BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G63460.1
Length=3783
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg939446 jgi|Araly1|939446|scaffold_503637.1 5716 0.0
Ahg472106 jgi|Araly1|472106|fgenesh2_kg.1__2060__AT1G18830.1 399 6e-110
> Ahg939446 jgi|Araly1|939446|scaffold_503637.1
Length=3358
Score = 5716 bits (3095), Expect = 0.0
Identities = 3264/3348 (97%), Gaps = 2/3348 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 93 CCGATTCCAATATGGCTTGCATCAAGGGGGTGGGCCGATCCGCCTCCGTTGCCCTGGCTC 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CCGATTCCAATATGGCTTGCATCAAGGGGGTGGGCAGATCCGCCTCCGTTGCCCTGGCTC 71
Query 153 CCGATGCTCCTTACATGGCCGCCGGAACCATGGCCGGAGCCGTCGATCTCTCCTTTAGCT 212
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 CCGACGCTCCTTACATGGCCGCCGGAACCATGGCCGGAGCCGTCGATCTCTCCTTTAGCT 131
Query 213 CTTCCGCCAATCTCGAGATCTTTAAGCTCGACTTTCAGTCTGACGATCGCGACTTGCCTC 272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 132 CTTCCGCCAATCTCGAGATCTTTAAGCTCGACTTTCAGTCTGACGATCGCGATTTGCCTC 191
Query 273 TCGTCGGGGAAATCCCCAGCTCCGAGCGGTTCAATAGACTCGCCTGGGGAAGAAACGGAT 332
|||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 TCGTTGGGGAAAGCCCCAGCTCCGAGCGCTTCCATAGACTCGCCTGGGGAAGAAACGGAT 251
Query 333 CTGGATCCGAGGAATTCGCCCTTGGTCTTATTGCCGGCGGCCTTGTCGACGGAAATATAG 392
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CTGGATCCGAGGAATTCTCCCTCGGTCTTATTGCCGGCGGCCTTGTCGACGGAAATATAG 311
Query 393 ATCTATGGAATCCTCTTTCTTTGATCGGTTCCCAGCCCAGCGAAAATGCACTCGTTGGCC 452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 312 ATCTATGGAATCCTCTTTCTTTGATCGGTTCCCAGCCCAGTGAAAATGCACTCGTTGGCC 371
Query 453 ATCTTTCAGTTCACAAAGGCCCTGTTCGTGGTCTTGAGTTTAATGCTATCAGCTCAAATC 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 372 ATCTTTCAGTTCACAAAGGCCCTGTTCGTGGTCTTGAGTTTAATGCTATCAACCCAAATC 431
Query 513 TACTTGCTTCTGGGGCTGATGATGGTGAAATTTGCATTTGGGACTTATTAAAGCCTTCAG 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 TACTTGCTTCTGGGGCTGATGATGGTGAAATTTGCATTTGGGACTTATTAAAGCCTTCAG 491
Query 573 AGCCTTCTCATTTTCCACTGCTCAAGGGTAGTGGTTCTGCTACGCAAGGTGAAATCTCCT 632
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 AGCCTTCTCATTTTCCACTTCTCAAGGGTAGTGGTTCTGCTACGCAAGGTGAAATCTCCT 551
Query 633 TTATATCGTGGAATAGAAAAGTTCAACAGATATTAGCTTCTACCTCATACAATGGGACTA 692
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 TTATATCGTGGAATCGAAAAGTTCAACAGATATTAGCTTCTACCTCATACAATGGGACTA 611
Query 693 CTGTAATTTGGGACTTGAGGAAGCAGAAGCCTATAATTAACTTTGCAGATTCAGTTCGAC 752
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 612 CTGTAATATGGGACTTGAGGAAGCAGAAGCCTATAATTAACTTTGCAGATTCAGTTCGAC 671
Query 753 GCCGGTGCTCTGTTTTACAGTGGAACCCTAACGTTACTACTCAGATAATGGTTGCATCAG 812
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672 GCCGGTGCTCTGTTTTACAGTGGAACCCTAACATTACTACTCAGATAATGGTTGCATCAG 731
