BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G55410.1
Length=3494
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg485968 jgi|Araly1|485968|fgenesh2_kg.5__1960__AT3G55410.1 5722 0.0
Ahg940181 jgi|Araly1|940181|scaffold_600725.1 243 9e-63
> Ahg485968 jgi|Araly1|485968|fgenesh2_kg.5__1960__AT3G55410.1
Length=3404
Score = 5722 bits (3098), Expect = 0.0
Identities = 3308/3410 (97%), Gaps = 12/3410 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 55 AGTGTAGAACGACGATTGTTGAATGCGTTATTGTAATTGTTAAGAATTGAAGTTAAAGTG 114
|||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1 AGTGGAGAAAGACGATTGTTGAATGCGTTATTGTAATTGTTAAGTATTGAAGTTAAAGCA 60
Query 115 TTGTTTTTGAATCTGGTGAAATGGTGTGGTTTCGTGCTGGTTCCAGTGTTACAAAGCTAG 174
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGTTTTTGAATCTGGTGAAATGGTGTGGTTTCGAGCTGGTTCGAGTGTTACAAAGCTAG 120
Query 175 CTGTTAGAAGGATTTTGAATCAGGGTGCTTCGTATGCGACGAGGACACGGTCTATTCCGT 234
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 121 CTGTTAGAAGGATTTTGAATCAGGGTGGTTCGTATGCGACGAGGACACGGTCTCTTCCGT 180
Query 235 CTCAAACTCGTTCCTTTCACTCGACTATATGCAGACCAAAGGCTCAGAGTGCTCCAGTTC 294
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 181 CTCAAACTCGTTCCTTTCACTCGACTATTTACAGACCAAAGGCTCAGAGTGCTCCTGTTC 240
Query 295 CTAGAGCTGTTCCTCTTTCTAAGCTAACTGATAGTTTCTTAGATGGGACGAGCAGTGTCT 354
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 241 CTAGAGCTGTACCTCTTTCTAAGCTAACTGATAGTTTCTTAGATGGGACGAGCAGTGTTT 300
Query 355 ACCTTGAGGAGTTACAAAGGGCTTGGGAAGCTGATCCTAACAGTGTAGATGAGTCTTGGG 414
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCTTGAGGAGTTACAAAGGGCTTGGGAAGCTGATCCTAACAGTGTAGATGAGTCTTGGG 360
Query 415 ATAATTTCTTTAGGAACTTTGTTGGTCAGGCTGCCACGTCTCCTGGCATCTCTGGGCAGA 474
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 361 ATAATTTCTTTAGGAACTTTGTCGGTCAGGCTGCCACGTCTCCTGGCATTTCTGGGCAGA 420
Query 475 CAATTCAGGAGAGTATGAGGCTGTTGTTACTTGTTAGGGCTTATCAGGTGAATGGTCACA 534
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAATTCAGGAGAGTATGAGGCTGTTGCTACTTGTCAGGGCTTATCAGGTGAATGGTCACA 480
Query 535 TGAAAGCGAAGTTGGATCCGTTAGGTTTGGAACAGCGAGAGATCCCTGAGGATCTTGACT 594
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGAAAGCAAAGTTGGATCCGTTAGGTTTGGAACAGCGAGAGATCCCTGAGGATCTTGACT 540
Query 595 TGGCTCTTTATGGATTCACTGAGGCTGACCTTGACAGAGAGTTCTTCTTGGGGGTGTGGC 654
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 541 TGGCTCTTTATGGATTCACTGAGGCTGATCTTGACAGAGAGTTCTTCTTGGGAGTGTGGC 600
Query 655 AGATGTCAGGATTCATGTCTGAGAACCGACCAGTGCAGACCCTTCGTTCCATATTGACAA 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AGATGTCAGGATTCATGTCTGAGAACCGACCAGTGCAGACCCTTCGTTCCATATTGACAA 660
Query 715 GGCTCGAACAGGCATACTGTGGGAATATCGGATTTGAGTATATGCACATTGCAGATCGAG 774
|||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 661 GGCTTGAACAGGCATACTGTGGGAATATTGGGTTTGAGTATATGCACATTGCAGATCGGG 720
Query 775 ATAAATGTAACTGGTTGAGAGAAAAGATTGAGACACCAACTCCTTGGCGGTACAACAGGG 834
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 721 ATAAATGTAATTGGTTGAGAGAAAAGATTGAAACACCAACTCCTTGGCAGTACAACAGGG 780
Query 835 AGCGCCGTGAGGTGATTCTCGATCGGCTTGCATGGAGTACTCAGTTCGAGAATTTCTTAG 894
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 781 AGCGCCGTGAGGTGATTCTCGATCGGCTTGCATGGAGTACTCAGTTTGAGAATTTCTTAG 840
Query 895 CTACCAAGTGGACAACAGCCAAAAGATTTGGACTTGAGGGAGGAGAATCATTAATTCCTG 954
