BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G14760.1
Length=5311
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg493421 jgi|Araly1|493421|fgenesh2_kg.7__2854__AT4G14760.1 6209 0.0
> Ahg493421 jgi|Araly1|493421|fgenesh2_kg.7__2854__AT4G14760.1
Length=4998
Score = 6209 bits (3362), Expect = 0.0
Identities = 3836/4065 (94%), Gaps = 31/4065 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 281 ATGGATTCCAAAGTCAAGACAATGATAAAGCTCATCGAAGCTGATGCAGATTCGTTTGCA 340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATTCCAAAGTCAAGACAATGATAAAGCTCATCGAAGCTGATGCAGATTCGTTTGCA 60
Query 341 AGAAGGGCAGACATGTACTTCAAGAAACGTCCAGAGCTAATGAAACTGGTGGAAGAGCTA 400
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AGAAGGGCAGATATGTACTTCAAGAAACGTCCAGAGCTCATGAAACTGGTGGAAGAGCTA 120
Query 401 TACAGAGCTTATCGTGCTTTAGCTGAGAGGTATGATCATACAACTGTGGAGCTTCGGCGT 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TACAGAGCTTATCGTGCTTTAGCTGAGAGGTATGATCATACAACTGTGGAGCTTCGGCGT 180
Query 461 GCGCATAAAGTCATGGTTGAGGCGTTTCCTAACCAGATGTCTTTTGACATGATTGAGGAT 520
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 181 GCGCATAAAGTCATGGTTGAGGCCTTTCCTAACCAGATGCCTTTTGACATGATTGAGAAT 240
Query 521 TCTGCATCATCTTCTTCTGAGCCTCGTACAGAAGCAGATACAGAAGCTCTACAAAAGGAT 580
|| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 241 TCCGCATCATCGTCTTCTGAGCCTCATACAGAAGCAGATACAGAAGTTCTACAAAAGGAT 300
Query 581 GGTACTAAAAGTAAAAGGAGTTTTAGTCAGATGAATAAATTAGATGGAACTTCTGATTCT 640
||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 301 GGTGCTAAAAGTAAAAGGAGTTTAAGTCAGCTGAATAAATTATATGGAACTTCTGATTCT 360
Query 641 CACGAAGCAGATTCTGAAGTTGAAACCTTAAAGAGAACATTGCTTGAGCTTCAGACTGAA 700
||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CACAAAGCAGATTCTGAAGTCGAAAGCTTAAAGAGAACATTGCTTGAGCTTCAGACTGAA 420
Query 701 AAGGAAGCTTTGAATCTCCAATATCAGTTAATCTTGAGCAAAGTATCCAGATTTGAAAAG 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AAGGAAGCTTTGAATCTCCAATATCAGTTAATCTTGAACAAAGTATCCAGATTTGAAAAG 480
Query 761 GAACTCAACGATGCTCAAAAGGATGTTAAAGGATTTGATGAACGTGCTTGCAAAGCTGAC 820
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAACTTAACGATGCTCAAAAGGATGTTAAAGGATTTGATGAACGTGCTTGCAAAGCTGAC 540
Query 821 ATTGAGATTAAAATACTCAAGGAATCTCTTGCAAAGCTAGAGGTGGAGAGGGATACTGGG 880
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 541 ACAGAGATTAAAATACTCAAGGAATCTCTTGCAAAGCTAGAGGTGGAGAGAGATACTGGG 600
Query 881 CTTCTTCAGTATAGTCAAGCCATTGAGAGAATAGCGGATTTGGAAGCATCGATTTCTCAT 940
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CTTCTTCAGTATAGTCAAGCCATGGAGAGAATAGCGGATTTGGAAGCATCGATTTCTCAT 660
Query 941 GGGCAAGAATATGCGAAGGGGCTCACTAACCGAGTGTCTGAAGCA-GAAAGAGAAGCCAT 999
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 661 GGGGAAGAATATGCGAAGGGGCTCACTAACCGAGCATCTGAAG-ATGAAAGAGAAGCCAT 719
Query 1000 GAGTCTCAAGAAAGAGCTTTCTAGATTGCAGTCTGAGAAGGAGGCTGGCTTGC-TACGAT 1058
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 720 GAGTCTCAAGCAAGAGCTTTCTAGATTGAAGTCTGAGAAGGAGGCTGGCTTGCTTA-GAT 778
