BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G00450.1
Length=7108
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg895977 jgi|Araly1|895977|Al_scaffold_0006_3973 5664 0.0
> Ahg895977 jgi|Araly1|895977|Al_scaffold_0006_3973
Length=6774
Score = 5664 bits (3067), Expect = 0.0
Identities = 3338/3472 (96%), Gaps = 6/3472 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3303 GGGTGGAAGAAACCTTGTAACTGTACCAAGGAATGTTGAAAACAACATGTGTGAAATAGG 3362
|||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3306 GGGTGGGAGAAACCTTGTAACTATGCCAAGGAATGTTGAAAACAACATGTGTGAAATAGG 3365
Query 3363 CGAGGCGATTCTAGTATCATCACTGAGAAGGTATGAAAACATTCTACTTTCAGCTGATCT 3422
||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3366 GGAGGCTATTTTAGTATCATCACTGAGGAGGTATGAAAACATTCTACTTTCAGCTGATCT 3425
Query 3423 TGTTCCTGAGGCCATGACAGCTTTGATGAACCGTGCTGCATCACTTATGTCTAGTAATGG 3482
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3426 TGTTCCTGAGGCCATGACAGCTTTGATGAACCGTGTTGCATCACTTATGCCTAGTAATGG 3485
Query 3483 AAAAATTTCTGGATCAGCAGCCTTAGTTTATACTCGCTATATTTTGAAAAGATATGGAAG 3542
||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3486 AAAGATTTCTGGATCAGCAGCCTTAGTTTATGCTCGCTATATTTTGAAAAGATATGGAAG 3545
Query 3543 CCTCCCCAGTGTTGTGGAATGGCATAACAATTTCAAAGCAACATCCGAAAAGAAGCTACT 3602
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||
Sbjct 3546 TCTTCCCAGTGTTGTGGAATGGCATAACAATTTCAAAGCAACATGCGAAAAGAGGCTTCT 3605
Query 3603 TTCTGAACTAGATCATACGCGATCAGGAAATGGTGAGTATGGGAACCCCCTCGGGGTTCC 3662
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3606 TTCTGAACTAGATCATACACGATCAGGAAATGGTGAGTATGGGAACCCCCTTGGGGTTCC 3665
Query 3663 AGCAGGAGTAGATAATCCAGATGACTATTTACGTaaaaaaaTCAGCATTGGCGGTGCACG 3722
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 3666 AGCAGGAGTAGATAATCCAGATGACTATTTACGAAAAAAAATCAGCATCGGCGGTACACG 3725
Query 3723 TCCTTCAAGAGTGGGTTTGAGTATGCGAGATGTTTTGCAACGACATGTTGAAGAGGCGAC 3782
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3726 TCCTTCAAGAGTGGGTTTGAATATGCGAGAGGTTGTGCAACGACATGTTGAAGAGGCGAC 3785
Query 3783 TCATTATCTCAAAAAACTCATTGGGACTGGTACTATGAAAGCCTCTCTCGCTGAGAAAAA 3842
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||
Sbjct 3786 TCATTATCTCAGAAAACTCACTGGGACTGGTACTATGAAAGCCTCACTTACCGAGAAAAA 3845
Query 3843 TGATGACGGGTATCAGGTGGCTCAACAAATTGTAGTTGGACTAATGGACTGCATTAGACA 3902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3846 TGATGACGGGTATCAGGTGGCTCAACAAATTGTAGTTGGACTAATGGACTGCATTAGACA 3905
Query 3903 GACTGGCGGTGCAGCTCAAGAGGGTGATCCCTCTTTGGTTTCTTCTGCGGTTTCTGCGAT 3962
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3906 GACCGGTGGTGCAGCTCAAGAGGGTGATCCCTCTTTGGTTTCTTCTGCGGTTTCTGCGAT 3965
Query 3963 TATAAACAGTGTAGGCCTTT-CAGTGGCAAGGATTACAGATTTCTCTTTGGGAAACATTT 4021
|||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3966 TATAAACAGTGTAGGCCTTTCCA-TGGCAAGGATTTCAGATTTCTCTTTGGGAAACATTT 4024
Query 4022 ATCAGAATCATCCTTCTGGCGTTGATTCATCTAATATTGCACGATACATTTTACGAATCC 4081
