BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G59770.3
Length=5308
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg939002 jgi|Araly1|939002|scaffold_503193.1 4351 0.0
> Ahg939002 jgi|Araly1|939002|scaffold_503193.1
Length=4931
Score = 4351 bits (2356), Expect = 0.0
Identities = 2566/2669 (96%), Gaps = 8/2669 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2413 AGGGTGCTTCAATACCACGCTGTGCAAATGGTACAAATCTTCTGGTACCCTTACCAGGGC 2472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2270 AGGGTGCTTCAATACCACGCTGTGCAAATGGTACAAATCTTCTGATACCCTTACCAGGGC 2329
Query 2473 CAATTAGTTCTGAGGATATGGCTGTTACTGGAGCTGGTGCACGTCTTCATGAAAAAGATA 2532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 CAATTAGTTCTGAGGATATGGCTGTTACTGGAGCTGGTGCACGTCTTCATGAAAAAGATA 2389
Query 2533 CGTCAAGTCTTTCACTGCTATATGATTTTGAAGAACTAGAAGGACAGTTGGATTTCTTAA 2592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 CGTCAAGTCTTTCACTGCTATATGATTTTGAAGAACTAGAAGGACAGTTGGATTTCTTAA 2449
Query 2593 CCCGTGTAGTTGCTGTTACATTTTATCCAGCTGGTGCTGTTAGAATTCCTATGACTCTTG 2652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2450 CCCGTGTAGTTGCTGTTACATTTTATCCAGCTGGTGCTGTTAGAATTCCTATGACTCTTG 2509
Query 2653 GTCAGATAGAAGTCCTTGGAATTTCTCTTCCATGGAAAGGAATGTTTACTTGTGAACGTA 2712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 GTCAGATAGAAGTCCTTGGAATTTCTCTTCCATGGAAACGAATGTTTACTTGTGAACGTA 2569
Query 2713 CTGGAGGAAGATTAGCTGAACTTGCAAGGAAACCAGATGAAGATGGAAGTCCTTTTTCAT 2772
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2570 CTGGAGGAAGATTAGCTGAACTTGCAAGAAAACCAGATGAAGATGAAAGTCCTTTTTCAT 2629
Query 2773 CTTGTTCTGACTTGAATCCGTTTGCTGCAACAACATCTTTACAGGCTGAAACTGTTTCCA 2832
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2630 CTTGTTCTGACTTGAATCCGTTTGCTTCAACA---TCTTTACAGACTGAAACTGTTTCCA 2686
Query 2833 CACCAGTACAACAGAAGGATCCCTTTCCCAGTAATCTGCTTGACCTTTTGACAGGAGAGG 2892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2687 CACCAGTACAACAGAAGGATCCCTTTCCCAGTAATCTGCTTGACCTTTTGACAGGAGAGG 2746
Query 2893 ACTCTTCTTCTGACCCCTTCCCACAACCAGTGGTGGAATGTATTGCAAGTGGAGGCAATG 2952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 2747 ACTCTTCTTCTGACCCCTTCCCACAACCAGTGGTGGAATGTGTTGCAAGTGGAGGAAATG 2806
Query 2953 ACATGCTTGATTTCTTAGACGAAGCAGTTGTTGAATATCGCGGCTCTGACACTGTTCCTG 3012
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807 ACATGCTTGATTTCTTAGACCAAGCAGTTGTTGAATATCGCGGCTCTGACACTGTTCCTG 2866
Query 3013 ACGGGTCTGTCCCACAAAATAAAAGGCCCAAGGACAGTGGTGCTCATCTGTACTTAAATT 3072
|| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2867 GCGAGTCTGTCCCACAAGACAAAAGGCCCAAGGACAGTGGTGCTCATCTGTACTTAAATT 2926
Query 3073 GCCTAAAGTCCCTTGCGGGTCCAAACATGGCAAAGAAGCTTGAGTTTGTAGAAGCTATGA 3132
| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2927 GTCTAAAATCCCTTGCGGGTCCAAACATGGGAAAGAGGCTTGAGTTTGTAGAAGCGATGA 2986
