCATGACTCAAGCTCAGCCCGTGGAAGCACCGAGCGAA 3755
||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3596 AAGCCCTAGGTCATTTAT-ATCTCATGACTCAGGCTCAGCCCGTGGAAACACCGAGCGAA 3654
Query 3756 GTCCACGAGTGAGCCAGCCA-AAGAGATCCAGCGGGCACAGCAGAGACCGGCAGTGGTTG 3814
||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3655 GTCCACGAGGGAGCCAGC-AGAAGAGATCCAGCGGGCACAGCAGAGACCGGCAGTGGTTG 3713
Query 3815 AACAACGGTCACAACAGTAGCTTCAACAACAGTCATAATAACCGGCAATGGCCATACAGC 3874
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3714 AACAGCAGTCACAACAGTAGCTTCAACAACAGTCATAATAACCGTCAATGGCCATACAGC 3773
Query 3875 AATAGCCATGGGTATGACCATGGATCAGGTTCGTATGCAGCCCATCCGCCCAAAGGGCTG 3934
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3774 AATAGCCATGGGTATGACCATGGATCAGGTTCGTACGCAGCTCATCCGCCCAAAGGGCTG 3833
Query 3935 AAAATATGTAAATTCTATGAGAGTGGATACTGCAAAAGAGGTGCATCTTGTAGTTTTTGG 3994
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3834 AAAATCTGTAAATTCTATGAGAGTGGATACTGCAAAAGAGGTGCATCTTGTAGTTTTTGG 3893
Query 3995 CACCCCTGAattttcatttcttgtatttt 4023
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3894 CACCCCTGAATTTTCATTTCTTGTATTTT 3922
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 156112164446
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5