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4025 ATCAGAATCATCCATCTGGCGTCGATTCATCTAATATTGCACGATACATTTTACAAATCC 4084
Query 4082 ATATAACCTGTCTGTGCCTTCTTAAGGAAGCTCTTGGAGAGCGTCAAAGCCGAGTGTTTG 4141
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4085 ATATAACCTGCCTGTGCCTTCTTAAGGAAGCTCTTGGAGAGCGTCAAAGCCGAGTGTTTG 4144
Query 4142 AAATAGCACTTGCAACAGAAAGTTCCACTGCGCTTACTGGAGTTTTTGCTCCTGTGAAGG 4201
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||
Sbjct 4145 AAATAGCACTTGCAACAGAAAGTTCCACTGCTCTTGCTGGAGCTTTTGCTCCGGGGAAGG 4204
Query 4202 GATCACGAGGTCAGCATCAGCTATCTCCTGAATCCTATGATTCAAATGCAAACAATTCAA 4261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4205 GATCACGAGGTCAGCATCAGCTATCTCCTGAATCCTATGATTCAAATGCCAACAATTCAA 4264
Query 4262 C-AATCGATATGTCGAATGGTACTGGAAAAATGGCGCTGAGCAGAGCG-ACAAAAATTAC 4319
| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||
Sbjct 4265 CAAAT-GATATGCCGAACGGTACTGGAAAAATGGCGCTGAGTAGAG-GAACAAAAATTAC 4322
Query 4320 TGCAGCTGTATCTGCACTTGTTATAGGTTCTATCACACATGGTGTTATAACCCTTGAGAG 4379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4323 TGCAGCTGTATCTGCACTTGTTATAGGTTCTATCACACATGGTGTTATAACCCTTGAGAG 4382
Query 4380 GATTGTTGGTCTACTGAGACTAAAGGATTACTTAGATTTCGTTCAGTTTGTAAGGCGTAC 4439
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4383 GATTGTTGGTCTGCTGAGACTAAAGGAGTACTTAGATTTCGTTCAGTTTGTAAGGCGTAC 4442
Query 4440 AAAATCGAGTTCTAATGGCAGTGCTAGATCCATGGGAGCCTCTAAAGTGGAAAGCCCTAT 4499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4443 AAAATCGAGTTCTAATGGCAGTGCTAGATCCATGGGGGCCTCTAAAGTGGAAAGCCCTAT 4502
Query 4500 TGAAGTGTATGTACATTGGTTCAGACTCCTTGTTGGTAACTGTAAAACTGTTTCGGAAGG 4559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4503 TGAAGTGTATGTACATTGGTTCAGACTCCTTGTTGGTAACTGTAAAACTGTTTCGGAAGG 4562
Query 4560 GCTGGTTTTGGAGCTTGTGGGAGAATCTTCCGTGGTGGCTATATCACGCATGCAGCGTAT 4619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4563 GCTGGTTTTGGAGCTTGTGGGAGAATCTTCCGTGGTGGCTATATCACGCATGCAGCGTAT 4622
Query 4620 GCTTCCGCTGAAATTGGTCTTCCCACCAGCCTATTCAATTATTGCGTTTGTTCTGTGGAG 4679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4623 GCTTCCGCTGAAATTGGTCTTCCCACCAGCCTATTCAATTATTGCGTTTGTTCTATGGAG 4682
Query 4680 GCCTTTTGTTTCAAATAGTAACTCTAACTCCAGCGTCCATGAAGACACTCACCGCCTTTA 4739
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4683 GCCTTTTGTTTCGAATAGTAACTCTAACTCCGGCGTCCATGAAGACACTCACCGCCTTTA 4742
Query 4740 TCAGTCTTTGACAATGGCCTTCCATGATGTTATTAAGCATCTTCCTTTCCGAGACGTGTG 4799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4743 TCAGTCTTTGACAATGGCCTTCCATGATGTTATTAAGCACCTTCCTTTCCGAGACGTGTG 4802
Query 4800 CTTCAGAGACACCCAGGGACTTTATGAACTGATAGTTGCTGATTCCACAGATGCTGAATT 4859
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4803 CTTGAGAGACACCCAGGGACTTTATGAACTGATAGTTGCTGATTCCACAGATGCTGAGTT 4862
Query 4860 TGCGTCGGTGTTTGAATCGCATGGATTGGATATGCACTTGAAATCTGTGGCCTTTGCTCC 4919
||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4863 TGCGTCGGTATTTGAATCGTATGGTTTGGATATGCACTTGAAATCTGTGGCCTTTGCTCC 4922
