BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G60740.1
Length=3944
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg939118 jgi|Araly1|939118|scaffold_503309.1 6287 0.0
Ahg907940 jgi|Araly1|907940|Al_scaffold_0002_1021 2854 0.0
> Ahg939118 jgi|Araly1|939118|scaffold_503309.1
Length=3813
Score = 6287 bits (3404), Expect = 0.0
Identities = 3679/3813 (96%), Gaps = 13/3813 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 TTGAACCCCTTTCTCTTTCCAGTAATGGCATCTAGAGCAGAGGAAATG-TCGCCGACGAA 74
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||
Sbjct 1 TTGAATCCCTTTCTCTTTCCAGTAATGGCATCTAGAGCAGAGGAGA-GATCGCCGGCGAA 59
Query 75 GATCGAAATCGAAACGGCGGTAAAAATTGAAGAGGAAGAAGACGATGAGCATGATTCTAA 134
|||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 60 GATCAAAATCGAAACGGCGGTTAAAATGGAAGAGGAAGAAGACGACGAGCATGATTCTAA 119
Query 135 GGAGAGAGTTCTACAGAGGTATTTTTTACAAGAATGGAAGCTCGTTAAATCTCTTCTCGA 194
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 120 GGAGAGAGTTCTACAGAGGTACTTTTTACAAGAATGGAAGCTCGTTAAATCCCTTCTCGA 179
Query 195 TGATATTGTTTCAAATGGCCGTGTTGTTGATCCTACTTCTGTTCATAAGATCCGATCCAT 254
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TGATATCGTTTCAAATGGCCGTGTCGTTGATCCTACTTCTGTTCATAAGATCCGATCCAT 239
Query 255 TATGGATAAATACCAGGAGCAAGGTCAATTAGTGGAACCTTACTTAGAGAGTATAGTTTC 314
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TATGGATAAATACCAGGAGCAAGGTCAACTAGTGGAACCTTACTTAGAGAGTATAGTTTC 299
Query 315 TCCATTAATGTTTATCATCCGCTCCAAAACAGTTGATTTAGAGGCCAAACCTGATGAAAT 374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 300 TCCATTAATGTTTATCATCCGCTCCAAAACAGTTGATTTAGAAGCCAGACCTGATGAAAT 359
Query 375 TCTTGAGATTATTAAGCCAATAAGCATCATTATCTATGCTTTAGTTACTGTATGTGGGTA 434
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 360 TCTTGAGATTATTAAGCCAATTAGCATCATTATCTATGCTTTAGTTACCGTATGTGGGTA 419
Query 435 CAAAGCTGTTATCAAGTTCTTTCCGCATCAAGTATCCGATCTGGAACTCGCCGTTTTGCT 494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 420 CAAAGCTGTTATCAAGTTCTTTCCGCATCAAGTATCCGATCTGGAACTCGCTGTGTTGCT 479
Query 495 CCTCGAGAAGTGCCATAGTACAAATTCTGTTTCTGCCTTGAGGCAAGAAAGCACTGGAGA 554
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CCTGGAGAAGTGCCATAGTACAAATTCTGTTTCTGCCTTGAGGCAAGAAAGCACTGGAGA 539
Query 555 AATGGAGGCCAAATGTGTTACTCTTTTGTGGCTTTCAATCCTTGTGTTGGTTCCGTTTGA 614
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AATGGAAGCCAAATGTGTTACTCTTTTGTGGCTTTCCATCCTTGTGTTGGTTCCGTTTGA 599
Query 615 TATTTCTTCTGTTGATACAAGCATTGCTGATGACAAGACCTTTGGTGTGGATGACCTTGC 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 600 TATTTCTTCTGTTGATACAAGCATTGCTGATGACAAGACCTTTGGTGTGGACGACCTTGC 659
Query 675 TCCTTTGGTATTGAAGATATTAGGTTTCTGTAAGGACTATCTGTGCAGTGCTGGACCAAT 734
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 660 TCCTTTGGTATTGAAGATATTAGGTTTCTGTAAGGACTATCTATGCAGTGCTGGACCAAT 719
Query 735 GCGCAGGATATCGGGGTTGCTACTCTCTAAGCTTTTAACTCGTCCGGATATGGGAAAAGC 794
|||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GCGCAGGATATCTGGATTGCTTCTATCGAAGCTTTTAACCCGTCCGGATATGGGAAAAGC 779
Query 795 TTTTTCGAGCTTTTTTGAGTGGACATATGAAGTTTTGTCTTGTAAGGAAGATAGTGTCAC 854
|||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||
Sbjct 780 TTTTTCAAGCTTTTTTGAGTGGACACATGAAGTTTTATCATCTAAGGAAGATAGTGTCAC 839
Query 855 GAACCACTTTCGCTTGCTTGGTGTAATGGAAGCTCTATCTGCCATTTTTAAGACTGCTAG 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 AAACCACTTTCGCTTGCTTGGTGTAATGGAAGCTCTGTCTGCCATTTTTAAGACTGCTAG 899
