BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G62360.1
Length=4026
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486740 jgi|Araly1|486740|fgenesh2_kg.5__2732__AT3G62360.1 6115 0.0
> Ahg486740 jgi|Araly1|486740|fgenesh2_kg.5__2732__AT3G62360.1
Length=3801
Score = 6115 bits (3311), Expect = 0.0
Identities = 3661/3828 (96%), Gaps = 31/3828 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCGGTCCGATATCTTGGATCCGTGCTCCATTGACGAACAATAATCATTCTTCTTTTTCT 60
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || || | | |||
Sbjct 1 ATCGGTCCGATATTTTGGATCCGTGCTCCATTGACGAAC-A-AA-CA-AC-AC----TCT 51
Query 61 TAAGTTCAACCATTTTAGCTCCTTCACTGGAGCTTCACGTCGGGTACAATGGCGGCCAGT 120
| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 52 T--CTT------TTTTAGCTCCTTCACCGGAGCTTCACATCGGGAACAATGGCGGCCAGT 103
Query 121 AGGAAGATTTGTCATTCTCTGATCGTTTTCCTCATAGCGATTTCTACAGTCTACGGTGTT 180
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 104 AGGAAGATTTGTCATTCTCTGATCGTCTTCCTTATAGCGATTTCTACAGTTTACGGTGTT 163
Query 181 TCCGCGGATTCGATAAAAGGCTGCGGTGGTTTTGTCGAGGCGAGTTCGTCTTTGGTCAGG 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 TCCGCGGATTCGATAAAAGGCTGCGGTGGTTTTGTCGAGGCGAGTTCGTCTTTGGTCAGC 223
Query 241 TCTCGGAAAGGATCCGATGGGAAACTGGATTTTTCTCATATCACAGTTGAGCTTCAAACA 300
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 TCTCGGAAAGGATCCGATGGGAAACTGGATTATTCTCATATCACAGTTGAGCTTCAAACA 283
Query 301 GTAGATGGATTGGTAAAAGACAGTACACAGTGTGCCCCAAATGGTTACTATTTCATCCCA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 GTAGATGGATTGGTAAAAGACAGTACACAGTGTGCCCCAAATGGTTACTATTTCATCCCA 343
Query 361 GTATATGACAAGGGCTCATTCATTCTCAAGATAAATGGACCTGACGGATGGTCATGGAAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 344 GTATATGACAAGGGCTCATTCATTCTCAAGATAAATGGACCAGAGGGATGGTCATGGAAT 403
Query 421 CCAGATAAGGTAACTGTTGTTGTTGACGACTCTAGTTGCAACAACAATGATGATATTAAC 480
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 404 CCAGATAAGGTTACTGTCGTTGTTGACGACTCTAGTTGCAACAACAATGAGGATATTAAC 463
Query 481 TTCCACTTCACGGGTTTTACATTATCCGGTAAAGT-CTTGGGAGCTGTTGGTGGGGAGAG 539
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 464 TTCCGCTTCACGGGTTTTACATTATCCGGTAAAGTCCTT-GGAGCTGTTGGTGGGGAGAG 522
Query 540 TTGTCTGATTAAGAATGGAGGCCCAGCAGATGTCAATGTTGAATTGTTGTCTTCTGATGG 599
|||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 523 TTGTGTGATTAAGAATGGAGGTCCAGCTGATGTCAATGTTGAATTGTTGTCTTCTGAT-G 581
Query 600 ATCAGAAGATCCTGTCGCTTCTGTTCTCACATCGTCAGATGGGAGCTACTTATTCAAGAA 659
| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 ----G-AGATCCCGTTGCTTCTGTTCTCACATCGTCAGATGGGAGCTACTTATTCAAGAA 636
Query 660 TATTATTCCAGGAACATACAATATCCGTGCATCCCATCCAGAGCTGCAAGTTGAAGTTCG 719
