BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G05420.1
Length=3714
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg943318 jgi|Araly1|943318|scaffold_603862.1 5709 0.0
Ahg492777 jgi|Araly1|492777|fgenesh2_kg.7__2210__AT4G21100.1 3807 0.0
> Ahg943318 jgi|Araly1|943318|scaffold_603862.1
Length=3313
Score = 5709 bits (3091), Expect = 0.0
Identities = 3232/3302 (98%), Gaps = 1/3302 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 146 CCT-GGAGACAAAGAAGAGGAAGATGAGCTCATGGAACTACGTTGTTACGGCTCACAAAC 204
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 CCTCGGGGACAAAGAAGAGGAAGATGAGCTCATGGAACTACGTTGTTACGGCTCACAAAC 62
Query 205 CGACCAGTGTCACTCACTCGTGCGTTGGCAACTTCACAAGTCCTCAAGAGCTCAATCTCA 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 CGACCAGTGTCACTCACTCGTGCGTTGGCAACTTCACAAGTCCTCAAGAGCTCAATCTCA 122
Query 265 TTGTCGCGAAATGTACTCGAATCGAGATCCATTTGCTTACCCCACAAGGACTTCAGCCTA 324
|||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 123 TTGTTGCGAAATGTACCCGAATTGAGATCCATTTGCTTACCCCGCAGGGACTTCAGCCTA 182
Query 325 TGTTGGACGTTCCTATATATGGAAGAATCGCTACTCTGGAGTTGTTCCGACCCCATGGCG 384
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 183 TGCTGGATGTTCCTATATATGGAAGAATCGCTACTCTGGAGTTGTTCCGGCCCCATGGCG 242
Query 385 AAGCGCAAGACTTTTTGTTCATTGCAACTGAGAGATACAAATTCTGTGTTCTTCAATGGG 444
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 243 AAGCACAAGACTTTTTGTTCATTGCAACTGAGAGATACAAATTCTGTGTTCTTCAGTGGG 302
Query 445 ATCCTGAGTCCTCTGAGCTTATTACAAGAGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCC 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 ATCCTGAGTCCTCTGAGCTTATTACAAGAGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCC 362
Query 505 GGCCAACAGACAATGGTCAGATTGGTATAATTGATCCAGATTGTAGATTAATTGGACTCC 564
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 GACCAACAGACAATGGTCAGATTGGCATAATTGATCCAGATTGTAGATTAATTGGACTCC 422
Query 565 ATCTGTATGACGGCTTGTTCAAGGTTATTCCATTTGATAATAAGGGACAGCTCAAGGAAG 624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 423 ATCTGTATGACGGCTTGTTCAAGGTTATTCCATTTGATAATAAGGGACAGCTCAAAGAAG 482
Query 625 CTTTTAATATCAGGCTTGAGGAATTGCAGGTTCTGGATATCAAGTTTCTGTTTGGATGTG 684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CTTTTAATATCAGGCTTGAGGAATTGCAGGTTCTGGATATCAAGTTTCTGTTTGGATGTG 542
Query 685 CAAAGCCCACTATTGCAGTACTATATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACAT 744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 CAAAGCCCACTATTGCAGTACTATATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACAT 602
Query 745 ATGAAGTCTCTCTTAAAGATAAGGATTTTGTCGAGGGTCCATGGTCTCAGAACAGTCTCG 804
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||
Sbjct 603 ATGAAGTCTCTCTAAAAGATAAGGATTTTGTCGAGGGTCCATGGTCACAGAATAATCTCG 662
Query 805 ACAATGGTGCTGACTTGCTGATTCCTGTACCACCACCGCTCTGTGGTGTCCTTATTATTG 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 ACAATGGTGCTGACTTGCTGATTCCTGTACCACCACCGCTCTGTGGTGTCCTTATTATTG 722
Query 865 GTGAAGAAACAATTGTCTATTGCAGTGCTAGTGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTT 924
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 GTGAAGAAACAATTGTCTATTGCAGTGCTAATGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTT 782