Query 915 CCGGAAAGTGTTGCTAGATGTGCTTCCTATTGTTTTGAATGATGTGACTGTGCTAAGCAA 974
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 900 CCGGAAAGTGTTGCTAGATGTGCTTCCTATTGTTTTGAATGATGTGACCGTGCTAAGCAA 959
Query 975 ATCAAACGCGGCGGCTAAAAGTTCTCTGCTTCGCAAGTATTTGATCAAGTTAACTCAGAG 1034
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ATCAAATGCGGCGGCTAAAAGTTCTCTGCTTCGCAAGTATTTGATCAAGTTAACTCAGAG 1019
Query 1035 GATAGGGCTTGTTTGTCTTCCTCATCGCTCACCTTCCTGGCGCTATGTGGCTCAAACCGC 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1020 GATAGGGCTTGTTTGTCTTCCTCATCGCTCACCTTCCTGGCGCTATGTGGCTCAAACTGT 1079
Query 1095 CTCTCTTTCTGAGAATATGTCTACGAGTTCATCTCAAAGATTGGCGCCTGATCATACTGT 1154
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1080 CTCTCTTTCTGAGAATATGTCTACGAGTTCAGCCCAAAGATTGCCGCCTGATCATACTGT 1139
Query 1155 GACTGCCATCTTACAACCAGAAAGTTTGGATGATCAAGAGGATGAAGATATGGATGTTCC 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 GACTGCCATCTTACAACCAGAAAGTTTGGATGATCAAGAGGATGAAGATATGGATGTTCC 1199
Query 1215 AGAAATCTTAGAAGAGATTATTGAAATGCTACTATCTGGTTTGAGGGACACGGACACCGT 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AGAAATCTTAGAAGAGATTATTGAAATGCTACTCGCGGGTTTGAGGGACACGGACACCGT 1259
Query 1275 GGTTCGTTGGTCTGCTGCAAAGGGTATAGGTCGTGTTACTTCACGTCTAACATCTGTTCT 1334
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GGTCCGTTGGTCTGCTGCGAAGGGTATAGGTCGTGTAACTTCACGTCTAACATCTGTTCT 1319
Query 1335 GTCTGATGAGGTGTTGTCATCTGTATTGGAGCTTTTTTCACCAGGAGAGGGAGATGGTTC 1394
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1320 GTCTGAAGAGGTGTTGTCATCTGTATTGGAGCTGTTTTCACCAGGAGAGGGAGATGGCTC 1379
Query 1395 ATGGCATGGGGGTTGTTTGGCCTTAGCTGAACTGGCTCGTAGAGGGTTACTTTTGCCTAG 1454
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1380 ATGGCATGGGGGTTGTTTGGCCTTAGCTGAACTGGCTCGTAGAGGGGTACTTTTGCCTAG 1439
Query 1455 AAGTTTTCCACTAGTCGTCCCAGTTATTGTGAAGGCACTCCATTATGATGTTCGCCGAGG 1514
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1440 AAGTTTTCCACCAGTCGTTCCAGTTATTGTGAAGGCACTCCATTATGATGTTCGCCGTGG 1499
Query 1515 TCCACACAGTGTTGGATCTCATGTGCGTGATGCAGCTGCCTATGTTTGTTGGGCATTTGG 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TCCACACAGTGTTGGATCTCATGTGCGTGATGCAGCTGCCTATGTTTGTTGGGCATTTGG 1559
Query 1575 GCGCGCCTATTCCCACAAAGATATGAAAAACGTGCTGGATCAGCTTGCTCCAGATTTATT 1634
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 ACGTGCCTATTCCCACAAAGATATGAAAAACGTGCTGGATCAGCTTGCTCCAGATTTATT 1619
Query 1635 GATAGTGGGTTCCTTTGATAGAGAGGTGAACTGTAGAAGGGCTGCTGCCGCTGCTTTCCA 1694
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GATAGTAGGTTCCTTTGATAGAGAGGTGAACTGTAGAAGGGCTGCTGCCGCTGCTTTCCA 1679
Query 1695 AGAGAATGTTGGAAGACAAGGAAATTACCCTCATGGGATTGACATAGTGAGCATAGCTGA 1754
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1680 AGAGAATGTTGGAAGACAAGGAAATTACCCTCATGGGATTGACATAGTGAACATAGCTGA 1739
Query 1755 TTATTTTTCCCTATCTTCTCGGGTGAACTCTTACCTTCAGGTTGCTGTTTCCATTGCTCA 1814
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 TTATTTTTCCCTTTCTTCTCGGGTGAACTCTTACCTTCAGGTTGCTGTTTCCATTGCTCA 1799
Query 1815 ATATGAAGGATATCTATATCCTTTTGTGGATGAATTGCTATACAACAAGATCTGCCACTG 1874
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 ATATGAAGGGTATCTACATCCTTTTGTGGATGAATTGCTATACAACAAGATCTGCCACTG 1859
Query 1875 GGATAAAAGCTTGAGAGAACTTGCTGCAGAAGCTCTTGCTCCTCTTGTTAAGTACGAGCC 1934
