BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G55480.2 Length=3549 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg348635 jgi|Araly1|348635|fgenesh1_pg.C_scaffold_5002027 5454 0.0 Ahg338097 jgi|Araly1|338097|fgenesh1_pg.C_scaffold_2000196 405 1e-111 > Ahg348635 jgi|Araly1|348635|fgenesh1_pg.C_scaffold_5002027 Length=3351 Score = 5454 bits (2953), Expect = 0.0 Identities = 3221/3353 (96%), Gaps = 7/3353 (0%) Strand=Plus/Plus Query 78 ATGTTCAATAAGTTTGGTTCGACGTCGGAGACTCTTAGCAAAGCTTCAGCTG-GGTTGCT 136 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| Sbjct 1 ATGTTCAATAAGTTTGGTTCGACGTCGGAGACTCTAAGCAAAGCTTCAGCTGTGG-TGCA 59 Query 137 TCGGATCGGCACTGACGCTCATCTTTATGATGATCCGGAAGACGTCAACATTGCTCCACT 196 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60 CCGGATCGGCACTGACGCTCATCTTTATGATGATCCGGAAGACGTCAACATTGCTCCACT 119 Query 197 TCTCGATAGCAAGTTCGAATCTGAGAAATGTGAAGCTCTTAAGCGTCTCCTTGCTCTTAT 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 TCTCGATAGCAAGTTCGAATCTGAGAAATGTGAAGCTCTTAAGCGTCTCCTTGCTCTTAT 179 Query 257 CGCTCAAGGCTTTGATGTCTCCAATTTCTTTCCTCAGGTGGTGAAGAATGTGGCGTCACA 316 |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 180 CGCTCAGGGCTCTGATGTCTCCAATTTCTTCCCTCAGGTGGTGAAAAATGTGGCGTCACA 239 Query 317 GTCATCGGAAGTGAAGAAGCTTGTTTACTTGTATTTGCTACAATATGCAGAAAAGCGTCC 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 GTCATCGGAAGTGAAGAAGCTTGTTTACTTGTATTTGCTACAATATGCAGAAAAGCGTCC 299 Query 377 AAATGAAGCATTGCTATCGATCAACTATTTTCAAAAGGACTTGGGGGATCCAAATCCATT 436 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 AAATGAAGCGTTGCTATCGATCAACTATTTTCAGAAGGACTTGGGGGATCCAAATCCATT 359 Query 437 GGTTAGGGCTTGGGCTCTTCGTACAATGGCTGGGATTCGCTTACATGTTATTGCACCTCT 496 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 360 GGTTAGGGCTTGGGCACTTCGTACAATGGCGGGGATTCGCTTACATGTTATTGCACCTAT 419 Query 497 TGCACTTGCAGCTGTGAGTAAATGTGCTAGAGATCCAGCTGTTTATGTTCGGAGATGTGC 556 |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || ||| Sbjct 420 TGCACTCGCAGCTGTGGGTAAATGTGCTAGGGATCCAGCGGTTTATGTCCGGAAATATGC 479 Query 557 TGCAAACGCTCTTCCGAAGTTGCATGATTTGCGGCTGGAAGAACATGCTTCTGCGATTGA 616 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 TGCAAATGCTCTTCCGAAGTTGCATGATTTGCGGCTGGAAGAACATGCTTCTGCGATTGA 539 Query 617 AGAGCTAGTTGGGATACTGTTGAATGACCATTCTCCAGGAGTAGTTGGAGCTGCGGCAGC 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 AGAGCTAGTTGGGATACTGTTGAATGACCATTCTCCAGGAGTAGTTGGAGCTGCGGCAGC 599 Query 677 GGCATTCACCTCTATCTGTCCAAATAACTTCAAACTGATTGGGAAGAACTATAAGAAGTT 736 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 600 GGCATTCACCTCCATCTGTCCAAATAACTTCAAACTGATTGGAAAGAACTATAAGAAGTT 659 Query 737 