BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G59100.1 Length=5766 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg938922 jgi|Araly1|938922|scaffold_503113.1 6501 0.0 Ahg325786 jgi|Araly1|325786|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001006 67.6 1e-09 > Ahg938922 jgi|Araly1|938922|scaffold_503113.1 Length=5845 Score = 6501 bits (3520), Expect = 0.0 Identities = 3710/3805 (98%), Gaps = 0/3805 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1956 GCCAAAACTATACGTTGGAAGAGGTATGCATGAGGACATGTTCTCTCTCTTCAAGTATAC 2015 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2015 GCCAAAACTATATGTTGGAAGAGGTATGCATGAGGACATGTTCTCTCTCTTCAAGTATAC 2074 Query 2016 CACCTTCTGGATCATGCTACTGATCAGCAAGCTTGCTTTCAACTATTATGTGGAGATACT 2075 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2075 CACCTTCTGGATCATGCTACTGATCAGCAAGCTTGCTTTCAACTATTATGTGGAGATACT 2134 Query 2076 ACCCCTTATTACGCCAACAAAGATGATCATGAATCTGCACATTGGTCACTACCAGTGGCA 2135 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2135 ACCCCTTATTACGCCAACAAAGATGATCATGAATCTGCACATTGGTCACTACCAGTGGCA 2194 Query 2136 TGAATTTTTTCCCCATGCAACTAACAATATTGGAGTGGTTATTGCTATATGGGCTCCAAT 2195 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2195 TGAATTTTTTCCCCATGCAACTAACAATATTGGAGTGGTTATTGCTATATGGGCTCCAAT 2254 Query 2196 TGTACTGGTTTACTTGATGGATACTCAAATATGGTACGCCATTTTTTCCACTCTGTTTGG 2255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2255 TGTACTGGTTTACTTGATGGATACTCAAATATGGTACGCCATATTTTCCACTCTGTTTGG 2314 Query 2256 AGGCATACATGGGGCCTTCAGTCATCTGGGAGAAATACGGACTCTTGGGATGTTGCGATC 2315 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2315 AGGCATACATGGGGCCTTCAGTCATCTGGGAGAAATACGGACTCTTGGGATGTTGCGGTC 2374 Query 2316 TAGATTTGAGTCAATACCAATTGCCTTCAGCCGCACCCTCATGCCATCCGAAGATGCAAA 2375 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2375 TAGATTTGAGTCAATACCAACTGCCTTCAGCCGCACCCTCATGCCATCAGAAGATGCAAA 2434 Query 2376 AAGAAAACATGCGGATGACTATGTGGACCAGAAAAACATCACTAATTTCTCCCAGGTGTG 2435 |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2435 AAGAGAACATGCTGATGACTATGTGGACCAGAAAAACATCACTAATTTCTCCCAGGTGTG 2494 Query 2436 GAACGAGTTCATTTACTCTATGAGAAGCGAGGATAAGATCAGTGACAGAGATAGGGATTT 2495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2495 GAACGAGTTCATTTACTCTATGAGAAGCGAGGATAAGATCAGTGACAGAGATAGGGATTT 2554 Query 2496 GCTGCTTGTACCATCTTCGTCGGGTGATGTGTCTGTCATCCAGTGGCCACCTTTCTTGCT 2555 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2555 GCTGCTTGTACCTTCTTCTTCGGGTGATGTGTCTGTCATCCAGTGGCCACCTTTCTTGCT 2614 Query 2556 TGCTAGTAAGATTCCTATTGCTGTGGACATGGCAAAAGATTTCAAGGGAAAAGAGGATGC 