BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G13750.1
Length=8252
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg890991 jgi|Araly1|890991|Al_scaffold_0007_2977 1.025e+04 0.0
Ahg890992 jgi|Araly1|890992|Al_scaffold_0007_2978 2615 0.0
Ahg896223 jgi|Araly1|896223|Al_scaffold_0005_189 963 0.0
Ahg470891 jgi|Araly1|470891|fgenesh2_kg.1__845__AT1G08300.1 710 0.0
Ahg910534 jgi|Araly1|910534|Al_scaffold_0001_788 571 2e-161
Ahg896238 jgi|Araly1|896238|Al_scaffold_0005_204 532 1e-149
> Ahg890991 jgi|Araly1|890991|Al_scaffold_0007_2977
Length=6411
Score = 1.025e+04 bits (5551), Expect = 0.0
Identities = 6124/6406 (96%), Gaps = 17/6406 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1792 GTAACTTCATTAAGACGTGGTATGTGGGATAGCATATATGATAATTTTCAAATGACAAGC 1851
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 16 GTAACTTCATTAAAACGTGGAATGTGGGATAGCATATATGATAATTTGCAAATGACAAGC 75
Query 1852 CTAAGTGATACGACTAATACAGGCTCAGGAAATCAAGTTGGTGAAATTAACCCAATTGAA 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 76 CTAAGTGATACGACTAATACAGGCTCAGGAAATCAAGTTGGTGAAATTAACCCAAGTGAA 135
Query 1912 AACAGTGAGTTAAGCAAGACTCAGCATGTTATGCCTCCTACACACT-GTAACACTGTCGA 1970
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||
Sbjct 136 AACAGTGAGTTAAGCAAAACTCAGCATGTTATGCCTCCTAAACA-TAGTAACACTGTTGA 194
Query 1971 AGAAATTATTAGAAGGCTTTCCTTGTATTTTGAGCATGATCTTTCTGGAGCGAAGCACAT 2030
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 195 AGAAATTATCAGAAGACTTTCCTTGTATTTTGAGCATGATCTTTCTGGAGAGAAGCACAT 254
Query 2031 TGGTATCTTTAGGAAGCTACAGACTTGCGAGAATTTGTTGGCAGAGCAATTTCAAGTACA 2090
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255 TGGTATCTTCAGGAAGCTACAGACTTGCGAGGTTTTGTTGGCAGAGCAATTTCAAGTACA 314
Query 2091 GGATTTTGAGTCTCTTGGTTGGGGTGGGTTTTTTGCTTTCTTGGAAAAACATATGTTACT 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 GGATTTTGAGTCTCTTGGTTGGGGTGGGTTTTTCACTTTCTTGGAAAAACATATGTTACT 374
Query 2151 GCTACCAACACAACTTCAAAGGTTTCTATCTAGAGAATTACAGGAAGAGTTTCCTCTGGA 2210
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 375 ACTACCAACACAACTTCAAAGGTTTCTATCTAGAGAATTACTGGAAGAGTTTCCTCTGGA 434
Query 2211 GGTCCACGTGAATGAGAATCTGTTGACTCTTCTGCTTTCGCAAGCTTCTGAATTTTCAAG 2270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 435 GGTCCACGTGAATGAGAATCTGTTGACTCTTCTGCTTTCGCAAGCGTCTGAATTTTCAGG 494
Query 2271 TGATAAAGTACTATCTAGACAAACATTAGCTCGACTGGTTGCAGAACAATTTCCATCAAT 2330
|| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 495 TGGTAATGTAATATCTAGACAAACAGTAAATCGACTGCTTGCAGAACAATTTCCGTCAAT 554
Query 2331 CAGTTTCAAGGTTGTCGGAAGAGATTCAGAGGAAAATTTCTCTGAAATCATTGGTAAGAA 2390
|| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 555 CAATTTTAAGGTTGTCGGAAGAAATTCAGAGGAAAATTTCACTGAAATCATTGGTAAGGA 614
Query 2391 GAAGTCTTCTTCTAAATGTGTCCTCTTTTCTGCAACATTGTTGGGAGCTGAAAACTCTTT 2450
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 615 GAAGTCTTGTTCTAAATGTGTGCTCTTTTCTGCAACATTGTCGGGAGCTGAAAACTCTTT 674
Query 2451 GACAAGTAAATATCTGGAAGAATCCCTGACAGTGGGAAATGATACTGAAGCAAGAAGCAC 2510
||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 675 GACCAGTAAATATCTAGAAGAATCCTTGACAGTGGGGAATGATACTGAAGCAAGAGGCAG 734
Query 2511 CACTCTTAATGCTGTTGCATCCAAAGAGGTTTTAGATGTTTTGCTTAGGGTTCCGTTGTT 2570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 CACTCTTAATGCTGTTGCATCCAAAGAGGTTTTAGATGTTTTGCTTAGGGTTCCGTTGTT 794
Query 2571 GTCAGACTTGAATTCATGGTGTCACTGGGATCTTAGGTATGCTCCACAGTTTGGTCCTCT 2630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 GTCAGACTTGAATTCATGGTGTCACTGGGATCTTAGGTATGCTCCACAGTTTGGTCCTCT 854
Query 2631 TATGGGCTGTTTAAATGAGATTAATTCAACAGATCTGTTGTGTCTAGTGACAAGGGATGG 2690
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 TTTGGGCTGTTTAAATGAGATTAATTCAAAAGATCTGCTGTGTCTAGTGACAAGGGATGG 914
Query 2691 TAAGATTATCAGAGCAGATCCTTCTGCAACAGCAGATTCATTCTTAGAGGCTGCTCTTCA 2750
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 915 TAAGATTATCAGAACAGATCCTTCTGCAACAGCAGATTCATTCTTGGAGGCTGCTCTTCA 974
Query 2751 AGGATCTGCTTACCGTACTGCTGCACAGTTGTTGTCATTGATATCATTGAATGGAAGAAC 2810
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 975 AGGATCTGCTTACTGTACTGCTGCACAGTTGTTGTCGTTGATATCATTGAATGGACGAAC 1034
Query 2811 ACATCTACCATTTTCCCTTCTAAAATGCTATGCAAAACGTGCATTTGAAGtttttttttA 2870
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1035 ACATCTACCGTTTTCCCTTCTAAAATGCTATGCAAAACGTGCATTTGAAGTTTTTTTTGA 1094
Query 2871 TAACTATTCCGAGGAGATGGAGCTAAATGATAGGAATTCTCTTGTGCAAATGCATGGGCC 2930
|||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1095 TAACCATTCCGAGGAGATGGAGCTTAATAATAGGAATTCTCTTGTGCAAATGCATCGGCC 1154
Query 2931 AGAAAAGCTCAGCACTTCTTTTGACAAAGTGATAGTTGTAGGAGAGAAAGCTAAAGTGGC 2990
|||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1155 AGAACAGCTTAGTACTTCTTTGGACAAAATGATAGTTGTAGGAGAGAAAACTAAAGCGGC 1214
Query 2991 TAAACGTGACTATGCTGCCTCTAAGTTTCTTCTTGATTGTCTGGGCTATCTACCTGGGGA 3050
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1215 TAAAAGTGACTATGCTGCCTCTAAGTTTCTTCTTGATTGTCTGGGCTATTTACCTGGGGA 1274
