BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G57300.2
Length=4997
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg938705 jgi|Araly1|938705|scaffold_502896.1 4183 0.0
> Ahg938705 jgi|Araly1|938705|scaffold_502896.1
Length=4565
Score = 4183 bits (2265), Expect = 0.0
Identities = 2411/2483 (97%), Gaps = 4/2483 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2287 GGATGCTGGCTTTCATATTTTGATTACTAGCTATCAGCTATTAGTCACTGATGAAAAGTA 2346
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2085 GGATGCTGGCTTTCATATTTTGATTACTAGCTATCAGCTATTAGTCACCGATGAAAAGTA 2144
Query 2347 TTTTCGCCGGGTGAAGTGGCAATATATGGTGCTAGATGAGGCCCAAGCAATCAAGAGTTC 2406
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 TTTTCGCCGGGTGAAGTGGCAATACATGGTGCTAGATGAGGCCCAAGCAATCAAGAGTT- 2203
Query 2407 CT-CCAGTATAAGATGGAAAACCCTTCTTAGTTTTAACTGTCGGAACCGATTGCTTCTGA 2465
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2204 CTGCCAGTATAAGATGGAAAACCCTTCTTAGTTTTAACTGTCGGAACCGATTGCTTCTGA 2263
Query 2466 CTGGTACTCCAATTCAGAACAACATGGCAGAGTTATGGGCCCTGCTGCATTTCATCATGC 2525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 CTGGTACTCCAATTCAGAACAACATGGCAGAGTTATGGGCCCTGCTGCATTTCATCATGC 2323
Query 2526 CAATGTTGTTTGACAACCATGATCAATTTAATGAATGGTTCTCAAAAGGAATTGAGAATC 2585
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 CAATGTTGTTTGACAACCATGATCAATTTAATGAGTGGTTCTCAAAAGGAATTGAGAATC 2383
Query 2586 ATGCTGAACACGGAGGCACTTTAAATGAGCACCAGCTTAACAGACTGCATGCGATCTTGA 2645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2384 ATGCTGAACACGGAGGCACTTTAAATGAGCACCAGCTTAACAGACTGCATGCGATTTTGA 2443
Query 2646 AACCGTTCATGCTTCGACGGGTAAAAAAGGATGTGGTTTCTGAGCTAACTACAAAGACGG 2705
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 AACCGTTCATGCTTCGACGGGTAAAGAAGGATGTGGTTTCTGAGCTAACTACAAAGACGG 2503
Query 2706 AAGTTACAGTACACTGCAAGCTCAGTTCTCGACAACAAGCTTTTTATCAGGCTATTAAGA 2765
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504 AAGTTACAGTACACTGCAAGCTCAGTTCGCGACAACAAGCTTTTTATCAGGCTATTAAGA 2563
Query 2766 ACAAAATTTCTCTGGCTGAGTTGTTTGATAGCAACCGCGGACAATTTACTGATAAGAAAG 2825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 ACAAAATTTCTCTGGCTGAGTTGTTTGATAGCAACCGCGGACAATTTACTGATAAGAAAG 2623
Query 2826 TATTGAATTTAATGAATATTGTCATTCAACTAAGGAAGGTTTGCAACCATCCAGAGTTGT 2885
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 TACTGAATTTAATGAATATTGTCATTCAACTTAGGAAGGTTTGCAACCATCCAGAGTTGT 2683
Query 2886 TCGAAAGGAATGAAGGGAGCTCGTATCTCTACTTTGGAGTGACTTCCAATTCTCTTTTGC 2945
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2684 TCGAAAGGAATGAAGGGAGCTCGTATCTCTACTTTGGAGTAACTTCCAATTCTCTTTTAC 2743
