BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G63340.2
Length=3953
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486842 jgi|Araly1|486842|fgenesh2_kg.5__2834__AT3G63330.1 2043 0.0
Ahg899328 jgi|Araly1|899328|Al_scaffold_0005_3294 1238 0.0
Ahg486840 jgi|Araly1|486840|fgenesh2_kg.5__2832__AT3G63320.1 730 0.0
Ahg922936 jgi|Araly1|922936|scaffold_104217.1 202 2e-50
> Ahg486842 jgi|Araly1|486842|fgenesh2_kg.5__2834__AT3G63330.1
Length=1400
Score = 2043 bits (1106), Expect = 0.0
Identities = 1236/1298 (95%), Gaps = 11/1298 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2376 TAACGCTACTAGTTCGATCAATGAAGATGAGAATACATCAAAAAATGGTGTTCATAATGA 2435
||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1 TAACGCTACTAGTTCGATCGATGAAGATAAAAATACATCGAAAAATGGTGTTCATTATGA 60
Query 2436 TACTGATGGTCCTAATAACTCCTTCATTTTGAAGCGGATAATGGTCGAGAGAGGACCAAC 2495
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 61 TGCTGATGGTCCTAATAACTCCTTCATTTTGAAGCGGATAATGGTAGAGAGAGGACCAAC 120
Query 2496 CGTCTATTTAAGTGGTCTAAGGGAGAAGCATTTTGGTGAACTGTTTCTAAATGCATATAA 2555
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TGTTTATTTAAGTGGTCTAAGGGAGAAGCATTTTGGTGAACTGTTTCTAAATGCATATAA 180
Query 2556 TGTAAGTGAGAGTTCTTCTGCAACGCAAGCGTCAAGTTCTCAAGCAGCGTCATCAGAATT 2615
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 181 TATAAGTGAGAGTTCTTCTGCAACGCAAACGTCAAGTTCTCAACCAGCGTCATCAGGATT 240
Query 2616 GGGTCTCTCTGAAGAGGGTTTGAAACATATAGCTAGATACATAGAGTATTTTGAATCTCG 2675
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GGGTCTCTCTGAAGAGGGTTTGAAACATATTGCTAGATACATAGAGTATTTTGAATCTCG 300
Query 2676 ATATAATGACATATGGCTTGTGTTTCACCACGAGGGTGTATCTTTATCAAAGCTGATGTA 2735
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATATAATGACATATGGCTTGTGTTTCACCACGAGGGTGCATCTTTATCAAAGCTGATGTA 360
Query 2736 CACTGTGGAAGAAGCAGAGATTAG--CT-C---TGAAAAGGCTGAAGAGGCAAGTCACGG 2789
||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 361 CACTGCGGAAGAAGCAGAGAATAGCTCTGCTGGTGAAAAGGCTGAAGAAGCAAGTCACGG 420
Query 2790 GCAGATACTTCGTCCGTCAAAGTGGTGGACCTGGCTGAAGACGACAGAATCAGGAAAAGA 2849
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GCAGATACTTCGTCCGTCGAAGTGGTGGACCTGGTTGAAGACGACAGAATCAGGAAAAGA 480
Query 2850 AGAAATGCGGAGAATAATATGGCAATTGTTGCTAGGTTTAAAGGCATGCCATGATCGCAA 2909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGAAATGCGGAGAATAATATGGCAATTGTTGCTAGGTCTAAAGGCATGCCATGATCGCAA 540
Query 2910 TATTACTCACAGAGATATAAAACCCGAGAATATGGTGATATGCCTTGAAGACATCAAGTC 2969
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 541 CATTACTCACAGAGATATAAAACCCGAGAATATGGTGATATGCATTGAAGACATCAAGTC 600
Query 2970 AGGCAGATGCTTAAAGGGTGTACCAAATGGGGATCAAAACTTCAAAACTAATATGCGCAT 3029
