BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G57660.1
Length=5013
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486216 jgi|Araly1|486216|fgenesh2_kg.5__2208__AT3G57660.1 8061 0.0
> Ahg486216 jgi|Araly1|486216|fgenesh2_kg.5__2208__AT3G57660.1
Length=5037
Score = 8061 bits (4365), Expect = 0.0
Identities = 4831/5051 (96%), Gaps = 52/5051 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTCACGCTCAAACCACAGAGGTGTGTTTGAGTTTTCACCGCTCTTTATTGTTTCCC 60
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCACGTTCAAACCACAGAGGTGTGTTTGAGTTTTCACCGCTCCGTATTGTTTCCC 60
Query 61 ATGGGAGCTTCCCAGGTGGTCGAATCTGTTAGATTCAGTTTCATGACAGAGCAAGATGTT 120
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATGGGAGCTTCCCAGGTGGTTGAATCTGTTAGATTCAGTTTCATGACAGAGCAAGATGTT 120
Query 121 CGAAAGCATAGTTTCCTGAAAGTTACCAGTCCTATTTTACACGATAACGTGGGC-AATCC 179
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||
Sbjct 121 CGAAAGCATAGTTTTCTGAAAGTTACGAGTCCTATATTACTCGATAACGTGGGCGAA-CC 179
Query 180 TTTTCCTGGTGGTCTCTATGATCTTAAA-TTAGGTCCTAAAGATGATAAGCAAGCTTGCA 238
|| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| |||||||
Sbjct 180 TTATCCTGGTGGTCTCTATGATCCTAAACTT-GGTCCTATAGAGGATAAAAAAGCTTGTG 238
Query 239 ATTCATGTGGTCAGCTCAAACTTGCTTGTCCAGGACATTGTGGTCATATCGAGCTTGTCT 298
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 ATACATGTGGTCAGCTCAATCTTGCTTGTCCAGGACATTGTGGTCATATCGAGCTTGTCT 298
Query 299 TTCCTATTTACCATCCTTTGCTCTTCAATCTTCTTTTCAATTTCTTGCAGAGGGCCTGTT 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 299 ATCCTATTTACCATCCTTTGCTCTTCAATCTTCTTTACAATTTTTTGCAGAGGACCTGTT 358
Query 359 TCTTCTGTCATCACTTTATGGCAAAACCGGAAGATGTTGAAAGAGCTGTTTCTCAGCTGA 418
|| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 TCATCTGTCATCATTTTATGGCAAAACCTTACGATGTTGAAAGAGCTGTTTCTCAGCTGA 418
Query 419 AACTCATCATTAAAGGTGATATAGTTTCCGCGAAGCAATTGGAGTCCAACACTCCCACTA 478
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 AACTCATCATTAAAGGTGATATAGTTTCTGCAAAGCAATTGGAGTCCAACACTCCCACTA 478
Query 479 AGTCTA-AGTCTAGTGATGAAAGCTGTGAATCAGTTGTAACCACTGATTCATCCGAAGAA 537
|||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 479 AGTC-AGATTCTAGTGATGTAAGCTGTGAATCAGGTGTAACCACTGATTCATCCGAAGGA 537
Query 538 TGTGAAGATTCTGACGTGGAAGATCAGAGATGGACATCTCTTCAGTTTGCTGAAGTCACT 597
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 TGTGAAGATTCTGACATGGAAGATCAGAGATGGACATCTCTTCAGTTTGCTGAAGTCACT 597
Query 598 GCTGTCTTGAAGAATTTTATGAGGTTGTCATCAAAGTCGTGTAGTAGATGCAAAGGAATT 657
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
Sbjct 598 GCTGTCATGAAGAATTTTATGAGGTTGTCATCAAAGTCGTGTAATAGATGCAAAGCAGTA 657
Query 658 AATCCTAAACTCGAGAAGCCTATGTTCGGATGGGTTCGCATGAGAGCAATGAAA-GACTC 716
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||
Sbjct 658 AATCCTCAACTAGAGAAGCCTATGTTCGGATGGGTTCGCATGAAAGCAATGAAAGGA-TC 716
Query 717 CGATGTTGGAGCTAATGTCATTCGAGGGCTTAAGCTAAAGAAGTCCACTAGCAGTGTTGA 776
