BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G62110.1
Length=2142
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486722 jgi|Araly1|486722|fgenesh2_kg.5__2714__AT3G62110.1 2739 0.0
Ahg937784 jgi|Araly1|937784|scaffold_501975.1 2401 0.0
Ahg939301 jgi|Araly1|939301|scaffold_503492.1 582 3e-165
> Ahg486722 jgi|Araly1|486722|fgenesh2_kg.5__2714__AT3G62110.1
Length=2056
Score = 2739 bits (1483), Expect = 0.0
Identities = 1684/1778 (95%), Gaps = 26/1778 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 383 TTTT-TTGTCAAGATTTTTAATTTAAGTTTCCTGGAGGAGGAGATCACAGATCTTCTTTT 441
|||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 TTTTATTGTCAAGATTTTTAATTTAGGTTTCCT---GGAGGAGATCACAGATCTTCTTTT 340
Query 442 CATATGAAGAGATCTTTCCTTCTCTTGTATGTGCTCCTGGTACAGGCCTTCTATGGGGCT 501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 341 CATATGAAGAGATCTTTCCTTCTCTTGTATGTGCTCCTGGTACAGTCCTTCTATGGTGCT 400
Query 502 TGGTGTAGTGTTGGAGAAAGCCTGCATTGTGAATATTCCAATTTAGCGAGTCTTCACCGG 561
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 401 TGGTGTAGTGTAGGAGGAAGCCTGCATTGTGAATATTCCAGTTTAGCGAGTCTTCACCGG 460
Query 562 CCTCACAGCGTATCGATTACAGAGTTTGGAGCGGTTGGAGATGGTGTGACTCTAAACACT 621
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 461 CCTCACAGTGTATCGATTACAGAGTTTGGAGCGGTTGGAGATGGTGTGACTCTAAATACT 520
Query 622 AAAGCCTTTCAGAATGCTCTGTTCTACCTCAATTCTTTCTCTGATAAAGGCGGGGCCAAG 681
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 521 AAAGCCTTTCAGAATGCTTTGTTCTACCTCAATTCTTTCTCTGACAAAGGCGGTGCCAAG 580
Query 682 CTTTTTGTTCCCGCTGGTCAGTGGCTTACCGGGAGTTTCGACCTTATCAGTCACCTCACC 741
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 581 CTTTTTGTTCCTGCTGGTCAGTGGCTTACCGGGAGTTTCGACCTCATCAGTCACCTCACC 640
Query 742 TTATGGCTAGATAAAGGTGCAACGATTCTCGGGTCAACGAGCTCAGAGAATTGGCCCGTG 801
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 641 TTATGGCTAGACAAAGGTGCAACGATTCTCGGGTCAACGAGCTCAGAGAATTGGCCTGTG 700
Query 802 GTTGATCCATTACCATCATATGGACGAGGAAGAGAATTGCCCGGTAGAAGACACAGAAGT 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 GTTGATCCATTACCATCATATGGACGAGGAAGAGAATTGCCCGGTAGAAGACACAGAAGT 760
Query 862 CTTATATATGGTCAGAATCTCACAGATGTAGTCATAACAGGCGAGAACGGGACAATTGAT 921
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 CTTATATATGGTCAAAATCTCACAGATGTAGTCATAACAGGCGAGAACGGGACAATTGAT 820
Query 922 GGTCAAGGAACTGTATGGTGGGATTGGTTTAGAAATGGAGAGCTTAACTATACAAGACCT 981
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 821 GGTCAAGGAAGTGTATGGTGGGATTGGTTTAGAAATGGAGAGCTAAACTATACAAGACCT 880
Query 982 CATCTTGTTGAGCTCATGAACTCTACTGGTCTGATCATCTCCAACCTCACATTCTTGAAT 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 CATCTTGTTGAGCTCATGAACTCTACTGGTCTGATCATCTCCAACCTCACATTCTTGAAT 940
Query 1042 TCACCGTTTTGGAACATTCATCCTGTTTATTGCAGAGATGTTGTTGTAAAGAATCTCACA 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 941 TCACCGTTTTGGAACATTCATCCTGTTTATTGCAGAGATGTTGTTGTGAAGAATCTCACA 1000
