BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G59100.1
Length=5766
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg938922 jgi|Araly1|938922|scaffold_503113.1 6501 0.0
Ahg325786 jgi|Araly1|325786|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001006 67.6 1e-09
> Ahg938922 jgi|Araly1|938922|scaffold_503113.1
Length=5845
Score = 6501 bits (3520), Expect = 0.0
Identities = 3710/3805 (98%), Gaps = 0/3805 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1956 GCCAAAACTATACGTTGGAAGAGGTATGCATGAGGACATGTTCTCTCTCTTCAAGTATAC 2015
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 GCCAAAACTATATGTTGGAAGAGGTATGCATGAGGACATGTTCTCTCTCTTCAAGTATAC 2074
Query 2016 CACCTTCTGGATCATGCTACTGATCAGCAAGCTTGCTTTCAACTATTATGTGGAGATACT 2075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2075 CACCTTCTGGATCATGCTACTGATCAGCAAGCTTGCTTTCAACTATTATGTGGAGATACT 2134
Query 2076 ACCCCTTATTACGCCAACAAAGATGATCATGAATCTGCACATTGGTCACTACCAGTGGCA 2135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 ACCCCTTATTACGCCAACAAAGATGATCATGAATCTGCACATTGGTCACTACCAGTGGCA 2194
Query 2136 TGAATTTTTTCCCCATGCAACTAACAATATTGGAGTGGTTATTGCTATATGGGCTCCAAT 2195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195 TGAATTTTTTCCCCATGCAACTAACAATATTGGAGTGGTTATTGCTATATGGGCTCCAAT 2254
Query 2196 TGTACTGGTTTACTTGATGGATACTCAAATATGGTACGCCATTTTTTCCACTCTGTTTGG 2255
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2255 TGTACTGGTTTACTTGATGGATACTCAAATATGGTACGCCATATTTTCCACTCTGTTTGG 2314
Query 2256 AGGCATACATGGGGCCTTCAGTCATCTGGGAGAAATACGGACTCTTGGGATGTTGCGATC 2315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2315 AGGCATACATGGGGCCTTCAGTCATCTGGGAGAAATACGGACTCTTGGGATGTTGCGGTC 2374
Query 2316 TAGATTTGAGTCAATACCAATTGCCTTCAGCCGCACCCTCATGCCATCCGAAGATGCAAA 2375
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2375 TAGATTTGAGTCAATACCAACTGCCTTCAGCCGCACCCTCATGCCATCAGAAGATGCAAA 2434
Query 2376 AAGAAAACATGCGGATGACTATGTGGACCAGAAAAACATCACTAATTTCTCCCAGGTGTG 2435
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2435 AAGAGAACATGCTGATGACTATGTGGACCAGAAAAACATCACTAATTTCTCCCAGGTGTG 2494
Query 2436 GAACGAGTTCATTTACTCTATGAGAAGCGAGGATAAGATCAGTGACAGAGATAGGGATTT 2495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2495 GAACGAGTTCATTTACTCTATGAGAAGCGAGGATAAGATCAGTGACAGAGATAGGGATTT 2554
Query 2496 GCTGCTTGTACCATCTTCGTCGGGTGATGTGTCTGTCATCCAGTGGCCACCTTTCTTGCT 2555
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2555 GCTGCTTGTACCTTCTTCTTCGGGTGATGTGTCTGTCATCCAGTGGCCACCTTTCTTGCT 2614
Query 2556 TGCTAGTAAGATTCCTATTGCTGTGGACATGGCAAAAGATTTCAAGGGAAAAGAGGATGC 2615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2615 TGCTAGTAAGATTCCTATTGCTGTGGACATGGCAAAAGATTTCAGGGGAAAAGAGGATGC 2674