Query 4920 TCTTCGAGCGCGTCTTTTCTTAAATTCCCTAATTGATTGTAAGGTGCCATCCTCTGGTTA 4979
||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4923 TCTTCGAGCACGTCTTTTCTTCAATTCCATAATTGATTGTAAGGTGCCATCCTCTGGTTA 4982
Query 4980 TTCCCATGAAGGAGTTAGTGAAGCAAAAAACCGACATCAGGGAAATGGAACAAAGCTTGT 5039
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4983 TTCCCATGAAGGAGTTAGTGAAGCAAAAAACCGACACCAGGGAAATGGAACAAAGCTTGT 5042
Query 5040 GGACAAGCTTGTATCTGTATTAGATTGCCTGCAGCCTGCAAAATTTCACTGGCAGTGGGT 5099
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5043 GGACAAGCTTGTATCTTTATTAGATTGCCTGCAACCTGCAAAATTTCACTGGCAGTGGGT 5102
Query 5100 TGAACTCAGGCTGCTTCTAAACGAGCAAGCACTTGCTGAGAAACTCGAAAATCATGATAT 5159
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5103 TGAACTCAGGCTGCTTCTAAACGAGCAAGCACTTACTGAGAAACTCGAAAATCATGATAT 5162
Query 5160 GCCTTTGACAGATGCAATACGATCTTCCTGTCCTACCTCTGAGAAGCCTGATGCCTCTGA 5219
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5163 GCCTTTGACCGATGCAATACGATCTTCCTGCCCTACCTCTGAGAAGCCTGCTGCCTCTGA 5222
Query 5220 GAATGAGAAAAATTTCATTCAAATCCTCCTCACAAGGTTATTGGTTAGACCTGATGCGGT 5279
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5223 GTATGAGAAAAATTTCATTCAAATGCTCCTCACAAGGTTATTGGTTAGACCTGATGCAGT 5282
Query 5280 CCCTCTTTTCTCAGAAGTGGTTCATCTCTTCGGTAGATCGGTTGAGGATTCAATGTTGAA 5339
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5283 CCCACTTTTCTCAGAAGTGGTTCATCTCTTTGGTAGATCGGTTGAGGATTCAATGTTGAA 5342
Query 5340 GCAAGCTGAATGGTTTCTAGCAGGCCAAGATGTTCTTTTTGGACGAAAAACAATCAGACA 5399
||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5343 GCAAGCTGAATGGATTCTAGGAGGTCAAGAAGTTCTTTTTGGACGAAAAACAATCAGACA 5402
Query 5400 AAAACTGATTATTGTAGGTGAAAGCAAAGGACTCCCCACGAAACCTCAGTTTTGGAAACC 5459
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5403 AAAACTGATTATTGTAGGTGAAAGCAAAGGACTTCCCACGAAACCTCAGTTTTGGAAACC 5462
Query 5460 TTGGGGTTGGTGCAACAGCTCTAGTTCCGATCATATTACAGCAAACAAGGCAGGGAAGAA 5519
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 5463 TTGGGGTTGGTGCAACAACTCTAGTTCCGATCATATTACAACAAACAAAGCAGGGAAGAA 5522
Query 5520 AAGGAAGTTTGAAATTACTTCTATCGAAGAAGGGGAAGTGATTGAGGAAGGTTCAGGTTC 5579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5523 AAGGAAGTTTGAAATTACTTCTATCGAAGAAGGGGAAGTGATTGAGGAAGGGTCAGGTTC 5582
Query 5580 AAGAAAGGTATTATTACCCCGGGTATTGGATGAGAATAGTCCCAGTGTTGGCTATGGGAT 5639
|| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5583 AAAAAAGGTATTATTACCCCGGGCAGTAGATGAGAATAGTCCCAGTGTTGGCTATGGGAT 5642
Query 5640 TACAACTGAGAGGGCTTTTGTTCAGCTAGTGCTTCCATGCATAGACCAAAGCTCTGATGA 5699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5643 TACAACTGAGAGGGCTTTTGTTCAGCTAGTGCTTCCATGCATAGACCAAAGCTCTGATGA 5702
Query 5700 GTCTCGAAGTACCTTTGTGAATGAGTTGGTAAGACAGTTTAGCAATATTGAGCAGCAATT 5759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5703 ATCTCGAAGTACCTTTGTGAATGAGTTGGTAAGACAGTTTAGCAATATTGAGCAGCAATT 5762
Query 5760 AAGTTCAGTTACCAACCGCAGTACAACAAGCAACAAGCAAATGGGAACTGCTTCTTCTGG 5819