2615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2615 TGCTAGTAAGATTCCTATTGCTGTGGACATGGCAAAAGATTTCAGGGGAAAAGAGGATGC 2674 Query 2616 TGAACTATTTAGAAAGATTAAGAGTGATAGCTACATGTATTATGCTGTTATTGAGAGTTA 2675 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2675 TGAACTATTTAGAAAGATTAAGAGTGATAGCTACATGTATTTTGCTGTTATTGAGAGTTA 2734 Query 2676 TGAGACATTGAAGAAAATAATTTACGCTCTTCTGGAAGATGAAGCAGATAGAAGGGTCAT 2735 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2735 TGAGACATTGAAGAAAATAATTTACGCTCTACTGGAAGATGAAGCAGATAGAAGGGTCAT 2794 Query 2736 GAATCAGGTATTTTTAGAAGTGGACATGAGCATGCAGCAACAGAGATTCATATATGAATT 2795 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2795 GAATCAGGTATTTTTGGAAGTGGACATGAGCATACAGCAACAGAGATTCATATATGAATT 2854 Query 2796 CCGCATGAGTGGATTACCGCTCCTTAGTGATAAGCTGGAGAAGTTTCTAAGTATATTGTT 2855 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2855 CCGGATGAGTGGATTGCCGCTCCTTAGTGATAAGTTGGAGAAGTTTCTAAGTATATTGTT 2914 Query 2856 AAGTGACTATGAAGACCAGGGTACATACAAGTCTCAGTTAATTAATGTCTTCCAGGATGT 2915 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2915 AAGTGACTATGAAGACCAGGGTACATACAAGTCTCAATTAATTAATGTCTTCCAGGATGT 2974 Query 2916 TATCGAAATTATCACTCAAGATCTCTTGGTTAATGGGCATGAAATTCTTGAAAGGGCTCG 2975 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2975 TATCGAAATTATTACTCAAGATCTCTTGGTTAATGGGCATGAAATTCTTGAAAGGGCTCG 3034 Query 2976 TGTTCATTCTCCTGACATCAAAAATGAGAAAAAGGAACAGAGGTTTGAGAAAATTAATAT 3035 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3035 GGTTCATTCTCCTGACATCAAAAATGATAAAAAGGAACAGAGGTTTGAGAAAATTAATAT 3094 Query 3036 CCACCTAGTACGGGATAGATGTTGGCGGGAAAAGGTTATTCGGCTTCATTTGCTCTTATC 3095 ||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 3095 TCACCTCGTAGGGGATAAATGCTGGCGGGAGAAGGTTATTCGACTTCATTTGCTCTTGTC 3154 Query 3096 GGTCAAAGAATCTGCAATAAATGTTCCTCAAAACTTGGAAGCCCGCCGACGTATCACATT 3155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 3155 GGTCAAAGAATCTGCAATAAATGTTCCTCAAAACTTGGAAGCTCGCCGCCGTATCACATT 3214 Query 3156 CTTTGCTAATTCTCTGTTTATGAATATGCCTAGTGCTCCAAGAATACGAGATATGCTATC 3215 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3215 CTTTGCTAATTCTCTGTTTATGAATATGCCTAATGCTCCAAAAATACGAGATATGCTATC 3274 Query 3216 TTTCAGTGTTTTAACTCCTTACTACAAAGAAGATGTGCTGTATTCAGAGGAAGACCTTAA 3275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| Sbjct 3275 TTTCAGTGTTTTAACTCCTTACTACAAAGAAGATGTTCTCTATTCAGAGGAGGACCTTAA 3334 Query 3276 CAAGGAAAATGAAGATGGGATCTCAATTCTGTTTTATCTACAAAAGATTTATCCTGATGA 3335 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3335 CAAGGAAAATGAAGATGGGATCTCAATACTGTTTTACCTACAAAAGATTTATCCTGATGA 3394 Query 3336 GTGGACCAATTATTTGGATCGCTTAAAGGATCCTAAGCTTCCTGAGAAAGACAAGTCAGA 