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 637 TATTATTCCAGGAAAATACAATATCCGTGCATCCCATCCAGAGCTGCAGGTTGAAGTTCG 696
Query 720 CGGTTCAACAGAGGTGGAACTTGGATTTGCAAATGGCATGGTTGATGACATATTCTTCGT 779
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 697 CGGTTCAATAGAGGTGGAACTTGGATTTGCAAATGGCATGGTGGATGACATATTCTTCGT 756
Query 780 CCTTGGTTATGATCTTAAGGGGTCGGTTGTTGCTCAGGGGAATCCAATCCTGGGTGTCCA 839
|| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 757 CCGTGGTTATGATCTCAAGGGGTCTGTTGTTGCTCAGGGAAATCCAATCCTGGGTGTTCA 816
Query 840 TATATATTTGCATTCAGATGATGTTTCCATGGTAGATTGTCCCCAAGGATCTGGTGACGC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 817 TATATATTTGCATTCAGATGATGTTTCCATGGTAGATTGCCCCCAAGGATTTGGTGACGC 876
Query 900 TGCTGGAGAAAGGAAATCTCTTTGCCATGCTGTATCCGATGCAGAAGGAATTTTCAGTTT 959
||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 877 TGCTGGAGAAAGGAAGCCTCTCTGCCATGCTGTATCTGATGCGGAAGGAATTTTCAGTTT 936
Query 960 CAAGTCCATCCCTTGTGGAAAATACGAATTGGTGCCGCATTATAAGGGTGAGAATACGGT 1019
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 CAAGTCCATCCCTTGTGGAAAATACGAATTGGTGCCACATTATAAGGGTGAGAATACGGT 996
Query 1020 CTTTGATGTTTCACCTCCTGTTATGCCTGTATCTGTAGAGCATCAACATGTCACTGTTCC 1079
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 997 CTTTGATGTTTCACCTCCTGTTATGCCTGTTTCTGTAGAGCATCAACATGTCACCGTTCC 1056
Query 1080 CCAAAAATTTCAGGTAACAGGATTCTCCATTGGGGGTCGCGTAGTTGACGGTAATTCAGT 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 CCAAAAATTTCAGGTAACAGGATTCTCCATTGGGGGTCGTGTAGTTGACGGTAATTCAGT 1116
Query 1140 GGGAGTTGAGGGCGTTAAAATCTTAGTAGATGGTAGTCTAAGATCTGTCACAGACAAGGA 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1117 GGGAGTTGAGGGCGTTAAAATCTTAGTAGATGGTAGTCTAAGATCTGTCACGGACAAGGA 1176
Query 1200 AGGCTATTACAAGCTTGACCAGCCTGCTAAATTGGTTGTTACTCAACCTCTCCTAGTGAA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 AGGCTATTACAAGCTTGACCAGCCTGCTAAATTAGTTGTTACTCAACCTCTCCTAGTGAA 1236
Query 1260 TTTTTTGAGGCTTCTAGAGTCTAGAGTAAAGAATATGGCTAGATTTCTGAAGGTTACCTC 1319
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1237 TTTTTGGAGGCTTTTAGAGTCTAGAGTAAAGAATATGGCTAGATTTCTGAAGGTTACGTC 1296
Query 1320 AAACCAGTATACAATTGATGCAGTCAAGGAGCATTACAAGTTCGACAAACTGAAGAAGTT 1379
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 AAATCAGTATACAATTGATGCAGTCAAGGAGCATTACAAGTTCGACAAACTGAAGAAGTT 1356
Query 1380 CATGGTTTTACCAAATATGGCTTCACTTCCAGACATCAATGCTGTATCCTATGATATCTG 1439
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 1357 CATGGTTTTACCAAATATGGCTTCACTTCCAGACATCAGTGCTGTATCCTATGAGATCTG 1416
Query 1440 TGGTGTGGTGCGAATGTTTGGTTCTCGTCACAAAGCAAAGGTAGCTTTGACTCATGGACC 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417 TGGTGTGGTGCGAATGTTTGGTTCTCGTCACAAAGCAAAGGTAGCTTTGACTCATGGACC 1476