Query 3051 GTTTCGCAGTTTAGTTGTTGATATCTTGCTACCAGGACTACGTTCTGTTGTTAAAGATGC 3110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 GTTTCGCAGTTTAGTTGTTGATATCTTGCTACCAGGTCTACGTTCTGTTGTTAAAGATGC 1334
Query 3111 TCCTACAAGAGTTTTGTCTGCATGCGAGCAAACAGAGCAACGCATCATGCTGCATGATGC 3170
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 TCCTACAAGAGTTTTGTCTGCATGCAAGCAAACAGAGCAACGCATCATGCTGCATGATGC 1394
Query 3171 CGGATTGCTGCTAGGCATTGTTGAGTGGATTAGTGATTACCATAAGTTTTGCTCATCATG 3230
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1395 CGGATTGCTGCTTGGCATTGTTGAGTGGATTAGTGATTACCATATGTTTTGCTCATCATG 1454
Query 3231 TTCTCCAAACTCTTCAATAGTGGAGAATGCTTCGTCCAACTTAGATTCTGGCGCAGGTTT 3290
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1455 TTCTCCGAACTCTTCAATAGTGGAGAGTGCTTCGTCCAACTTAGATTCTGTCGCAGGTTC 1514
Query 3291 TGTGCAAAACGAATTGGAGGACCCAGTTCAGACCAAACAAAGATGCATGATCGTATCAGA 3350
||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515 TGTGCAAAAAGAATTGGAGGACCCAATTCAGACCGAACAAAGATGCATGATCGTATCAGA 1574
Query 3351 GAAGTCGTGCGAATACAAAGAAGAACCTCATGAATCTTGTCACACTTTTGGTGGTTCAGG 3410
|||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1575 GAAGGCTTGCCAGGACAAAAAAGAACCTCATGAATCTTGTCACACTTTTGGTGGTTCTGG 1634
Query 3411 GATTTTATGTGATTCTGTTGGGGAGGCTTTCACCCAGACTGCACCTGAATTTTATGATAA 3470
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||
Sbjct 1635 GACTTTATGTGATTCTGTTGGGGAGGCTTTCACCCAGACTGCGCTTGAGTTTCATGATAA 1694
Query 3471 TCGAGCCTCTGTTATTGATTCAATCAGACGGGATGAGTTTGGGTTGGATTTAACTTCTTC 3530
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1695 TCCAGCCTCTGTTATTGATTCAATCAGACGGGATGAGTTTGGGTTAGATTTAACTTCTTC 1754
Query 3531 TGGTTCTGAGATGAGTATGCTGCAGAAACAACATGCTCGGTTAGGAAGAGCACTTCAGTG 3590
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 TGGCTCTGAGATGAGTATGCTGCAGAAACAACATGCTCGGTTAGGAAGAGCACTTCAGTG 1814
Query 3591 TTTGTCCCAAGAACTGTATTCTCAAGATTCACACTTCATTCTTGAACTTGTTCAAAATGC 3650
||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 TTTGTCCCAGGAATTGTATTCACAAGATTCACACTTCATTCTTGAACTTGTTCAAAATGC 1874
Query 3651 TGATGACAATAAATACCCTGAACACGTGGAACCCACACTCACATTCATTCTTCAAAAGAC 3710
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 TGATGACAATAAGTACCCTGCACACGTGGAACCCACACTCACATTCATTCTTCAAAAGAC 1934
Query 3711 CGGGATTGTTGTTTTAAACAACGAGTGTGGCTTCATGCCTGAGAACATTCGGGCCCTGTG 3770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 CGGGATTGTTGTTTTAAACAACGAGTGTGGCTTCATGCCTGAGAACATTCGGGCCCTGTG 1994
Query 3771 TGATGTTGGTCAATCCACAAAGAAAGGATCTGGTGGATACATAGGGAAGAAAGGAATTGG 3830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TGATGTTGGTCAATCCACAAAGAAAGGATCTGGTGGATACATAGGGAAGAAAGGAATTGG 2054
Query 3831 CTTCAAGTCAGTGTTTCGGGTTTCTGATGCTCCTGAGATCCACTCAAATGGTTTCCATTT 3890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055 CTTCAAGTCAGTGTTTCGGGTTTCTGATGCTCCTGAGATCCACTCAAATGGTTTCCATTT 2114
Query 3891 CAAGTTTGATATAAGTGAGGGTCAGATTGGATATATTTTACCGACTGTTGTGCCTCCTCA 3950
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 CAAGTTTGATATTAGTGAGGGTCAGATTGGATATATTTTGCCGACTGTTGTGCCTCCTCA 2174
Query 3951 TGATATTGAATCGCTTAGCAGCATGTTATCTGGCCGTGCTTTACACCTGAAGGATGCAGG 4010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2175 AGATATTGAATCGCTTAGCAGCATGTTATCTGGCCGTGCTTTACACCTAAAGGATGCAGG 2234
Query 4011 ATGGAACACTTGCATTACACTTCCTTTCAGA-GCCATTGATTCCGAAAGAACAACAGTGA 4069
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235 ATGGAACACTTGCATTACACTTCCTTTCAGAAGC-ATTGATTCCGAAAGAACAACAGTGA 2293
Query 4070 ATCACATTGAACCTATGTTTTCAGACCTTCACCCTTCTTTATTACTCTTCCTACATCGCC 4129
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 ATCACATTGAACCTATGTTTTCAGACCTTCATCCTTCTTTATTACTCTTCCTACATCGCC 2353
Query 4130 TCCAGTGCATAGTATACAGAAACGTGCTTGACGATTCTCTCTTGGTCATGAGGAAAGAGG 4189
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 CCCAGTGCATAGTATACAGAAATGTGCTTGAAGATTCTCTCTTGGTCATGAGGAAAGAGG 2413
Query 4190 TTGTGAGCAAGAATATCGTAAAGGTTTCATGTGGGGAAAATAGCATGACATGGTTTGTGG 4249
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 TTGTGAGCAATAATATCGTAAAGGTTTCATGTGGGGAAAATAGCATGACATGGTTTGTGG 2473
Query 4250 CATCAGAGAAATTAAAGGCTACCAATCTTCGTGATGATGTTCAGACAACAGAAATTTCCA 4309
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2474 CATCAGAGAAATTAAAGGCTGCCAATCTTCGTGATGACGTTCAGACAACAGAGATTTCGA 2533
Query 4310 TAGGATTCACTCTTGACATGCTGGAAGATGGAACTTACAGATCATGTATGATTCAAGAAC 4369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2534 TAGGATTCACTCTTGACATGCTGGAAGATGGAACTTACAGATCATGTATGATTCAAGAAC 2593
Query 4370 CTGTTTTTGCTTTTCTTCCTCTAAGAACTTATGGTTTGAAATTTATTATACAAGGGGATT 4429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2594 CTGTTTTTGCTTTTCTTCCTCTAAGAACTTATGGTTTGAAATTTATTATACAAGGGGATT 2653
Query 4430 TCATTCTTACATCATCAAGGGAGGATGTTGATGAGGATAGTCCTTGGAACCAGTGGCTGT 4489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2654 TCATTCTTACATCATCAAGGGAGGATGTTGATGAGGATAGTCCTTGGAACCAGTGGCTGT 2713
