BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G08370.1 Length=1053 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg327089 jgi|Araly1|327089|fgenesh1_pm.C_scaffold_6002309 401 4e-111 Ahg921634 jgi|Araly1|921634|scaffold_102915.1 307 9e-83 Ahg942633 jgi|Araly1|942633|scaffold_603177.1 73.1 4e-12 > Ahg327089 jgi|Araly1|327089|fgenesh1_pm.C_scaffold_6002309 Length=888 Score = 401 bits (217), Expect = 4e-111 Identities = 331/384 (86%), Gaps = 15/384 (4%) Strand=Plus/Plus Query 515 TCTACAGCTCTCCACCACCA---CCTCCATATGTTTACAACTCTCCACCACCACCTCCAT 571 |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 296 TCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACTACCTCCAT 355 Query 572 ATGTTTA-CGAGTCTGTTCCTCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCA 630 ||||||| | ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 356 ATGTTTATC-TTTCTCCTCCTCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATCCCCTCCA 414 Query 631 TATGTTTA-CAATTCTGCTCCTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCC 689 |||||||| | | ||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 415 TATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCC 473 Query 690 ATATGTTTACAATTCT-GCTCCTCGT-GTTCCATTTATCTACAGCTCTCCACCACCACCT 747 |||||||||||| ||| || || | | |||||| |||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 474 ATATGTTTACAAGTCTACCT-TTCATCG-TCCATTCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCT 531 Query 748 CCATATGTTTACAAGTCTGTTCC-TCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCC 806 ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 532 CCATATGTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCC 590 Query 807 TCCATATGTTTACAATTCTGCTCCT-CGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCTACCACCTC 865 ||||||||||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct 591 TCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCC 649 Query 866 CTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 889 |||||||||||||||| ||||||| Sbjct 650 CTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673 Score = 396 bits (214), Expect = 2e-109 Identities = 378/453 (83%), Gaps = 27/453 (6%) Strand=Plus/Plus Query 515 TCTACAGCTCTCCACCACCA-C-C-TCCATATGTTTACAACTCTCCACCACCA---CCTC 568 |||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||| ||||||||||||| |||| Sbjct 230 TCTACAACTCTCCACCACCACCTCTTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCTC 289 Query 569 CATATGTTTACGAG-TCT---GTTCCTCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCC 624 |||| || ||| || ||| || | | ||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 290 CATACGTCTAC-AGCTCTCCACCACCACCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACTA 348 Query 625 CCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCTCCTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCA-C 682 |||||||||||||| | |||| |||||| | || ||||| |||| |||||||||||| | Sbjct 349 CCTCCATATGTTTATC-TTTCTCCTCCTCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATC 407 Query 683 CTCCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCTCCTCGTGTTCCATTTATCTACAGCTCTCCACCA 741 | |||||||||||||| | | ||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 408 C-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCA 465 Query 742 CCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCC--TCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCAC 799 || |||||||||||||||||||| | || || | ||||||||||||||||||| ||| Sbjct 466 CCGCCTCCATATGTTTACAAGTC--TACCTTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGCAC 523 Query 800 CACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCC-TCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCTA 858 |||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||| | Sbjct 524 CACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCA 582 Query 859 CCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCC-TCGT-GTTCCATTCATCTACAGCTCTC 916 ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || | | |||||||||||| ||||||| Sbjct 583 CCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCG-TCCATTCATCTATAGCTCTC 640 Query 917 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 949 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 641 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673 Score = 379 bits (205), Expect = 2e-104 