BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G55480.2
Length=3549
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg348635 jgi|Araly1|348635|fgenesh1_pg.C_scaffold_5002027 5454 0.0
Ahg338097 jgi|Araly1|338097|fgenesh1_pg.C_scaffold_2000196 405 1e-111
> Ahg348635 jgi|Araly1|348635|fgenesh1_pg.C_scaffold_5002027
Length=3351
Score = 5454 bits (2953), Expect = 0.0
Identities = 3221/3353 (96%), Gaps = 7/3353 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 78 ATGTTCAATAAGTTTGGTTCGACGTCGGAGACTCTTAGCAAAGCTTCAGCTG-GGTTGCT 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||
Sbjct 1 ATGTTCAATAAGTTTGGTTCGACGTCGGAGACTCTAAGCAAAGCTTCAGCTGTGG-TGCA 59
Query 137 TCGGATCGGCACTGACGCTCATCTTTATGATGATCCGGAAGACGTCAACATTGCTCCACT 196
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 CCGGATCGGCACTGACGCTCATCTTTATGATGATCCGGAAGACGTCAACATTGCTCCACT 119
Query 197 TCTCGATAGCAAGTTCGAATCTGAGAAATGTGAAGCTCTTAAGCGTCTCCTTGCTCTTAT 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TCTCGATAGCAAGTTCGAATCTGAGAAATGTGAAGCTCTTAAGCGTCTCCTTGCTCTTAT 179
Query 257 CGCTCAAGGCTTTGATGTCTCCAATTTCTTTCCTCAGGTGGTGAAGAATGTGGCGTCACA 316
|||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 180 CGCTCAGGGCTCTGATGTCTCCAATTTCTTCCCTCAGGTGGTGAAAAATGTGGCGTCACA 239
Query 317 GTCATCGGAAGTGAAGAAGCTTGTTTACTTGTATTTGCTACAATATGCAGAAAAGCGTCC 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GTCATCGGAAGTGAAGAAGCTTGTTTACTTGTATTTGCTACAATATGCAGAAAAGCGTCC 299
Query 377 AAATGAAGCATTGCTATCGATCAACTATTTTCAAAAGGACTTGGGGGATCCAAATCCATT 436
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 AAATGAAGCGTTGCTATCGATCAACTATTTTCAGAAGGACTTGGGGGATCCAAATCCATT 359
Query 437 GGTTAGGGCTTGGGCTCTTCGTACAATGGCTGGGATTCGCTTACATGTTATTGCACCTCT 496
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 360 GGTTAGGGCTTGGGCACTTCGTACAATGGCGGGGATTCGCTTACATGTTATTGCACCTAT 419
Query 497 TGCACTTGCAGCTGTGAGTAAATGTGCTAGAGATCCAGCTGTTTATGTTCGGAGATGTGC 556
|||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |||
Sbjct 420 TGCACTCGCAGCTGTGGGTAAATGTGCTAGGGATCCAGCGGTTTATGTCCGGAAATATGC 479
Query 557 TGCAAACGCTCTTCCGAAGTTGCATGATTTGCGGCTGGAAGAACATGCTTCTGCGATTGA 616
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TGCAAATGCTCTTCCGAAGTTGCATGATTTGCGGCTGGAAGAACATGCTTCTGCGATTGA 539
Query 617 AGAGCTAGTTGGGATACTGTTGAATGACCATTCTCCAGGAGTAGTTGGAGCTGCGGCAGC 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AGAGCTAGTTGGGATACTGTTGAATGACCATTCTCCAGGAGTAGTTGGAGCTGCGGCAGC 599
Query 677 GGCATTCACCTCTATCTGTCCAAATAACTTCAAACTGATTGGGAAGAACTATAAGAAGTT 736
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 600 GGCATTCACCTCCATCTGTCCAAATAACTTCAAACTGATTGGAAAGAACTATAAGAAGTT 659
