BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G59020.2
Length=3943
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486363 jgi|Araly1|486363|fgenesh2_kg.5__2355__AT3G59020.2 5906 0.0
> Ahg486363 jgi|Araly1|486363|fgenesh2_kg.5__2355__AT3G59020.2
Length=3664
Score = 5906 bits (3198), Expect = 0.0
Identities = 3519/3671 (96%), Gaps = 34/3671 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACcttcttctcttatacctctctctctctttcgtcttcgtcgtctcttcttcctcctga 60
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1 GACCTTCTTCTCTTATA-C-CTCTCTCTCTTTCGTCTTCGTCGTCTCTTCTTCCTCTTGA 58
Query 61 tttgactctctcgagtctcgtcgATTTCCTCCGGGAGGAGACTTGAAATTCGTGACTTTC 120
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 59 TTTGA--CTCTC--GTCTCGTCGATTTCCTCCGGGAGGAGACTCGAAATTCGTGACTTGC 114
Query 121 CGATTGTGAATTCCCCGATGGATCTGCCTAGCCTCGCTTTAATCGTTGGCGCGGCTGCTT 180
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 115 CGATTGTGAATTTCCCGATGGATCTGCCTAGCCTTGCCTTAATCGTTGGCGCGGCTGCTT 174
Query 181 TCAGTCCCAATCCTGACGAGCGCAGAGCTGCTGAGCAGAGCCTTAATCAGTTGCAGCACA 240
||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 TCAGTCCCAATCCCGATGAGCGTAGAGCTGCTGAGCAGAGCCTTAATCAGTTGCAGCACA 234
Query 241 CTCCACAGCATTTGATAAGGATATTGCAAATAATTGTTGATGGTGGCTCTGATCTTTCTG 300
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 CTCCACAGCATTTGATAAGGATACTGCAAATAATTGTTGATGGTGGCTCTGATCTTTCTG 294
Query 301 TACGCCAATCTGCTAGTATCCATTTCAAGAATTTCATTGCTAAGCACTGGGAACCTCATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 TACGCCAATCTGCTAGTATCCATTTCAAGAATTTCATTGCTAAGCACTGGGAACCTCATT 354
Query 361 CTGGTGACCAGAACATAATCTTGCCAAGTGATAAGAATGTTGTCAGGAACCAGATTCTTG 420
||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 355 CTGGTGATCAGAACAAAATCTTGCCTAGTGATAAGAATGTTGTCAGGGACCAGATTCTTG 414
Query 421 TATTTGTCTCTCAAGTGCCCCCGATTTTGAGAGTTCAGATGGGAGAGTGCCTGAAGACCA 480
||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 TATATGTCTCTCAAGTTCCTCCGATTTTGAGAGTTCAGATGGGAGAGTGCCTGAAGACCA 474
Query 481 TAATTTACGCTGACTATCCTGAGCAATGGCCCGAACTCCTGGACTGGGTGAAGCAAAACT 540
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 475 TAATTTACGCTGACTATCCTGAGCAATGGCCCCATCTCCTCGACTGGGTGAAGCACAACT 534
Query 541 TGCAAAAACCACAAGTTTATGGAGCGCTATTTGTCTTGAGGATACTATCTTCAAAATACG 600
||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 TGCAAGAACAAGAAGTTTATGGAGCGCTATTTGTCTTGAGGATACTATCTTCAAAATACG 594
Query 601 AGTTTAAGTCAGATGAAGATAGGGCACCCATTCACCGAGTAGTCGAGGAGACTTTTCCCC 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 595 AGTTTAAGTCAGATGAAGATAGGGCACCCATTCACCGAGTAGTCGAGGAGACGTTTCCGC 654
Query 661 ACCTGTTGAACATATTTAACAATCTTGTCCATGTTGAAAATCCTTCTCTCGAAGTGGCAG 720
|||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 ACCTTTTGAATATATTTAACAAACTTGTCCATGTTGAAAATCCTTCTCTCGAAGTGGCAG 714
Query 721 ACCATATCAAGCTTATTTGCAAGATATTCTGGTCATGTATTTATCTAGAGCTTCCGAGAC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 ACCATATCAAGCTTATTTGCAAGATATTCTGGTCATGTATTTATCTAGAGCTTCCGAGAC 774
Query 781 CATTGTTTGATCCAAACTTTTTTAATGCTTGGATGGGTCTGTTCCTAAACATTTTGGAAC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 CATTGTTTGATCCAAACTTTTTTAATGCTTGGATGGGTCTGTTCCTAAACATTTTGGAAC 834
Query 841 GTCCTGTTCCCGTAGAAGGCCAGCCTGAAGACCCTGAGCTTAGAAAATCCTGGGGATGGT 900