||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 CGACATTGTAGCTAATGTAATTCGAGGGCTTAAGCTAAAGAAGTCCACTAGCAGTGTTGA 776
Query 777 AAATCCAGATGGCTTTGATGATAGTGGCATTGATGCATTATCAGAAGTTGAAGATGGTGA 836
||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 AAATCCAGATGACTTTGATGATAGTGGCATCGATGCATTATCAGAAGTTGAAGATGGTGA 836
Query 837 TAAAGAGACAAGAGAAAAGTCCACGGAAGTAGCTG-CAGAGTTTGAAGAGCAT----A-A 890
||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| | |
Sbjct 837 TAAAGAGACAAGAGAAAAGTCTACAGAAGTAG-TGAAAGAGTTTGAAGAGCATAACAATA 895
Query 891 -TTCTAAAAGAGACCTTTTACCGAGTGAGGTCA-GGAATATCTTAAAACATCTGTGGCAG 948
|||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||
Sbjct 896 GTTCTAAAAGAGACCTTTTGCCGACTGAGGTCAGGGAA-ATCTTAAAAGATCTGTGGGAG 954
Query 949 AATGAGCACGAGTTTTGCTCCTTCATTGGTGATCTTTGGCAGAGTGGGTCTGAAAAAATT 1008
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 955 AATGAGCACGACTTTTGCTCCTTCATTGGTGATCTTTGGCAGAGTGGATCTGAAAAAATT 1014
Query 1009 GACTACTCTATGttttttttGGAGAGTGTTCTTGTGCCCCCTACTAAATTTAGACCTCCA 1068
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 1015 GACTACTCTATGTTCTTTTTGGAGAGTGTTCTAGTGCCCCCTATTAAATTTAGACCTTCA 1074
Query 1069 ACAACAGGAGGTGATAGTGTTATGGAACATCCTCAAACCGTAGGACTAAATAAGGTCATA 1128
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1075 ACAAAAGGAGGTGATAGTGTTATGGAACATCCTCAAACCGTAGGACTAAATAAGGTCTTA 1134
Query 1129 GAATCCAATAATA-TACTCGGGAATGCCTGTACTAACAAATTAGATCAGTCGAAGGTAAT 1187
| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1135 GGTTCCAAT-ATACAACTCGGGAATGCGTGTACTAACAAATTAGATCAGTCTAAGATAA- 1192
Query 1188 TTTC-AGATGGAGGAATCTTCAAGAATCAGTCAATGTCTTGTTTGATAGCAAAACTGCCA 1246
|||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1193 TTTCTAGATGGATGAATCTTCAAGAATCAGTCAATGTCTTGTTTGATAGCAAAACTGCGA 1252
Query 1247 CAGTTCAAAGCCAGAGAGACAGCTCTGGAATATGTCAATTGCTGGAGAAGAAAGAGGGGC 1306
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1253 CAGTTCAAAGCCAGAGAGAGGGCTCTGGAATATGTCAATTGCTGGAGAAGAAAGAGGGAC 1312
Query 1307 TATTTCGGCAAAAAATGATGGGAAAGAGAGTGAATCATGCGTGCAGATCTGTGATATCTC 1366
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1313 TATTTCGGCAAAAAATGATGGGAAAGAGAGTGAATCATGCATGCAGATCTGTGATATCTC 1372
Query 1367 CAGATCCTTATATCGCTGTTAATGACATCGGAATTCCTCCTTGTTTTGCTTTGAAATTGA 1426
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 CAGATCCTTATATCGCTGTTAATGACATTGGAATTCCTCCTTGTTTTGCTTTGAAATTGA 1432
Query 1427 CGTATCCCGAGAGGGTGACTCCTTGGAATGTGGAGAAGTTAAGGGAAGCTATCATTAATG 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 CGTATCCCGAGAGGGTGACTCCTTGGAATGTGGAGAAGTTAAGGGAAGCTATCATTAATG 1492
Query 1487 GTCCTGACATTCATCCTGGAGCTACACATTACTCTGACAAATCATCTACAATGAAGTTGC 1546
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 1493 GTCCTGATATTCATCCTGGAGCTACACATTACTCTGACAAATTATCTACAGTGAAGTTGC 1552
Query 1547 CCTCTACCGAAAAAGCACGAAGGGCAATTGCAAGAAAATTACTGTCCTCACGAGGAGCCA 1606
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CTTCTACCGAAAAAGCACGAAGAGCAATTGCAAGAAAATTACTGTCCTCACGAGGAGCCA 1612