Query 1500 CACAAATGTCAAACCACAAATGAAGCTAACAGATGAGACCGGAGCTTTCTGCTTTGAGGT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1477 CACAAATGTCAAACCACAAATGAAGCTAACAGATGAGACCGGAACTTTCTGCTTTGAGGT 1536
Query 1560 TCCACCAGGCGAATATAGGCTGTCTGCTTTGGCTGCTACACCAAAGGGTGCTTCTGAGCT 1619
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537 TCCACCAGGCGAATATAGGCTGTCAGCTTTGGCTGCTACACCAAAGGGTGCTTCTGAGCT 1596
Query 1620 TCTGTTTTTGCCAGCTTATGTT-GATGTTGCCGTTAAAAGTCCTTTGTTGAACATAGAAT 1678
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1597 TCTGTTTTTGCCAGCTTAT-TTGGATGTTGCCGTTAAAAGCCCATTGTTGAACATAGAAT 1655
Query 1679 TCTCTCAGGCCAGAGTCAATGTGCATGGTTCTGTTACTTGCAAGGAGAAATGTGGTCCTT 1738
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1656 TCTCTCAGGCCAAAGTCAATGTGCATGGTTCTGTTACTTGCAAGGAGAAATGTGGTCCGT 1715
Query 1739 CTGTCTCAGTGGTGCTTGTGGGAGCTGCTGGTGATCGTGACAAGAAGACAGTTGTTTTAA 1798
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1716 CTGTGTCAGTGGTGCTTGTGGGAGCGGCTGGTGATCGTGACAAGAAGACTGTTGTTTTAA 1775
Query 1799 CCGACGAGAGCAGTCAATTTCTATTTTCAGACATATTGCCTGGAAAATATAGAGTTGAGG 1858
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 CCGACGAGAGCAGTCAATTTCTTTTTTCAGACATACTGCCTGGAAAATATAGAGTTGAGG 1835
Query 1859 TGAAAAGTATTTCACCGGAAGCCGCATCTGATGAAGACAGTTGGTGCTGGGACCGTAGCT 1918
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 TGAAAAGCATTTCACCGGAAGCCGCATCTGATGAAGACAGTTGGTGCTGGGACCGTAGCT 1895
Query 1919 CCATTGATGTGAATGTCGGAACTGAGGATATCAAAGGGATTGAATTTGTCCAGAAAGGTT 1978
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CCATTGATGTGAATGTCGAAACTGAGGATATCAAAGGGATTGAATTTGTCCAGAAAGGTT 1955
Query 1979 ACTGGATTAATATTATCTCCACTCATGAGGTGGACGCTAGAATCGCTCATCCTGATGGAT 2038
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1956 ACTGGATTAATATTATCTCCACCCATGAGGTGGACGCTAGAATCGCTCATCCTAATGGAT 2015
Query 2039 CGCCTACTAGTTTGAAAATCAAGAAAGGTTCACAGAAAATATGCATTGAGTCACCTGGAG 2098
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2016 CACCTACTAGTTTGAAAATCAAGAAAGGTTCGCAGAAAATATGCGTTGAGTCACCTGGAG 2075
Query 2099 GGCATGAGCTTCAGCTTTCTGACTCATGCATGTCCTTTGGGAGCAATTCAATAAAGATAG 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2076 GGCATGAGCTTCAGCTTTCTGACTCATGCATGTCCTTTGGGAGCAATTCAATAAAGATAG 2135
Query 2159 ATGTCTCAAATCCACAGCCTATTCATCTGAAAGCAGAGAAGTACCTCCTCAAAGGTCTGA 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136 ATGTCTCAAATCCACAGCCTATTCATCTGAAAGCAGAGAAGTACCTCCTCAAAGGTCTGA 2195
Query 2219 TAAATGTGGAGTCTAGTTCAACTATTGAGTCGGAATTGCAAGAGAATTTCATTGTTGACA 2278
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |
Sbjct 2196 TTAATGTGGAGTCTAGTTCAACTATTGAGTCTGAATTGCCAGAAAATTTCATTGTTGATA 2255
Query 2279 TTCAAGACAAGAAAGGGAATGTTATCAACACTATTGCTGCCAAACTTGCATCTGATGGAA 2338
