BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G61690.1
Length=4948
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486657 jgi|Araly1|486657|fgenesh2_kg.5__2649__AT3G61690.1 7733 0.0
> Ahg486657 jgi|Araly1|486657|fgenesh2_kg.5__2649__AT3G61690.1
Length=4912
Score = 7733 bits (4187), Expect = 0.0
Identities = 4705/4950 (95%), Gaps = 56/4950 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCATCTTCTTCCGCACGATTTCAGTCCGCCAGTGGTAACCTTGATCAATCTCGCATTTG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATCATCTTCTTCCGCACGATTTCAGTCCGCCAGTGTTAACCTTGATCAATCTCGCATTTG 60
Query 61 CCTCTCGATTCGTCGATACTGCTAGATTTTCTCTCGATTTATCCTCTAGGGTTCTTATTG 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 CCTCTCGATTCGTCGATACTGCTAGATTTTCTCTCGATTTAT--TCTAGGGTTCTTATTG 118
Query 121 ATTTCCGCCACCCACTCTCTGTTTTTAGAATCTAACTCCCGTCTCCTTCGTTTCCTCCTC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||
Sbjct 119 ATTTCCGCCACCCACTCTCTGTTTTTAGAATCTAACTTCCGTCTCCTTCG-TT--TGCTC 175
Query 181 CTAGGGTTTCCTTCTTCTTCAATTCGATTTCCCCTT-CTCCGATTTCG-A-TTTGATTCT 237
|||||||| |||||||||||||||| || | | || || | ||| | | ||||||||
Sbjct 176 CTAGGGTTACCTTCTTCTTCAATTC-ATCTGCGATTCCTTC--TTTTGCATTTTGATTC- 231
Query 238 TTACAAATTTGTCTGTTTGGGGTTATTGGATTAGCCA-GATAGATCCAAGG-TTCTTTAG 295
|| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||
Sbjct 232 TTGCAAATTTGTATGTTTGGGGTTATCGGATTAGCCACG-CAGATCGAAGGTTTTTTTA- 289
Query 296 GC-TCGTAGCTATTTGATTTGTTTTCCCCATTTCCGGTGACTTTGAAGCTACGAT-TCAT 353
|| ||||||||||| || | |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||
Sbjct 290 GCTTCGTAGCTATTAGA--T-TTTT-CCCATTCCCGGCGACTTTGAAGCCACGATATAAT 345
Query 354 CAGGGAGGTTGCTTATTAGCAACCGTTGAAGAAAACGTAACGGTTGGTTTAAGGTCTTTG 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 346 CAGGGAGGTTGCTTATTAGCAACCGTTGAAGAAAACGTAACGGTTGG-TTAAGGTCTTTG 404
Query 414 TTTGGATTAGAGGGGTAAGCTTTCGTCGGTGACTGTCACGGCAGAGATTTGCATGGGTGA 473
|||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 405 TTTGGATTTGA-GGGTAAGGTTTCGTCCGTGACTGTGACGGGAGAGATTTGCATGGGTGA 463
Query 474 GCATGAATCATGGGCGGCTTCTCCGCCGTCACCCTCTGGCTTACATCCCAACGGTTTATT 533
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||
Sbjct 464 GCATGAATCATGGGCGGCTTCTCCGCCGTCACCCACTCTCTTATATCCCAACGGTTTATT 523
Query 534 ACCAGGCAAGGCTGCATCTGTGACTAGGCCA-CTCGATGCTGAGCGATGGGCCAAGGCGG 592
||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 524 GCCAGGCAAGGCTGCATCTGTGACAAGG-CAGCTCGATGCGGAGCGATGGGCCAAGGCTG 582
Query 593 AGGATCGAACTGCCAAGCTCATTGCTTGCATCCAGCCAAATCCACCTTCCGAAGATCGCC 652
||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 583 AGGATAGAACTGCTAAGCTCATTGCTTGTATCCAGCCAAATCCTCCTTCCGAAGATCGCC 642
Query 653 GTAATGCTGTTGCCAGTTACGTCAGGAGGCTTATCATGGAATGCTTCCCTCAGGTTCAGA 712
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 GCAATGCTGTTGCCAGTTACGTGAGGAGGCTTATCATGGAATGCTTCCCTCAGGTTCAGA 702
Query 713 TCTTTATGTTTGGATCTGTACCTCTCAAGACTTATTTGCCTGATGGAGATATCGACTTAA 772