3395 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3395 GTGGACCAATTATTTGGATCGCTTAAATGATCCTAAGCTTCCTGAGAAAGACAAGTCAGA 3454 Query 3396 GTTCCTTCGAGAGTGGGTATCTTACAGAGGTCAGACGTTAGCCAGAACAGTTAGGGGTAT 3455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3455 GTTCCTTCGAGAGTGGGTATCTTACAGAGGTCAGACGCTAGCCAGAACAGTTAGGGGTAT 3514 Query 3456 GATGTACTATAGACAGGCTCTGGAGCTTCAATGCTACCAGGAAGTTGCAGGGGAACAAGC 3515 |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3515 GATGTACTATAGGCAGGCTTTGGAGCTTCAATGCTACCAGGAAGTTGCAGGGGAACAAGC 3574 Query 3516 CGAGTTTAGTGTCTTTCGGGCCATGGCGTCCAACGATGAAAATCAGAAGGCTTTCCTGGA 3575 ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 3575 CGAATTTAGTGTCTCCCGGGCCATGGCGTCCAATGATGATAATCAGAAAGCTTTCCTGGA 3634 Query 3576 ACGTGCCAGAGCTCTTGCAGATCTGAAGTTCACTTATGTTGTTTCTTGTCAGGTCTACGG 3635 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3635 ACGTGCTAAAGCTCTTGCAGATCTGAAGTTCACTTATGTTGTTTCTTGTCAGGTCTACGG 3694 Query 3636 AAATCAGAAAAAGTCCGGTGATATCCACAACCGCAGCTGCTACACGAATATTCTGCAGCT 3695 |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3695 AAATCAGAAAAAGTCCAGTGATATTCACAACCGTAGTTGCTACACGAATATTCTGCAGCT 3754 Query 3696 CATGCTAAAATATCCATCATTGCGGGTTGCTTATGTAGATGAGAGGGAGGAGACAGCAGA 3755 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3755 CATGCTGAAATATCCATCATTACGGGTTGCTTATGTAGATGAGAGGGAGGGGACAGCAGA 3814 Query 3756 TGCAAAATCTCCGAAGGTCTTTTACTCTGTACTTCTAAAAGGAGGTGACAAGTTTGATGA 3815 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3815 TGCAAAATCTCCTAAGGTCTTTTACTCTGTACTTCTAAAGGGAGGTGACAAGTTTGATGA 3874 Query 3816 GGAAATTTACCGCATCAAGCTTCCTGGTCCTCCAGCTGAGATTGGTGAAGGAAAGCCTGA 3875 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3875 GGAAATTTACCGCATAAAGCTTCCTGGTCCTCCAGCTGAGATTGGTGAAGGAAAGCCTGA 3934 Query 3876 AAATCAAAATCATGCTATCATATTTACACGTGGTGAAGCACTACAAACTATAGATATGAA 3935 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3935 AAATCAAAATCATGCTATCATATTTACACGTGGTGAAGCACTACAAACTATAGATATGAA 3994 Query 3936 TCAAGACAATTACTTTGAAGAAGCTTTCAAACTAAGAAATGTATTGGAGGAATTCAATAA 3995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3995 TCAAGACAATTACTTTGAAGAAGCTTTCAAACTAAGAAATGTATTGGAGGAATTCAATAA 4054 Query 3996 GGAGCGTGTTGGTAGACGCAAGCCAACAATATTGGGTCTCCGAGAACATATATTTACTGG 4055 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4055 GGAGCGTGTTGGTAGACGCAAGCCAACAATTTTGGGTCTCCGAGAACATATATTTACTGG 4114 Query 4056 AAGTGTTTCGTCATTAGCTTGGTTCATGTCCAATCAGGAGAGTAGTTTTGTGACAATTGG 4115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4115 AAGTGTTTCGTCATTAGCTTGGTTCATGTCCAATCAGGAGAGTAGTTTTGTGACAATTGG 4174 Query 4116 