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1860 GGATAAAAGCTTGAGAGAACTTGCTGCAGAAGCTCTTGCTGCTCTTGTTAAGTACGAGCC 1919
Query 1935 TAAGCACTTTGCCAACTATGTGCTGGAGAAACTAATTCCTTGTACCCTTTCAACTGATTT 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 TAAGCACTTTGCCAACTATGTGCTGGAGAAACTAATTCCTTGTACCCTTTCAACTGATTT 1979
Query 1995 GTGCATGCGCCATGGTGCAACATTGGCAGCTGGAGAGGTTGTGTTAGCTCTGCACCAGTG 2054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 GTGCATGCGCCATGGTGCAACATTGGCAGCTGGAGAGGTTGTGTTAGCTCTGCACCAGTG 2039
Query 2055 TGGCTATGTCCTTTCTGCTGATAGCCAAAAGCGTATGGCTGGTATTGTTCCTTCCATTGA 2114
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 2040 TGGCTATGTCCTTTCTGCTGATAGCCAAAAGAGTATGGCTGGGATTGTTCCATCCATTGA 2099
Query 2115 GAAAGCACGCCTTTACCGTGGAAAAGGTGGAGAAATAATGCGACTGGCTGTCTCACGATT 2174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2100 GAAAGCACGCCTTTACCGTGGAAAAGGTGGAGAAATAATGCGACTGGCTGTCTCACGGTT 2159
Query 2175 TATCGAGTGTATTTCGTTATCGCATGTGACTTTAGCTGAAAGAACAGAACGGATCTTGCT 2234
|||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 TATCGAGTGTATCTCGCTATCTCATGTGACATTAGCTGAAAGAACAGAACGGATCTTGCT 2219
Query 2235 TGATACTCTCACTGAGAATTTAAGACATCCCAATTCTCAAATACAGAATGCAGCTGTCAG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2220 TGATACTCTCACTGAGAATTTAAGACATCCCAATTCTCAAATACAGAATGCTGCTGTCAG 2279
Query 2295 TGCTGTTAAACAGCTTGTGCAATCTTATCTCGTTGGCAATGATAAGAAATCTGTTGATTT 2354
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TGCTGTTAAACAGCTTGTGCAATCCTATCTCGTTGGCAATGATAAGAAATCTGTTGATTT 2339
Query 2355 AATATTAAAACACCTAAAACATCTAACGGACCCAAATGTAGCTGTCCGAAGAGGTTCTGC 2414
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 AATATCAAAACACCTAAAACATCTAACGGACCCAAATGTAGCTGTCCGAAGAGGTTCTGC 2399
Query 2415 ACTTGCACTAGGTGTCTTGCCATATGAACTATTGACTGCAAAATGGAAGGATATAGTTTT 2474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 ACTTGCACTAGGTGTCTTGCCATATGAACTATTGACTGCAAAATGGAAGGATATAGTTTT 2459
Query 2475 GAAGCTCTGCAGTGCGTGTAAGATAGAGGTGAACCCTGAAGACAGAGATGCAGAGGCACG 2534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 GAAGCTCTGCAGTGCGTGTAAGATAGAGGTGAACCCTGAAGACAGAGATGCAGAGGCACG 2519
Query 2535 TGTGAATGCTGTAAAAGGACTCACATCCGTGTGTGAGACTCTTACTCAGAAAAGGGCTAG 2594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 TGTGAATGCTGTAAAAGGACTCACATCCGTGTGTGAGACTCTTACTCAGAAAAGGGCTAG 2579
Query 2595 CGATCCTGGAAATGATGACCTGTCTCTTTTTCTTCTTATCAAGACTGAAGTGATGGATAC 2654
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 TGATCCTGAAAACGATGACCTGTCTCTTTTTCTTCTTATCAAGACTGAAGTGATGGATAC 2639
Query 2655 TTTACTGAAAGCTCTTGATGACTATTCAGTTGATAACCGAGGTGATGTAGGTTCTTGGGT 2714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 TTTACTGAAAGCTCTTGATGACTATTCAGTTGATAACCGAGGTGATGTAGGTTCTTGGGT 2699
Query 2715 TCGTGAAGCTGCAGTCCATGGTCTTGAGAAGTGTACATATATCCTCTGTAAGAAAAT-GG 2773
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2700 TCGTGAAGCTGCAGTCCATGGCCTTGAGAAGTGTACATATATCCTCTGTAAGAAAATCGG 2759
Query 2774 AAACATATTCAGAGGGTGATTATAACGATGATACGTCCTCACTTTTCGATTCGAATCTTG 2833
|| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2760 AA-CAAATTCAGAGGGTGATCATAACAATGATACGTCCTCACTTTTCGATTCAAATCTTG 2818
Query 2834 CGACCCGTCTAATTGGAGGTAT-GCTGAAGCAAGGAGTGGAGAAAATGGATAAATTAAGA 2892
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2819 CGACCCGTCTAATTGGAGGTATTG-TGAAGCAAGGAGTGGAGAAAATGGATAAACTAAGA 2877
Query 2893 GAAACAGCTGCAAAGGTTCTTCAAAGGATTTTGTATCACAAATCTGTTTCCGTCCCTCAT 2952
