BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G55320.1
Length=4626
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg485955 jgi|Araly1|485955|fgenesh2_kg.5__1947__AT3G55320.1 7590 0.0
Ahg482971 jgi|Araly1|482971|fgenesh2_kg.4__2031__AT2G39480.1 4610 0.0
> Ahg485955 jgi|Araly1|485955|fgenesh2_kg.5__1947__AT3G55320.1
Length=4627
Score = 7590 bits (4110), Expect = 0.0
Identities = 4468/4640 (96%), Gaps = 27/4640 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATGATCTCTAGAGGTTTATTCGGATGGTCTCCGCCTCATATGCAACCATTAACTCCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGATGATCTCTAGAGGTTTATTCGGATGGTCTCCGCCTCATATGCAACCACTAACTCCA 60
Query 61 GTCTCTGAAGTCTCCGAGCCACCTGAGTCTCCTTCTCCTTATCTCGACCCTGGTGCTGAG 120
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTCTCTGAAGTCTCCGAGCCTCCTGAGTCTCCTTCTCCTTATCTCGACCCTGGTGCTGAG 120
Query 121 TCTGGTGGTGGCAC-GG-GCACGGCGGCGGCGCTAGCGGAGGCTGATGAAGAGATGGATG 178
|||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCTGGTGGTGGCACAGGTGC-C-GCGGCGGCGCAAGCGGAGGCTGATGAAGAGATGGATG 178
Query 179 ATCAAGATGAGCTTGAACCACCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTCTTCGCTTGCG 238
| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 AGCAAGACGAGGTTGAACCACCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTCTTCGCTTGCG 238
Query 239 CTGACCGCTTTGATTGGGTGCTTATGATTGTTGGCTCTGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTA 298
||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 CTGACCGGTTCGATTGGGGGCTTATGATTGTTGGCTCTGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTA 298
Query 299 CTGCGCTTATTGTCTACTTGCATTACTTCGCCAAGATTGTTGATGTTCTTGCTTTCTCTA 358
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 CTGCGCTTATTGTCTACTTGCATTACTTCGCCAGGATTGTTGATGTTCTTGCTTTCTCTA 358
Query 359 ATGATTCTAGTCAGCAGAGATCTGAACACCAGTTTGACCGACTCGTCCAGCTTTCGTTGA 418
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 359 CTGATTCGAGTCAGCAGAGATCTGAACATCAGTTTGACCGACTCGTTGAGCTTTCGTTGA 418
Query 419 CGATCGTGTACATTGCTGGAGGTGTTTTCATTTCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGA 478
| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CTATTGTGTACATTGCCGGAGGTGTTTTCATTTCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGA 478
Query 479 TACTGACTGGAGAAAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCCAAGTATGTCCAAGTATTATTGA 538
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TACTGACGGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCCAAGTATGTCCAAGTATTATTGA 538
Query 539 ATCAAGATATGAGTTTCTTTGATACATATGGTAATAATGGAGATATTGTGAGCCAAGTGC 598
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 ATCAGGATATGAGTTTCTTTGATACGTATGGTAATAATGGAGATATTGTGAGCCAAGTGC 598
Query 599 TGAGCGATGTCTTACTCATTCAGTCAGCTTTAAGCGAGAAAGTTGGAAATTATATTCATA 658
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TAAGCGATGTCTTACTCATTCAGTCAGCTTTAAGCGAGAAAGTTGGAAATTATATTCATA 658
Query 659 ACATGGCTACGTTTATCAGTGGACTTGTTATTGGATTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCAT 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 ACATGGCTACGTTTATCAGTGGACTTGTTATTGGATTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCAT 718
Query 719 TGATTACACTAGCCACTGGTCCTTTCATCGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATTTTTC 778
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 719 TGATTACACTAGCCACCGGCCCTTTCATCGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATATTTC 778
Query 779 TACACAGACTTGCTGAGAACATACAGGATGCATATGCTGAAGCAGCCGGCATTGCTGAAC 838
| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 779 TTCACAGACTTGCTGAGAACATACAAGACGCATATGCTGAAGCAGCCGGTATTGCTGAAC 838
Query 839 AGGCGATCTCTTACATTAGGACTTTATATGCCTTTACAAATGAAACTCTAGCAAAATATT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AGGCGATCTCTTACATTAGGACTTTATATGCCTTTACAAATGAAACTCTAGCAAAATATT 898
Query 899 CATATGCAACCTCCCTTCAAGCAACCCTGAGATACGGCATATTAATTAGTCTTGTGCAAG 958
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 CATATGCAACTTCCCTTCAAGCAACCTTGAGATACGGCATATTAATTAGTCTTGTGCAAG 958
Query 959 GCCTTGGACTTGGATTTACTTATGGGCTTGCTATATGCTCGTGTGCGCTGCAACTTTGGA 1018
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GCCTTGGACTTGGGTTTACTTATGGGCTTGCTATATGCTCGTGTGCGCTGCAACTTTGGA 1018
