BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G62080.2
Length=1666
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486715 jgi|Araly1|486715|fgenesh2_kg.5__2707__AT3G62080.2 2627 0.0
Ahg485327 jgi|Araly1|485327|fgenesh2_kg.5__1319__AT3G62080.2 2233 0.0
Ahg899207 jgi|Araly1|899207|Al_scaffold_0005_3173 1964 0.0
> Ahg486715 jgi|Araly1|486715|fgenesh2_kg.5__2707__AT3G62080.2
Length=1614
Score = 2627 bits (1422), Expect = 0.0
Identities = 1551/1615 (96%), Gaps = 2/1615 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 53 TCTCTCCGACGATCTTCGTATAAAACTTAGTCCGGCGGGAAATCGACTTTCAAATTCGCA 112
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCTCTCCGACGATCTCCGTATAAAACTTAGTGCGGCGGGAAATCGACTTTCAAATTCGCA 60
Query 113 GGATTCTGTCGATATTCTTGAAATGGATCCTGAAGCTGTGAAGGAGTTTATACGAAGGGA 172
|||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGATTCTGTCGAAATTCTTGAAATGGATTCGGAAGCTGTGAAGGAGTTTATACGAAGGGA 120
Query 173 AGTTCCAGATTGGGACGATGAGGTGGTGGCGATGGCTAGATTCAAGGCGTTTAGTGGTCA 232
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 121 AGTTCCAGATTGGGACGATGAGGTGGTGACGACGGCTAGATTCAAGGCGTTTAGTGGGCA 180
Query 233 GAGGTCCGATTGGGAACTTAAATTTCAGTTTTGGCGTGATTTGATCATCAAGGTTTCGCG 292
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 181 GAGATCCGATTGGGAACTTAAATTTCAGTTTTGGCGTGATTTGATCCTCAAGGTTTCGCG 240
Query 293 TCAGTTTGGGTTGTTCATCATTGATCCTGTCCAGGTGAAGAAGGCGTGGTTTGATCGAGG 352
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 241 TCAGTTTGGGTTGTTCATCATTGATCCTGTTAAGGTGAAGAAGGCGTGGTTTAATCGAGG 300
Query 353 AGGAATGACGCCTTTATGCATTGATGATGTTGTGTTATTGATGCATAGTGAAGGTGATGT 412
|||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGGAATAACGCCTTTATGCATTGATCATGTTCTGTTATTGATGCATAGTGAAGGTGATGT 360
Query 413 TGTGCGGATTAGTGATCTCGATGATCCCGGTAGTGGTCGTATTGCTCGTTTATTGAGGAC 472
|||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 361 TGTGCGGATTAGCGATATTGATGATCCGGGTAGTGGTCGTATTTCTCGTTTATTGAGGAC 420
Query 473 AGTGAAGAACTTAATGGTTCAACAGCCAGTGAAGCAGGAAGAGATTCTGGAAAATACACT 532
||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 421 AGTGAGGAACTTGATGGTTCGACAGTCAGTGAAGCCGGAAGAGATTCTGGAAACTAAACT 480
Query 533 TGTTCTTGTTCCACTCTTGAAGGAGAAGGCGGCTGACGTGGTGAAGATATTATCTGAGGG 592
|||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 481 TGTTTTTGTCCCACTCTTGAAGGAGAAGGCTGCTGACGTGGTGAATATATTATCTGAGGG 540
Query 593 ACACTGGACTTCTACTTGTGTTGTCACGCTGAAGAAGTTTCGGAATTTGTGCAACGGTTC 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 541 ACACTGGACTTCTACTTGTGTTGTCACGCTGAAGAAGTTTCGGAATTTGTGCAACGGCTC 600
Query 653 GAATGAGGCTTCAGCTGTTTTGAGTCACTTGTCAGGGTGTGGAAAAGCGCATAAAATCTC 712
||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GAATGAGGCATCTGCTGTTTTGAGTCACTTGTCAGGTTGTGGAAAAGCGCATAAAATCTC 660
Query 713 TATCAATCGGGGAGAACTGATTGAGGGTGTTAAGGTGTCCTTTTCACAAACAGCACTTCC 772
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 661 TATCAATCGGGGAGAACTGATCGAGGGCGTTAAAGTGTCCTTTTCACAAGCAGCACTTCC 720
Query 773 CGGTATCTCAACTTTAGACTGTGATATTCTGCACTTGCTAAGGACTACAGAAAAGCTCCA 832
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CAGTATCTCAACTTTAGACTGTGATATTCTGCACTTGCTAAGGACTACAGAAAAGCTCCA 780