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 GAAACAGCTGCGAAGGTTCTTCAACGGATTTTGTATCACAAATCTGTTTCCGTCCCTCAT 2937
Query 2953 GTACCTTATAGAGAAAAACTGGAAGAAATTCTTCCCAACAAGGCAAACTTACAATGGGCG 3012
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2938 ATACCTCATAGAGAAAAACTGGAAGAAATTCTTCCCAACAAGGCAAGCTTACAGTGGGCG 2997
Query 3013 GTTCCGGCTTTCTCTTTCCCACGGTTTGTGCAGCTTTTGAAACTCCGTTGTTACAGCAAA 3072
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2998 GTTCCGGCTTTCTCTTTCCCACGTTTTGTGCAGCTATTAAAACTCCGTTGCTACAGCAAA 3057
Query 3073 GAGGTGATGTCTGGATTAGTAATTTCAATTGGAGGATTACAAGATTCACTTAGAAAGGCT 3132
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3058 GAGGTGATGTCTGGATTAGTAATTTCTATTGGAGGATTACAAGATTCACTTAGAAAGGCT 3117
Query 3133 TCTCTCGTTGCATTGTTGGAGTATATGAGGGAAGGTGAAGCTAAAGACCCTAAAGAACAA 3192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3118 TCTCTCGTTGCATTGTTGGAGTATATGAGGGAAGGTGAAGCTAAAGACCCTAAAGAACAA 3177
Query 3193 CAATCCAGAGAGTCTGCCCTGGGAGATGACATTCTCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAA 3252
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3178 CAATCCAGAGAGTCTGCACTGGGAGATGACATTCTCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAA 3237
Query 3253 TGTGACAGAGTTATGGTACCCTGTCTACAGACAATTGAGATCCTCTTCAGCAGCAAGATC 3312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3238 TGTGACAGAGTTATGGTACCCTGTCTACAGACAATTGAGATCCTCTTCAGCAGCAAGATC 3297
Query 3313 TTTCTGAATCAAGAGTCGTATACGTTTAGTTTCTACGCGGGTGTCATGGATTCTCTAGCC 3372
|||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3298 TTTCTGAATCTAGAGTCTTATACGTTGAGTTTCTACGCGGGTGCCATGGATTCTCTAGCC 3357
Query 3373 ATCGAACTAAGAGCTTCTAAGGATTTCACAAAGTTAAAAGCAGGCCTTGCAATACTTGGA 3432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3358 ATCGAACTAAGAGCTTCTAAGGATTTCACAAAGTTAAAAGCAGGCCTTGCAATACTTGGA 3417
Query 3433 TATATTGCTTCAGTCTCGCATTTCA-TCAGCACAAAAGCATTCTCTCAACTTCTATCATT 3491
||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3418 TATATCGCTTCAGTCTCACATC-CAATCAGCACAAAAGCATTCTCTCAGCTTCTATCATT 3476
Query 3492 CCTTGGCCACCGATACCCAATGATCCGAAAGGCGGCAGCGGAACAAGTCTATCTTGCGCT 3551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3477 CCTTGGCCACCGATACCCAATGATCCGAAAGGCGGCAGCTGAACAAGTCTATCTTGCGCT 3536
Query 3552 ACTTCAAAACGGAATCTTAGTGACAGAGGAGAAGATGGAGAAAGTGATAGAGATAATTTC 3611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3537 ACTTCAAAACGGAATCTTAGTGACAGAGGAGAAGATGGAGAAAGTTATAGAGATAATTTC 3596
Query 3612 AGAATCTTGTTGGGAAGCAGACATGGAAACGACTAAGACTCAGAGGTTAGAATTGTGCGA 3671
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3597 AGAATCTTGTTGGGAAGCAGACATGGAAACGACTAAGAGTCAGAGGTTAGAATTGTGCGA 3656
Query 3672 GTTGGCTGGTTTAGACCATGAAGTAGTGTTCAAGACCAGAAACAGATTGGTGATTAAGGA 3731
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||
Sbjct 3657 ATTGGCTGGTTTAGACCATGAAGTAGTGTTCAAGACAAGAAACAGATTGGCGACTAGGGA 3716
Query 3732 TATAGCCGGAAAT-AAATCGGCTGC-T--GACGAAAATGCGTCTTACTCTTCATTGGTCG 3787
||||||||| ||| ||| || |||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3717 TATAGCCGGGAATGAAA-CGACTGCGTCTGACGAGAACGCGTCTTACTCTTCCTTGGTCG 3775
Query 3788 ACTCCTCTGGCTTCTGATTTTACGCATTGTCCT 3820
| ||||||||||| |||||| |||| |||||||
Sbjct 3776 ATTCCTCTGGCTTTTGATTTCACGCTTTGTCCT 3808
> Ahg907940 jgi|Araly1|907940|Al_scaffold_0002_1021
Length=3813
Score = 2854 bits (1545), Expect = 0.0