Query 2946 CCCATCCCTTTGGTGAGCTAGAGGATGTACATTATTCTGGTGGTCAAAATCCGATAATAT 3005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2744 CCCATCCCTTTGGTGAGCTAGAGGATGTACATTATTCTGGTGGTCAAAATCCGATAATAT 2803
Query 3006 ACAAGATACCTAAGCTACTACACCAAGAGGTGCTCCAAAATTCTGAAACATTTTGTTCTT 3065
||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804 ACAAGATGCCTAAACTACTACACCAAGAGGTCCTCCAAAATTCTGAAACATTTTGTTCTT 2863
Query 3066 CTGTCGGGCGTGGCATCTCAAGAGAATCTTTTCTGAAGCATTTTAATATATATTCACCTG 3125
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2864 CCGTCGGGCGTGGCATCTCAAGAGAATCCTTTCTGAAGCATTTTAATATATATTCACCTG 2923
Query 3126 AGTATATTCTTAAGTCAATATTCCCATCTGATAGTGGGGTAGATCAAGTGGTTAGTGGAA 3185
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 2924 AGTATATTCTTAGGTCAATATTCCCATCTGATAGTGGGGTAGATCAAATGGTTAGTGAAA 2983
Query 3186 GTGGAGCATTTGGCTTTTCACGCTTGATGGATCTATCACCA-TCAGAAGTTGGATATCTG 3244
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 2984 GTGGAGCATTTGGCTTTTCACGCTTGATGGATCTATCACCGGT-AGAAGTTGGATATCTG 3042
Query 3245 GCTCTGTGTTCTGTTGCAGAAAGGCTATTATTTTCTATACTGAGGTGGGAGCGGCAATTT 3304
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3043 GCGCTGTGTTCTGTTGCAGAAAGGCTATTATTCTCTATACTGAGATGGGAGCGGCAATTT 3102
Query 3305 TTGGATGAATTAGTTAACTCTCTTATGGAGTCCAAGGATGGTGATCTTAGTGACAATAAC 3364
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3103 TTGGATGAATTAGTGAACTCTCTTATGGAATCCAAGGATGATGATCTTAGTGACAATAAC 3162
Query 3365 ATCGAGAGAGTTAAAACCAAAGCTGTCACAAGAATGTTGCTGATGCCATCAAAAGTTGAA 3424
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3163 ATCGAGAGAGTTAAAACCAAAGCTGTCACAAGAATGTTACTGATGCCATCAAAAGTTGAA 3222
Query 3425 ACGAATTTTCAGAAAAGGAGACTAAGCACAGGGCCTACCCGTCCTTCATTTGAAGCGCTA 3484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3223 ACGAATTTTCAGAAAAGGAGACTAAGCACAGGGCCTACCCGTCCTTCATTTGAAGCGCTA 3282
Query 3485 GTGATCTCTCATCAGGATAGGTTTCTTTCAAGTATCAAACTCCTGCATTCTGCATATACT 3544
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3283 GTGATCTCTCATCAGGATAGGCTTCTTTCAAATATCAAACTCCTGCATTCTGCATATACT 3342
Query 3545 TATATCCCAAAAGCCAGAGCTCCACCTGTAAGCATTCATTGCTCGGACAGAAATTCGGCA 3604
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3343 TATATCCCAAAAGCCAGAGCTCCACCGGTAAGCATTCATTGCTCGGACAGAAATTCTGCA 3402
Query 3605 TACAGAGTTACAGAAGAATTACATCAACCATGGCTTAAGAGACTATTAATCGGTTTTGCA 3664
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3403 TACAGAGTTACAGAAGAATTACATCAACCATGGCTCAAGAGACTATTAATCGGTTTTGCA 3462
Query 3665 CGAACGTCAGAAGCTAATGGACCCAGGAAGCCTAACAGCTTTCCACATCCTTTAATCCAA 3724
|| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3463 CGTACATCAGAAGCTAACGGACCCAGGAAGCCGAACAGCTTTCCACATCCTTTAATCCAA 3522
Query 3725 GAAATTGATTCAGAACTTCCAGTTGTGCAGCCTGCGCTTCAACTGACACACAGAATATTT 3784
