BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G59410.2 Length=4300 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg486408 jgi|Araly1|486408|fgenesh2_kg.5__2400__AT3G59410.1 6215 0.0 Ahg938956 jgi|Araly1|938956|scaffold_503147.1 215 2e-54 > Ahg486408 jgi|Araly1|486408|fgenesh2_kg.5__2400__AT3G59410.1 Length=3761 Score = 6215 bits (3365), Expect = 0.0 Identities = 3545/3633 (98%), Gaps = 7/3633 (0%) Strand=Plus/Plus Query 584 TCTCTGCAATATTTCAAGAGGACTGCAAAGTTGTTTCTGATTCGCGTTCGCCTCCGCAAA 643 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 131 TCTCCGCAATATTTCAAGAGGACTGCAAAATTGTTTCAGATTCGCGTTCCCCTCCGCAAA 190 Query 644 TAGCAATCAAGCTCAGG---CCGTACTC-AAAGGACATGGGATATGAAGACACCGACATA 699 | | ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||| Sbjct 191 TTGTAATCAAGCTCAGGTTTTCGTACTCGAAA-GATATGGGATATGAGGACATCGACATC 249 Query 700 TCTGCTATGCTTATAGTTAGGTGCTTACCAGGATATCCTTACAAGTGCCCCAAGCTTCAG 759 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 250 TCTGCTATGCTTGTAGTGAGGTGCTTACCAGGATATCCTTACAAGTGCCCCAAGCTTCAG 309 Query 760 ATTACTCCAGAACAAGGGTTGACAACAGCTGATGCTGAGAAGCTTTTATCTCTTCTCGAG 819 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 310 ATTACTCCAGAACAAGGGTTGACAACAGCTGATGCTGAGAAGCTTTTATCTCTTCTCGAG 369 Query 820 GACCAGGCAAATTCCAATGCTCGTGAAGGTCGGGTTATGATATTCAACCTGGTGGAGGCT 879 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 370 GACCAGGCAAATTCCAATGCTCGTGAAGGTCGGGTTATGATATTCAACCTGGTGGAGGCT 429 Query 880 GCTCAAGAGTTTTTATCAGAAATCATTCCGGAAAGTCATGATGAGGAATCTGTTCCATGC 939 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct 430 GCCCAAGAGTTTTTATCAGAAATCATTCCGGAAAGTCACGATGAGGAACCTGTTCCATGC 489 Query 940 TTGACTGCACATCGAAGCACTCAGTTCATTGAGCAACCTATGCTTTCAAATATAGCAAAA 999 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 490 TTGACTGCACATCGAAGCGCTCAGTTCATTGAGCAACCTATGCTTTCAAATAAAGCAAAA 549 Query 1000 TCCTGTTCTGGTGGACCTTTTGTGTATGGTTTTATAGACCTATTTAGTGGCTTGGAAGAT 1059 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 550 TCCTGTACTGGTGGACCTTTTGTGTATGGTTTTATAGACCTATTTAGTGGCTTGGAAGAT 609 Query 1060 GCAAGAAATTGGAGTCTGACTCCAGATGAAAATAGGGGAATCGTATCTTCAGTACAATCT 1119 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 610 GCAAGGAATTGGAGTCTGACTCCAGATGAAAATAGGGGAATCGTATCTTCAGTACAATCT 669 Query 1120 CACCCACTAGACACTTCAAGAATTTTGCATCAGAAGCCAGACAAGAATCTGAAGCGATTT 1179 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| Sbjct 670 CACCCACTAGACACTTCAAGAATTTTGCATGAGAAGTCGGACAAGAATCTTAAGCGATTT 729 Query 1180 GAAGACCATGCTAAAGAAGAAGTTGCACTGCCTGCTCCCATTGCCAAACTGAATACTGTT 1239 || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 730 GAGGACCATGCTAAAGAAGAAATTGCACTGCCTGCTCCCACTGCCAAACTAAATACTGTT 789 Query 1240 CAAGAGGAGAATGTTGATGATACAAGCATCTCTTCTTTTGACTCAAGTAAATCTACTGAC 1299 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 790 CAAGAGGATAATGTTGATGATACAAGCATCTCCTCTTTTGACTCAAGTAAATCTACTGAC 849 Query 1300 