CCAAAGAATTTTGGCAAACCCTCTGAGGGTCCGTTTTCATTATGGTCATCCTGACATATT 4175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4175 CCAAAGAATTTTGGCAAACCCTCTGAGGGTCCGTTTTCATTATGGCCATCCTGACATATT 4234 Query 4176 TGACAGAATCTTTCACATAACAAGGGGCGGTGTGAGCAAGGCTTCGAAAGTAATAAATTT 4235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4235 TGACAGAATCTTTCACATAACAAGGGGCGGTGTGAGCAAGGCTTCGAAAGTAATAAACTT 4294 Query 4236 GAGTGAGGATATTTTCGGAGGCTTCAATTCAACTCTCCGTGGAGGATATGTTACACATCA 4295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4295 GAGTGAGGATATTTTCGGAGGCTTCAATTCAACTCTCCGTGGAGGATATGTTACACATCA 4354 Query 4296 CGAGTATATCCAAGTTGGAAAGGGACGGGACGTGGGGTTGAACCCAATCTCTATTTTTGA 4355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4355 CGAGTATATCCAAGTTGGAAAGGGACGGGACGTGGGGTTGAACCCAATCTCTATTTTTGA 4414 Query 4356 AGCAAAAGTAGCAAATGGAAACGGGGAGCAAACGCTAAGCCGTGATGTTTACCGTTTGGG 4415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4415 AGCAAAAGTAGCAAATGGAAACGGGGAGCAAACGCTAAGCCGTGATGTTTACCGTTTGGG 4474 Query 4416 GCATCGGTTTGACTTTTACAGGATGCTCTCATTCTATTTTACGACCATTGGATTCTATTT 4475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4475 GCATCGGTTTGACTTTTACAGGATGCTCTCATTCTATTTTACGACCATTGGATTCTATTT 4534 Query 4476 TAGTAGCATGCTCACCGTTCTTACTGTATATGCATTCCTGTATGGACGGATGTACATGGT 4535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4535 TAGTAGCATGCTCACCGTTCTTACTGTATATGCATTCCTGTATGGACGTATGTACATGGT 4594 Query 4536 TATGAGCGGATTGGAGAAAGAGATTTTGAGACTCGCAAGCCCGAATCAGCTTGAGGCTCT 4595 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4595 TATGAGCGGATTGGAGAAAGAGATTTTGCGACTCGCAAGCCCGAATCAGCTTGAGGCTCT 4654 Query 4596 TGAGCAGGCTCTGGCTACACAGTCAATATTTCAGCTTGGTTTCTTGATGGTGTTACCGAT 4655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4655 TGAGCAGGCTCTGGCTACACAGTCAATATTTCAGCTTGGTTTCTTGATGGTGTTACCGAT 4714 Query 4656 GGTAATGGAGATTGGCTTGGAACACGGTTTTCGCTCTGCTATTGTCGATTTTTTCATAAT 4715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4715 GGTAATGGAGATTGGCTTGGAACACGGTTTTCGCTCTGCTATAGTCGATTTTTTCATAAT 4774 Query 4716 GCAGCTGCAGCTAGCCTCGGTATTCTTTACATTCCAGCTTGGGACAAAGTCACATTATTA 4775 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4775 GCAGCTGCAGCTAGCCTCGGTATTCTTTACATTCCAGCTTGGGACAAAGTCACATTATTA 4834 Query 4776 CGGGAGAACAATTTTACATGGTGGTTCCAAATATAGACCGACGGGCCGTGGGTTTGTTGT 4835 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4835 TGGGAGAACAATTTTACATGGTGGTTCCAAATATAGACCGACGGGCCGTGGGTTTGTTGT 4894 Query 4836 TTTCCATGCCAAGTTTGCGGAGAACTACAGGTTGTATTCGAGAAGTCACTTTGTGAAGGG 4895 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4895 TTTCCATGCTAAGTTTGCGGAGAACTACAGGTTGTATTCGAGAAGTCACTTTGTGAAGGG 4954 Query 