Query 1019 TTGGACGATTCTTTGTTCACAATGGAAGGGCAAATGGTGGAGAAATCATAGCAGCTCTTT 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TTGGACGATTCTTTGTTCACAATGGAAGGGCAAATGGTGGAGAAATCATAGCAGCTCTTT 1078
Query 1079 TTGCTGTTATTTTAAGTGGCCTGGGGTTAAATCAAGCTGCTACGAACTTCTACTCTTTTG 1138
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1079 TTGCTGTTATTTTAAGTGGCCTAGGATTAAATCAAGCTGCTACGAACTTCTATTCTTTTG 1138
Query 1139 ATCAAGGAAGGATTGCTGCGTATAGACTTTTTGAGATGATAACTCGTTCATCTTCTGTGG 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 ATCAAGGAAGGATTGCTGCGTATAGACTTTTTGAGATGATAACTCGTTCATCTTCTGTGG 1198
Query 1199 CTAACCAAGAAGGAGCTGTGCTGGCTTCTGTTCAAGGAAATATTGAGTTCCGGAATGTAT 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 CTAACCAAGAAGGAGCTGTGCTGGCTTCTGTTCAGGGAAATATTGAGTTCCGGAATGTAT 1258
Query 1259 ATTTCAGTTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGCGGATTTTACCTCACGGTTC 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTTCAGTTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGCGGATTTTACCTCACGGTTC 1318
Query 1319 CTGCTAAAAAAGCAGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGCATCATTC 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 CTGCTAAAAAAGCAGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGCATCATTC 1378
Query 1379 CTTTAATGGAACGGTTTTATGATCCGACATTAGGAGAAGTTCTTCTTGATGGAGAAAATA 1438
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 CTTTAATGGAACGGTTTTATGATCCAACATTAGGAGAAGTTCTTCTTGATGGAGAAAATA 1438
Query 1439 TTAAAAATCTAAAACTGGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGGTTGGTTACCCAGGAGCCTG 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1439 TTAAAAATCTAAAACTGGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGGCTGGTTACCCAGGAGCCTG 1498
Query 1499 CTCTGCTTAGCTTGAGCATAAGAGAGAATATTGCATATGGTCGTGATGCTACTCTTGATC 1558
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 CTCTGCTAAGCTTGAGCATAAGAGAGAATATTGCGTATGGTCGTGATGCTACTCTTGATC 1558
Query 1559 AGATAGAGGAGGCAGCTAAAAATGCGCATGCGCACACATTTATCAGCTCACTTGAAAAAG 1618
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1559 AGATAGAGGAGGCAGCTAAAATTGCGCATGCACACACATTTATCAGCTCACTTGCAAAAG 1618
Query 1619 GATATGAAACACAGGTCGGGAGAGCCGGTTTAGCAATGACAGAGGAGCAGAAAATTAAAC 1678
|||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 GATATGAAACGCAGGTTGGGAGAGCAGGTTTAGCAATGACAGAGGAGCAGAAAATTAAAC 1678
Query 1679 TTTCGATTGCTAGAGCTGTGCTTTTGAATCCAACAATTCTTCTGCTTGATGAAGTAACTG 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 TTTCGATTGCTAGAGCTGTGCTTTTGAATCCAACAATTCTTCTGCTTGATGAAGTAACTG 1738
Query 1739 GAGGACTAGACTTCGAAGCTGAAAGAATTGTGCAGGAAGCTCTTGATCTTCTGATGTTGG 1798
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 GAGGATTAGACTTCGAAGCTGAAAGAATTGTGCAGGAAGCTCTTGATCTTCTGATGTTGG 1798
Query 1799 GACGGTCAACCATAATAATAGCCCGACGATTAAGTTTGATAAAAAATGCTGACTATATTG 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 GACGGTCAACCATAATAATAGCCCGACGATTAAGTTTGATAAAAAATGCTGACTATATTG 1858
Query 1859 CTGTGATGGAGGAGGGTCAGCTCGTTGAAATGGGTACACACGATGAATTGATAAATCTTG 1918
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 CCGTGATGGAGGAGGGTCAGCTCGTTGAAATGGGTACACACGATGAATTGATAAATCTTG 1918
Query 1919 GTGGGCTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTTCCAAGAAGGATGC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 GTGGGCTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTTCCAAGAAGGATGC 1978
Query 1979 CAGTTAGGAACTACAAGGAGTCTGCGGTGTTTGAGGTCGAGAGAGACTCTTCAGCTGGCT 2038
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 CAGTTAGGAACTACAAGGAGTCTGCGGTGTTTCAGGTCGAGAGAGACTCTTCAGCTGGCT 2038
Query 2039 GTGGCGTCCAAGAACCATCATCACCCAAAATGATTAAGTCTCCATCTCTTCAAAGAGGTA 2098
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GTGGCGTCCAAGAACCATCATCACCCAAAATGATCAAGTCTCCATCTCTTCAAAGAGGTA 2098
Query 2099 GTGGTGTGTTCCGTCCCCAGGAACTGTGTTTTGATACTGAAGAATCACCTAAAGCTCATA 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2099 ATGGTGTGTTCCGTCCCCAGGAACTGTGTTTTGATACTGAAGAATCACCTAAAGATCATA 2158
Query 2159 GCCCTGCATCTGAGAAAACAGGGGAAGATGGCATGTCTCTGGATTG-TGCTGATAAAGAG 2217
|||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2159 GCCCTGCACCTGAGAAAATGGGGGAAAATGGCTTGCCTCTGGAC-GATGCTGATAAAGAG 2217