GATGTGGAATCTGGATTATTCCAAAATGAGAAGAAGGAATCAAATCTTCAAGATGATACA 1359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 850 GATGTGGAATCTGGATTATTCCAAAATGAGAAGAAGGAATCAAATCTTCAAGATGATACA 909 Query 1360 GCTGAAGATGACAGCACTAACTCCGAAAGTGAGTCGCTGGGGTCATGGTCTTCTGATTCC 1419 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 910 GCTGAAGATGACAGCAGTAACTCCGAAAGTGAGTCGCTGGGGTCATGGTCTTCTGATTCC 969 Query 1420 TTAGCTCAAGATCAAGTGCCTCAGATTAGCAAGAAAGATCTGTTGATGGTCCATTTACTT 1479 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 970 TTATCTCAAGATCAAGTGCCTCAGATTAGCAAGAAAGACCTGTTGATGGTCCATTTACTT 1029 Query 1480 CGAGTAGCTTGCACTTCCCGAGGACCTTTGGCTGATGCATTACCTCAGATAACTGATGAA 1539 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1030 CGAGTAGCTTGCACTTCCAGAGGACCTTTGGCTGATGCATTACCTCAGATAACTGATGAA 1089 Query 1540 CTGCATGAGCTTGGTATATTGTCTGAAGAAGTGTTGGATTTAGCTTCCAAATCATCTCCA 1599 |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1090 CTGCATCAGCTTGGTATATTGTCTGAAGAAGCGTTGGATTTAGCTTCGAAATCATCTCCA 1149 Query 1600 GACTTTAATAGAACCTTTGAACATGCATTCAATCAAAACATGGCCTCAACCAGTGTTCCT 1659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1150 GACTTTAATAGAACCTTTGAACATGCATTCAATCAAAACATGGTCTCAACCAGTGTTCCT 1209 Query 1660 CAGTTTTGGGAGCCACCTTCTGATTCTTGCGAGCCAAATGCATCACTCCCAAGCTCGCGA 1719 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1210 CAGTTTTGGGAGCCACCTTCTGATTCTGGCGAGCCAAATGCATCACTCCCAAGCTCGCGA 1269 Query 1720 TATCTCAATGATTTTGAAGAGTTGAAACCCCTTGGCCAAGGTGGTTTCGGCCACGTTGTG 1779 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1270 TATCTCAATGATTTTGAAGAGTTGAAACCCCTTGGACAAGGTGGTTTCGGCCACGTTGTG 1329 Query 1780 TTGTGCAAAAATAAACTGGATGGAAGACAATATGCAGTGAAGAAAATTCGACTGAAGGAC 1839 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1330 TTGTGCAAAAATAAACTGGATGGAAGACAATATGCAGTGAAGAAAATTCGACTGAAGGAG 1389 Query 1840 AAAGAGATACCTGTCAACAGTCGGATAGTTCGAGAAGTAGCAACACTTTCCCGTTTGCAG 1899 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1390 AAAGAGATACCTGTCAACAGTCGAATAGTTCGAGAAGTAGCAACACTTTCCCGTTTGCAG 1449 Query 1900 CATCAGCATGTTGTACGTTACTATCAGGCCTGGTTCGAAACAGGAGTTGTTGATCCCTTT 1959 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1450 CATCAGCATGTTGTACGTTACTATCAGGCCTGGTTCGAAACAGGAGTTGTTGATCCTTTT 1509 Query 1960 GCTGGCGCAAATTGGGGATCAAAAACTGCAGGGAGTTCAATGTTCAGCTACTCAGGTGCA 2019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1510 GCTGGCGCAAATTGGGGATCAAAAACTGCAGGGAGTTCAATGTTCAGCTACTCAGGTGCA 1569 Query 2020 GTGTCAACTGAAATTCCTGAGCAGGACAATAATCTTGAGTCGACTTATCTATATATTCAA 2079 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1570 GTGTCAACTGAAATTCCTGAGCAGGACAACAATCTTGAGTCGACTTATCTATATATTCAA 1629 Query 2080 ATGGAATATTGTCCCAGGACTCTCCGCCAGGTTTTTGAATCATATAACCACTTCGACAAA 2139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1630 ATGGAATATTGTCCCAGGACTCTCCGCCAGGTTTTTGAATCATATAACCACTTCGACAAA 1689 Query 2140 GACTTTGCATGGCATTTAATTCGCCAAATTGTGGAAGGCTTAGCTCATATCCATGGACAA 2199 