Query 925 CCATCACTAAAGCATATGGAAGAGTTGATGTTGATGGCTCTAGATATCTTCTTGGTGACC 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 783 CCATCACTAAAGCATATGGAAGAGTTGATGTTGATGGCTCTAGGTATCTTCTTGGTGACC 842
Query 985 ATGCTGGAATGATTCATCTGCTTGTTATAACGCACGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTAA 1044
|||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 ATGCTGGACTGATTCATCTTCTTGTTATAACGCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTAA 902
Query 1045 AAATTGAGCTTTTGGGTGAAACATCTATTGCATCGACTATATCGTACCTTGACAATGCCG 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 AAATTGAGCTTTTGGGTGAAACATCTATTGCATCGACTATATCGTACCTTGACAATGCCG 962
Query 1105 TTGTCTTTGTCGGCTCAAGCTATGGTGATTCACAGCTAGTAAAGCTGAATCTACACCCTG 1164
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTGTCTTTGTCGGCTCAAGCTATGGCGATTCACAGCTAGTAAAGCTGAATCTACACCCTG 1022
Query 1165 ATGCAAAAGGCTCATATGTAGAAGTCTTGGAAAGGTATATCAACTTGGGGCCTATTGTCG 1224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 ATGCAAAAGGCTCATATGTAGAAGTCTTGGAAAGGTATATCAACTTGGGGCCTATTGTCG 1082
Query 1225 ACTTTTGTGTAGTTGACCTCGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGTTCTGGAG 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 ACTTTTGTGTAGTTGACCTCGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGTTCTGGAG 1142
Query 1285 CATTTAAGGATGGTTCCCTCCGCGTAGTTCGCAATGGAATAGGAATCAATGAACAGGCGT 1344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 CATTTAAGGATGGTTCCCTCCGCGTAGTTCGCAATGGAATAGGAATCAATGAACAGGCGT 1202
Query 1345 CTGTGGAACTTCAAGGTATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCTTCAATTGATGAAGCCT 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 CTGTGGAACTTCAAGGTATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCTTCAATTGATGAAGCCT 1262
Query 1405 TCGATACATTTCTTGTTGTTAGCTTTATCAGTGAAACTCGCATATTAGCCATGAATCTTG 1464
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1263 TCGATACATTCCTCGTTGTTAGCTTTATCAGTGAAACTCGTATATTAGCCATGAATCTTG 1322
Query 1465 AGGATGAACTGGAAGAAACAGAGATTGAGGGCTTCTTGTCTCAAGTGCAGACGTTATTTT 1524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 AGGATGAACTGGAAGAAACAGAGATTGAGGGCTTCTTGTCTCAAGTGCAGACGTTATTTT 1382
Query 1525 GCCATGATGCTGTGTACAATCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGACTAGTCA 1584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 GCCATGATGCTGTGTACAATCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGACTAGTCA 1442
Query 1585 GTTCTACAACTAGAGAATTGCGGGACGAGTGGCATGCCCCAGCTGGATTCACTGTTAATG 1644
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1443 GTTCTACAACTAGAGAATTGCGGGACGAGTGGCATGCCCCGGCTGGATTCACTGTTAATG 1502
Query 1645 TTGCAACTGCAAATGCCAGCCAGGTTCTTTTGGCGACTGGAGGTGGGCATTTGGTTTATC 1704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1503 TTGCAACTGCAAATGCCAGCCAGGTTCTTTTGGCGACTGGAGGTGGGCATTTGGTGTATC 1562
Query 1705 TAGAAATTGGAGATGGGAAATTGACGGAAGTGCAACATGCCCTTTTGGAGTACGAGGTTT 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 TAGAAATTGGAGATGGGAAATTGACGGAAGTGCAACATGCCCTTTTGGAGTACGAGGTTT 1622
Query 1765 CCTGTCTTGATATAAACCCTATCGGTGACAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCGGTTG 1824