Query 1607 CTACAGAACTTGGGAAAACTTGTGATATCAACTTTGAAGGTAAAACTGTCCATCGACATA 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 CTACAGAACTTGGGAAAACTTGTGATATCAACTTTGAAGGTAAAACTGTCCATCGACATA 1672
Query 1667 TGCGAGATGGTGACATCGTCCTTGTGAATCGTCAGCCAACATTACATAAACCTAGCTTAA 1726
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 TGCGAGATGGTGACGTCGTCCTTGTGAATCGTCAGCCAACATTACATAAACCTAGCTTAA 1732
Query 1727 TGGCGCACAAGGTCCGTGTTCTGAA-GGGGGAGAAAACACTTCGTCTCCACTATGCAAAT 1785
||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733 TGGCGCACATCGTCCGTGTTCT-AAGGGGGGAGAAAACACTTCGTCTCCACTATGCAAAT 1791
Query 1786 TGCAGTACATACAATGCAGATTTTGATGGTGATGAGATGAATGTGCATTTTCCACAAGAT 1845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 TGCAGTACATACAATGCAGATTTTGATGGTGATGAGATGAATGTGCATTTTCCACAAGAT 1851
Query 1846 GAGATTTCACGTGCTGAGGCCTACAATATTGTCAATGCTAACAACCAATATGCTAGGCCT 1905
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 GAGATTTCACGTGCTGAGGCCTACAATATTGTCAATGCTAACAACCAATATGCTAGGCCC 1911
Query 1906 TCTAATGGCGAGCCACTTCGAGCTTTAATTCAGGATCATATTGTCAGTTCCGTTTTGCTT 1965
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1912 TCTAATGGCGATCCACTTCGAGCTTTAATTCAGGATCATATCGTCAGTTCCGTTTTGCTT 1971
Query 1966 ACTAAAAGGGACACATTTTTGGACAAAGATCATTTTAATCAGCTTCTCTTCAGTTCCGGT 2025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 ACTAAAAGGGACACATTTTTGGACAAAGATCATTTTAATCAGCTTCTCTTCAGTTCCGGT 2031
Query 2026 GTCACTGACATGGTACTCAGTACTTTTTCTGGAAGATCTGGCAAGAAAGTCATGGTATCA 2085
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 GTGACTGACATGGTACTCAGTTCTTTTTCTGGAAGATCTGGCAAGAAAGTCATGGTATCA 2091
Query 2086 GCTTCTGATGCAGAACTGTTGACAGTCACGCCTGCTATTTTGAAGCCAGTGCCTCTTTGG 2145
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2092 GCTTCTGATGCAGAACTGTTGACAGTCACGCCTGCTATTTTGAAACCAGTGCCTCTTTGG 2151
Query 2146 ACTGGGAAGCAGGTCATCACTGCAGTGTTGAATCAGATAACCAAAGGTCACCCGCCTTTC 2205
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2152 ACTGGGAAGCAGGTCATCACTGCAGTGTTGAATCAGATAACCAAAGGTCACCCGCCGTTC 2211
Query 2206 ACCGTAGAGAAAGCTACCAAACTTCCAGTTGATTTCTTCAAATGTAGATCTAGAGAAGTA 2265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 ACCGTAGAGAAAGCTACCAAACTTCCAGTTGATTTCTTCAAATGTAGATCTAGAGAAGTA 2271
Query 2266 AAACCTAACAGTGGAGATTTGACCAAAAAGAAAGAGATTGACGAGTCATGGAAACAGAAT 2325
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 AAACCTAACAGTGGAGATTTGACCAAAAAGAAAAAGATTGACGAGTCATGGAAACAGAAT 2331
Query 2326 CTTAATGAAGATAAATTGCACATCAGAAAAAATGAATTCGTCTGCGGTGTGATCGACAAG 2385
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 2332 CTTAATGAAGATAAATTGCTCATCAGAAAAAATGAATTTGTCTGCGGTGTGATTGACAAG 2391
Query 2386 GCTCAGTTTGCTGACTATGGGCTGGTTCATACAGTGCATGAGCTTTATGGTTCAAATGCT 2445
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 GCTCAGTTTGCTGACTATGGGTTGGTTCATACAGTGCATGAGCTTTATGGTTCAAATGCT 2451
Query 2446 GCAGGAAATCTGCTCTCTGTTTTTAGTCGTCTCTTTACAGTCTTTCTTCAGACCCACGGT 2505
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2452 GCAGGAAATCTGCTCTCCGTTTTTAGTCGTCTCTTTACAGTCTTTCTTCAGATTCACGGT 2511