Identities = 2160/2452 (88%), Gaps = 61/2452 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1382 AGGGAGATGGTTCATGGCATGGGGGTTGTTTGGCCTTAGCTGAACTGGCTCGTAGAGGGT 1441
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 1394 AGGGAGATGGCTCATGGCATGGGGGTTGCTTGGCTTTAGCTGAACTGTCTCGCAGAGGGT 1453
Query 1442 TACTTTTGCCTAGAAGTTTTCCACTAGTCGTCCCAGTTATTGTGAAGGCACTCCATTATG 1501
|||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1454 TACTGTTGCCTAGAAGTTTCCCACAAGTCGTCCCAGTTATTGTTAAGGCACTCCATTATG 1513
Query 1502 ATGTTCGCCGAGGTCCACACAGTGTTGGATCTCATGTGCGTGATGCAGCTGCCTATGTTT 1561
|||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1514 ATGTCCGTCGAGGTCCGCACAGTGTTGGATCTCATGTGCGTGATGCAGCTGCCTACGTTT 1573
Query 1562 GTTGGGCATTTGGGCGCGCCTATTCCCACAAAGATATGAAAAACGTGCTGGATCAGCTTG 1621
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1574 GTTGGGCATTTGGGCGCGCCTATTACCACAAAGATATGAAAAATGTCCTGGATCAGCTTG 1633
Query 1622 CTCCAGATTTATTGATAGTGGGTTCCTTTGATAGAGAGGTGAACTGTAGAAGGGCTGCTG 1681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634 CTCCAGATTTATTGATAGTGGGTTCCTTTGATAGAGAGGTGAACTGTAGAAGGGCTGCTG 1693
Query 1682 CCGCTGCTTTCCAAGAGAATGTTGGAAGACAAGGAAATTACCCTCATGGGATTGACATAG 1741
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 CCGCTGCTTTCCAAGAGAATGTTGGAAGGCAAGGAAATTACCCTCATGGGATTGACATAG 1753
Query 1742 TGAGCATAGCTGATTATTTTTCCCTATCTTCTCGGGTGAACTCTTACCTTCAGGTTGCTG 1801
||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1754 TGAACATAGCTAACTATTTTTCCCTTTCTTCTCGGGTGAACTCGTACCTTCAGGTTGCTG 1813
Query 1802 TTTCCATTGCTCAATATGAAGGATATCTATATCCTTTTGTGGATGAATTGCTATACAACA 1861
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 CTTCCATTGCTCAATATGAAGGGTATCTATATCCTTTTGTGGATGAATTGCTATACAACA 1873
Query 1862 AGATCTGCCACTGGGATAAAAGCTTGAGAGAACTTGCTGCAGAAGCTCTTGCTCCTCTTG 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1874 AGATCTGCCACTGGGATAAAAGCTTGAGAGAACTTGCCGCAGAAACTCTTGCTGCTCTTG 1933
Query 1922 TTAAGTACGAGCCTAAGCACTTTGCCAACTATGTGCTGGAGAAACTAATTCCTTGTACCC 1981
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1934 TTAAATACGAGCCTAAGCACTTTGCCAACTATGTGCTGGAGAAACTAACTCCTCGTACCC 1993
Query 1982 TTTCAACTGATTTGTGCATGCGCCATGGTGCAACATTGGCAGCTGGAGAGGTTGTGTTAG 2041
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 TTTCAAGTGATTTGTGCATGCGCCATGGTGCAACATTGGCAGCTGGAGAGGTTGTGTTAG 2053
Query 2042 CTCTGCACCAGTGTGGCTATGTCCTTTCTGCTGATAGCCAAAAGCGTATGGCTGGTATTG 2101
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2054 CTCTGCACCAGTGTGGCTATGTACTTTCTGCTGATAGCCATAAGCGTATGGCTGGGATTG 2113
Query 2102 TTCCTTCCATTGAGAAAGCACGCCTTTACCGTGGAAAAGGTGGAGAAATAATGCGACTGG 2161
| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114 TCCCTGCCATTGAGAAAGCACGGCTTTATCGTGGAAAAGGTGGAGAAATAATGCGACTGG 2173
Query 2162 CTGTCTCACGATTTATCGAGTGTATTTCGTTATCGCATGTGACTTTAGCTGAAAGAACAG 2221
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |
Sbjct 2174 CTGTCTCACGGTTTATCGAGTGTATCTCGTTATCGCATGTGACATTAACTGAGAGAACTG 2233
Query 2222 AACGGATCTTGCTTGATACTCTCACTGAGAATTTAAGACATCCCAATTCTCAAATACAGA 2281
|||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234 AACGGATCCTGCTTGATACCCTCAATGAGAATTTGAGACATCCCAATTCTCAAATACAGA 2293
Query 2282 ATGCAGCTGTCAGTGCTGTTAAACAGCTTGTGCAATCTTATCTCGTTGGCAATGATAAGA 2341
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2294 ATGCAGCTGTCAATGCTGTTAAACAGTTTGTGCAATCCTATCTCGTTTGCAATGATAAGA 2353
Query 2342 AAT-CTGTTGATTTAATATTAAAACACCTAAAACATCTAACGGACCCAAATGTAGCTG-T 2399