Query 3133 AGCTTGAAATTGAACGTCTACGTCTCAATATTTCTGCAGCAGAAAGAGATAGGGCACTGT 3192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2987 AGCTTGAAATTGAACGTCTACGTCTCAATATTTCTGCAGCAGAAAGAGATAAGGCACTGT 3046
Query 3193 TATCGATTGGAATTGATCCAGCTACCATTAATCCAAACTCTTCATACGACGAGTTATATA 3252
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3047 TATCGGTTGGAATGGATCCAGCTACCATTAATCCAAACTCTTCATACGACGAGTCATATA 3106
Query 3253 TTGGAAGATTATGCAAAATAGCAAATGCACTTGCAGTTATGGGCCAGGCTTCTCTTGAAG 3312
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3107 TTGGAAGATTATGCAGAATAGCAAATGCACTTGCAGTTATGGGCCAGGCTTCTCTTGAAG 3166
Query 3313 ATAAAATTATAGCTTCTATTGGTCTAGAGAAGCTGGAAAATAATGTGATAGATTTCTGGA 3372
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3167 ATAAAATTATAGCTTCTATTGGTCTAGGGAAGCTGGAAAATAATGTGATAGATTTCTGGA 3226
Query 3373 ACATAACCAGAATTGGTGAGGGTTGTGATGGCGGAATGTGTCAAGTCCGAGCCGAGGTCA 3432
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3227 ACATAACCGGAACTGGTGAGGGTTGTGATGGCGGAATGTGTCAAGTCAGAGCCGAGGTCA 3286
Query 3433 ATAAAAGTCCAGTTGGATCTTCTACCAAGAGTTCAAGAGGAGAGTCGGGCTCAGTGTTCT 3492
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3287 ATAAAAGTCCAGTTGGATCTTCTACCAAGAGTTCAGGACGAGAGTCGGGCTCAGTGTTCA 3346
Query 3493 TGTGCTTCCAATGTATGAAAAAAGCTTGCAAGTTTTGTTGTGCTGGAAAAGGAGCTCTTC 3552
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3347 TGTGTTTCCAATGTATGAAAAAAGCTTGCAAGTTTTGTTGTGCTGGAAAAGGAGCTCTTC 3406
Query 3553 TGCTTTCAAAATCCTACTCCAGGGACACTGCGAATGGAGGTGGAAGTCTTGCAGATGTCT 3612
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3407 TGCTTTCAAAATCTTACTCCAGGGACACTGCGAATGGAGGTGGAAGTCTTGCAGATGTCT 3466
Query 3613 CTGCTACTTCGATAGGTTCAGATCATTACATTTGTAAAAAATGCTGCAGCTCGATAGTGC 3672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3467 CTGCTACTTCGATAGGTTCAGATCATTACATTTGTAAAAAATGCTGCAGCTCGATAGTGC 3526
Query 3673 TTGAAGCCCTGATTGTAGATTATGTAAGGGTCATGGTCAGCTTGCGAAGAAGTGGCCGTG 3732
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 3527 TTGAAGCCTTGATTGTAGATTATGTAAGGGTCATGATCAGCCTGCGAAGAAGTGGTCGTG 3586
Query 3733 TTGATAATGCTGGTCGGGAAGCTTTGAATGAGGTATTTGGATCTAACATTACAAATCACC 3792
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3587 TTGATAGTGCTGGTCGGGAAGCTTTGAATGAGATATTTGGATCTAACATTACAAATCATC 3646
Query 3793 TTGCTGTTAGAGGTCAACCTTCTCCTAATCGAGAAGACTTCAATTTCCTTCGTCAAATTT 3852
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 TTGCTGTTAGAGGTCAACCTTCTCCTAATGGAGAAGACTTCAATTTCCTTCGTCAAATTT 3706
Query 3853 TGGGTAAAGAGGAGTCGCTTTCTGAGTTCCCATTTGCAAGCTTCTTACATAAGGTCGAAA 3912
||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3707 TGGGTCAAGAGGAGTCACTTGCTGAGTTCCCATATGCAAGCTTCTTACATAAGGTCGAAA 3766
Query 3913 CTGCGACTGATTCAGCACCATTTTTCTCATTGCTCACCCCTCTGAATCTTGCTTCAAGTA 3972
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3767 CTGGGACTGATTCAGCACCATTTTTCTCATTGCTCACCCCTCTGAATCTTGCTTCAAGTA 3826
Query 3973 ATGCCTACTGGAAAGCTCCTCCGTCTGCAGACTCTGTTGAAGCCGCCATTGTTCTCAACA 4032
