BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G14970.1 Length=4681 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg946845 jgi|Araly1|946845|scaffold_703074.1 4383 0.0 > Ahg946845 jgi|Araly1|946845|scaffold_703074.1 Length=4201 Score = 4383 bits (2373), Expect = 0.0 Identities = 2665/2806 (95%), Gaps = 20/2806 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1563 AGATTCTAGGTGCCCTAGTGACACATGTGGGATCTGATAACAAATTTGAGGTCAGTTCTG 1622 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1252 AGATTCTAGGTGCCCTTGTGACACATGTGGGATCTGATAACAAATTTGAGGTCAGTTCTG 1311 Query 1623 TCTTGGAGATGATGACAGCTCTGGTGAAAAAATATGCACAGCAACTCCTCCCCTTTTCTT 1682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct 1312 TCTTGGAGATGATGACAGCTCTGGTGAAAAAATATGCACTGCAACTCCTTCCCTTTTCTT 1371 Query 1683 CCCACATAAATGGTATCTCTGGAACTTGTATTTTGGACTACTTAGAGGGATTTACTATTG 1742 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1372 CCCACATAAATGGTATCTCTGGAACTTGTATTTTGGACTACTTAGAGGGATTTACAATTG 1431 Query 1743 ATAATTTGCATAAGGTCTATGAGGTTTTCAGCCTCCTCGCACTATCAGCTCGTGCAAGTG 1802 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1432 AAAATTTGCATAAGGTCTATGAGGTTTTCAGTCTCCTCGCACTATCAGCTCGTGCAAGTG 1491 Query 1803 GTGATTCTTTTCGATCTTCAATCTCAAATGAACTTATGATGATAGTAAGGAAGCAGGTTA 1862 | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1492 GCGATTCTTTTCGATCTTCAATTTCAAATGAACTTATGATGATAGTAAGGAAGCAGGTTA 1551 Query 1863 GTCATCCAGACCTCAAGTACAAAAAGATGGGCTTAGTTGGAAGTCTTAGGATTGTTTCGT 1922 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1552 GTCATCCAGACCTCAAGTACAAAAAGATGGGCTTAGTTGGAAGTCTTACAATTGTTTCGT 1611 Query 1923 CACTTGGGGATGCAAAGAGTGTTCCTGACTTTTCATCATCGCAGGTTTCAGATTGTGGGG 1982 |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1612 CACTTGGGGATGCAAATAGTGTTCCTGACTTCTCATCATCGCAGGTTTCAGATTGTGGGG 1671 Query 1983 AGATTTTGGAGCTCTTAAAGACATCTGTTGAATCTTGCAGACAGTCGAACTTAGCCCTAA 2042 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1672 AGATTTTGGAGCTCTTAAAGACATCTGTTGACTCTTGCAGACAGTCTAACTTAGCCCTAA 1731 Query 2043 TTATGTTCTATGATGAATTCGCTACCATTCTTAGCCATAAATTACTTCAACCAGAAATTA 2102 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1732 TTATGTTCTATGATGAATTTGCTACCATTCTTAGCCAAAAATTACTTCAACCAGAAATTA 1791 Query 2103 TGGAGTGGATTGGGAAGCATCTGGGAGAATTTGAGTCGCTTTTTCTAGCCGATCTTGAAA 2162 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1792 TGGAGTGGATTGGGAAGCATCTGGGGGAATTTGAGTCGCTATTTCTAGCCGATCTTGAAA 1851 Query 2163 AC-GAAAAGATGGCCGAAAAGGGTTCATATTCTGGACTAGAAGGGGATCTTTGGATGAAC 2221 || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1852 ACGGAAAA-ATGGCTGATAAGGGTTCATATTCTGGACTAGAAGGGGATCTTTGGATGAAC 1910 Query 2222 TTGGATGGTAGTATATCACCAATCTGTTTGAATATTTTGGCCCTGGCATCTTCATCCTCA 2281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1911 TTGGATGGTAGTATATCACCAATCTGTTTGAATATTTTGGCCCTGGCATCTTCATCCTCA 1970 Query 2282 GAGTCCTGTTGTCTGCAGATTCTTCCTTCAAATTTTCTTTTGCTATCAACTGTTGAGAGG 2341 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1971 GAGTCCTGTTGTCTGCAAATTCTTCCTTCAAATTTTCTTTTGCTATCAACTGTTGAGAGG 