Identities = 362/434 (83%), Gaps = 25/434 (6%) Strand=Plus/Plus Query 596 TTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCA-C-CC-CCTCCATATGTTTACA-AT-T-CTGCTC 649 |||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||| || |||| | | | | | Sbjct 254 TTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCAC 313 Query 650 CTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCT-CCTCCATATGTTTA-CAATTCTGC 707 | | | ||||| | |||| |||||||||||| || |||||||||||||| | |||| | Sbjct 314 CACCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCA-CTACCTCCATATGTTTATC-TTTCTCC 371 Query 708 TCCTCGTGTTCCATTTATCTACAGCTCTCCACCA-CCACCTCCATATGTTTA-CAAGTCT 765 ||||| | || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| Sbjct 372 TCCTCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATCC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCT 429 Query 766 GTTCCTCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCT 825 |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 430 CCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCT 489 Query 826 -GCTCCTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCT-CTACCACCTCCTCCATATGTTTACAATT 883 || || | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 490 ACCT-TTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGC-ACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGT 547 Query 884 CTGCTCC-TCGT-GTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAA 941 |||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 548 CTGC-CCTTCATCG-TCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAA 605 Query 942 TTCTGCTCCT-CGTATTCCATTTATCTATAGTTCTCCACCACCCCA-CCATATGTTTACA 999 ||||| ||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 606 GTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACA 664 Query 1000 AGTTTGTTCCTCAT 1013 ||| || || |||| Sbjct 665 AGTCTGCTCTTCAT 678 Score = 339 bits (183), Expect = 3e-92 Identities = 461/584 (79%), Gaps = 64/584 (11%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGTCAATCCTAGTAATTGGCCATC-TCTTCTAATGTTGGTCTTAGCCTTCTATGTCGT 59 |||| |||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||| ||||| |||||||| Sbjct 1 ATGGCCAATACTAGTAATTTGCCATCAT-TTCTTATGTTGGCCTTGGCCTTGTATGTCGT 59 Query 60 TGTAGTGCCTACAAGTGCTCAGTGCAAATACTCTCCACAATCA-C-C-A-C------C-- 107 || || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | | | Sbjct 60 TGCAGCACATACAAGTGCTCAGTGCAAATACTCTCCACCATCACCACTACCGTATGTCTA 119 Query 108 -A-----CCACAACCATATGTCTACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTC 161 | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 TAGTTCTCCACCACCATATGTCTACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTC 179 Query 162 TCCACCACCATCTCCTTATCTCTATAGCTCCCCACCACCACCTCCATACGTATACAACTC 221 ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| Sbjct 180 TCCCCCACCGGCTCCTTACCTCTATAGCTCCCCACCACCTCCACCATACGTCTACAACTC 239 Query 222 TCCACCACCACCTCCTCCATACATCTACAACTCTCCACCACGACCTCC---ATATGTTTA 278 |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| || || Sbjct 240 TCCACCACCACCTCTTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCTCCATACGTCTA 299 Query 279 TAAG-TCTCC-CC-CT-CCTCCTCCATTCGTGTACAGCTCTCCACCACCCCCTACATATA 334 | | ||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct 300 CA-GCTCTCCACCACCACCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACTACCTCCATATG 358 Query 335 TTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCCTCGTATTACATTCA 394 |||| || || || || |||| | | | || || || | | | || | Sbjct 359 TTTAT--CTTTCT-CCTCCTCCTC--T-T-T---CAT-TC-GT-C-T---A---CAG-C- 396 Query 395 TCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCTCCTCGTATTCCATTC 453 ||| || | | | | ||| |||||||||||| || | || | |||| | |||||||| Sbjct 397 TCTCCA-C-C---ATC-CCC--TCCATATGTTTATCAGT-CTCCCCCTCCTTTTCCATTC 447 Query 454 ATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCT-CGT-GTTCTAT 511 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | | | || | || Sbjct 448 ATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCTAC-CTTTCATCGTCC-AT 505 Query 512 TTATCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACAACTCT 555 | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 506 TCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCT 549 Score = 329 bits (178), Expect = 2e-89 Identities = 366/453 (81%), Gaps = 27/453 (6%) Strand=Plus/Plus