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CTACCAAGTGGACAACAGCTAAGAGATTTGGACTTGAGGGAGGAGAATCATTAATTCCTG 900
Query 955 GAATGAAGGAGATGTTTGACAGAGCAGCAGATCTTGGAGTAGAGAGTATTGTTATTGGAA 1014
| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GTATGAAGGAGATGTTTGACAGGGCCGCAGACCTTGGAGTAGAGAGTATTGTTATTGGAA 960
Query 1015 TGTCTCACAGAGGAAGATTGAATGTTCTGGGTAATGTTGTTCGGAAGCCACTCCGTCAGA 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TGTCTCACAGAGGAAGATTGAATGTTCTGGGTAATGTTGTTCGGAAGCCACTCCGTCAGA 1020
Query 1075 TATTTAGTGAGTTCAGTGGTGGTATTAGGCCTGTAGATGAAGTTGGCTACACTGGAACTG 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TATTTAGTGAGTTCAGTGGTGGTATTAGGCCTGTAGATGAAGTTGGCTACACTGGAACTG 1080
Query 1135 GTGATGTCAAATATCACTTGGGAACCTCTTATGATCGACCTACAAGAGGTGGGAAGAAAA 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GTGATGTCAAATATCACTTGGGAACCTCTTATGATCGACCTACAAGAGGTGGGAAGAAAA 1140
Query 1195 TCCATCTCTCTTTGGTTGCTAATCCAAGTCACTTGGAAGCTGCAGATTCTGTTGTTGTTG 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 TCCATCTCTCTTTGGTTGCTAATCCAAGTCACTTGGAAGCTGCAGATTCTGTTGTTGTTG 1200
Query 1255 GCAAAACCAGAGCAAAACAGTACTACTCCAATGATTTAGACAGGACCAAAAATTTAGGTA 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GCAAAACCAGAGCAAAACAGTACTACTCCAATGATTTAGACAGGACCAAAAATTTAGGTA 1260
Query 1315 TTTTGATTCACGGAGATGGTAGTTTTGCTGGACAAGGGGTAGTCTATGAAACTCTCCATC 1374
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||
Sbjct 1261 TTTTGATTCATGGAGATGGTAGTTTTGCTGGACAAGGGGTAGTTTACGAAACTCTGCATC 1320
Query 1375 TTAGTGCTCTTCCAAACTACACCACCGGAGGAACCATACATATTGTGGTGAACAACCAAG 1434
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TTAGTGCTCTTCCAAACTACACCACCGGGGGAACCATACATATTGTGGTGAACAACCAAG 1380
Query 1435 TGGCTTTCACGACAGATCCAAGGGCGGGGAGATCTTCCCAGTATTGTACTGATGTTGCAA 1494
||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1381 TGGCTTTTACTACAGACCCAAGGGCTGGGAGATCTTCCCAGTATTGTACGGATGTTGCTA 1440
Query 1495 AGGCTTTGAGTGCTCCCATCTTTCATGTTAATGGGGATGATGTTGAGGCTGTTGTTCATG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 AGGCTTTGAGTGCTCCCATCTTTCATGTTAATGGGGATGATGTTGAGGCTGTTGTTCATG 1500
Query 1555 CCTGCGAGCTTGCTGCTGAGTGGCGTCAGACTTTTCATTCTGATGTTGTCGTTGATTTGG 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CCTGCGAGCTTGCTGCTGAGTGGCGTCAGACTTTTCATTCTGATGTTGTCGTTGATTTGG 1560
Query 1615 TTTGCTACCGTAGGTTCGGGCATAATGAGATAGATGAACCATCTTTCACTCAGCCAAAAA 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1561 TTTGCTACCGTAGGTTCGGGCATAATGAGATAGATGAACCATCCTTCACTCAGCCAAAAA 1620
Query 1675 TGTACAAGGTTATCAAAAATCATCCTTCAACCCTTCAGATCTACCACAAAAAGCTCTTGG 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TGTACAAGGTTATCAAAAATCATCCTTCAACCCTTCAGATCTACCACAAAAAGCTCTTGG 1680
Query 1735 AATGCGGTGAAGTATCACAACAGGATATTGACCGGATACAGGAAAAGGTTAACACCATCC 1794
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 AATGCGGTGAAGTATCACAACAGGATATCGACCGGATACAGGAAAAGGTTAACACCATCC 1740
Query 1795 TCAATGAAGAATTTGTCGCTAGTAAGGACTATCTCCCTAAGAAACGAGATTGGCTTTCAA 1854
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 TCAATGAAGAATTTGTCGCTAGTAAAGACTATCTCCCTAAGAAACGAGATTGGCTTTCAA 1800
Query 1855 CCAATTGGGCTGGATTTAAGTCTCCTGAGCAGATCTCACGTGTTAGAAACACTGGCGTCA 1914
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 CCAATTGGGCTGGATTTAAGTCTCCTGAACAGATCTCACGTGTTAGAAACACTGGCGTCA 1860
Query 1915 AACCAGAGATACTGAAGACTGTTGGCAAGGCAATTTCATCTCTTCCAGAAAACTTCAAGC 1974