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1690 GATTTTGCATGGCATTTAATTCGCCAAATTGTGGAAGGCTTAGCTCATATCCATGGACAA 1749 Query 2200 GGAATAATTCATCGGGATTTTACACCTAACAATATTTTCTTTGACGCTCGGAATGATATT 2259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1750 GGAATAATTCATCGGGATTTTACACCTAACAATATTTTCTTTGACGCTCGGAATGATATC 1809 Query 2260 AAAATTGGGGATTTTGGTCTTGCAAAGTTCTTGAAGCTGGAACAGTTGGATCAAGATGGG 2319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1810 AAAATTGGGGATTTTGGTCTTGCAAAGTTCTTGAAGCTGGAACAGTTGGATCAAGATGGG 1869 Query 2320 GGTTTCTCTACGGATGTGGCTGGAAGCGGAGTCGATAGTACTGGTCAAGCTGGTACTTAC 2379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1870 GGTTTCTCTACGGATGTGGCTGGAAGCGGAGTCGATAGTACTGGTCAAGCTGGTACTTAC 1929 Query 2380 TTTTACACAGCACCTGAAATTGAGCAAGATTGGCCTAAGATTGATGAAAAGGCCGACATG 2439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1930 TTTTACACAGCACCTGAAATTGAGCAAGATTGGCCTAAGATTGATGAAAAGGCCGACATG 1989 Query 2440 TATAGCTTAGGGGTTGTGTTCTTTGAACTTTGGCATCCTTTTGGAACCGCCATGGAGAGA 2499 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1990 TATAGCTTAGGGGTTGTGTTCTTCGAACTTTGGCATCCTTTTGGAACCGCCATGGAGAGA 2049 Query 2500 CACGTTATTTTAACTAACCTGAAGCTGAAAGGGGAGCTACCTCTCAAATGGGTAAATGAA 2559 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2050 CACGTTATTTTAACTGACCTGAAGCTGAAAGGGGAGCTACCTCTCAAATGGATAAATGAA 2109 Query 2560 TTTCCCGAACAGGCGTCTCTACTGCGGCGTTTGATGTCTCCAAGTCCATCTGATCGTCCC 2619 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2110 TTTCCCGAACAGGCGTCTCTACTGCGGCGTTTGATGTCTCCAAGTCCGTCTGATCGTCCC 2169 Query 2620 TCTGCCACAGAACTTCTTAAGCATGCATTTCCTCCCAGAATGGAATCTGAGTTACTGGAC 2679 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2170 TCTGCCACAGAACTTCTTAAGCATGCATTTCCTCCCAGAATGGAATCTGAGTTACTGGAT 2229 Query 2680 AATATTCTAAGAATAATGCAAACTTCTGAAGATTCAAGTGTTTATGATAGAGTAGTAAGT 2739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2230 AATATTCTAAGAATAATGCAAACTTCTGAAGATTCAAGTGTTTATGATAGAGTAGTAAGT 2289 Query 2740 GTGATATTTGATGAAGAAGTATTAGAGATGAAAAGCCATCAGTCTAGTAGATCGAGACTC 2799 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2290 GTGATATTTGATGAAGAAGTATTAGAGATGAAAAGTCATCAGTCTAGTAGTTCGAGACTC 2349 Query 2800 TGTGCAGATGATAGTTATATTCAATACACAGAGATAAATACAGAGCTTCGTGATTATGTT 2859 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2350 TGCGCAGATGATAGTTATATTCAATACACAGAGATAAATACAGAGCTTCGTGATTATGTT 2409 Query 2860 GTTGAAATAACAAAAGAAGTCTTTAGGCAGCATTGTGCGAAGCATCTAGAGGTCATACCA 2919 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2410 GTTGATATCACAAAAGAAGTCTTTAGGCAGCATTGTGCGAAGCATCTAGAGGTCATCCCA 2469 Query 2920 ATGCGCTTACTTAGTGATTGCCCCCAGTTTAGCAGGAAAACTGTAAAGCTTTTGACCAAT 2979 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2470 ATGCGTTTACTTAGTGATTGCCCCCAGTTTAGCAGGAAAACTGTAAAGCTTTTGACCAAT 2529 Query 2980 GGAGGAGATATGCTTGAACTATGCTATGAGCTACGACTGCCTTTTGTGC-ATTGGATAAG 3038 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 2530 