Query 1059 ACAATAAAAGCCTTGAGTTGATATCTTCCTTAGAGAAGACAATTAGAGATGCGGAGGAGA 1118
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 779 ACAATAAAAGCCTTGAGTTGATATCTTCTTTAGAAAAGACAATTAGAGATGCCGAGGAGA 838
Query 1119 GTGTTAGAGTATTCAGGGACCAATCGGAACAAGCAGAAACTGAAATCAAAGCTTTGAAAC 1178
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GTGTTAGAATATTCAGGGACCAATCTGAACAAGCAGAAAATGAAATCAAAGCTTTGAAAC 898
Query 1179 AAGAACTTCTGAAGTTGAACGAAGTCAATGAGGACTTGAATGTTCGATATCAGCAGTGTT 1238
|||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 AAGAACTTTTGAAGTCGAATGAAGTGAATGACGACTTGAATGTTCGATATCAGCAGTGTT 958
Query 1239 TGGAGACAATATCAAAGTTAGAGAGAGAAGTTTCTCATGCTCAAGATAATGCCAAAAGAC 1298
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 TGGAGACAATATCAAATTTAGAGAGAGAAGTTTCTCATGCTCAAGATAATGCCAAAAGAC 1018
Query 1299 TGAGCAGTGAAGTTCTTGCTGGCGCTGCAAAAATAAAGACTGTGGAGGAACAATGCGCTC 1358
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TGAGCAGTGAAGTTCTTGCTGGCGCTGCAAAGATAAAGACTGTGGAGGAACAATGCGCTC 1078
Query 1359 TTTTGGAGAGCTTCAATCAAACA-ATGAAGGTAGAAGCAGAAAATCTAGCGCACAAAATG 1417
||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TTTTGGAGAGCTTTAATCAAA-ATCTCAAGGTAGAAGCAGACAATCTAGCGCACAAAATG 1137
Query 1418 TCAGCTAAGGATCAAGAACTTTCCCAGAAGCAAAACGAGATTGAAAAGC--TTCAAGCTG 1475
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||
Sbjct 1138 TTAGCTAAAGATCAAGAACTTTCCCAGAAGCAAAACGAGCTTG--AAGCTTTTCAAGCTC 1195
Query 1476 TAATGCAAGAAGAACAATTGCGGTTTTCAGAACTTGGAGCTAGCCTTCGAAATTTGGAGA 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1196 TAATGCAAGAAGAACAATTGCGGTTTTCAGAACTTGGAGCTAGCCTTCGAAATTTGGAGA 1255
Query 1536 GTTTGCATTCTCAATCCCAAGAGGAGCAGAAGGTTCTCACCTCAGAACTTCATAGCCGGA 1595
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||
Sbjct 1256 GTTTGCATTCTCAATCCCAAGAGGAACAGAAGGTTCTCACCTTGGAACTTCAAAGCAGGA 1315
Query 1596 TTCAAATGTTGAGAGAACTGGAGATGCGAAATAGTAAGTTGGAAGGTGACATCAGCTC-- 1653
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 TTCAAATGTTGAGAGAACTGGAGATGCGAAATCGTAAGTTGGAAGGTGACATCAGCTCAG 1375
Query 1654 -TAAAGAAGAAAACCGAAACTTAAGCGAAATAAATGACACTTCTATCTCCTTGGAGATTC 1712
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 TTAAAGAAGAAAACCGAAACTTAAGCGAATTAAATGACACTTCTATCTCCTTGGAGATTC 1435
Query 1713 AGAAAAATGAGATCTCTTGCTTGAAGAAAATGAAAGAAAAGCTCGAGGAAGAAGTTGCGA 1772
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 AAAAAAATGAGATCTCTTGCTTGAAGAAAATGAAAGAGAAGCTCGAGGAAGAAGTTGCGA 1495
Query 1773 AACAGATGAACCAGAGCAGTGCCCTTCAAGTAGAGATCCACTGTGTGAAGGGTAATATTG 1832
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 AACAGATGAACCAAAGCAGTGCCCTTCAAGTAGAGATCCACTGTGTGAAGGGTAATATTG 1555
Query 1833 ACAGCATGAATAGGAGATACCAAAAAC-TAATTGACCAAGTAAGCCTCACAGGTTTCGAT 1891
||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1556 ACAACATGAATAGGAGATACC-AAAACTTAATTGATCAAGTGAGCCTCACAGGTTTCGAT 1614
Query 1892 CCCGAATCTCTTTCCTACTCCGTGAAGAAACTACAAGACGAGAACTCGAAGCTAGTCGAG 1951