4896 ACTAGAGCTGCTTTTATTGCTAGTTGTTTATCAAATCTATGGGCATTCATACCGGAGTTC 4955 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4955 ACTAGAGCTGCTTTTATTGCTAGTTGTTTATCAAATCTATGGGCATTCATACCGGAGTTC 5014 Query 4956 AAACCTTTATCTGTATATCACAGTCTCGATGTGGTTTATGGTTGGTTCTTGGTTGTTTGC 5015 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 5015 AAGCCTTTATCTGTATATCACAGTCTCGATGTGGTTTATGGTTGGTTCTTGGTTGTTCGC 5074 Query 5016 ACCATTTATATTCAATCCTTCGGGGTTTGAGTGGCAAAAGACAGTTGACGATTGGACTGA 5075 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 5075 ACCATTTATATTCAATCCCTCGGGTTTTGAGTGGCAAAAGACGGTTGATGATTGGACTGA 5134 Query 5076 TTGGAAACGATGGCTTGGAGATCGGGGTGGTATAGGCATCCCGGTTGAAAAAAGCTGGGA 5135 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5135 CTGGAAACGATGGCTCGGAGATCGGGGTGGCATAGGCATCCCGGTTGAAAAAAGCTGGGA 5194 Query 5136 ATCGTGGTGGAACGTAGAGCAAGAACACCTCAAACATACAAGTATTAGAGGGAGGATTCT 5195 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5195 ATCATGGTGGAACGTAGAGCAAGAACACCTCAAACATACAAGTATTAGAGGGAGGATTCT 5254 Query 5196 GGAAATCACACTTGCTCTCCGCTTTTTCATTTATCAGTACGGAATTGTTTACCAGCTCAA 5255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5255 GGAAATCACACTTGCTCTCCGCTTTTTCATTTATCAGTACGGAATTGTTTACCAGCTCAA 5314 Query 5256 TATCTCTCAGCGCAGCAAGAGCTTTTTGGTTTATGGACTCTCTTGGGTGGTCTTGCTCAC 5315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5315 TATCTCTCAGCGCAGCAAGAGCTTTTTGGTTTATGGACTCTCTTGGGTGGTCTTGCTCAC 5374 Query 5316 ATCATTACTTGTTCTAAAGATGGTATCTATGGGCAGACGAAGATTTGGAACAGATTTTCA 5375 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5375 ATCATTACTTGTTCTAAAGATGGTATCAATGGGCAGACGAAGATTTGGAACAGATTTTCA 5434 Query 5376 GCTAATGTTCAGGATTCTTAAAGCACTTCTCTTCCTCGGCTTTTTGTCAGTCATGACAAT 5435 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct 5435 GCTAATGTTCAGGATTCTTAAAGCACTTCTCTTCCTCGGCTTTTTGTCAATCATGACTGT 5494 Query 5436 ATTATTTGTGGTGTTCAAACTCACACTCACCGATCTCTCTGCTTCAGTTCTTGCTTTTCT 5495 |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5495 GTTATTTGTTGTGTTCAAACTCACACTCACCGACCTATCTGCTTCAATTCTTGCTTTTCT 5554 Query 5496 TCCAACCGGGTGGGCGATTCTTCTGATTGGGCAAGTACTGAGGTCACCGATCAAAGCTTT 5555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5555 TCCAACCGGGTGGGCGATTCTTCTGATTGGGCAAGTACTGAGGTCACCGATCAAAGCTTT 5614 Query 5556 AGGGGTTTGGGACTCGGTGAAAGAGCTAGGAAGAGCGTATGAGAATATCATGGGACTTGT 5615 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 5615 AGGGATTTGGGACTCGGTGAAGGAGCTAGGAAGAGCCTATGAGAAGATCATGGGACTTGT 5674 Query 5616 AATCTTTGCACCAATCGCTGTTCTGTCTTGGTTTCCCATTGTCTCCGAGTTTCAAGCTCG 5675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5675 AATCTTTGCACCAATCGCTGTTCTGTCTTGGTTTCCCATTGTCTCCGAGTTTCAAGCTCG 