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3523 GAAATTGATTCAGAACTTCCACTTGTGCAGCCTGCGCTACAACTGACACACAGAATATTT 3582
Query 3785 GGTTCTTGCCCTCCAATGCAAAGTTTTGACCCAGCAAAGTTGCTCACGGACTCTGGGAAG 3844
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3583 GGTTCTTGCCCTCCAATGCAAAGTTTCGACCCAGCAAAGTTGCTCACGGACTCTGGGAAG 3642
Query 3845 CTGCAGACACTTGATATATTATTGAAGCGGCTTCGAGCTGGAAATCACAGGGTGCTCCTG 3904
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3643 CTGCAGACACTTGATATATTATTGAAGCGGCTTCGAGCTGGAAATCACAGGGTGCTCCTC 3702
Query 3905 TTTGCACAAATGACAAAGATGCTGAACATTCTCGAGGATTATATGAACTATAGAAAGTAC 3964
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3703 TTTGCACAAATGACAAAGATGCTGAACATTCTTGAGGATTACATGAACTATAGAAAGTAC 3762
Query 3965 AAGTACCTCAGGCTTGATGGATCCTCCACCATCATGGATCGCCGAGATATGGTTAGGGAT 4024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3763 AAGTACCTCAGGCTTGATGGATCCTCCACCATCATGGATCGCCGAGATATGGTTAGGGAT 3822
Query 4025 TTTCAGCATAGGAGCGATATTTTTGTATTCTTGCTGAGCACCAGAGCTGGAGGACTTGGT 4084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3823 TTTCAGCATAGGAGCGATATTTTTGTATTCTTGCTGAGCACGAGAGCTGGAGGACTTGGT 3882
Query 4085 ATCAACTTGACGGCTGCAGACACTGTCATTTTCTATGAAAGTGATTGGAATCCCACCTTG 4144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3883 ATCAACTTGACGGCTGCAGACACTGTCATTTTCTATGAAAGTGATTGGAATCCCACCTTG 3942
Query 4145 GATTTACAAGCTATGGACAGGGCTCATCGTCTTGGACAGACAAAAGATGTTACTGTTTAT 4204
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3943 GATTTACAAGCTATGGACAGAGCTCATCGTCTTGGACAGACAAAAGATGTTACTGTGTAT 4002
Query 4205 CGTCTCATCTGTAAGGAGACGGTGGAAGAGAAAATTTTGCACAGGGCAAGTCAGAAAAAT 4264
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4003 CGGCTCATCTGCAAGGAGACGGTGGAAGAGAAAATTTTGCACAGGGCAAGTCAGAAAAAT 4062
Query 4265 ACAGTTCAACAGCTTGTTATGACTGGAGGGCATGTTCAGGGTGATGATTTTCTTGGAGCT 4324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4063 ACAGTTCAACAGCTTGTTATGACTGGAGGGCATGTTCAGGGTGATGATTTTCTTGGAACT 4122
Query 4325 GCGGATGTGGTATCTCTGCTAATGGATGATGCGGAGGCAGCACAACTGGAGCAGAAATTC 4384
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4123 GCGGATGTGGTATCGCTGCTAATGGATGATGCAGAGGCAGCACAACTGGAGCAGAAATTC 4182
Query 4385 AGAGAACTACCATTACAGGTAAAGGACAGGCAGAAGAAAAAGACGAAACGTATCAGAATA 4444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 4183 AGAGAACTACCATTACAGGTAAAGGACAGGCAGAAGAAAAGGACGAAATGTATCAGAATA 4242
Query 4445 GATGCTGAAGGAGATGCAACTTTGGAAGAGTTAGAAGATGTTGACCGACAGGATAACGGA 4504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||
Sbjct 4243 GATGCTGAAGGAGATGCAACTTTGGAAGAGTTAGAAGATACTGAACGACAAGATAACGGA 4302
Query 4505 CAGGAACCTTTGGAAGAACCGGAAAAGCCAAAATCCAGTAATAAAAAGAGGAGAGCTGCT 4564