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1615 CCCGAATCTCTTTCCTACTCCGTGAAAAAACTACAAGACGAGAACTCGAAGCTAATCGAG 1674
Query 1952 TTATGCACCAATCAGAGAGACGAAAATAATGCTGTTACAGGGAAGCTA-TGTGAAATGGA 2010
||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||
Sbjct 1675 TTATGTACCAATCAGAGAGGTGAAAAAAATGCTGTTACAAGAAAGCTATTG-GAAATGGA 1733
Query 2011 CAGCATTCTAAAGAGGAATGCTGATTTGGAGAAATTGCTTCTGGAATCAAACACCAAACT 2070
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1734 CAGCATTCTAAAGAGGAATGCTGATTTGGAGAAATTGCTTTTGGAATCAAACACCAAACT 1793
Query 2071 AGACGGTTCCAGGGAGAAAGCGA-AGGATCTG-ATAGAAAGATGTGAGTCTTTACGAGGA 2128
||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 AGACGGTTCCAGGGAGAAAGC-AGAGGATCTGCA-AGAAAGATGTGAGTCTTTACGAGGA 1851
Query 2129 GAGAAATCTGAGCTTGCTGCCGAGAGAGCTAACTTGGTTTCCCAGTTGCAAATCATGACT 2188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 GAGAAATCTGAGCTTGCTGCCGAGAGAGCTAACTTGGTTTCCCAGTTGCAAATCATGACT 1911
Query 2189 GCGAATATGCAGACACTCTTGGAAAAGAACTCTGTATTAGAGAAATCCCTGTCTTGTGCA 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 GCGAATATGCAGACACTCTTGGAAAAGAACTCTTTATTGGAGAAATCCCTGTCTTGTGCA 1971
Query 2249 AACATTGAGCTTGAAAGTTTGAGGGATAAGTCAAAGTGCTTTGATGATTTCTTCCAGTTT 2308
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1972 AACATTGAGCTTGAAAGTTTAAGGGATAAGTCAAAGTGCTTTGAAGATTTCTTCCAGTTT 2031
Query 2309 CTCAAAAATGATAAGTCTGAGCTTATGAAGGAAAGAGAATCTCTTGTCTCTCAGTTGTGT 2368
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |
Sbjct 2032 CTCAAAAATGATAAGTCTGAACTTATGAAGGAAAGAGAATCTATTGTCTTTCAATTGTAT 2091
Query 2369 AAGGTTGAGGAGAAGCTAGGAGTCTTGGAGAAGAAGTATACAGAACTGGAAGTAAGGTAT 2428
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 2092 ACGGTTGAGGAGAAGCTAGGAGCCTTGGAGAAGAAGTACACAGAACTGGAAGTAAAGTAT 2151
Query 2429 ACTGATTTACAGAGAGATAATAAGCTCAAAAGCCATCAAGTAGAAGAGTTACAGGTCTCA 2488
||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 ACTGATTCACAAAGCGATAATAAGCTCAAAAACCATCATGTAGAAGAGTTACAGGTCTCA 2211
Query 2489 CTTGCCGCTGAGAAGCAGGAGAGTGCTAATTACAAACGATC-TACTGAAAGCAGATTAGC 2547
|||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 2212 CTTGCCACTGAAAAGCAGGAAAATGATAATTACAAACGATCAT-CTGAAAGCAGATTAGC 2270
Query 2548 AGATCTTCAGAAGAATGTGAGCTTTCTTCGAGAAGAGTGTCGTTCCAGGAAAAGAGAGTA 2607
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 2271 AGATCTTCAGAAGAATGTGAGCTTTCTTCGAGAAGAGTGTCGCTCGAGGAAAAGAGATTA 2330
Query 2608 CGAGGATGAGCTTGACAGAGTTGTAAACAAACAAGTCGAGATCTTCATCTTGCAAAAGCT 2667
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2331 TGAGGATGAGCTTGACAGAGTTGTAAACAAACAAGTCGAGATCTTCATCTTGCAAAAGCT 2390
Query 2668 TATAGAAGATCTAGAGCAGAAGAATTTTTCTCTCCTGATTGAGTGTCAGAAGCATGTTGA 2727
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 TATAGAAGATCTGGAGCAGAAGAATTGTTCTCTCCTGATTGAGTGTCAGAAGCATGTTGA 2450
Query 2728 AGCATCAGAATTTTCCGAGAAACTCATTGCTGAGCTGGAAAGTGAGAATCTCGAGCAGCA 2787
|||||| ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2451 AGCATCGGAATTCTCAGAGAAACTCATTTCGGAACTGGAAAGTGAGAATCTCGAGCAGCA 2510