Query 2616 TGAACTATTTAGAAAGATTAAGAGTGATAGCTACATGTATTATGCTGTTATTGAGAGTTA 2675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2675 TGAACTATTTAGAAAGATTAAGAGTGATAGCTACATGTATTTTGCTGTTATTGAGAGTTA 2734
Query 2676 TGAGACATTGAAGAAAATAATTTACGCTCTTCTGGAAGATGAAGCAGATAGAAGGGTCAT 2735
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2735 TGAGACATTGAAGAAAATAATTTACGCTCTACTGGAAGATGAAGCAGATAGAAGGGTCAT 2794
Query 2736 GAATCAGGTATTTTTAGAAGTGGACATGAGCATGCAGCAACAGAGATTCATATATGAATT 2795
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2795 GAATCAGGTATTTTTGGAAGTGGACATGAGCATACAGCAACAGAGATTCATATATGAATT 2854
Query 2796 CCGCATGAGTGGATTACCGCTCCTTAGTGATAAGCTGGAGAAGTTTCTAAGTATATTGTT 2855
||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2855 CCGGATGAGTGGATTGCCGCTCCTTAGTGATAAGTTGGAGAAGTTTCTAAGTATATTGTT 2914
Query 2856 AAGTGACTATGAAGACCAGGGTACATACAAGTCTCAGTTAATTAATGTCTTCCAGGATGT 2915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2915 AAGTGACTATGAAGACCAGGGTACATACAAGTCTCAATTAATTAATGTCTTCCAGGATGT 2974
Query 2916 TATCGAAATTATCACTCAAGATCTCTTGGTTAATGGGCATGAAATTCTTGAAAGGGCTCG 2975
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2975 TATCGAAATTATTACTCAAGATCTCTTGGTTAATGGGCATGAAATTCTTGAAAGGGCTCG 3034
Query 2976 TGTTCATTCTCCTGACATCAAAAATGAGAAAAAGGAACAGAGGTTTGAGAAAATTAATAT 3035
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GGTTCATTCTCCTGACATCAAAAATGATAAAAAGGAACAGAGGTTTGAGAAAATTAATAT 3094
Query 3036 CCACCTAGTACGGGATAGATGTTGGCGGGAAAAGGTTATTCGGCTTCATTTGCTCTTATC 3095
||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3095 TCACCTCGTAGGGGATAAATGCTGGCGGGAGAAGGTTATTCGACTTCATTTGCTCTTGTC 3154
Query 3096 GGTCAAAGAATCTGCAATAAATGTTCCTCAAAACTTGGAAGCCCGCCGACGTATCACATT 3155
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3155 GGTCAAAGAATCTGCAATAAATGTTCCTCAAAACTTGGAAGCTCGCCGCCGTATCACATT 3214
Query 3156 CTTTGCTAATTCTCTGTTTATGAATATGCCTAGTGCTCCAAGAATACGAGATATGCTATC 3215
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3215 CTTTGCTAATTCTCTGTTTATGAATATGCCTAATGCTCCAAAAATACGAGATATGCTATC 3274
Query 3216 TTTCAGTGTTTTAACTCCTTACTACAAAGAAGATGTGCTGTATTCAGAGGAAGACCTTAA 3275
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3275 TTTCAGTGTTTTAACTCCTTACTACAAAGAAGATGTTCTCTATTCAGAGGAGGACCTTAA 3334
Query 3276 CAAGGAAAATGAAGATGGGATCTCAATTCTGTTTTATCTACAAAAGATTTATCCTGATGA 3335
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3335 CAAGGAAAATGAAGATGGGATCTCAATACTGTTTTACCTACAAAAGATTTATCCTGATGA 3394
Query 3336 GTGGACCAATTATTTGGATCGCTTAAAGGATCCTAAGCTTCCTGAGAAAGACAAGTCAGA 3395