Query 395 TCTACAGCTCTCCACCACC-CC-C-TCCATATGTTTACA-AT-T-CTGCTCCTCGTATTC 448 |||||| |||||||||||| || | |||||| || |||| | | | | || | | || Sbjct 230 TCTACAACTCTCCACCACCACCTCTTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCTC 289 Query 449 CATTCATCTATAGCTCT---CCACCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCTCGT- 504 ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| | || | | Sbjct 290 CATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCAC-TA 348 Query 505 GTTCTATTTATCTA-CAGCTCTCCACCACCACCTCCATAT-GTTTACAACTCTCCACCA- 561 || || | | || | ||||| || || | | ||| | || |||| |||||||||| Sbjct 349 CCTCCATATGTTTATC-TTTCTCCTCCTCCTCTTTCAT-TCGTCTACAGCTCTCCACCAT 406 Query 562 CCACCTCCATATGTTTA-CGAGTCTGTTCCTCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACC 620 || |||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 407 CC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACC 464 Query 621 ACCCCCTCCATATGTTTACAATTCT-GCTCCTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCAC 679 ||| ||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||||| |||||| ||| Sbjct 465 ACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCTACCT-TTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGCAC 523 Query 680 CACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCC-TCGT-GTTCCATTTATCTACAGCTCTCC 737 |||||||||||||||||||||| ||||| || || | | |||||| |||||||||||||| Sbjct 524 CACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCG-TCCATTCATCTACAGCTCTCC 581 Query 738 ACCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCC-TCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTC 796 |||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||| Sbjct 582 ACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTC 640 Query 797 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 829 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 641 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673 Score = 305 bits (165), Expect = 3e-82 Identities = 372/468 (79%), Gaps = 29/468 (6%) Strand=Plus/Plus Query 605 TCTACAGCT-CTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCC-TCGTATTCCATT 662 ||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| ||| | || || ||| || Sbjct 140 TCTACAG-TCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCCCCACCG-GCTCC-TT 196 Query 663 -CATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAA-T-T-CTGCTCCTCGTGTTC 718 | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | | | | || | | ||| Sbjct 197 ACCTCTATAGCTCCCCACCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTCTTC 256 Query 719 CATTTATCTACAGCTCTCCACCACCA---CCTCCATATGTTTACAAG-TCT---GTTCCT 771 ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||| || Sbjct 257 CATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCTCCATACGTCTAC-AGCTCTCCACCACCA 315 Query 772 CGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCTCC 830 | | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| Sbjct 316 CCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACTACCTCCATATGTTTATC-TTTCTCCTCC 374 Query 831 TCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCTACCA-CCTCCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCT 888 || | || ||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||||| | | ||| | Sbjct 375 TCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATCC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCC 432 Query 889 CCTCGTGTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCT 948 |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | Sbjct 433 CCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCTAC- 491 Query 949 CCT-CGTATTCCATTTATCTATAGTTCTCCACCACC-CCACCATATGTTTACAAGTTTGT 1006 | | | | |||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||| || Sbjct 492 CTTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC 551 Query 1007 TCCT-CATATTCCAT-CATCTACAACTCTCCACCACCCCCTCCATATG 1052 ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 552 -CCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATG 598 Score = 228 bits (123), Expect = 8e-59 Identities = 322/414 (78%), Gaps = 30/414 (7%) Strand=Plus/Plus Query 101 CACCACCACCACAACCATATGTCTACAG-TC-CC-CCACTACCAT-CTCCATATGTTTAC 156 |||||||||| | ||||| |||||||| || || |||| ||| | ||||||| || ||| Sbjct 275 CACCACCACCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACC-TCCTCCATACGTCTAC 