Query 2788 GATGGAAGCAGAAATATTTTTGGATGAGATTGATAGCTTGAGAGGTGCAATCTATCAGGT 2847
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 2511 GATGGAAGCAGAAATATTTTTGGATGAGATTGATAGCTTGAGGGGTGCAATCTGTCAAGT 2570
Query 2848 GATAAAGGCACTTCAAGTTGAAGCAGATTGCAAGACTGAACAGAAGATTACAAAAGACCA 2907
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2571 GATAAAGGCACTTCAAGTTGAAGCAGATTGCAAGGCTGAACAGAAGATTACGAAAGACCA 2630
Query 2908 AATTTCAGTT-TCACGTGCTTTGGGAGAGATTGATAGCCTAAAAGGTTCACTCTCCAGTG 2966
|||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2631 AATTTCAGTTGT-ACGTGCTTTGGGAGAGATTAAAAGCTTAAAATGTTCACTTTCCAGTG 2689
Query 2967 CTGAATATGAGATGCATCGACTTGTAGTTGAGAACTCGGTGCTTTTATCTCTACTTGGAC 3026
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2690 CTGAATATGAGATGCAGCGACTTGTAGTTGAGAACTCTGTGCTCTTATCTCTACTTGGAC 2749
Query 3027 AATTCCAGTCAGATGGTTTGGTGCTCGAATCGGAGAAGAACATACTCGAAAAAGATCTAA 3086
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2750 AATTCCAATCAGATGGTTTGGTGGTCGAATCGGAGAAGAACATTCTCGAAAAAGATCTAA 2809
Query 3087 AGACTAAAATACATCAGTGTGGAATGCTTGAAAAGGACAAGCAAGATCTACAGGAAGCGA 3146
|| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 2810 AGGCTATAATACATCACTGTGGAATACTGGAAAAGGACAAGCAAGATCTATTGGAGGCGA 2869
Query 3147 ACCGGTTGTTGAAATCAAAACTGATCAAAAGAGAGCAACAAGAGCAAAAGCTGAGAGCTG 3206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2870 ACCGGTTGTTGAAATCAAAACTGATCAAAAGAGAGCAACAAGAACAAGAGCTGAGAGCTG 2929
Query 3207 AACTG-AAATTTGAGAATTTGAAGTTTGAGAGTTTGCATGACTCATACATGGTTTTGCAA 3265
||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2930 AACTGCAAACG-GAGCATTTGAAGTTTGAGAGTTTGCATGAGTCATACATGGTTTTGCAA 2988
Query 3266 CAAGATTATTCCTATACACTCAATGATAACAAAACTTTGCTTCTGAAATTTTCAGAATTT 3325
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 2989 CAAGATTATTCCTATACACTCAATGATAACAAAAATTTGCTTCTGAAATTCTCAGAACTT 3048
Query 3326 AAAGATGGAATGCATGTAGTTGAGGAAGAAAATGATGCAATTCTTCAGGAGGCTGTTGCT 3385
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3049 AAAGATGGAATGTGTGTAATTGAGGAAGAAAATGATGCAATTCTTCAGGAAGCTGTTGCA 3108
Query 3386 TTGAGTAACACGTGTGTTGTTTACAGGTCCTTTGGGTCTGAAATGGCTGAGGAGGTCGAA 3445
||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3109 TTGAGTAACACATGTGTGGTTTACAGATCCTTTGAGTCTGAAATGGCTGAGGAGGTTGAA 3168
Query 3446 GATTTTGTTGAAACTGTAAGCAGTTTACGAGAAATTAGTACGGGACTGAAGCGCAAGGTT 3505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3169 GATTTTGTTGAAACTGTAAGCAGTTTACGAGAAATTAGTACGGGCCTGAAGCGCAAGGTT 3228
Query 3506 GAGACACTGGAGAAGAAGTTAGAAGGTAAAGAGAAAGAAAGTCAAGGTCTTAACAAGATG 3565
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 GAGACACTGGAGAAGAAGTTAGAAGGTAAAGAGGAAGAAAGTCAAGGTCTTAACAAGATG 3288
Query 3566 CTGGAAAATTTACAGGAAGGCCTTGAAGAAGACAACTTCTTAACTGGACTCTTGGAACAT 3625
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 3289 CTGGAGAACTTACAGGAAGGCCTTGAAGAAGACAACTTCTTAAATGGACTCTTGGAGCAT 3348
Query 3626 CAGGTTTCTAATGTAGACGAAATCTTGGAACATAGGGAAATGGAGATCCTAGAAGCAGAG 3685