| ||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||| |||||||| ||||||| |
Sbjct 2354 T-TGCTGTTGATTTAGTATCAAAACACTTGACACATCTAACCGACCCAAACGTAGCTGCT 2412
Query 2400 CCGAAGAGGTTCTGCACTTGCACTAGGTGTCTTGCCATATGAACTATTGACTGCAAAATG 2459
| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2413 CGGA-GAGGTTTTGCACTTGCACTAGGTGCCTTGCCATGTGAACTATTGACTGCAAAGTG 2471
Query 2460 GAAGGATATAGTTTTGAAGCTCTGCAGTGCGTGTAAGATAGAGG-TGAACCCTGAAGACA 2518
||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||| |
Sbjct 2472 GAAGGATGTAGTTTTGAAGCTCTGCAGTGCATGTCAGATAGAGGCT-AATCCTGAAGATA 2530
Query 2519 GAGATGCAGAGGCACGTGTGAATGCTGTAAAAGGACTCACATCCGTGTGTGAGACTCTTA 2578
||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 2531 GAGATGCTGAGGCACGCATGAATGCTGTGAATGGACTCATATCCGTGTGTGAAACTCTTA 2590
Query 2579 CTCAGAAAAGGGCTAGCGATCCTGGAAATGATGACCTGTCTCTTTTTCTTCTTATCAAGA 2638
||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2591 CTCAGCGAAGTGCTAGTGATCCTGAAAACGATGACCTGTCTCTTTTTGTTCTTATCAAGA 2650
Query 2639 CTGAAGTGATGGATACTTTACTGAAAGCTCTTGATGACTATTCAGTTGATAACCGAGGTG 2698
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2651 CTGAAGTGGTGGATACTTTACTGAAAGCTCTTGATGACTATTCAGTTGATAACAGAGGTG 2710
Query 2699 ATGTAGGTTCTTGGGTTCGTGAAGCTGCAGTCCATGGTCTTGAGAAGTGTACATATATCC 2758
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2711 ATGTTGGTTCTTGGGTTCGTGAAGCTGCAATCCATGGACTTGAGAAGTGTACATATATTC 2770
Query 2759 TCTGTAAGAAAATG-GAAACATATTCAGAGGGTGATTATAACGATGA-TACGTCCTCACT 2816
||||||||||| | ||| || || ||| || |||| ||||| |||| | | ||||| ||
Sbjct 2771 TCTGTAAGAAAGTCCGAA-CAAATGCAGCGGATGATCATAACAATGAAT-CATCCTCGCT 2828
Query 2817 TTTCGATTCGAATCTTGCGACCCGTCTAATTGGAGGTAT-GCTGAAGCAAGGAGTGGAGA 2875
||| ||||| ||||| || | || | | ||||||||||| | |||| |||||| ||||||
Sbjct 2829 TTTTGATTCAAATCTCGCAAACCATTTGATTGGAGGTATTG-TGAAACAAGGAATGGAGA 2887
Query 2876 AAATGGATAAATTAAGAGAAACAGCTGCAAAGGTTCTTCAAAGGATTTTGTATCAC-AAA 2934
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2888 AAATGGATAAATTAAGAGAAACTGCTGCAAAAGTTCTTCAAAGGATTTTGTATCACGAAA 2947
Query 2935 TCTGTTTCCGTCCCT--CATGTACCTTATAGAGAAAAACTGGAAGAAATTCTTCCCAACA 2992
||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||
Sbjct 2948 -CTGTTACCGTCCCTTTCAT--ACCTCATAGAGAAACACTGGAAGAAGTTATTCCCAACA 3004
Query 2993 AGGCAAACTTACAATGGGCGGTTCCGGCTTTCTCTTTCCCACGGTTTGTGCAGCTTTTGA 3052
| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 3005 AAGCAAGCTTACAATGGGCGGTTCCGGAATTCTCTTTCCCACGTTTTGTTCAGCTCTTGA 3064
Query 3053 AACTCCGTTGTTACAGCAAAGAGGTGATGTCTGGATTAGTAATTTCAATTGGAGGATTAC 3112
|| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 3065 AATTCCGTTGTTATAGCAAACAGGTAATGTCTGGATTAGTAGTTTCTATCGGAGGATTAC 3124
Query 3113 AAGATTCACTTAGAA-AGGCTTCTCTCGT-TGCATTGTTGGAGTATATGAGGGAAG--G- 3167
|||| || |||| || || |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||| |
Sbjct 3125 AAGAGTCGCTTAAAACAG-CTTCGCTC-TCTGCATTACTGGAGTATTTGAGGGAAGAAGA 3182
Query 3168 TGAAGCTAAAGACC-CTAAAGAACAACAATCCAGAGAGTCTGCCCTGGGAGATGACATTC 3226
|||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||| | | || ||||| |
Sbjct 3183 TGAAGCTAAAGACCTC-AAACAACAACAATCTAGAGAATCTGCGATTTGCGACGACATCC 3241
Query 3227 TCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAATGTGACAGAGTTATGGTACCCTGTCTACAGACAA 3286
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 3242 TCTGGATACTTCAAGAGTACAAAAAATGTGACCGAGTTATCGTACCCTGTCTAAAGACAA 3301