Query 4490 TGTCAGAATTTCCGGGTTTGTTTGTGGATGCGT-TAAGGTCCTTTTGCAGTCTTCCTTCT 4548
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2714 TGTCAGAGTTTCCGGGTTTGTTTGTGGATGC-TCTAAGGTCCTTTTGCAGTCTTCCTTCT 2772
Query 4549 TTCACCCAGAATCTGGGTAAAGGTGTCTCCTCATACATGCAGCTTGTACCTCTCG-TCGG 4607
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2773 TTCACCCAGAATCTGGGTAAAGCTGTGTCCTCATATATGCAGCTTGTACCTCTCGCT-GG 2831
Query 4608 GGAAGTGCATGGGTTCTTTTCTTCTCTCCCTCGTTCTATTATATCTAGATTGAGAACAAC 4667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2832 GGAAGTGCATGGGTTCTTTTCTTCTCTCCCTCGTTCTATTATATCTAGATTGAGAACAAC 2891
Query 4668 CAATTGCTTGCTGCTTGAGGGAGACGGTGAAGAATGGGTTCCTCCTTGCAAGGTTTTAAG 4727
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2892 AAATTGCTTGCTGCTTGAGGGAGACGGTGAAGAATGGGTTCCTCCTTGCAAGGTTTTAAG 2951
Query 4728 AAACTGGAATGAAAAGATTAGGGTTCTTCTTAAGGATGGATTGCTTCAGGAGCATCTTGC 4787
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2952 AAACTGGAATGAAAAGATAAGGGTTCTTCTTAAGGATGGATTGCTTCAGGAGCATCTTGC 3011
Query 4788 TTTGGGCTTTTTGGACAAAGATATAGTTTTGTCAGATTCCCTGTCAAGGGCACTCG-GCA 4846
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3012 TTTGGGCTTTTTGGACAAAGATATAGTTTTGTCAGATTCCCTGTCAAGGGCACT-GAGCA 3070
Query 4847 TTGAAGACTATGGACCGAAGACTTTGGTGCAAATTCTTTCTTCATTGAGTCACAAGAATG 4906
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3071 TTGAAGACTATGGACCGAAGACTTTGGTGCAGATTCTTTCTTCATTGAGTCACAAGAATG 3130
Query 4907 GTTGTCTACAATCAATGGGCTTTACATGGTTATCGTCTATTCTTACTGAACTTTACCTAC 4966
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3131 GTTGTCTACAATCAATGGGCTTTACATGGTTATCGTCTATTCTTACTGAACTTTACATAC 3190
Query 4967 TATTCCGTTCTTCTGGGCATGGTAATGTAGAGTTAGGTATAGATAAGAGTCTTATAGATG 5026
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3191 TATTCCGTTCTTCTGGGCATGGTAATGTAGAGTTAGGTATAGATAAGACTCTTATAGATG 3250
Query 5027 ACCTTCACAAGATCCCATTTATTCCCCTCTCAAATGGTAAGTTCACCTCTTTAGATGAAG 5086
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3251 ACCTTCACAAGATCCCATTTATTCCCCTGTCAAATGGTAAGTTCACCGCTTTAGATGAAG 3310
Query 5087 GCGCAGTGTGGTTGCACCATGACACCACTGGGTTAGATCTTGGTGATGTATTTGAAGCAT 5146
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3311 GCGCAGTATGGTTGCACCATGACACCACTGGGTTAGATCTTGGTGATGTATTTGAAGCAT 3370
Query 5147 TTCCTGTGTTATATGGAAATCTCCGAACCATTGATCATTCCCTTCTTTTGGCGTCTTCTG 5206
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3371 TTCCTGTGTTATATGGAAATCTCCGAACCATTGATCATTCCCTTCTTTTGGCGTCTTCGG 3430
Query 5207 TTGATGAAAAATCCTCTGTGGATGACCTTGTAAACATGCTTTGTGCAATTGGCGTTCAAA 5266
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3431 TTGATGAAAAATCCTCTGTGGATGACCTCGTAAACATGCTTTGTGCAATTGGCGTTCAAA 3490
Query 5267 AGCTGTCAGCACATGAAATCGTTAAAGCTCATATATTACCAGCCTTTGAGGCAAGGAGTA 5326
|||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3491 AGCTGTCAGCACATGAAATCATCAAAGTTCATATATTACCAGCCTTTGAGGCAAGGAGTA 3550
Query 5327 CAGGTGCAGTGGACGGTTTAATGGTTGATTACTTATGCTTTGTGATGACACATCTACGAT 5386
||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3551 CAGATACAGTGGAGGGTTTGATGGTTGATTACTTATGCTTTGTGATGACACATCTACGAT 3610
Query 5387 CTGGCTGTCATATTTGTC-TGAAGGAGAGGAAGTACATTATTTCTGAGTTGAGAAGCAAA 5445
|| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3611 CTAGCTGTCATATTTGTCAT-AATGAGAGGAACTACATTATTTCTGAGTTAAGAAGCAAA 3669
Query 5446 GCTCTGGTATTATCAAATTATGGGTTGAAACAGCTAGGTGAAGGGTCAATTCATTTCGGT 5505
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3670 GCTCTGGTATTATCAAATTATGGGTTGAAACAGCTCGGTGAGGGGTCAATTCATTTCGGT 3729
Query 5506 GAAGAATATGGAAACCAGGTCAACATGAAGAAGCTTACCAAAAACTTGGATATATCATGG 5565
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3730 GAAGAATTTGGAAACCAGGTCAACATGAAGAAGCTTACCAAAAACTTGGATATTTCATGG 3789
Query 5566 CATGTGGTTGATGGTACCTACTTGAAACATCCAGCATCAAAATTTTATGCATGCGGATTG 5625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3790 CATGTGGTTGATGGTACCTACTTGAAACATCCAGCATCAAAATTTTATGCATGCGGATTG 3849
Query 5626 AAGGAGTGGCGGGAATTTTTTCAAGAGATTGGAATAGCTGATTTTGTTCAAGTAGTTCAA 5685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3850 AAGGAGTGGCGGGAATTTTTTCAAGAGATTGGAATAGCTGATTTTGTTCAAGTGGTTCAA 3909
Query 5686 GTTGAAAAGAGCATTGCTGAATTCTATTCTGTTTCACACTGTGAAAAGTATGATATCAAC 5745
|||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3910 GTTGAAAAGACCATTGCTGAGTTTTATTCTGTTTCACGTTGTGAAAAGTATGATATCAAC 3969
Query 5746 TTGTTATCTCCTGATTTAACTGTTAAAGACTGGGAATCCCCGGAACTAGTTGATCTCTTG 5805
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3970 TTGTTATCTCCTGAGTTAACTGTTAAAGACTGGGAATCCCCAGAACTAGTTGATCTCTTG 4029
Query 5806 TCTCTCTTGCACAAAAGTAATGGCCGTAAAGGTTGCAAGTATCTTTTGGAAGTCCTTGAT 5865
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 4030 TCTCTCTTGCACAAAAGTAATGGCCGCAAAGGTTGCAAGTACCTGTTGGAAGTCCTTGAT 4089
Query 5866 AGACTGTGGGACGATTGTTACTATGACAAAACAACTGTTAACTATAACTCGGGTACGCAT 5925
||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4090 AGACTGTGGGATGAATGTTACCATGAAAAAACAACTGTTAACTATAACTCAGGTACGCAT 4149