Query 2218 CCAACTATCAAAAGGCAAGATAGTTTCGAGATGAGGTTGCCACACCTTCCTAAAGTTGAC 2277
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||
Sbjct 2218 CCAACTATCAAAAGGCAAGATAGTTTCGAGATGAGGTTACCAGACCTTCCGAAAATTGAC 2277
Query 2278 GTTCAGTGTCCCCAACAAAAATCAAACGGCTCAGAGCCAGAGTCCCCTGTTTCACCCCTT 2337
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 GTTCAGTGTCCCCGACAAAAATCAAACGGCTCAGAGCCAGAGTCCCCTGTTTCACCCCTT 2337
Query 2338 TTGACATCAGATCCTAAAAACGAGCGTTCCCATTCGCAGACGTTTAGTCGTCCTCTTAGT 2397
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2338 TTGACATCAGATCCTAAAAACGAGCGTTCCCATTCGCAGACGTTTATTCGTCCTCTTAGT 2397
Query 2398 TCTCCTGATGACACTAAAGCAAATGGTAAGGCGTCTAAGGATGCTCAACACAAGGAGTCA 2457
||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 TCTCCAGATGACACTACTGCAAATGGTAAGGCGTCTAAGGATGCTCAACACAAGGAGTCA 2457
Query 2458 CCTTCGTTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTCCCAGAGTGGCTTTATGCTGTATTAGGG 2517
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 CCTTCATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTCCCAGAGTGGCTTTATGCTGTATTAGGA 2517
Query 2518 AGTCTTGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTTCTGGCTTATGTCATTGCGTTG 2577
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2518 AGTCTCGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTTCTGGCTTATGTCATTGCGTTG 2577
Query 2578 GTAGTTACGGAATATTATAAAAGCAAAGGAGGCCACCTGCGCGAGGAGGTTGACAAATGG 2637
||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 GTAGTGACGGCATATTATAAAAGCAAAGGAGTCCACCTGCGCGAGGAGGTTGACAAATGG 2637
Query 2638 TGTTTGATCATTGCCTGCATGGGGATTGTGACAGTTGTTGCCAATTTCTTGCAGCATTTC 2697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2638 TGTTTGATCATTGCCTGCATGGGGATTGTGACAGTTGTTGCCAATTTCTTGCAGCACTTC 2697
Query 2698 TATTTTGGCATAATGGGAGAGAAAATGACGGAGAGAGTTAGGAGGATGATGTTCTCAGCA 2757
|||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2698 TATTTTGGGATAATGGGGGAGAAAATGACAGAGAGAGTTCGGAGGATGATGTTCTCAGCA 2757
Query 2758 ATGCTGCGTAACGAAGTTGGATGGTTCGATGATGAAGAGAACAGTCCAGATACATTATCC 2817
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 ATGCTGCGTAATGAAGTTGGATGGTTCGATGATGAAGAGAACAGTCCAGATACATTATCC 2817
Query 2818 ATGCGTTTAGCAAATGATGCTACTTTTGTCCGAGCTGCCTTCAGCAACAGGCTTTCAATA 2877
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2818 ATGCGTTTAGCAAATGATGCTACTTTTGTCCGAGCTGCGTTCAGCAACAGGCTTTCAATA 2877
Query 2878 TTTATTCAAGATAGTTTTGCTGTTATTGTTGCTCTTCTGATTGGGTTG-CTGCTTGGTTG 2936
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||
Sbjct 2878 TTTATTCAAGATAGTTTTGCTGTTATAGTTGCTCTTCTTATCGGGTTGGC-GCTTGGTTG 2936
Query 2937 GCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCAACTCTGCCAATTCTCACTCTTTCTGCCATTGCTCA 2996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2937 GCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCAACTCTGCCAATTCTCACTCTTTCTGCCATTGCTCA 2996
Query 2997 GAAACTGTGGCTTGCCGGATTCTCAAAAGGCATACAGGAGATGCACAGAAAAGCATCTTT 3056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2997 GAAACTGTGGCTTGCCGGATTCTCAAAAGGCATACAGGAGATGCATAGAAAGGCATCTTT 3056
Query 3057 AGTTCTCGAGGATGCTGTTAGAAACATCTACACTGTTGTTGCTTTCTGTGCTGGTAACAA 3116
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3057 AGTCCTCGAGGATGCTGTTAGAAACATCTACACTGTTGTTGCTTTCTGTGCTGGTAACAA 3116
Query 3117 AGTGATGGAACTGTACAGGATGCAACTCCAGCGGATACTCAGACAGAGCTATCTCCATGG 3176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3117 AGTGATGGAACTGTACAGGATGCAACTCCAGCGGATACTCAGACAGAGCTATCTCCATGG 3176
Query 3177 GATGGCTATTGGTTTTGCGTTTGGTTTTTCACAGTTTCTTCTTTTCGCCTGCAACGCGCT 3236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3177 GATGGCTATTGGTTTTGCGTTTGGTTTTTCACAGTTTCTTCTTTTCGCCTGCAATGCGCT 3236
Query 3237 CCTCCTATGGTGCACTGCGTTATCTGTTAACCGTGGATATATGAAATTATCGACAGCTAT 3296
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3237 CCTCCTATGGTGCACTGCGTTATCTGTCAACCGTGGATATATGAAGTTATCAACAGCTAT 3296
Query 3297 AACGGAGTACATGGTTTTCTCATTTGCTACATTCGCCCTTGTGGAGCCATTTGGATTAGC 3356
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3297 AACAGAGTACATGGTTTTCTCATTTGCTACATTCGCCCTTGTCGAGCCATTTGGATTAGC 3356
Query 3357 ACCGTATATCCTCAAGCGACGTAAGTCTCTGATATCAGTGTTTGAAAT-AGTCGATCGAG 3415
||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 3357 ACCGTATATTCTCAAGCGACGCAAGTCTCTGATTTCAGTGTTTGAAATCA-TAGATCGAG 3415