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1861 AACCAGAGATACTTAAGACTGTTGGCAAGGCAATTTCATCGCTTCCAGAAAACTTCAAGC 1920
Query 1975 CACACAGGGCAGTGAAGAAAGTTTATGAACAACGTGCCCAAATGATTGAATCAGGAGAGG 2034
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1921 CACACAGGGCAGTGAAGAAAGTTTATGAACAACGTGCCCAAATGATTGAATCAGGAGAAG 1980
Query 2035 GAGTTGACTGGGCCCTTGCAGAAGCTCTTGCTTTTGCTACCTTAGTTGTGGAAGGCAATC 2094
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 GAGTTGACTGGGCTCTTGCAGAAGCTCTTGCTTTTGCTACCTTAGTTGTGGAAGGCAATC 2040
Query 2095 ATGTCCGATTGAGTGGTCAGGATGTCGAACGAGGAACATTTAGTCATCGTCATTCTGTCC 2154
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 ATGTCCGGTTGAGTGGTCAAGATGTCGAACGAGGAACATTTAGTCATCGTCATTCTGTCC 2100
Query 2155 TTCATGACCAGGAAACTGGAGAAGAGTATTGTCCTCTAGATCATCTCATCATGAATCAGG 2214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 TTCATGACCAGGAAACTGGAGAAGAGTATTGTCCTCTAGATCATCTCATCATGAATCAGG 2160
Query 2215 ATCCTGAGATGTTTACTGTTAGCAACAGTTCTCTTTCAGAATTTGGTGTCCTTGGGTTCG 2274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 ATCCTGAGATGTTTACTGTTAGCAACAGTTCTCTTTCAGAATTTGGTGTCCTTGGGTTCG 2220
Query 2275 AATTGGGTTACTCCATGGAAAGCCCGAACTCGTTGGTACTATGGGAAGCTCAGTTTGGAG 2334
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AATTGGGTTACTCCATGGAAAGCCCAAACTCGTTGGTATTATGGGAAGCTCAGTTTGGAG 2280
Query 2335 ACTTCGCCAATGGAGCTCAGGTGATATTTGATCAGTTCATCAGCAGTGGAGAAGCCAAAT 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 ACTTCGCCAATGGAGCTCAGGTGATATTTGATCAGTTCATCAGCAGTGGAGAAGCCAAAT 2340
Query 2395 GGCTGCGTCAAACCGGGCTTGTTATGCTACTTCCCCATGGTTATGATGGTCAGGGACCTG 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2341 GGCTGCGTCAAACCGGGCTTGTTATGCTACTTCCCCATGGTTATGATGGTCAGGGCCCTG 2400
Query 2455 AACATTCAAGTGCGAGGTTGGAACGTTACCTTCAGATGAGTGATGATAATCCCTATGTCA 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 AACATTCAAGTGCGAGGTTGGAACGTTACCTTCAGATGAGTGATGATAATCCCTATGTCA 2460
Query 2515 TACCAGACATGGAACCAACAATGCGAAAGCAAATTCAAGAATGTAATTGGCAGATTGTCA 2574
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 TACCAGACATGGAACCAACGATGCGAAAGCAAATTCAAGAATGTAATTGGCAGATTGTCA 2520
Query 2575 ATGCCACAACTCCCGCCAACTATTTCCATGTTCTGCGGCGACAGATACACAGAGACTTCC 2634
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 ATGCCACAACTCCTGCCAACTATTTCCATGTTCTGCGGCGACAGATACACAGAGACTTCC 2580
Query 2635 GTAAGCCTCTGATTGTAATGGCACCAAAGAACTTGCTCCGTCACAAGGACTGCAAATCAA 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2581 GTAAGCCTCTGATTGTAATGGCACCAAAGAACTTGCTTCGTCACAAGGATTGCAAATCAA 2640
Query 2695 ATCTCTCAGAGTTTGATGATGTCCAAGGCCACCCAGGTTTTGACAAGCAAGGAACTAGAT 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 ATCTCTCAGAGTTTGATGATGTCCAAGGCCACCCAGGTTTTGACAAGCAAGGAACTAGAT 2700
Query 2755 TTAAGCGATTAATCAAGGATCAGAATGATCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGAT 2814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 TTAAGCGATTAATCAAGGATCAGAATGATCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGAT 2760
Query 2815 TGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTCTATTATGAGCTTGATGATGAACGGAAGAAGGTTGGCG 2874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2761 TGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTCTATTATGAGCTTGATGATGAGCGGAAGAAGGTTGGCG 2820
Query 2875 CAACAGATGTTGCTATCTGTAGAGTTGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGATCTCATTC 2934