2030 Query 2342 TTGACAAATGATGGATCCCTTGCCGGGGTTGATGCTCTGCTCGGATGCCCTTTGCACCTT 2401 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2031 TTGACAAATGATGGATCCCTTGCCGGGATTGATGCTCTGCTCGGATGCCCTTTGCACCTT 2090 Query 2402 CCTTCTTCAAAGTACTTTGCTGCAGCTGGTTGGCAGTCTCTGGCAAAGAAGCAGAAAGAA 2461 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2091 CCTTCTTCAAAGTACTTTGCTGCAGCTAGTTGGCAGTCGCTGGCAAAGAAGCAGAAAGAA 2150 Query 2462 ATCCTCTCCCTCTCGTTATATTATGCTGCAAACTGGATACGAGAACTCCTGAACGCCTTC 2521 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2151 ATCCTCTCTCTCTCTTTATATTATGCTGCAAACTGGATACGAGAACTCCTGAACGCCTTT 2210 Query 2522 AGTTCCCAAATTGATGAAAAAATTGGTTGCATTAGTCAGGCTACTGTAAAGGATGTAACA 2581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| Sbjct 2211 AGTTCCCAAATTGATGAAAAAATTGGTTGCATTAGTCAGGCTACAGAAAAGGATGTTACA 2270 Query 2582 ACAAAGCTTCTAAAACGCCTCAGAAATTTAGTATTCTTGGAAAGCTTATTGAGTAATTTG 2641 |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| Sbjct 2271 ACAAAGCTTCTAAAGCGACTCAGAAATTTAGTATTCCTGGAAAGCTTATTGAGCAATTTG 2330 Query 2642 ATTACACTATCTCCTCAGTCTCTACCGGAGCTCCACCCTTATTCTGAATCTCATGTAGAA 2701 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2331 ATTACACTATCTCCTCAGTCTCTACCAGAGCTCCACCCTTATTCTGAATCTCATGTAGAA 2390 Query 2702 CATCCGAGGAAGAAGAACGAGAAGAGGAAGCTGGACGATGATGCCTCCCAACGCAAGGTA 2761 ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2391 AATCCGGGGAAGAAGAACGAGAAAAGGAAGCTAGACGATGATGCCTCCCAACGCAAGGGA 2450 Query 2762 AGCATGAAAAATAACTTGAAAAAATCAAAGCACTCAGATGTGAATGAAAAGCTGCGACAG 2821 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2451 AGCATGAAAAATAACTTGAAAAAATCAAAGCACTCAAATGTGAATGAAAAGCTGCGACAG 2510 Query 2822 CCAACTATTATGGACGCATTCAAGAAAGCAGGAGCAGTGATGAGTCATAGTCAAACACAG 2881 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct 2511 CCAACTATTATGGACGCATTCAAGAAAGCAGGAGCAGCGATGAGTCAAAGTCAAACACAG 2570 Query 2882 TTACGTGGAACCCCTTCCCTTCCATCTATGGATGGCAGCACAGCAGCGGGGTCAATGGAC 2941 ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 2571 CTACATGGAACCCCTTCCCTCCCATCTTTAAATGGCAGCACAGCAGCAGGGTCCGTGGAC 2630 Query 2942 GAAAATTGTTCTGATAATGAATCTCTAATTGTGAAGATTCCTCAAGTTTCCTCGGCACTT 3001 || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2631 GACAACTGTTCTGATAATGAATCTTTAATTGTGAAGATTCCTCAAGTTTCCTCGGCACTT 2690 Query 3002 GAAGCTCAAAGATTTAAGTTCAGGCCTCTTCTTCCTCAATGCCTTTCCATCTTAAATTTT 3061 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2691 GAAGCTCAAAGATTCAAGTTCAGGCCTCTTCTTCCTCAATGCCTTTCCATCTTAAATTTT 2750 Query 3062 CCAAAGGTTCTAAGCCAAGACATGGGCAGCCCTGAGTATAGAGCTGAGCTGCCTTTGTAT 3121 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| Sbjct 2751 CCAAAGGTTCTAAGCCAAGACATAGGCAGCCCTGAGTATAAAGCTGAGCTACCCGTGTAT 2810 Query 3122 TTGTATCTCTTACATGATCTTCACACCAAGCTGGATTGTCTTGTTCCTCCTGGTAAACAA 3181 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2811 CTGTATCTCTTACATGATCTTCACAACAAGCTGGATTGTCTTGTTCCTCATGGTAAACAA 2870 Query 3182 CATCCTTTTAAACGTGGAAGCGCTCCAGGTTATTTCGGGAGATTCAAATTGGTTGAACTT 3241 || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2871 