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3827 ATGCCTACTGGAAAGCTCCTCCGTCTGCAAACTCTGTTGAAGCCGTCATTGTTCTCAACA 3886
Query 4033 CCCTTTCAGATGTCAGCAGTGTGATTCTACTCGTTAGTCCATGTGGTTACTCTGATGCTG 4092
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3887 GCCTTTCAGATGTCAGCAGTGTGATTCTACTCGTTAGTCCATGTGGTTACTCTGATGCTG 3946
Query 4093 ATGCTCCTACCGTCCAAATTTGGGCGAGCAGCGACATAAACAAGGAAGCACGGACTTTGA 4152
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3947 ATGCTCCTACCGTCCAAGTTTGGGCCAGCAGCGACATAAATAAAGAAGCACGGACTTTGA 4006
Query 4153 TGGGAAAGTGGGATGTACAGTCCTTTATTAGATCTTCGCCTGAGCTTTCTGGTTCAGAAA 4212
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||
Sbjct 4007 TGGGAAAGTGGGATGTACAGTCCTTTATTAGATCTTCGCCTGAGCTGTATGGTCCAGAAA 4066
Query 4213 AGTCTGGTAGAGCACCTAGGCATATAAAATTTGCTTTCAAGAATCCTGTCCGTTGCCGCA 4272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4067 AGTCTGGTAGAGCACCTAGGCATATAAAATTTGCTTTCAAGAATCCTGTTCGTTGCCGCA 4126
Query 4273 TTATATGGATAACACTGCGTCTTCCTAGGCTTGGATCTAGTAGCTCAGTTAGTTTGGACA 4332
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 4127 TTATATGGATAACACTGCGTCTTCCTCGGCTTGGATCCAG---CTCAGTTAGTTTGGACA 4183
Query 4333 AAAACATCAATCTCTTATCTTTGGATGAGAACCCATTTGCTCCAATTCCTCGACGTGCCT 4392
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4184 AAAACATTAATCTCTTATCTTTGGATGAGAACCCATTTGCTCCAATTCCTCGGCGTGCCT 4243
Query 4393 CTTTTGGAGCAACCATTGAGAATGATCCATGTATTCATGCAAAACACATCTTGGTCACTG 4452
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4244 CTTTTGGAGCAACCATTGAGAATGATCCATGTCTTCATGCAAAACGCATCTTGGTCACTG 4303
Query 4453 GAAACACCGTGAGGGATAAAACGCTACAAAGTGTTGAGAGCATGAGCGTAAGAAACTGGC 4512
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4304 GAAACACCGTGAGGGATAAAACACTACAAAGTGTTGAGAGCATGAGCATAAGAAACTGGC 4363
Query 4513 TGGACAGAGCCCCACGTTTGAATAGATTCCTGATACCAT-TAGAGACTGAGAGACCAATG 4571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||
Sbjct 4364 TGGACAGAGCCCCACGTTTGAATAGATTCCTGATACC-TCTAGAGGCTGAGAGACCAATG 4422
Query 4572 GAGAATGATCTAGTCTTGGAACTTTATCTGCAACCTGCTTCACCTTTAGCTGCTGGATTC 4631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4423 GAGAATGATCTAGTCTTGGAACTTTATCTGCAACCTGCTTCACCTTTAGCTGCTGGATTC 4482
Query 4632 CGTTTAGATGCTTTTAGTGCGATAAAGCCTCGTGTAACCCACTCGCCTTCTTCAGATGTA 4691
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 4483 CGTTTAGATGCTTTTAGTGCGATAAAGCCTCGTGTGACCCACTCACCTTCTTCGGATGTA 4542
Query 4692 GTTGACATTTGGGACCCGACGAGTGTCATAATGGAAGATAGACACGTCTCTCCGGCCATC 4751
|||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 4543 GTTGACATATGGGACCCGGCGAGTATCATAATGGAAGATAGACACGTCTCTCCTGCCGTC 4602
Query 4752 TTGTATATACAAGTATCTGTTCTACAGGAGCAATACAAAATGGTGACAATCGCGGAATAC 4811
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 4603 TTGTATATACAAGTATCTGTTCTTCAGGAGCAATACAAAACGGTGACAATTGCGGAATAC 4662
Query 4812 AGATTGCCTGAGGCGAGAGATGGAACAAAGTTGTATTTTGACTTCCCTAAACAGATACAA 4871