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2821 CAACCGATGTTGCTATCTGTAGAGTGGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGATCTCATTC 2880
Query 2935 AGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATCGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGA 2994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2881 AGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATCGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCTATGA 2940
Query 2995 ACATGGGAGCATTCAGCTACATATCTCCACGGCTATGGACAGCAATGAGAAGCGTAAACA 3054
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2941 ACATGGGAGCATTCAGCTACATATCGCCGCGGCTATGGACAGCAATGAGAAGCTTAAACA 3000
Query 3055 GAGGAGATATGGAAGACATTAAGTATGTTGGTCGTGGTCCTTCTGCTGCAACTGCCAC-G 3113
| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3001 GGGGAGATATGGAAGACATTAAGTACGTTGGCCGTGGTCCTTCTGCTGCAACTGCCACCG 3060
Query 3114 GGTTTCTATACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCCGGGCTTGTCCAGAAAGCCATCGGAAAG 3173
|||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3061 GGTT-CTACACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCTGAGCTTGTCCAGAAAGCCATAGGAAAG 3119
Query 3174 GAACCCATCAATTAAAAACTCTTCCTTTTTAAATGACTTCTCAGACTGATAAG-AGAAAA 3232
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | ||||
Sbjct 3120 GAGCCCATCAATTAAAA-CTCTTCCTTTTTAAATGAATTCTCAGACCGAAAAGGAAAAAA 3178
Query 3233 AGGAGAAAACTTTGAAATAAGAACTTTGGGTGATGCAAAAGTGCTAAACAACACTGTCAA 3292
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3179 AGGAGAAAACTTTGAAATAAGAACTTTGGGTGATGCAAAAGTGCTAAACAACACTGACAA 3238
Query 3293 AATCCGCTGTTTCTTTG--ATAtttttttGGTCCCATTGATTTTGAGCCTGGCTCGTGTT 3350
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3239 AATCCTCTGTTTCTTTGTTATATTTTTTTGGTCCCATTGATTTTGAGCCTGCCTAGTGTT 3298
Query 3351 GCCAG-TCAAAACATTaaaaaaaaaTCTTATATTGATATACAGTTTTGTTATTGCTCTTC 3409
|| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 GC-AGGTCAAAACAT-AAAAAAAAATCTCATATTGATACACAGTTTTGTTATTGCTCTTC 3356
Query 3410 tttttttCTTCTTTGA-ATCATCTTTTGCGTTGTCATTGTCTTTTCCCTT 3458
|||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3357 TTTTTT-CTTCTTTGATA-CATCTTTTGCGTTGTCATTGTCTTTTTCCTT 3404
> Ahg940181 jgi|Araly1|940181|scaffold_600725.1
Length=231
Score = 243 bits (131), Expect = 9e-63
Identities = 193/219 (88%), Gaps = 19/219 (9%)
Strand=Plus/Plus
Query 2854 ATGAACGGAAGAAGGTTGGCGCAACAGATGTTGCTATCTGTAGAGTTGAACAGCTTTGTC 2913
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 31 ATGAGCGGAAGAAGGTTGGCGCAAGGGATGTTGCTATTTGTAGAGTGGAGCAGCTTTGTC 90
Query 2914 CTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATCGTTT 2973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |
Sbjct 91 CTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAA-TGCC-A-A--G--- 142
Query 2974 GGTGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGAGCATTCAGCTACATATCTCCACGGCTATGGA 3033
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143 ------AAGA-GA--CGATGAACATGGGAGCATTCAGCTACATATCTCCACGGCTATGGA 193
Query 3034 CAGCAATGAGAAGC-GTAAACAGAGGAGATATGGAAGAC 3071
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 194 CAGCAATGAGAAGCTG-AAACAGAGGAGATATGGAAGAC 231
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 131945605591
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5