CAACCTTTTAAACGTGGAAGTGCTACAGGTTATTTCGGGAGATTCAAATTGGTTGAACTT 2930 Query 3242 CTCAACCAAATTAAAAGACTTTTTCCAAGCCTCAGGATACATTTGAATATAGCTATTTCC 3301 |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2931 CTCAGTCAAATTAAAGGACTTTTTCCAAGCCTCAGGATACATTTGAATATAGCTATTTCC 2990 Query 3302 TTGCTAATAAGAGGTGATGAAACTTCTCAAACTACTTGGAGAGATGAGTTTGCTTTGTCC 3361 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct 2991 TTGCTAATAAAAGGTGATGAAACTTCTCAAACTAGTTGGAGAGATGAGTTTGCTATGGCC 3050 Query 3362 GGAAATCCGAACACATCCAGTATTGTGGTTTCTGAATCTCTGGTTTACACAATGGTGTGC 3421 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3051 GGAAATCCGAACATGTCCAATATTGTGGTTTCTGAATCTCTGGTTTACACAATGGTGTGC 3110 Query 3422 AAAGAAGTATTATACTGTTTCAGCAAGATATTGACCCTCCCCGAGTTTGAAACAGACAAG 3481 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3111 AAAGAAGTTTTATACTGTTTCAGCAAGATGTTGACCCTCCCTGAGTTTGAAACAGACAAG 3170 Query 3482 TCACTGTTGCTGAATCTTCTTGAAGCCTTCCAGCCAACTGAAATACCAGTAGCTAACTTT 3541 |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3171 TCACTGCTGCTGAATCTTCTTCAAGCCTTCCAGCCAACTGAAATACCAGTAGCTAGCTTT 3230 Query 3542 CCGGACTTTCAACCTTTTCCGTCACCGGGGACAAAGGAGTACTTGTATATTGGCGTTTCT 3601 ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3231 CCGGACTTTCAACATTTCCCGTCACCTGGGACAAAGGAGTACTTGTATATTGGCGTTTAT 3290 Query 3602 TATTTCTTTGAAGATATTTTGAATAAAGGTAACTATTTTTG-TTCGTTTACTGATGATTT 3660 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| Sbjct 3291 TATTTCTTTGAAGATATTTTGAATAAAGGTAATTATTTT-GCTTGGTTTACTGATGATTC 3349 Query 3661 CCCCTATCCATGTTCCTTCTCCTTTGATCTGGCCTTTGAATGTCTTCTCACTCTACAGTT 3720 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3350 CCCCTATGCATGTTCCTTCTCCTTTGATCTGGCCTTTGAATGTCTTCTCATTCTACAGTT 3409 Query 3721 AGTGGTGACCTCTGTACAAAAATATCTTGGTAAGGTATCTGAAGAAGCTAACAGAAAGAG 3780 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct 3410 GGTGGTGACCTCTGTACAAAAATATATTGGTAAGGTATCTGAAGAGGCTAACAAAAAGAG 3469 Query 3781 AAACCCAGGTCATTTTCATGGTCTTGTACCCAATCTACATGCCAAACTGGGAACTTCTGC 3840 |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3470 AAACCCGGGTCATTTTCAGGGTCTTGTACCCAGCCTACATGCCAAACTGGGAACTTCTGC 3529 Query 3841 TGAGAAACTTCTCAGGCATAAATGGGTCGATGAAAGTACTGATAATAAGGGCTTAAAGAA 3900 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3530 TGAGAAACTTCTCAGGCATAAATGGGTCGATGAAAGTACTGATAATAAGGGTTTAAAGAA 3589 Query 3901 CAAAGTATGTCCATTTGTGTCAAATTTGCGGATAGTACAATTTACAGG-TGAAATGGTTC 3959 |||||||||||||||||| | |||| || | | | |||| ||||||||||| Sbjct 3590 CAAAGTATGTCCATTTGT--C---TTTG-GGTT--TCCG-----CAGGGTGAAATGGTTC 3636 Query 3960 AGACCATATTGCGAATATACCTGGAAGCCAGTGGATCCACATCTGATTTGCTTGATGAGC 4019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3637 AGACCATATTGCGAATATACCTGGAAGCCAGTGGATCCACATCTGATTTGCTTGATGAGC 3696 Query 4020 TTGCTTGTACCATTTTACCTCAGGCCTCTCTATCCAAGTCAACAGGAGAAGATGATGATG 4079 ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3697 TTGCTTGTAACATTTTACCTCAGGCGTCTCTATCCAAGTCAACAGGAGAAGATGATGATG 3756 Query 4080 CCCGTGATCATGAATTCCCAACCCTATGCGCAGCTACTTTTAGAGGATGGTACAAGACAT 