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 TCTTTATGTTTGGATCTGTACCTCTGAAGACTTATTTGCCTGATGGAGATATCGACTTAA 762
Query 773 CGGCTTTTAGCGCTAACCAAAATCTGAAGGATTCTTGGGCTAATTTGGTTCGTGATATGC 832
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 763 CGGCTTTTAGCGCTAACCAAAACCTGAAGGATTCTTGGGCGAATTTGGTTCGCGATATGC 822
Query 833 TTGAAAAGGAAGAGAAGAATGAGAATGCTGAATTCCATGTCAAAGAAGTCCAGTATATAC 892
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 823 TGGAAAAGGAAGAGAAGAACGAGAATGCTGAATTCCATGTCAAAGAAGTCCAGTATATTC 882
Query 893 AAGCAGAAGTGAAGATAATTAAGTGTCTGGTAGAGAATATTGTGGTAGATATATCTTTCA 952
| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 883 AGGCAGAAGTAAAGATAATTAAGTGTCTGGTGGAGAATATTGTGGTGGATATATCTTTCA 942
Query 953 ACCAGATTGGAGGGCTGTGTACATTATGCTTCCTTGAGGAGGTTGATCACTATATAAACC 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 ACCAGATTGGAGGGCTGTGTACATTATGCTTCCTTGAGGAGGTTGATCACTATATAAACC 1002
Query 1013 AGAACCATTTATTCAAGCGTAGTATTATATTGATTAAAGCCTGGTGTTACTACGAGAGCC 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 AGAACCATTTATTCAAGCGTAGTATTATATTGATTAAAGCCTGGTGTTACTACGAGAGCC 1062
Query 1073 GTATATTGGGAGCTCACCATGGGCTTATTTCGACATATGCCCTGGAAACCTTGGTTCTTT 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1063 GTATATTGGGAGCTCACCATGGGCTTATTTCGACATATGCCCTAGAAACCTTGGTTCTTT 1122
Query 1133 ACATATTTTATCTTTTCAACAACTCATTTTCGGGACCTCTTGAGGTTCTCTATCGTTTTC 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1123 ACATATTTTATCTTTTCAACAACTCATTTTCGGGACCCCTTGAGGTCCTCTATCGATTTC 1182
Query 1193 TTGAGTTCTTTAGTAAGTTTGACTGGCAGAATTTTTGTCTTAGCCTCTGGGGCCCTGTTC 1252
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1183 TTGAGTTCTTTAGTAAGTTTGACTGGCAGAATTTTTGTCTTAGCCTCTGGGGACCTGTTC 1242
Query 1253 CAGTTAGTTCACTACCAGATGTAACAGCGGAGCCTCCACGAAGGGATGTTGGAGAGTTAC 1312
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 1243 CAGTTAGTTCACTACCAGATGTAACAGCGGCGCCTCCTCGAAAGGATGTTGGAGAGTTAC 1302
Query 1313 GAGTTAGTGAAGCGTTTTATAGAGCTTGTAGTAGAGTTTATGCAGTTAATATTGCTCCTC 1372
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 GAGTTAGTGAAGCGTTTTATAGAGCTTGTAGTAAAGTTTATGCAGTTAATATTGCTCCTC 1362
Query 1373 AAGAGATACAGGGCCAGCCTTTTGTGTCCAAACATTTCAATGTTATAGACCCTTTGCGTG 1432
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 AAGAGATACAGGGCCAGCCTTTTGTTTCCAAACATTTCAATGTTATAGACCCTTTGCGTG 1422
Query 1433 AAAACAACAACCTTGGACGCAGTGTCAGTAAAGGTAACTTCTTTAGGATACGAAGCGCAT 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1423 AAAACAACAACCTTGGACGCAGTGTCAGTAAAGGTAACTTCTTTAGGATACGAAGTGCAT 1482
Query 1493 TTACCCTGGGTGCCAAGAAGTTGACCAGGTTACTTGAATGCCCTAAGGAGAATTTGATCC 1552
||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 TTACCCTTGGTGCCAAGAAGTTGGCTAGGTTACTTGAATGCCCTAAGGAGAATTTGATCC 1542
Query 1553 ATGAGGTTAACCAATTTTTTATGAACACATGGGAAAGACACGGCAGTGGTCGACGTCCTG 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 ATGAGGTTAACCAATTTTTTATGAACACATGGGAAAGACACGGCAGTGGTCGACGTCCTG 1602