Query 833 AGATCAACTTGAAGTGATGGACCAACGTTGTGAAAAGTCAAAGAAATCAGCGCTGGCATC 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGATCAACTTGAAGTGATGGACCAACGTTGTGAAAAGTCAAAGAAATCAGCGCTGGCATC 840
Query 893 TCTAAAGTCTGGACACAGGAAAGTTGCTCTAAGGCATGCAAGGGAATTGAAGGTGGTGAC 952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 841 TCTAAAGTCTGGACACAGGAAAGTTGCTCTAAGGCATGCAAGGGAATTGAAGTTGGCGAC 900
Query 953 TGAGAGCAGAGAAAAATGCACGTCACTTCTGAACAGAGTAGAAGAAGTGTTGAACACTAT 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TGAGAGCAGAGAAAAATGCACGTCACTTCTGAACAGAGTAGAAGAAGTGTTGAACACTAT 960
Query 1013 AGCGGATTCCGAATCTACGAAAATGGTCTCAGAAGCAATTAAAACTGGAGCTAGGGTTAT 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AGCGGATTCCGAATCTACGAAAATGGTCTCAGAAGCAATCAAAACTGGAGCTAGGGTTAT 1020
Query 1073 GAAGGACATCAAGATCAGTGCAGATGATGTTCATGACTATCTAGAAGAACTTGAGGAAAC 1132
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GAAGGACGTCAAGATCAGTGCAGATGATGTTCATGACTATTTAGAAGAACTTGAGGAAAC 1080
Query 1133 TATTGAATCACAGAAGCAAGTCGAAAAAGCTCTCGAATCAGCTCCATATCCAGATATTGA 1192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1081 TATTGAATCACAGAAGCAAGTCGAAAAAGCTCTCGAATCAGCTCCATATCCAGATACTGA 1140
Query 1193 TGATGAAGATATCGAAGAAGAATTACTGGAACTAGAGATGGACCTTGAAAGTGAAAGTTC 1252
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 TGATGAAAATATCGAAGAAGAATTACTGGAATTAGAGATGGACCTTGAAAGTGAAAGTTC 1200
Query 1253 TCAGGTCCTACCAGCGACTTCAGATACTGCAGATTCACTGACTGAGATGTTCTCAGAGCT 1312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TCAGGTCCTACCAGCGACTTCAGATACTGCAGATTCACTGACTGAGATGTTCTCAGAGCT 1260
Query 1313 TAAACTTGGCAAGACGAAACAAACATTGGAAGAGCAAGCTACTGAGCCAGCTCAGATGAA 1372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1261 TAAACTTGGCAAGACGAAACAAACATTGGAAGAGCAAGCTACTGAGCCAGCTCGGATGAA 1320
Query 1373 AGATAGCGGAAAAAAGATTCTTGAAGCAGCATAGCTGAACAATGCATCTTCATTGCGGTG 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1321 AGATAGCGGAAAAAAGATTCTTGAAGCAGCATAGCTGAACAATGCATCTTCATTGTGGTG 1380
Query 1433 CGATCTCTTCTCTTCCTGTTGTTCTTAGTGAAGAAATACACTCAGTATCATATAAATAGA 1492
|||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 CGATCTCTTCTCTTACTGTTGTACTTAGAGAAGAAATACACTCAGTATCATATAAATAGA 1440
Query 1493 ATAGAACCGGGTAAAGTGAGTTGAGTATTTGTATGCTATGCCTCTTGTTTGGATTCTAGA 1552
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1441 ATAGAAACGGGTAAAGTGAGTTGAGTATTTGTATGCTATGCCTCTTGTTCGGATTCAAGA 1500
Query 1553 AACAATAGCTTCACTCCATTGTATAAAGTCAGCAGCTTGTTTCATAAACAGAGAGGAACG 1612
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1501 AACAATAGCTTCACTCCATTGTATAAAGTCAGGAGCTTGTTTCATAAACAGAGAGGAAGG 1560
Query 1613 TCGAGTTATGATTTTTATCACTCCGATAGTG-TTCGATAATTTATTAATGTTTCT 1666
|||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TCGAATGATGATTTTGATCACTCCGATAGTGGTT-GATAATTTATTAATGTTTCT 1614
> Ahg485327 jgi|Araly1|485327|fgenesh2_kg.5__1319__AT3G62080.2
Length=1471
Score = 2233 bits (1209), Expect = 0.0
Identities = 1345/1412 (95%), Gaps = 3/1412 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 173 AGTTCCAGATTGGGACGATGAGGTGGTGGCGATGGCTAGATTCAAGGCGTTTAGTGGTCA 232