Query 813 ATGACGACAGTTCACCTACTTTGAAGCTCTGGGACATGAGGAATATAATGTCACCTGTGC 872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 732 ATGACGACAGTTCACCTACTTTGAAGCTCTGGGACATGAGGAATATATTGTCACCTGTGC 791
Query 873 GCGAGTTTACTGGACACCAAAGAGGGGTAATTGCAATGGAGTGGTGCCCAAGTGACAGCT 932
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 792 GCGAGTTTACTGGACACCAAAGAGGGGTGATTGCAATGGAGTGGTGTCCAAGTGACAGCT 851
Query 933 CATATCTTCTCACCTGTGCTAAGGACAACCGAACGATTTGCTGGGATACAAATACAGCAG 992
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 852 CATATCTTCTTACTTGTGCTAAGGACAACCGAACGATTTGCTGGGACACAAATACAGCAG 911
Query 993 AGATTGTGGCTGAGTTACCTGCTGGCAACAATTGGAATTTTGATGTTCATTGGTACCCAA 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 912 AGATTGTGGCTGAGTTACCTGCTGGCAACAATTGGAATTTTGATGTTCATTGGTACCCAA 971
Query 1053 AGATACCTGGAGTTATATCAGCATCTTCATTTGATGGGAAAATTGGCATCTACAATATCG 1112
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 972 AGATACCTGGAGTTATATCAGCATCATCATTTGATGGGAAAATTGGCATCTACAACATCG 1031
Query 1113 AGGGTTGCAGTCGCTATGGTGTTGAAGAGAATAATTTTGGTACTGCTCCTTTAAAAGCAC 1172
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1032 AGGGTTGCAGTCGATATGGTGCTGAAGAGAATAATTTTGGTACTGCTCCTTTAAGAGCAC 1091
Query 1173 CAAAATGGTATAAGCGCCCGGTTGGTGCATCTTTTGGATTTGGGGGAAAGCTTGTATCGT 1232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 CAAAATGGTATAAGCGCCCGGTTGGTGCATCTTTTGGATTTGGGGGAAAGCTTGTATCGT 1151
Query 1233 GTCACGCAAGGGCCCCTGCAAAGGGTACTTCGAGCATTCTATCCGAGGtttttttGCACA 1292
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 GTCACACAAGGGCCCCTGCAAAGGGTACTTCGAGCATTCTATCCGAGGTTTTTTTGCACA 1211
Query 1293 GCCTGGTAACAGAACAGAGTTTGGTGAGTCGAACTTCTGAATTTGAAGCTGCAATAGAAA 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212 GCCTGGTAACAGAACAGAGTTTGGTGAGTCGAACTTCGGAATTTGAAGCTGCAATAGAAA 1271
Query 1353 ATGGAGATATGACTTCTCTAAGGGGTTTGTGCGAGAAGAAATCTGAAGAGACTGAATCCG 1412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1272 ATGGAGATATGACTTCTCTAAGGGGTTTGTGCGAGAAGAAATCGGAAGAGACTGAATCCG 1331
Query 1413 AAGAGGAGAAAGAGACATGGGGCTTGCTGAAAATCATGTTCGAAGAGGAAGGAACTTCAA 1472
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 AAGAGGAGAAAGAGACATGGGGCTTACTGAAAATCATGTTCGAAGAGGAAGGAACTTCAA 1391
Query 1473 GGACAAAGTTGATCAGCCATCTTGGCTTTACTTTGCCTGTTGCGGAAAAGGATCAGGCAG 1532
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 1392 GGACAAAGTTGATCAGCCATCTTGGCTTTACTTTGCCTATTGCGGAAAATGATCAGGCAG 1451
Query 1533 TAGATGGGCTCTCATCAGATCTCAATGGCATTAGATTAGAGGATACTGCGGCAGATGCAC 1592
|| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1452 TAAATGGGCTCTCATCAGATCTGAATGGCAATAGATTAGAGGATACTGCGGCGGATGCAA 1511
Query 1593 TGGATCTTGACGACAGTAACGAGGCAGCTGCATTTGCGATGGATAATGGAGAAGACTTCT 1652
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512 TGGAACCTGACGACAGTAACGAGGCAGCTGCATTTGCTATGGATAATGGAGAAGACTTCT 1571