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 601 CGGAAGATGCTTAAAGGGTGTACCAAATGGAGATCATAACTTCAAAACTAAAATGCGCAT 660
Query 3030 CATCGACTTTGGCAGTGCACTTGATGAGTATACAATAAAACACTTATATGGGTCAACAGG 3089
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 661 CATCGACTTTGGCAGTGCACTTGATGAGTATACAATGAAACATTTATATGGGTCAACAGG 720
Query 3090 ACCGTCAAGAGCAGAACAAACTCATGATTATGCACCACCCGAAGCCATTCTGAACAGCAG 3149
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 721 TCCATCAAGAGCAGAACAAACTCATGATTATGCACCACCCGAAGCCATTATGAACAGTAG 780
Query 3150 CTGGCACCATGGGCCAACCAGTTTGACATTGAAATACGACATGTGGAGTGTTGGGGTTGT 3209
|||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTGGCACCATGGACCGACCAGTTTGGCACTGAAATACGACATGTGGAGTGTTGGGGTTGT 840
Query 3210 GATGTTAGAGATGATTTTAGGATCACCCAATGTTTTTGAGATTAGTTCTGTTACACGTGC 3269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GATGTTAGAGATGATTTTAGGATCACCCAATGTTTTTGAGATTAGTTCTGTTACACGTGC 900
Query 3270 CCTTTTGGATCAACATATCAGAGGTTGGAGTGAAAACTTTAAAGAGCTTGCATACAAGCT 3329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CCTTTTGGATCAACATATCAGAGGTTGGAGTGAAAACTTTAAAGAGCTTGCATACAAGCT 960
Query 3330 TCGATCC-TTAATGGAGATGTGCATCCTAATCCCAGGTAGCTCTTTAAAACATGGTGGCG 3388
||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCGATCCCTTA-TGGAGATGTGCATCTTAATCCCAGGTAGTTCTTTAAAACATGGTGGCG 1019
Query 3389 CCAGCTCAAAGCAGGGTGGAATTTCACTTGCGTCATGGAAATGCTCTGAAGAATTTTTTG 3448
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 CCAGCTCAAAGCAGGGTGGGATTTCACTTGCGTCATGGAAATGCTCTGAAGAATTTTTTG 1079
Query 3449 CAGAACAGATAAAGAGCAGAGACCCACTGAAGATTGGGTTTCCAAATGTTTGGGCATTAA 3508
||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1080 CAGAACAGATAAAAAGTAGAGACCCTCTGAAGATTGGGTTTCCAAATGTTTGGGCGTTAA 1139
Query 3509 GGTTGGTGAGGGGTCTATTACAATGGTACCCTGAGGACAGAGTAACCGTAGATGAGGCTC 3568
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 GGTTGGTGAGGGCTCTATTACAATGGTACCCTGAGGACAGAGTAACCGTAGATGAGGCTC 1199
Query 3569 TGCAGCACCCTTATTTCCAGCCCCCTCCCAGCTCCTAAGAGTAGAGAAGA--A-GATGGA 3625
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||
Sbjct 1200 TGCAGCACCCTTATTTCCAGCCCTCTCCCAACTCCTAAGTGTAGAGAAGAGTAAGATGGA 1259
Query 3626 TTATGTAGGAACAAGGTTAAAACGAGCAAGGGAAGATT 3663
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TTATGTAGGAACAAGGTTGGAACGAGCAAGGGAAGATT 1297
> Ahg899328 jgi|Araly1|899328|Al_scaffold_0005_3294
Length=1569
Score = 1238 bits (670), Expect = 0.0
Identities = 752/791 (95%), Gaps = 7/791 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1290 TACTTTGGTGAAGTTGTACAGAGAGCGAAGACGCAATCGGGGCTCTTCACCATCAAGGTT 1349
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 786 TACTTTGGTGAAGTTGTACAGAGAGCGAAGGCGCAATCGAGGCTCTTCACCATCAAGGTT 845