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1623 CTTGTCTTGATATAAACCCTATCGGTGACAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTTCGGTTG 1682
Query 1825 GGATGTGGACAGATATAAGTGTGAGGATCTTTTCGCTGCCAGAATTGACTCTTATTACAA 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 GGATGTGGACAGATATAAGTGTGAGGATCTTTTCGCTGCCAGAATTGACTCTTATTACAA 1742
Query 1885 AAGAGCAACTTGGAGGGGAAATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTCGAAGGGA 1944
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743 AAGAGCAACTCGGAGGGGAAATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTCGAAGGGA 1802
Query 1945 TATCTTACTTGCTATGTGCTCTTGGAGATGGCCATCTTTTGAACTTCCAGATGGATACAA 2004
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1803 TATCTTACTTGCTCTGTGCTCTTGGAGATGGCCATCTTTTGAACTTCCAGTTGGATACAA 1862
Query 2005 CTACCGGACAATTAAAAGACAGGAAAAAAGTATCACTCGGGACTCAGCCTATAACTCTGC 2064
||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1863 CTACCGGGCAGTTGAAAGACAGGAAAAAAGTATCACTAGGGACTCAGCCTATAACTCTGC 1922
Query 2065 GTACATTTTCATCAAAAAGCGCCACACATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAACCGTGA 2124
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 GTACTTTTTCATCAAAAAGCGCCACACATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAACCGTGA 1982
Query 2125 TCTATAGCAGCAACAAGAAGCTGTTATATAGCAATGTCAATCTTAAAGAAGTTAGTCATA 2184
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983 TCTATAGCAGCAACAAGAAACTGTTATACAGCAATGTCAATCTTAAAGAAGTTAGTCATA 2042
Query 2185 TGTGCCCTTTCAATTCTGCTGCTTTTCCCGACAGTTTAGCAATTGCCAGGGAAGGTGAAC 2244
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043 TGTGCCCTTTCAACTCTGCTGCTTTTCCCGACAGTTTAGCAATTGCCAGGGAAGGTGAAC 2102
Query 2245 TTACGATTGGAACCATTGATGATATTCAGAAGCTTCACATACGTACTATTCCTCTTGGAG 2304
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2103 TTACGATTGGTACCATTGATGATATTCAGAAGCTTCACATACGCACTATTCCTCTTGGAG 2162
Query 2305 AGCATGCTCGTCGAATTTGCCATCAGGAGCAGACACGTACATTTGGTATCTGCAGTTTGG 2364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 AGCATGCTCGTCGAATTTGCCATCAGGAGCAGACACGTACATTTGGTATCTGCAGTTTGG 2222
Query 2365 GAAACCAGTCAAATTCCGAAGAATCTGAAATGCACTTTGTCCGTCTTTTGGACGACCAGA 2424
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2223 GAAACCAGTCAAATGCCGAAGAATCTGAAATGCACTTTGTCCGTCTTTTAGACGACCAGA 2282
Query 2425 CTTTCGAGTTTATGTCAACTTACCCCTTGGATTCCTTTGAATATGGTTGTTCAATTCTGA 2484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||
Sbjct 2283 CTTTCGAGTTTATGTCAACTTACCCCTTGGATTCCTTTGAATACGGTTGCTCCATTCTGA 2342
Query 2485 GCTGCTCATTCACCGAAGATAAAAATGTCTATTACTGCGTTGGAACCGCATATGTTTTAC 2544
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2343 GCTGCTCATTCACCGACGATAAAAATGTCTATTACTGCGTTGGAACCGCATATGTTTTAC 2402
Query 2545 CGGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATATTAGTATTTATAGTCGAAGATGGGAGGT 2604
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2403 CGGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATATTAGTATTTATAGTTGAAGATGGGAGGT 2462
Query 2605 TGCAGCTAATCGCCGAGAAAGAAACCAAAGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTTAATG 2664