Query 737 GTGCCAGATTCTCCCTGACGTTGAAGAGTGGGGTCAGATATTACTCATAGGAACTCTTTT 796
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 GTGCCAGATTCTTCCTGACGTAGAAGAGTGGGGTCAGATATTACTCATAGGAACTCTTTT 719
Query 797 GCGCTATGTGGTTGCTAGGCATGGACTTGTACGGGAATCTTTGATGTTGTCCATACATGG 856
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 720 GCGCTATGTGGTTGCTAGGCATGGACTTGTACGGGAATCTTTGATGTTGTCCCTACATGG 779
Query 857 TACGAATAGTAATGGCTTCTGTGAGAAGGATGGCCTAGGCAGAGATCTTACATTGGAT-- 914
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 780 TATGGATAGTAATGGCTTCTGTGAGAAGGATGGCCTAGTCAGAGATCTTACATTGGATAA 839
Query 915 A-AAGAAGATGGTGGTAAAAGTGATTCATTTGATGTTAATCTGGTCAGTCTTGTATCTAA 973
| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 840 AGAAGAAGATGGTGATAAAAGTGATTCATTTGATGTTAATCTGGTCAGCCTTGTATCTAA 899
Query 974 ATGTTACATTCAAGGTCCAGATGAGTATCTATCAAGATCCAGTTGCACCGATACAGTGTC 1033
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 900 ATGTTACATTGAAGGTCCAGATGAGTATCTATCAAGATCTAGTTACACCGATACAGTGTC 959
Query 1034 ATCTGCTTTCGATACCAAAGAGACCACATCTATTGCACATAATGAAGATGTTAAGATCCT 1093
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ATCTGCTTTCGATAGCAAAGAGACCACATCTATTGCACATAATGAAGATGTTAAGATCCT 1019
Query 1094 GCTTCAGTGTACATCTCCATTGTTATGGAGTAATAACAGTGCGGTTGTACTAGCAGCAGC 1153
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GCTTCAGTGTACATCCCCATTGCTATGGAGTAATAACAGTGCGGTTGTACTAGCAGCAGC 1079
Query 1154 TGGCGTTCAATGGATAATGGCGCCTCTGGAAGATGTTAAGAAAATTGTTAAACCGCTCTT 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TGGCGTTCAATGGATAATGGCGCCTCTGGAAGATGTTAAGAAAATTGTTAAACCGCTCTT 1139
Query 1214 GTTTTTGCTTAGGTCATCTAGCGCCTCCAAATATGTGGTCCTCTGCAATATCCTAGTTTT 1273
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1140 GTTTTTGCTTAGGTCATCCAGCGCCTCCAAATATGTGGTCCTCTGCAACATCCTAGTTTT 1199
Query 1274 TGCCAAAGCAGTCCCTTCTCTCTTTGCTCCACACTTCGAAAATTTCTTTATTTGTTCCTC 1333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TGCCAAAGCAGTCCCTTCTCTCTTTGCTCCACACTTCGAAACTTTCTTTATTTGTTCCTC 1259
Query 1334 AGATGCATATCAAGTGAAAGCATACAAGCTGGAAATGCTTTCTCTCATTGCTACCACTTC 1393
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 AGATGCATATCAAGTTAAAGCATACAAGCTGGAAATGCTTTCTCTCATTGCTACCACTTC 1319
Query 1394 ATCTATCGCTTCAATTTTGAGAGAGTTTGAGGATTATATTAAAGATCCAGACAGGAGATT 1453
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 ATCTATCTCTTCAATTTTGAGAGAGTTTGAGGATTATGTTAAAGATCCAGACAGGAGATT 1379
Query 1454 TGCGGCTGATACAGTTGCAGCAATTGGTTTGTGCGCAAAAAGACTGATGACAATTCCAAC 1513
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1380 TGCGGCTGATACAGTTGCAGCAATTGGTTTGTGTGCAAAAAGACTGCCAACAATTCCAAC 1439