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 GTCCTGTTCCCGTAGAAGGTCAGCCTGAAGACCTTGAGCTTAGAAAATCCTGGGGATGGT 894
Query 901 GGAAGGCCAAGAAGTGGATTGCTCATATCTTAAACAGGCTATACACTCGGTTTGGAGATC 960
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 GGAAGGCCAAGAAGTGGGTTGCTCATATCTTAAACAGGCTATACACTCGGTTTGGAGATC 954
Query 961 TGAAACTCCAGAATCCAGATAACAAAGCCTTTGCTCAAATGTTCCAGATAAACTATGCAG 1020
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 955 TGAAACTCCAGAATCCAGATAACAAAGCCTTCGCCCAAATGTTCCAGATGAACTACGCAG 1014
Query 1021 CCAAGATATTAGAGTGCCACCTGAAATTGTTGAATGCCATTCGTATAGGTGGATATCTTC 1080
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1015 CCAAGATATTAGAGTGCCACCTGAAATTATTGAATGCCATTCATATTGGTGGATATCTTC 1074
Query 1081 CGGATAGAGTCATCAACCTAATTCTTCAATATCTAAGCAACAGTATCTCGAAGAGTAGCA 1140
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1075 CGGATAGAGTCATCAATCTAATTCTTCAATATCTAAGCAACAGTATCTCGAAGAATAGCA 1134
Query 1141 TGTACAACTTACTGCAGCCCCACCTTAACACTCTCCTATTTGAAATAGTTTTCCCACTTA 1200
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1135 TGTACAACTTACTGCAGCCCCACCTTGACACTCTATTATTTGAAATAGTTTTCCCACTAA 1194
Query 1201 TGTGTTTCAATGATAATGATCAAATGCTTTGGGATGAAGACCCGCATGAGTATGTAAGGA 1260
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1195 TGTGTTTCAATGACAATGATCAAATGCTTTGGGATGAAGACCCACATGAGTATGTAAGGA 1254
Query 1261 AGGGTTATGATATAATTGAAGATTTATACAGTCCCAGGACTGCGTCTATGGACTTTGTGA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 AGGGTTATGATATAATTGAAGATTTATACAGTCCCAGGACTGCGTCTATGGACTTTGTGA 1314
Query 1321 CTGAGCTGGTCAGAAAGCGTGGAAAAGAAAACTTCCCAAAATTTATACAGTTCGTTGTGG 1380
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1315 CTGAGCTGGTCAGAAAGCGTGGAAAAGACAACTTCCCAAAATTTATACAGTTCATCGTGG 1374
Query 1381 ACATTTTTAAGAGATATAATGAAGCATCTCTGGAAAACAAGCCTTATCGCCTTAAGGATG 1440
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 ACATTTTTAAGAGATATACTGAAGCACCTCTGGAAGATAAGCCTTATCGCCTTAAGGATG 1434
Query 1441 GTGCTCTGCTTGCTGTTGGGACACTTTGTGATAAACTTAGGCAAACTGAACCCTACAAAT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1435 GTGCTCTGCTTGCTGTTGGGACACTTTGTGATAAACTTAGGCAAAATGAACCCTACAAAT 1494
Query 1501 CTGAGCTGGAGAATATGTTAGTGCAACATGTTTTTCCTGAATTTAGCAGCCCAGCTGGTC 1560
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1495 CTGAACTGGAGAATATGTTAGTGCAACATGTTTTTCCTGAATTTAGCAGCCCGGCTGGTC 1554
Query 1561 ATCTTAGAGCTAAGGCTGCGTGGGTTGCAGGGCAGTACGCCAATATCGATTTCTCAGACC 1620
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1555 ATCTTAGAGCTAAGGCTGCATGGGTTGCAGGGCAGTACGCCCATATCAATTTCTCAGACC 1614
Query 1621 AGAGCAATTTTTCAAAGGCATTGCATTGTGTTATCTCCGGAATGTGTGATCTAGAACTTC 1680
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 1615 AGAGCAATTTTTCAAAGGCATTGCATTGTGTTATCTCCGGAATGCGTGATCCAGAACTTC 1674
Query 1681 CTGTTCGGGTGGATTCAGTTTTTGCTTTGCGTTCATTTATTGAAGCCTGCAAAGATTTAG 1740
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1675 CTGTTCGGGTGGATTCAGTTTTTGCTTTGCGTTCCTTTATTGAAGCCTGCAAAAATTTAG 1734
Query 1741 ATGAAATCCGCCCAGTTCTTCCTCAACTTCTTGATGAATTTTTCAAGCTAATGAAGGAAG 1800
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1735 ATGAAATCCGCCCAGTTCTTCCCCAACTTCTTGATGAATTTTTCAAGCTAATGAATGAAG 1794