GTGCCAGATTCTCCCTGACGTTGAAGAGTGGGGTCAGATATTACTCATAGGAACTCTTTT 796 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 GTGCCAGATTCTTCCTGACGTAGAAGAGTGGGGTCAGATATTACTCATAGGAACTCTTTT 719 Query 797 GCGCTATGTGGTTGCTAGGCATGGACTTGTACGGGAATCTTTGATGTTGTCCATACATGG 856 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 720 GCGCTATGTGGTTGCTAGGCATGGACTTGTACGGGAATCTTTGATGTTGTCCCTACATGG 779 Query 857 TACGAATAGTAATGGCTTCTGTGAGAAGGATGGCCTAGGCAGAGATCTTACATTGGAT-- 914 || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 780 TATGGATAGTAATGGCTTCTGTGAGAAGGATGGCCTAGTCAGAGATCTTACATTGGATAA 839 Query 915 A-AAGAAGATGGTGGTAAAAGTGATTCATTTGATGTTAATCTGGTCAGTCTTGTATCTAA 973 | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 840 AGAAGAAGATGGTGATAAAAGTGATTCATTTGATGTTAATCTGGTCAGCCTTGTATCTAA 899 Query 974 ATGTTACATTCAAGGTCCAGATGAGTATCTATCAAGATCCAGTTGCACCGATACAGTGTC 1033 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 900 ATGTTACATTGAAGGTCCAGATGAGTATCTATCAAGATCTAGTTACACCGATACAGTGTC 959 Query 1034 ATCTGCTTTCGATACCAAAGAGACCACATCTATTGCACATAATGAAGATGTTAAGATCCT 1093 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 ATCTGCTTTCGATAGCAAAGAGACCACATCTATTGCACATAATGAAGATGTTAAGATCCT 1019 Query 1094 GCTTCAGTGTACATCTCCATTGTTATGGAGTAATAACAGTGCGGTTGTACTAGCAGCAGC 1153 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 GCTTCAGTGTACATCCCCATTGCTATGGAGTAATAACAGTGCGGTTGTACTAGCAGCAGC 1079 Query 1154 TGGCGTTCAATGGATAATGGCGCCTCTGGAAGATGTTAAGAAAATTGTTAAACCGCTCTT 1213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 TGGCGTTCAATGGATAATGGCGCCTCTGGAAGATGTTAAGAAAATTGTTAAACCGCTCTT 1139 Query 1214 GTTTTTGCTTAGGTCATCTAGCGCCTCCAAATATGTGGTCCTCTGCAATATCCTAGTTTT 1273 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1140 GTTTTTGCTTAGGTCATCCAGCGCCTCCAAATATGTGGTCCTCTGCAACATCCTAGTTTT 1199 Query 1274 TGCCAAAGCAGTCCCTTCTCTCTTTGCTCCACACTTCGAAAATTTCTTTATTTGTTCCTC 1333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1200 TGCCAAAGCAGTCCCTTCTCTCTTTGCTCCACACTTCGAAACTTTCTTTATTTGTTCCTC 1259 Query 1334 AGATGCATATCAAGTGAAAGCATACAAGCTGGAAATGCTTTCTCTCATTGCTACCACTTC 1393 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1260 AGATGCATATCAAGTTAAAGCATACAAGCTGGAAATGCTTTCTCTCATTGCTACCACTTC 1319 Query 1394 ATCTATCGCTTCAATTTTGAGAGAGTTTGAGGATTATATTAAAGATCCAGACAGGAGATT 1453 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1320 ATCTATCTCTTCAATTTTGAGAGAGTTTGAGGATTATGTTAAAGATCCAGACAGGAGATT 1379 Query 1454 TGCGGCTGATACAGTTGCAGCAATTGGTTTGTGCGCAAAAAGACTGATGACAATTCCAAC 1513 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1380 TGCGGCTGATACAGTTGCAGCAATTGGTTTGTGTGCAAAAAGACTGCCAACAATTCCAAC 1439 Query 1514 TACATGTCTTGATGGATTGTTAGCACTAGTTCGACAGGAATCTTTTGCTGGCGATTTTGA 