Query 1613 ATGCTCCTGGAAATGACTTATGGCTATCAAGACTGGGAGATCCTGAGCCATATCATCAAG 1672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1603 ATGCTCCTGGAAATGACTTATGGCTATCAAGACTGGGAGATCCTGAGTCATATCATCAAG 1662
Query 1673 CTGAAAATGTTAGTAATTCTTTAAACAACAAAAGAAACCAAAATGCCATCCGTCTTGGTG 1732
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663 CTGAAAATGTTAGTAATTCTTCAAGCAACAAAAGAAACCAAAATGCCATCCGTCTTGGTG 1722
Query 1733 GGGTTCACGGAGCTCGGAGTATGCCCTCTCAACAGAATAACTGTGGAACAGAAATTACAT 1792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1723 GGGTTCACGGAGCTCGGAGTATGCCCTCTCAACAGAATAACTGTGGAACAGAAATTATAT 1782
Query 1793 CTAGAGTAACATATCAAACGCAAAAGAGTCGAGGCAACTCTTACCAACCTGCTCAGGAAG 1852
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1783 CTAGAGTAACATATCAAACGCAAAAGAGTCGAGGCAACTCTTACCAACCTGCTCAGGATG 1842
Query 1853 TCAATTCCAATCAAAGTGCTTTAAATGATAAGCTTCAGCAAACTGTTAAGCCAGAAACTC 1912
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1843 TCATTTCCAATCAAAGTGCTTCAAATGATAAGCTTCAGCAAACTGCTAAGCCAGAAACTC 1902
Query 1913 TGGTTAACAATTTTCATGGTAGGCATATTTTTGCCAGGACCCGCTCTAGCCCTGAGCTTA 1972
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1903 TGGTTAATAATTTTCATGGTACGCATATTTTTGCCAGAACCCGGTCTAGCCCTGAGCTTA 1962
Query 1973 CTGAGACACATGGTGAAGCTCTTTTACAATCTCGTCGTAGTAGAGCCGCCCCAGATGCTG 2032
|||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1963 CTGAGACATATGATGAAGCTCTTTTACAATCACGTCGTAGTAGA---GCCCCAGAAGCTG 2019
Query 2033 GGAAACGCCAAACTAATTCTACCAGGGTTGATAGTATCAGGaaaa-aaaGTCTTGAGTCT 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||
Sbjct 2020 GGAAACGCCAAACTAATTCTACCAGGGTTGATAATATCAGGAAAATGAA-TATGGAGTCT 2078
Query 2092 GAAACTTTGTCAAGTGGTGTTAGATATTCAGCCGACTCTTCGTCAGTTAGGCATACTCCA 2151
|||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 GAAACTTTGTCAAGCAGTGTTCGATATTCGGCCGACTCATCGTCAGTTAGGCATACTCCA 2138
Query 2152 TCCCCTCAAAGTCCTGATAGTACTGCTGACATGAGCAGTGCAGTGAACAGTTACTATGAT 2211
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2139 TCCCCTCGAAGTCCTGATAGTACTGCTGACATGAGCAGTGCAGTGAATAGTTACTATGAT 2198
Query 2212 GAAGTAGGGTCCGTTTCCGTGAATGAAGACTTCTCTGTTGCAGGGGAACAGGAAGAGCAA 2271
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199 GAATTAGGGTCAGTTTCCGTGAATGAAGACTTCTCTGTTGCAGGGGAACAGGAAGAGCAA 2258
Query 2272 GATCTTGTTAACTCGATGACATCTGTTACTGGGCAAGGTTTTAATGGACACTTTCCTTTC 2331
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2259 GATCTTGTTAACTCGATGACATCTGCTGCTGGGCAAGGTTTTAATGGACATTTTCCTTTC 2318
Query 2332 CCTTTTAATTTTTCAACGGGTCACTTACCGTTTCCAATTACACCTTCTATCTTAGCTTCA 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2319 CCTTTTAATTTTTCAACGGGTCACTTACCGTTTCCAATTACACCTTCTATCTTAGCTTCA 2378
Query 2392 ATGGGATATGGTCAGAGGAATATGCCTGGTATTGTTCCTTCTAACCTTCCTTTCATCGAG 2451
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2379 ATGGGATATGGTCAGAGGAATATGCCTGGTATTATTCCTTCTAACCTTCCTTTCATCGAC 2438