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2256 TTCAAGACAAGAAAGGAAATGTTATCAACAGTATTACTGCCAAACTTGCATCTGATGGAA 2315
Query 2339 GTGGCGTTTATGAGTACTACACCTGGGCTAGTCTTGGTGAAAAGATTAGCTTTGTTCCTC 2398
|||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2316 GTGGGGTTTATGAGTACTATACCTGGGCAAATCTTGGTGAAAAGATTAGCTTTGTTCCTC 2375
Query 2399 AAGATTCTAGGGGTAATGTAGAGAAGAAGATGTTGTTTTACCCTAAAGAGATTCATGCTG 2458
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||
Sbjct 2376 GAGATTCTAGGGGTAATGTGGAGAAGAAGATTTTGTTTTATCCTAAAGTGCTTCATGCTG 2435
Query 2459 TAGTGTCAAAAGATGGATGTCAAGCTTCTGTTTCTCCATTTACTGGTCGGCTTGGTCTTT 2518
|||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436 TAGTGTCAAATGATGGATGCCAAGCTTCAGTTTCTCCATTTACTGGTCGGCTTGGTCTTT 2495
Query 2519 ACATACAAGGATCAGTCTCTCCTCCTCTTCCTGGTGTTAATATTAAGATTTTTGCGGCAA 2578
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||
Sbjct 2496 ACATAGAAGGATCAGTCTCTCCTCCTCTTCTTGGTGTTCATATTAAGGTTTCCGCTGCAA 2555
Query 2579 AGGACAGCCTTATTTCTTCACTTAAGAAAGGGGAAATAGCTATTGAAACAAGCACTTTAT 2638
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2556 AAGACAGCCTTATTTCTTCACTTAAGAAAGGTGAAGTAGCTATTGAAACAAGCACTTCAC 2615
Query 2639 CAGCTGGTTCATTTGTTGCTGGGCCTTTGTATGACGATATACCATATGCCACTGAAGCTT 2698
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||
Sbjct 2616 CAGCTGGTTCATTTGTTGCTGGGCCTTTGTATGATGATATACCATATGATACCGAGGCTT 2675
Query 2699 CAAAGCCTGGCTACCATATTAAAAGGTTAGGACCATATTCCTTCTCCTGCCAGAAGCTTG 2758
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2676 CAAAGGCTGGCTACCATATTAAAAGGCTAGGACCATATTCCTTCTCTTGCCAGAAGCTTG 2735
Query 2759 GTCAGATCTCTGTGCGTGTAAACTCAAAGGACAATGCTGAGACATCAATACCTCCACTGT 2818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2736 GTCAGATCTCTGTGCGTGTAAACTCAAAGGACAATGCCGAGACATCAATACCTCCGCTGT 2795
Query 2819 TGTTATCATTAAGTGGCGATCATGGTTACAGAAATAATTCCATATCTGGCGCTGGTGGAC 2878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2796 TGTTATCATTAAGTGGCGATCATGGTTACAGAAATAATTCCATATCTGGTGCTGGTGGAC 2855
Query 2879 TCTTTGTGTTTGATAGCTTATTCCCTGGAAATTTCTACTTGCGTCCCCTTCTTAAGGAAT 2938
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2856 TCTTTGTGTTTGATAGCTTATTCCCTGGAAATTTCTACTTGCGTCCCCTTCTGAAGGAAT 2915
Query 2939 ATTCTTTCAAACCTTCAACACTGGCTATAGAACTGAA-TTCTGGGGAATCCAGTGAAGCT 2997
||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2916 ATTCTTTCAAACCCTCAACACTGGCTATAGAACT-AAGTTCTGGGGAGTCCAGTGAAGCT 2974
Query 2998 GTCTTTGAGGCTACTCGTGTTGCCTACAGTGCAATGGGTAGAGTCGCTCTTCTATCGGGC 3057
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2975 GTCTTTGAGGCTACTCGTGTTGCCTACAGTGCAATGGGTAGAGTCGCTCTCCTATCGGGC 3034