1573 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1440 TACATGTCTTGATGGATTATTAGCACTAGTTCGACAGGAATCTTTTGCTGGCGATTTTGA 1499 Query 1574 GTCCGCGGATGGAGAAGCTGGAGTATTGGTGCAAGCCGTGATGTCAATTCAGACTATGAT 1633 ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || Sbjct 1500 GTCAGTGGATGGAGAAGCTGGAGTGTTGGTGCAAACCGTAATGTCGATTCAGACTATCAT 1559 Query 1634 AGAGCGAGACCCCCTTCGTCATGAGAAAGTGTTAATTCAGCTGTTTCGTAGTCTGGATTC 1693 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1560 AGAGCGAGATCCCCTTCGTCATGAGAAAGTTTTAATTCAGCTGTTTCGTAGTCTGGATTC 1619 Query 1694 AATCAAGGTAGCTGCTGCTCGTGCAACTATTATTTGGATGGTGGGGGTCTACTGCTCTTT 1753 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1620 AATCAAGGTAGCTGCTGCTCGTGCAACTATTATTTGGATGGTGGGGGTCTACTGCTCTTT 1679 Query 1754 GGGTCATATCATTCCTAGGATGCTGACCACAATAACCAAGTACCTTGCATGGAGCTTTAA 1813 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 GGGTCATATCATTCCTAGGATGCTTACCACAATAACCAAGTACCTTGCATGGAGCTTTAA 1739 Query 1814 ATCAGAGGCATCAGAGACAAAACTACAGATTCTTAATACTATTGCTAAGGTTCTAATAAG 1873 |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| Sbjct 1740 ATCAGAGGCATCAGAGGCAAAACTTCAGATTCTTAATGCTACTGCTAAGGTTCTAAAAAG 1799 Query 1874 TGCAGAGGCTGGTGACTTTCATATGTTGAAAAGGATTGTGGTCTATGTGTTTGAATTGGG 1933 ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| Sbjct 1800 TGCAGAGGCTGACGACTTTCAGATGTTGAAAAGGGTTGTGATTTATGTGTTTGAATTGGG 1859 Query 1934 CGAATATGACTTAAGCTATGATATTCGTGATCGAACTCGTTTCCTGAAGAAACTGCTGTC 1993 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 1860 CGAATGTGACTTAAGCTATGATGTTCGTGATCGAACCCGTTTCCTCAAGAAACTGCTGTC 1919 Query 1994 ATGCAAATTAGCTAGTCATGAGCCGGCAGAAGACAGTGTTGCATCACAAGAAAATATTGC 2053 || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1920 ATCCAAATTAGCTTGTCATGAGCCGGCAGAAGACAGTGTTGCATCACAAGAAAATATCGC 1979 Query 2054 TGCGCATGTTGTGGAACATGTCTTTGGAAGAAAACTGAAATCTGTTTCACCTATAACCCT 2113 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| Sbjct 1980 TACGCATGTTGTGGAACATGTCTTTGGAAGAAAACTGAAACCTTTTTCACCTTTAGCCCT 2039 Query 2114 GCACAATCGTTTTTATCTTCCTGGATCTCTGTCACAGATAGTTCTTCATGCAGCCCCTGG 2173 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2040 GCACAATCGTTTTTATCTTCCTGGATCTCTATCACAGATAGTTCTTCATGCAGCCCCTGG 2099 Query 2174 ATATGAACCTCTTCCAAAGCCCTGCAGTTTTGTGTATGAAGAACAGGACCAGCTGTCAGA 2233 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2100 ATACGAACCTCTTCCAAAGCCCTGCAGTTTTGTGTTTGAAGAACAAGACCAGCTGTCAGA 2159 Query 2234 TTTAGATAAACAAAGAGAGGCCGCAGCTGATTTAGATGGTTCTGAGGAATCCTCTGAAAC 2293 |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct 2160 TTTAGACAGACAAAGAGAGGCCGCAGCTGATTTAGATGGTTCTCAGGAATCATCTGAAAC 2219 Query 2294 