Query 2452 GCACCTTGGAGTACTAATCTGCAATTTCCGCAAAACTTTGTTTCTTCACCATTTACCCAT 2511
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||
Sbjct 2439 ACACCTTGGAGTACTAATGTGCAATTTCCACAAAACTTTGTGTCGCCACCGTTTACCCAT 2498
Query 2512 TATTTTCCCAGTGGAGCCCACCCAATTTCAGAAAAGCCGAGCAAAACTGGTAGTGATGAC 2571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2499 TATTTTCCCAGTGGAGCCCACCCAATTTCAGAAAAGCCGAGCAAAACTGGTAGTGATGAC 2558
Query 2572 ATGGGGTCTTCAGAAGTGAATGTCGATGAGTCTGACAATGATCTCTGGCACGAGCCAGAA 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2559 ATGGGGTCTTCAGAAGTGAATGTCGATGAGTCTGACAATGATCTCTGGCACGAGCCAGAA 2618
Query 2632 AGGGGAACTCATAGTTTTGGACTTGAAAATGGTGGTTATGGAATGCATCAGGCAGATGAT 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2619 AGGGGAACTCATAGTTTTGGACTTGAAAATGGTGGTTATGGAATGCATCAGGCAGATGAT 2678
Query 2692 AAACATCAGTCATCTTTTGCAGAGCACAGTTTTGTACCTTCAAGAAGGAAAAATCGGCTG 2751
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2679 AAACATCAGTCATCTTTTGCAGAGCACAGTTTTGTACCCTCAAGTAGGAAAAATCGACTG 2738
Query 2752 ACAAGGGGGGATGATTTAGAAAATTCCCACTCTCCAGTCAGAGGAAGCAGTCAGATTCAG 2811
|||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 ACAAGGGGAGATGGTTTCGAAAATTCCCACTCTCCAGTCAGAGGAAGCAGTCAGATTCAG 2798
Query 2812 AGTGAGGAGAGAACTGTAGGCTCTAGATCTGTGTCTGGCGCTAGTTCCGTTCGAAGCAGG 2871
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2799 AGTGAGGAGAGAACTGCAGGCTCTAGATCTGTGTCTGGTGCTAGTTCCGTTCGAAGCAGG 2858
Query 2872 ACTTCATCTGAAAGCTCCTGGGATGGATCAACTACAAGGGGGTCAAAGCCAGCTAAGGAT 2931
||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2859 ACTTCATCTGAAAGCTCTTGGGATGGGTCAACCACAAGGGGGTCAAAGCCAGCTAAGGAT 2918
Query 2932 AGACGGAATAGGAAAGTTGTGTCTGGGGCCGCATCTACACTGTATGGAAAAGGAAAGAGT 2991
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2919 AGACGGAATAGGAAAGTTGTGTCTGGGGCTGCATCTACACTGTATGGAAAAGGAAAGAGT 2978
Query 2992 GTTCCTGAGCACTCAATCCAGATTGATGATGATAACAGAGAATGGATTCCTGTATCTAGC 3051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2979 GTTCCTGAGCACTCAATCCAGATTGATGATGATAACAGAGAATGGATTCCTGTATCTAGC 3038
Query 3052 AATGAAATAATAGATAGAGATCTGGGGCCTCGTCCTACTGTCCCTTCATTTCAAGTTCAG 3111
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3039 AATGAAATAATCGATAGAGATCTGGAGCCTCGTCCTACTGTCCCTTCATTTCAAGTACAG 3098
Query 3112 AGGCATCAAATACATGGTCATGAACTAGCTCAGGCAAGTGGATCAGAGTCCACAGTGTCT 3171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099 AGGCATCAAATACATGGTCATGAACTAGCTCAGGCAAGTGGATCAGAGTCCACAGTGTCT 3158
Query 3172 CTTGCTCCGTTTATCCTTGGCCATGGCATGCAACAAAACGAGGTTGATAATTCTGGATAT 3231
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3159 CTTGCTCCTTTTCTCCTTGGCCATGGCATGCAACAAAATGAGGTTGATAATTCTGGATAC 3218
Query 3232 ACGTTTTATCCCACAGGACCACCTGTTCCGATTGTTGCAATGCTTCCAATGTACAATTAC 3291
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3219 ACGTTTTATCCCACAGGGCCACCTGTTCCGATTGTTGCAATGCTCCCAATGTACAATTAC 3278
