BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G59410.2
Length=4300
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486408 jgi|Araly1|486408|fgenesh2_kg.5__2400__AT3G59410.1 6215 0.0
Ahg938956 jgi|Araly1|938956|scaffold_503147.1 215 2e-54
> Ahg486408 jgi|Araly1|486408|fgenesh2_kg.5__2400__AT3G59410.1
Length=3761
Score = 6215 bits (3365), Expect = 0.0
Identities = 3545/3633 (98%), Gaps = 7/3633 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 584 TCTCTGCAATATTTCAAGAGGACTGCAAAGTTGTTTCTGATTCGCGTTCGCCTCCGCAAA 643
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 131 TCTCCGCAATATTTCAAGAGGACTGCAAAATTGTTTCAGATTCGCGTTCCCCTCCGCAAA 190
Query 644 TAGCAATCAAGCTCAGG---CCGTACTC-AAAGGACATGGGATATGAAGACACCGACATA 699
| | ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 191 TTGTAATCAAGCTCAGGTTTTCGTACTCGAAA-GATATGGGATATGAGGACATCGACATC 249
Query 700 TCTGCTATGCTTATAGTTAGGTGCTTACCAGGATATCCTTACAAGTGCCCCAAGCTTCAG 759
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 TCTGCTATGCTTGTAGTGAGGTGCTTACCAGGATATCCTTACAAGTGCCCCAAGCTTCAG 309
Query 760 ATTACTCCAGAACAAGGGTTGACAACAGCTGATGCTGAGAAGCTTTTATCTCTTCTCGAG 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 ATTACTCCAGAACAAGGGTTGACAACAGCTGATGCTGAGAAGCTTTTATCTCTTCTCGAG 369
Query 820 GACCAGGCAAATTCCAATGCTCGTGAAGGTCGGGTTATGATATTCAACCTGGTGGAGGCT 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 GACCAGGCAAATTCCAATGCTCGTGAAGGTCGGGTTATGATATTCAACCTGGTGGAGGCT 429
Query 880 GCTCAAGAGTTTTTATCAGAAATCATTCCGGAAAGTCATGATGAGGAATCTGTTCCATGC 939
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 430 GCCCAAGAGTTTTTATCAGAAATCATTCCGGAAAGTCACGATGAGGAACCTGTTCCATGC 489
Query 940 TTGACTGCACATCGAAGCACTCAGTTCATTGAGCAACCTATGCTTTCAAATATAGCAAAA 999
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 490 TTGACTGCACATCGAAGCGCTCAGTTCATTGAGCAACCTATGCTTTCAAATAAAGCAAAA 549
Query 1000 TCCTGTTCTGGTGGACCTTTTGTGTATGGTTTTATAGACCTATTTAGTGGCTTGGAAGAT 1059
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 TCCTGTACTGGTGGACCTTTTGTGTATGGTTTTATAGACCTATTTAGTGGCTTGGAAGAT 609
Query 1060 GCAAGAAATTGGAGTCTGACTCCAGATGAAAATAGGGGAATCGTATCTTCAGTACAATCT 1119
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 GCAAGGAATTGGAGTCTGACTCCAGATGAAAATAGGGGAATCGTATCTTCAGTACAATCT 669
Query 1120 CACCCACTAGACACTTCAAGAATTTTGCATCAGAAGCCAGACAAGAATCTGAAGCGATTT 1179
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||
Sbjct 670 CACCCACTAGACACTTCAAGAATTTTGCATGAGAAGTCGGACAAGAATCTTAAGCGATTT 729
Query 1180 GAAGACCATGCTAAAGAAGAAGTTGCACTGCCTGCTCCCATTGCCAAACTGAATACTGTT 1239
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 730 GAGGACCATGCTAAAGAAGAAATTGCACTGCCTGCTCCCACTGCCAAACTAAATACTGTT 789
Query 1240 CAAGAGGAGAATGTTGATGATACAAGCATCTCTTCTTTTGACTCAAGTAAATCTACTGAC 1299
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 CAAGAGGATAATGTTGATGATACAAGCATCTCCTCTTTTGACTCAAGTAAATCTACTGAC 849