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 9 AGTTCCAGATTGGGACGATGAGGTGGTGGCGACGGCCAGATTCAAGGCGTTTAGTGGGCA 68
Query 233 GAGGTCCGATTGGGAACTTAAATTTCAGTTTTGGCGTGATTTGATCATCAAGGTTTCGCG 292
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 69 GAGATCCGATTGGGAACTTAAATTTCAGTTTTGGCGTGATTTGATCCTCAAGGTTTCGCG 128
Query 293 TCAGTTTGGGTTGTTCATCATTGATCCTGTCCAGGTGAAGAAGGCGTGGTTTGATCGAGG 352
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 129 TCAGTTTGGGTTGTTCATCATTGATCCTGTTCAGGTGAAGAAGGCGTGGTTTAATCGAGG 188
Query 353 AGGAATGACGCCTTTATGCATTGATGATGTTGTGTTATTGATGCATAGTGAAGGTGATGT 412
|||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 AGGAATAACGCCTTTATGCATTGATCATGTTCTGTTATTGATGCATAGTGAAGGTGATGT 248
Query 413 TGTGCGGATTAGTGATCTCGATGATCCCG-GTAGTGGTCGTATTGCTCGTTTATTGAGGA 471
|||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 249 TGTGCGGATTAGCGATCTTGATGAT-CCGAGTATTGGCCGTATTTCTCGTTTATTGAGGA 307
Query 472 CAGTGAAGAACTTAATGGTTCAACAGCCAGTGAAGCAGGAAGAGATTCTGGAAAATACAC 531
|||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 308 CAGTGAGGAACTTGATGGTTCAACAGTCAGTGAAGCAGGAAGAGATTCTGGAAACTAAAC 367
Query 532 TTGTTCTTGTTCCACTCTTGAAGGAGAAGGCGGCTGACGTGGTGAAGATATTATCTGAGG 591
||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||
Sbjct 368 TTGTTATTGTACCACTCTTGAAGGAGAAGGCGGGTGATGTGGTTAATATTTTATCTGAGG 427
Query 592 GACACTGGACTTCTACTTGTGTTGTCACGCTGAAGAAGTTTCGGAATTTGTGCAACGGTT 651
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 428 GACACTGGACTTCTACTTGTGTTGTCACGCTGAAGAAGTTTCAGAATTTGTGCAACGGCT 487
Query 652 CGAATGAGGCTTCAGCTGTTTTGAGTCACTTGTCAGGGTGTGGAAAAGCGCATAAAATCT 711
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 CGAATGAGGCATCTGCTGTTTTGAGTCACTTGTCAGGGTGTGGAAAAGCGCATAAAATCT 547
Query 712 CTATCAATCGGGGAGAACTGATTGAGGGTGTTAAGGTGTCCTTTTCACAAACAGCACTTC 771
||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||
Sbjct 548 CTATCAATCAGGGAGAACTGATCGAGGGCGTTAAAGTATCCTTTTCACAAGCAGCACTTC 607
Query 772 CCGGTATCTCAACTTTAGACTGTGATATTCTGCACTTGCTAAGGACTACAGAAAAGCTCC 831
| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 CTAGCATCTCAACTTTAGATTGTGATATTCTGCACTTGCTAAGGACTACAGAAAAGCTCC 667
Query 832 AAGATCAACTTGAAGTGATGGACCAACGTTGTGAAAAGTCAAAGAAATCAGCGCTGGCAT 891
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 ACGATCAACTTGAAGTGATGGACCAACGTTGTGAAAAGTCAAAGAAATCAGCGCTGGCAT 727
Query 892 CTCTAAAGTCTGGACACAGGAAAGTTGCTCTAAGGCATGCAAGGGAATTGAAGGTGGTGA 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 728 CTCTAAAGTCTGGACACAGGAAAGTTGCTCTAAGGCATGCAAGGGAATTGAAGTTGGCGA 787
Query 952 CTGAGAGCAGAGAAAAATGCACGTCACTTCTGAACAGAGTAGAAGAAGTGTTGAACACTA 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 CTGAGAGCAGAGAAAAATGCACGTCACTTCTGAACAGAGTAGAAGAAGTGTTGAACACTA 847
Query 1012 TAGCGGATTCCGAATCTACGAAAATGGTCTCAGAAGCAATTAAAACTGGAGCTAGGGTTA 1071
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 848 TAGCGGATTCTGAATCTACGAAAATGGTCTCAGAAGCAATCAAAACTGGAGCTAGGGTCA 907
Query 1072 TGAAGGACATCAAGATCAGTGCAGATGATGTTCATGACTATCTAGAAGAACTTGAGGAAA 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 908 TGAAGGACATCAAGATCAGTGCAGATGATGTTCATGACTATTTAGAAGAACTTGAGGAAA 967