Query 5926 GGTATCATCAGATCATCAGAATCTTCATTTATGAGGGTAATTTGTGATTCTCTATGGATA 5985
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4150 GGTGTCATCAGATCATCAGAATCTTCATTTATGAGGGTAATTTGTGATTCTCAATGGATA 4209
Query 5986 GTTTCAAGCATGGACAGCAAATTGCATCTTTCAAAAGACCTCTATCATGATTGTGATGAT 6045
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4210 GTTTCAAGCATGGACAGCGAATTGCATCTTGCAAAAGGCCTCTATCATGATTGTGATGAT 4269
Query 6046 GTGCAGTCAATACTTGGCATGAATGCTCCCTATGCAGTTCCTACGGTTACAAGTGTCAAG 6105
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4270 GTGCAGTCTATACTTGGCATGAATGCTCCCTATTCAGTTCCTAAGGTTACAAGTGTCAAA 4329
Query 6106 TTACTTAGTGATATTGGTTTTAAGACCAAAGTTTCCCTCGATGATGCTTTGGAAGTCCTA 6165
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4330 TTACTTAGTGATATTGGTTTTAAGACCAAAGTTTGCCTCGATGATGCTCTGGAAATCCTA 4389
Query 6166 GAATCTTGGGTACACTGTGGAGACTCTTTCAAATCAAGCATCTCTCAGATTACCAGATTT 6225
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4390 GAAGCTTGGGTACACTGTGGAGACAATTTCAAATCAAGCATCTCTCAGATTACCAGATTT 4449
Query 6226 TACAAATATTTGTGGAATGAAATGGCTGATTCAAAACAGAAAATTACTGAAAAGCTTCAT 6285
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4450 TACAAATATATGTGGAATGAAATGGCTGATTCAAAGCAGAAAATAACTGAAAAGCTTCAT 4509
Query 6286 ACTCTTCCGTCTGTGTTTGTACCACATGGAATTGCAAGTAGGCAGAATGATATGATATCG 6345
||| | |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4510 ACTATCCCGTCTGTATTTGTACCACATGGAAATGGAAGTAGGCAGAATGATATGGTATCT 4569
Query 6346 GGAATATTCTTGTCACTTGATGATGTTTACTGGAATGATTCTGCTGGCGTTTTAGATGAG 6405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4570 GGAATATTCTTGTCACTTGATGATGTTTACTGGAATGATTCTGCTGGCGTTTTAGATGAG 4629
Query 6406 ATAAAAGAGATCAGTTCGCAGATCAGCAGTGTTGTGGAACCATTGCGTAGAAAAACATTG 6465
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 4630 ATAAAAGAGATCAGTTCGCAGATCAGTAGCGTTGTGGAACCATTGCGTAGGAAATCATTG 4689
Query 6466 GGCAATATCTATCCAGGTCTACATGACTTTTTTGTGAATGGGTGTGGAGTACCTGAGACG 6525
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4690 TGCAATATCTATCCAGGTCTCCATGACTTTTTTGTGAATGGGTGTGGAGTACCTGAGACG 4749
Query 6526 CCTTCGTTTCAAGAGTACCTTAAAATTCTAGGGCAGTTTGCACATAATGTGTCACCCTCA 6585
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4750 CCTTCGTTTCAAGATTACCTTAAAATTCTAGGGCAGTTTGCACATAATGTGTCACCTTCA 4809
Query 6586 TCTGCCGCCAAGGCTGTCTTCAAAATTTTCCTGAAGTGGAGTGATGACTTGAACTCTGGC 6645
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4810 TGTGCTGCCAAGGCTGTCTTCAAAATTTTCCTGAAGTGGAGTGATGACTTGAACTCTGGC 4869
Query 6646 AAATCTTCCGAAGATGTTATTCATTTTAAAGAGAGACTTTCAGAACTGGAGTACACTGTA 6705
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4870 AAATCTTCCGAAGATGTTGTTCATTTTAAAGAGAGACTTTCAGAACTCGAGTACACTGTA 4929
Query 6706 CTCCCTACTGAAAATGATAAGTGGGTTTCCTTGCACTCCTCGTTTGGTCTCGTATGTTGG 6765
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 4930 CTTCCTACTGAAAATGACAAGTGGGTTTCCTTGCACTCCTCGTTCGGTCTAGTATGTTGG 4989
Query 6766 TGTGATAATGAGAAGTTAAAGAAGAGATTTAAAAACAAGGATAAAATTGAGTTTATTAGC 6825
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 4990 TGTGATGATGAGAAGTTAAAGAAGAGATTTAAGAAGAAGGATAACATTGAGTTTATTAAC 5049
Query 6826 TTTGGGGAAAATGATGACGAAGGGCAAGAAGTGCTTCAAACAAAAGTGTCTGGGCTCATG 6885
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5050 TTTGGGGAAAATGATGACGAAGAGCAAGAAGTGCTTCAAACAAAAGTGTCTGGGCTCATG 5109
Query 6886 CACAGTTTGGGCATTCCAAGTATTTCTGAGGTGGTAAAGCGTGAAGCGAAATATGAAGGT 6945
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5110 CACAGCTTAGGCATTCCAAGTATTTCTGAGGTGGTAAAGCGTGAAGCGAAATATGAAGGT 5169
Query 6946 TTGCAAGATAATACTGTAACAGTGTCACTTGTTAACTGGGCTCTGCCTTATGCACAGCGG 7005
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5170 TTGCAAGATAATACTGTAACAGTATCACTTGTTAACTGGGCTCTGCCTTACGCACAGCGA 5229
Query 7006 TATATCTTTACTCTTCATCATGAGAAGTATACCCAAACAAAAAAGACAGTCCATAGTCAA 7065
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5230 TATATCTTTACTCTTCATCATGAGAAGTACACCCAAACAAAAAAGACAGTCCATAGTCAA 5289
Query 7066 GTCAAACGTCTACAAGTCTTTGTTGTTGATAAGTTATCCTATAGGAATGTCATACCGCAA 7125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5290 GTCAAACGTCTACAAGTCTTTGTTGTTGATAAGTTATGCTATAGGAATGTCATACCGCAA 5349
Query 7126 TATGGCATCAGCTCTAAAAAGGAGTTCAAATGCAGTTCTCTTCTGCAGGATAAAGCTCTG 7185
||||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5350 CATGGCATTAGCTCTAACAGGGAGATCAAATGCAGCTCTCTTCTGCAGGATAAAGCTCTG 5409
Query 7186 TACACAACACCAAGTCTGGATTCCCATTCCTTGTTCATGGAACTGTCTCGTTTGTTTTTC 7245
|||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5410 TACACAACACCATGTCTAGATTCCCATTCCATGTTCATGGAACTGTCTCGTTTGTTTTTC 5469
Query 7246 AACGGAGTGCCTGATCTGCATTTGGCAAATTTCCTTCACTTGATCAAAACAATGGCAGAA 7305
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||
Sbjct 5470 AACGGAGTTCCTGATCTGCATTTGGCAAATTTCCTTCACTTGATAAAAACTATGGCGGAA 5529
Query 7306 TCTGGGTTGAGCGAGGAGCAAATGGAATCCTTCATTCTGAACAGTCAGAAAGTTCATCAG 7365
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5530 TCTGGGTTGAGCGAGGAGCAAATGGACTCATTCATTCTGAACAGTCAGAAAGTTCATCAG 5589