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3395 GTGGACCAATTATTTGGATCGCTTAAATGATCCTAAGCTTCCTGAGAAAGACAAGTCAGA 3454
Query 3396 GTTCCTTCGAGAGTGGGTATCTTACAGAGGTCAGACGTTAGCCAGAACAGTTAGGGGTAT 3455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3455 GTTCCTTCGAGAGTGGGTATCTTACAGAGGTCAGACGCTAGCCAGAACAGTTAGGGGTAT 3514
Query 3456 GATGTACTATAGACAGGCTCTGGAGCTTCAATGCTACCAGGAAGTTGCAGGGGAACAAGC 3515
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3515 GATGTACTATAGGCAGGCTTTGGAGCTTCAATGCTACCAGGAAGTTGCAGGGGAACAAGC 3574
Query 3516 CGAGTTTAGTGTCTTTCGGGCCATGGCGTCCAACGATGAAAATCAGAAGGCTTTCCTGGA 3575
||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 3575 CGAATTTAGTGTCTCCCGGGCCATGGCGTCCAATGATGATAATCAGAAAGCTTTCCTGGA 3634
Query 3576 ACGTGCCAGAGCTCTTGCAGATCTGAAGTTCACTTATGTTGTTTCTTGTCAGGTCTACGG 3635
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3635 ACGTGCTAAAGCTCTTGCAGATCTGAAGTTCACTTATGTTGTTTCTTGTCAGGTCTACGG 3694
Query 3636 AAATCAGAAAAAGTCCGGTGATATCCACAACCGCAGCTGCTACACGAATATTCTGCAGCT 3695
|||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3695 AAATCAGAAAAAGTCCAGTGATATTCACAACCGTAGTTGCTACACGAATATTCTGCAGCT 3754
Query 3696 CATGCTAAAATATCCATCATTGCGGGTTGCTTATGTAGATGAGAGGGAGGAGACAGCAGA 3755
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3755 CATGCTGAAATATCCATCATTACGGGTTGCTTATGTAGATGAGAGGGAGGGGACAGCAGA 3814
Query 3756 TGCAAAATCTCCGAAGGTCTTTTACTCTGTACTTCTAAAAGGAGGTGACAAGTTTGATGA 3815
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3815 TGCAAAATCTCCTAAGGTCTTTTACTCTGTACTTCTAAAGGGAGGTGACAAGTTTGATGA 3874
Query 3816 GGAAATTTACCGCATCAAGCTTCCTGGTCCTCCAGCTGAGATTGGTGAAGGAAAGCCTGA 3875
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3875 GGAAATTTACCGCATAAAGCTTCCTGGTCCTCCAGCTGAGATTGGTGAAGGAAAGCCTGA 3934
Query 3876 AAATCAAAATCATGCTATCATATTTACACGTGGTGAAGCACTACAAACTATAGATATGAA 3935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3935 AAATCAAAATCATGCTATCATATTTACACGTGGTGAAGCACTACAAACTATAGATATGAA 3994
Query 3936 TCAAGACAATTACTTTGAAGAAGCTTTCAAACTAAGAAATGTATTGGAGGAATTCAATAA 3995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3995 TCAAGACAATTACTTTGAAGAAGCTTTCAAACTAAGAAATGTATTGGAGGAATTCAATAA 4054
Query 3996 GGAGCGTGTTGGTAGACGCAAGCCAACAATATTGGGTCTCCGAGAACATATATTTACTGG 4055
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4055 GGAGCGTGTTGGTAGACGCAAGCCAACAATTTTGGGTCTCCGAGAACATATATTTACTGG 4114
Query 4056 AAGTGTTTCGTCATTAGCTTGGTTCATGTCCAATCAGGAGAGTAGTTTTGTGACAATTGG 4115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4115 AAGTGTTTCGTCATTAGCTTGGTTCATGTCCAATCAGGAGAGTAGTTTTGTGACAATTGG 4174