Query 1300 GATGTGGAATCTGGATTATTCCAAAATGAGAAGAAGGAATCAAATCTTCAAGATGATACA 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 GATGTGGAATCTGGATTATTCCAAAATGAGAAGAAGGAATCAAATCTTCAAGATGATACA 909
Query 1360 GCTGAAGATGACAGCACTAACTCCGAAAGTGAGTCGCTGGGGTCATGGTCTTCTGATTCC 1419
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 GCTGAAGATGACAGCAGTAACTCCGAAAGTGAGTCGCTGGGGTCATGGTCTTCTGATTCC 969
Query 1420 TTAGCTCAAGATCAAGTGCCTCAGATTAGCAAGAAAGATCTGTTGATGGTCCATTTACTT 1479
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 970 TTATCTCAAGATCAAGTGCCTCAGATTAGCAAGAAAGACCTGTTGATGGTCCATTTACTT 1029
Query 1480 CGAGTAGCTTGCACTTCCCGAGGACCTTTGGCTGATGCATTACCTCAGATAACTGATGAA 1539
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 CGAGTAGCTTGCACTTCCAGAGGACCTTTGGCTGATGCATTACCTCAGATAACTGATGAA 1089
Query 1540 CTGCATGAGCTTGGTATATTGTCTGAAGAAGTGTTGGATTTAGCTTCCAAATCATCTCCA 1599
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1090 CTGCATCAGCTTGGTATATTGTCTGAAGAAGCGTTGGATTTAGCTTCGAAATCATCTCCA 1149
Query 1600 GACTTTAATAGAACCTTTGAACATGCATTCAATCAAAACATGGCCTCAACCAGTGTTCCT 1659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1150 GACTTTAATAGAACCTTTGAACATGCATTCAATCAAAACATGGTCTCAACCAGTGTTCCT 1209
Query 1660 CAGTTTTGGGAGCCACCTTCTGATTCTTGCGAGCCAAATGCATCACTCCCAAGCTCGCGA 1719
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 CAGTTTTGGGAGCCACCTTCTGATTCTGGCGAGCCAAATGCATCACTCCCAAGCTCGCGA 1269
Query 1720 TATCTCAATGATTTTGAAGAGTTGAAACCCCTTGGCCAAGGTGGTTTCGGCCACGTTGTG 1779
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 TATCTCAATGATTTTGAAGAGTTGAAACCCCTTGGACAAGGTGGTTTCGGCCACGTTGTG 1329
Query 1780 TTGTGCAAAAATAAACTGGATGGAAGACAATATGCAGTGAAGAAAATTCGACTGAAGGAC 1839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 TTGTGCAAAAATAAACTGGATGGAAGACAATATGCAGTGAAGAAAATTCGACTGAAGGAG 1389
Query 1840 AAAGAGATACCTGTCAACAGTCGGATAGTTCGAGAAGTAGCAACACTTTCCCGTTTGCAG 1899
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390 AAAGAGATACCTGTCAACAGTCGAATAGTTCGAGAAGTAGCAACACTTTCCCGTTTGCAG 1449
Query 1900 CATCAGCATGTTGTACGTTACTATCAGGCCTGGTTCGAAACAGGAGTTGTTGATCCCTTT 1959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1450 CATCAGCATGTTGTACGTTACTATCAGGCCTGGTTCGAAACAGGAGTTGTTGATCCTTTT 1509
Query 1960 GCTGGCGCAAATTGGGGATCAAAAACTGCAGGGAGTTCAATGTTCAGCTACTCAGGTGCA 2019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 GCTGGCGCAAATTGGGGATCAAAAACTGCAGGGAGTTCAATGTTCAGCTACTCAGGTGCA 1569
Query 2020 GTGTCAACTGAAATTCCTGAGCAGGACAATAATCTTGAGTCGACTTATCTATATATTCAA 2079
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 GTGTCAACTGAAATTCCTGAGCAGGACAACAATCTTGAGTCGACTTATCTATATATTCAA 1629
Query 2080 ATGGAATATTGTCCCAGGACTCTCCGCCAGGTTTTTGAATCATATAACCACTTCGACAAA 2139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 ATGGAATATTGTCCCAGGACTCTCCGCCAGGTTTTTGAATCATATAACCACTTCGACAAA 1689
Query 2140 GACTTTGCATGGCATTTAATTCGCCAAATTGTGGAAGGCTTAGCTCATATCCATGGACAA 2199
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 GATTTTGCATGGCATTTAATTCGCCAAATTGTGGAAGGCTTAGCTCATATCCATGGACAA 1749