AGGGGATGA-GAATGGCTCCTCTGATTATGACTCTGAATCTTCTAATGGTTCGGATTTTA 2352 || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | Sbjct 2220 AGTGGATGACG-ATGGCTCCTCTGATTATGACTCTGAATCTTCTATTGGTTCAGATTGCA 2278 Query 2353 GCAGTGAAGGTGATGAAAGAACAGTGTCTAATGACGCCAATGACCCAGCTGCTCCTTTAA 2412 ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2279 GCAGTGACGGTGATGAAAGAACGGTGTCTAATGGTGCCAATGATCCAGCTGCTCCTTTAA 2338 Query 2413 TTCAAATTTCAGAGACTTCTGTTTCCGCTGACCAGGAAGAACTAAGGTCCAGAAGGGCCC 2472 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| Sbjct 2339 TTCAAATTTCAGAGACTTCTGTTTCCGCTGACCAAGAAGAACTAAGGTCCAAAAAGGCCC 2398 Query 2473 TGGATTTGTGGTTAGATGATCAGCCTAGTACATCAAACCAAACTCCATCTGCATTAAATA 2532 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2399 TGGATTTGTGGTTAGATGATCAGCCAAGTACATCAAACCAAACTCCATCTGCATTAAATA 2458 Query 2533 GTAATCAGAGCTCTTATGCGAAGATATCCATTGGTGATGTAGGAAGCCGAGTTAAGCCTA 2592 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 2459 GTAATCAGAGCTCTTATGCGAAGATATCCATTGGTGATATAGGAAGCCGAGTGAAGCCTA 2518 Query 2593 AAAGCTATAGTCTCGTAGACCCTGGAAATGGCAGTGGCTTGAAGGTAGACTATGCCTTTT 2652 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2519 AAAGCTATAGTCTCTTAGACCCTAGAAATGGCAGTGGCTTGAAGGTAGACTATGCCTTTT 2578 Query 2653 TATCTGAAGTCTCTAATGTATCTCCATTACATGTTTGCGTAGAAGTTCTGTTTGAGAACA 2712 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2579 TATCTGAAGTCTCTACTGTATCTCCATTACATGTTTGCGTAGAAGTTCTGTTTGAGAACA 2638 Query 2713 GTTCTGCTGAACCTATCCTGGAGGTGAATTTGGAAGATGAAGAATCAATGAAGGTAGCAG 2772 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2639 GTTCTGCTGAACCTATCCTGGAGGTGAATTTGGAAGATGAAGAATCGATGAAGGTAGCAG 2698 Query 2773 ACTCTTCTGAACAGACATTGGTTGGTAAAGCAAATGCATCTTACAACAATATACCAACCC 2832 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | Sbjct 2699 ACTCTTCTGAACAGACTTTGGTTGGTAAAGCAAATGCATCTTACAACAATGTGCCAACTC 2758 Query 2833 TAATTCCAATGGAGGAAATTAGCTGCCTTGAACCACATCAGAGCACAAAGAGGCTTATCC 2892 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2759 TAATTCCAATGGAGGAAATCAGCTGCCTTGAACCACATCAGAGCGCAAAGAGGCTTATCC 2818 Query 2893 AGGTTCGGTTTCATCACCACCTGCTTCCCATGAGGTTAACCTTACATTACAATGAAAAGA 2952 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2819 AGGTTCGGTTTCATCACCACCTGCTTCCCATGAGGTTAACCTTACATTACAATGGAAAGG 2878 Query 2953 AAGTTCCTGTCAAGTTACGACCTGATCTTGGATACCTTGTGAAACCATTTTCAATGAGCA 3012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2879 AGGTTCCTGTCAAGTTACGACCTGATCTTGGATACCTTGTGAAACCATTTTCAATGAGCA 2938 Query 3013 TCGAGGAATTCTTAGCTACAGAATCTCGATTACCTGGAATGTTTGAGTATAGTCGAAGGT 3072 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2939 TCGAGGAATTCTTAGCCACAGAATCTCGATTACCTGGAATGTTTGAGTATAGTCGAAGGT 2998 Query 3073 