Query 7366 GTTCCTGATGGTGAAGAGATCTGGTCCCTCAAATCTGCTGTTAAAGCGAAGAAGAAAGCT 7425
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5590 ATTCCTGATGGTGAAAAGATCTGGTCCCTTAAATCTGCTGTTAAAGCGAAGAAGAAAGCT 5649
Query 7426 GGAATAAGCTTGAGCTGGTTACCTTCAAGTTCTAAAACAAGACATGGTTCTAGCAAGACC 7485
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 5650 GGAATACGCTTGAGTTGGTTACCTTCAAGTTCCAAAACAGGACGTGGTTCTAGCAAGACT 5709
Query 7486 AACACTGATGATTCTAAACAAGAGCTGGACACTAGTAGCAGCAAAGAGGATGTAACAGAG 7545
|||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5710 AACACTGATGATTCTAAACAAGAGCTGGCCTCTAGCAGCAGCAAAGAGTATGTAACAGAG 5769
Query 7546 GCTCTTGAAGAAAAAATACCGATTGAGATGACCAATACCAACTTGGTTTCTGGATATGAT 7605
|||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5770 GCTCTTGAGGAAAAAATACCGACTGA-A--ACCGATACCAACTTGGTTTCAGGATATGAT 5826
Query 7606 AATTGTGCAGGCACAAGTTCACGAGCTAGTGAGCCAAACCCGTTGCATTCTATGCATATG 7665
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5827 AATTGTGCAGGCACAAGTTCACGAGCTAGTGTGCCAAACCCATTGCATTCTATGCATATG 5886
Query 7666 ATTAGTGGCTCAACCTCAGGGAATCAGGCTGCTATGCATCTCAATCCAAATCTTCCTCAT 7725
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 5887 ATTAGTGGCTCAACCTCAGGGAATCAGGCTGCTATTCACCTCAACCCAAATCTTCCACAT 5946
Query 7726 GAATGGAACAATTCCTTCACAGCTAATTTCAGCGATAGAGACCAGCTTCATACAGGCACA 7785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 5947 GAATGGAACAATTCCTTCACAGCTAATTTCAGCGATAGAGATCAGCTTCATACCGGCACA 6006
Query 7786 CCTTGGGCTGCACAAGCGCAACAGACCGGTAGAAAAGGTGAAGAAATCGCTTACAGATAC 7845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 6007 CCTTGGGCTGCACAAGCGCAACAGACCGGTAGAAAAGGTGAAGAAATCGCTTATAGATAC 6066
Query 7846 TTTGTTGCAAAATACGGCAATGAGGCACTGGTTAAATGGGTTAACGACCAGAGCGAAACC 7905
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6067 TTTGTTGCGAAATACGGCAATGAGGCTCTGGTTAGATGGGTTAACGACCAGAGCGAAACT 6126
Query 7906 GGTTTACCTTACGACCT-CATGATCGAAAACCGAGGTGGTAAGAAAGAGTACGTGGAGGT 7964
||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6127 GGTTTACCTTACGACCTAC-TGATTGAAAACCGGGGTGGTAAGAAAGAGTACGTAGAGGT 6185
Query 7965 GAAAGCAACGGTATCGACACGGAAAGACTATTTCAACTTGACAGTGAGGGAATGGCAATT 8024
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6186 GAAAGCAACGGTGTCTACACGGAAAGACTATTTCAACTTGACAGTGAGGGAATGGCAATT 6245
Query 8025 TGCAAATGAGAAAGGAGAGAGTTACATAATAGCTCATGTTTTGTTAGGAAACAGTAATGC 8084
||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6246 TGCAAGTGAGAAAGGAGAGAATTACATAATTGCTCATGTTTTGTTAGGAAACAGTAATGC 6305
Query 8085 AATCCTCACACAGCATAGAAACCCGGTCAAGTTATGCCAAGAAGGTCATCTCCGGTTATT 8144
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6306 AATCCTCACACAGCATAAAAACCCGGTCAAGTTATGCCAAGAAGGTCATCTCCGGTTATT 6365
Query 8145 GGTTCTCATGCCCAACCAGAGAAACGAGGTCAACGTTACATTTTAA 8190
| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 6366 GATTCTCATGCCTAACCAGAGAAACGAGGTCAATGTTTCATTTTAA 6411
> Ahg890992 jgi|Araly1|890992|Al_scaffold_0007_2978
Length=1827
Score = 2615 bits (1416), Expect = 0.0
Identities = 1681/1808 (93%), Gaps = 21/1808 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCAAGGGAACCACGACGGTTCGTGGTCTCTACACCCCTCCACCAACA----A-----T 51
||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||| || | | |
Sbjct 1 ATGCAAGGGAACCACGACGGTTCCTGGCCTCTAAACGCTTCCACGAATAGTGGAGTTCGT 60
Query 52 GGAAGCGGCAGAGCCAACGGAAACATCAACATCAACACCGTTCCCGGTGGAGGATACCTT 111
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGAAGCGGCAGAGGCAACGCAAACATCAACATCAACACCGTTCCCGGTGGAGGATACCTT 120
Query 112 CCTCAGGCAAATCCTGTCTTTCCCAATTTCAATCAACCCATTAGATAC-CCAATTCCTCA 170
||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||
Sbjct 121 CCTCAAACGAATCCTGTGTTTCCCAATTTCAATCAACCCATTGGATACTCC-CTGCCGCA 179
Query 171 GTTTCCGGCGAATTTTTACCGCCCTAATTTCCCTGACTTCTCTCTCGGAAACCCTAATTT 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 180 ATTTCCGGCGAATTTTTACCGCCCTAATTTCCCTGACTTCTCACTCGGAAACCCTAATTT 239
Query 231 CCAACCCCATCAAAATCTCAACTTCCTTCATCAACAAATCCCTCACCAATATGGCTCCGC 290
|||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||
Sbjct 240 CCAACCTCATCAGAATCTCAACTTCCATCATCAACAAATCCCTCACCAATTTGGGTCTGC 299
Query 291 TGCTAATCACTTCCTTCAAAACCATAAC-CAAAACAGCTTCTCTTTCCCACCTCAATCTA 349
||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 300 CGCTAATCTCTTCCTTCAAAACCAT-ACTCAAAGCAGCTTCTCTTTCCCTCCTCAATCTC 358
Query 350 TACCTAATAATGATATCAGTATCTCTCAGAATCACGGAGCTTTCGAAAACTCTTCATTGA 409
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||
Sbjct 359 TTCCTAATAATGATATCAGTATCTCTCAGAATCACGGCGCTTTCGAAAGCTCTTCCTTGA 418
Query 410 AACGAAGACGACAAGAGGAGGTTGTA-CAAGT-GACTGATGTGGTTCCAAAATCTAATTT 467
||||||||||||||||||||| | | || | | || | ||||| |||||||||||
Sbjct 419 AACGAAGACGACAAGAGGAGG-AGGATGTTGTCGTCAGA-GAAGTTCCGAAATCTAATTT 476
Query 468 TGCTTCCGGTGAGAGTGCTAATAACTCCTTCAGTGTATCTCTACCGATCCCTATAGCAAC 527
|| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 TGTTTCCGGTGAGAGTGCTAATAATTCCTTCAGTGTTTCTCTACCGATCCCTATAGCAAC 536