GGAGGAGATATGCTTGAACTATGCTATGAGCTACGACTGCCTTTTGT-CAATTGGATAAG 2588 Query 3039 CGTAAATCAGAAATCCTCATTCAAGCGATATGAAATATCTCATGTCTACAGGAGAGCAAT 3098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CGTAAATCAGAAATCCTCATTCAAGCGATATGAAATATCTCATGTCTACAGGAGAGCAAT 2648 Query 3099 TGGCCATTCTCCACCAAATCCGTGTCTTCAGGCGGACTTTGACATTGTTGGAGGCACACT 3158 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 TGGCCATTCTCCACCAAATCCGTGTCTTCAGGCGGACTTTGACATTGTTGGAGGCACACC 2708 Query 3159 ATCCCTGACAGAGGCAGAAGTTCTCAAGGTGATAGTAGACATCACAACCCACATCTTTCA 3218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 ATCCCTGACAGAGGCAGAAGTTCTCAAGGTGATAGTCGACATCACAACCCACATCTTTCA 2768 Query 3219 TCGCGGATCTTGTGACATTCATTTGAATCATGGAGATTTGCTGGATGCGATTTGGTCCTG 3278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TCGCGGATCTTGTGACATTCATTTGAATCATGGAGATTTGCTGGATGCGATTTGGTCCTG 2828 Query 3279 GGCAGGAATTAAGGCAGAGCATAGACGAAAGGTTGCAGAGCTTCTTTCCATGATGGGATC 3338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 GGCAGGAATTAAGGCAGAGCATAGACGAAAGGTTGCAGAGCTTCTTTCCATGATGGGATC 2888 Query 3339 CTTGCGTCCTCAGTCATCTGAGCGGAAGCTAAAATGGGTTTTCATAAGGCGTCAACTTCT 3398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CTTGCGTCCTCAGTCATCTGAGCGGAAGCTAAAATGGGTTTTCATAAGGCGTCAACTTCT 2948 Query 3399 TCAGGAGTTGAAGTTACCTGAAGCTGTTGTCAATAGACTGCAGACTGTTGCTTCAAGGTT 3458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2949 TCAGGAGTTGAAGTTACCTGAAGCTGTTGTCAATAGACTGCAGACTGTTGCTTCAAGGTT 3008 Query 3459 TTGTGGAGATGCAGATCAAGCACTTCCTCGTTTAAGAGGGGCTCTGCGTGCTGATAGACC 3518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3009 TTGTGGAGATGCAGATCAAGCACTTCCTCGTTTAAGAGGGGCTCTGCGTGCTGATAGACC 3068 Query 3519 TACCCGCAAAGCACTCGATGAGTTGTCAAACCTCTTAACCTACCTGAGAGTCTGGAGGAT 3578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3069 TACCCGCAAAGCACTCGATGAGTTGTCAAACCTCTTAACCTACCTGAGAGTCTGGAGGAT 3128 Query 3579 AGAAGAGCATGTTCATATTGATGTTCTGATGCCACCAACTGAAAGTTATCACCGGAATTT 3638 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3129 AGAAGAGCATGTTCATATTGATGTTCTGATGCCACCTACTGAAAGTTATCACCGGAATTT 3188 Query 3639 GTTTTTTCAGGTTTTCTTAACCAAAGAAAATAGCTCTGGGACATCTAATGATGGCGTTTT 3698 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 3189 GTTTTTTCAGGTTTTCTTAACCAAAGAAAATAGCTCTGGGACATCGAGTGATGGCGTTTT 3248 Query 3699 ACTTGCTGTTGGTGGTCGTTATGATTGGTTGGTGCAGGAAGTGTGTGATCGTGAACATAA 3758 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3249 ACTTGCTGTTGGTGGTCGTTATGATTTTTTGGTGCAGGAAGTGTGTGATCGTGAATATAA 3308 Query 3759 AATGAACCTCCCTGGTGCTGTTGGAGTTAGTCTTGCACTGGAGACAATATTTCAGCATCT 3818 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3309 AATGAATCTCCCTGGTGCTGTTGGCGTTAGTCTTGCACTGGAGACAATATTTCAACATCT 3368 Query 3819 TCCTATGGATCTAAGGCCTATTAGAAATGAAGTCAGCACCAGTGTACTTGTTTGTTCAAG 3878 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3369 TCCTATGGATCTAAGGCCTATTAGAAATGAAGTCAGCACCAGTGTACTTGTTTGTTCAAG 3428 Query 3879 AGGAGGTGGTGGTTTACTGGTCCAGCGCATGGAACTAGTTGCGGAACTATGGGAAAAAAG 