Query 2200 GGAATAATTCATCGGGATTTTACACCTAACAATATTTTCTTTGACGCTCGGAATGATATT 2259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750 GGAATAATTCATCGGGATTTTACACCTAACAATATTTTCTTTGACGCTCGGAATGATATC 1809
Query 2260 AAAATTGGGGATTTTGGTCTTGCAAAGTTCTTGAAGCTGGAACAGTTGGATCAAGATGGG 2319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 AAAATTGGGGATTTTGGTCTTGCAAAGTTCTTGAAGCTGGAACAGTTGGATCAAGATGGG 1869
Query 2320 GGTTTCTCTACGGATGTGGCTGGAAGCGGAGTCGATAGTACTGGTCAAGCTGGTACTTAC 2379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 GGTTTCTCTACGGATGTGGCTGGAAGCGGAGTCGATAGTACTGGTCAAGCTGGTACTTAC 1929
Query 2380 TTTTACACAGCACCTGAAATTGAGCAAGATTGGCCTAAGATTGATGAAAAGGCCGACATG 2439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1930 TTTTACACAGCACCTGAAATTGAGCAAGATTGGCCTAAGATTGATGAAAAGGCCGACATG 1989
Query 2440 TATAGCTTAGGGGTTGTGTTCTTTGAACTTTGGCATCCTTTTGGAACCGCCATGGAGAGA 2499
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 TATAGCTTAGGGGTTGTGTTCTTCGAACTTTGGCATCCTTTTGGAACCGCCATGGAGAGA 2049
Query 2500 CACGTTATTTTAACTAACCTGAAGCTGAAAGGGGAGCTACCTCTCAAATGGGTAAATGAA 2559
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2050 CACGTTATTTTAACTGACCTGAAGCTGAAAGGGGAGCTACCTCTCAAATGGATAAATGAA 2109
Query 2560 TTTCCCGAACAGGCGTCTCTACTGCGGCGTTTGATGTCTCCAAGTCCATCTGATCGTCCC 2619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2110 TTTCCCGAACAGGCGTCTCTACTGCGGCGTTTGATGTCTCCAAGTCCGTCTGATCGTCCC 2169
Query 2620 TCTGCCACAGAACTTCTTAAGCATGCATTTCCTCCCAGAATGGAATCTGAGTTACTGGAC 2679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2170 TCTGCCACAGAACTTCTTAAGCATGCATTTCCTCCCAGAATGGAATCTGAGTTACTGGAT 2229
Query 2680 AATATTCTAAGAATAATGCAAACTTCTGAAGATTCAAGTGTTTATGATAGAGTAGTAAGT 2739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2230 AATATTCTAAGAATAATGCAAACTTCTGAAGATTCAAGTGTTTATGATAGAGTAGTAAGT 2289
Query 2740 GTGATATTTGATGAAGAAGTATTAGAGATGAAAAGCCATCAGTCTAGTAGATCGAGACTC 2799
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2290 GTGATATTTGATGAAGAAGTATTAGAGATGAAAAGTCATCAGTCTAGTAGTTCGAGACTC 2349
Query 2800 TGTGCAGATGATAGTTATATTCAATACACAGAGATAAATACAGAGCTTCGTGATTATGTT 2859
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2350 TGCGCAGATGATAGTTATATTCAATACACAGAGATAAATACAGAGCTTCGTGATTATGTT 2409
Query 2860 GTTGAAATAACAAAAGAAGTCTTTAGGCAGCATTGTGCGAAGCATCTAGAGGTCATACCA 2919
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2410 GTTGATATCACAAAAGAAGTCTTTAGGCAGCATTGTGCGAAGCATCTAGAGGTCATCCCA 2469
Query 2920 ATGCGCTTACTTAGTGATTGCCCCCAGTTTAGCAGGAAAACTGTAAAGCTTTTGACCAAT 2979
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2470 ATGCGTTTACTTAGTGATTGCCCCCAGTTTAGCAGGAAAACTGTAAAGCTTTTGACCAAT 2529
Query 2980 GGAGGAGATATGCTTGAACTATGCTATGAGCTACGACTGCCTTTTGTGC-ATTGGATAAG 3038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 2530 GGAGGAGATATGCTTGAACTATGCTATGAGCTACGACTGCCTTTTGT-CAATTGGATAAG 2588