Query 4116 CCAAAGAATTTTGGCAAACCCTCTGAGGGTCCGTTTTCATTATGGTCATCCTGACATATT 4175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4175 CCAAAGAATTTTGGCAAACCCTCTGAGGGTCCGTTTTCATTATGGCCATCCTGACATATT 4234
Query 4176 TGACAGAATCTTTCACATAACAAGGGGCGGTGTGAGCAAGGCTTCGAAAGTAATAAATTT 4235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4235 TGACAGAATCTTTCACATAACAAGGGGCGGTGTGAGCAAGGCTTCGAAAGTAATAAACTT 4294
Query 4236 GAGTGAGGATATTTTCGGAGGCTTCAATTCAACTCTCCGTGGAGGATATGTTACACATCA 4295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4295 GAGTGAGGATATTTTCGGAGGCTTCAATTCAACTCTCCGTGGAGGATATGTTACACATCA 4354
Query 4296 CGAGTATATCCAAGTTGGAAAGGGACGGGACGTGGGGTTGAACCCAATCTCTATTTTTGA 4355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4355 CGAGTATATCCAAGTTGGAAAGGGACGGGACGTGGGGTTGAACCCAATCTCTATTTTTGA 4414
Query 4356 AGCAAAAGTAGCAAATGGAAACGGGGAGCAAACGCTAAGCCGTGATGTTTACCGTTTGGG 4415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4415 AGCAAAAGTAGCAAATGGAAACGGGGAGCAAACGCTAAGCCGTGATGTTTACCGTTTGGG 4474
Query 4416 GCATCGGTTTGACTTTTACAGGATGCTCTCATTCTATTTTACGACCATTGGATTCTATTT 4475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4475 GCATCGGTTTGACTTTTACAGGATGCTCTCATTCTATTTTACGACCATTGGATTCTATTT 4534
Query 4476 TAGTAGCATGCTCACCGTTCTTACTGTATATGCATTCCTGTATGGACGGATGTACATGGT 4535
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4535 TAGTAGCATGCTCACCGTTCTTACTGTATATGCATTCCTGTATGGACGTATGTACATGGT 4594
Query 4536 TATGAGCGGATTGGAGAAAGAGATTTTGAGACTCGCAAGCCCGAATCAGCTTGAGGCTCT 4595
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4595 TATGAGCGGATTGGAGAAAGAGATTTTGCGACTCGCAAGCCCGAATCAGCTTGAGGCTCT 4654
Query 4596 TGAGCAGGCTCTGGCTACACAGTCAATATTTCAGCTTGGTTTCTTGATGGTGTTACCGAT 4655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4655 TGAGCAGGCTCTGGCTACACAGTCAATATTTCAGCTTGGTTTCTTGATGGTGTTACCGAT 4714
Query 4656 GGTAATGGAGATTGGCTTGGAACACGGTTTTCGCTCTGCTATTGTCGATTTTTTCATAAT 4715
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4715 GGTAATGGAGATTGGCTTGGAACACGGTTTTCGCTCTGCTATAGTCGATTTTTTCATAAT 4774
Query 4716 GCAGCTGCAGCTAGCCTCGGTATTCTTTACATTCCAGCTTGGGACAAAGTCACATTATTA 4775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4775 GCAGCTGCAGCTAGCCTCGGTATTCTTTACATTCCAGCTTGGGACAAAGTCACATTATTA 4834
Query 4776 CGGGAGAACAATTTTACATGGTGGTTCCAAATATAGACCGACGGGCCGTGGGTTTGTTGT 4835
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4835 TGGGAGAACAATTTTACATGGTGGTTCCAAATATAGACCGACGGGCCGTGGGTTTGTTGT 4894
Query 4836 TTTCCATGCCAAGTTTGCGGAGAACTACAGGTTGTATTCGAGAAGTCACTTTGTGAAGGG 4895
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4895 TTTCCATGCTAAGTTTGCGGAGAACTACAGGTTGTATTCGAGAAGTCACTTTGTGAAGGG 4954