Query 3292 CAAGCTGGTGGTAATGCAACATCAGATGCTCTGGCAAGCCACCACAGTGTGGATGAAGGA 3351
||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3279 CAAGCTGGTGGTAATGCGACATCGGATACTCTGGCAAGCCACCACAGTGTGGATGAAGGA 3338
Query 3352 GTAGAGAATCATGAACCCTGTAAAAGTTTCGACTCGTCCAGGGGACTTGATCAGTCTGAG 3411
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3339 GTAGAGAATCATGATCCCTGTAAAAGTTTTGACTCGTCCAGGGGACTTGATCAGTCTGAG 3398
Query 3412 ATAGTAGTTTCTTCGCACTCCACTAGAATGGGCTCTTCTGCAGAACAGGTGGAGCGTAAG 3471
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3399 ATAGTAGTTTCTTCGCACGCCACTAGAATTGGCTCTTCTGCAGAACAGGTGGAGCATAAG 3458
Query 3472 AATGATATACTCAATGGTGATTTTATAAGCCATTGGCAAAATTTGCAGTATGGCCGCTCT 3531
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3459 AATGATATCCTCAATGGTGATTTTATAAGCCATTGGCAAAATTTGCAGTATGGCCGCTCT 3518
Query 3532 TGCCAGAATTCTCAACATCCGCCTGTGTTGTATCCTGCTCCTGTTGTAGTGCCACCTGCT 3591
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3519 TGCCAGAATTCTCAACATCCGCCTGTGTTGTATCCTGCCCCTGTTGTAGTGCCACCTGCT 3578
Query 3592 TATCTCCAGGGGCGTTTACCATGGGATGGTCCTGGAAGACCTCTGGCTTACACCAATGCT 3651
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 3579 TATCTCCAGGGGCGTTTACCATGGGATGGTCCTGGAAGACCTCTTGCTTACACCAATGTT 3638
Query 3652 GTGAATCAACTCATGACCTACGGACCTCGTCTTGTACCGGTTGCTCCTGTACAACCTGTT 3711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3639 GTGAATCAACTCATGACCTACGGACCTCGTCTTGTACCGGTTGCTCCTGTACAACCTGTT 3698
Query 3712 TCAACCAGGCCACCCAACATTTACCCTCGTTACGCTAATGAAACTCCCAGATATCGAAGT 3771
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3699 TCAACCAGGCCACCCAACATTTACCCTCGTTATGCTAATGAAACTCCCAGATACCGAAGT 3758
Query 3772 GGAACAGGGACCTATTTTCCAAATCCAAAGATTTCTCCTAGGGAGCAGCGGCCTACTTCT 3831
|| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3759 GGGACGGGGACCTATTTTCCAAATCCTAAGATTTCTCCTAGGGAGCAGCGGCCTACATCT 3818
Query 3832 GGCATGAGGCGTGGAAATTATGGGCATGACAGAACCGACCATCATAGCGATAGAGAAGGG 3891
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3819 GGCATGAGGCGTGGGAATTATGGGCATGACAGAACCGACCATCATAGTGATAGAGAAGGG 3878
Query 3892 AATTGGAATGCTGGTTCAAAGACACGAGGTTCTGGACGTAACCACAACAATCGTAACCAA 3951
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3879 AATTGGAATGCTGGTACAAAGACACGAGGTTCTGGACGTAACCACAACAATCGTAACCAA 3938
Query 3952 GCTGACAATAAGCCAATTTCAAGGCAAGACCGATCTGATAGGCATTGGGGGTCGTCGTAC 4011
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3939 GCTGACAATAAGCCAAGCTCAAGGCAAGACCGATCTGATAGGCATTGGGGGTCGTCGTAT 3998
Query 4012 AGACATGAATCGTCCTCCTATTCTGCTCATCATTCTCAAAACGGTCCAATTCGCTCAAAC 4071
|| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3999 AGGCATGAGTCGTCCTCCTATTCTTCTCATCATTCTCAAAACGGTCCAATTCGCTCAAAC 4058
Query 4072 ACTTCACAAGATGCTTCTGGAAATATTGCTTATGGTATGTACCGATTACCACCGGGGATG 4131
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 4059 ACTTCACAAGATGCTTCTGGAAATATTGCATATGGTATGTACCGATTGCCGCCGGGCATG 4118