Query 1653 TTAACAACTTTCCTGCTAAACCGGATACACCTGTATCTACATCTGCCAAAGATTTTATGC 1712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1572 TTAACAACTTTCCTGCTAAACCGGATACACCTGTATCTACGTCTGCCAAAGATTTTATGC 1631
Query 1713 CTTCTGACACAGATTTTTCTACCAAAGGAGAAGAAACGCAAGAAATGCAAGAAGAAGAGG 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632 CTTCTGACACAGATTTTTCTACCAAAGGAGAAGAAACTCAAGAAATGCAAGAAGAAGAGG 1691
Query 1773 AAGAAAGTTCTGACCCAGTTTTTGATAATGCCATCCAGCGAGCGTTGATTGTTGGAGATT 1832
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1692 AAGAAAGTTCTGACCCAGTATTTGATAATGCCATCCAGCGTGCTTTGATTGTTGGAGATT 1751
Query 1833 ACAAGGAGGCGGTGGATCAGTGTATAACTGCAAATAAGATGGCCGATGCTTTAGTTATTG 1892
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1752 ACAAGGAGGCGGTGGATCAGTGTATATCTGCAAATAAGATGGCCGATGCTTTAGTTATTG 1811
Query 1893 CTCATGTTGGTGGTACAGCGTTGTGGGAGAGTACTCGTGAGAAATATTTGAAGACGAGCA 1952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812 CTCATGTTGGTGGTACAGCGTTGTGGGAGAGTACTCGTGAGAAATATTTGAAGACGAGCA 1871
Query 1953 GTGCGCCATACATGAAGGTTGTTTCTGCGATGGTGAACAATGATCTCAGGAGCCTTATCT 2012
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1872 GTGCGCCTTACATGAAGGTTGTTTCTGCGATGGTGAACAATGATCTCAGGAGCCTTATCT 1931
Query 2013 ATACAAGGTCACATAAGTTCTGGAAAGAGACTCTTGCTCTCCTCTGTACTTTTGCACAAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1932 ATACAAGGTCACATAAGTTCTGGAAAGAGACTCTTGCTCTCCTCTGTACTTTTGCACAAG 1991
Query 2073 GAGAACAATGGACAACCCTGTGTGATGCCCTTGCCTCGAAGTTGATGGCTGCTGGTAACA 2132
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992 GAGAACAATGGACCACCCTGTGCGATGCCCTTGCCTCGAAGTTGATGGCTGCTGGTAACA 2051
Query 2133 CTTTGGCTGCAGTTCTCTGCTACATTTGCGCAGGCAATGTTGACAGAACAGTAGAAATTT 2192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2052 CTTTGGCTGCAGTTCTCTGCTACATTTGCGCAGGCAATGTTGACAGAACAGTAGAAATTT 2111
Query 2193 GGTCGAGGAGCCTTGCAAATGAGCGGGATGGAAGATCTTATGCTGAGCTTCTTCAAGATC 2252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2112 GGTCGAGGAGCCTTGCAAATGAGCGGGATGGAAGATCTTATGCTGAGCTTCTTCAAGATC 2171
Query 2253 TTATGGAGAAGACTCTTGTCCTTGCTTTGGCAACTGGCAACAAAAAGTTCAGCGCATCTC 2312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2172 TTATGGAGAAGACTCTTGTCCTTGCTTTGGCAACTGGCAACAAAAAGTTCAGCGCATCTC 2231
Query 2313 TGTGTAAACTCTTTGAGAGTTATGCTGAGATACTGGCCAGCCAAGGGCTTCTTACAACGG 2372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2232 TGTGTAAACTCTTTGAGAGTTATGCTGAGATACTGGCCAGCCAAGGGCTTCTTACAACGG 2291
Query 2373 CAATGAAGTACTTGAAAGTTCTGGATTCTGGTGGCTTGTCACCTGAACTTTCAATATTAC 2432
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2292 CAATGAAGTACTTGAAAGTTCTGGATTCTGGTGGCTTGTCGCCTGAACTTTCAATATTAC 2351
Query 2433 GTGATCGTATTTCTCTATCTGCAGAACCTGAGACTAACACTACAGCTTCAGGAAACACTC 2492
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2352 GTGATCGTATTTCTCTGTCTGCAGAACCTGAGACTAACACTGCAGCTTCAGGAAACACTC 2411