Query 1350 CTCTGACTTTAAACTGGAACATGGCAATGGACTACTGCGTTTCATTGCCAAAGAATTGAC 1409
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 846 CTCTGACTTTAAACTGGAACATGGCAATGGACTACTGCATTTCATTGCCAAAGAATTGAC 905
Query 1410 AAAGGACCATCACCCAAATAGAGAGGATGAAAAGATTCGTGTTGAAGCTGCAGGAGGTTA 1469
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 906 AAAGGACCATCACCCAAATAGGGAGGATGAAAAGATTCGTGTTGAAGCTGCAGGAGGTTA 965
Query 1470 TGTCACTGAGTGGGCCGGTGTGCCACGAGTGAATGGCCAGCTGACTGTCTCCCGTGCAAT 1529
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 966 TGTCACAGAGTGGGCCGGTGTGCCACGAGTGAATGGCCAGCTGACTGTCTCCCGTTCAAT 1025
Query 1530 TGGTGACCTTACTTATAGAAGTTATGGTGTCATCTCTGCACCTGAGGTGATGGACTGGCA 1589
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 TGGTGACCTTACTTATAAAAGTTACGGTGTCATCTCTGCACCTGAGGTGATGGACTGGCA 1085
Query 1590 GCCTCTAGTGGCTAATGACAGCTTCCTGGTAGTGTCATCTGATGGCATCTTTGAGAAGTT 1649
||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1086 GCCTCTACTGGCTAATGACAGCTACTTGGTAGTATCATCGGATGGCATCTTTGAGAAGTT 1145
Query 1650 GGAGGTGCAAGAAGTATGTGATCTTTTGTGGGAAGTAAACAATCAAACTAGCTCTGGAGC 1709
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 GGAGGTGCAAGAAGTATGTGATCGTCTGTGGGAAGTAAACAATCAAACTAGCTCTGGAGC 1205
Query 1710 AGGAGTGCCTTCATACTGCTCAATTTCTTTGGCAGACTGCTTGGTTAATACTGCCTTTGA 1769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 AGGAGTGCCTTCATACTGCTCAATTTCTTTGGCAGACTGCTTGGTTAATACTGCCTTTGA 1265
Query 1770 GAAGGGAAGCATGGACAATATGGCTGCTGTTGTTGTCCCTCTAAAATCGAATCTAGTTAC 1829
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1266 GAAGGGAAGTATGGATAATATGGCTGCTGTTGTTGTTCCTCTAAAATCGAATCTAGTTAC 1325
Query 1830 TCAGCTCCAACGGAAGGAGCAGAGTATGAATGACAACAAAGACAAGATTGCTTCAGCACT 1889
||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1326 GCAGCTCCAATGGAAAGAGCAGAGCATGAATGACAACAAAGATAAGATTGCTTCAGCACT 1385
Query 1890 ACCCTGTAGCAACTGTACGCTTCCACCAGTGCCTAATGATATAAATTTGGGTCCATTGCA 1949
|||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 ACCCACTAACAACTGTGCGCTTCCAT---TGCCTAATGATATAAATTTGGGTCCATTGCA 1442
Query 1950 ATTGAAACAGGCTCAGCCACTTGGAACCATGTTTAACAGGTTATTGGTAGAGGTTAAAAA 2009
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||
Sbjct 1443 ATTGAAACAGGCTCAACCACTTGCAACCATGTTTAACAGGTTATTG--A-AG-TTAAAAA 1498
Query 2010 CGGAAGTTTTTGCCGCTTTTATATGTCAGAGAACCTTATTGGGGCATCTCAAGGGCAAAT 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1499 CGGAAGTTTTTGCCGCTTTTATATGTCAGAGAACCTTATTGGGGCGTCTCAAGGGCAAAT 1558
Query 2070 GAACAATTTGA 2080
| |||||||||
Sbjct 1559 GGACAATTTGA 1569
Score = 1112 bits (602), Expect = 0.0
Identities = 721/777 (93%), Gaps = 14/777 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 416 GGCTCCTTATTATATTTTTCGTCTTCTTCTTCCTGGTGATTAACTGTCGAGGGGAATCTT 475