Query 2506 TTCACCTGTGGCGTTGATGATCTTATTATTTTAAAAGATATGGATGAAGAGAGGACGAAG 2565
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 TTCACCTGTGGAGTTGATGATCTTATTATTTTAAAAGATATGGATGAAGAGAGGACGAAG 2571
Query 2566 CAACTTCAAGAATGTGAAAATGTTGGTGAAAGAGTACTCCGTAAAACCTTTGGCATAGAT 2625
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2572 CAACTTCAAGAGTGTGAAAATGTTGGTGAAAGAGTACTCCGTAAGACCTTTGGCATAGAT 2631
Query 2626 GTTGATGTTCAGATAGATCCTCAGGACATGAGATCCAGAATAGAACGAATTCTTTATGAG 2685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 GTTGATGTTCAGATAGATCCTCAGGACATGAGATCCAGAATAGAACGAATTCTTTATGAG 2691
Query 2686 GACGGGGAATCTGCTTTGGCATCTTTGGACAGGAGCATCGTAAATTATCTCAACCAGTGT 2745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 2692 GACGGGGAATCTGCTTTGGCATCTTTGGACAGGAGCATCGTAAATGATCTCAATCAGTGT 2751
Query 2746 TCAAGCAAGGGTGTGATGAACGATTTACTGTCTGATGGGTTACTAAAAACACCTGGAAGG 2805
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |
Sbjct 2752 TCAAGCAAGGGTGTGATGAACGATTTGCTGTCTGATGGGTTACTGAAAACACCCGGAATG 2811
Query 2806 AATTGTATATCGCTAATGACGATATCTGGGGCTAAGGGCAGTAAGGTTAACTTCCAGCAA 2865
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2812 AATTGTATATCGCTAATGACTATATCTGGGGCTAAGGGCAGTAAGGTCAACTTCCAGCAA 2871
Query 2866 ATCTCTTCACACCTTGGCCAGCAAGATTTAGAAGGAAAAAGAGTTCCCCGAATGGTTTCT 2925
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 ATCTCTTCGCATCTTGGCCAGCAAGATTTAGAAGGAAAAAGAGTTCCCCGAATGGTTTCT 2931
Query 2926 GGGAAGACATTACCTTGTTTCCATCCATGGGACTGGTCCCCTAGAGCTGGGGGATTTATT 2985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 GGGAAGACATTACCTTGTTTCCATCCATGGGACTGGTCCCCTAGAGCTGGGGGATTTATT 2991
Query 2986 AGTGACAGATTCCTAAGTGGTCTTCGCCCCCAAGAATATTACTTCCATTGCATGGCTGGA 3045
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2992 AGTGACAGATTCCTTAGTGGTCTTCGCCCCCAAGAATATTACTTCCATTGCATGGCTGGA 3051
Query 3046 CGAGAAGGGTTAGTTGATACTGCAGTGAAGACATCGCGTAGTGGGTATCTGCAAAGATGC 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3052 CGAGAAGGGTTAGTTGATACTGCAGTGAAGACATCGCGTAGTGGGTATCTGCAAAGATGC 3111
Query 3106 TTGATGAAAAATCTTGAGAGTCTTAAAGTCAACTATGATTGTACTGTCCGGGATGCTGAT 3165
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3112 TTGATGAAAAATCTTGAGAGCCTTAAAGTCAACTATGATTGTACTGTCCGGGATGCTGAC 3171
Query 3166 GGGTCCATCATTCAGTTCCAATATGGTGAAGATGGTGTGGATGTTCATCGGTCTAGCTTC 3225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3172 GGGTCCATCATTCAGTTCCAATATGGTGAAGATGGTGTGGATGTTCATCGGTCTAGCTTC 3231
Query 3226 ATTGAAAAGTTCAAAGAACTGACAATAAATCAAGATATGGTCCTTCAAAAATGCAGTGAA 3285
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3232 ATTGAAAAGTTCAAAGAACTGGCAATAAATCAAGATATGGTCCTTCAAAGATGCAGTGAA 3291
Query 3286 GACATGCTATCTGGAGCTAGTAGTTACATCAGTGATCTGCCTATTAGTCTTAAGAAGGGA 3345
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3292 GACATGCTATCTGGAGCCAGTAGTTACATCAGTGATCTGCCTATTAGTCTTAAGAACGGA 3351