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2463 TGCAGTTAATCGCCGAGAAAGAAACCAAAGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTTAATG 2522
Query 2665 GAAAACTTCTTGCTGCTATTAATCAGAAGATTCAGTTGTACAAGTGGATGCTGAGGGATG 2724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2523 GAAAACTTCTTGCTGCTATTAATCAGAAGATTCAGTTGTACAAGTGGATGCTGCGGGATG 2582
Query 2725 ATGGCACTCGTGAACTGCAGTCTGAATGCGGACATCACGGACACATTCTAGCTCTCTATG 2784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2583 ATGGCACTCGTGAACTGCAGTCTGAATGCGGACATCACGGACACATTCTAGCTCTCTATG 2642
Query 2785 TGCAGACCCGTGGAGACTTTATAGTTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCCTTATTGC 2844
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2643 TACAGACCCGTGGAGACTTTATCGTTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCCTTATTGT 2702
Query 2845 TATACAAGCACGAGGAAGGTGCAATTGAGGAGCGGGCTCGGGATTACAATGCAAATTGGA 2904
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2703 TATACAAGCACGAGGAAGGTGCAATTGAGGAGCGGGCTCGGGATTACAATGCGAATTGGA 2762
Query 2905 TGTCAGCGGTTGAGATACTCGATGATGATATTTACCTCGGTGCTGAGAACAATTTCAATC 2964
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2763 TGTCAGCGGTTGAGATACTAGATGATGATATTTACCTCGGTGCTGAGAACAATTTCAATC 2822
Query 2965 TGTTAACAGTGAAAAAGAACAGTGAAGGTGCTACTGATGAAGAACGAGGACGGTTAGAGG 3024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2823 TGTTAACAGTGAAAAAGAACAGTGAAGGTGCTACTGATGAAGAACGAGGACGGTTGGAGG 2882
Query 3025 TAGTTGGAGAGTATCACCTTGGGGAATTTGTGAACAGATTCCGCCATGGATCTCTAGTAA 3084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883 TAGTTGGAGAGTATCACCTTGGGGAATTTGTGAACAGATTCCGCCATGGATCTCTAGTAA 2942
Query 3085 TGAGGCTACCTGATTCAGAGATTGGTCAGATCCCAACTGTCATCTTTGGTACAGTCAATG 3144
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2943 TGAGGCTACCTGATTCAGAGATTGGTCAGATCCCAACTGTCATCTTTGGTACCGTCAATG 3002
Query 3145 GAGTGATTGGAGTAATAGCTTCACTTCCTCAAGAACAATATACTTTCTTGGAGAAGTTGC 3204
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3003 GAGTGATAGGAGTAATAGCTTCACTTCCTCAAGAACAGTATACTTTCTTGGAGAAGTTGC 3062
Query 3205 AGTCAAGTTTGAGAAAAGTGATTAAAGGAGTCGGCGGATTAAGCCACGAGCAATGGAGGT 3264
|||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3063 AGTCGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGGAGTTGGCGGATTAAGCCACGAGCAATGGAGGT 3122
Query 3265 CGTTTAATAACGAGAAAAGAACCGCGGAAGCGAGGAATTTCTTGGATGGTGACTTAATCG 3324
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3123 CGTTTAATAACGAGAAAAGAACCGCAGAAGCGAGGAATTTCTTGGATGGTGACTTAATCG 3182
Query 3325 AATCGTTTCTGGATCTGAGTAGAAACAAGATGGAGGATATATCGAAATCCATGAATGTTC 3384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AATCGTTTCTGGATCTGAGTAGAAACAAGATGGAGGATATATCGAAATCCATGAATGTTC 3242
Query 3385 AAGTGGAGGAGTTGTGTAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTGAGTCAAATCAA 3444
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3243 AAGTGGAAGAGTTGTGTAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTGAATCAAATCAA 3302
Query 3445 TC 3446
||
Sbjct 3303 TC 3304
> Ahg492777 jgi|Araly1|492777|fgenesh2_kg.7__2210__AT4G21100.1
Length=3357
Score = 3807 bits (2061), Expect = 0.0
