BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G54460.1 Length=4352 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg485847 jgi|Araly1|485847|fgenesh2_kg.5__1839__AT3G54460.1 6761 0.0 > Ahg485847 jgi|Araly1|485847|fgenesh2_kg.5__1839__AT3G54460.1 Length=4303 Score = 6761 bits (3661), Expect = 0.0 Identities = 4100/4307 (95%), Gaps = 49/4307 (1%) Strand=Plus/Plus Query 45 AGAAAGATGAGATTTTCCTAAAGCAAATCTACAAAGCCTTATAAAttt-ttttttCTGGC 103 ||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||| | ||| | ||| | Sbjct 31 AGAAAGATGCGATTTTTTTAGAGAAAATCTATAAAGCCTTAT-ACTTTCTGCATTC-CGT 88 Query 104 GG-CGATGGCC---GATGATCACAAACTCTGTGGTTTTCTCTGTACCGTTCTTTCCGTCG 159 || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 89 GGTCGAGGGCCGATGATGATCACAAACTCTGTGGTTTTCTCTGTACCGTTCTTTCCGTCG 148 Query 160 ATTCGCCTGATCTTCTTCAATCGGGCTCGTCTTGTTTCATCTTCAATGATGGTTCCGTCA 219 ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | Sbjct 149 ATTCGCCTGGTCTTCTTCAATTGGGCTCTTCCTGTTTCATCTTCAATGA--------T-- 198 Query 220 CCGGTTTCAAATCCGAAAATGGCTTGATCTTATCCCTCACT-AATCCCATCTCTAATCTC 278 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 199 --GGTTTCAAATCCGACAATGGCTTGATCTTATCCCTCA-TCAATCCCATCTCTAATCTC 255 Query 279 CAATCCCTAATTTCGTCAAAAGGAGATCATGATGTTGAGAATTCCGGAACAATTGAAGAC 338 |||||||||||||||| |||||||||| || || | | || ||||||| Sbjct 256 AAATCCCTAATTTCGTCTGAAGGAGATCA-GA-ATT--G---T--GG------TGAAGAC 300 Query 339 GGTCGATTGGAGACTCCGCAGAAACGCCGTAAGTGCGTTGAGGGAGAGAGTAGTGGTA-A 397 ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct 301 GGTGGATTGCAGACTCCACAGAAACGCCGTAAGTGCGTTGAGGGAGAGAGTAGTCGTACA 360 Query 398 GCGAAAGACTCCGAAATCGAAGAGACGAGTTTTATCCGGGAGCAAGGAGAAGACTGTACA 457 |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 361 -CGAAAGTCTCCGAAGTCGAAGAGCCGAGTTTTATCCGGGAGCAAGGAGAAGACCGTACA 419 Query 458 GGGAAGGAAGAGGGTAAAGAGTATAGGTATGGTGAATGGAAGTATAAGTGTAGTGCAGCA 517 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 420 GGGGAGGAAGAGGGTAAAGAGTATAGGCATGGTGAATGGAAGCATAAGTGTAGTGCAGCA 479 Query 518 GCTTCATGCTTTGGTTGCTAATAAATGCTTGAAGATTA-TATGTCGTGTGGTGAAGGTTG 576 |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||||||| ||| Sbjct 480 GCTTCACGCTTTGGTTGCCAACAAATGTTTGAAGA-TATTTTCTCAAGTGGTGAAGATTG 538 Query 577 ATAAAGGTGAGAATGGAGAAGAAAGAGCTGTGGTGTTAGTTGATGTTTACCTGCCTATTG 636 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| Sbjct 539 ATAAAGGTGAGAATGGAGAAGAAAGAGCTGTGGTGCTAGTTGATGTTTACTTACCTATTG 598 Query 637 AATTGTGGTCCGGATGGCAATTTCCTAAATCTCAAGCTACTGCTGCTGCATTGTTTAAGC 696 |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 599 CATTGTGGTCCGGGTGGCAATTTCCCAAATCCCAAGCTACTGCTGCTGCATTGTTCAAGC 658 Query 697 ACTTGAGCTGTGACTGGGGACTGAGAGTCTCAATCCTTGACGGAAAAAGTATTTGGGAAG 756 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 659 ACTTGAGCTGTGACTGGGGACTGAGAGTCTCAATCCTTGACGGGGAAAGTGTTTGGGAAG 718 Query 757 AGGCCAATGGAAGAATAAAGGCCATCTGGGATCTATCTGACTGTCATGTGTTTGACTGCA 816 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| Sbjct 719 AGGCCAATGGAAGAATAAAGGCCATCTGGGATCTATCCGACTGTCATGTGTTTAATTGCA 