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4663 AGATTGCCTGAGACGAGAGATGGAACAAAGATGTTTTTTGACTTCCCTAAACAGATTCAA 4722
Query 4872 GCACAGAGAGTATCGTTTAAACTGCTAGGAGATGTAGCAGCTTTTACAGATGAGCCCGCA 4931
||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 4723 GCACACACAGTTTCGTTTAAGCTGCTAGGAGATGTAGCAGCTTTTGCAGATGATCCCGCA 4782
Query 4932 GAGGCTGTTGATTTGAGCAGCCGGGCTTCTCCTTTTGCTGCAGGACTGTCTTTAGCAAAC 4991
|||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4783 GAGGCTGTTGATTTAAGCGGTCGGGCATCTCCATTTGCTGCAGGACTGTCTTTAGCAAAC 4842
Query 4992 AGGATCAAGCTATATTACTATGCGGATCCTTACGAAGTAGGCAAATGGACTAGCCTTTCA 5051
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4843 AGGATCAAGCTATATTACTATGCGGATCCTTACGAAGTAGGCAAATGGGCTAGCCTTTCA 4902
Query 5052 AGTGTCTGATTTTACACTTTCACTGGCCG 5080
| ||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4903 AATGTCTGATTTTACTCTCTCACTGGCCG 4931
Score = 3812 bits (2064), Expect = 0.0
Identities = 2205/2274 (97%), Gaps = 6/2274 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 96 TGGTCCGCTTGGTCCTGAGCTCAGATGGATCTGCATCCACCAGGTGGTTCAAAAAAGACA 155
||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGGTCTGCTTGGCCCTGAGTTCAGATGGATCTGCATCCACCAGGTGGTTCAAAAAAGACA 60
Query 156 TCTGTAGTTGTTGTCACCTTAGACACTGGTGAAGTCTATGTCATTGCAAGTTTGTTATCT 215
||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 61 TCTATTGTTGTTGTCACCTTAAACTCTGGTGAAGTCTATGTCATTGCAAGTTTGCTATCT 120
Query 216 AAGGCTGATACTCAAGTTATCTATATCGATCCTACGACTGGTATCCTGCGGTACAATGGG 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAGGCTGATACTCAAGTTATCTATATCGATCCTACGACTGGTATCCTGCGGTACAATGGG 180
Query 276 AAGCCTGGCCTTGATAATTTTAAGTCAGAGCGTGAAGCCTTAGATTATATTACGAATGGA 335
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 181 AAGCCTGGTCTTGATAATTTTAAGTCAGAGCGTGAAGCCTTAGACTATATCACGAATGGA 240
Query 336 TCAAGAGGAGGTGTTAGAAGCTCTGTTTATGCCAGGGCAATACTCGGTTATGCTGTC-TT 394
||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||
Sbjct 241 TCAAGAGGAGGTGTTAGAAACTCAGTTTATGGCAAGGCAATACTCGGCTATGCTG-CGTT 299
Query 395 GGGGAGCTTTGGGATGCTTTTAGTTGCGACCAGGCTAAATCCAAGTATTCCAGATTTGCC 454
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GGGGAGCTTTGGGATGCTTTTAGTTGCCACCAGGCTAAATCCAAGTATTCCAGATTTGCC 359
Query 455 TGGTGGTGGATGTGTATATACAGTGGCTGAGAGTCAATGGGTCAAAATACCAC-TCTACA 513
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||
Sbjct 360 TGGTGGTGGATGTGTTTATACAGTGACTGAGAGTCAGTGGGTCAAAATACCACTTC-ACA 418
Query 514 ATCCACAGCCTCAAGGGAAAGGTGAAACCAAGAATATTCAGGAGTTGACTGAGCTTGACA 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 419 ATCCACAGCCTCAAGGGAAAGGTGAAACCAAGAATATTCAGGAGTTGACAGAGCTTGACA 478
Query 574 TCGACGGGAAGCACTATTTCTGTGATACTAGAGACATCACTCGGCCCTTCCCAAGCCGTA 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TCGACGGGAAGCACTATTTCTGTGATACTAGAGACATCACTCGGCCCTTCCCAAGCCGTA 538
Query 634 TGCCACTTCAAAGCCCTGATGATGAATTTGTTTGGAATAGATGGTTGTCCGTGCCTTTTA 693