Identities = 2890/3295 (88%), Gaps = 38/3295 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 159 AAGAGGAAGATGAGC-TCATGGAACTACGTTGTTACGGCTCACAAACCGACCAGTGTCAC 217
|||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 82 AAGAAGAAAATGAGCGT-ATGGAACTACGCCGTTACGGCTCAAAAACCGACCTGTGTCAC 140
Query 218 TCACTCGTGCGTTGGCAACTTCACAAGTCCTCAAGAGCTCAATCTCATTGTCGCGAAATG 277
|||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 141 TCACTCTTGCGTCGGAAACTTCACCAGTCCTCAAGAACTCAATCTCATTGTTGCGAAATC 200
Query 278 TACTCGAATCGAGATCCATTTGCTTACCCCACAAGGACTTCAGCCTATGTTGGACGTTCC 337
|||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| |||| |||||
Sbjct 201 CACTCGAATCGAGATCCATCTGCTTTCTCCACAGGGACTTCAGACTATACTGGATGTTCC 260
Query 338 TATATATGGAAGAATCGCTACTCTGGAGTTGTTCCGACCCCATGGCGAAGCGCAAGACTT 397
| ||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 261 TCTATATGGGAGGATCGCCACTTTGGAATTGTTCCGTCCCCATGGTGAAGCACAAGATTT 320
Query 398 TTTGTTCATTGCAACTGAGAGATACAAATTCTGTGTTCTTCAATGGGATCCTGAGTCCTC 457
|||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 321 TTTGTTTGTTGCAACTGAGAGATATAAATTCTGCGTTCTTCAATGGGATTATGAGTCCTC 380
Query 458 TGAGCTTATTACAAGAGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGGCCAACAGACAA 517
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 381 TGAGCTTATAACAAGGGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCGACGGACAA 440
Query 518 TGGTCAGATTGGTATAATTGATCCAGATTGTAGATTAATTGGACTCCATCTGTATGACGG 577
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 441 TGGTCAGATTGGTATAATTGATCCTGATTGCAGATTAATTGGTCTGCATCTGTATGACGG 500
Query 578 CTTGTTCAAGGTTATTCCATTTGATAATAAGGGACAGCTCAAGGAAGCTTTTAATATCAG 637
|||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 501 CTTGTTTAAGGTCATTCCATTTGACAATAAAGGACAGCTCAAGGAAGCTTTTAACATAAG 560
Query 638 GCTTGAGGAATTGCAGGTTCTGGATATCAAGTTTCTGTTTGGATGTGCAAAGCCCACTAT 697
||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||
Sbjct 561 GCTGGAGGAGTTGCAGGTCCTAGATATCAAGTTTCTGTATGGATGCACGAAGCCAACAAT 620
Query 698 TGCAGTACTATATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTCTCTCT 757
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 621 TGCAGTACTTTATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTTTCTCT 680
Query 758 TAAAG-ATAAGGATTTTGTCGAGGGTCCATGGTCTCAGAACAGTCTCGACAATGGTGCTG 816
|||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 681 -AAAGGAGAAGGACTTTGTCGAAGGTCCATGGTCACAGAACAATCTCGATAATGGTGCTG 739
Query 817 ACTTGCTGATTCCTGTACCACCACCGCTCTGTGGTGTCCTTATTATTGGTGAAGAAACAA 876
|||| |||| |||||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 740 ACTTATTGATCCCTGTACCTTCTCCTCTGTGTGGCGTCCTCATCATTGGAGAAGAAACAA 799
Query 877 TTGTCTATTGCAGTGCTAGTGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTTCCATCACTAAAG 936
|||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 800 TTGTCTATTGTAGTGCCAATGCATTCAAAGCAATCCCAATAAGACCTTCCATCACAAAAG 859
Query 937 CATATGGAAGAGTTGATGTTGATGGCTCTAGATATCTTCTTGGTGACCATGCTGGAATGA 996
||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||
Sbjct 860 CATATGGAAGAGTTGATCTTGATGGTTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATACCGGACTGA 919