Query 3039 CGTAAATCAGAAATCCTCATTCAAGCGATATGAAATATCTCATGTCTACAGGAGAGCAAT 3098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 CGTAAATCAGAAATCCTCATTCAAGCGATATGAAATATCTCATGTCTACAGGAGAGCAAT 2648
Query 3099 TGGCCATTCTCCACCAAATCCGTGTCTTCAGGCGGACTTTGACATTGTTGGAGGCACACT 3158
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 TGGCCATTCTCCACCAAATCCGTGTCTTCAGGCGGACTTTGACATTGTTGGAGGCACACC 2708
Query 3159 ATCCCTGACAGAGGCAGAAGTTCTCAAGGTGATAGTAGACATCACAACCCACATCTTTCA 3218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709 ATCCCTGACAGAGGCAGAAGTTCTCAAGGTGATAGTCGACATCACAACCCACATCTTTCA 2768
Query 3219 TCGCGGATCTTGTGACATTCATTTGAATCATGGAGATTTGCTGGATGCGATTTGGTCCTG 3278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2769 TCGCGGATCTTGTGACATTCATTTGAATCATGGAGATTTGCTGGATGCGATTTGGTCCTG 2828
Query 3279 GGCAGGAATTAAGGCAGAGCATAGACGAAAGGTTGCAGAGCTTCTTTCCATGATGGGATC 3338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829 GGCAGGAATTAAGGCAGAGCATAGACGAAAGGTTGCAGAGCTTCTTTCCATGATGGGATC 2888
Query 3339 CTTGCGTCCTCAGTCATCTGAGCGGAAGCTAAAATGGGTTTTCATAAGGCGTCAACTTCT 3398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2889 CTTGCGTCCTCAGTCATCTGAGCGGAAGCTAAAATGGGTTTTCATAAGGCGTCAACTTCT 2948
Query 3399 TCAGGAGTTGAAGTTACCTGAAGCTGTTGTCAATAGACTGCAGACTGTTGCTTCAAGGTT 3458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 TCAGGAGTTGAAGTTACCTGAAGCTGTTGTCAATAGACTGCAGACTGTTGCTTCAAGGTT 3008
Query 3459 TTGTGGAGATGCAGATCAAGCACTTCCTCGTTTAAGAGGGGCTCTGCGTGCTGATAGACC 3518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 TTGTGGAGATGCAGATCAAGCACTTCCTCGTTTAAGAGGGGCTCTGCGTGCTGATAGACC 3068
Query 3519 TACCCGCAAAGCACTCGATGAGTTGTCAAACCTCTTAACCTACCTGAGAGTCTGGAGGAT 3578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3069 TACCCGCAAAGCACTCGATGAGTTGTCAAACCTCTTAACCTACCTGAGAGTCTGGAGGAT 3128
Query 3579 AGAAGAGCATGTTCATATTGATGTTCTGATGCCACCAACTGAAAGTTATCACCGGAATTT 3638
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3129 AGAAGAGCATGTTCATATTGATGTTCTGATGCCACCTACTGAAAGTTATCACCGGAATTT 3188
Query 3639 GTTTTTTCAGGTTTTCTTAACCAAAGAAAATAGCTCTGGGACATCTAATGATGGCGTTTT 3698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 3189 GTTTTTTCAGGTTTTCTTAACCAAAGAAAATAGCTCTGGGACATCGAGTGATGGCGTTTT 3248
Query 3699 ACTTGCTGTTGGTGGTCGTTATGATTGGTTGGTGCAGGAAGTGTGTGATCGTGAACATAA 3758
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3249 ACTTGCTGTTGGTGGTCGTTATGATTTTTTGGTGCAGGAAGTGTGTGATCGTGAATATAA 3308
Query 3759 AATGAACCTCCCTGGTGCTGTTGGAGTTAGTCTTGCACTGGAGACAATATTTCAGCATCT 3818
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3309 AATGAATCTCCCTGGTGCTGTTGGCGTTAGTCTTGCACTGGAGACAATATTTCAACATCT 3368
Query 3819 TCCTATGGATCTAAGGCCTATTAGAAATGAAGTCAGCACCAGTGTACTTGTTTGTTCAAG 3878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3369 TCCTATGGATCTAAGGCCTATTAGAAATGAAGTCAGCACCAGTGTACTTGTTTGTTCAAG 3428
Query 3879 AGGAGGTGGTGGTTTACTGGTCCAGCGCATGGAACTAGTTGCGGAACTATGGGAAAAAAG 3938