Query 3346 GCTGAGAAGTTTGTAGAGGCAATGCCTATGAATGAACGTATTGCTTCTAAATTTGTGAGA 3405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3352 GCTGAGAAGTTTGTAGAGGCAATGCCTATGAATGAACGTATTGCTTCTAAATTTGTGAGA 3411
Query 3406 CAAGAAGAACTACTGAAGCTGGTGAAGTCAAAATTCTTTGCAAGTCTTGCGCAGCCAGGG 3465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3412 CAAGAAGAACTACTGAAGCTGGTGAAGTCAAAATTCTTTGCAAGTCTTGCGCAGCCAGGG 3471
Query 3466 GAGCCTGTAGGTGTACTTGCTGCTCAATCTGTAGGAGAGCCATCAACACAGATGACGTTG 3525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3472 GAGCCTGTAGGTGTACTTGCTGCTCAATCTGTAGGAGAGCCATCAACACAGATGACGTTG 3531
Query 3526 AATACTTTCCATCTTGCTGGACGTGGAGAGATGAATGTGACACTTGGAATTCCACGTTTA 3585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3532 AATACTTTCCATCTTGCTGGACGTGGAGAGATGAATGTGACACTTGGAATTCCACGTTTA 3591
Query 3586 CAAGAGATTTTGATGACAGCTGCAGCAAACATTAAGACACCAATAATGACATGCCCGTTG 3645
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3592 CAAGAGATTTTGATGACAGCTGCAGCAGACATTAAGACACCAATAATGACATGCCCGTTG 3651
Query 3646 CTGAAAGGCAAAACAAAGGAGGATGCAAATGATATTACTGATAGGTTGAGGAAGATAACG 3705
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||
Sbjct 3652 CTGAAAGGCAAAACAAAGGAGGATGCAAATGATATCACTGGTAAGTTGAGGAAGATTACG 3711
Query 3706 GTGGCAGATATAATAAAGAGCATGGAACTGTCAGTTGTACCATATACGGTTTATGAGAAT 3765
|||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3712 GTGGCAGATATAATAAAGAGTATGGACCTTTCAATTGTACCATATACGGTTTATGAGAAT 3771
Query 3766 GAAGTTTGTAGTATTCACAAGCTTAAGATAAATCTCTATAAGCCAGAGCATTATCCGAAG 3825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3772 GAAGTTTGTAGTATTCACAAGCTTAAGATAAATCTCTATAAGCCAGAGCATTATCCGAAG 3831
Query 3826 CACACCGATATCACTGAAGAAGACTGGGAAGAGACGATGAGGGCTGTATTTTTAAGGAAG 3885
||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||
Sbjct 3832 CACACTGATATCACCGAAAAAGACTGGGAAGAGACGATGACGGTTGTGTTTTTGAGGAAG 3891
Query 3886 TTGGAGGACGCTATAGAGACCCACATGAAAATGCTCCATAGAATAAGGGGCATACACAAT 3945
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3892 TTGGAGGACGCTATAGAGATCCACATGAAAATGCTCCATAGAATAAGGGGCATATGCAAT 3951
Query 3946 GATGTCACAGG-TCCA-ATAGCTGGAAATGAAACTGATAATGATGATTCTGTAAGTGGAA 4003
|| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3952 GA---CA-AGGGTCCAGA-AGCTGGAAATGAAACTGATAATGATGATTCTGTAAGTGGAA 4006
Query 4004 AGCAGAATGAAGATGATGGTGATGATGATGGCGAGGGTACAGAAGTTGATGATCTTGGTT 4063
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4007 AGCAGAATAAAGATGATGGTGATGATGATGGCGAGGGTACAGAGGTTGATGATCTTGGTT 4066
Query 4064 CAGATGCACAGAAACAGAAGAAACAAGAAACAGATGAGATGGATTATGAGGAAAACTCTG 4123
||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4067 CAGATGCACAGAAGCAGAAGAAACAAGCAACAGATGAGATGGATTATGAAGAAAACTCTG 4126
Query 4124 AAGATGAGACGAACGAACCATCTTCAATCAGTGGAGTAGAGGACCCTGAGATGGATAGTG 4183
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4127 AAGATGAAACGAACGAACCATCGTCAATCAGTGGAGTAGAGGACCCTGAGATGGATAGTG 4186
Query 4184 AGAATGAGGACACAGAAGTTAGCAAGGAAGATACTCCGGAACCGCAGGAAGAG-----T- 4237