Query 4896 ACTAGAGCTGCTTTTATTGCTAGTTGTTTATCAAATCTATGGGCATTCATACCGGAGTTC 4955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4955 ACTAGAGCTGCTTTTATTGCTAGTTGTTTATCAAATCTATGGGCATTCATACCGGAGTTC 5014
Query 4956 AAACCTTTATCTGTATATCACAGTCTCGATGTGGTTTATGGTTGGTTCTTGGTTGTTTGC 5015
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5015 AAGCCTTTATCTGTATATCACAGTCTCGATGTGGTTTATGGTTGGTTCTTGGTTGTTCGC 5074
Query 5016 ACCATTTATATTCAATCCTTCGGGGTTTGAGTGGCAAAAGACAGTTGACGATTGGACTGA 5075
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 5075 ACCATTTATATTCAATCCCTCGGGTTTTGAGTGGCAAAAGACGGTTGATGATTGGACTGA 5134
Query 5076 TTGGAAACGATGGCTTGGAGATCGGGGTGGTATAGGCATCCCGGTTGAAAAAAGCTGGGA 5135
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5135 CTGGAAACGATGGCTCGGAGATCGGGGTGGCATAGGCATCCCGGTTGAAAAAAGCTGGGA 5194
Query 5136 ATCGTGGTGGAACGTAGAGCAAGAACACCTCAAACATACAAGTATTAGAGGGAGGATTCT 5195
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5195 ATCATGGTGGAACGTAGAGCAAGAACACCTCAAACATACAAGTATTAGAGGGAGGATTCT 5254
Query 5196 GGAAATCACACTTGCTCTCCGCTTTTTCATTTATCAGTACGGAATTGTTTACCAGCTCAA 5255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5255 GGAAATCACACTTGCTCTCCGCTTTTTCATTTATCAGTACGGAATTGTTTACCAGCTCAA 5314
Query 5256 TATCTCTCAGCGCAGCAAGAGCTTTTTGGTTTATGGACTCTCTTGGGTGGTCTTGCTCAC 5315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5315 TATCTCTCAGCGCAGCAAGAGCTTTTTGGTTTATGGACTCTCTTGGGTGGTCTTGCTCAC 5374
Query 5316 ATCATTACTTGTTCTAAAGATGGTATCTATGGGCAGACGAAGATTTGGAACAGATTTTCA 5375
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5375 ATCATTACTTGTTCTAAAGATGGTATCAATGGGCAGACGAAGATTTGGAACAGATTTTCA 5434
Query 5376 GCTAATGTTCAGGATTCTTAAAGCACTTCTCTTCCTCGGCTTTTTGTCAGTCATGACAAT 5435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 5435 GCTAATGTTCAGGATTCTTAAAGCACTTCTCTTCCTCGGCTTTTTGTCAATCATGACTGT 5494
Query 5436 ATTATTTGTGGTGTTCAAACTCACACTCACCGATCTCTCTGCTTCAGTTCTTGCTTTTCT 5495
|||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5495 GTTATTTGTTGTGTTCAAACTCACACTCACCGACCTATCTGCTTCAATTCTTGCTTTTCT 5554
Query 5496 TCCAACCGGGTGGGCGATTCTTCTGATTGGGCAAGTACTGAGGTCACCGATCAAAGCTTT 5555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5555 TCCAACCGGGTGGGCGATTCTTCTGATTGGGCAAGTACTGAGGTCACCGATCAAAGCTTT 5614
Query 5556 AGGGGTTTGGGACTCGGTGAAAGAGCTAGGAAGAGCGTATGAGAATATCATGGGACTTGT 5615
|||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5615 AGGGATTTGGGACTCGGTGAAGGAGCTAGGAAGAGCCTATGAGAAGATCATGGGACTTGT 5674
Query 5616 AATCTTTGCACCAATCGCTGTTCTGTCTTGGTTTCCCATTGTCTCCGAGTTTCAAGCTCG 5675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5675 AATCTTTGCACCAATCGCTGTTCTGTCTTGGTTTCCCATTGTCTCCGAGTTTCAAGCTCG 5734