333 Query 157 AAG-TCTCCACCACCATCTCCTTATCTCTATAGCTCCCCACCACCACCTCCATACGTATA 215 || |||||||||| | |||| ||| | ||| || || || || | | ||| ||| || Sbjct 334 -AGCTCTCCACCACTACCTCCATATGTTTATCTTTCTCCTCCTCCTCTTTCATTCGTCTA 392 Query 216 CAACTCTCCACCACCACCTCCTCCATACATCTA-CAACTCTCCACCACGACCTCCATATG 274 || |||||||||| || |||||||| | || | | ||||| || | ||||| | Sbjct 393 CAGCTCTCCACCA--TCC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCAT-T- 446 Query 275 TTTATA-AG-TCTCCCCCTCCTCCTCCAT-TCGTGTAC-AGCTCTCCACC--ACCCCCTA 328 | || || ||||| || || ||||||| | || ||| || ||| ||| | | | Sbjct 447 CATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCCATAT-GTTTACAAG-TCT--ACCTTTCATCGTC 502 Query 329 CATAT-ATTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCC-TCGTAT 386 ||| | || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || | Sbjct 503 CAT-TCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCG 560 Query 387 TACATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCT-CGTA 445 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | Sbjct 561 TCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATC 619 Query 446 TTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 499 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 620 GTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673 Score = 219 bits (118), Expect = 5e-56 Identities = 419/558 (75%), Gaps = 46/558 (8%) Strand=Plus/Plus Query 178 TATCTCTATAGCT-CCCCACCACCACCTCCATACGTATACAACTCTCCACCACCACCTCC 236 ||| |||| || | |||||| |||| ||||||| || ||||| ||| | || ||||| | Sbjct 136 TATGTCTACAG-TCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCT-C-CC-CCACCGGC 191 Query 237 TCCATACATCTACAACTCTCCACCACGACCTCCATATGTTTATAAGTCT-C-CC-CCTCC 293 ||| ||| |||| | ||| ||||||| || ||||| || || || ||| | || || || Sbjct 192 TCCTTACCTCTATAGCTCCCCACCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACC 251 Query 294 TCCTCCATTCGTGTACAGCTCTCCACCA-C-CC-CCTACATATATTTACAACTCTCCACC 350 || ||||| ||| ||||||||||||||| | || ||| |||| | |||| ||||||||| Sbjct 252 TCTTCCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCTCCATACGTCTACAGCTCTCCACC 311 Query 351 ACCA---CCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCCTCGTATTACATTC--ATCTACAGC--T 403 |||| |||||||| || ||| || || ||| | | ||| | | || | | | | Sbjct 312 ACCACCTCCTCCATACGTCTAC-AG-CT-CTCCAC-CACTACCTCCATATGTTTATCTTT 367 Query 404 CTCCACCACCCCCTCCATAT-GTTTACAATTCTGCTCC-TCGTATTCCAT-TCATCTAT- 459 |||| || || | | ||| | || |||| ||| | || || ||||| | | ||| Sbjct 368 CTCCTCCTCCTCTTTCAT-TCGTCTACAGCTCTCCACCATC-CCCTCCATAT-GTTTATC 424 Query 460 AGCTCTCCACCACCTCCTCCATAT-GTTTACAATTCTGCTCC-TCGTGTTCTATTTATCT 517 || ||||| || ||| ||||| | | |||| ||| | || || || || | | | Sbjct 425 AG-TCTCCCCCTCCTTTTCCAT-TCATCTACAGCTCTCCACCACCG-CCTCCATATGTTT 481 Query 518 AC-AGCTCTCCACC-ACCA-CCTCCATAT-GTTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATAT 573 || || ||| ||| || | ||||| | | |||| |||| ||||||| ||||||||| Sbjct 482 ACAAG-TCT--ACCTTTCATCGTCCAT-TCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATAT 537 Query 574 GTTTACGAGTCTGTTCC-TCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATA 632 |||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 GTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATA 596 Query 633 TGTTTACAATTCTGCTCCT-CGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCAT 691 ||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 597 TGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCAT 655 Query 692 ATGTTTACAATTCTGCTC 709 |||||||||| ||||||| Sbjct 656 ATGTTTACAAGTCTGCTC 673 Score = 135 bits (73), Expect = 5e-31 Identities = 284/377 (75%), Gaps = 49/377 (13%) Strand=Plus/Plus Query 101 CACCACCACCACAACCATATGTCTACAGTC-CCCCACTACCATCTCCATATGTTTA-CAA 158 |||||||||| | ||||| |||||||| | | |||| || | ||||||||||||| | Sbjct 308 CACCACCACCTCCTCCATACGTCTACAG-CTCTCCACCACTACCTCCATATGTTTATC-T 365 Query 159 GTCTCCACCACCATC-TCCTTATC-TCTATAGCTCCCCACCA-CCACCTCCATACGTATA 215 ||||| || || || | | | || |||| ||||| |||||| || |||||||| || || Sbjct 366 TTCTCCTCCTCC-TCTTTCAT-TCGTCTACAGCTCTCCACCATCC-CCTCCATATGTTTA 422 Query 216 -CAACTCTCCACCACCACCTCCTCCATACATCTACAACTCTCCACCA-CGACCTCCATAT 273 | | ||| | || || ||| ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| Sbjct 423 TC-AGTCT-C-CC-CCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCG-CCTCCATAT 