Query 4132 AAGCAAAACAGTGTGACTTCTTCAGAGGGACACAACGTTCCATCTGTCATGATGTTTTAT 4191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4119 AAGCAAAACAGTGTGACTTCTTCAGAGGGACACAACGTTCCATCTGTGATGATGTTTTAT 4178
Query 4192 CCATATGGCCATAATAATGTTTACAATTCACCATCTGAACACAATGAGTATGGGTCTCTT 4251
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4179 CCATATGACCATAATAATGTTTACAATTCACCATCTGAACACCATGAGTATGGGTCTCTT 4238
Query 4252 GGACCAG-GTGGTGAAGCGCCACATTTAAATGACGAGGATCAGCCAAGGTTTCGTGGTGC 4310
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4239 GGACCAGCG-GGTGAAGCGCCACATTTAAATGACGAGGATCAGCCAAGGTTTCGTGGTGC 4297
Query 4311 TGCTGCTTCTGCTCATATGTCTTCACCTGACGATCCTTCCTCGCCTCACTTCCCCAGGGG 4370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4298 TGCTGCTTCTGCTCATATGTCTTCACCTGACGATCCTTCCTCGCCTCACTTCCCCAGGGG 4357
Query 4371 AAAGTAACATCGATGGTTGCTCAAGTTTAGCTGCAATAAACTCAAGAACTTAGAAGAATA 4430
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4358 AAAGTAACATCAATGGTTGCTCAAGTTTAGCTGCAATAAACTCAAGAACTTAGAAGAATA 4417
Query 4431 CTGTACGATCACATCACTAGGGTCTTGGAAATCTAAAGAAGGCAAAAAGTTGTGAAGCCG 4490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4418 CTGTACGATCACATCACTAGGGTCTTGGAAATCTAAAGAAGGCAAAAGGTTGTGAAGCCG 4477
Query 4491 TGAAAG--GAG--A-GACTTGATAGAGCTCAGACCAATCTGGATATTTCTGTTCAAGTGT 4545
|||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 4478 TGAAAGAAGAGTCAAGACTTGATAGACCTCAGACCAATCTCGATTTTTCTGTTCAAGTGT 4537
Query 4546 GGTCTGGAGAGCAGCAAAGAAGGAAGCCAAGTCAAAGGGGAATCGGTAAGCGACCCAAGC 4605
| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4538 GCTCTTGAGAGCAACAAAGAAGGAAACCAAGTCAAAGAGGAATCGGTTAGCGACCCAAGC 4597
Query 4606 CTGGATTGTTCTTTGTATGTACACTACAATCAAGCCA-TTACCGCCCATGATCATCGGTT 4664
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4598 CTGGTTTGTTCTTTGTATGTACACTACAATCAAGCCAATTACCGCTCATGATCATCGGTT 4657
Query 4665 T-AATCATCATTTTCACGGAGATTGCTGTTTGGTTTTGATAGCCCAGATGGATGAAAAAA 4723
| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 4658 TTAATCATCGTTTTCACGGAGACTGCTGCTTGGTTTTAATAGGCCAGATGGATGAAAAAA 4717
Query 4724 -CGCAGGAACTCTTTCTCAGATCTAGTTCGGTTAGGTAActtttctctgttttttgtttc 4782
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |
Sbjct 4718 ACGCAGGAACTCTTTCTCAGATCTAGTACGGTTAGGTAACTTTACTCT-T---------C 4767
Query 4783 ttttcgctttcccttagcattttatttccatagaaaatgtagccttttttGCCCACATAG 4842
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 4768 TTTT---TT-CCCTTAGCATTTTATTTCCATAGAAAATGTAGTCTTTTT-GCCCACATAG 4822
Query 4843 AAACTAATAGAATCCAGGGCTTATCGTCAATCTTGTTTCTAAAAATTCAAGAAAGAATTT 4902
|||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4823 AAACTATTAGAATCCAGGGCTTATCGTCAACCATGTTTCTAAAAATTCAAGAAATAATTC 4882
Query 4903 CTCTACTATTTTTAGAAAAAGAAAACTGTA 4932
|||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 4883 CTCTACTATTTTCAGAAAAAGAAAACAGTA 4912
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 187281316733
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5