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3349 CAGGTTTCTAATGTAGATGAAATCTTAGAACATAGGGAAATTGAGATCCTAGAAGCAGAG 3408
Query 3686 CATATGCTCAAGGCCACAAACAATGAAAACGAAGAGCTGCACAAAGAAGTTGAGGAGCTG 3745
|| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3409 CAAATGCTCAAGGCTACAAACAATGCAAATGAAGAGCTGCACAAAGAAGTTGAGGAGCTG 3468
Query 3746 AGGAAAGACTATGAAGACTCAAGACGGATGAGGGCAAATTTAGAGTGGCAGATTTCTGAA 3805
|||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 3469 AGGAAAGACTGTGAAGAATCAAGACGAATGAGGGGAAATTTAGAGAGGCAGATTTCCGAA 3528
Query 3806 CTGTCAGATGTTGCTGGAAGACAGGAGGAAGAGATTAGAAAACTTAACGCTTTGAATGAG 3865
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 3529 CTGTCAGATGTTGCTGGAAGACAGGAGGAAGAGATTCGAAAACTTAATGCTTTGAATAAG 3588
Query 3866 AATTTGGAGTCAGAGGTACAGTTTTTAAACAAAGAAATTCAACGACAACAGGTTCGAGAG 3925
||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3589 AATTTGGAGTCGGAGGTAGAGTTCTTAAACAAAGAAATTCAACGACAACAGGTTCGAGAA 3648
Query 3926 GAGTACCTGAGTTTGGAGCTGCAAGAGAAAAGCAATGAGATTGGACTTTGGGATTCTGCG 3985
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3649 GAGTACCTGAGTTTGGAGCTGCAAGAGAAAAGCAATGAGATTGGACTTTGGGATGCTGAA 3708
Query 3986 GCAACATCTTTCTACTTTGATCTTCAGGTCTCAGCTATCCGTGAACTCATTCTTGAGAAC 4045
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3709 GCAACATCTTTCTACTTTGATCTTCAGATCTCAGCTGTCCATGAACTCATTCTTGAGAAC 3768
Query 4046 AAAGTTAACGAACTC-TCAGGAGTTTGTGAAAACCTCAATGATGAAGTTGTTACGAAAAC 4104
||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3769 AAAGTTAACGAACTCAT-AGGAGTTTGTGAAAATCTCAATGATGAAGTTGTTACAAAAAT 3827
Query 4105 GACTAAGATTAAACAGATGAAAGAAACAGTTGGATTTTTGGAGTCTCAAGTGACTGAGCT 4164
||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3828 GACGAAGATAAAACAGATGAAAGAAACAATTGGCTTTTTGGAGTCTCAGGTGACTGAGCT 3887
Query 4165 GAAGAGTCAGTTGTCAGCTTATGATCCTGTGATAGCATCTTTGGCAGGGGATGTAAAAGC 4224
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 3888 GAAGAGTCAATTGTCAGCTTATGATCCTGTGATAGCATCTTTGGCAGTAGATGTAAAATC 3947
Query 4225 CCTTGAGAAAAGTACACATGCTTTAACGAAATTTCCTGCAACAGCCTATCAACAAAGAGT 4284
|||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3948 CCTTGAGAAAAGTACACAGGCTTTCACGAAGTTTCCTGCAACAGCCTATCAAGAAAGAGT 4007
Query 4285 GGGAAACAATCTGGAAGAAAGCGGCAGTACCACCAGC-CCATGCA 4328
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 4008 GGTAAACAATCTTGAAGAAAGCGGCAGTACCACCA-CTCCATGCA 4051
Score = 1537 bits (832), Expect = 0.0
Identities = 915/956 (96%), Gaps = 2/956 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4357 TCCAAGTATTAAGACCATCGAACAAGCA-TTTGTTAAAGAAAAAGGCAGGCTATCAAGGC 4415
|||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4044 TCCATGCATTAAGACCATCGAACAAGCACTTT-TTAAAGAAAAAGGCAGGCTATCAAGGC 4102
Query 4416 AAATAACACGAAGCACCTCCCAAAAACGCAGAGACCGCAGGAAGATTGAAAATATACAAC 4475
||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4103 AAAGAACACGAAGCGCCTCCCAAAAAAGCAGAGACCGCAAAAAAATTGAAAATATACAAC 4162