Query 528 TGATGATAGTGGTGTGTCTCGAGTCCATGGAGAGAAGTCATCTGGAAAACCCAAGCGCAA 587
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||
Sbjct 537 TGATGATAGTGGTGTGTCTCGAGTCCATGGAGAGAAGTCATCCGCAAAACCAAAGCGAAA 596
Query 588 AGTTGATGTCTTGCGGATTGATAAGGCTGTTAACAAGACGCGTAAATTATTTGTTGCTGC 647
|||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 597 AGTTGAAGTCTTGCGGATTGATAAAGCTGTGAACAAGACGCGTAAATCAGTTGTTGCTGC 656
Query 648 TGGAGAGAGTGTTTCTTCGACTAGAGTGTCGAGAGCTGTTTTAGAAGAGCTTCAAGCTGA 707
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||
Sbjct 657 TGGAGAGAGTGTATCTTCGACTAGAGTGTCGAGAGCGGTTCTCGAAGAACTTCAGGCTGA 716
Query 708 TTCTTGGCGTTCCTTGGGTGTGCAAATGCAAGATGTTCCTTCTCTTCGTCAACTTATGGC 767
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 717 TTCTTGGCGTTCTTTGGGTGTGCAAATGCAAGATGTTCCTTCCCTTCGTCAACTAATGGC 776
Query 768 CATTGAAGGCAAGATCAATGCATTTATTCACTGCTTCGTTGGGGCTAGAAGAATTGTGAC 827
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 CATTGAAGGAAAGATCAATGCATTTATTCACTGCTTCGTTGGGGCTAGAAGAATTGTGAC 836
Query 828 CCTGCATGATTTGGAAGTGGCAATATGCCGGAACGAGTTTGTTGATTCTTTCGATGATCT 887
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 837 ACTGCATGATTTGGAAGTGGCAATATGCCGGAACGAGTTTGTTGATTCTTTTGATGATTT 896
Query 888 GGAATTGGGACCTTTGCTGCAGCATCCACTGGTTTTGCTGTATTTTCCATCGATATCCAG 947
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 897 GGAATTGGGACCTTTGCTGCAGCATCCACTAGTCTTGCTGTATTTTCCATCCATATCTAG 956
Query 948 TTCTACTGGACCAGTTAAGATCACTAGTGAGGAGATAATATCATTTCTTGATAGCTATCT 1007
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 CTCTACTGGCCCAGTTCAGATCACTAGTGAGGAGATAATATCATTTCTTGATAGCTATCT 1016
Query 1008 GCACACTTATATGACAGAAGATGTTAAGCTCGATGAATTTCTGAATTTTGTTGCAAGTCA 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1017 GCACACTTATATGACAGAAGATGTTAAGCTCGATGAATTTCTGAATTTTGTTGCAAGCCA 1076
Query 1068 AAAGTCAGTTACAAGCAAGGAAAAGCTTGGTGTGCGTATTCAGAGCTTGCGGATGTATGT 1127
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 AAAATCAGTTACAAGCAAGGAAAAGCTTGGTGTCCGTATTCAGAGCTTGCGGATGTATGT 1136
Query 1128 ATCTTTCATTCTAGACGCGAAGAGACAAGAAGGTGAAACACTGAAAGTCTTACTGACTGA 1187
||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 1137 ATCTTTCATTCAAGACGCCAAAAGACAAGAAGGTGAAACATTGAAAGTCTTACTTACTGA 1196
Query 1188 GCTGCATCAGAAGTATCACATCCCCTCATCAAAGAAACAACAG-CGAGATAAATCTCTAA 1246
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||
Sbjct 1197 GCTGCATCAGAAGTATCAGATCCCCTCATCAAAGAAACAAC-GACAAGATAAACCCCTAA 1255
Query 1247 CTGTCTCTGAGCGAGCTGACTCATTTGCTTTACATCATAAGGATTATTGTGGCAAGCATA 1306
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 CTGTCTCTGAGCGGGCTGACTCATTTGCTTTACATCATAAGGATTATTGTGGCAAGCATA 1315
Query 1307 TAAGATTTGATTCTTCAAGCTCAGATGAAAATGATA-ATGTTTATGAGGTTAGAAATCTT 1365
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1316 TAAGATTTGATTCATCAAGCTCAGATGACAATGATAGTTG-TTATGAGGTTAGAAATAAG 1374
Query 1366 AATAGTTCTGACCATATCAATAGTTGTCCATATCCATCTGTTGCGGAAGAGATGAAGCGT 1425
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 AATAGTTCTGACCATTTCAATAGTTGTCCATATCCATCTGTTGCGGAAGAGATGAAGCGG 1434
Query 1426 CTTGGGGGCTCCAATAAGAAAAGGAAGGGTGAAAGACGTAATCATGAAAAATCTGATTCC 1485
||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 CTTGGTGGCTCCAATAAGAAAAGGAAGGGTGAAAAACATAATCATGAAAAATCTGATTCG 1494
Query 1486 TCCAAACTGCTTAGAAAATCCCCCTCTAAATTACAAGGACATGCGAAACAAGAGATACCT 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 TCCAAACTGCTTAGAAAATCCCCCTCTAAATTACAAGGACATGCGAAACAAGAGATACCT 1554
Query 1546 AAATTGGCTGATGATTCTGAAGCTAAGAAGGTTTTCAGTGTCGATGAGGCTGATTTTACA 1605
| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGATTGACTGATGATTCTGATGCTAAGAAGGTTTTCAGTGTCGATGAGGCTGATTTTACA 1614
Query 1606 CTTTCTGAAGGAGATTTAAGATTGTTCATTTCAACTTGGAAGGACACATGTAAAGAGCTA 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 CTTTCTGAAGGAGATTTAAGATTGTTCATTTCAACTTGGAAGGACACATGTAAAGAGCTA 1674
Query 1666 AGCATTTCAACGTTTGTCGAGAAAATGTTGTCTTTTTACAACTTGGGGGGCTCTGAAGGA 1725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 AGCATTTCAACGTTTGTCGAGAAAATGTTGTCTTTTTACAACTTGGGGGGCTCTGAAGGA 1734
Query 1726 AGAGCTCAGATTAAAAGAGCTAAAGCGATGTCATCATTTCCGTTTGTTGGATTACTAAAT 1785
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 CGAGCTCAGATTAAAAGAGCTAAAGCAATGTCATCATTTCCGTTTGTTGGATTACTAAAT 1794
Query 1786 GTCGCTGT 1793
||||||||
Sbjct 1795 GTCGCTGT 1802
> Ahg896223 jgi|Araly1|896223|Al_scaffold_0005_189
Length=1182
Score = 963 bits (521), Expect = 0.0
Identities = 607/650 (93%), Gaps = 0/650 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6092 TTACAAGTGTCAAGTTACTTAGTGATATTGGTTTTAAGACCAAAGTTTCCCTCGATGATG 6151
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 260 TTACAAGTGTCAAGTTACTTAGTGATATTGGTTTTAAGACCAAAGTTTGCCTCGATGATG 319
Query 6152 CTTTGGAAGTCCTAGAATCTTGGGTACACTGTGGAGACTCTTTCAAATCAAGCATCTCTC 6211
|| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 320 CTCTGGAAATCCTGGAAGCTTGGGTACATTGTGGAGACTCTTTCAAATCAAGCATATCTC 379