Query 997 TTCATCTGCTTGTTATAACGCACGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTAAAAATTGAGCTTT 1056
|||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 920 TTCACCTGCTTGTTATAACCCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTCAAAATTGAGCTTT 979
Query 1057 TGGGTGAAACATCTATTGCATCGACTATATCGTACCTTGACAATGCCGTTGTCTTTGTCG 1116
|||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 980 TGGGTGAAACCTCTATTGCATCTTCCATCTCGTATCTTGACAATGCTGTCGTCTTTGTCG 1039
Query 1117 GCTCAAGCTATGGTGATTCACAGCT-AGTAAAGCTGAATCTA-CACCCTGATGCAAAAGG 1174
| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || || || || |||||||||||
Sbjct 1040 GTTCAAGCTATGGAGATTCACAGCTTATTAA-GCTAAA-CTTGCAACCGGATGCAAAAGG 1097
Query 1175 CTCATATGTAGAAGTCTTGGAAAGGTATATCAACTTGGGGCCTATTGTCGACTTTTGTGT 1234
||||| |||||| | || |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1098 TTCATACGTAGAAATTTTAGAAAAGTATGTCAACCTGGGGCCTATTGTTGACTTCTGTGT 1157
Query 1235 AGTTGACCTCGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGTTCTGGAGCATTTAAGGA 1294
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 1158 AGTTGACCTTGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGCTCTGGAGCATACAAGGA 1217
Query 1295 TGGTTCCCTCCGCGTAGTTCGCAATGGAATAGGAATCAATGAACAGGCGTCTGTGGAACT 1354
|||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1218 TGGTTCTCTTCGCATAGTTCGCAATGGGATAGGAATAAATGAACAGGCGTCCGTGGAACT 1277
Query 1355 TCAAGGTATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCTTCAATTGATGAAGCCTTCGATACATT 1414
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1278 TCAAGGCATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCGTCAATTGATGAAGCCTTTGATACATT 1337
Query 1415 TCTTGTTGTTAGCTTTATCAGTGAAACTCGCATATTAGCCATGAATCTTGAGGATGAACT 1474
||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1338 CCTTGTAGTTAGTTTTATCAGTGAAACTCGTATACTAGCCATGAATATAGAGGATGAACT 1397
Query 1475 GGAAGAAACAGAGATTGAGGGCTTCTTGTCTCAAGTGCAGACGTTATTTTGCCATGATGC 1534
|||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1398 GGAAGAAACAGAGATTGAAGGTTTCTTGTCTGAAGTGCAGACTTTATTTTGCCATGATGC 1457
Query 1535 TGTGTACAATCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGACTAGTCAGTTCTACAAC 1594
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1458 TGTCTACAACCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGATTAGTTAGTTCTACAAC 1517
Query 1595 TAGAGAATTGCGGGACGAGTGGCATGCCCCAGCTGGATTCACTGTTAATGTTGCAACTGC 1654
||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1518 TAGAGAATTGCGGAATAAGTGGGATGCCCCAGCTGGATTCGCTGTTAATGTTGCAACTGC 1577
Query 1655 AAATGCCAGCCAGGTTCTTTTGGCGACTGGAGGTGGGCATTTGGTTTATCTAGAAATTGG 1714
|||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1578 AAATGCTAGCCAGGTGCTTTTGGCCACTGGAGGTGGGCATTTGGTCTATCTAGAAATTGG 1637
Query 1715 AGATGGGAAATTGACGGAAGTGCAA-CATGCCCTTTTGGAGTACGAGGTTTCCTGTCTTG 1773
||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 GGATGGGACATTGACGGAAGT-CAAACATGTCCTGTTGGAGTACGAGGTTTCCTGTCTTG 1696
Query 1774 ATATAAACCCTATCGGTGACAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCGGTTGGGATGTGGA 1833
| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1697 ACATAAACCCCATTGGCGATAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCAGTCGGGATGTGGA 1756
Query 1834 CAGATATAAGTGTGAGGATCTTT-TCGCTGCCAGAATTGACTCTTATTACAAAAGAGCAA 1892
| ||||||||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1757 CTGATATAAGTGTGAGGATTTTTGT-GCTGCCGGACTTGACTCTTATTACTAAGGAGCAA 1815
Query 1893 CTTGGAGGGGAAATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTCGAAGGGATATCTTAC 1952
|| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1816 CTAGGAGGAGAGATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTTGAAGGGATATCTTAC 1875
Query 1953 TTGCTATGTGCTCTTGGAGATGGCCATCTTTTGAACTTCCAGATGGATACAACTACCGG- 2011
||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| || |||
Sbjct 1876 TTGCTCTGTGCTCTTGGAGATGGTCATCTCTTAAACTTCCAGTTGGATACAAGTAGCGGG 1935
Query 2012 ACAATTAAAAGACAGGAAAAAAGTATCACTCGGGACTCAGCCTATAACTCTGCGTACATT 2071
| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1936 A-AATTAAGAGACCGGAAAAAAGTATCACTTGGGACTCAGCCTATAACTCTGCGTACTTT 1994
Query 2072 TTCATCAAAAAGCGCCACACATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAACCGTGATCTATAG 2131
|||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||
Sbjct 1995 TTCATCTAAAAGTGCAACGCATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAGCTGTTATATATAG 2054
Query 2132 CAGCAACAAGAAGCTGTTATATAGCAATGTCAATCTTAAAGAAGTTAGTCATATGTG-CC 2190
|| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2055 CAACAACAAGAAGCTGTTATACAGCAACGTGAATCTGAAAGAAGTTAGTCATATGTGTCC 2114
Query 2191 CTTTCAATTCTGCTGCTTTTCCCGACAGTTTAGCAATTGCCAGGGAAGGTGAACTTACGA 2250
||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 2115 CTT-CAACTCTGCTGCTTTTCCAGACAGTCTAGCAATTGCAAGGGAAGGCGAACTTACAA 2173
Query 2251 TTGGAACCATTGATGATATTCAGAAGCTTCACATACGTACTATTCCTCTTGGAGAGCATG 2310
|||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 2174 TTGGCACCATCGATGACATTCAGAAGCTTCACATACGTACCATTCCTATTGGAGAGCATG 2233
Query 2311 CTCGTCGAATTTGCCATCAGGAGCAGACACGTACATTTGGTATCTGCAGTTTGGGAAACC 2370
||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2234 CTCGTCGCATATGCCATCAGGAACAAACACGGACATTTGCTATCTGCTGTTTGAGAAACC 2293
Query 2371 AGTCAAATTCCGAAGAATCTGAAATGCACTTTGTCCGTCTTTTGGACGACCAGACTTTCG 2430
| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| | |||||
Sbjct 2294 AACCAAGTGCAGAAGAATCTGAAATGCATTTTGTCCGTCTGCTGGATGCCCAAAGTTTCG 2353
Query 2431 AGTT-TATGTCAACTTACCCCTTGGATTCCTTTGAATATGGTTGTTCAAT-TCTGAGCTG 2488
|||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || || | |||||||
Sbjct 2354 AGTTCT-TGTCAACTTACCCTTTGGATGCCTTTGAATACGGTTGCTCCATAT-TGAGCTG 2411
Query 2489 CTCATTCACCGAAGATAAAAATGTCTATTACTGCGTTGGAACCGCATATGTTTTACCGGA 2548
||| || || || || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||
Sbjct 2412 CTCGTTTACAGACGACAAAAATGTCTATTATTGTGTTGGTACGGCATATGTTTTGCCCGA 2471
Query 2549 GGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATATTAGTATTTATAGTCGAAGATGGGAGGTTGCA 2608
|||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||
Sbjct 2472 GGAAAATGAACCCACTAAGGGAAGGATACTGGTGTTTATAGTTGAAGAAGGGAGATTGCA 2531
Query 2609 GCTAATCGCCGAGAAAGAAACCAAAGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTTAATGGAAA 2668
||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||