Query 1102 ATTTTGGCTCCTCTTGAATCTCCAAATACAGATGGAGTTGATCCAGATTCATCAACTAAT 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1001 ATTTTGGCTCCTCTTGAATCTCCAAATACAGATGGAGTTGATCCAGACTCATCAACTAAT 1060
Query 1162 GTTTGCATAGAGGATTGTTACATAGTTACCGGGGATGATTTGGTATCGATAAAAAGCGGA 1221
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 GTTTGCATAGAGGATTGTTACATAGTTACCGGAGATGATTTGGTATCGATAAAAAGCGGA 1120
Query 1222 TGGGATGAGTATGGAATATCCTACGCAAGACCGAGCTCCAAGATCAAGATTAATCGGTTA 1281
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1121 TGGGATGAGTACGGAATATCCTACGCAAGACCGAGCTCCAAGATCAAGATCAATCGGTTA 1180
Query 1282 ACAGGTCAAACTACTTCAAGCTCAGGAATAGCAATAGGAAGTGAAATGTCGGGAGGTGTA 1341
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1181 ACAGGTCAAACTACTTCAAGCTCAGGCATAGCAATCGGAAGTGAAATGTCAGGAGGTGTG 1240
Query 1342 TCCGAAATATACATTAAAGACTTACATTTGTTCAATTCGAATACTGGAATCAGAATCAAG 1401
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 1241 TCCGAAATATATATTAAAGACTTACATTTATTCAATTCAAATACCGGAATCAGAATCAAG 1300
Query 1402 ACTTCTGCTGGAAGAGGCGGGTATGTTAGAAACGTTCACATCTTGAACGTGAAGCTCGAT 1461
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 ACTTCTCCGGGAAGAGGCGGGTATGTTAGAAACGTTCACATCTTGAACGTGAAGCTCGAT 1360
Query 1462 AATGTAAAGAAAGCGATTAGGTTCACCGGTAAGTACGGTGAACATCCTGATGAGAAATAC 1521
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1361 AATGTAAAGAAAGCGATTAGATTCACGGGTAAGTACGGTGAACATCCTGATGAAAAATAT 1420
Query 1522 GATCCCAAAGCACTCCCAGCTATAGAGAAAATCACCTTTGAGAATGTAAATGGCGATGGA 1581
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1421 GATCCCAAAGCACTCCCAGCTATCGAGAAAATCACCTTTGAGAATGTAAATGGTGATGGA 1480
Query 1582 ATAGGTGTTGCGGGTCTTCTTGAAGGTATAGAAGGAGATGTGTTTAAGAATATATGTTTC 1641
|| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1481 ATCGGTGTTGCGGGTCTACTTGAAGGTATAGCAGGAGATGAGTTTAGGAATATATGTTTC 1540
Query 1642 CTTAATGTTACTCTTAGAGTGAAGAAGAATTCGAAGAAATCACCATGGGAATGCTCGAAT 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1541 CTTAATGTTACTCTTAGAGTGAAGAAGAATTCGAAGAAATCTCCATGGGAATGCTCAAAT 1600
Query 1702 GTGAGAGGTTATTCACAGTGGGTTTCGCCGGAAATTACTTGTGATTCTTTGAAAGAGAGT 1761
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 GTTAGAGGTTATTCACAGTGGGTTTCGCCGGAAATTACTTGTGATTCTTTGAAAGAGAGT 1660
Query 1762 ATATTCCCGGAACATGGATCTGATTGTTTCGGGTTATCGGAAAATAATATGGAGATATCA 1821
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1661 ATATTCCCGGAACATCAATCTGATTGTTTTGGGTTATCGGAAAATAATCTGGATATATCA 1720
Query 1822 AGTGGTTTAAGTAGATCACCATGGTTACTTTCTTGGTAAGTTACTGTGAAGTTTTGAACA 1881
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1721 AGTGGTTTAAGTAGATCACCATGGTTACTTTCTTGGTAAGTTACGGTGAAGTTTTGAACA 1780
Query 1882 TCAAAGGGGAAACA-CAGTTTGCTTGATT-CTGAAGAAACCTCTTCGATTTTGAAAAATG 1939
| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1781 TGGAAGGGGAAACAACAGTTTGCTTGATTGC-GAAGAAACCTCTTCGATTTTCAAAAGTG 1839