Query 5676 TCTGCTTTTCAATCAAGCTTTTAGCAGAGGCCTTCAAATCTCTATGATTCTCGCTGGTCG 5735
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5735 TCTGCTTTTCAATCAAGCGTTTAGCAGAGGCCTTCAAATCTCTATGATTCTCGCTGGTCG 5794
Query 5736 GAAAGACAAAGCAACTTCTTCGCAC 5760
||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 5795 GAAAGACAAAGCAGCAACTTCGCAC 5819
Score = 3227 bits (1747), Expect = 0.0
Identities = 1889/1960 (96%), Gaps = 0/1960 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAAGCTAGTTCGAGTGGAACGGCGGAGTTGCCGCGGTCTCTTTCTCGGAGAGCTCCG 60
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 21 ATGGAAGCTAGTTCGAGTGGAACGGCGGAATTGCCGCGTTCTCTTTCCCGGAGAGCTCCG 80
Query 61 TCGCGTGCGACTACTATGATGATTGATAGACCAAACGAAGATGCTAGTGCTATGGATAGC 120
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 81 TCACGTGCGACTACTATGATGATTGATAGACCAAACGAAGATGCTAGCGCTATGGATAGC 140
Query 121 GAGCTTGTTCCTTCCTCTCTCGCTTCTATTGCCCCGATTCTTCGCGTTGCTAATGAAATT 180
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 GAGCTTGTTCCTTCCTCTCTTGCTTCTATTGCTCCGATTCTTCGCGTTGCTAATGAAATT 200
Query 181 GAGAAGGACAATCCTCGAGTGGCTTATCTATGCCGGTTTCATGCGTTTGAGAAAGCTCAT 240
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 201 GAGAAGGATAATCCTCGAGTGGCTTATCTCTGCCGGTTTCATGCGTTTGAGAAGGCTCAT 260
Query 241 AGGATGGATGCTACATCCAGTGGACGAGGTGTTCGTCAGTTTAAGACCTATCTGTTACAT 300
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 AGGATGGATGCTACATCGAGTGGACGCGGTGTTCGTCAGTTTAAGACCTATCTGTTACAT 320
Query 301 AGACTTGAGAAGGAAGAAGAGGAAACCAAGCCTCAGCTGGCGAAAAACGATCCTAGAGAA 360
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 321 AGACTGGAGAAGGAAGAAGTGGAAACCAAGCCTCAGCTGGCGAAAAATGATCCTAGAGAA 380
Query 361 ATTCAGGCATATTACCAGAACTTCTATGAGAAATATATTAAAGAAGGAGAAACATCAAGA 420
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 ATTCAGGCATATTACCAGAATTTCTATGAGAAATGTATTAAAGAAGGAGAAACATCAAGA 440
Query 421 AAACCGGAGGAAATGGCAAGGCTTTACCAAATTGCATCGGTATTGTACGATGTACTGAAG 480
|||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 AAACCGGAAGAGATGGCAAGGCTTTACCAAATTGCTTCGGTATTGTACGATGTACTGAAG 500
Query 481 ACTGTAGTACCTTCACCTAAAGTGGATTACGAGACCCGTAGATATGCCGAAGAAGTTGAA 540
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 501 ACTGTAGTACCTTCTCCAAAAGTGGATTACGAGACCCGTAGATATGCAGAAGAAGTTGAA 560
Query 541 AGGAAAAGGGATAGATATGAGCACTACAACATTCTTCCTTTATATGCTGTAGGGACTAAA 600
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 AAGAAAAGGGACAGATATGAGCACTACAACATTCTTCCTTTATATGCTGTAGGGACTAAA 620
Query 601 CCAGCAATTGTGGAACTTCCTGAGGTCAAGGCTGCATTCAGTGCTGTCCGTAATGTGCGC 660