Query 3287 TTGA-GATCCTCTTCAGCAGCAAGATCTTTCTGAATCAAGAGTCGTATACGTTTAGTTTC 3345
|| | || | |||| | | || ||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||
Sbjct 3302 TTCAAGAGC-TCTTG-G-A-CAGGATTTTTCGGAATCAAGAGGCTTATACGTTGAGTTTC 3357
Query 3346 TACGCGGGTGTCATGGATTCTCT-AGCCATCGAACTAAGAGCTTCTAAGGATTTC-ACAA 3403
||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| | ||| | ||
Sbjct 3358 TACACGGGAGTCATGGATTC-CTTAGCCATCGAACTAAGAGCCTCAAAGAAATTCGA-AA 3415
Query 3404 AGTTAAAAGCAGGCCTTGCAATACTTGGATATATTGCTTCAGTCTCGCATTTCATCAGCA 3463
|| || | || ||| ||| ||||||||| | |||||| || || ||| | ||||||||
Sbjct 3416 AGGTAGACGCGGGCGTTGGAATACTTGGGTCTATTGCCTCTGTTTCGGAACCCATCAGCA 3475
Query 3464 CAAAAGCATTCTCTCAACTTCTATCATTCCTTGGCCACCGATACCCAATG----AT--CC 3517
|| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||
Sbjct 3476 CAGAAGCGTTCTCTCAGCTTCTATCATTCCTTGCCCACCAATACCCAAAGGCTCATATCC 3535
Query 3518 GAAAGGCGGCAGCGGAACAAGTCTATCTTGCGCTACTTCAAAACGGAATCTTAGTGAC-A 3576
|||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| || |
Sbjct 3536 GAAATAAGGCAGCTTTTCAAGCCTATCTTGCGCTGCTACAAAACAAAATCTTAGT-ACCA 3594
Query 3577 GAGGAGAAGATGGAGAAAGTGATAGAGATAATTTCAGA-ATCTTGTTGGGAAGCAGACAT 3635
||||| ||||| |||||||||| | | ||||| || | | |||||||||| || |||||
Sbjct 3595 GAGGACAAGATTGAGAAAGTGAAACATATAATATCTGTGA-CTTGTTGGGATGCTGACAT 3653
Query 3636 GGAAACGACT-AAGACTCAGAGGTTAGAATTGTGCGAGTTGGCTGGTTTAGACCATGAAG 3694
||| | || || ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||
Sbjct 3654 GGAGTCAACCCAAT-CTCAGAGGTTAGAATTGTGTGAATTGACTGGTTTAGATCATGGAG 3712
Query 3695 TAGTGTTCAAGACCAGAAACAGATTGGTGATTAAGGATATAGCCGGAAATAAATCGGCTG 3754
|||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| | || || |||||
Sbjct 3713 TAGTGTTCAAGACCAGAATCAGAAGGGTGACTAGGGATA--G----AATTA---CGGCTT 3763
Query 3755 CTG-ACGAAAATGCGTCTTACTCTTCAT-TGGTCGACTCCTCTGGCTTCTGA 3804
|| |||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3764 -TGGACGAGAATGCGTCTTACTCAGC-TCTGGTCGATTCCTCTGGCTTCTGA 3813
Score = 1591 bits (861), Expect = 0.0
Identities = 1145/1283 (89%), Gaps = 15/1283 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 111 AGAAGACGATGAGCATGATTCTAAGGAGAGAGTTCTACAGAGGTATTTTTTACAAGAATG 170
|||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| || || ||||| ||||||||
Sbjct 48 AGAAGAGGAAGAGCATGATTCGAGGGAGAGATTTCTACTTAGATACTTTTTGCAAGAATG 107
Query 171 GAAGCTCGTTAAATCTCTTCTCGATGATATTGTTTCAAATGGCCGTGTTGTTGATCCTAC 230
|||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 108 GAAGCTTGTTAAATCCCTTCTCGATGATATTGTTGCAAATGGCCGTGTCATTGATCCTTC 167
Query 231 TTCTGTTCATAAGATCCGATCCATTATGGATAAATACCAGGAGCAAGGTCAATTAGTGGA 290
||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 168 TTCTGTTCAGAAAATCCGCTCCATCATGGATAAATACCAGGAGCAAGGTCAACTAGTGGA 227
Query 291 ACCTTACTTAGAGAGTATAGTTTCTCCATTAATGTTTATCATCCGCTCCAAAACAGTTGA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 228 ACCTTACTTAGAGAGTATAGTTTCTCCATTAATGTTTATCATCCGTTCGAAAACAGTTGA 287
Query 351 TTTAGAGGCCAAACCTGATGAAATTCTTGAGATTATTAAGCCAATAAGCATCATTATCTA 410
||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 288 ATTAGACGTCAAACCTGATGAAATTCTCGATATTGTTAAGCCGATAAGCATTATTATCTA 347
Query 411 TGCTTTAGTTACTGTATGTGGGTACAAAGCTGTTATCAAGTTCTTTCCGCATCAAGTATC 470
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 TGCTTTAGTTACTGTATGTGGTTACAAAGCTGTTATCAAGTTCTTTCCGCATCAAGTATC 407