Query 3416 TCCCTACGATTGAACCAGATGATAACTCTGCTCTCAAACCTCCTAATGTCTACGGAAGTA 3475
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3416 TCCCTACAATTGAACCAGATGATAACTCTGCTCTCAAACCGCCTAATGTCTACGGAAGCA 3475
Query 3476 TTGAATTGAAAAACGTAGACTTCTGCTACCCAACTCGACCCGA-GATACTAGTGCTGAGC 3534
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3476 TTGAATTGAAAAACATAGACTTCTGCTACCCAACTCGACCCGAAG-TACTAGTGCTGAGC 3534
Query 3535 AACTTTAGTCTCAAAATCAGTGGCGGACAGACTGTAGCTGTTGTTGGCGTTTCAGGTTCT 3594
||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3535 AACTTCAGTCTCAAAGTCAGTGGCGGACAGACAGTAGCTGTGGTTGGCGTTTCAGGTTCT 3594
Query 3595 GGAAAGAGCACGATAATCTCACTAGTAGAGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGCCAAGTC 3654
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3595 GGAAAAAGCACAATAATCTCACTGGTAGAGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGTCAAGTC 3654
Query 3655 CTACTAGATGGGAGAGACTTAAAGTTATATAACTTGAGATGGTTGAGAAGCCACATGGGT 3714
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3655 CTACTAGATGGGAGAGACTTAAAGTTATATAATTTGAGATGGTTGAGAAGCCACATGGGT 3714
Query 3715 TTGGTTCAGCAAGAACCCATAATCTTTTCCACAACAATCAGAGAGAATATCATATATGCA 3774
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 TTGGTTCAGCAAGAACCCATAATCTTTTCCACGACGATCAGAGAGAATATCATATATGCA 3774
Query 3775 AGGCATAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAAGCAGCAAGAATTGCAAATGCTCACCAT 3834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3775 AGGCATAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAAGCAGCAAGAATTGCTAATGCTCACCAT 3834
Query 3835 TTCATCAGCAGCTTACCTCACGGTTACGACACACATATTGGGATGAGAGGCGTAGAACTT 3894
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3835 TTCATCAGCAGCTTACCTCACGGTTATGACACACATATCGGGATGAGAGGGGTAGAACTT 3894
Query 3895 ACCCCTGGACAGAAACAGAGAATAGCAATAGCACGCGTAGTACTGAAGAATGCTCCCATC 3954
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3895 ACCCCGGGACAGAAACAGAGAATAGCAATAGCACGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCCATT 3954
Query 3955 ATCTTAATAGATGAAGCCAGCTCGTCTATCGAATCTGAATCGAGTCGGGTTGTGCAGGAG 4014
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3955 ATCTTAATAGATGAAGCCAGCTCGGCTATCGAATCTGAATCGAGTCGGGTTGTGCAGGAG 4014
Query 4015 GCTCTTGATACATTGATAATGGGGAACAAAACAACAATTCTGATAGCACATAGAGCGGCT 4074
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4015 GCTCTTGACACATTGATAATGGGGAACAAAACAACAATTCTGATAGCGCATAGAGCGGCT 4074
Query 4075 ATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGGTACTTAATGGAGGGAGGATAGTAGAGGAAGGT 4134
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4075 ATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGGTGCTCAATGGAGGGAGGATAGTAGAGGAAGGT 4134
Query 4135 ACACATGATTCTTTAGCAGCAAAAAATGGGTTGTATGTACGTTTGATGCAACCACACTTT 4194
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4135 ACACATGATTCTTTAGCAGCAAAGAATGGATTGTATGTACGTTTGATGCAACCACATTTT 4194
Query 4195 GGTAAAGGTCTACGCCAACATCGACTGATATAGAGTTTTGAGGCTCCATCAATGATAATG 4254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 4195 GGTAAAGGTCTACGCCAACATCGACTGATATAGAGTTTTGAGGCTCCATAAATGATCGTG 4254
Query 4255 ATTTTGGCATCTCTGATCAATGATTCTC------CGG-AGG-ATTACAAGATGTTCaaaa 4306
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||
Sbjct 4255 ATTTTGGCATCTCTGATCAATGATTCTCGGGAGTCGGGAGGGAT-ACACGATGTTCAAAA 4313
Query 4307 aaaaCCCTATACAACCACGGGTAGTTCTCTAGCAGATAGGGCCTGTAGATGTAGATTTCC 4366
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4314 AAAAC--TATACAACCACGGTTAGTTCTCTAGCAGATAGGGCCTGTAGATGTAGATTTCC 4371
Query 4367 ATAGTCTTCGAGCTGCTTATTCtttttttGGAGACGAAGCATCAGAAGTAGGTCATGGTC 4426
|| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4372 ATGGTCTTCGAGCTGCTTATTCTTTTTT-GGAAACGAAGCATCAGAAGTAGGTCATGGTC 4430
Query 4427 ATTGCTTCGTTCTCCAAAGTATATCGATTTTGTCTATTGAATCTGAATATTTTAGGAGGT 4486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4431 ATTGCTTCGTTCTCCAAAGTATATCGATTTTGTCTATTGAATCTGAAGATTTTAGGAGGT 4490
Query 4487 TGGTAAATCATTTTGGAGGCTGTTTATTTGCCTTTCCTTTATATGTGTCTGTGCTGGTTT 4546
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 4491 TGGTAAATCATTTTGGAGGCTGTTTATTTATCTTTCCTTTAT-T-TGTCTGTGCTGGTTT 4548