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 539 TGCCACTGCAAAGCCCTGATGATGAATTTGTTTGGAATAGATGGTTATCCGTGCCTTTCA 598
Query 694 AGAATATTGGGCTACCTGAACACTGTGTCATTCTTCTGCAGGGGTTTGCAGAATATCGAC 753
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 AGAATATTGGGCTGCCTGAACACTGTGTCATTCTTCTGCAGGGGTTTGCAGAATATCGAC 658
Query 754 CTTTTGGGAGCTCAGGCCAGCTAGAAGGGATTGTTGCTCTAATGGCCCGTCGTAGCAGAC 813
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 CTTTTGGGAGCTCAGGTCAGCTAGAAGGGATTGTTGCTCTAATGGCCCGTCGTAGCAGAC 718
Query 814 TGCATCCAGGGACTCGTTACCTAGCTAGGGGCATTAATTCATGTTCTGGCACAGGTAACG 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TGCATCCAGGGACTCGTTACCTAGCTAGGGGCATTAATTCATGTTCTGGCACAGGTAACG 778
Query 874 AAGTTGAGTGTGAGCAGCTTGTATGGATACCTAAAAGAAATGGTCAAAGCATTGCTTTCA 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 779 AAGTTGAGTGTGAGCAGCTTGTATGGATACCTAAAAGGCATGGTCAAAGCATTGCTTTCA 838
Query 934 ACTCGTACATTTGGCGACGTGGCACCATACCAATATGGTGGGGTGCAGAATTAAAGATGA 993
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 839 ACTCGTACATTTGGCGACGTGGCACCATACCAATATGGTGGGGTGCAGAATTGAAGATGA 898
Query 994 CTGCGGCAGAAGCAGAAATTTATGTGGCAGATAGGGATCCTTATAAAGGCAGTACAGAGT 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 899 CTGCGGCAGAAGCAGAAATTTATGTGGCAGATAGGGATCCTTATAAAGGCAGTACGGATT 958
Query 1054 ATTACCAAAGGTTAAGCAAGCGATATGATACTAGGAATCTAGATGCACCTGTTGGAGAAA 1113
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 959 ATTACCAAAGATTAAGCAAGCGATATGATACTAGGAATCTAGATGCACCAGTTGGAGAAA 1018
Query 1114 ACCAGAAGAAAAAGGCTTTTGTTCCTATTGTGTGCGTTAATTTACTAAGAAGTGGAGAAG 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1019 ACCAGAAGAAAAAGGCTTTTGTTCCTATTGTGTGCGTTAATTTGCTAAGAAGTGGAGAAG 1078
Query 1174 GGAAATCAGAATGTATCTTAGTACAACATTTTGAAGAATCGATGAACTTTATCAAATCCA 1233
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1079 GGAAATCAGAATGTATCTTAGTACAACATTTTGAAGAATCGATGAACTTTATCAGATCCA 1138
Query 1234 GTGGAAAGCTTCCTTATACTCGTGTTCACCTGATAAATTATGATTGGCATGCCAGCGTGA 1293
|||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 GTGGAAAGCTTCCTCATACCCGTGTTCACCTAATAAATTATGATTGGCATGCCAGCGTGA 1198
Query 1294 AACTAAAAGGGGAACAGCAAACTATTGAAGGATTGTGGATGTATCTAAAATCTCCCACTA 1353
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 AACTAAAGGGGGAACAGCAAACTATTGAAGGATTGTGGATGTATCTAAAATCTCCCACTA 1258
Query 1354 TGGCAATAGGAATTTCTGAAGGTGACTATTTGCCTTCACGTCAAAGACTGAAAGATTGCA 1413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGCAATAGGAATTTCTGAAGGTGACTATTTGCCTTCACGTCAAAGACTGAAAGATTGCA 1318
Query 1414 GAGGTGAGGTAATCTGTATTGATGACATTGAAGGTGCCTTCTGTTTGAGATCACATCAAA 1473
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1319 GAGGTGAGGTAATCTGTATTGATGACATTGAAGGTGCCTTCTGTTTGAGATCGCATCAAA 1378
Query 1474 ATGGGGTGATACGTTTTAACTGCGCTGATTCCTTGGATCGAACAAATGCGGCTAGTTTCT 1533
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 ATGGGGTGATACGCTTTAACTGCGCTGATTCTTTGGATCGAACAAATGCGGCTAGTTTCT 1438