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4303 CAGGAACCTTTGGAAGAACCGGAAAAGACAAAACCCAGTAACAAAAAGAGGAGAGCTGCT 4362
Query 4565 TCAAATCCGAAAGCTAGAGCTCCTCAGAAAGCAAAGGAAGAAGCAAATGGTGAAGATACT 4624
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4363 TCAACTCCGAAATCTAGAGCTCCTCAGAAAGCAAAGGAAGAAGCAAATGGTGAAGATACT 4422
Query 4625 CCTCAGAGGACAAAAAGGGTAAAGAGACAAACAAAGAGCATAAACGAAAGTCTTGAACCT 4684
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4423 CCTCAAAGGACAAAAAGGGTAAAGAGACAAACAAAGAGCATAAACGAGAGTCTTGAACCT 4482
Query 4685 GTATTCTCTGCCTCTGTAACAGAATCAAATAAAGGATTCGATCCAAGTAGCTCCGCTAAC 4744
|| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4483 GTCTTCTCTGCCTCTGTTACAGAAACAAATAGAGGATTCGATCCAAGTAGCTCCGCCAAC 4542
Query 4745 TAATCCGAAGATGATTAGAGCTT 4767
||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4543 TAATCTGAAGATGATTAGAGCTT 4565
Score = 3518 bits (1905), Expect = 0.0
Identities = 2018/2074 (97%), Gaps = 1/2074 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 103 TGTTATTCTCTTCCCGTCTCTCATGGATCCTTCAAGACGACCACCGAAGGACTCTCCTTA 162
||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGTCATTCTCTT-CTGTCTCTCATGGATCCTTCAAGACGACCACCGAAGGACTCTCCTTA 59
Query 163 CGCGAATCTATTCGATCTCGAGCCGTTGATGAAGTTTAGAATTCCGAAACCTGAAGATGA 222
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 CGCGAATCTCTTCGATCTCGAGCCGTTGATGAAGTTCAGAATTCCGAAACCTGAAGATGA 119
Query 223 AGTTGATTATTATGGGAGTAGTAGCCAGGATGAAAGTAGAAGCACTCAAGGTGGGGTAGT 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 AGTTGATTATTATGGGAGTAGTAGCCAGGATGAAAGTAGAAGCACTCAAGGTGGGGTAGT 179
Query 283 GGCAAACTACAGCAATGGGTCTAAATCGAGAATGAATGCGAGCTCCAAGAAGAGAAAGCG 342
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 180 GGCAAACTACAGCAATGGGTCTAAATCGAGAATGAATGTGAACTCCAAGAAGAGAAAGCG 239
Query 343 GTGGACAGAAGCTGAGGATGCAGAGGACGATGATGATCTCTACAATCAACATGTTACTGA 402
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GTGGACAGAAGCTGATGATGCAGAGGATGATGATGACCTCTACAATCAACATGTTACTGA 299
Query 403 GGAGCACTACCGATCAATGCTTGGGGAGCATGTACAAAAATTCAAAAATAGGTCCAAGGA 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 300 GGAGCACTACCGATCAATGCTTGGGGAGCATGTACAAAAATTCAAAACTAGGTCCAAGGA 359
Query 463 GACTCAAGGGAATCCTCCTCATCTGATGGGTTTTCCGGTGCTAAAGAGCAATGTGGGCAG 522
| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GTCTCAAGGGAATCCTCCACATCTGATGGGTGTTCCGGTGCTAAAGAGCAATGTGGGCAG 419
Query 523 TTACAGAGGTAGGAAACCAGGGAATGATTACCATGGGAGGTTCTATGACATGGACAACTC 582
|||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||
Sbjct 420 TTACAGAGGTAGGAAACCAGTGAATGATCACTATGGGAGATTCTATGATATGGACAGCTC 479
Query 583 TCCAAATTTTGCAGCTGATGTGACCCCACATAGGCGAGGAAGCTACCATGATCGTGATAT 642