Query 2493 AGCCTCAAAGCACCATGCCATATAATCAGGAGCCAACTCAGGCGCAACCAAACGTTCTTG 2552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2412 AGCCTCAAAGCACCATGCCATATAATCAGGAGCCAACTCAGGCGCAACCAAACGTTCTTG 2471
Query 2553 CTAACCCATATGATAATCAGTATCAGCAACCGTACACTGATTCTTATTATGTCCCTCAAG 2612
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2472 CTAACCCATATGATAATCAGTATCAGCAACCATACACTGATTCTTATTATGTCCCTCAAG 2531
Query 2613 TTTCACATCCACCCATGCAGCAACCAACCATGTTTATGCCACACCAAGCTCAGCCAGCTC 2672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2532 CTTCACATCCACCCATGCAGCAACCAACCATGTTTATGCCTCACCAAGCTCAGCCAGCTC 2591
Query 2673 CGCAGCCATCTTTTACTCCAGCTCCTACAAGCAATGCTCAGCCATCCATGAGAACTACAT 2732
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2592 CGCAGCCATCTTTCACTCCAGCTCCTGCAAGCAATGCTCAGCCAACCATGAGGACTACAT 2651
Query 2733 TTGTTCCTTCAACTCCCCCTGCACTGAAGAATGCAGATCAATATCAGCAGCCAACCATGA 2792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2652 TTGTTCCTTCAACTCCCCCTGCACTGAAGAATGCAGACCAATATCAGCAGCCAACCATGA 2711
Query 2793 GTTCTCATTCATTCACGGGACCATCTAACAATGCATACCCTGTTCCCCCGGGTCCTGGT- 2851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2712 GTTCTCATTCATTCACGGGACCATCTAACAATGCATACCCTGTTCGCCCGGGTCCTGGTA 2771
Query 2852 CAATATGCACCTTCTGGCCCTTCACAACTTGGGCAATATCCTAACCCTAAGATGCCCCAA 2911
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2772 CA-TATGCACCTTCTGGCCCTTCACAAGTTGGGCAATATCCTAACCCTAAGATGCCCCAA 2830
Query 2912 GTTGTTGCTCCAGCAGCTGGACCCATAGGATTTACGCCCATGGCAACTCCAGGAGTTGCT 2971
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2831 GTTGTGGCTCCATCAGCTGGACCCATAGGATTTACGCCCATGGCAACTCCAGGAGTTGCT 2890
Query 2972 CCAAGATCTGTGCAACCAGCAAGTCCTCCAACACAGCAGGCAGCTGCACAGGCAGCCCCT 3031
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2891 CCAAGATCTGGGCAACCAGCTAGTCCTCCAACACAGCAGGCAGCTGCGCAGGCAGCCCCT 2950
Query 3032 GCGCCTGCAACTCCGCCACCAACTGTTCAGACTGCAGATACTTCCAACGTTCCAGCCCAC 3091
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2951 ACGCCTGCAACTCCGCCACCAACTGTTCAGACTGCAGATACTTCCAACGTTCCAGCCCAC 3010
Query 3092 CAGAAACCTGTGATAGCAACGTTGACAAGGCTTTTCAATGAGACATCGGAAGCACTGGGA 3151
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 3011 CAGAAACCTGTGATAGCAACGTTGACAAGGCTTTTTAACGAGACATCGGAAGCACTGGGA 3070
Query 3152 GGCGCACGTGCGAATACTACTAAGAAGCGTGAGATAGAAGACAACTCGAGAAAATTAGGT 3211
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3071 GGCGCACGTGCAAATCCTACTAAGAAGCGTGAGATAGAAGACAACTCGAGAAAATTAGGT 3130
Query 3212 GCTCTGTTTGTGAAACTCAACAGCGGAGACATCTCCAAGAATGCTGCGGACAAACTCGCA 3271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3131 GCTCTGTTTGTGAAACTCAACAGCGGAGACATCTCCAAGAATGCTGCGGACAAACTCGCA 3190
Query 3272 CAGCTATGCCAAGCTCTGGACAACAATGACTTCAGCACAGCCCTTCAAATACAGGTACTT 3331