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 621 CCAGCTATTGTGGAACTTCCTGAGGTCAAGGCTGCATTCAGTGCTGTTTGTAATGTGCGC 680
Query 661 AATCTTCCACGACGAAGAATTCATTTGCCATCTAATACCCCTAATGAAATGCGTAAGGCT 720
|||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 AATCTTCCACGAAGAAGAGTTCACTTGCCATCTAATGCCCCTAATGAAATGCGTAAGGCT 740
Query 721 AGAACCAAACTTAATGACATACTTGAATGGCTTGCTTCTGAGTTCGGGTTTCAGAGAGGG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 741 AGAACCAAACTTAATGACATACTTGAATGGCTTGCTTCTGAGTTCGGATTTCAGAGAGGG 800
Query 781 AACGTGGCAAATCAGAGGGAGCACATAATACTGCTTCTTGCTAATGCTGACATTAGAAAG 840
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 801 AACGTAGCAAATCAGAGGGAGCACATAATTCTGCTTCTTGCTAATGCTGATATTAGAAAC 860
Query 841 AGAAATGATGAAGAATATGATGAGTTGAAACCTAGCACCGTCACTGAGTTGATGGACAAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 861 AGAAATGATGAAGAATATGATGAGTTGAAACCTAGCACCGTCATTGAGTTGATGGACAAA 920
Query 901 ACTTTTAAAAGTTATTACTCATGGTGTAAATATTTGCACTCTACGTCTAATCTCAAGTTT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 921 ACTTTTAAAAGTTATTACTCATGGTGTAAATATTTGCACTCTACGCCTAATCTCAAGTTT 980
Query 961 CCAGATGATTGTGATAAACAGCAGCTGCAGCTTATCTATATTTCCCTGTACCTTTTAATA 1020
||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 981 CCAGAAGGTTGTGATAAACAGCAGCTGCGGCTTATCTATATTTCCCTGTACCTTTTAATA 1040
Query 1021 TGGGGTGAAGCCTCGAATGTTAGATTTATGCCCGAATGTATCTGCTATATTTTCCATAAT 1080
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 TGGGGCGAAGCCTCAAATGTTAGATTTATGCCCGAATGTATCTGCTATATTTTCCATAAT 1100
Query 1081 ATGGCAAATGACGTCTATGGAATTCTGTTTAGCAATGTTGAAGCTGTTAGTGGTGAGACA 1140
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 ATGGCAAATGACGTCTACGGAATTCTGTTTAGCAATGTTGAAGCTGTTAGTGGTGAGACA 1160
Query 1141 TATGAAACAGAAGAAGTTATTGATGAAGAATCATTTCTGAGAACTGTTATAACTCCAATC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 1161 TATGAAACAGAAGAAGTTATTGATGAAGAATCATTTCTGAGAAATGTCATAACTCCAATC 1220
Query 1201 TATCAGGTCATACGCAACGAAGCCAAAAGGAACAAGGGAGGTACAGCAAGCCATTCGCAA 1260
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1221 TATCAGGTCATACGCAAGGAAGCCAGAAGGAACAAGGGGGGCACAGCAAGCCATTCGCAA 1280
Query 1261 TGGAGAAATTACGATGATTTGAATGAATACTTTTGGTCTAAGAAATGCTTCAAGATAGGA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 TGGAGAAATTACGATGATTTGAATGAATACTTTTGGTCTAAGAAATGCTTCAAGATAGGA 1340
Query 1321 TGGCCTCTTGACCTTAAAGCAGACTTTTTCCTAAACTCTGACGAGATAACCCCACAGGAC 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1341 TGGCCTCTTGACCTTAAAGCAGACTTTTTCCTAAACGCTGACGAGATAACCCCACAGAAC 1400
Query 1381 GAGAGGCTGAATCAAGTCACTTATGGGAAAAGCAAGCCTAAAACCAACTTTGTTGAAGTC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 GAGAGGCTGAATCAAGTCACTTATGGGAAAAGCAAGCCTAAAACCAACTTTGTTGAAGTC 1460