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TCCAAATTTTGCTGCTGATGTGATCCCACATAGGCGAGGAAGCTACCATGATCGTGATAT 539
Query 643 TACACCCAAGATAGCATATGAACCTTCGTATTTGGACATTGGTGATGGTGTCATCTACAA 702
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TACCCCCAAAATAGCATATGAACCTTCGTATTTGGACATTGGTGATGGTGTCATCTACAA 599
Query 703 AATCCCCCCAAGTTATGACAAGCTGGTGGCATCATTAAACTTACCGAGCTTTTCAGACAT 762
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 600 AATCCCCCCAAGCTATGACAAGCTGGTGGCATCATTAAACTTACCAAGCTTTTCAGATAT 659
Query 763 TCATGTGGAAGAATTTTACTTGAAAGGAACTCTGGATCTGAGATCATTAGCAGAACTGAT 822
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TCATGTGGAAGAATTTTACTTGAAAGGAGCTCTGGATCTGAGATCATTAGCAGAACTGAT 719
Query 823 GGCAAGTGATAAAAGGTCTGGAGTAAGAAGCCGTAATGGAATGGGTGAGCCTCGACCTCA 882
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GGCTAGTGATAAAAGGTCTGGAGTAAGAAGCCGTAATGGAATGGGTGAGCCTCGACCTCA 779
Query 883 ATATGAATCTCTTCAAGCTAGAATGAAGGCCCTGTCACCTTCAAACTCCACCCCAAATTT 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 780 ATATGAATCTCTTCAAGCTAGAATGAAGGCCCTGTCACCTTCAAACTCCACCCTAAATTT 839
Query 943 TAGCCTCAAGGTGTCAGAAGCTGCAATGAATTCTGCCATTCCAGAAGGATCTGCTGGAAG 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TAGCCTCAAGGTGTCAGAAGCTGCAATGAATTCTGCCATTCCAGAAGGATCTGCTGGAAG 899
Query 1003 TACTGCACGGACAATTCTGTCTGAGGGTGGTGTTTTACAGGTCCATTACGTGAAGATTCT 1062
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 900 TACTGCACGAACAATTCTGTCTGAGGGTGGTGTTTTACAGGTCCATTACGTGAAGGTTCT 959
Query 1063 GGAGAAGGGGGATACATACGAGATTGTTAAACGAAGTCTACCGAAGAAGCTGAAAGCAAA 1122
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 960 GGAGAAGGGGGATACATACGAGATTGTTAGACGAAGTCTACCGAAGAAGCTGAAAGCGAA 1019
Query 1123 GAATGATCCTGCAGTCATTGAGAAAACAGAAAGGGATAAAATTAGAAAAGCCTGGATCAA 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GAATGATCCTGCAGTCATTGAGAAAACAGAAAGGGATAAAATTAGAAAAGCCTGGATCAA 1079
Query 1183 TATTGTCAGAAGAGATATAGCAAAACACCATAGAATTTTCACTACTTTTCATCGTAAACT 1242
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1080 TATAGTCAGAAGAGATATAGCAAAACACCATAAAATTTTCACTACTTTCCATCGAAAACT 1139
Query 1243 ATCAATTGATGCCAAGAGGTTTGCAGATGGTTGCCAAAGAGAGGTGAGAATGAAGGTGGG 1302
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1140 ATCAATTGATGCCAAGAGGTTTGCAGATGGTTGCCAAAGAGAGGTGCGAATGAAGGTGGG 1199
Query 1303 TAGATCATACAAAATCCCAAGAACTGCACCAATTCGCACTAGGAAGATATCCAGAGACAT 1362
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TAGATCATACAAAATCCCAAGGACTGCACCGATTCGCACTAGGAAGATATCCAGAGACAT 1259
Query 1363 GCTGCTATTCTGGAAGCGATATGACAAGCAGATGGCAGAAGAGAGGAAAAAGCAAGAAAA 1422
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GCTGCTATTCTGGAAGCGACATGACAAGCAGATGGCAGAAGAGAGGAAAAAGCAAGAAAA 1319