Query 1940 ATGCTTTCTTTCATCTTTTGTTGTTTTCGTGTAAATTTGTGTGCAGTGAGGAAAATAATC 1999
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1840 ATGCTTTCTTTCATTTTTTGTTGTTTTCTTGTAAATTTGTGTGCAGTGAGGGCAATAATC 1899
Query 2000 AGAGTGGCTTAAGAGttt-ttgtt--tt--t---gtttt-CC-TT-----GTATGGGCTT 2044
|||||||||||||||||| || || || | ||||| || || ||||||||||
Sbjct 1900 AGAGTGGCTTAAGAGTTTCTTTTTCCTTCGTTTTGTTTTTCCATTTTCTTGTATGGGCTT 1959
Query 2045 T--AATGCTTTTGGTGAGCGGAACAATTGTAATATCTCCGAC-AGAGTCTGTTGAAATTT 2101
| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||
Sbjct 1960 TTTAATGCTTT-GGTGAGCGGAACAAGTGTAATATCTCCGACGACAGTCTTTTGAAATTT 2018
Query 2102 TTTGACAATTATTTTTCAATTTCAGATTCCATAACTAG 2139
|||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||
Sbjct 2019 TTTGACAATTATTTTTCAATCTCAAAGTCCATAACTAG 2056
Score = 357 bits (193), Expect = 2e-97
Identities = 273/306 (89%), Gaps = 28/306 (9%)
Strand=Plus/Plus
Query 29 TCTCTGGGTTTCTCTCAGTGACCCTCTTTGTCTCTTTGTAACAGAACATCAAATAAGGA- 87
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1 TCTCTGGGTTTCTCTCAGTGACCATCTTTGTCTCTTTGTAACAGAACATCAAATAA-GAC 59
Query 88 G-GAA-GATATTAAAAAATTGGTAATGGCG-A-T---GATCATGGGTACGGAGAAGGTAG 140
| ||| |||||| ||||| ||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 60 GAGAAGGATATT-AAAAA-TGGTAATGGCGAATTGGCGATGATGGGTACGGAGAAGGTAG 117
Query 141 AAGATGGACCTACTGCTTGAATTTTGGCGGG--CAGAAACGGTCTCTTTCAATGATTTTT 198
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 AAGATGGACCTACTGCTTGAAATTTGGCGGGGGCAGAAACGGTCTCTTTCAATGATTTTT 177
Query 199 ATGTCCATTGTGGGTTCCCCAGTTTCCTCTCACCACTGACCCATCTAATCAATCTTTGCA 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 178 ATGTCCATTGTGGGTTCCCCAGTTTCCTCTCACCACTGACCCATCTA-TCACTCTTTGCA 236
Query 259 ACTTGCTACTACTATCCATCCATCCATGAGAGAGAAATTTTTTGTGATTCAAAGTTTTGA 318
|||||| | || |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 237 ACTTGC--C-AC-ATCCAT--------GAGAGAGAA-TTTTTC-TGATTCAAAGTTTTGA 282
Query 319 TTTTTA 324
||||||
Sbjct 283 TTTTTA 288
> Ahg937784 jgi|Araly1|937784|scaffold_501975.1
Length=1457
Score = 2401 bits (1300), Expect = 0.0
Identities = 1408/1460 (96%), Gaps = 7/1460 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 425 ATCACAGATCTTCTTTTCATATGAAGAGATCTTTCCTTCTCTTGTATGTGCTCCTGGTAC 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATCACAGATCTTCTTTTCATATGAAGAGATCTTTCCTTCTCTTGTATGTGCTCCTGGTAC 60
Query 485 AGGCCTTCTATGGGGCTTGGTGTAGTGTTGGAGAAAGCCTGCATTGTGAATATTCCAATT 544
| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATGCCTTCTATGGTGCTTTGTGTAGTGTTGGAGGAAGCCTGCATTGTGAATATTCCAATT 120
Query 545 TAGCGAGTCTTCACCGGCCTCACAGCGTATCGATTACAGAGTTTGGAGCGGTTGGAGATG 604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TAGCGAGTCTTCACCGGCCTCACAGCGTATCGATTACAGAGTTTGGAGCGGTTGGAGATG 180
Query 605 GTGTGACTCTAAACACTAAAGCCTTTCAGAATGCTCTGTTCTACCTCAATTCTTTCTCTG 664