Query 1534 TTGGTGGTCTTCAAGTGTTTGTAGAGCAATGTAGAAGGCTGGGAATATCACTTGATACTG 1593
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1439 TTGGTGGTCTTCAAGTGTTTGTAGAGCAATGTAGAAGGCTAGGAATATCGCTTGATACTG 1498
Query 1594 ATCTTGGATATGGTCATAATTCTGTTAATAATCAGGGGGGATATAACGCTCCCCTTCCAC 1653
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1499 ATCTTGGATATGGTTATAATTCTGTTAATAATCATGGGGGATATAATGCTCCCCTTCCAC 1558
Query 1654 C-GGGATGGGAAAAAAGAGCTGATGCCGTAACTGGAAAATCATATTATATAGATCACAAT 1712
| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CAGGG-TGGGAAAAAAGAGCTGATGCAGTAACTGGAAAATCGTATTATATAGATCACAAT 1617
Query 1713 ACAAAGACAACAACATGGAGTCATCCATGTCCTGATAAACCATGGAAGAGACTTGACATG 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 ACAAAGACAACAACATGGAGTCATCCATGTCCTGATAAACCATGGAAGAGACTTGACATG 1677
Query 1773 AGGTTTGAGGAATTTAAGAGATCAACTATCTTATCTCCTGTGTCAGAACTTGCCGATCTT 1832
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1678 AAGTTTGAGGAATTTAAGAGATCAACTATCTTATCTCCTGTGTCTGAACTTGCTGATCTT 1737
Query 1833 TTTCTGCAACAAGGTGATATCCATGCAACCCTCTATACTGGCTCGAAAGCTATGCACAGC 1892
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1738 TTTCTGCAACAAGGTGATATCCATGCAACCCTCTATACTGGCTCAAAAGCTATGCACAGC 1797
Query 1893 CAAATTCTCAACATCTTCAGTGAAGAATCAGGAGCATTTAAACAGTTTTCTGCAGCACAG 1952
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 CAAATTCTCAACATCTTTAGCGAAGAATCAGGAGCATTTAAACAGTTTTCTGCAGCACAG 1857
Query 1953 AAAAACATGAAGATTACACTACAGAGAAGATATAAAAATGCTATGGTTGATAGTTCACGG 2012
||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 AAAAACATGAAAATTACGCTGCAGAGAAGATATAAAAATGCTATGGTTGATAGTTCACGG 1917
Query 2013 CAAAAACAGCTCGAGATGTTTCTGGGAATGAGGCTTTTCAAGCATCTTCCATCAATTCCT 2072
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 CAAAAGCAGCTGGAGATGTTTCTGGGAATGAGGCTTTTCAAGCATCTTCCATCAATTCCT 1977
Query 2073 GTCCAGCCTTTACATGTACTTTCTCGACCATCTGGTTTCTTTCTGAAACCTGTACCTAAC 2132
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 GTCCATCCTTTACATGTACTTTCTCGACCATCTGGTTTCTTTCTGAAACCTGTACCTAAC 2037
Query 2133 ATGTCCGAAAGTTCCAATGATGGGTCCAGTCTGCTGAGTATCAAGAGGAAGGACATAACT 2192
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038 ATGTCCGAAAGTTCCAATGATGGGTCCAGTCTGCTCAGTATCAAGAGGAAGGACATAACT 2097
Query 2193 TGGCTATGTCCACAAGCTGCAGATATTGTTGAATTATTTATCTATCTCAGTGAGCCTTGC 2252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 TGGCTATGTCCACAAGCTGCAGATATTGTTGAATTATTTATCTATCTCAGTGAGCCTTGC 2157
Query 2253 CATGTATGTCAACTTCTACTGACCATATCACACGGTGCGGATGATTTGACATGTCCATCC 2312
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 CATGTATGTCAACTTCTACTGACCATATCACACGGGGCGGATGATTTGACATGTCCATCC 2217
Query 2313 ACTGTGGACGTGAGAACTGGACGCCACATAGAGGACCTTAAATTAGTTGTTGAG 2366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 ACTGTGGACGTGAGAACTGGACGCCACATAGAGGACCTTAAATTAGTTGTTGAG 2271
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 200982043013
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5