Query 1423 GGAAGCTGCAGAGGCTTTTAAACGTGAACAGGAGCAGCGAGAGTCAAAAAGGCAGCAACA 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1320 GGAAGCTGCAGAGGCTTTTAAACGTGAACAGGAGCTTCGAGAGGCAAAAAGGCAGCAACA 1379
Query 1483 AAGGCTCAATTTCCTTATTAAACAGACTGAGCTTTACAGTCACTTCATGCAAAACAAGAC 1542
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 AAGGCTCAATTTTCTTATTAAACAGACTGAGCTTTACAGTCACTTCATGCAAAACAAGAC 1439
Query 1543 CGATTCGAATCCTTCCGAAGCCTTACCAATAGGTGATGAAAATCCGATTGACGAAGTGCT 1602
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 CGATTCAAATCCTTCCGAAGCCTTACCAATAGGTGATGAAAATCCGATTGACGAAGTGCT 1499
Query 1603 CCCAGAAACTTCAGCGGCAGAACCTTCTGAGGTAGAGGATCCTGAAGAGGCTGAACTGAA 1662
||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 CCCAGAAACTTCAGCAGCAGGACCTTCTGAGGTGGAGGATCCTGAAGAGGCTGAACTGAA 1559
Query 1663 GGAAAAGGTCTTGAGAGCTGCCCAAGATGCGGTGTCTAAGCAGAAGCAAATAACAGATGC 1722
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 GGAAAAGGTCCTGAGAGCTGCCCAAGATGCGGTGTCTAAGCAGAAGCAAATAACAGATGC 1619
Query 1723 ATTTGACACTGAATATATGAAGCTACGCCAAACTTCTGAAATGGAAGGTCCTTTAAATGA 1782
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1620 ATTTGACACTGAATATATGAAGCTACGCCAAACTTCTGAAATGGAAGGTCCTTTGAATGA 1679
Query 1783 TATATCAGTTTCTGGCTCGAGCAATATAGATTTGCATAACCCATCTACAATGCCTGTTAC 1842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TATATCAGTTTCTGGCTCGAGCAATATAGATTTGCATAACCCATCTACAATGCCTGTTAC 1739
Query 1843 ATCAACAGTTCAGACTCCAGAGTTATTTAAAGGAACCCTTAAAGAATACCAAATGAAAGG 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 ATCAACAGTTCAGACTCCAGAGTTATTTAAAGGAACCCTTAAAGAATACCAAATGAAAGG 1799
Query 1903 CCTTCAGTGGCTAGTCAATTGTTATGAGCAGGGTTTGAATGGCATACTTGCTGATGAAAT 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 CCTTCAGTGGCTAGTCAATTGTTATGAGCAGGGTTTGAATGGCATACTTGCTGATGAAAT 1859
Query 1963 GGGCTTGGGTAAGACTATTCAAGCTATGGCGTTCTTGGCACATTTGGCTGAGGAAAAGAA 2022
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 GGGCTTGGGTAAGACTATTCAAGCTATGGCTTTCTTGGCACATTTGGCTGAGGAAAAGAA 1919
Query 2023 CATTTGGGGTCCATTTCTTGTTGTTGCCCCTGCCTCTGTTCTTAACAATTGGGCTGATGA 2082
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 CATTTGGGGTCCATTTCTGGTTGTTGCCCCTGCCTCTGTTCTTAACAATTGGGCTGATGA 1979
Query 2083 AATCAGTCGTTTCTGTCCTGACTTGAAAACTCTTCCATATTGGGGAGGATTACAAGAACG 2142
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1980 AATCAGTCGTTTCTGTCCTGATTTGAAAACTCTTCCATATTGGGGAGGATTGCAAGAACG 2039
Query 2143 AACAATTTTAAGAAAGAATATCAATCCCAAGCGT 2176
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 AACAATTTTAAGAAAGAATATCAATCCCAAGCGT 2073
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189146137810
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5