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 181 GTGTTACTCTAAACACTAAAGCCTTTCAGAATGCTTTGTTCTACCCCAATTCTTTCTCTG 240
Query 665 ATAAAGGCGGGGCCAAGCTTTTTGTTCCCGCTGGTCAGTGGCTTACCGGGAGTTTCGACC 724
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATAAAGGCGGTGCCAAGCTTTTTGTTCCCGCTGGTCAGTGGCTTACCGGGAGTTTCGACC 300
Query 725 TTATCAGTCACCTCACCTTATGGCTAGATAAAGGTGCAACGATTCTCGGGTCAACGAGCT 784
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTATCAGTCACCTCACCTTATGGCTAGATAGTGGTGCAACGATTCTCGGGTCAACGAGCT 360
Query 785 CAGAGAATTGGCCCGTGGTTGATCCATTACCATCATATGGACGAGGAAGAGAATTGCCCG 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CAGAGAATTGGCCCGTGGTTGATCCATTACCATCATATGGACGAGGAAGAGAATTGCCCG 420
Query 845 GTAGAAGACACAGAAGTCTTATATATGGTCAGAATCTCACAGATGTAGTCATAACAGGCG 904
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTAGAAGACACAGAAGTCTTATCTATGGTCAGAATCTCACAGATGTAGTCATAACAGGCG 480
Query 905 AGAACGGGACAATTGATGGTCAAGGAACTGTATGGTGGGATTGGTTTAGAAATGGAGAGC 964
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGAACGGGACAATTGATGGTCAAGGAAGTGTATGGTGGGATTGGTTTAGAAATGGAGAGC 540
Query 965 TTAACTATACAAGACCTCATCTTGTTGAGCTCATGAACTCTACTGGTCTGATCATCTCCA 1024
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TAAACTATACAAGACCTCATCTTGTTGAGCTCATGAACTCTACTGGTCTGATCATCTCCA 600
Query 1025 ACCTCACATTCTTGAATTCACCGTTTTGGAACATTCATCCTGTTTATTGCAGAGATGTTG 1084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ACCTCACATTCTTGAATTCACCGTTTTGGAACATTCATCCTGTTTATTGCAGAGATGTTG 660
Query 1085 TTGTAAAGAATCTCACAATTTTGGCTCCTCTTGAATCTCCAAATACAGATGGAGTTGATC 1144
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TTGTGAAGAATCTCACAATTTTGGCTCCTCTTGAATCTCCAAATACAGATGGAGTTGATC 720
Query 1145 CAGATTCATCAACTAATGTTTGCATAGAGGATTGTTACATAGTTACCGGGGATGATTTGG 1204
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 721 CAGACTCATCAACTAATGTTTGCATAGAGGATTGTTACATAGTTACCAGAGATGATTTGG 780
Query 1205 TATCGATAAAAAGCGGATGGGATGAGTATGGAATATCCTACGCAAGACCGAGCTCCAAGA 1264
| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TGTCGATAAAAACCGGATGGGATGAGTACGGAATATCCTACGCAAGACCGAGCTCCAAGA 840
Query 1265 TCAAGATTAATCGGTTAACAGGTCAAACTACTTCAAGCTCAGGAATAGCAATAGGAAGTG 1324
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 841 TCAAGATCAATCGGTTAACAGGTCAAACTACTTCAAGCTCAGGAATAGCAATCGGAAGTG 900
Query 1325 AAATGTCGGGAGGTGTATCCGAAATATACATTAAAGACTTACATTTGTTCAATTCGAATA 1384
||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 901 AAATGTCAGGAGGTGTGTCCGAAATATATATTAAAGACTTACATTTATTCAATTCGAATA 960
Query 1385 CTGGAATCAGAATCAAGACTTCTGCTGGAAGAGGCGGGTATGTTAGAAACGTTCACATCT 1444
| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCGGAATCAGAATCAAGACTTCTCCGGGAAGAGGCGGGTATGTTAGAAACGTTCACATCT 1020
Query 1445 TGAACGTGAAGCTCGATAATGTAAAGAAAGCGATTAGGTTCACCGGTAAGTACGGTGAAC 1504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1021 TGAACGTGAAGCTCGATAATGTAAAGAAAGCGATTAGATTCACGGGTAAGTACGGTGAAC 1080