||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3191 CAGCTGTGTCAAGCTCTGGACAACAATGACTACAGCGCAGCCCTTCAAATACAGGTACTT 3250
Query 3332 CTGACTACCAGCGAATGGGACGAATGCAACTTCTGGCTGGCAACACTAAAGCGGATGATG 3391
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3251 CTGACGACCAACGAATGGGACGAATGCAACTTCTGGCTGGCAACACTAAAGCGGATGATG 3310
Query 3392 GTCAAGGCCAGGCAAAATGTGCGGTGATTATTTATTTTCTGGGTTCAT 3439
|||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3311 GTCAAGGCGAGGCAAAGTGTGCGATGATTATTTATTTTCTGGGTTCAT 3358
> Ahg472106 jgi|Araly1|472106|fgenesh2_kg.1__2060__AT1G18830.1
Length=2682
Score = 399 bits (216), Expect = 6e-110
Identities = 445/554 (80%), Gaps = 22/554 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1970 GTTGTTTCTGCGATGGTGAACAATGATCTCAGGAGCC-TT-ATCTATACAAGGTCACATA 2027
||||| ||||| ||| ||||||||||| | | || || || || ||||||| ||| ||
Sbjct 1498 GTTGTCTCTGCAATGATGAACAATGATTTAATGA-CCTTTGTTC-ATACAAGACCACCTA 1555
Query 2028 AGTTCTGGAAAGAGACTCTTGCTCTCCTCTGTACTTTTGCACAAGGAGAACAATGGACAA 2087
| | ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||
Sbjct 1556 AATCCTGGAAAGAAACACTTGCTCTCATCTGCACTTTTGCAGAAGGAGATGAATGGATAA 1615
Query 2088 CCCTGTGTGATGCCCTTGCCTCGAAGTTGATGGCTGCTGGTAACACTTTGGCTGCAGTTC 2147
||| |||||||| ||| |||| || ||||||| | ||||| || ||||||||| ||
Sbjct 1616 GCCTCTGTGATGCTCTTACCTCAAATTTGATGGATCCTGGTTTTACGTTGGCTGCAACTC 1675
Query 2148 TCTGCTACATTTGCGCAGGCAATGTTGACAGAACAGTAGAAATTTGGTCGAGGAGCCTTG 2207
| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1676 TGTGTTACATTTGCTCAGGCAATGTCGACAAAACAGTAGACATTTGGTCAAGGAGCCTTG 1735
Query 2208 CAAATGAGCGGGAT-GGAAGATCTTATGCTGAGCTTCTTCAAGATCTTATGGAGAAGACT 2266
||| || | ||| |||| |||||||||||||| | |||||| || | ||||
Sbjct 1736 AAAAAGAAAGTGATGGGAA-ATCTTATGCTGAGCGTGTTCAAG-----AT---G-CGACT 1785
Query 2267 CTTGTCCTTGCTTTGGCAACTGGCAACAAAAAG-TTCAGCGCATCTCTGTGTAAACTCTT 2325
|||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 1786 CTTGTCCTTGCTTTGGTAACTGGCAAC-AAGAGATTCAGTGCGTCTCTACGTAAACTCTT 1844
Query 2326 TGAGAGTTATGCTGAGATACTGGCCAGCCAAGGGCTTCTTACAACGGCAATGAAGTACTT 2385
||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||| |||
Sbjct 1845 TGAGAGTTATGCTGAGATATTGGCCAGTCAAGGACTTCTTGCAACCGCTATGAAGTTCTT 1904
Query 2386 GAAAGTTCTGGATTCTGGTGGCTTGTCACCTGAACTTTCAATATTACGTGATC-GTATTT 2444
||| |||| || ||||| | || ||||| ||||||||||| || | | ||| | |||
Sbjct 1905 AAAATTTCTTGAGTCTGGCGATTTCTCACCCGAACTTTCAATCTTGCATAATCAG-ATTG 1963
Query 2445 CTCTATCTGCAGAACCTGA-GA--CTAACACTACAGCTTCAGGAAACACTCAGCCTCAAA 2501
|||| | ||| |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||| || |||
Sbjct 1964 CTCTGTATGCGGAACCTGAAGCTGCTAACACTTCTGCTTCAGAAAACACTCAGTCTAAAA 2023
Query 2502 GCACCATGCCATAT 2515
| |||||||||||
Sbjct 2024 TCTCCATGCCATAT 2037
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 142944244188
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5