Query 1801 TTGAAAACGAAGACCTTGCTTTTACATTAGAGACTATTGTGTATAAGTTTGGAGAGGAGA 1860
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 TTGAAAACGAAGACCTTGCTTTTACTTTAGAGACTATCGTGTATAAGTTTGGAGAGGAGA 1854
Query 1861 TTTCTCCGTATGCTTTGGGTTTGTGCCAAAACTTGGCCAGTGCTTTCTGGAGGTGTATCG 1920
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1855 TTTCTCCTTATGCTTTGGGTTTGTGCCAAAACTTGGCCAGTGCATTCTGGAGGTGTATCG 1914
Query 1921 ACACTGACAACGGTGATGATGAAACTGATGATGCTGGTGCATTGGCTGCAGTGGGATGTC 1980
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 ACACTGACAATGGTGATGATGAAGCTGATGATGCTGGTGCATTGGCTGCAGTGGGATGTC 1974
Query 1981 TCCGTGCCATCAGTACCATTCTTGAATCTATCAGTAGTCTCCCTCATCTTTATGGTCAGA 2040
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 TCCGTGCCATTAGTACCATTCTTGAATCTATCAGTAGTCTCCCTCATCTTTATGGTCAGA 2034
Query 2041 TTGAACCACAGTTACTGCCAATAATGCGGAAAATGCTGACAACTGATGGTCAAGATGTGT 2100
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 TTGAACCACAGTTGCTGCCAATAATGCGGAAAATGCTGACAACTGATGGTCAAGATGTGT 2094
Query 2101 TTGAAGAGGTTCTGGAGATCGTCTCATATATTACTACTTTTTCACCTACAATATCATTGG 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 TTGAAGAGGTTCTGGAGATCGTCTCATATATTACTACTTTTTCACCTACAATATCATTGG 2154
Query 2161 AGATGTGGAGTCTATGGCCTTTAATGATGGAAGCACTCGTGGATTGGGCTATTGACTTTT 2220
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 ACATGTGGAGTCTATGGCCTTTAATGATGGAAGCACTCGTGGATTGGGCTATTGACTTTT 2214
Query 2221 TCCCAAATATATTGGTCCCGTTGCACAACTATATATCCAGGGGGACTGGGCATTATCTTA 2280
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2215 TCCCAAATATATTGGTCCCGCTGCACAACTATATATCCAGGGGGACTGGGCATTATCTCA 2274
Query 2281 CTTGCAAGGAACCAGATTACCAGCAAAATCTTTGGAATGTGATATCTGTGCTTATGGCGA 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2275 CTTGCAAGGAACCAGATTACCAGCAAAATCTTTGGAATGTGATCTCTGTGCTTATGGCAA 2334
Query 2341 ATAAAAATATTGATGACAGTGACCTCGAGCCAGCTCCGAAGCTATTAGGGATAGTGCTTC 2400
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 ATAAAAATATTGATGACAGTGACCTTGAGCCAGCTCCGAAGCTATTAGGGATAGTGCTTC 2394
Query 2401 AGACATGCAAGGGCCAGGTGGATCAATGGGTAGAACCCTACCTGAGAATCACACTTGATC 2460
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 AGACATGCAAGGGCCAGGTGGATCAATGGGTAGAGCCCTACCTGAGAATCACACTTGATC 2454
Query 2461 GGCTACGCGGTGCTGAGAAATCTTCCTTCAAGTGCCTTCTGGTTGAAGTGGTTGCAAATG 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 GGCTACGCGGTGCTGAGAAATCTTCCTTCAAGTGCCTTCTGGTTGAAGTGGTTGCAAATG 2514
Query 2521 CCTTTTACTACAATACCCCTTTGGCACTTGGCATACTGCAACGATTTGGTATCGCAACAG 2580
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 CCTTTTACTACAATGCCCCTTTGGCACTTGGCATACTGCAACGATTTGGTATCGCAACAG 2574
Query 2581 AAATTTTTACTCTATGGTTCCAAATGCTGCAAGAAAAGAAGAAGAGTGGTGCACGTTCTA 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2575 AAATTTTTACTCTATGGTTCCAAATGCTGCAAGAAAAGAAGAAGAGTGGCGCACGTTCTA 2634
Query 2641 ACTTCAAGAGAGAACATGATAAGAAAGTTTGCATCTTGGGGTTGACATCACTTTTCAGCC 2700
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2635 ACTTCAAGAGAGAAAATGATAAGAAAGTTTGCATCTTGGGGTTGACATCACTTTTCAATC 2694
Query 2701 TTCCAGCTGGTCAATTGCCTGGAGAGGTCTTGCCACATGTATTCAGGGCTCTTCTCGAGC 2760
|||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 TTCCAGCTGGTCAATTACCCGGAGAGGTTTTGCCACATGTATTCAGGGCTCTTCTCGAGC 2754
Query 2761 TTTTAGTGGCATACAAGGATCAACTTGCTGAAGCGGCAAAGGCAGAAGAGgaagaagaag 2820