Query 4476 CTGATGACCAGGTCACTGGTGAATCTAGACAGCCAAGATTGAGGCCTGAGATGACAGAGG 4535
||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4163 TTGATGACAAGGTCTCTGGTGATTCTAGACAGCCAAGATCGAGGCCTGAGATGACAGAGG 4222
Query 4536 TGAAAAATGAATTATTAATGAAAGACAATCCTCGTGATCAAGTCACAGACTCCCTGACCT 4595
||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4223 TGAAAAATGGATTATTGATGAACGACATTCCTCGTGATCAAATCACAGACTCCCTGACCT 4282
Query 4596 ATGGCAGAAGCCAGGGAACTAGTCATGGTTCCAATGACATGTTTGAGTTTTGGGATGAAT 4655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4283 ATGGCAGAAGCCAGGGAACTAGTCATGGTTCCAATGACATGTTTGAGTTTTGGGATGAAT 4342
Query 4656 CTGCTGAATCAGAGACCAGTGTAAACTTTCTCATCAACAGTAACAAACCGCAGAGGTCAT 4715
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4343 CTGCTGAATCAGAGACCAGTATAAACTTTCTCATCAACAGTAACAAACCGCAGAGGCCAT 4402
Query 4716 TGAACTCCAATCTCCGTCATCAAAGCCGGAATCCCTCTATAGAATCTGATAAAGCGGTTG 4775
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4403 TGAACTCCAATCTCCGTCGCCAAAGCCGGAATCCCTCTATAGAATCTGATAAAGCGGTTA 4462
Query 4776 GAGTTGTTGACAAACTAGAGTTATCTAGAAACATCGAAGACAAGGCAAAGATTCTGGAGA 4835
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4463 GAGTTGTTGACAAGCTGGAGTTATCTAGAAACATCGAAGACAAGGCAAAGATTCTGGAGA 4522
Query 4836 GACTTTTGTCTGATTCAAGGAGACTGTCAAGTCTCCGGATTAGCCTAACAGATCTGAAAA 4895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4523 GACTTTTGTCTGATTCAAGGAGACTGTCAAGTCTCCGGATTAGCCTAACAGATCTGAAAA 4582
Query 4896 GAAAGCTGGAGATGAATGAGAAACAAAGAAGATTCAGCAACGCTGATTTGGTTATAGTGA 4955
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4583 GCAAGCTGGAGATGAATGAGAAACAAGGAAGATTCAGCAACGCTGATTTGGTTATAGTGA 4642
Query 4956 AGAGACAGTTGAAAGAAATGGAAGAAGCTGTCTCGCAGCTGGAAAACACAAACGAGATTC 5015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4643 AGAGACAGTTGAAAGAAATGGAAGAAGCTGTCTCGCAGCTGGAAAACACAAACGAGATTC 4702
Query 5016 TTTCAAAGGAAATTGAAGAGACTGGAGATGCCAGAGATATATACAGAAAGGTGGTCGTGG 5075
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4703 TTTCAAAGGAAATTGAGGAGACTGGAGATGCCAGAGATATATACAGAAAGGTGGTCTTGG 4762
Query 5076 AGAAGTCAAGAAGCGGGTCTGAGAAGATAGAGCAGCTGCAAAACAAAATGCAGAACATTG 5135
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4763 AGAAGTCAAGAAGCGGGTCTGAAAAGATAGAGCAGCTGCAAAACAAAATGCAGAGCATTG 4822
Query 5136 AGCAAACAGTTCTGAAGCTTGAAGATGGCACCAAAAGCAAAGGAAGGAAAATGTTTTCAG 5195
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4823 AGCAAACAGTGCTGAAGCTTGAAGATGGCACCAAAAGCAAAGGAAGGAAAATGTTTTCAG 4882
Query 5196 AGACTAGGACAGTGATTCTCTTGAGAGACATTATTCATAAGGGCGGAAAAAGAAGTGCGA 5255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |
Sbjct 4883 AGACTAGGACAGTGATTCTCTTGAGAGACATTATTCACAAGGGCGGGAAAAGAACTGCAA 4942
Query 5256 GAAAGAAGAAAAACCGGTTCTGCGGGTGTATAAGGTCTTCGACTAAAGAAGAGTAG 5311
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 4943 GAAAGAAGAAAAACCGGTTCTGTGGGTGTATAAGATCTTCAACTAAAGAAGAGTAG 4998
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 201096215732
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5