Query 1132 CTATTGAATCACAGAAGCAAGTCGAAAAAGCTCTCGAATCAGCTCCATATCCAGATATTG 1191
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 968 CTATTGAATCACAGAAGCAAGTCGAAAAAGCTCTCGAATCCGCTCCATATCCAGATACTG 1027
Query 1192 ATGATGAAGATATCGAAGAAGAATTACTGGAACTAGAGATGGACCTTGAAAGTGAAAGTT 1251
|||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 ATGATGAAAATTTCGAAGAAGAATTACTGGAATTAGAGATGGACCTTGAAAGTGAAAGTT 1087
Query 1252 CTCAGGTCCTACCAGCGACTTCAGATACTGCAGATTCACTGACTGAGATGTTCTCAGAGC 1311
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 CTCAAGTCCTACCAGCGACTTTAGATACTGCAGATTCACTGACTGAGATGTTCTCAGAGC 1147
Query 1312 TTAAACTTGGCAAGACGAAACAAACATTGGAAGAGCAAGCTACTGAGCCAGCTCAGATGA 1371
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1148 TTAAACTTGGCAAGACGAAACAAACATTGGAAGAGCAAGCTACTGAGCCAGCTCGGATGA 1207
Query 1372 AAGATAGCGGAAAAAAGATTCTTGAAGCAGCATAGCTGAACAATGCATCTTCATTGCGGT 1431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1208 AAGATAGCGGAAAAAAGATTCTTGAAGCAGCATAGCTGAACAATGCATCTTCATTGTGGT 1267
Query 1432 GCGATCTCTTCTCTTCCTGTTGTTCTTA-GTGAAGAAATACACTCAGTATCATATAAATA 1490
|||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 1268 GCGATCTCTTCTCTTCTTGTTGTACTTAAGAGAAGAAATACACTCGGTATCATATAGATA 1327
Query 1491 GAATAGAACCGGGTAAAGTGAGTTGAGTATTTGTATGCTATGCCTCTTGTTTGGATTCTA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1328 GAATAGAACCGGGTAAAGTGAGTTGAGTATTTGTATGCTATGCCTCTTGTTCGGATTCTA 1387
Query 1551 GAAACAATAGCTTCACTCCATTGTATAAAGTC 1582
||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 GAAACAAGAGCTTCACTCCATTGTATAAAGTC 1419
> Ahg899207 jgi|Araly1|899207|Al_scaffold_0005_3173
Length=1257
Score = 1964 bits (1063), Expect = 0.0
Identities = 1205/1272 (95%), Gaps = 15/1272 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 135 ATGGATCCTGAAGCTGTGAAGGAGTTTATACGAAGGGAAGTTCCAGATTGGGACGATGAG 194
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATTCGGAAGCTGTGAAGGAGTTTATACGAAGGGAAGTTTCAGATTGGGACGATGAG 60
Query 195 GTGGTGGCGATGGCTAGATTCAAGGCGTTTAGTGGTCAGAGGTCCGATTGGGAACTTAAA 254
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 61 GTGGTGGCGACGGCTAGATTCAAGGCGTTTAGTGGGCAGAGATCCAATTGGGAACTTAAA 120
Query 255 TTTCAGTTTTGGCGTGATTTGATCATCAAGGTTTCGCGTCAGTTTGGGTTGTTCATCATT 314
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTTCAGTTTTGGCGTGATTTGATCCTCAAGGTTTTGCGTCAGTTTGGGTTGTTCATCATT 180
Query 315 GATCCTGTCCAGGTGAAGAAGGCGTGGTTTGATCGAGGAGGAATGACGCCTTTATGCATT 374
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 181 GATCCTGTTCAGGTGAAGAAGGCGTGGTTTAATCGAGGAGGAATAACGCCTTTATGCATT 240
Query 375 GATGATGTTGTGTTATTGATGCATAGTGAAGGTGATGTTGTGCGGATTAGTGATCTCGAT 434
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 241 GATCATGTTCTGTTATTGATGCATAGTGAAGGTGATGTTGTGCGGATTAGCGATATTGAT 300
Query 435 GATCCCGGTAGTGGTCGTATTGCTCGTTTATTGAGGACAGTGAAGAACTTAATGGTTCAA 494
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 301 GATCCGGGTAGTGGTCGTATTTCTCGTTTATTGAGGACAGTGAGGAACTTGATGGTTCAA 360
Query 495 CAGCCAGTGAAGCAGGAAGAGATTCTGGAAAATACACTTGTTCTTGTTCCACTCTTGAAG 554