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5763 AAGTTCAGTTACCAACCACAGTACAACAAACAACAAGCACATGGGAACTGCTTCTTCTGG 5822
Query 5820 GTCTGAGATTTCATCAAATAAAGGAAGTACCCGGAAGGGCCTTCGCGGTGGTAGCCCTAG 5879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5823 GTCTGAGATTTCATCAAATAAAGGAAGTACCCGGAAGGGCCTTCGCGGTGGTAGCCCTAG 5882
Query 5880 TTTGGCAAGAAGATCCTCAGCCAATACTACTGACACTTCGCCGCCGCCTTCCCCTGCTGC 5939
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5883 TTTGGCAAGAAGATCCTCAACCAATATTACTGACACTGCGCCGCCGCCTTCCCCTGCTGC 5942
Query 5940 TTTGAGAGCTTCTATGTCTTTGCGGTTGCAATTTCTTCTAAGATTACTGCCTGTCATCTG 5999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5943 TTTGAGAGCTTCTATGTCTTTGCGGTTGCAATTTCTTCTAAGATTACTGCCTGTCATCTG 6002
Query 6000 CGGGGAACCTTCATTTAAGAACACCAGACATGCACTTGCGTCTACAATAGTTCGTCTACT 6059
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 6003 CGGGGAACCTTCATTTAGGAACACGAGACATGCACTTGCATCTACAATAGTCCGTCTACT 6062
Query 6060 TGGAAGCAGAGTAGTTTATGAAGATTATGCTGTATGTTCTCCTCGTAGTGAGCTATCAAA 6119
||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||
Sbjct 6063 TGGAAGCCGAGTAGTTTATGAAGATTATGCTGTCTGCTCTCCTCGTATTGAGGTATCAAA 6122
Query 6120 GGCAGAAACAGAATCAACAATAGATCCTTCTTCCATGGCAGATCTCTCTAGTGAAGTCTT 6179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6123 GGCAGAAACAGAATCAACAATAGATCCTTCTTCCATGGCAGATCTCTCTAGTGAAGTCTT 6182
Query 6180 ATTTGACCGGTTACTGTTTGTACTCCATGGGCTGTTAAGCAATCACCAGCCAAAATGGCT 6239
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6183 ATTTGACCGGTTACTGTTTGTACTCCATGGGTTGTTAAGCAATCACCAGCCAAAATGGCT 6242
Query 6240 AAAGCCAAGGCCTTCCTCTAATGAATCATCCAAAGACTTTACCTTGTTTGATCGCGATGC 6299
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6243 AAAGCCAAGGCCTTCCTCTAGTGAACCATCCAAAGACTTTACCTTGTTTGATCGCGATGC 6302
Query 6300 AGCAGAGAGCTTACAGAATGAGCTTTCGCGGATGCAGTTACCAGACACCATTAGATGGCG 6359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6303 AGCAGAGAGCTTACAGAATGAGCTTTCGCGGATGCAGTTACCAGACACCATTAGATGGCG 6362
Query 6360 GATCCAAGCAGCGATGCCAATCCTCCTTCCTTCTCTACGCTGTTCTCTCTCATGCCAGCC 6419
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6363 GATCCAATCAGCGATGCCAATCCTCCTTCCTTCTCTACGCTGTTCTCTCTCGTGCCAGCC 6422
Query 6420 TCATTCTGTTCCGCCAACCGCACTCACACTTGTTCAGCCCTCTGGATCTACTGCTGCTGC 6479
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||
Sbjct 6423 TCATTCCGTTCCGCCAACTGCACTCACACTTGTTCAACCCTCTGGATCTGCCGCTGCTGC 6482
Query 6480 TGGAACCAATCAAAGAAACTCCCCTGCCATATCGAAAAGTGGAACTGCAGCAGCACAAGG 6539
|||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||
Sbjct 6483 TGGACCCAACCAAAGAAACTCCCCTGCCATATCGAAAACTGGAACCGCAGCAGTGCAAGG 6542
Query 6540 GAAGCTGAAGCCGACAATGTTGGCACCACATCAACAACAAGAAGCAGACAACACGGATGT 6599
||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6543 GAAGCTGAAGCAGACAGTGTTGGCACCACCTCAACAACAAGAAGCAGATAACACGGATGT 6602
Query 6600 GGTTGACCCGTGGACGCTCCTCGAAGATGGGACAAGTTCAGGTCTATCAAGCAGCAACGC 6659