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3429 AGGAGGTGGCGGTTTACTGGTCCAGCGTATGGAACTAGTTGCGGAACTGTGGGAAAAAAG 3488
Query 3939 TATAAAGGCTGAGTTTGTTCCAACACCTGATCCAAGTCTTACTGAGCAGTACGAATATGC 3998
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 3489 CATAAAGGCTGAGTTTGTTCCAACACCTGATCCAAGTCTGACAGAGCAGTACGAATATGC 3548
Query 3999 AAATGAACATGAAATCAAATGTCTAGTGATCATCACAGAGTCTGGAGTAGCTCAAAATCA 4058
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3549 AAACGAACATGAAATCAAATGTCTAGTGATCATCGCAGAGTCTGGAGTGGCTCAAAATCA 3608
Query 4059 AATAGAGTTTGTAAAGGTTCGTCACCTTGAACTGAAGAAGGAGAAAGTGGTAGGAAGAGA 4118
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3609 AATAGAGTTTGTAAAGGTTAGGCACCTTGAACTGAAGAAGGAGAAAGTGGTAGGAAGAGA 3668
Query 4119 AGAACTTGTCAAATTTCTGCTGGATGCAATGGCTGTTCAATTTAGAAACCCCTCTGTTTG 4178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3669 AGAACTTGTCAAATTTCTGCTGGATGCAATGGCTGTTCAGTTTAGAAACCCCTCTGTTTG 3728
Query 4179 GAGCTAAAGAGAGTAAATAAAGAGCCACTTTTT 4211
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3729 GAGCTAAAGAGAGTAAATAAAGAGCCACTTTTT 3761
Score = 226 bits (122), Expect = 1e-57
Identities = 128/131 (98%), Gaps = 0/131 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 382 GAGGAAATGGGTCGCAGCAGTTCGAAGAAAAAGAAGAAACGAGGAGGTAGCGGAAGAAGG 441
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1 GAGGAAATGGGTCGCAGCAGTTCGAAGAAAAAGAAGAAACGAGGAGGTAGTGGAAGAAGG 60
Query 442 GGTCAGCTGAAAGACCATGGATCTAATGCTGATGAAGATAATGAACTTCTATCTGAGGAG 501
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 61 GGTCAGCTGAAAGACCATGGATCTAATGCTGATGAAGATAATGAACTTTTATCGGAGGAG 120
Query 502 ATCACTGCTCT 512
|||||||||||
Sbjct 121 ATCACTGCTCT 131
> Ahg938956 jgi|Araly1|938956|scaffold_503147.1
Length=352
Score = 215 bits (116), Expect = 2e-54
Identities = 212/254 (83%), Gaps = 23/254 (9%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AATACGACGGCGTTTTGAATG--TT-TG-TGCTGGACAGGATCAACAT---AGAACTCTG 53
||||||||| ||||| ||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 251 AATACGACGACGTTTCGAAGGCTTTGTGCTGCTGGACAGGATCAACATAGAAGAACTCTG 192
Query 54 ATGGCGCCATCTTTG-A-AGAAGAGCCGTCGATGATT-TTTTCGTCATTGAGACT--TAT 108
||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||| || | ||||||| ||
Sbjct 191 ATGGCGCCATCTTTGAAGAGAAGAGCCGTCAATGCTTATTTTGGTTA-TGAGACTCAGAT 133
Query 109 ATA-AAACAAT-CACT-GAGAGCGATTTTTCAAAATTCTTTACGCCGGGATCAA-GTAGA 164
||| ||||| | | | |||||| ||||||||||||| | ||||||| || || ||||
Sbjct 132 ATATAAACATTCCTTTGGAGAGCCCTTTTTCAAAATTCCTCACGCCGGAAT-AATATAGA 74
Query 165 GAAAAGTAATCGAAGGTTTTGTTAGTGCTGGCAGTCACCGTCG-CCATTTTTT---GAAA 220
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||
Sbjct 73 GAAAAGTAATCGGAGGTTTTGTTAGTGCTGGCAATCACC-TCGGCCATTTTTTTTTGAAA 15
Query 221 TTCTTAGATCGAAA 234
||||||||||||||
Sbjct 14 TTCTTAGATCGAAA 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 162620009429
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5