Query 4547 GTTCTTGCAAAAACATGGATGATGTATGTAAAGCTTAAGAAAATAGTTGAGAATGTGTAA 4606
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||
Sbjct 4549 GTTGTTGCAAAAACATGGATGATGTATGTAAAGCTTTA-AAAATTGTAGAGAATGTGTAA 4607
Query 4607 ATGTATTCATTTATCATTGC 4626
||||||||| |||| |||||
Sbjct 4608 ATGTATTCACTTATTATTGC 4627
> Ahg482971 jgi|Araly1|482971|fgenesh2_kg.4__2031__AT2G39480.1
Length=4861
Score = 4610 bits (2496), Expect = 0.0
Identities = 3688/4263 (87%), Gaps = 83/4263 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATGATCTCTAGAGGTTTATTCGGATGGTCTCCGCCTCATATGCAACCATTAACTCCA 60
|||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 180 ATGATGATTTCCAGAGGTTTGTTTGGTTGGTCTCCGCCGCATATACAACCGTTAACTCCG 239
Query 61 GTCTCTGAAGTCTCCGAGCCACCTGAGTCTCCTTCTCCTTATCTCGACCCTGGTGCTGAG 120
|| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 240 GTTTCTGAAGTTTCCGAGCCTCCTGAGTCACCTTCTCCTTACCTTGATCCTGGTGCTGAG 299
Query 121 -TCTGGTGGTGGCACGGGCACGGCGGCGGCGCTAGCGGAGGCTGATGAAGAGATGGATGA 179
| |||||| |||| | ||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||
Sbjct 300 AAC-GGTGGT---TCGGG-A--ACGGCGGCGCAAGCGGATGATGAGGAAGATATGGAGGA 352
Query 180 TCAAGATGAGCTTGAACCACCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTCTTCGCTTGCGC 239
| || ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 353 GCCGGAGGAGATGGAGCCTCCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTATTTGCTTGTGC 412
Query 240 TGACCGCTTTGATTGGGTGCTTATGATTGTTGGCTCTGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTAC 299
||| || |||||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 413 TGATCGGTTTGATTGGGTGCTTATGGTTTTTGGATCCGTAGCTGCTGCTGCTCATGGCAC 472
Query 300 TGCGCTTATTGTCTACTTGCATTACTTCGCCAAGATTGTTGATGTTCTTGC-TTTCTCTA 358
|||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||
Sbjct 473 TGCGCTTATTATCTACTTGCACTACTTCGCCAAAATTGTTCAGGTTCTTGCATTTC-CTA 531
Query 359 ATGATTCTAG-TCAGCAGAGAT-CTGAACACCAGTTTGACCGACTCGTCCAGCTTTCGTT 416
||| || | ||| | || | ||| | ||||| | || |||||| ||||||||||
Sbjct 532 GTGAATC-GGATCACCTGA-TTAGTGATGATCAGTTCAATCGTCTCGTCGAGCTTTCGTT 589
Query 417 GACGATCGTGTACATTGCTGGAGGTGTTTTCATTTCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTG 476
||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 GACCATTGTATACATTGCTGGAGGTGTTTTTGTATCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTG 649
Query 477 GATACTGACTGGAGAAAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCCAAGTATGTCCAAGTATTATT 536
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |
Sbjct 650 GATACTGACTGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCAAAGTACGTCCAAGTACTACT 709
Query 537 GAATCAAGATATGAGTTTCTTTGATACATATGGTAATAATGGAGATATTGTGAGCCAAGT 596
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||
Sbjct 710 AAATCAGGATATGAGTTTCTTTGATACATATGGGAATAACGGGGATATAGTAAGCCAAGT 769
Query 597 GCTGAGCGATGTCTTACTCATTCAGTCAGCTTTAAGCGAGAAAGTTGGAAATTATATTCA 656
|||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||
Sbjct 770 GCTGAGTGATGTCCTACTTATTCAGTCGGCTCTAAGCGAAAAAGTTGGGAATTACATTCA 829
Query 657 TAACATGGCTACGTTTATCAGTGGACTTGTTATTGGATTTGTCAACTGCTGGGAAATTGC 716
||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 TAACATGGCAACATTTATCAGTGGTCTTGTTATCGGTTTTGTCAACTGCTGGGAAATTGC 889
Query 717 ATTGATTACACTAGCCACTGGTCCTTTCATCGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATTTT 776
| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 890 GCTCATTACGTTAGCCACCGGTCCTTTCATTGTTGCTGCAGGAGGCATATCAAATATATT 949
Query 777 TCTACACAGACTTGCTGAGAACATACAGGATGCATATGCTGAAGCAGCCGGCATTGCTGA 836
||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 TCTCCACAGACTTGCTGAGAATATTCAAGATGCATATGCTGAAGCAGCCGGCATTGCTGA 1009
Query 837 ACAGGCGA-TCTCTTACATTAGGACTTTATATGCCTTTACAAATGAAACTCTAGCAAAAT 895
|||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1010 ACAGGC-AGTCTCTTACGTTAGGACTTTGTATGCCTTTACAAATGAAACTCTTGCAAAAT 1068
Query 896 ATTCATATGCAACCTCCCTTCAAGCAACCCTGAGATACGGCATATTAATTAGTCTTGTGC 955
| || |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct 1069 ACTCTTATGCAACTTCTCTCCAAGCAACTCTGAGATATGGTATATTGATTAGTCTTGTGC 1128
Query 956 AAGGCCTTGGACTTGGATTTACTTATGGGCTTGCTATATGCTCGTGTGCGCTGCAACTTT 1015