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6603 GGTTGACCCGTGGACGCTTCTCGAAGATGGGACAAGTTCAGGTCTATCAAGCAGCAACGC 6662
Query 6660 TTCAAATAGCAGCGACATGGCCAACCTTCGAGCCACCTGTTGGCTGAAAGGTGCAGTCAG 6719
|||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6663 TTCAAACAGCAGCGACATGGCCAATCTCCGAGCCACCTGTTGGCTGAAAGGTGCAGTTAG 6722
Query 6720 GGTCAGACGGACTGATCTAACTTACGTTGGTTCAGTAGACGACGACAGCTGA 6771
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6723 GGTCAGACGGACTGATCTAACTTATGTTGGTTCAGTAGACGACGACAGCTGA 6774
Score = 4732 bits (2562), Expect = 0.0
Identities = 2739/2824 (97%), Gaps = 14/2824 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 422 AGGCTGGTCAGGTTTATGGGGTGCCTCTCTCTGGTTCGCTTCTATGTAAGCCTGGATTTC 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 AGGCTGGTCAGGTTTATGGGGTGCCTCTCTCTGGTTCGCTTCTATGTAAGCCTGGATTTC 550
Query 482 CAGAACAAAGGTCATGTGGGGAGGAGACAAAGAAAAGATGGATCGAGAGTTTATCACAAC 541
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 CAGAACAAAGATCATGTGGGGAGGAGACAAAGAAAAAATGGATCGAGAGTTTATCACAAC 610
Query 542 AGCACAAACGATTGCGCTCTTTGGCTGATAACATTCCTGGATATAGGAGAAAAACCTTAT 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 AGCACAAACGATTGCGCTCTTTGGCTGATAACATTCCTGGATATAGGAGAAAAACCTTAT 670
Query 602 TTGAAGTCCTTATAAGGAACAATGTCCCACTATTGAGAGCTACTTGGTTTATAAAAGTGA 661
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 TTGAGGTCCTTATAAGGAACAATGTCCCACTATTGAGAGCTACTTGGTTTATAAAAGTGA 730
Query 662 CTTATCTCAATCAGGTACATTGTTGGGCAATAAATTGGTGCGACCTAGTCCTGCTGCTAT 721
|||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 CTTATCTCAATCAGGTACATTGTTGGGC-A-AGA---GTGCGACCTAGTCCTGCTGCTAT 785
Query 722 TTCTTCAGGAACACCTGACAAGACACAAGCTTCTCGGTGTGAGCAATGGACAAAAGATGT 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 TTCTTCAGGAACACCTGACAAGACACAAGCTTCTCGGTGTGAGCAATGGACAAAAGATGT 845
Query 782 TATTGAATATTTGCAATACCTCTTGGATGAACTTTTGTCACGGAATAGCTCATTTCCTGC 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 846 TATTGAATATTTGCAATACCTCTTGGATGAACTTTTGTCACGGAATAGCTCATTTACTGC 905
Query 842 TCAGCAAACTAGAGATAGGTCACCACAGATGCTTTATACAGGATCAATGCAAAAGAATAG 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 906 TCAGCAAACTAGAGATAGGTCACCACAGATGCTTTATACAGGATCAATGCAAAAGAATAG 965
Query 902 TCCAGCATCAACAAGCCTTTACGGCGAGGAAACATCTCTACATTTTAAATGGTGGTATAT 961
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 TCCAGCATCAGCAAGCCTTTACGGCGAGGAAACATCTCTACATTTTAAATGGTGGTATAT 1025
Query 962 GGTGCGTCTTCTACAGTGGCACCATGCTGAAGGGCTTCTTTTTCCTAATCTCATTGTTGA 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 GGTGCGTCTTCTACAGTGGCACCATGCTGAAGGGCTTCTTTTTCCTAATCTCATTGTTGA 1085
Query 1022 TTGGGTTCTCAAGCTCTTACAGCTTTGTGAATTTCCATTTTGCTTTACTGCAGGAAAAGG 1081
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1086 TTGGGTTCTCAAGCTCTTACAGCTTTGTGAATTTCCCTTTTGC-TTACTGCAGGAAAAGG 1144
Query 1082 AGATCTTTGAAATTTTGCAGCTGCTACTCCCCATTGTGTATGGTGTTTTAGAGAGTATTG 1141
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 AGGTCTTTGAAATTTTGCAGTTGCTACTCCCCATTGTGTATGGTGTTTTAGAGAGTATTG 1204