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4187 AGAATGAGGACGCAGAAGTTAGCAAGGAAGATACTCCGGAACCGCAGGAAGAGGCAGATG 4246
Query 4238 ----C-----------TATGGAACCTCAAAAAGAGGTAAAAGGGGTAAAGAATGTCAAAG 4282
| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4247 TTAGCAAGGAAGAGACTATGGAACCACAAAAAGAGGTAAAAGCGGTAAAGAATGTCAAAG 4306
Query 4283 AACAGAGTaaaaaaaaGAGACGGAAATTTGTTCGAGCTAAAAGTGACAGACATATCTTTG 4342
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4307 AACAGAGTAAAAAAAAGAGACGGAAATTTGTTGGAGTTAAAAGTGACAGACATATCTTCG 4366
Query 4343 TGAAAGGTGAAGGAGAGAAATTTGAGGTCCATTTCAAGTTTGCTACAGATGACCCTCATA 4402
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4367 TGAGAGGTGAAGGAGAGAAATTTGAGGTCCATTTCCAGTTTGCTACAGATGACCCTCATA 4426
Query 4403 TTTTACTTGCCCAGATTGCTCAACAAACGGCGCAGAAGGTTTACATCCAGAATTCTGGGA 4462
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4427 TTTTACTTGCCCAGATTGCTCAAAAAACAGCGCAGAAGGTTTACATCCAGAATTCTGGGA 4486
Query 4463 AGATTGAACGATGCACAGTGGCTAATTGTGGTGATCCTCAGGTGATCTACCATGGAGACA 4522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4487 AGATTGAACGATGCACAGTGGCTAATTGTGGTGATCCTCAGGTGATCTACCATGGAGACA 4546
Query 4523 ATCCAAAGGAGAGAAGAGAAATATCCAACGATGAAAAGAAAGCCTCACCAGCTCTCCACG 4582
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4547 ATCCAAAGGAGAGAAGAGAAATATCCAACGATGAAAAGAAAGCCTCGCCAGCTCTCCACG 4606
Query 4583 CATCAGGAGTTGATTTCCCTGCACTGTGGGAATTCCAAGATAAACTTGACGTCAGGTACT 4642
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4607 CATCAGGAGTTGATTTCCCTGCACTCTGGGAATTCCAAGATAAACTTGACGTCAGGTACT 4666
Query 4643 TGTATAGCAACAGCATTCACGATATGCTCAACATTTTTGGAGTTGAAGCAGCTAGAGAAA 4702
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4667 TGTACAGCAACAGCATTCACGATATGCTCAACGTTTTTGGAGTTGAAGCAGCTAGAGAAA 4726
Query 4703 CAATAATCAGGGAAATAAACCACGTCTTCAAATCATATGGCATTTCTGTAAGCATCAGAC 4762
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4727 CAATAATCAGGGAAATAAACCATGTCTTCAAATCATATGGTATTTCTGTAAGCATCAGAC 4786
Query 4763 ACTTGAACCTCATTGCAGATTATATGACCTTTTCCGGTGGATACCGACCAATGAGCCGTA 4822
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4787 ACTTGAACCTCATTGCGGATTATATGACCTTTTCTGGTGGATACCGACCAATGAGCCGTA 4846
Query 4823 TGGGAGGAATTGCAGAATCAACTTCACCATTCTGCAGAATGACTTTTGAAACAGCCACTA 4882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4847 TGGGAGGAATTGCAGAATCAACTTCACCATTCTGCAGAATGACATTTGAAACAGCCACTA 4906
Query 4883 AGTTCATTGTCCAAGCAGCTACTTATGGAGAAAAGGACACATTAGAAACCCCCTCTGCTA 4942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4907 AGTTCATTGTCCAAGCAGCTACTTATGGAGAAAAGGACACATTAGAAACTCCCTCTGCTA 4966
Query 4943 GAATCTGTCTTGGCTTGCCTGCGCTTTCAGGAACTGGATGCTTCGATTTGATGCAGAGAG 5002
|||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4967 GAATCTGTCTCGGCTTGCCCGCGCTTTCAGGAACCGGATGCTTCGATTTGATGCAGAGAG 5026
Query 5003 TGGAGCTCTGA 5013
|||||||||||
Sbjct 5027 TGGAGCTCTGA 5037
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189755058978
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5