Query 3058 CAGCCACAAGAAGGTGTTGCAATTGAAGCTCGCTCTGACTCCAAAGGATACTATGAGGAG 3117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CAGCCACAAGAAGGTGTTGCAATTGAAGCTCGCTCTGACTCCAAAGGATACTATGAGGAG 3094
Query 3118 ACTACAAGCGATATTAATGGAAATTATCGACTGAGAGGGTTACATCCAGATACAGCATAT 3177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3095 ACTACAAGCGATATTAATGGAAATTATCGACTGAGAGGGTTACATCCAGATGCAACATAT 3154
Query 3178 GTAATTAAAGTGTCGAAGAAAATTGGTTCAGCCAACAATCAAATTGAACGTGCATCTCCA 3237
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3155 GTAATTAAAGTGTCGAAGAAAATTGGTTCAGGCAACAATAAAATTGAACGTGCATCTCCA 3214
Query 3238 GAGTCGGTTTCTCTTCAGATTGGTTATGAAGATATCAATGGGCTCGACTTTTTGGTATTT 3297
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3215 GAGTCAGTTTCTCTTCAGATTGGTTATGAAGATATCAATGGGCTCGACTTTTTGGTATTT 3274
Query 3298 GAACAACCAGAAACGACCATATTGACATGCCATGTCGAAGGAAAACAAAACGAAGATCTA 3357
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3275 GAACAACCAGAAACGACCATATTGACGTGCCATGTCGAAGGAAAACAAAACGAAGATCTA 3334
Query 3358 AACTCGAATCTGCTAGTGGAGATCAAATCAGCCATTGATAAATCTAAGATAGAGAATGTC 3417
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3335 AACTCGAATCTGCTAGTGGAGATCAAATCAGCCATTGACAAATCTAAGATAGAGAATGTC 3394
Query 3418 TTTCCACTACCACTCTCCAACTTCTTCCAAGTAAAAGGCTTACCCAAAGGTAAGCACCTT 3477
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||
Sbjct 3395 TTTCCACTACCACTCTCCAACTTCTTCCAAGTAAAAGGTTTACCCAGAGGTAAACACCTT 3454
Query 3478 GTGCAGCTTAAATCCAGTCGTCCTTTGATCTCCCACAAAGTAGAATCAGAGATTATTGAA 3537
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3455 GTGCAGCTTAAATCCAGTCGTCCTCTAATCTCCCACAAAGTAGAATCAGAGATTATTGAA 3514
Query 3538 GTTGATTTCGAGACCAATGCCCAAATCCATATTGGTCCACTTCGATACAGCATTGTGGCA 3597
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3515 GTTGATTTCGAGACAAATGCCCAAATCCATATCGGTCCACTTCGATACAGCATCGTGGCA 3574
Query 3598 GATCATCAGAGTCAGGAAGTGACACCTGCAGCTATATTGCCACTGGTTATTGGAGTTTCG 3657
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3575 GACCATCAGAGTCAGGAAGTGACACCTGCAGCTATATTGCCACTGGTTATTGGAGTTTCG 3634
Query 3658 GCAATTGCTCTATTCCTCAGCATCCCCAGGTTGAAAGACATCTACCAAGCCACGGTTGGA 3717
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3635 GCAATTGCTCTGTTCCTCAGCATCCCCAGGTTGAAAGACATCTACCAAGCCACGGTTGGG 3694
Query 3718 ATTTCGTCTCCCGGGTTCACTACATCTGCCAAGAGAGAACCTCGAAAAGCTGTTGCTAGA 3777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3695 ATTTCGTCTCCCGGGTTCACTACATCTGCCAAGAGAGAACCTCGAAAAGCTATTGCTAGA 3754
Query 3778 AAGAAGACGTTCTGAAGAATTTATTCATCTTCGGTCTTCttttt-ttt 3824
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 3755 AAGAAGACGTTCTGAAGAATTTATTCATCTTCGGTCTT-TTTTTGTTT 3801
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 152192234427
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5