778 Query 817 AATTACTCTGTAATGCCCCAAATTCTCCAAAAAGACGGTTATTTAAACTACATGAAATTT 876 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| | Sbjct 779 AATTACTCTGTAATGCCCCAGATTCTCCAAAAAGACGATTGTTCAAACTACATGAAATCT 838 Query 877 TTAAGAGCTTGCCCAGTCCAGGAAATCATGATGTGTCTTATTCTTCTAGAGTATTGCCGT 936 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 839 TTAAGAGCTTGCCCAGTCCAGGAAATCATGATGTGTCTTGTTCTTCTAGAGTATTACCGT 898 Query 937 CTACTGACTCTTGTGTATCTGGTGTATGGGATCTCTCAGATGACGTTTTGATTAGCATAC 996 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 899 CTACTGACTCTTGTGCATCTGGTGTATGGGATCTCTCAGATGACGTTTTGATTAGCATAC 958 Query 997 TGATGAAACTTGACACGAAGGATCTTTTTAGCATTGCAGCAGTCTGCCGTCTCTTCAGAT 1056 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 TGATGAAACTTGACACGAAGGATCTTTTTAGCATTTCAGCAGTCTGCCGTCTCTTCAGAT 1018 Query 1057 CATTGACCTCTCTAATTGTGCCATGTATGAATCTAAAACTCTTTCCTCATCAGCAGGCAG 1116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 CATTGACCTCTCTAATTGTGCCATGTATGAATCTAAAACTCTTTCCTCATCAGCAGGCAG 1078 Query 1117 CAGTTGGTTGGATGCTGGAGCGTGAGAGGAAAGCTGAAGTTTCCTCGCATCCCCTTTACT 1176 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 CAGTTGGTTGGATGCTGGAGCGTGAGAGGAAAGCTGAAGTTTCCTCGCATCCCCTTTACT 1138 Query 1177 TGAGTTTTGATACTGAGGATGGGTTTAGTTTCTACGTAAATGCTGTGACTGGTGATATAA 1236 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1139 TGAGTTTTGATACTGAGGATGGGTTTAGTTTCTATGTAAATGCTGTGACTGGTGATATAA 1198 Query 1237 TCACTGAGGCAGCTCCCATGGTCAAGGATTTCCGTGGGGGAATGTTCTGCGATGAACCAG 1296 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 TCACTGAGGCAGCTCCCATGGTCAAGGATTTTCGTGGGGGAATGTTCTGCGATGAACCAG 1258 Query 1297 GTCTCGGAAAGACAATAACAGCATTATCCCTTATCCTAAAGACGCAGGGAACAATGGCTG 1356 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1259 GTCTCGGAAAGACGATAACAGCATTATCCCTTATCCTAAAGACGCAGGGAACAATGGCTG 1318 Query 1357 ATCCGCCTGAGGGACTTCCTATCGTTTGGTGTACCCACAAAAGTGACAAAAAATGTGCCT 1416 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 1319 ATCCGCCTGAGGGACTTCCTATCGTTTGGTGTACACATAAAAGTGACAAAAAATGCGCCT 1378 Query 1417 ATTATGAGTACACGAGTGACCAGTTCACTTCTAACAGCATGTCTGCTGTAAAGAGGTTTC 1476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1379 ATTATGAGTACACGAGTGACCAGTTCACTTCTAACAGCATGTTTGCTGTAAAGAGGTTTC 1438 Query 1477 AAAGTCCAAGTAGCTGTCGAAACCAGGTTTCTTTTGAAGCCTTTCGTCCGCTGCTGGAGT 1536 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 AAAGTCCAAGTAGCTGTCGAAACCAGTTTTCTTTTGAAGCCTTTCGTCCGCTGCTGGAGT 1498 Query 1537 CAAAATCGTTGCCATTTAAGCAAGCGAGGCTGATGGATCCAGATGATCAAACATTGGAGT 1596 | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1499 CGAAATCGTTGCCACTTAAGCAAGCTAGGCTGATGGATCCAGATGATCAAACATTGGAGT 1558 Query 1597 CTAAGAATTCAAACTTTGAAAACGAATTTGAAACTCACATCCCTGCGTCCCTGGATTTAA 1656 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1559 CTAAGAACTCAAACTTTGAAAACGAATTTGAAACCCACATCCCTGCGTCCCTGGATGTAA 1618 Query 1657 AAGCTCAATGTAGAAAGAGCTTGGGTAATGTCAGAAAAAATCTCTTGCCTGCATATAATG 1716 ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| Sbjct 1619 AAGCTCAATGTAGAAAGCCCTTGGGTAATGTCAGGAAAAATCTCTTGCATGTATATGATG 1678 Query 