5734 Query 5676 TCTGCTTTTCAATCAAGCTTTTAGCAGAGGCCTTCAAATCTCTATGATTCTCGCTGGTCG 5735 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5735 TCTGCTTTTCAATCAAGCGTTTAGCAGAGGCCTTCAAATCTCTATGATTCTCGCTGGTCG 5794 Query 5736 GAAAGACAAAGCAACTTCTTCGCAC 5760 ||||||||||||| | |||||||| Sbjct 5795 GAAAGACAAAGCAGCAACTTCGCAC 5819 Score = 3227 bits (1747), Expect = 0.0 Identities = 1889/1960 (96%), Gaps = 0/1960 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAAGCTAGTTCGAGTGGAACGGCGGAGTTGCCGCGGTCTCTTTCTCGGAGAGCTCCG 60 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 21 ATGGAAGCTAGTTCGAGTGGAACGGCGGAATTGCCGCGTTCTCTTTCCCGGAGAGCTCCG 80 Query 61 TCGCGTGCGACTACTATGATGATTGATAGACCAAACGAAGATGCTAGTGCTATGGATAGC 120 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 81 TCACGTGCGACTACTATGATGATTGATAGACCAAACGAAGATGCTAGCGCTATGGATAGC 140 Query 121 GAGCTTGTTCCTTCCTCTCTCGCTTCTATTGCCCCGATTCTTCGCGTTGCTAATGAAATT 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 141 GAGCTTGTTCCTTCCTCTCTTGCTTCTATTGCTCCGATTCTTCGCGTTGCTAATGAAATT 200 Query 181 GAGAAGGACAATCCTCGAGTGGCTTATCTATGCCGGTTTCATGCGTTTGAGAAAGCTCAT 240 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 201 GAGAAGGATAATCCTCGAGTGGCTTATCTCTGCCGGTTTCATGCGTTTGAGAAGGCTCAT 260 Query 241 AGGATGGATGCTACATCCAGTGGACGAGGTGTTCGTCAGTTTAAGACCTATCTGTTACAT 300 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 261 AGGATGGATGCTACATCGAGTGGACGCGGTGTTCGTCAGTTTAAGACCTATCTGTTACAT 320 Query 301 AGACTTGAGAAGGAAGAAGAGGAAACCAAGCCTCAGCTGGCGAAAAACGATCCTAGAGAA 360 ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 321 AGACTGGAGAAGGAAGAAGTGGAAACCAAGCCTCAGCTGGCGAAAAATGATCCTAGAGAA 380 Query 361 ATTCAGGCATATTACCAGAACTTCTATGAGAAATATATTAAAGAAGGAGAAACATCAAGA 420 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 381 ATTCAGGCATATTACCAGAATTTCTATGAGAAATGTATTAAAGAAGGAGAAACATCAAGA 440 Query 421 AAACCGGAGGAAATGGCAAGGCTTTACCAAATTGCATCGGTATTGTACGATGTACTGAAG 480 |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 441 AAACCGGAAGAGATGGCAAGGCTTTACCAAATTGCTTCGGTATTGTACGATGTACTGAAG 500 Query 481 ACTGTAGTACCTTCACCTAAAGTGGATTACGAGACCCGTAGATATGCCGAAGAAGTTGAA 540 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 501 ACTGTAGTACCTTCTCCAAAAGTGGATTACGAGACCCGTAGATATGCAGAAGAAGTTGAA 560 Query 541 AGGAAAAGGGATAGATATGAGCACTACAACATTCTTCCTTTATATGCTGTAGGGACTAAA 600 | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 561 AAGAAAAGGGACAGATATGAGCACTACAACATTCTTCCTTTATATGCTGTAGGGACTAAA 620 Query 601 CCAGCAATTGTGGAACTTCCTGAGGTCAAGGCTGCATTCAGTGCTGTCCGTAATGTGCGC 660 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 621 