|||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 23 GGCTCCTTATTACATCTTTCGTCCTCTTCTTATTGGCGATTAACTGTCTAGGGGAATCTT 82
Query 476 CTACGTGTTTGGCGGTTTACAAACAAGGCGGAGCTCCAGCTGTGTTTCAATCACCCAAAT 535
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 83 CGACGTGTTTGGCCGTTTACAAACAAGGCGGAGCTCCAGCCGTGTTTCAATCACCCAAAT 142
Query 536 GCCCTCGTTGGATTCTCCAGAATTGGGGTTCTCCTACTCATAGTGGAGCTGGTCGTTGCC 595
|||||||||||| |||||| |||||||| | | | | |||||||||||||||||||
Sbjct 143 GCCCTCGTTGGAATCTCCACAATTGGGG---T-C-A---A-AGTGGAGCTGGTCGTTGCC 193
Query 596 ATACCGCAGCTATTCA-AGGTCGGAGGAACTACCAAGAGGATCGTCTTCTCTGTGCTCTT 654
|||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 194 ATACTGCAGCTATT-AGAGGTCGGAGGAACTACCAAGAGGATCGTCTCCTCTGTGCTCTT 252
Query 655 GATCTTCGCATTCCATTTCCCGGCAAGACTGGAACACCAAAGGATGTTTTGGTTGGAATT 714
|||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 GATCTTCGCATTCCGTTTCCCGGCAAGACTGG-A-A-CAAAGGATGTTTTGGTTGGAATT 309
Query 715 GCAGCAGTCTTTGACGGACATAATGGTGCAGAAGCCAGTGACATGGCTTCAAAACTTTTA 774
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 310 GCAGCAGTCTTTGATGGACATAATGGTGCAGAAGCCAGTGAAATGGCTTCAAAACTTTTA 369
Query 775 TTGGATTACTTTGCTTTGCATATCAACTTTCTCTTGGACGCTACATTTTCTGCTATGACG 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 370 TTGGATTACTTTGCTTTGCATATCAACTTTCTCTTGGACGCAACTTTTTCTGCTATGACG 429
Query 835 AGGAAGTTGATTGGACGATTCCCAACTAAAGGAGACCACAGTGTCATTTTGCACGGCGTA 894
|||||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||
Sbjct 430 AGGAAGATGATTGGACGACTACCAACTAAAGGGGAGCACCGTGTTATTTTGCATGGCGTA 489
Query 895 AGTCGGGATGAAATCATGCATCTATACAACCTGGATTTTCAAATGCAGTTTCGAGACTCA 954
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 AGTCAGGATGAAATCAGGCATCTATACAACCTGGATTTTCAAATGCAGTTTCGAGACTCA 549
Query 955 TTGCCACTTCATTTTGATGATTCTCTCCCCTTGGATATTATGAAGGAAGCATTGCTGAGA 1014
||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 TTGCCACTTAATTTTGATGATTCTCTTCACTTGGATATTATGAAGGAAGCATTGCTGAGA 609
Query 1015 GCGATCCATGACATTGATGTCACATTTACTAAGGAAGCATCAAACAGAAAGCTGAATTCA 1074
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct 610 GCAATCCATGACATTGATGCCACATTTACTAAGGAAGCATCAACCCGAAAGCTTAATTCA 669
Query 1075 GGTTCAACGGCTACAATTGCACTTATTGCAGATGGTCAACTAATGGTTGCTAGTATCGGT 1134
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 GGTTCAACGGCTACAATTGCACTTATAGCTGATGGTCAACTAATGGTTGCTAGTATCGGT 729
Query 1135 GACTCAAAAGCACTTCTCTGTTCTGAAAAATTTGAGACTCTGGAAGAAGCTAGAGGT 1191
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 730 GACTCAAAGGCACTTCTGTGTTCTGAAAAATTTGAGACTCTCGAAGAAGCTAGAGGT 786
> Ahg486840 jgi|Araly1|486840|fgenesh2_kg.5__2832__AT3G63320.1
Length=1263
Score = 730 bits (395), Expect = 0.0