1717 GCGCATCTGAGCTCTCTGAAGTGATGGAAGCTAAAAGAATCAGTAATTGGAAGAAATGTG 1776 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1679 GCGCATCTGAGCTCTCCAAAGTGATGGAAGCTAAAAGAATCGGTAATTGGAAGAAATGTG 1738 Query 1777 GTATGATAACAGGTTGCAAGAGAAAGGGTCTTACTGATTCGGATGTGGAAAGCGATATTT 1836 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1739 GTATGATAACAGGTTGCAAGAGAAAGGGTCTTACTGATTCGGATGTGGAAAGCGATATTT 1798 Query 1837 GGATGCAGTGTGATTCTTGCTCAAAGTGGCGGAGAATAATAGATGAAGGTGTATCTGTTA 1896 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 GGATACAGTGTGATTCTTGCTCAAAGTGGCGGAGAATAATAGATGAAGGTGTATCTGTTA 1858 Query 1897 CTGGTTCTGCATGGTTTTGTAGCAACAATAATGACCCTGCATATCAAAGTTGTAATGATC 1956 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1859 CTGGTTCTGCATGGTTTTGTAGCAACAATGCTGACCCTGCATATCAGAGTTGTAATGATC 1918 Query 1957 CTGAAGAATTATGGGATAAATCTCAACCTATAAAATACTTGCAAGGGTTTTATACTAAGG 2016 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 CTGAAGAATTATGGGATAGATCTCAACCTATAAAATTCTTGCAAGGGTTTTATACTAAGG 1978 Query 2017 GAGCCTCTGGGGAAGAAAGTGATAATATCTCTTTCTTCACGAGTGTCCTTCGGGAACACA 2076 |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1979 GAGCCTCTGGTGAAGAAAATGATAATATCTCTTTCTTCACCAGTGTCCTTCGGGAACACA 2038 Query 2077 AGTCTTCAGTAAGCTCAACCGTAAAGAAAGCCTTAATTTGGCTTGCTAAACTCCCTCTTG 2136 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2039 AGTCTTCAGTAAACTCAACCGTAAAGAAAGCCTTAATTTGGCTTGCTAAACTCCCTCTTG 2098 Query 2137 AGAAGCTCTCACAGATGGAAACAGTTGGCTTACCTGGTCCAGTGTTGGGTTTAAAAT-TA 2195 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct 2099 AGAAACTCTCACAGATGGAAACAGTTGGCTTACCTGGTCCAGTGTTGGGTTT-GAATAAA 2157 Query 2196 GATGCCCTTGGGTTCCAGAGAATATTTCGAGCATTTGGTCTTAAGAGTAGAGTTGAAAAG 2255 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2158 GATGCCCTTGGGTTCCAGACAATATTTCGAGCATTTGGTCTTAAGAGTAGAGTTGAAAAG 2217 Query 2256 GGTGTCACCAAATGGTTTTACCCGAAGTTTCTTGAGAACTTAGTATTTGATGTACCTGCC 2315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2218 GGTGTCACCAAATGGTTTTACCCGAAGTTTCTTGAGAACTTAGTATTTGATGTACCTGCC 2277 Query 2316 CTCAAAGTTGCTCTCTGTCAGCCGCTGGATACATTTAGACTGTATTTGTCAAAAGCAACT 2375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2278 CTCAAAGTTGCTCTCTGTCAGCCGCTGGATACATTTAGACTGTATTTGTCAAAAGCAACT 2337 Query 2376 CTAATCGTCGTCCCCACAAATTTAGTTAATCATTGGTTAACACAAATCCAAAAACATGTT 2435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2338 CTAATCGTCGTCCCCACAAATTTAGTTAATCATTGGACAACACAAATCCAAAAACATGTT 2397 Query 2436 TGCTCTGATCAGCTTCGTATTCTCGTTTGGGCTGACCATATAGAGCTTTCTCCACACAGC 2495 ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2398 TGCTCTGATCAGCTTCGCCTTCTTGTTTGGACTGACCATATAGAGCTTTCTCCACACAGC 2457 Query 2496 TTGGCTTGGGATTATGATGTTGTGATCACAACTTTTAGTCGCTTAAGTGCGGAATGGAAT 2555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2458 TTGGCTTGGGATTATGATGTTGTGATCACAACTTTTAGTCGCTTAAGTGCGGAATGGAAT 2517 Query 2556 CCCCGGAAGAAAAGCCCATTGATCCAAGTGCATTGGCTTAGGGTCATGCTAGATGAAGGA 2615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2518 CCCCGGAAGAAAAGCCCATTGATCCAAGTGCATTGGCTTAGGGTCATGCTAGATGAAGGA 2577 Query 2616 