CCAGCTATTGTGGAACTTCCTGAGGTCAAGGCTGCATTCAGTGCTGTTTGTAATGTGCGC 680 Query 661 AATCTTCCACGACGAAGAATTCATTTGCCATCTAATACCCCTAATGAAATGCGTAAGGCT 720 |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 681 AATCTTCCACGAAGAAGAGTTCACTTGCCATCTAATGCCCCTAATGAAATGCGTAAGGCT 740 Query 721 AGAACCAAACTTAATGACATACTTGAATGGCTTGCTTCTGAGTTCGGGTTTCAGAGAGGG 780 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 741 AGAACCAAACTTAATGACATACTTGAATGGCTTGCTTCTGAGTTCGGATTTCAGAGAGGG 800 Query 781 AACGTGGCAAATCAGAGGGAGCACATAATACTGCTTCTTGCTAATGCTGACATTAGAAAG 840 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 801 AACGTAGCAAATCAGAGGGAGCACATAATTCTGCTTCTTGCTAATGCTGATATTAGAAAC 860 Query 841 AGAAATGATGAAGAATATGATGAGTTGAAACCTAGCACCGTCACTGAGTTGATGGACAAA 900 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 861 AGAAATGATGAAGAATATGATGAGTTGAAACCTAGCACCGTCATTGAGTTGATGGACAAA 920 Query 901 ACTTTTAAAAGTTATTACTCATGGTGTAAATATTTGCACTCTACGTCTAATCTCAAGTTT 960 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 921 ACTTTTAAAAGTTATTACTCATGGTGTAAATATTTGCACTCTACGCCTAATCTCAAGTTT 980 Query 961 CCAGATGATTGTGATAAACAGCAGCTGCAGCTTATCTATATTTCCCTGTACCTTTTAATA 1020 ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 981 CCAGAAGGTTGTGATAAACAGCAGCTGCGGCTTATCTATATTTCCCTGTACCTTTTAATA 1040 Query 1021 TGGGGTGAAGCCTCGAATGTTAGATTTATGCCCGAATGTATCTGCTATATTTTCCATAAT 1080 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1041 TGGGGCGAAGCCTCAAATGTTAGATTTATGCCCGAATGTATCTGCTATATTTTCCATAAT 1100 Query 1081 ATGGCAAATGACGTCTATGGAATTCTGTTTAGCAATGTTGAAGCTGTTAGTGGTGAGACA 1140 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1101 ATGGCAAATGACGTCTACGGAATTCTGTTTAGCAATGTTGAAGCTGTTAGTGGTGAGACA 1160 Query 1141 TATGAAACAGAAGAAGTTATTGATGAAGAATCATTTCTGAGAACTGTTATAACTCCAATC 1200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 1161 TATGAAACAGAAGAAGTTATTGATGAAGAATCATTTCTGAGAAATGTCATAACTCCAATC 1220 Query 1201 TATCAGGTCATACGCAACGAAGCCAAAAGGAACAAGGGAGGTACAGCAAGCCATTCGCAA 1260 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 1221 TATCAGGTCATACGCAAGGAAGCCAGAAGGAACAAGGGGGGCACAGCAAGCCATTCGCAA 1280 Query 1261 TGGAGAAATTACGATGATTTGAATGAATACTTTTGGTCTAAGAAATGCTTCAAGATAGGA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1281 TGGAGAAATTACGATGATTTGAATGAATACTTTTGGTCTAAGAAATGCTTCAAGATAGGA 1340 Query 1321 TGGCCTCTTGACCTTAAAGCAGACTTTTTCCTAAACTCTGACGAGATAACCCCACAGGAC 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 1341 TGGCCTCTTGACCTTAAAGCAGACTTTTTCCTAAACGCTGACGAGATAACCCCACAGAAC 1400 Query 1381 GAGAGGCTGAATCAAGTCACTTATGGGAAAAGCAAGCCTAAAACCAACTTTGTTGAAGTC 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1401 