Query 6212 AGATTACCAGATTTTACAAATATTTGTGGAATGAAATGGCTGATTCAAAACAGAAAATTA 6271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 380 AGATTACCAGATTTTACAAATATTTGTGGAATGAAATGGCTGATTCAAAGCAGAAAATTA 439
Query 6272 CTGAAAAGCTTCATACTCTTCCGTCTGTGTTTGTACCACATGGAATTGCAAGTAGGCAGA 6331
|||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 440 CTGAAAAGCTCCGTACTCTACCATCTGTATTTGTACCACACAAAATTGGAAGTAGGCAGA 499
Query 6332 ATGATATGATATCGGGAATATTCTTGTCACTTGATGATGTTTACTGGAATGATTCTGCTG 6391
||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 500 ATGATCTGATAACTGGAATATTCTTGTCACTTGATGATGTATACTGGAATGATTCCGCTG 559
Query 6392 GCGTTTTAGATGAGATAAAAGAGATCAGTTCGCAGATCAGCAGTGTTGTGGAACCATTGC 6451
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 560 GCGTTTTAGACGAGATAAAAGAGATCAGTTCGAAGATCAGCAGTGTTGTGGAATCATTGC 619
Query 6452 GTAGAAAAACATTGGGCAATATCTATCCAGGTCTACATGACTTTTTTGTGAATGGGTGTG 6511
||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 ATAGGAAAACATTGTGCAATATTTATCCAGGTCTCCGTGACTTTTTTGTGAATGGGTGTG 679
Query 6512 GAGTACCTGAGACGCCTTCGTTTCAAGAGTACCTTAAAATTCTAGGGCAGTTTGCACATA 6571
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 680 GAGTACCTGAGACGCCTTCTTTTCAAGAGTACCTTAAAATTCTAGGACAGTTTGCACATT 739
Query 6572 ATGTGTCACCCTCATCTGCCGCCAAGGCTGTCTTCAAAATTTTCCTGAAGTGGAGTGATG 6631
|||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ATGTGTCACCTTCATGTGCTGCCAAGGCTGTCTTCAAAATTTTCCTGAAGTGGAGTGATG 799
Query 6632 ACTTGAACTCTGGCAAATCTTCCGAAGATGTTATTCATTTTAAAGAGAGACTTTCAGAAC 6691
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 ACTTGAACTCTGGCAAATCTTCGGAAGATGTTGTTCATTTTAAAGAGAGACTTTCAGAAC 859
Query 6692 TGGAGTACACTGTACTCCCTACTGAAAATGATAAGTGGGTTTCCTTGCAC 6741
| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 860 TTGAGTACACTGTGCTTCCTACTGAAAATGATAAGTGGGTTTCCTTACAC 909
> Ahg470891 jgi|Araly1|470891|fgenesh2_kg.1__845__AT1G08300.1
Length=1388
Score = 710 bits (384), Expect = 0.0
Identities = 578/670 (86%), Gaps = 20/670 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 582 GCGC-AAAGTTGATGTCTTGCGGATTGATAAGGCTGTTAACAAGACGCGTAAATTATTTG 640
|||| || || || ||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| | |
Sbjct 208 GCGCTAATGTAGAAGTCATGCGAATTGATAAGGCCATCAACAATACGCGTAAATCACTAA 267
Query 641 TTGCTGCTGGAGAGAGTGTTTCTTCGACTAGAGTGTCG-AGAGCTGTTTTAGAAGAGCTT 699
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| | |||
Sbjct 268 TTGCTGCTGGAGAGAACGTTTCTTCGACTAGAGTGTCGCA-ATCAGTTTTAGAACAACTT 326
Query 700 CAAGCTGAT--T-CTTGGCGTTCCTTGGGTG-TGCAAATGCAAGATGTTCCTTCTCTTCG 755
|| |||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 327 CAGGCTGATGATATTTGGCGTTCCTTGGG-GATACAAATGCAAGATGTTCCTTCGCTTCG 385
Query 756 TCAACTTATGGCCATTGAAGGCAAGATCAATGCATTTATTCACTGCTTCGTTGGGGCTAG 815
||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 386 CCAACTCATGGCCCTTGAAGGCAAGATCATTGCCTTTATTCACTGCTTCATTGGCGCTAG 445
Query 816 AAGAATTGTGACCCTGCATGATTTGGAAGTGGCAATATGCCGGAACGAGTTTGTTGATTC 875
| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||
Sbjct 446 AGGAATCGTGACTCTGCATGATTTGGAAGTAGCAATATGCCGTAACGAGTTCGTTGGTTG 505
Query 876 TTTCGATGATCTGGAATTGGGACCTTTGCTGCAGCATCCACTGGTTTTGCTGTATTTTCC 935
||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 506 TTTTGATGATCTGGGATTGGGACCTTTGCTGCAACATCCACTTGTCTTGCTCTATTTTCC 565
Query 936 ATCGATATCCAGTTCTACTGGACCAGTT-AAGATCACTAGTGAGGAGATAATATCATTTC 994
||| || || ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 566 ATCCATCTCTGGTTCTACTGCCCCAGTTCAA-ATCACTAGTGAGGAGTTAATCTCATTTC 624
Query 995 TTGATAGCTATCTGCACACTTA-TATGACAGAAGATGTTAAGCTCGATGAATTTCTGAAT 1053
||||||||| ||| | ||||| || | || |||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 625 TTGATAGCTTTCTAAAAACTTACGAT-ATGGACGATGTTAAGCTCGATGAATTCCTGGAT 683
Query 1054 TTTGTTGC-AAGTCAAAAGTCAGTTACAAGCAAGGAAAAGCTTGGTGTGCGTATTCAGAG 1112
|||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 684 TTTGTTGCGGAGGAAAAAG-CAGTTACAAGCAAGGAAAAGCTTGGTGTCCGTATTCAGAG 742
Query 1113 CTTGCGGATGTATGTATCTTTCATTCTAGACGCGAAGAGACAAGAAGGTGAAACACTGAA 1172
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 743 CTTGCGGATGTATGTATCTTTCATTCAAAACGCGAAGAGACAAGAAGGCGAAACATTGAA 802
Query 1173 -AGTCTTACTGACTG-AGCTGCATCAGAAGTATCACATCC-CCTCATCAAAGAAACAACA 1229
| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 803 GA-TCTTGCTGACTGGA-CTGCATCAGAAGTATCACATCCTCC-CATCAAAGAAACAACA 859
Query 1230 GCGAGATAAA 1239
|| |||||||
Sbjct 860 GCAAGATAAA 869
Score = 568 bits (307), Expect = 3e-160
Identities = 454/523 (87%), Gaps = 18/523 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1283 ATAAGGATTATTGTGGCAAGCATATAAGATTTGATTC-TTCAAGCTCAGATGAAAATGAT 1341
|||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| || || ||||||
Sbjct 865 ATAAAGATTATTGTGGCAAGCATACAAGATTTAATTCATT-GAGCTCGGAGGACAATGAT 923
Query 1342 AATG-T--TTATGAGGTTAG-AAATCTTAATAGTTCTGACC-ATATCAATAGTTGTCCAT 1396
| || | |||||||| | | |||| ||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||