Query 1505 ATCCTGATGAGAAATAC--GATCCCAAAGCACTCCCAGCTATAGAGAAAATCACCTTTGA 1562
|||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1081 ATCCTGAT-A-AAATTTTTGATCCCAAAGCACTCCCAGCTATCGAGAAAATCACCTTTGA 1138
Query 1563 GAATGTAAATGGCGATGGAATAGGTGTTGCGGGTCTTCTTGAAGGTATAGAAGGAGATGT 1622
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 GAATGTAAATGGTGATGGAATCGGTGTTGCGGGTCTACTTGAAGGTATAGAAGGAGATGA 1198
Query 1623 GTTTAAGAATATATGTTTCCTTAATGTTACTCTTAGAGTGAAGAAGAATTCGAAGAAATC 1682
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 GTTTAGGAATATATGTTTCCTTAACGTTACTCTTAGAGTGAAGAAGAATTCGAAGAAATC 1258
Query 1683 ACCATGGGAATGCTCGAATGTGAGAGGTTATTCACAGTGGGTTTCGCC-GGAAATTACTT 1741
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1259 TCCATGGGAATGCTCAAATGTTAGAGGTTATTCACAGTGGGTTTCGCCAGGAA-TTACTT 1317
Query 1742 GTGATTCTTTGAAAGAGAGTATATTCCCGGAACATGGATCTGATTGTTTCGGGTTATCGG 1801
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GTGATTCTTTGAAAGAGAGTATATTCCCGGAACATCGATCTGATTGTTTCGGGTTATCGG 1377
Query 1802 AAAATAATATGGAGATATCAAGTGGTTTAAGTAGATCACCATGGTTACTTTCTTGGT-AA 1860
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1378 AAAATAATCTGGAGATATCAAGTGGTTTAAGTAGATCACCATGGTTACTTTCTTGGTGAA 1437
Query 1861 GTTACTGTGAAGTTTTGAAC 1880
||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GTTACTGTGAAGTTTTGAAC 1457
> Ahg939301 jgi|Araly1|939301|scaffold_503492.1
Length=437
Score = 582 bits (315), Expect = 3e-165
Identities = 345/359 (96%), Gaps = 3/359 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 425 ATCACAGATCTTCTTTTCATATGAAGAGATCTTTCCTTCTCTTGTATGTGCTCCTGGTAC 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATCACAGATCTTCTTTTCATATGAAGAGATCTTTCCTTCTCTTGTATGTGCTCCTGGTAC 60
Query 485 AGGCCTTCTATGGGGCTTGGTGTAGT-GT-T-GGAGAAAGCCTGCATTGTGAATATTCCA 541
| ||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATGCCTTCTATGGTGCTTGGTGTAGTAGTGTTGGAGGAAGCCTGCATTGTGAATATTCCA 120
Query 542 ATTTAGCGAGTCTTCACCGGCCTCACAGCGTATCGATTACAGAGTTTGGAGCGGTTGGAG 601
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTTAGCGAGTCTTCACCGGCCTCACAGTGTATCGATTACAGAGTTTGGAGCGGTTGGAG 180
Query 602 ATGGTGTGACTCTAAACACTAAAGCCTTTCAGAATGCTCTGTTCTACCTCAATTCTTTCT 661
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATGGTGTGACTCTAAATACTAAAGCCTTTCAGAATGCTTTGTTCTACCTCAATTCTTTCT 240
Query 662 CTGATAAAGGCGGGGCCAAGCTTTTTGTTCCCGCTGGTCAGTGGCTTACCGGGAGTTTCG 721
|||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTGACAAAGGCGGTGCCAAGCTTTTTGTTCCTGCTGGTCAGTGGCTTACCGGGAGTTTCG 300
Query 722 ACCTTATCAGTCACCTCACCTTATGGCTAGATAAAGGTGCAACGATTCTCGGGTCAACG 780
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ACCTCATCAGTCACCTCACCTTATGGCTAGATAAAGGTGCAACGATTCTCGGGTCAACG 359
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 80598958420
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5