CACACTCTTGGTTCTAGTGTCAGTTTGACTAATAAATTTCAGATGGCTGTTTCTCTGACA 2675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2578 CACACTCTTGGTTCTAGTGTCAGTTTGACTAATAAATTTCAGATGGCTGTTTCTTTGACA 2637 Query 2676 GCTTGTAATCGTTGGCTATTGACAGGAACACCAACCCCTAACACACCAAATAGCCAGCTT 2735 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2638 GCTTGTAATCGTTGGCTATTGACAGGAACACCAACCCCTAACACACCAAATAGCCAGCTT 2697 Query 2736 TCACATATCCAACCTCTTTTAAAGTTTCTTCACGAGGAAGTCTATGGAGAAAATCCAAAG 2795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct 2698 TCACATATCCAACCTCTTTTAAAGTTTCTTCACGAGAAAGTATATGGAGAAAATCCAAAG 2757 Query 2796 TTTTGGGAAGCTGGCATCCTTAGACCATTTGAAGCAGAAATGGAGGAGGGTCGTTTGCGT 2855 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2758 TTTTGGGAAGCTGGCATCCTTAGACCATTTGAAGCAGAAATGGAGGAGGGTCGTTTGCGT 2817 Query 2856 TTACTTCAGCTGCTTCAGAGATGCATGATAAGCTCTAGAAAGAAAGATCTGCAGATGATT 2915 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2818 TTACTTCAGCTGCTTCAGAGATGCATGATAAGCTCTAGAAAGAAAGATCTGAAGATGATT 2877 Query 2916 CCTCCGTGTATCAAGAAGGTGACATACCTTAATTTCCTTCCAGGGCATGCAAGAAGCTAC 2975 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2878 CCTCCGTGTATCAAGAAGTTGACATACCTTAATTTCCTTCCAGGTCATGCAAGAAGCTAC 2937 Query 2976 AATGAACTAGTGGAGACAGTTAGGCGTAATATCTTATTAGCTGATTGGAATGATCCGTCT 3035 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2938 AATGAACTAGTGGAGACAGTTAGGCGTAATATCTTATTAGCTGATTGGAATGATCCGTCT 2997 Query 3036 CATGTAGAAAGTCTGCTTAACTCTAAACAGTGGAAATTTCGGAGCATTACCATTAGTAAT 3095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 2998 CATGTAGAAAGTCTGCTTAACTCTAAACAGTGGAAATTTCGAAGCATTACCATCAGTAAT 3057 Query 3096 GTCAGACTATCTTGCTGTGTGGCTGGGCATATAAAAATGACCGACGCTGGTCATGACATT 3155 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || Sbjct 3058 GTCAGACTATCTTGCTGTGTGGCTGGGCATATTAAAATGACTGACGCTGGTCATGATATC 3117 Query 3156 AAAGAGACAATGGATGCTTTACTTGAAAATGATCTGGATCTTTGGACGGAGGAGTACTCT 3215 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| Sbjct 3118 AAAGAGACAATGGATGCTTTACTTGAAAATGGTCTGGATCTTTCGACAGAGGAGTATTCT 3177 Query 3216 TTTATTCAAGATAGCCTTATTGGTGGCTGTAACTGTAAAAGATGTGGGGAATGGTGCCGA 3275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3178 TTTATTCAAGATAGCCTTATTGGTGGCTGTAACTGTAAAAGATGTGGGGAATGGTGCCGA 3237 Query 3276 CTTCCTGTTATCACTCCATGTAGACACCTGTTGTGCCTTGATTGTGTTGCTCTTGATAGC 3335 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3238 CTTCCTGTTATCACTCCATGTAGACACCTGCTGTGCCTTGATTGTGTTGCTCTTGATAGC 3297 Query 3336 GAAAGGTGTACTATTTCTGGTTGTGGATATTTATATGAGATGCAAACTCCTGAAACTTTG 3395 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct 3298 GAAAGGTGTACTATTCCTGGTTGTGGATATTTATATGAGATGCAAAGTCCTGAAACGTTG 3357 Query 3396 GCGCGACCAGAAAATCCAAATCCAAAGTGGCCTGTGCCAAAGGATCTTATTGAGTTACAG 3455 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3358 GCTCGACCAGAAAATCCAAATCCAAAGTGGCCTGTGCCAAAGGATCTTATTGAGTTACAG 3417 Query 3456 CCTTCATATAAGCAGGACGATTGGAATCCTGACTGGCAATCTACGTCCAGCAGTAAAGTC 3515 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3418 CCTTCATATAAACAGGACGACTGGAATCCTGACTGGCAATCTACGTCCAGCAGTAAAGTC 