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 1129 AAGGACTTGGACTTGGATTTACTTACGGGCTTGCTATATGTTCATGTGCTCTGCAACTTT 1188
Query 1016 GGATTGGACGATTCTTTGTTCA--CAATGGA-AGGGCAAATGGTGGAGAAATCAT-AGCA 1071
||||||| || ||||||||| | | || | || |||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1189 GGATTGGTCGGTTCTTTGTT-ATTC-AT-CATAGAGCAAATGGTGGAGAAATCATCA-CA 1244
Query 1072 GCTCTTTTTGCTGTTATTTTAAGTGGCCTGGGGTTAAATCAAGCTGCTACGAACTTCTAC 1131
|| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 1245 GCCCTTTTTGCTGTTATTTTAAGTGGGCTGGGTTTAAATCAAGCGGCTACAAACTTTTAT 1304
Query 1132 TCTTTTGATCAAGGAAGGATTGCTGCGTATAGACTTTTTGAGATGATAA-CTCGTTCATC 1190
|| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1305 TCATTTGATCAAGGAAGAATTGCAGCGTATAGGCTTTTTGAGATGATAAGC-CGTTCATC 1363
Query 1191 TTCTGTGG-CTAACCAAGAAGGAGCTGTGCTGGCTTCTGTTCAAGGAAATATTGAGTTCC 1249
|||| || |||| ||||| ||| || | || || |||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1364 CTCTG-GGACTAATCAAGAGGGAACTATTTTGTCTGCTGTTCTAGGAAATATTGAGTTTC 1422
Query 1250 GGAATGTATATTTCAGTTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGCGGATTTTACC 1309
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1423 GGAATGTATATTTCAGCTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGTGGATTTTACC 1482
Query 1310 TCACGGTTCCTGCTAAAAAAGCAGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCA 1369
|||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 TCACTGTGCCGGCTAAAAAAGCTGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCA 1542
Query 1370 GCATCATTCCTTTAATGGAACGGTTTTATGATCCGACATTAGGAGAAGTTCTTCTTGATG 1429
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1543 GCATCATTCCTCTAATGGAACGGTTTTATGATCCTACACTAGGAGAAGTTCTACTTGATG 1602
Query 1430 GAGAAAATATTAAAAATCTAAAACTGGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGGTTGGTTACCC 1489
| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || |
Sbjct 1603 GGGAAAATATTAAAAATCTAAAGTTAGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGCCTGGTGACAC 1662
Query 1490 AGGAGCCTGCTCTGCTTAG-CTTGAGCATAAGAGAGAATATTGCATATGGTCGTGATGCT 1548
||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1663 AGGAGCCTGCTTTGCTTAGTCTT-AGCATAAGAGAGAATATTGCATATGGCCGAGATGCT 1721
Query 1549 ACTCTTGATCAGATAGAGGAGGCAGCTAAAAATGCGCATGCGCACACATTTATCAGCTCA 1608
||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1722 ACTCTGGATCAGATAGAGGAAGCAGCTAAAAAAGCACATGCACACACATTTATCAGCTCA 1781
Query 1609 CTTGAAAAAGGATATGAAACACAGGTCGGG-AGAGCCGGTTTAGCAATGACAGAGGAGCA 1667
|||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||
Sbjct 1782 CTTGAAAAAGGATATGAAACTCAGGTTGGGAAGA-CTGGTTTAACGTTGACAGAGGAGCA 1840
Query 1668 GAAAATTAAACTTTCGATTGCTAGAGCTGTGCT-TTTGAATCCAACAATTCTTCTGCTTG 1726
|||||| ||||| |||||||||||||| || || || | |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1841 GAAAATAAAACTATCGATTGCTAGAGCCGTACTCTTAG-ATCCAACAATTCTTTTGCTTG 1899
Query 1727 ATGAAGTAACTGGAGGACTAGACTTCGAAGCTGAAAGAATTGTGCAGGAAGCTCTTGATC 1786
| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||
Sbjct 1900 ACGAGGTCACTGGAGGACTAGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCCAAGAAGCTCTTGATC 1959
Query 1787 TTCTGATGTTGGGACGGTCAACCATAATAATAGCCCGACGATTAAGTTTGATAAAAAATG 1846
|||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||
Sbjct 1960 TTCTAATGTTAGGAAGGTCGACCATAATAATAGCCCGACGACTAAGTCTGATAAGAAATG 2019
Query 1847 CTGACTATATTGCTGTGATGGAGGAGGGTCAGCT-CGTTGAAATGGGTACACACGATGAA 1905
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2020 CTGACTATATTGCTGTAATGGAGGAGGGTCAGCTAC-TTGAAATGGGTACGCATGATGAA 2078
Query 1906 TTGATAAATCTTGGTGGGCTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTT 1965
|| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 TTAATCAACCTTGGTAATTTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTA 2138
Query 1966 CCAAGAAGGATGCCAGTTAGGAACTACAAGGAGTCTGCGGTGTTTGAGGTCGAGAGAGAC 2025
|| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||| ||||| ||
Sbjct 2139 CCCAGACGGATGCCAGTTAGGAACTACAATGATTCTGCTGCGTTTCAGGTTGAGAGGGAT 2198
Query 2026 TCTTCAGCTGGCTGTGGCGTCCAAGAACCATCATCACCCAAAATGATTAAGTCTCCATCT 2085
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2199 TCTTCAGCTGGCCGTGGCTTCCAAGAACCATCATCGCCCAAAATGGCCAAGTCTCCATCT 2258