477 Query 274 GTTTATAAGTCT-CC--CCCTCCTCC-TCCAT-T-C-G---TGTA-CAGCT-CTCC---- 317 ||||| |||||| || | || ||| | ||| | | | || | || || |||| Sbjct 478 GTTTACAAGTCTACCTTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATAT 537 Query 318 ----ACCA--C--CCCCT-A-CAT--A-T-ATTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATAT 363 || | | ||| | | | | | | || |||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct 538 GTTTACAAGTCTGCCCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATAT 597 Query 364 GTTTACAAGTCTGTTCC-TCGTATTACATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATA 422 ||||||||||||| || || | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 GTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCATA 656 Query 423 TGTTTACAATTCTGCTC 439 ||||||||| ||||||| Sbjct 657 TGTTTACAAGTCTGCTC 673 Score = 130 bits (70), Expect = 2e-29 Identities = 93/104 (89%), Gaps = 2/104 (2%) Strand=Plus/Plus Query 547 TACAACTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACGAGTCTGTTCC-TCGTATTCCATTCAT 605 |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||| Sbjct 571 TACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCAT 629 Query 606 CTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 649 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 630 CTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673 Score = 71.3 bits (38), Expect = 1e-11 Identities = 98/125 (78%), Gaps = 11/125 (9%) Strand=Plus/Plus Query 109 CCACAACCATATGTCTACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACC- 167 |||| |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 757 CCACCACCATACGCCTACAGT---CCACCACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCT 813 Query 168 -ACCATCTCCTT-ATC-T-CT-ATAGCTCCCCACCACCACCTCCATACGTATACAACTCT 222 || ||||| | | | || ||| | ||||| ||| ||||||| || ||||| ||| Sbjct 814 TACT-TCTCCACCACCATACTCATA-CAGTCCACCGCCATCTCCATATGTTTACAAGTCT 871 Query 223 CCACC 227 ||||| Sbjct 872 CCACC 876 Score = 56.5 bits (30), Expect = 4e-07 Identities = 51/60 (85%), Gaps = 5/60 (8%) Strand=Plus/Plus Query 109 CCACAACCATATGTC-TACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACC 167 |||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 821 CCACCACCATA-CTCATACAGT---CCACCGCCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACC 876 > Ahg921634 jgi|Araly1|921634|scaffold_102915.1 Length=928 Score = 307 bits (166), Expect = 9e-83 Identities = 508/668 (76%), Gaps = 44/668 (7%) Strand=Plus/Plus Query 355 CCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCCTCGTATTACATT-CATCTACAGCTCTCCACCACC 413 ||||| ||||| ||||||||| ||||| | || || | ||||||| ||||||||||| Sbjct 14 CCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCTC-CACCACCTTACGTCTACAGTTCTCCACCACC 72 Query 414 CCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCTCGTATTCCATTCA--TCTATAGCTCTCCACCA 471 ||||||||||| ||||| ||| |||| | | ||| || | ||||||||||||||||| Sbjct 73 GCCTCCATATGTCTACAAATCTCCTCCACCTCCTCC-TT-ATGTCTATAGCTCTCCACCA 130 Query 472 CCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCTCGTGTTCTATTTATCTACAGCTCTCCACCA 531 |||||||||||||||||||| ||| |||| | || || ||||||| ||||||||| Sbjct 131 CCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTCTACAGTTCTCCACCA 190 Query 532 CCACCTCCATATGTTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACGAG-TCTGTTCC 590 |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| || || || Sbjct 191 CCACCTCCATATGTCTACAAATCTCCACCACCGCCTCCTTATGTGTAC-AGCTCACCACC 249 Query 591 TCGTATTCCATTCATCT--ACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCT 648 | ||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| || || || | || || Sbjct 250 ACCCCCTCC-TT-ATGTTTACAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAGCTC-GCC 306 Query 649 -CCTCGTAT-TCCAT-TCATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCT 705 || | | ||||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 307 ACCACC-ACCTCCATATG-TCTACAGCTCACCACCGCCTCCTCCATATGTATACAAGTCT 364 Query 706 GCTCCTCGTGTTCCATT-TATCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACAAGTC 764 | || | ||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 365 CCACCACCACCTCC-TTATGTCTACAGCTCGCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTC 423 Query 765 TGTTCCTCGTAT-TCCAT-TCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAT 822 | || | | ||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| Sbjct 424 TCCACCACC-ACCTCCATATG-TCTACAGCTCGCCACCGCCTCCTCCATATGTATACAAG 481 Query 823 TCTGCTCCTCGTAT-TCCATTCAT--CTATAGCTCTCTACCACCTCCTCCATATGTTTAC 879 ||| | || | | ||| || || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct 482 TCTCCACCACC-ACCTCC-TT-ATGTCTACAGCTCGCCACCACCTCCTCCATATGTTTAC 538 Query 880 AATTCTGCTCCTCGTGTTCCATT-CATCTACAGCT---CTCCACCACCCCCTCCATATGT 935 || ||| |||| | ||| || | || | |||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 539 AAGTCTCCTCCACCACCTCC-TTACGTCGATAGCTATTCTCCACCACCGACTCCATATGT 597 Query 936 TTACAATTCTGCTCCTCGTAT-TCCATTTATCTATAGTTCTCCACCACCC-CACCATATG 993 |||||| ||| |||| ||| || || | ||| | ||||||| || | ||||||| Sbjct 598 TTACAAGTCTCCTCCA--TATGTCTAT--AGCTAC--T-CTCCACCGCCGGCTCCATATG 650 Query 994 TTTACAAG 1001 |||||||| Sbjct 651 TTTACAAG 658 Score = 233 bits (126), Expect = 2e-60 Identities = 384/505 (76%), Gaps = 32/505 (6%) Strand=Plus/Plus Query 565 CCTCCATATGTTTACGAGTCTGTTCCTCGTATTCCA--TT-CATCTACAGCTCTCCACCA 621 ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||| || | ||||||| ||||||||| Sbjct 14 CCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCTC-CA--CCACCTTACGTCTACAGTTCTCCACCA 70 Query 622 CCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCTCGTATTCCATTCA--TCTATAGCTCTCCAC 679 || ||||||||||| ||||| ||| |||| | | ||| || | ||||||||||||||| Sbjct 71 CCGCCTCCATATGTCTACAAATCTCCTCCACCTCCTCC-TT-ATGTCTATAGCTCTCCAC 128 Query 680 CACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCTCGTGTTCCATTTATCTACAGCTCTCCAC 739 |||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||| ||||||| Sbjct 129 CACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTCTACAGTTCTCCAC 188 Query 740 CACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCCTC-GTATTCCATTCATCT--ACAGCTCTC 796 |||||||||||||||| ||||| ||| || | | | || || || | ||||||| | Sbjct 189 CACCACCTCCATATGTCTACAAATCTCCACCACCGCCT-CC-TT-ATGTGTACAGCTCAC 245 Query 797 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCTCGTAT-TCCATTCATCTATAGCTCT 855 ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | | ||| | | |||||||||| Sbjct 246 CACCACCCCCTCCTTATGTTTACAAATCTCCTCCACC-ACCTCCCTACGTCTATAGCTCG 304 Query 856 CTACCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCTCGTGTTCCAT-TCATCTACA-GCT 913 | |||||| ||||||||||| |||| || | || | | ||||| | | |||| | | Sbjct 305 CCACCACCACCTCCATATGTCTACAGCTCACCACCGCCTCCTCCATATG-TATACAAG-T 362 Query 914 CTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCT-CCTCGTATTCCATTTATCTATA-G 971 |||||||||| ||||| ||||| |||| || || || | | ||||| | | || | | Sbjct 363 CTCCACCACCACCTCCTTATGTCTACAGCTC-GCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAG 421 Query 972 TTCTCCACCACC-CCACCATATGTTTACAAGTTTGTT-CCTCATATTCCATCATCTA--C 1027 | |||||||||| || |||||||| |||| | | | || | | ||||| || || | Sbjct 422 T-CTCCACCACCACCTCCATATGTCTACA-GCTCGCCACCGCCTCCTCCAT-ATGTATAC 478 Query 1028 AACTCTCCACCACCCCCTCCATATG 1052 || ||||||||||| ||||| |||| Sbjct 479 AAGTCTCCACCACCACCTCCTTATG 503 Score = 213 bits (115), Expect = 2e-54 Identities = 217/264 (82%), Gaps = 15/264 (6%) Strand=Plus/Plus Query 96 ACAA-TCACCACCACCACAACCATATGTCTACAGTC-CCCCACTACCAT-CTCCATATGT 152 |||| || |||||||||| || ||||||||||| | | |||| ||| | |||||||||| Sbjct 357 ACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTATGTCTACAG-CTCGCCACCACC-TCCTCCATATGT 414 Query 153 TTACAAGTCTCCACCACCATCTCCTTATCTCTATAGCTCCCCACCACCACCTCCATACGT 212 ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| || Sbjct 415 TTACAAGTCTCCACCACCACCTCCATATGTCTACAGCTCGCCACCGCCTCCTCCATATGT 474 Query 213 ATACAACTCTCCACCACCACCTCCTCCATACATCTACAACTCTCCACCACGACCTCCATA 272 |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| Sbjct 475 ATACAAGTCTCCACCACCACCTCCTT-ATG--TCTACAGCTCGCCACCACCTCCTCCATA 531 Query 273 TGTTTATAAGTCTCCCCCTCCTCCTCCATT-CGT-GTACAGCT---CTCCACCACCCCCT 327 |||||| |||||||| || || ||||| || ||| | | |||| |||||||||| || Sbjct 532 TGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCC-TTACGTCG-ATAGCTATTCTCCACCACCGACT 589 Query 328 ACATATATTTACAACTCTCCACCA 351 ||||| ||||||| ||||| ||| Sbjct 590 CCATATGTTTACAAGTCTCCTCCA 613 > Ahg942633 jgi|Araly1|942633|scaffold_603177.1 Length=1325 Score = 73.1 bits (39), Expect = 4e-12 Identities = 53/59 (90%), Gaps = 3/59 (5%) Strand=Plus/Plus 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