3477 Query 3516 AGTTATCTCGTAGACAGGCTGAGGAAGTTACATGAGGGTAATaaaaaaaGCATTTTGTCT 3575 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3478 AGTTATCTCGTAGACAGGCTGAGGAAGTTACATGAGGGTAATAGAAAAAGCATTTTGTCT 3537 Query 3576 TTCAACAAGACTGACAATGACAACCTGGAAGACAATCCCCCAGGTACCTC-GGAAGCCTT 3634 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| Sbjct 3538 TTCAACAAGACTGACAATGACAACCTGGAAGACAATCCCGCTGGTACCTCAGGAA-CCTT 3596 Query 3635 TTTGGGGAAAGAATTACATGGACAGGATTGTGGATCTCAGATGGTATTTGTTGATAAAGT 3694 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3597 TTTGGGGAAAGAATCCCATGGACAGGATTGTGGATCTCAGATGGTATTTGTTGATAAAGT 3656 Query 3695 ATTGATTTTCTCTCAATTTCTGGAGCATATTCACGTGATTGAACAACAGTTGACAACTGC 3754 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3657 ATTGATTTTCTCTCAATTTCTTGAGCATATTCACGTGATTGAACAACAGTTGACAACTGC 3716 Query 3755 TGGCATCAAGTTTGGTAAAATGTACAGTCCAATGCAGTCGTATAATAAGATGAAAGCTCT 3814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| Sbjct 3717 TGGCATCAAGTTTGGTAAAATGTACAGTCCAATGCATTCATGTAATAAGATGAAATCTCT 3776 Query 3815 GGCAATGTTCCAGAACGATGCTGATTGCATGGCACTTTTGATGGATGGAAGTGGGGCCCT 3874 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3777 GGCAATGTTCCAGAACGATGCTGATTGCATGGCACTTTTGATGGATGGAAGTGCGGCCCT 3836 Query 3875 TGGTCTTGATTTGAGTTTTGTAACACATGTTTTCCTGATGGAACCAATCTGGGATAAAAG 3934 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3837 TGGTCTTGATTTGAGCTTTGTAACACATGTTTTCCTGATGGAACCAATCTGGGATAAAAG 3896 Query 3935 CTTGGAAGAGCAAGTCATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGCGCAAAGCGCCCTATTTTTGT 3994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3897 CTTGGAAGAGCAAGTCATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGCGCAAAGCGCCCTATTTTTGT 3956 Query 3995 AGAAACCTTAACCATGCGTGGCACGATTGAAGAACAAATGATGAGATTCCTAGAGGATGC 4054 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3957 AGAAACCTTAACCATGTGTGGCACGATTGAAGAACAAATGATGAGATTCCTAGAGGATGC 4016 Query 4055 AGAAAAGAGTGATAGATTATTGAGTGGAGATTACATAGAAGCGAAGCAGGAGACAACACG 4114 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 4017 AGAAAAGAGTGATAGATTATTCAGTGGAGATTACATAGAAGTGAAGCAGGAGACAACACG 4076 Query 4115 GAGCCGCCGAACGCTACATGATTTGGTAGAAAGCAATTACCTGTCTCATCTTAGCTTTGT 4174 | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4077 GTGCCGCCGAACGCTACATGATTTGGCAGAAAGCAATTACCTGTCTCGTCTTAGCTTTGT 4136 Query 4175 CCGATCCGATGGCAAAATGGAATTTGCAGCTTCGCAGCTTGCAGGTTTAAAAGATCACCA 4234 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4137 CCGATGCGATGGCAAAATGGAATTTGCAGCTTCGCAGCTTGCAGGTTTAAAAGGTCACCA 4196 Query 4235 ATTAGCTTAAGAAAAGTAGGTTTATTTT-GTAATCACAACAGTTCATTGTTACATAtttt 4293 ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| Sbjct 4197 ATTAGCTTAAGAAAAGTAGGTTTTTTTTTGTAATCACAACAAATAATTGTTACACATTTT 4256 Query 4294 t---tt-GGATATAAACTAGGATAAATATAAAGCCGATCATTTCAAA 4336 | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct 4257 TAAGTTTGGATATAAACTAGGATAAATATAAGGCCGATCATTGCAAA 4303 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 164599003225 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5