Query 1142 TTCTCTCTCAGACATATGTACAGAGTCTTGTAGCTATTGCTGTCCGTTTCATTCAGGAAC 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 TTCTCTCTCAGACATATGTACAGAGTCTTGTAGCTATTGCTGTCCGTTTCATTCAGGAAC 1264
Query 1202 CTGCTCCTGGTGGATCTGATCTTGTTGATAACTCTCGAAGAGCTTATACTCTATCTGCTC 1261
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1265 CTGCTCCTGGTGGATCTGATCTTGTTGATAACTCTCGAAGAGCTTATACTCTCTCTGCTC 1324
Query 1262 TAATTGAGATGGTTCGCTACTTGGTACTTGCTGCACCCGACACATTTGTTGCTTCAGATT 1321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1325 TAATTGAGATGGTTCGCTACTTGGTACTTGCTGCACCCGACACACTTGTTGCTTCAGATT 1384
Query 1322 TCTTTCCTCTTCCTCCTTCCGTAGCAGCATGTGGACCTAATGATGTGAGCTATACGTCAA 1381
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 GCTTTCCTCTTCCTCCTTCCATAGCAGCATGTGGACCTAATGATGTGAGCTATACGTCAA 1444
Query 1382 AGGCTTATGAGAATCTGGAAAAGCTGAGAAGTAACTCTGCGGAGATTTCTGCCCAGTTTC 1441
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||
Sbjct 1445 AGGGTTACGAGAATCTGGAAAAGCTGAGAAGTAACTCTGCAGAGAATTCTACCCAGTTTC 1504
Query 1442 AAGGAAGAGGAGTTCTTTCCCGGTTTGAGTTCCTTTCTTTTGATTATACCATTTCAACCA 1501
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1505 AAGGAAGAGGAGTTGTTTCCCGGTTTGAGTTCCTTTCTTTTGATTATACCATTTCAACTA 1564
Query 1502 TTCAAAGAAGTGCAGATGATTTGGCAAAGATAGCTAGCGCTGGTTACCCTCAACATAACG 1561
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565 TTCAAAGAAGTGCAGATGATTTGGCAAAGATAGCTAGCGCTGGTTACCCTCAACATAACA 1624
Query 1562 TGGCTAAAGCTGTTCAGGCCTTGGATAAAGCTTTGTCGGATGGAGATATCAGAGCTGCTT 1621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 TGGCTAAAGCTGTTCAGGCCTTGGATAAAGCTTTGTCGGATGGAGATATCAGAGCTGCTT 1684
Query 1622 ACAGTTATCTCTTTGAAGACCTTTGCAATGGAGCCGTTGATGAGGCCTGGATTACTGACG 1681
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1685 ACAGTTATCTCTTTGAGGACCTTTGCAATGGAGCCGTTGATGAGACCTGGATTGCTGACG 1744
Query 1682 TCAGTCCATGTTTAAGATCATCCCTTAGATGGATTGGCGCTATTAGCACATCCTTTGTTT 1741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745 TCAGTCCATGTTTAAGATCATCCCTTAGATGGATTGGCGCTATTAGCACATCCTTTGTTT 1804
Query 1742 GCTCCGtttttttCCTTATAGAATGGGCTACATGTGATTTTAGAGATTTCCGTGCTGGTG 1801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1805 GCTCCGTTTTTTTCCTTATAGAATGGGCTACATGTGATTTTAGAGATTTCCGTGCCGGTG 1864
Query 1802 TGCCTAAAGATATCAAGTTCTCTGGCAGAAAAGATTGTTCTCAGGTGTATTTAGTCATTC 1861
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865 TGCCCAAAGATATCAAGTTCTCTGGCAGAAAAGATTGTTCTCAGGTGTATTTAGTCATTC 1924
Query 1862 AGCTTCTGAAGCAAAAGATTCTGGGTGGAGAATTCACAGCTCGCAAAGGAAAGAATTGTC 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1925 AGCTTCTGAAGCAAAAGATTCTGGGTGGAGAATTCGCAGCTCGCAAAGGAAAGAACAGTC 1984
Query 1922 GCAACAATTTTCTTGGTGTTTCTAAACCTAGCGGTTC-GATGGATGCATTTGAAAGCCCG 1980
|||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1985 GCAACAATTTGCCTGGTGTTTCTAAACCTAGCAGTTCAG-TGGATGCTTTTGAAAGCCCG 2043
Query 1981 GGCCCATTACATGATATCATAGTCTGTTGGATTGATCAGCATGAGGTACACAAGGGAGGA 2040