4139 || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3757 CCTGTGATCATGAATTCCCTACCCTATGCGCAGCTACTTTCAGAGGATGGTACAAGACAT 3816 Query 4140 TGCTTGAAGAGAATCTTGCAATTCTCAACAAACTGGTGAAGACGGTTAGCTCAGAGAAAC 4199 ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3817 TGCATGAAGAAAATCTTGCAATTCTCAACAAAATGGTGAAAACGGTTAGCTCAGAGAAAC 3876 Query 4200 GACAAAACTGTCAACC-GAAAACTACTGAGGCACACTTGAAAAACATTCAGAAAACTGTA 4258 | |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3877 GGCAAAACTGTCAATCTGAAG-CTACTGAAGCACACTTGAAAAACATTCAGAAAACTGTA 3935 Query 4259 AATGTGGTAGTATCTTTAGTCAACTTGTGCCGATCTCATGAAAAGGTCACAATTCATGGC 4318 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 3936 AATGTGGTAGTCTCTTTAGTCAACTTGTGCCGATCTCATGAAAAGGTTACAATCCATGGC 3995 Query 4319 ATGGCTATCAAGTATGGTGGGAAGTATGTGGACTCATTTCTTAAAG 4364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3996 ATGGCTATCAAGTATGGTGGGAAGTATGTGGACTCATTTCTAAAAG 4041 Score = 1845 bits (999), Expect = 0.0 Identities = 1168/1250 (93%), Gaps = 9/1250 (1%) Strand=Plus/Plus Query 189 TCTCCGTCGCCGTCACTGGAAAAATGGTGTTTCTCTCTCGCAAAAAGCCTCCA----C-C 243 |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | Sbjct 1 TCTCCGTCGCAATCTCCGGAAAAATGGTGTTTCTCTCTCGCAAAAAACCTCCACCGCCAC 60 Query 244 -GCCTCCGTCGTCATCCTCAGCTGCTCCGTCTCTCAAAATCCCCCAGCCGCAAAAGGAAT 302 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 61 AGCCTCCGTCGTCGTCCTCAGCTGCTCCGTCTCTCAAAATTCCCCAGCCGCAAAAGGAAT 120 Query 303 CCGTTGAGCCCGACGCGGTGGAGAAGATGACTGCCATTCTAGCCGAAGTTGGATGCACAC 362 |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 121 CCGTCGAGCCCGACGCGGTGGAGAATATGACTGCGATTCTAGCGGAAGTCGGATGCACAC 180 Query 363 TGATGAATCCGTACGGTCCGCCGTGTCTTCCTTCCGATCTACACGCTTTCCGCCGCAATC 422 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TGATGAATCCGTACGGTCCGCCGTGCCTTCCTTCCGATTTACACGCTTTCCGCCGCAATC 240 Query 423 TCACTGGTCGCTTATCGTCTTTCTCCGCCAATTCCGGCGAGAGAGATAACGTCGGTGCTC 482 ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct 241 TCACTACTCGCTTATCGTCTTGCTCCGCCAATCCCGGTGAGAGAGATCACGTCGGTGCTC 300 Query 483 TTTGCTCAGTTTTCGTAGCTGGATTTTCATTGTATATTCAATCTCCGAGTAATCTTCGAA 542 || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 301 TTCGCTCAGTTTTCGTAGCTGGATTTTCATCGTACATTCAATCTCCGAGTAATCTTCGTA 360 Query 543 GAATGC--T-TTCTTCTTCTTCAACAACTAAGAGAGACGAGAGTTTAGTTCGAAATCTCC 599 || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 361 GAGTGCTTTCTTCTTCTTCTTCAACAACTAATAGAGACGAGAGTTTAGCTCGAAATCTCT 420 Query 600 TGCTTGTATCTCCGATTCAACTCGATATTCAGGAAATGCTACTCGAGAAGCTTCCGGAGT 659 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 421 TGCTTGTATCTCCGATCCAACTTGATATTCAGGAAATGCTACTCGAGAAACTTCCGGAGT 480 Query 660 ACTTTGATGTAGTTACAGGATGTTCTTTGGAGGAAGATGTTGCTCGCCTTATCATCAACC 719 ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | Sbjct 481 ACTTTGACGTTGTTACAGGATGTTCTTTGGAGGAGGATGTTGCTCGCCTAATCATCAATC 540 Query 720 ATTTTCGTTGGCTCGATTTCATTGTTAATCCCCATGTGTTCACCGATAAGTTAATGCAAG 779 |||| |||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| Sbjct 541 