Sbjct 2532 GCTTATTACAGAGAAGGAAACCAAGGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTCAACGGCAA 2591
Query 2669 ACTTCTTGCTGCTATTAATCAGAAGATTCAGTTGTACAAGTGGATGCTGA-GGGATGATG 2727
||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2592 ACTTCTTGCTGCTATTAATCAAAAAATTCAGTTGTATAAGTGGATGCT-ACGGGATGATG 2650
Query 2728 GCACTCGTGAACTGCAGTCTGAATGCGGACATCACGGACACATTCTAGCTCTCTATGTGC 2787
||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2651 GCACTCGCGAGCTGCAGTCTGAATGTGGACATCACGGTCACATACTAGCTCTCTACGTGC 2710
Query 2788 AGACCCGTGGAGACTTTATAGTTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCCTTATTGCTAT 2847
|||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |
Sbjct 2711 AGACCCGTGGAGACTTCATCGTCGTTGGTGACCTCATGAAATCAATCTCTTTATTGATCT 2770
Query 2848 ACAAGCACGAGGAAGGTGCAATTGAGGAGCGGGCTCGGGATTACAATGCAAATTGGATGT 2907
||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 2771 ACAAGCACGAGGAAGGTGCGATCGAGGAAAGAGCTCGGGACTATAATGCAAACTGGATGG 2830
Query 2908 CAGCGGTTGAGATACTCGATGATGATATTTACCTCGGTGCTGAGAACAATTTCAATCTGT 2967
| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |
Sbjct 2831 CGGCAGTTGAGATACTCGATGATGACATCTACCTCGGTGCTGATAATTGCTTCAACCTAT 2890
Query 2968 TAACAGTGAAA-AAGAACAGTGAAGGTGCTACTGATGAAGAACGAGGA-CGGT-TAGAGG 3024
| ||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| || || | | ||||
Sbjct 2891 TCACAGT-AAAGAAGAACAATGAAGGTGCCACAGATGAAGAACG-GGCTCG-TATGGAGG 2947
Query 3025 TAGTTGGAGAGTATCACCTTGGGGAATTTGTGAACAGATTCCGCCATGGATCTCTAGTAA 3084
| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 2948 TCGTTGGTGAGTATCACATAGGGGAATTTGTGAACCGATTCCGCCATGGCTCTCTTGTTA 3007
Query 3085 TGAGGCTACCTGATTCAGAGATTGGTCAGATCCCAACTGTCATCTTTGGTACAGTCAATG 3144
||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||| ||
Sbjct 3008 TGAGGCTTCCTGATTCAGAGATTGGTCAGATACCGACCGTCATATTTGGCACTGTCAGTG 3067
Query 3145 G-AGTGATTGGAGTAATAGCTTCACTTCCTCAAGAACAATATAC-TTTCTTGGAGAAGTT 3202
| | |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| | |||| |
Sbjct 3068 GGA-TGATTGGAGTGATAGCTTCTCTGCCTCAAGAACAGTATGCGTTTCTAG-AGAAACT 3125
Query 3203 GCAGTCAAGTTTGAGAAAAGTGATTAAAGGAGTCGGCGGAT-TAAGCCACGAGCAATGGA 3261
|||| | ||| |||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||
Sbjct 3126 GCAGACGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGGAGTTGGTGG-TCTAAGCCACGAGCAATGGA 3184
Query 3262 GGTCGTTTAATAACGAGAAAAGAACCGCGGAAGCGAGGAATTTCTTGGATGGTGA-CTTA 3320
| || || || |||||||||||||| |||||||| | || || ||||||||| || || |
Sbjct 3185 GATCATTCAACAACGAGAAAAGAACTGCGGAAGCAAAGAGTTACTTGGATGGAGATCT-A 3243
Query 3321 ATCGAATCGTTTCT-GGATCTGAGTAGAAACAAGATGGAGGATATATCGAAATCCATGAA 3379
|| |||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||| || || ||| ||| |
Sbjct 3244 ATTGAATCGTT-CTTGGATTTGAGCAGAGGTAAGATGGAGGAGATCTCTAAAGGTATGGA 3302
Query 3380 TGTTCAAGTGGAGGAGTTGTGTAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTGA 3434
||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3303 TGTCCAAGTGGAAGAGTTGTGCAAGAGAGTTGAAGAACTAACTAGGCTTCACTGA 3357
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 140318271651
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5