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2044 GGCCCATTACATGATATCATAGTCTGTTGGATTGATCAGCATGAGGTACACAGGGGAGGA 2103
Query 2041 GCAAAGCGCTTGCAATTACTCGTTTTTGAACTTATACGTTCTGGAATCTTTAATCCCATA 2100
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2104 GCAAAGCGCTTGCAATTACTTGTTTTTGAACTTATACGTTCTGGAATCTTTAATCCCATA 2163
Query 2101 GCATATGTGAGGCAACTCATAGTTAGCGGGATGATCGATGTGATTCAACCTGCTGTTGAT 2160
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2164 GCATACGTGAGGCAACTCATAGTTAGTGGGATGATCGATGTGATTCAACCTGCTGTTGAT 2223
Query 2161 CCTGAAAGGAGAATGAGGCACCATCGCATATTGAAACAGCTACCTGGGTGTTTTGTACAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2224 CCTGAAAGGAGAATGAGGCACCATCGCATATTGAAACAGCTACCTGGGTGTTTTGTACAT 2283
Query 2221 GAAACCTTAGAGGAAGCTCAACTCTTTGGAGGGGATAAGCTTTCCGAGGCTGTGAGAACT 2280
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2284 GAAACCCTAGAGGAAGCTCAACTCTTTGGAGGGGATAAGCTTTCCGAGGCTGTGAGGACT 2343
Query 2281 TATTCTAATGAACGGCGCCTTCTTCTTCGAGAACTGCTTGTTGAGAAAGGTAAATACTGG 2340
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2344 TATTCTAACGAACGGCGCCTTCTTCTTCGAGAACTGCTTGTTGAGAAAGGTAAATATTGG 2403
Query 2341 AATAATTTAGTTCTCTCAGATCAGAAGTCAAAGAAA-ATTTCCACTTCCCTTTCGTCTGT 2399
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2404 AATAATATAGTTCTGTCAGATCAGAAGTCAAAGAAACATT-CCACTTCCCTTCCGTCTGT 2462
Query 2400 TATTTTTCCAAGGGCGTGTAATGCCAAGAGC-AATAGTAAGGGACCTCGCAAACATACCA 2458
| ||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2463 TGTTTTTCCAAGGCCGTGTAATTCCATG-GCCAATAGTGAGGGACCTCGCAAACATACCA 2521
Query 2459 AGAGTAGTGTGGATATTAGAGAACTAAAGGAGCGCATATCAGCTCTACTGCAGTTTCCAG 2518
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2522 AGAGTCGTGTGGATATTAGAGAACTAAAGGAGCGCATATCAGCTGTACTGCAGTTTCCAG 2581
Query 2519 GTATGTCATGTGGTGTGGAAACCCCAGTGCGAGATGAATTCCAAAATAGTGTTAAGAGAT 2578
||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2582 GTATGTCATGTGGTGTGAAAAATCCAATGCAAGAGGAATTCCAAAATAGTGTTAAGAGAT 2641
Query 2579 CAAGTGGATCTGTGTATAGCAAGATGGATCAACCAGAAGCTACACCAGGGTGTGAAGACT 2638
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2642 CTAGTGGATCTGTGTATAGCAAGATAGATCAACCAGAAGCTACACCAGGGTGTGAAGACT 2701
Query 2639 GTAGAAGAGCAAAAAGACCAAAAATGAATGATGAAAAGAGCTCTTGCTATCAAGGGAATT 2698
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2702 GTAGAAGAGCAAAAAGACCAAAAATGAACGATGAAAAGAGCTCTTGCTATCAAGGGAATT 2761
Query 2699 CACCAATTGCATCAGATGAAGAAGATAACTGGTGGATCAAGAAAGGATCGAAAACTGTGG 2758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2762 CACCAATTGCATCAGATGAAGAAGATAACTGGTGGATCAAGAAAGGATCAAAAACTCTGG 2821
Query 2759 AGTCTTCTCTGAAGGTTGATCCTCAGATAGAGATAACTAAACAAGTACCACGAGGTAGGC 2818
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2822 AGTCTTCTCTGAAGGTTGATCCTCAGATAGAGTTAACTAAACAAGTACCACGGGGTAGGC 2881
Query 2819 AGAAGATGGCGCGTAAGACACAGTCGCTGGCTCAACTACAAGCTGCTAGAATTGAAGGTA 2878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2882 AGAAGATGGCGCGTAAGACACAGTCGCTGGCTCAACTACAAGCTGCTAGAATTGAAGGTA 2941