Query 2086 CTTCAAAGAGGT-AGTGGTGTGTTCCGTC-CCCAGGAACTGTGTTTTGATACTGAAGAAT 2143
||||| |||||| | | ||| || || | |||||||| |||| ||| ||| ||||||||
Sbjct 2259 CTTCAGAGAGGTCA-TAATGTTTTTCG-CTCCCAGGAAGTGTGCTTTAATAGTGAAGAAT 2316
Query 2144 CACCTAAAGCTCATAGCCCTGCATCTGAGAAAACAGGG-GAAGATGGCAT-GTC-TCTGG 2200
| || || | ||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| | ||| | |||
Sbjct 2317 CGCCCAATGATCATAGCCCTGCACCAGAGAAAA-TGGGAGAAAATGGC-TCGTCGT-TGG 2373
Query 2201 ATTG-TGCTGATAAAGAGCCAA-CTATCAAAAGGCAAGATAGTTTCGAGATGAGGTTGCC 2258
| || || |||||| || |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 2374 A-TGTTGGTGATAAGGAACCAAGC-ATCAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGCGGTTACC 2431
Query 2259 ACACCTTCCTAAAGTTGACGTTCAGTGTCCCCAA---CAAAAATCAAACGGCTCAGAGCC 2315
| | || || ||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||| ||
Sbjct 2432 AGAGCTACCAAAAATTGACATTCAGTGTCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCC 2491
Query 2316 AGAGTCCCCTGTTTCACCCCTTTTGACATCAGATCCTAAAAACGAGCGTTCCCATTCGCA 2375
||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||
Sbjct 2492 GGAGTCCCCTATATCACCCCTTTTGATATCCGATCCCCAAAATGAGCGCTCCCATTCACA 2551
Query 2376 GACGTTTAGTCGTCCTCTTAGTTCTC-CTGATGACACTAAAGCAAATGGTAAGGCGTCTA 2434
||| ||||| || |||||| | || | | ||||||||| |||||||| ||||| | | |
Sbjct 2552 GACTTTTAGCCGCCCTCTT-GGTCACTCAGATGACACTTCAGCAAATGTTAAGGTGGCCA 2610
Query 2435 AGGATGCTCAACACAAGGAGTCACCTTCGTTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTCCCAG 2494
|||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2611 AGGACGGTCAACACAAGGAGCCACCTTCATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTTCCAG 2670
Query 2495 AGTGGCTTTATGCTGTATTAGGGAGTCTTGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTC 2554
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 AGTGGCTATATGCTGTATTAGGGAGTATTGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTC 2730
Query 2555 TTCTGGCTTATGTCATTGCGTTGGTAGTTACGGA-ATATTATAAAAGCAAAGGAGGCCAC 2613
|||| |||||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| |||| ||| |||||
Sbjct 2731 TTCTAGCTTATGTTATTGCATTAGTAGTGAC-AACATACTATAAGAGCACGGGAAGCCAC 2789
Query 2614 CTGCGCGAGGAGGTTGACAAATGGTGTTTGATCATTGCCTGCATGGGGATTGTGACAGTT 2673
||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2790 CTGCGTGAGGAGGTTGACAAGTGGTGCTTGATCATTGCCTGCATGGGAATAGTGACAGTT 2849
Query 2674 GTTGCCAATTTCTTGCAGCATTTCTATTTTGGCATAATGGGAGAGAAAATGACGGAGAGA 2733
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2850 GTTGCCAATTTCTTGCAGCATTTCTACTTTGGTATTATGGGGGAGAAAATGACTGAGAGA 2909
Query 2734 GTTAGGAGGATGATGTTCTCAGCAATGCTGCGTAACGAAGTTGGATGGT-TCGATGATGA 2792
|| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || ||
Sbjct 2910 GTGCGGCGAATGATGTTCTCAGCAATGCTGCGTAATGAAGTTGGATGGTAT-GACGAAGA 2968
Query 2793 AGAGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCGTTTAGCAAATGATGCTACTTTTGTCCGAGC 2852
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2969 AGAGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCGCCTAGCAAATGATGCCACTTTTGTCCGAGC 3028
Query 2853 TGCCTTCAGCAACAGGCTTTCAATATTTATTCAAGATAGTTTTGCTGTTATTGTTGCTC- 2911
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3029 CGCCTTCAGCAACAGGCTTTCGATATTTATTCAGGATAGTTTTGCTGTTATTGTTGC-CA 3087
Query 2912 TTCTGATTGGGTTGCTGCTTGGTTGGCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCAACTCTGCCAA 2971
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 3088 TTCTTATTGGGTTGCTGCTCGGTTGGCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCGACTTTGCCAG 3147
Query 2972 TTCTCACTCTTTCTGCCATTGCTCAGAAACTGTGGCTTGCCGGATTCTCAAAAGGCATAC 3031
| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |
Sbjct 3148 TACTTACTCTTTCTGCCATTGCCCAGAAACTTTGGCTTGCTGGATTCTCAAAGGGCATCC 3207
Query 3032 AGGAGATGCA-CAGAAAAGCATCTTTAGTTCTCGAGGATGCTGTTAGAAACATCTACACT 3090
|||||||||| | |||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 3208 AGGAGATGCATC-GAAAGGCGTCTCTAGTACTCGAGGATGCTGTCAGAAACATATATACT 3266
Query 3091 GTTGTTGCTTTCTGTGCTGGTAACAAAG-TGATGGAACTGTACAGGA-TGCAACTCCAGC 3148
||||| || |||||||| || ||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||| |
Sbjct 3267 GTTGTCGCGTTCTGTGCCGGCAAC-AAGATGATGGAACTCTACA-GACTGCAACTCCAAC 3324