Query 1514 TACATGTCTTGATGGATTGTTAGCACTAGTTCGACAGGAATCTTTTGCTGGCGATTTTGA 1573
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TACATGTCTTGATGGATTATTAGCACTAGTTCGACAGGAATCTTTTGCTGGCGATTTTGA 1499
Query 1574 GTCCGCGGATGGAGAAGCTGGAGTATTGGTGCAAGCCGTGATGTCAATTCAGACTATGAT 1633
||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1500 GTCAGTGGATGGAGAAGCTGGAGTGTTGGTGCAAACCGTAATGTCGATTCAGACTATCAT 1559
Query 1634 AGAGCGAGACCCCCTTCGTCATGAGAAAGTGTTAATTCAGCTGTTTCGTAGTCTGGATTC 1693
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 AGAGCGAGATCCCCTTCGTCATGAGAAAGTTTTAATTCAGCTGTTTCGTAGTCTGGATTC 1619
Query 1694 AATCAAGGTAGCTGCTGCTCGTGCAACTATTATTTGGATGGTGGGGGTCTACTGCTCTTT 1753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 AATCAAGGTAGCTGCTGCTCGTGCAACTATTATTTGGATGGTGGGGGTCTACTGCTCTTT 1679
Query 1754 GGGTCATATCATTCCTAGGATGCTGACCACAATAACCAAGTACCTTGCATGGAGCTTTAA 1813
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GGGTCATATCATTCCTAGGATGCTTACCACAATAACCAAGTACCTTGCATGGAGCTTTAA 1739
Query 1814 ATCAGAGGCATCAGAGACAAAACTACAGATTCTTAATACTATTGCTAAGGTTCTAATAAG 1873
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1740 ATCAGAGGCATCAGAGGCAAAACTTCAGATTCTTAATGCTACTGCTAAGGTTCTAAAAAG 1799
Query 1874 TGCAGAGGCTGGTGACTTTCATATGTTGAAAAGGATTGTGGTCTATGTGTTTGAATTGGG 1933
||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 1800 TGCAGAGGCTGACGACTTTCAGATGTTGAAAAGGGTTGTGATTTATGTGTTTGAATTGGG 1859
Query 1934 CGAATATGACTTAAGCTATGATATTCGTGATCGAACTCGTTTCCTGAAGAAACTGCTGTC 1993
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1860 CGAATGTGACTTAAGCTATGATGTTCGTGATCGAACCCGTTTCCTCAAGAAACTGCTGTC 1919
Query 1994 ATGCAAATTAGCTAGTCATGAGCCGGCAGAAGACAGTGTTGCATCACAAGAAAATATTGC 2053
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1920 ATCCAAATTAGCTTGTCATGAGCCGGCAGAAGACAGTGTTGCATCACAAGAAAATATCGC 1979
Query 2054 TGCGCATGTTGTGGAACATGTCTTTGGAAGAAAACTGAAATCTGTTTCACCTATAACCCT 2113
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||
Sbjct 1980 TACGCATGTTGTGGAACATGTCTTTGGAAGAAAACTGAAACCTTTTTCACCTTTAGCCCT 2039
Query 2114 GCACAATCGTTTTTATCTTCCTGGATCTCTGTCACAGATAGTTCTTCATGCAGCCCCTGG 2173
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 GCACAATCGTTTTTATCTTCCTGGATCTCTATCACAGATAGTTCTTCATGCAGCCCCTGG 2099
Query 2174 ATATGAACCTCTTCCAAAGCCCTGCAGTTTTGTGTATGAAGAACAGGACCAGCTGTCAGA 2233
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2100 ATACGAACCTCTTCCAAAGCCCTGCAGTTTTGTGTTTGAAGAACAAGACCAGCTGTCAGA 2159
Query 2234 TTTAGATAAACAAAGAGAGGCCGCAGCTGATTTAGATGGTTCTGAGGAATCCTCTGAAAC 2293
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2160 TTTAGACAGACAAAGAGAGGCCGCAGCTGATTTAGATGGTTCTCAGGAATCATCTGAAAC 2219
Query 2294 AGGGGATGA-GAATGGCTCCTCTGATTATGACTCTGAATCTTCTAATGGTTCGGATTTTA 2352
|| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
Sbjct 2220 AGTGGATGACG-ATGGCTCCTCTGATTATGACTCTGAATCTTCTATTGGTTCAGATTGCA 2278
Query 2353 GCAGTGAAGGTGATGAAAGAACAGTGTCTAATGACGCCAATGACCCAGCTGCTCCTTTAA 2412
||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2279 GCAGTGACGGTGATGAAAGAACGGTGTCTAATGGTGCCAATGATCCAGCTGCTCCTTTAA 2338
Query 2413 TTCAAATTTCAGAGACTTCTGTTTCCGCTGACCAGGAAGAACTAAGGTCCAGAAGGGCCC 2472
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2339 TTCAAATTTCAGAGACTTCTGTTTCCGCTGACCAAGAAGAACTAAGGTCCAAAAAGGCCC 2398
Query 2473 TGGATTTGTGGTTAGATGATCAGCCTAGTACATCAAACCAAACTCCATCTGCATTAAATA 2532
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 TGGATTTGTGGTTAGATGATCAGCCAAGTACATCAAACCAAACTCCATCTGCATTAAATA 2458
Query 2533 GTAATCAGAGCTCTTATGCGAAGATATCCATTGGTGATGTAGGAAGCCGAGTTAAGCCTA 2592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 2459 GTAATCAGAGCTCTTATGCGAAGATATCCATTGGTGATATAGGAAGCCGAGTGAAGCCTA 2518
Query 2593 AAAGCTATAGTCTCGTAGACCCTGGAAATGGCAGTGGCTTGAAGGTAGACTATGCCTTTT 2652
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 AAAGCTATAGTCTCTTAGACCCTAGAAATGGCAGTGGCTTGAAGGTAGACTATGCCTTTT 2578
Query 2653 TATCTGAAGTCTCTAATGTATCTCCATTACATGTTTGCGTAGAAGTTCTGTTTGAGAACA 2712
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 TATCTGAAGTCTCTACTGTATCTCCATTACATGTTTGCGTAGAAGTTCTGTTTGAGAACA 2638
Query 2713 GTTCTGCTGAACCTATCCTGGAGGTGAATTTGGAAGATGAAGAATCAATGAAGGTAGCAG 2772
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2639 GTTCTGCTGAACCTATCCTGGAGGTGAATTTGGAAGATGAAGAATCGATGAAGGTAGCAG 2698
Query 2773 ACTCTTCTGAACAGACATTGGTTGGTAAAGCAAATGCATCTTACAACAATATACCAACCC 2832
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
Sbjct 2699 ACTCTTCTGAACAGACTTTGGTTGGTAAAGCAAATGCATCTTACAACAATGTGCCAACTC 2758
Query 2833 TAATTCCAATGGAGGAAATTAGCTGCCTTGAACCACATCAGAGCACAAAGAGGCTTATCC 2892
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2759 TAATTCCAATGGAGGAAATCAGCTGCCTTGAACCACATCAGAGCGCAAAGAGGCTTATCC 2818
Query 2893 AGGTTCGGTTTCATCACCACCTGCTTCCCATGAGGTTAACCTTACATTACAATGAAAAGA 2952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2819 AGGTTCGGTTTCATCACCACCTGCTTCCCATGAGGTTAACCTTACATTACAATGGAAAGG 2878
Query 2953 AAGTTCCTGTCAAGTTACGACCTGATCTTGGATACCTTGTGAAACCATTTTCAATGAGCA 3012
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 AGGTTCCTGTCAAGTTACGACCTGATCTTGGATACCTTGTGAAACCATTTTCAATGAGCA 2938
Query 3013 TCGAGGAATTCTTAGCTACAGAATCTCGATTACCTGGAATGTTTGAGTATAGTCGAAGGT 3072
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 TCGAGGAATTCTTAGCCACAGAATCTCGATTACCTGGAATGTTTGAGTATAGTCGAAGGT 2998
Query 3073 GTACTTTTGACGATCATGTTAAAGATTCAAGAACGGAGAATGGGAAAGACAAATTTCTTA 3132