GTACTTTTGACGATCATGTTAAAGATTCAAGAACGGAGAATGGGAAAGACAAATTTCTTA 3132 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2999 GTACTTTTGACGATCATGTTAAAGATTCAAGAATGGAGAATGGGAAAGACAAATTTCTCA 3058 Query 3133 GCATCTGCGAGAGTATAACACTAAAGGTGCTTAGCAACTCAAATCTACACCTTGTATCTG 3192 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3059 GCATCTGCGAGTGTATAACACTAAAGGTGCTTAGCAACTCAAATCTACACCTTGTGTCTG 3118 Query 3193 TGGATTTACCAGTTGCAAACTCACTCGAAGATGCAACTGGTCTGCGATTAAGATTCAGCA 3252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3119 TGGATTTACCAGTTGCAAACTCACTCGAAGATGCAACTGGTCTGCGATTAAGATTCAGCA 3178 Query 3253 GCAAAATCTTGAGCAGTGAGATCCCTCTTTTGATTACCATCACAGTCGAAGGCAAATGCA 3312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3179 GCAAAATCTTGAGCAGTGAGATCCCTCTTTTGATTACCATCACAGTCGAAGGCAAATGCA 3238 Query 3313 CCGAAGTTCTGAATTTAACAGTCAAGATCAATTGCGAAGAAACGGTTTTTGGTTTAAACC 3372 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3239 CCGAAGTTCTGAATATAACAGTCAAGATCAATTGCGAAGAAACGGTTTTTGGTTTAAACC 3298 Query 3373 TGTTGAACAGGATAGCTAATTTCATGGTTGAGCCGTCTTCTTCAGCCACTTGA 3425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct 3299 TGTTGAACAGGATAGCTAATTTCATGGTTGAGCCGTCTTCGTCAGCCAGTTGA 3351 > Ahg338097 jgi|Araly1|338097|fgenesh1_pg.C_scaffold_2000196 Length=366 Score = 405 bits (219), Expect = 1e-111 Identities = 297/334 (89%), Gaps = 7/334 (2%) Strand=Plus/Plus Query 2122 GTTTTTATCTTCCTGGATCTCTGTCACAGATAGTTCTTCATGCAGCCCCTGGATATGAAC 2181 |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 33 GTTTTTATCTTCCTGGATCTATATCACAGATAGTTCTTCATGCAGCCCCTGGATACGAAC 92 Query 2182 CTCTTCCAAAGCCCTGCAGTTTTGTGTATGAAGAACAGGACCAGCTGTCAGATTTAGATA 2241 |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 93 ATCTTCCAAAGCC-TGCAGTTTTGTTTTTGAAGAACAAGACCAGCTGTCAGATTTAGACA 151 Query 2242 AACAAAGAGAGGCCGCAGCTGATTTAGATGGTTCT-GAGGAATCCTCTGAAACAGGGGAT 2300 |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||| |||| Sbjct 152 GACAAAGAGAGGCCGCAGCTGTTTTAGATGATTCTCG-GGAATCATCTGAAACAGTGGAT 210 Query 2301 GA-GAATGGCTCCTCTGATTATGACTCTGAATCTTCTAATGGTTCGGATTTTAGCAGTGA 2359 || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| Sbjct 211 GACGA-TGGCTCCTCTGATTATGACTCTGAATCTTCTATTGATTCAGATTGCAGCAGTGA 269 Query 2360 AGGTGATGAAAGAACAGTGTCTAATGACGCCAATGACCCAGCTGCTCCTTTAATTCAAAT 2419 ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct 270 CGGTGATGAAAGAACAGTGTCTAATGGTGTCAATGATCCAGGTGCTCCTTTAATTCAAAT 329 Query 2420 TTCAGAGACTTCTGTTTCCGCTGACC-AGGAAGA 2452 ||| | |||||| |||| | ||||| || |||| Sbjct 330 TTCTGTGACTTCGGTTTTCAATGACCCAG-AAGA 362 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 134038772106 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5