ATTTCCGTTGGTTAGACTTCATTGTTAATCCCAATTTGTTCACCGATAAGCTGATGCAAG 600 Query 780 TTCTATCTATTTGTCCTTTGCACTTAAAGAAGGAAATTATTGGATCGTTGCCAGAGATTA 839 ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 601 TTCTATCAATTTGTCCTCTGCACTTAAAGAAAGAAATCATTGGATCCTTGCCAGAGATTA 660 Query 840 TTGGGGATCACAACTGTCAAGCTGTGGTTGATTCTTTAGAAAAGATGCTTCAGGAAGATT 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct 661 TTGGGGATCACAACTGTCAAGCTGTGGTTGATTCTTTAGAAAAGTTGCTTCAGGAGGATT 720 Query 900 CTGCTGTTGTTGTTGCAGTGCTTGATTCTTTCTCCAACCTTAATTTAGATGATCAATTGC 959 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 721 CTGCTGTTGTTGTTCCAGTGCTTGATTCTTTCTCTAACCTCAATTTAGATGATCAATTGC 780 Query 960 AAGAACAGGCGATTACAGTAGCGATATCATGTATTAGAACAATCGACGGAGAGCATATGC 1019 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| Sbjct 781 AAGAACAGGCGATTACAGTAGCAATATCATGTATTAGAACAATAGACGCAGAGCACATGC 840 Query 1020 CGTATCTACTTAGGTTTTTGCTTCTTGCTGCAACTCCTGTAAATGTTAGAAGGATAATCT 1079 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||| Sbjct 841 CGTATCTACTTAGGTTTTTGCTTCTTGCTGCTACTCCAGCAAATGTTAGAAGAATCATCT 900 Query 1080 CCCAGATAAGGGAACAGTTGAAATTCACCGGAATGTCACAACCTTGTGCTTCTCAAAATA 1139 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CCCAGATACGCGAACAGTTGAAATTCACCGGAATGTCACAACCTTGTGCTTCTCAAAATA 960 Query 1140 AACTCAAAGGAAAAGTACCTGCATATAATGCAGAAGGTTCTATTCTCCATGCTTTAAGAT 1199 ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 AACTCAAAGAAAAAATACCTGCATGTAATGCAGAAGGTTCTATTCTCCATGCTTTAAGAT 1020 Query 1200 CAAGCCTTCGATTTAAGAATATACTCTGTCAAGAAATTATAAAGGAGCTGAATAGTCTGG 1259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 CAAGCCTTCGATTTAAGAATATACTCTGTCAAGAAATCATAAAGGAGCTGAATAGTCTGG 1080 Query 1260 AGAAACCTCGAGATTTCAAGGTAATCGATGTATGGCTGCTTATTCTCATGTACATGAATG 1319 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1081 AGAAACCTCGGGATTTCAAGGTAATCGATGTATGGCTGCTTATTCTCATGTACATGAACG 1140 Query 1320 GGGATCCTGTCCGGAAGAGCATCGAGAAGATATTTAAGAAGAAAGTGGTTGATGAATGCA 1379 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GGGATCCTATCCGGAAGAGCATCGAGAAGATATTTAAGAAGAAAGTGGTTGATGAATGCA 1200 Query 1380 TACAAGAGGCCTTGCTTGATCAATGTATAGGTGGTAATAAAGAGTTTGTG 1429 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 TACAAGAAGCCTTGCTTGATCAATGTATAGGTGGTAATAAAGAGTTTGTG 1250 Score = 231 bits (125), Expect = 3e-59 Identities = 135/140 (96%), Gaps = 0/140 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4541 GGTAGCTTGAAACACAAGGACTTGAGAGGGCAAATAGTGAGTTCTCAGGCTTATATAGAT 4600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4041 GGTAGCTTGAAACACAAGGACTTGAGAGGGCAAATAGTGAGTTCTCAGGCTTATGTAGAT 4100 Query 4601 AACGAAGCCGATGAGGTTGAAGAAACCATGTCCGGAGAAGAAGAGCCCATGCAAGAGGAT 4660 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4101 AACGAAGCAGATGAGGTTGAAGAAACCATGTCCGGAGAAGAAGAACCCATGCAAGAGGAT 4160 Query 4661 GAACTTCCATTGACACCTTA 4680 ||| |||| ||||||||||| Sbjct 4161 GAAATTCCCTTGACACCTTA 4180 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 177119944742 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5