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2999 GTACTTTTGACGATCATGTTAAAGATTCAAGAATGGAGAATGGGAAAGACAAATTTCTCA 3058
Query 3133 GCATCTGCGAGAGTATAACACTAAAGGTGCTTAGCAACTCAAATCTACACCTTGTATCTG 3192
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3059 GCATCTGCGAGTGTATAACACTAAAGGTGCTTAGCAACTCAAATCTACACCTTGTGTCTG 3118
Query 3193 TGGATTTACCAGTTGCAAACTCACTCGAAGATGCAACTGGTCTGCGATTAAGATTCAGCA 3252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 TGGATTTACCAGTTGCAAACTCACTCGAAGATGCAACTGGTCTGCGATTAAGATTCAGCA 3178
Query 3253 GCAAAATCTTGAGCAGTGAGATCCCTCTTTTGATTACCATCACAGTCGAAGGCAAATGCA 3312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 GCAAAATCTTGAGCAGTGAGATCCCTCTTTTGATTACCATCACAGTCGAAGGCAAATGCA 3238
Query 3313 CCGAAGTTCTGAATTTAACAGTCAAGATCAATTGCGAAGAAACGGTTTTTGGTTTAAACC 3372
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 CCGAAGTTCTGAATATAACAGTCAAGATCAATTGCGAAGAAACGGTTTTTGGTTTAAACC 3298
Query 3373 TGTTGAACAGGATAGCTAATTTCATGGTTGAGCCGTCTTCTTCAGCCACTTGA 3425
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 3299 TGTTGAACAGGATAGCTAATTTCATGGTTGAGCCGTCTTCGTCAGCCAGTTGA 3351
> Ahg338097 jgi|Araly1|338097|fgenesh1_pg.C_scaffold_2000196
Length=366
Score = 405 bits (219), Expect = 1e-111
Identities = 297/334 (89%), Gaps = 7/334 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2122 GTTTTTATCTTCCTGGATCTCTGTCACAGATAGTTCTTCATGCAGCCCCTGGATATGAAC 2181
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 33 GTTTTTATCTTCCTGGATCTATATCACAGATAGTTCTTCATGCAGCCCCTGGATACGAAC 92
Query 2182 CTCTTCCAAAGCCCTGCAGTTTTGTGTATGAAGAACAGGACCAGCTGTCAGATTTAGATA 2241
|||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 93 ATCTTCCAAAGCC-TGCAGTTTTGTTTTTGAAGAACAAGACCAGCTGTCAGATTTAGACA 151
Query 2242 AACAAAGAGAGGCCGCAGCTGATTTAGATGGTTCT-GAGGAATCCTCTGAAACAGGGGAT 2300
|||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||
Sbjct 152 GACAAAGAGAGGCCGCAGCTGTTTTAGATGATTCTCG-GGAATCATCTGAAACAGTGGAT 210
Query 2301 GA-GAATGGCTCCTCTGATTATGACTCTGAATCTTCTAATGGTTCGGATTTTAGCAGTGA 2359
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||
Sbjct 211 GACGA-TGGCTCCTCTGATTATGACTCTGAATCTTCTATTGATTCAGATTGCAGCAGTGA 269
Query 2360 AGGTGATGAAAGAACAGTGTCTAATGACGCCAATGACCCAGCTGCTCCTTTAATTCAAAT 2419
||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 270 CGGTGATGAAAGAACAGTGTCTAATGGTGTCAATGATCCAGGTGCTCCTTTAATTCAAAT 329
Query 2420 TTCAGAGACTTCTGTTTCCGCTGACC-AGGAAGA 2452
||| | |||||| |||| | ||||| || ||||
Sbjct 330 TTCTGTGACTTCGGTTTTCAATGACCCAG-AAGA 362
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 134038772106
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5