Sbjct 924 AGTGCTGATTATGAGG-TCGAAAATGTTAATAGTTGTGACCAAT-TCAGTAGTTGCCCAT 981
Query 1397 ATCCATCTGTTGCGGAAGAGATGAAGC-GTCTTGGGGGCTCCAATAAGAAAAGGAAGGGT 1455
||||||| ||||| ||||||||||||| | | || | |||||||||| |||||||||| |
Sbjct 982 ATCCATCCGTTGCAGAAGAGATGAAGCAG-CCTGTGAGCTCCAATAAAAAAAGGAAGGCT 1040
Query 1456 GAAAGACGTAATCATGAAAAATCTGATTCCTCCAAACTGCTTAGAAAATCCCCCTCTAAA 1515
||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 1041 GAAAGTCGTAGCCATGAAAAATCTGATTTGTCCAAACTGCGTAGAAGATACCCCTCTAAA 1100
Query 1516 TTAC--A-AGGACATGCGAAACAAGAGATACCTAAATTGGCTGATGATTCTGAAGCTAAG 1572
|||| | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1101 TTACTTAGAGGACATGTGAAACAAGAGATACATAACTTGGCGGATGATTCTGATGCTAAG 1160
Query 1573 AAGGTTTTCAGTGTCGATGAGGCTGATTTTACACTTTCTGAAGGAGATTTAAGATTGTTC 1632
|| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 1161 CAGATTTTCAGTGGCAATGAGGCTGATTTCACACTTTCTGAAGGAGCTTTGAGATTGTTC 1220
Query 1633 ATTTCAACTTGGAAGGACACATGTAAAGAGCTAAGCATTTCAACGTTTGTCG-AGAAAAT 1691
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| |
Sbjct 1221 ATTTCAACTTGGAAGGATACATGTAAAGAGCTAAGCATGTCAATGTTTGT-GAAGAAATT 1279
Query 1692 GTTGTCTTTTTACAACTTGGGGGGCTCTGAAGGA-AGAGCTCAGATTAAAAGAGCTAAAG 1750
|||||||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280 GTTGTCTTTTTACAACTTAGGGGGATCCGAAGTACA-AGCTCAGATTAAAAGAGCTAAAG 1338
Query 1751 CGATGTCATCATTTCCGTTTGTTGGATTACTAAATGTCGCTGT 1793
|||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1339 CGATGTCATCATTTCCATTTTTTGGATTACTACATGTCGCTGT 1381
> Ahg910534 jgi|Araly1|910534|Al_scaffold_0001_788
Length=507
Score = 571 bits (309), Expect = 2e-161
Identities = 425/481 (88%), Gaps = 8/481 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 7714 AATCTTCCTCATGAATGGAACAATTCCT-TCACAGCTAATTTCAGCGAT-AGAGACCAGC 7771
|||||| ||||||||||||||||| || || || || | |||||| || ||| | ||||
Sbjct 31 AATCTTGTTCATGAATGGAACAATT-CTGTCTCAACTGACTTCAGC-ATAAGAAATCAGC 88
Query 7772 TTCATACAGGCACACCTTGGGCTGCACAAGCGCAACAGACCGGTAGAAAAGGTGAAGAAA 7831
|||| || || ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 89 TTCACACCGGGGCACTTTGGGCTGCACAGGCGCAAGAGACAGGTAGAAAAGGTGAAGAAA 148
Query 7832 TCGCTTACAGATACTTTGTTGCAAAATACGGCAATGA-GGCACTGGTTAAATGGGTTAAC 7890
||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||
Sbjct 149 TCGCTTACAGATACTTTGTTGCAAAATACGGTAA-GACGGCTCTGGTTAGATGGGTTAAT 207
Query 7891 GACCAGAGCGAAACCGGTTTACCTTACGACCTCATGATCGAAAACCGAGGTGGTAAGAAA 7950
|| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 208 GAGCAGAGCGAAACCGGGTTACCTTACGACCTGATAATCGAAAACCGAGGCGGTAAGAAA 267
Query 7951 GAGTACGTGGAGGTGAAAGCAACGGTATCGACACGGAAAGACTATTTCAACTTGAC-AGT 8009
|||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |
Sbjct 268 GAGTACATAGAGGTGAAAGCAACTGTATCCACACGGAAAGACTATTTTAATTTGACGA-T 326
Query 8010 GAGGGAATGGCAATTTGCAAATGAGAAAGGAGAGAGTTACATAATAGCTCATGTTTTGTT 8069
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||
Sbjct 327 GAGGGAATGGCAATTTGCAAATGAGAAAGGAGAGAGTTACTTTATAGCTCACGTTTTGTT 386
Query 8070 AGGAAACAGTAATGCAATCCTCACACAGCATAGAAACCCGGTCAAGTTATGCCAAGAAGG 8129
||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 387 AGGCAACAGTAATGCCATCCTCACACAACATAGGAACCTTGTCAAATTATGCCAAGACGG 446
Query 8130 TCATCTCCGGTTATTGGTTCTCATGCCCAACCAGAGAAACGAGGTCAACGTTACATTTTA 8189
||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 447 TCATCTCCGGTTATTTATTCTCATGCCTAACCAGCGAAACGAGGTCAATGTTGCATTTTA 506
Query 8190 A 8190
|
Sbjct 507 A 507
> Ahg896238 jgi|Araly1|896238|Al_scaffold_0005_204
Length=351
Score = 532 bits (288), Expect = 1e-149
Identities = 330/351 (94%), Gaps = 0/351 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6379 AATGATTCTGCTGGCGTTTTAGATGAGATAAAAGAGATCAGTTCGCAGATCAGCAGTGTT 6438
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1 AATGATTCCGCTGGCGTTTTAGACGAGATAAAAGAGATCAGTTCGAAGATCAGCAGTGTT 60
Query 6439 GTGGAACCATTGCGTAGAAAAACATTGGGCAATATCTATCCAGGTCTACATGACTTTTTT 6498
|||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 61 GTGGAATCATTGCATAGGAAAACATTGTGCAATATTTATCCAGGTCTCCGTGACTTTTTT 120
Query 6499 GTGAATGGGTGTGGAGTACCTGAGACGCCTTCGTTTCAAGAGTACCTTAAAATTCTAGGG 6558
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTGAATGGGTGTGGAGTACCTGAGACGCCTTCTTTTCAAGAGTACCTTAAAATTCTAGGA 180
Query 6559 CAGTTTGCACATAATGTGTCACCCTCATCTGCCGCCAAGGCTGTCTTCAAAATTTTCCTG 6618
|||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CAGTTTGCACATTATGTGTCACCTTCATGTGCTGCCAAGGCTGTCTTCAAAATTTTCCTG 240
Query 6619 AAGTGGAGTGATGACTTGAACTCTGGCAAATCTTCCGAAGATGTTATTCATTTTAAAGAG 6678
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 241 AAGTGGAGTGATGACTTGAACTCTGGCAAATCTTCGGAAGATGTTGTTCATTTTAAAGAG 300
Query 6679 AGACTTTCAGAACTGGAGTACACTGTACTCCCTACTGAAAATGATAAGTGG 6729
|||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGACTTTCAGAACTTGAGTACACTGTGCTTCCTACTGAAAATGATAAGTGG 351
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 312716785824
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5