Query 1441 CGCACATTCTGGAACCTCTTCAGAGATTTTGATCGAATGTGGATATTTCTTGTCATGGCT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461 CGCACATTCTGGAACCTCTTCAGAGATTTTGATCGAATGTGGATATTTCTTGTCATGGCT 1520
Query 1501 TTTCAGGCTATGGTAATAGTTGGATGGCATGGTTCTGGGTCACTAGGTGACATATTTGAC 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 1521 TTTCAGGCTATGGTAATAGTTGGATGGCATGGTTCTGGGTCTCTAGGCGACATCTTTGAC 1580
Query 1561 AAGGATGTATTCAAAACGGTGTTAACTATTTTTATTACTTCGGCGTATCTGACTCTTTTA 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 AAGGATGTATTCAAAACGGTGTTAACTATTTTTATTACTTCGGCGTATCTGACTCTTTTA 1640
Query 1621 CAAGCTGCACTGGATATTATCCTAAATTTCAATGCCTGGAAGAATTTCAAGTTTTCCCAG 1680
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1641 CAAGCTGCACTGGACATTATCCTTAATTTCAATGCTTGGAAGAATTTCAAGTTTTCCCAG 1700
Query 1681 ATATTGCGGTACCTTTTGAAATTCGCAGTAGCATTTATGTGGGCGGTACTGCTTCCAATT 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1701 ATATTGCGGTACCTTTTGAAATTCGCAGTAGCAGCTATGTGGGCAGTGCTGCTTCCAATT 1760
Query 1741 GCTTACTCGAAGTCTGTTCAACGCCCAACTGGAGTTGTAAAGTTCTTCAGTACTTGGACT 1800
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 GCTTACTCGAAGTCTGTCCAACGCCCAACTGGAGTTGTAAAGTTCTTCAGTACTTGGACT 1820
Query 1801 GGGGATTGGAAGGATCAGTCCTTTTATACGTACGCTGTTTCATTTTATGTGTTACCAAAC 1860
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1821 GGGGATTGGAAGGATCAGTCCTTTTATACGTACGCTGTTTTATTTTACGTGTTACCAAAC 1880
Query 1861 ATATTGGCAGCTCTGTTATTCCTCGTTCCACCATTCCGGAGAGCCATGGAGTGTTCAGAC 1920
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1881 ATACTGGCAGCTCTGTTATTCCTCGTTCCACCATTCCGGAGAGCCATGGAGTGTTCAGAC 1940
Query 1921 ATGCGACCTATCAAAGTTATAATGTGGTGGGCTCAGCCAA 1960
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1941 ATGCGAATTATCAAGGTTATAATGTGGTGGGCTCAGGCAA 1980
> Ahg325786 jgi|Araly1|325786|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001006
Length=5709
Score = 67.6 bits (36), Expect = 1e-09
Identities = 89/114 (78%), Gaps = 6/114 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 997 TATATTTCCCTGTACCTTTTAATATGGGGTGAAGCCTCGAATGTT-AGATTTATGCCCGA 1055
||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| | |||| || ||||| ||||| ||
Sbjct 973 TATATGGCCCTGTATCTTCTAATTTGGGGTGAAACAGCGAA-CTTGAGATTCATGCCTGA 1031
Query 1056 ATGTATCTGCTATATTT-TCCATAATATGGCAAATG-ACGTCTATGGAATTCTG 1107
||| ||||||| |||| | ||| |||||||| || || ||||||| || |||
Sbjct 1032 GTGTCTCTGCTACATTTAT-CATCATATGGCATTTGAAC-TCTATGGTATGCTG 1083
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 218412411447
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5