GAGAGGCTGAATCAAGTCACTTATGGGAAAAGCAAGCCTAAAACCAACTTTGTTGAAGTC 1460 Query 1441 CGCACATTCTGGAACCTCTTCAGAGATTTTGATCGAATGTGGATATTTCTTGTCATGGCT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1461 CGCACATTCTGGAACCTCTTCAGAGATTTTGATCGAATGTGGATATTTCTTGTCATGGCT 1520 Query 1501 TTTCAGGCTATGGTAATAGTTGGATGGCATGGTTCTGGGTCACTAGGTGACATATTTGAC 1560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| Sbjct 1521 TTTCAGGCTATGGTAATAGTTGGATGGCATGGTTCTGGGTCTCTAGGCGACATCTTTGAC 1580 Query 1561 AAGGATGTATTCAAAACGGTGTTAACTATTTTTATTACTTCGGCGTATCTGACTCTTTTA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1581 AAGGATGTATTCAAAACGGTGTTAACTATTTTTATTACTTCGGCGTATCTGACTCTTTTA 1640 Query 1621 CAAGCTGCACTGGATATTATCCTAAATTTCAATGCCTGGAAGAATTTCAAGTTTTCCCAG 1680 |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1641 CAAGCTGCACTGGACATTATCCTTAATTTCAATGCTTGGAAGAATTTCAAGTTTTCCCAG 1700 Query 1681 ATATTGCGGTACCTTTTGAAATTCGCAGTAGCATTTATGTGGGCGGTACTGCTTCCAATT 1740 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| Sbjct 1701 ATATTGCGGTACCTTTTGAAATTCGCAGTAGCAGCTATGTGGGCAGTGCTGCTTCCAATT 1760 Query 1741 GCTTACTCGAAGTCTGTTCAACGCCCAACTGGAGTTGTAAAGTTCTTCAGTACTTGGACT 1800 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1761 GCTTACTCGAAGTCTGTCCAACGCCCAACTGGAGTTGTAAAGTTCTTCAGTACTTGGACT 1820 Query 1801 GGGGATTGGAAGGATCAGTCCTTTTATACGTACGCTGTTTCATTTTATGTGTTACCAAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| Sbjct 1821 GGGGATTGGAAGGATCAGTCCTTTTATACGTACGCTGTTTTATTTTACGTGTTACCAAAC 1880 Query 1861 ATATTGGCAGCTCTGTTATTCCTCGTTCCACCATTCCGGAGAGCCATGGAGTGTTCAGAC 1920 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1881 ATACTGGCAGCTCTGTTATTCCTCGTTCCACCATTCCGGAGAGCCATGGAGTGTTCAGAC 1940 Query 1921 ATGCGACCTATCAAAGTTATAATGTGGTGGGCTCAGCCAA 1960 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1941 ATGCGAATTATCAAGGTTATAATGTGGTGGGCTCAGGCAA 1980 > Ahg325786 jgi|Araly1|325786|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001006 Length=5709 Score = 67.6 bits (36), Expect = 1e-09 Identities = 89/114 (78%), Gaps = 6/114 (5%) Strand=Plus/Plus Query 997 TATATTTCCCTGTACCTTTTAATATGGGGTGAAGCCTCGAATGTT-AGATTTATGCCCGA 1055 ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| | |||| || ||||| ||||| || Sbjct 973 TATATGGCCCTGTATCTTCTAATTTGGGGTGAAACAGCGAA-CTTGAGATTCATGCCTGA 1031 Query 1056 ATGTATCTGCTATATTT-TCCATAATATGGCAAATG-ACGTCTATGGAATTCTG 1107 ||| ||||||| |||| | ||| |||||||| || || ||||||| || ||| Sbjct 1032 GTGTCTCTGCTACATTTAT-CATCATATGGCATTTGAAC-TCTATGGTATGCTG 1083 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 218412411447 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5