3938 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3429 AGGAGGTGGCGGTTTACTGGTCCAGCGTATGGAACTAGTTGCGGAACTGTGGGAAAAAAG 3488 Query 3939 TATAAAGGCTGAGTTTGTTCCAACACCTGATCCAAGTCTTACTGAGCAGTACGAATATGC 3998 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 3489 CATAAAGGCTGAGTTTGTTCCAACACCTGATCCAAGTCTGACAGAGCAGTACGAATATGC 3548 Query 3999 AAATGAACATGAAATCAAATGTCTAGTGATCATCACAGAGTCTGGAGTAGCTCAAAATCA 4058 ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3549 AAACGAACATGAAATCAAATGTCTAGTGATCATCGCAGAGTCTGGAGTGGCTCAAAATCA 3608 Query 4059 AATAGAGTTTGTAAAGGTTCGTCACCTTGAACTGAAGAAGGAGAAAGTGGTAGGAAGAGA 4118 ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3609 AATAGAGTTTGTAAAGGTTAGGCACCTTGAACTGAAGAAGGAGAAAGTGGTAGGAAGAGA 3668 Query 4119 AGAACTTGTCAAATTTCTGCTGGATGCAATGGCTGTTCAATTTAGAAACCCCTCTGTTTG 4178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3669 AGAACTTGTCAAATTTCTGCTGGATGCAATGGCTGTTCAGTTTAGAAACCCCTCTGTTTG 3728 Query 4179 GAGCTAAAGAGAGTAAATAAAGAGCCACTTTTT 4211 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3729 GAGCTAAAGAGAGTAAATAAAGAGCCACTTTTT 3761 Score = 226 bits (122), Expect = 1e-57 Identities = 128/131 (98%), Gaps = 0/131 (0%) Strand=Plus/Plus Query 382 GAGGAAATGGGTCGCAGCAGTTCGAAGAAAAAGAAGAAACGAGGAGGTAGCGGAAGAAGG 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1 GAGGAAATGGGTCGCAGCAGTTCGAAGAAAAAGAAGAAACGAGGAGGTAGTGGAAGAAGG 60 Query 442 GGTCAGCTGAAAGACCATGGATCTAATGCTGATGAAGATAATGAACTTCTATCTGAGGAG 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct 61 GGTCAGCTGAAAGACCATGGATCTAATGCTGATGAAGATAATGAACTTTTATCGGAGGAG 120 Query 502 ATCACTGCTCT 512 ||||||||||| Sbjct 121 ATCACTGCTCT 131 > Ahg938956 jgi|Araly1|938956|scaffold_503147.1 Length=352 Score = 215 bits (116), Expect = 2e-54 Identities = 212/254 (83%), Gaps = 23/254 (9%) Strand=Plus/Minus Query 1 AATACGACGGCGTTTTGAATG--TT-TG-TGCTGGACAGGATCAACAT---AGAACTCTG 53 ||||||||| ||||| ||| | || || ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 251 AATACGACGACGTTTCGAAGGCTTTGTGCTGCTGGACAGGATCAACATAGAAGAACTCTG 192 Query 54 ATGGCGCCATCTTTG-A-AGAAGAGCCGTCGATGATT-TTTTCGTCATTGAGACT--TAT 108 ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||| || | ||||||| || Sbjct 191 ATGGCGCCATCTTTGAAGAGAAGAGCCGTCAATGCTTATTTTGGTTA-TGAGACTCAGAT 133 Query 109 ATA-AAACAAT-CACT-GAGAGCGATTTTTCAAAATTCTTTACGCCGGGATCAA-GTAGA 164 ||| ||||| | | | |||||| ||||||||||||| | ||||||| || || |||| Sbjct 132 ATATAAACATTCCTTTGGAGAGCCCTTTTTCAAAATTCCTCACGCCGGAAT-AATATAGA 74 Query 165 GAAAAGTAATCGAAGGTTTTGTTAGTGCTGGCAGTCACCGTCG-CCATTTTTT---GAAA 220 |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| Sbjct 73 GAAAAGTAATCGGAGGTTTTGTTAGTGCTGGCAATCACC-TCGGCCATTTTTTTTTGAAA 15 Query 221 TTCTTAGATCGAAA 234 |||||||||||||| Sbjct 14 TTCTTAGATCGAAA 1 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 162620009429 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5