Query 2879 GCCAGGGCGCTTCAACGAGTCATGTTTGTGATAATAAAGTAAGCTGTCCTCATCATGGCC 2938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2942 GCCAGGGCGCTTCAACGAGTCATGTTTGTGATAATAAAGTAAGCTGTCCTCATCATGGCC 3001
Query 2939 CTGGAGTGGAAGGAGAAAATCAGAAGGTGGTTGATGTGTTTAGAACTTCCACCCCTGTGG 2998
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3002 CTGGAGTGGAAGGAGAAAATCATAAGGTGGTTGATGTGTTTAGAACTTCCACCCCTGTGG 3061
Query 2999 ATATGGTATCTGTTGGAAACTCTTTGAAGCAGCTACAGTTTGTTGATAAGCGATCTATTG 3058
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3062 ATATTGTATCTGTTGGAAACTCTTTGAAGCAGCTACAGTTTGTTGATAAGCGGTCTATTG 3121
Query 3059 CAGTTTGGCTTACTACTGCAGTTCGGCAACTTGTTGAAGAGCCCCAAAAGAGCAGTGTGA 3118
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3122 CAGTTTGGATTACTACTGTTGTTCGGCAACTTGTTGAAGAGCCCCAAAAGAGCAGTGTGA 3181
Query 3119 GAGTTGGGCAGTTCAATAGAGGTGCTCCAGTTGAGGAGAAGAACACAATTAGGTGGAAGC 3178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3182 GAGTTGGGCAGTTCAATAGAGGTGCTCCAGTTGAGGAGAAGAGCACAATTAGGTGGAAGC 3241
Query 3179 TTGGGGCAGACGAGCTATACT-CCATATTATTTCTCTTGGATATCTCTCTTGACTTGGTT 3237
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3242 TTGGGGCAGACGAGCTAT-CTTCCATATTATTTCTCTTGGATATCTCTCTTGACTTGGTT 3300
Query 3238 TCAG 3241
||||
Sbjct 3301 TCAG 3304
Score = 640 bits (346), Expect = 0.0
Identities = 407/433 (94%), Gaps = 18/433 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 ATGCAAAGGTATCATGCTGCCAACTGCACTAGTGCAGTCAACAATAGTGCTATAGGTGGT 69
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGCAAAGGTATCATCCTGCCAACTGCTCTAGTGCAGTCAACAATAGTGCTGTAGGTGGT 60
Query 70 GCATCCGCGAGGGACTCAGGACGAGCTGATTCCTCTTCGATTGGAAACTATTCACTAAAC 129
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 61 GCATCCGCTAGGGACTCAGGACGAGCTGATTCCTCTTCGATTGGAAACTATTCCCTAAAC 120
Query 130 T-C---C------------AG--GAGACCACCACCGTTGACACCCTACAAGTTGAAGTGT 171
| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCAGGCATGTTGATAGAAAGAAGAGACCACCACCGTTGACACCCTACAAGTTGAAGTGT 180
Query 172 GAAAAGGACGGTCTGAATTCCCGATTAGGGCCGCCTGATTTTCATCCTCCAACATCAAAT 231
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 181 GAAAAGGACGGTCTGAATTCCCGATTAGGGCCGCCTGATTTTCATCCTCCTACATCAAAT 240
Query 232 TCTCCCGAAGAGAATCTGACCAAAGAGTATGTTCAATTTGGATACAAGGAAACTGTTGAT 291
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TCTCCCGAAGAGAATCTGACCAAAGAGTACGTTCAATTTGGATACAAGGAAACTGTTGAT 300
Query 292 GGACTTAAGGAATCCGAAGAAATTATATTGTCCCAGGTCCATACTTTCTCAAAGCCTGTT 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GGACTTAAGGAATCCGAAGAAATTATATTGTCCCAGGTCCATACTTTCTCAAAGCCTGTT 360
Query 352 GTCCATAAGTGCAAAGAGGCAGTCAGAAAGTGTCTTAGAGCTATCAATGAATCTCGTGCA 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTCCATAAGTGCAAAGAGGCAGTCAGAAAGTGTCTTAGAGCTATCAATGAATCTCGTGCA 420
Query 412 CTGAAGCGCAAGG 424
|||||||| ||||
Sbjct 421 CTGAAGCGTAAGG 433
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 269485674413
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5