Query 3149 GGATACTCAGACAGAGCTATCTCCATGGGATGGCTATTGGTTTTGCGTTTGGTTTTTCAC 3208
|||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||
Sbjct 3325 GGATACTCAGACAGAGCTTTTTCCACGGGATGGCTATTGGCTTTGCGTTTGGCTTCTCAC 3384
Query 3209 AGTTTCTTCTTTTCGCCTGCAACGCGCTCCTCCTATGGTGCACTGCGTTATCTGTTA-AC 3267
|||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||| | || ||
Sbjct 3385 AGTTTCTTCTCTTCGCCTGTAATGCGCTCCTCCTGTGGTACACCGCGTTATCAG-TAGAC 3443
Query 3268 CGTGGATATATGAAATTATCGACAGCTATAACGGAGTACATGGTTTTCTCATTTGCTACA 3327
|| ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 3444 CGCAGATATATGAAATTGTCTACAGCTCTGACCGAGTACATGGTCTTCTCCTTTGCTACA 3503
Query 3328 TTCGCCCTTGTGGAGCCATTTGGATTAGCACCGTATATCCTCAAGCGACGTAAG-TCTCT 3386
|| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| || |||||
Sbjct 3504 TTTGCTCTTGTGGAGCCATTCGGATTAGCACCTTACATTCTCAAGCGCCGT-AGATCTCT 3562
Query 3387 -GATATCAGTGTTTGAAATAGTCGATCGAGTCCCTACGATTGAACCAGATGATAACTCTG 3445
| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |
Sbjct 3563 CGCT-TCAGTTTTTGAAATAATAGATCGAGTTCCTACAATCGAACCTGATGATACCTCGG 3621
Query 3446 CTCTCAAACCTCCTAATGTCTACGGAAGTATTGAATTGAAAAACGTAGACTTCTGCTACC 3505
|||| | || |||||||| || ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||
Sbjct 3622 CTCTTAGTCCGCCTAATGTGTATGGAAGCATTGAACTGAAAAACATCGACTTCTGCTACC 3681
Query 3506 CAACTCGACCC-G-AGATACTAGTGCTGAGCAACTTTAGTCTCAAAATCAGTGGCGGACA 3563
|||| || ||| | || | |||| || |||||||| ||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3682 CAACCCG-CCCGGAAG-TGTTAGTACTAAGCAACTTCAGTCTCAAAGTCAATGGCGGACA 3739
Query 3564 GACTGTAGCTGTTGTTGGCGTTTCAGGTTCTGGAAAGAGCACGATAATCTCACTAG-TAG 3622
|| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | | | |
Sbjct 3740 AACAGTAGCTGTGGTTGGTGTTTCTGGTTCTGGAAAGAGCACAATAATATC-GTTGATCG 3798
Query 3623 AGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGCCAAGTCCTACTAGATGGGAGAGACTTAAAGTTAT 3682
||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||| | || |
Sbjct 3799 AGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGTCAGGTCTTATTAGATGGGCGAGACTTGACGTCGT 3858
Query 3683 ATAACTTGAGATGGTTGAGAAGCCACATGGGTTTGGTTCAGCAAGAACCCATAATCTTTT 3742
|||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3859 ATAATTTGAGATGGTTAAGAAGCCATATGGGTCTGATTCAACAGGAACCCATAATCTTTT 3918
Query 3743 CCACAACAATCAGAGAGAATATCATATATGCAAGGCATAATGCAAGTGAAGCTGAGATGA 3802
|||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3919 CCACGACGATCAGAGAAAACATTATATATGCAAGGCACAATGCAAGTGAGGCTGAGATGA 3978
Query 3803 AGGAAGCAGCAAGAATTGCAAATGCTCACCATTTCATCAGCAGCTTACCTCACGGTTACG 3862
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3979 AGGAAGCAGCAAGAATTGCAAATGCCCACCATTTCATCAGCAGCTTACCTCACGGATACG 4038
Query 3863 ACACACATATTGGGATGAGAGGCGTAGAACTTACCCCTGGACAGAAACAGAGAATAGCAA 3922
|||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |
Sbjct 4039 ACACGCATATCGGGATGAGAGGCGTTGAACTTACCCAAGGACAAAAACAGAGAATCGCTA 4098
Query 3923 TAGCACGCGTAGTACTGAAGAATGCTCCCATCA-TCTTAATAGATGAAGCCAGCTCGTCT 3981
|||| || ||||| |||||||||||||| || | | || || || ||||| || || ||
Sbjct 4099 TAGCTCGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCAAT-ACTGTTGATTGACGAAGCGAGTTCATCA 4157
Query 3982 ATCGAATCTGAATCGAGTCGGGTTGTGCAGGAGGCTCTTGATACATTGATAATGGGGAAC 4041
|||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4158 ATCGAATCCGAGTCGAGCCGTGTTGTGCAGGAAGCTCTTGATACATTGATAATGGGGAAC 4217
Query 4042 AAAACAACAATTCTGATAGCACATAGAGCGGCTATGATGAGACATGTGGATAACATTGTG 4101
|||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4218 AAAACAACAATTCTGATAGCGCATAGAGTAGCGATGATGAGACATGTGGATAACATCGTG 4277
Query 4102 GTACTTAATGGAGGGAGGATAGTAGAGGAAGGTACACATGATTCTTTAGCAGCAAAAAAT 4161
|| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 4278 GTTCTCAATGGAGGCAAAATAGTAGAGGAAGGTACACATGATTCTTTAGCGGGTAAAAAC 4337
Query 4162 GGGTTGTATGTACGTTTGATGCAACCACACTTTGGTAA-AGGTCTACGCCAACATCGACT 4220
|| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| | ||||| |||
Sbjct 4338 GGATTGTATGTCCGTTTAATGCAACCACATTTTGGCAAGAA-TCTACGGCGACATCAACT 4396
Query 4221 GAT 4223
|||
Sbjct 4397 GAT 4399
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 175026778227
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5