Identities = 494/542 (91%), Gaps = 6/542 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1287 AGCTACTTTGGTGAAGTTGTACAGAGAGCG-AAGACGCAATCGGGGCTCTTCAC-CATCA 1344
||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | |||||
Sbjct 618 AGCTACTTTAATAAAGTTTTACAGAGAGCGTAAG-CGCAATCGAGACTCTTC-CTCATCA 675
Query 1345 AGGTTCTCTGACTTTAAACTGGAACATGGCAATGGACTAC-TGCGTTTCATTGCCAAAGA 1403
||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||
Sbjct 676 AGGTTCTCTGATTTTAAGCTGGAACATCGCAATGGACT-CATACGTTTTATTGCCAAAGA 734
Query 1404 ATTGACAAAGGACCATCACCCAAATAGAGAGGATGAAAAGATTCGTGTTGAAGCTGCAGG 1463
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||
Sbjct 735 ATTGACTAAGGACCATCACCCAAATAGAGAGGATGAAATGCTCCGCGTTAAAGCTGCAGG 794
Query 1464 AGGTTATGTCACTGAGTGGGCCGGTGTGCCACGAGTGAATGGCCAGCTGACTGTCTCCCG 1523
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 795 AGGTTATGTCACTGAGTGGGCCGGTGTGCCACGGGTGAATGGTCAGCTGGCTGTCTCCCG 854
Query 1524 TGCAATTGGTGACCTTACTTATAGAAGTTATGGTGTCATCTCTGCACCTGAGGTGATGGA 1583
| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 TTCAATTGGTGACCTTACTTATAAAAGTTACGGTGTCATCTCTGCACCTGAGGTGATGGA 914
Query 1584 CTGGCAGCCTCTAGTGGCTAATGACAGCTTCCTGGTAGTGTCATCTGATGGCATCTTTGA 1643
||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 CTGGCAGCCTCTACTGGCTAATGACAGCTACTTGGTAGTGTCATCTGATGGCATCTTTGA 974
Query 1644 GAAGTTGGAGGTGCAAGAAGTATGTGATCTTTTGTGGGAAGTAAACAATCAAACTAGCTC 1703
||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 975 AAAGTTGGAGGTGCAAGATGTATGTGATCGTCTGTGGGAAGTAAAGAATCAAACTAGCTT 1034
Query 1704 TGGAGCAGGAGTGCCTTCATACTGCTCAATTTCTTTGGCAGACTGCTTGGTTAATACTGC 1763
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1035 TGGAGCAGGAGTGCCTTCATATTGCTCAGTTTCTTTGGCAGAATGCTTGGTTAATACTGC 1094
Query 1764 CTTTGAGAAGGGAAGCATGGACAATATGGCTGCTGTTGTTGTCCCTCTAAAATCGAATCT 1823
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||
Sbjct 1095 CTTTGAGAAGGGAAGTATGGATAATATGGCTGCAGTCGTGGTTCCTCTAAAATCCAATCT 1154
Query 1824 AG 1825
||
Sbjct 1155 AG 1156
> Ahg922936 jgi|Araly1|922936|scaffold_104217.1
Length=487
Score = 202 bits (109), Expect = 2e-50
Identities = 111/112 (99%), Gaps = 0/112 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3183 ATACGACATGTGGAGTGTTGGGGTTGTGATGTTAGAGATGATTTTAGGATCACCCAATGT 3242
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 ATACGACATGTGGGGTGTTGGGGTTGTGATGTTAGAGATGATTTTAGGATCACCCAATGT 289
Query 3243 TTTTGAGATTAGTTCTGTTACACGTGCCCTTTTGGATCAACATATCAGAGGT 3294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 TTTTGAGATTAGTTCTGTTACACGTGCCCTTTTGGATCAACATATCAGAGGT 341
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 149414031598
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5