||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 361 CAGTCAGTGAAGCCGGAAGAGATTCTGGAAAATAAACTTGTTATTGTACCACTCTTGAAG 420
Query 555 GAGAAGGCGGCTGACGTGGTGAAGATATTATCTGAGGGACACTGGACTTCTACTTGTGTT 614
|||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAGAAGGCTGCTGACGTGGTTAATATATTATCTGAGGGACACTGGACTTCTACTTGTGTT 480
Query 615 GTCACGCTGAAGAAGTTTCGGAATTTGTGCAACGGTTCGAATGAGGCTTCAGCTGTTTTG 674
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||
Sbjct 481 GTCACGCTCAAGAAGTTTCGGAATTTGTGCAACGGCTCGAATGAGGCATCTGCTGTTTTG 540
Query 675 AGTCACTTGTCAGGGTGTGGAAAAGCGCATAAAATCTCTATCAATCGGGGAGAACTGATT 734
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGTCACTTGTCAGGGTGTGGAAAAGCGCATAAAATCTCTATCAATCGGGGAGAACTGATC 600
Query 735 GAGGGTGTTAAGGTGTCCTTTTCACAAACAGCACTTCCCGGTATCTCAACTTTAGACTGT 794
||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GAGGGCATTAAAGTGTCCTTTTCACAAGCAGCACTTCCCAGTATCTCAACTTTAGACTGT 660
Query 795 GATATTCTGCACTTGCTAAGGACTACAGAAAAGCTCCAAGATCAACTTGAAGTGATGGAC 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GATATTCTGCACTTGCTAAGGACTACAGAAAAGCTCCAAGATCAACTTGAAGTGATGGAC 720
Query 855 CAACGTTGTGAAAAGTCAAAGAAATCAGCGCTGGCATCTCTAAAGTCTGGACACAGGAAA 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CAACGTTGTGAAAAGTCAAAGAAATCAGCGCTGGCATCTCTAAAGTCTGGACACAGGAAA 780
Query 915 GTTGCTCTAAGGCATGCAAGGGAATTGAAGGTGGTGACTGAGAGCAGAGAAAAATGCACG 974
||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GTTGCTCTACGGCATGCAAGGGAATTGAAGTTGGCGACTGAGAGCAGAGAAAAATGCACG 840
Query 975 TCACTTCTGAACAGAGTAGAAGAAGTGTTGAACACTATAGCGGATTCCGAATCTACGAAA 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 841 TCACTTCTGAACAGAGTAGAAGAAGTGTTGAACACTATAGCGGATTCTGAATCTACGAAA 900
Query 1035 ATGGTCTCAGAAGCAATTAAAACTGGAGCTAGGGTTATGAAGGACATCAAGATCAGTGCA 1094
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATGGTCTCAGAAGCAATCAAAACTGGAGCTAGGGTTATGAAGGACATCAAGATCAGTGCA 960
Query 1095 GATGATGTTCATGACTATCTAGAAGAACTTGAGGAAACTATTGAATCACAGAAGCAAGTC 1154
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GATGATGTTCATGACTATTTAGAAGAACTTGAGGAAACTATTGAATCACAGAAGCAAGTC 1020
Query 1155 GAAAAAGCTCTCGAATCAGCTCCATATCCAGATATTGATGATGAAGATATCGAAGAAGAA 1214
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 1021 GAAAAAGCTCTCGAATCAGCTCCATATCCAGATACTGATGATGAAAATATCGAAGACGAA 1080
Query 1215 TTACTGGAACTAGAGATGGACCTTGAAAGTGAAAGTTCTCAGGTCCTACCAGCGACTTCA 1274
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1081 TTACTGGAATTAGAGATGGACCTTGAAAGTGAAAGTTCTCAGGTCCTACCAGCGAATTTA 1140
Query 1275 GATACTGCAGATTCACTGACTGAGATGTTCTCAGAGCTTAAACTTGGCAAGACGAAACAA 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GATACTGCAGATTCACTGACTGAGATGTTCTCAGAGCTTAAACTTGGCAAGACGAAACAA 1200
Query 1335 ACATTGGAAGAGCAAGCTACTGAGCCAGCTCAGATGAAAGATAGCGGAAAAAAGATTCTT 1394
|||||||| | || ||| | | | | | || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 ACATTGGA-GC-CA-GCT-C-G-G--A--T--GA--AA-GATAGCGGAAAAAAGATTCTT 1245
Query 1395 GAAGCAGCATAG 1406
||||||||||||
Sbjct 1246 GAAGCAGCATAG 1257
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 62468001800
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5