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 TTTTAGTGGCATACAAGGATCAACTTGCTGAAGCTGCAAAGGCAGAAGAGGAAGAAGAAG 2814
Query 2821 atgaagatggtgatgatgacgacatggatgaattccaaacagatgatgaagatgaGGACG 2880
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 AAGAAGATGGTGATGACGACGACATGGATGAATTCCAGACAGATGATGAAGATGAGGACG 2874
Query 2881 GCGATGACGAGAATCCAGATGAAACTGATGGAAGTACACTCCGCAAGTTAGCAGCACAGG 2940
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875 GCGATGACGAGAATCCAGATGAGACTGATGGAAGTACACTCCGCAAGTTAGCAGCACAGG 2934
Query 2941 CAAAGGACTTCCGCTCTTACAGCGATGATGATGACTTTTCAGACGATGATTTTAGCGATG 3000
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 CAAAGGACTTCCGCTCTTACAGCGACGATGATGACTTTTCAGACGATGATTTTAGCGATG 2994
Query 3001 ACGAGGAATTAGAATCTCCAATTGATGAAGTGGATCCTTTCGTACTCTTCATGGATGCAG 3060
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 ACGAGGAATTAGACTCTCCAATTGATGAAGTGGATCCTTTCGTACTCTTCATGGATGCAG 3054
Query 3061 TCACAGCAATGCAAGTATCAGACTCGCCAAGGTTCCAAAGCCTTACCCAGACACTAGACC 3120
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 TCACAGCAATGCAAGTATCTGACTCGCCAAGGTTCCAAAGCCTTACCCAGACACTAGACC 3114
Query 3121 CGCACTACCATGGACTCGCAAGCACAATAGCTCAACACACGGAGCTGAGAAGAGCAGAGA 3180
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3115 CGCACTACCATGGACTCGCAAGCACAATAGCTCAGCACACGGAGCTGAGAAGATCCGAGA 3174
Query 3181 TTCTAAAGGAGAAACTTGAGAAGCAATCTTCTGCAACGGTTGCTTCCTGATTTTATCCAC 3240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 3175 TTCTAAAGGAGAAACTTGAGAAGCAATCTTCTGCAACGGTTGCTTCCTAATTTC-TCCAC 3233
Query 3241 GGCTCAGTCCTTGAAAAACCAA-TCGTTGGCGCTCTCAATTGGCTGCATTTTTTCATAAG 3299
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3234 GGCTCAGTCCTTGAAAAAACAAATCGTTGGCGCTCTCATTTGGCTGCATTTTTTCATAAG 3293
Query 3300 CCTCTTTATATTCCTCAAAAGTAGAGAGGCTTGTAGAGGTGAGTCTGGTCGACTCTCATT 3359
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3294 CCTCTTTATATCCCTCAAAAGTAGAGAGGCTTGTAGAGGTGAGTCTGGTCGACTCTCATT 3353
Query 3360 AGTCAGTTCATGTCTTAAGAGAGACCAATCTCTGCCATCTCCAGTTTTGCATTtcatcat 3419
|||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3354 AGTCTGT-CATGTCTTAAGAGAGACCAATCTCTACCATCTCCAGTTTTGCATTTCTTCAT 3412
Query 3420 catcatcatcatTCttt-ttttttGTTTTAATCATCCATAAGACCAACAAGACAAAAGAC 3478
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 3413 CATCATCATCATTCTTTCTTTTTTTTTTTAATCATCCAAAAGACCAGCAAGACAAAAGAC 3472
Query 3479 TAAACCCATTTCGGGTTTTCTTTATTTTATTTCATTTCAGACAGAACACAGAAACCCTTT 3538
||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||| ||| ||||||
Sbjct 3473 TAAACCCATTTCGGGTTC-CTTT-TTT-ATTT--T---AGACAGAACAGAGAT-CCCTTT 3523
Query 3539 GGGGGGTTTTATGTTCTCCGATTGGGATTTTGGAGGCATATATaaaaaaaaaGCACATAG 3598
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3524 GGGGGGTTTTATGTTCTCCGATTCGGATTTTGGAGGCAGATATAAAAAAA--GCACATAG 3581
Query 3599 tttttttttATTACTATTATCTATGTTTGTCACATTTATTATTGCTTGATTTGAGTCGTT 3658
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3582 TTTTTTTTTAT-------------GTTTGTCACATTTATTATTGCTTGATATGAGTCGTT 3628
Query 3659 CTTTACACTGT 3669
|||| ||||||
Sbjct 3629 CTTTGCACTGT 3639
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 149033455868
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5