Query 471 CGATCTGGAACTCGCCGTTTTGCTCCTCGAGAAGTGCCATAGTACAAATTCTGTTTCTG- 529
||| |||||||||| || || || |||||||||||||||| | ||||||||| |
Sbjct 408 TGATTTGGAACTCGCTGTGGCACTTCTGGAGAAGTGCCATAGTATGACTTCTGTTTC-GT 466
Query 530 CCTTGAGGCAAGAAAGCACTGGAGAAATGGAGGCCAAATGTGTTACTCTTTTGTGGCTTT 589
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467 CGTTGAGGCAAGAAAGCACTGGAGAAATGGAGGCTAAATGTGTTACTCTTTTGTGGCTTT 526
Query 590 CAATCCTTGTGTTGGTTCCGTTTGATATTTCTTCTGTTGATACAAGCATTGCTGATGACA 649
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
Sbjct 527 CAATCCTTGTGTTGGTCCCGTTTGATATTTCTTCTGTTGATACAAGCATTGCAAACGATA 586
Query 650 AGACCTTTGGTGTGGATGACCTTGCTCCTTTGGTATTGAAGATATTAGGTTTCTGTAAGG 709
||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 587 AGAGCTTTGGTGTGGACGATCTGGCTCCTTTGGTATTGAAGATTTTGGGTTTCTGTAAGG 646
Query 710 ACTATCTGTGCAGTGCTGGACCAATGCGCAGGATATCGGGGTTGCTACTCTCTAAGCTTT 769
||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 647 ACTATCTGTGCAGTGCTGGCCCTATGCGCAGGATTTCGGGATTGCTTCTCTCTAAGCTTT 706
Query 770 TAACTCGTCCGGATATGGGAAAAGCTTTTTCGAGCTTTTTT-GAGTGGACATATGAAGTT 828
|||| ||||||||||||||||| || ||| | || |||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 707 TAACGCGTCCGGATATGGGAAAGGCATTTGCAAG-TTTTTTCGAGTGGACACATGAAGTT 765
Query 829 TTGTCTTGTAAGGAAGATAGTGTCACGAACCACTTTCGCTTGCTTGGTGTAATGGAAGCT 888
|| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||
Sbjct 766 TTATCTTCTAAGGAAGATAGTGTTGTGAACAACTTTCGCTTGATTGGTGTGATGGAGGCT 825
Query 889 CTATCTGCCATTTTTAAGACTGCTAGCCGGAAAGTGTTGCTAGATGTGCTTCCTATTGTT 948
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 826 CTGGCTGCCATTTTTAAGATTGCTAGCCGGAAAGTGTTGCTAGATGCCCTTCCTGTTGTT 885
Query 949 TTGAATGATGTGACT-GTGCTAAGCAAATCAAACGCG-GCGGCTAAAAGTTCTCTGCTTC 1006
||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | || ||| |||| |||||||||
Sbjct 886 TTGAATGATGTGA-TCGTGCTAAGCAAATCAAATG-GAGCAACTAGAAGTCCTCTGCTTC 943
Query 1007 GCAAGTATTTGATCAAGTTAACTCAGAGGATAGGGCTTGTTTGTCTTCCTCATCGCTCAC 1066
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 GCAAGTATTTGATCCAGTTAACTCAGAGGATAGGGCTTGTTTGTCTTCCTCATCGCTCAC 1003
Query 1067 CTTCCTGGCGCTATGTGGCTCAAACCGCCTCTCTTTCTGAGAATATGTCTACGAGTTC-A 1125
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |
Sbjct 1004 CTTCCTGGCGCTATGTGGCTCAAACCGCCTCCCTTTCTGAGAATATATCTATGAGTTCGA 1063
Query 1126 TCTCAAA-GATTGGC---GCCTGATCATACTGTGACTGCCATCTTACAACCAGAAAGTTT 1181
| || | ||||| ||| |||||| || | |||| ||| |||||||| ||||
Sbjct 1064 CC-CACTTG-TTGGCACCGCCAGATCATGCTATCTTTGCCGTCTCGCAACCAGAGAGTTC 1121
Query 1182 GGATGATCAAGAGGATGAAGATATGGATGTTCCAGAAATCTTAGAAGAGATTATTGAAAT 1241
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 1122 GGATGACCAAGAGGATGAAGATATGGATGTTCCTGAAATCTTAGAACAGATAATTGAAAT 1181
Query 1242 GCTACTATCTGGTTTGAGGGACACGGACACCGTGGTTCGTTGGTCTGCTGCAAAGGGTAT 1301
|||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 GCTACTCTCTGGTTTGAGAGACACGGACACAGTAGTTCGTTGGTCTGCTGCAAAGGGTAT 1241
Query 1302 AGGTCGTGTTACTTCACGTCTAACATCTGTTCTGTCTGATGAGGTGTTGTCATCTGTATT 1361
||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||
Sbjct 1242 AGGTCGTGTAACTTCACGACTAACATCCGTTCTTTCTGAAGAAGTGCTGTCATCTGTATT 1301
Query 1362 GGAGCTTTTTTCACCAGGAGAGG 1384
||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1302 GGAACTGTTTTCACCAGGAGAGG 1324
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 149071513441
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5