BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G15180.1
Length=7855
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg493373 jgi|Araly1|493373|fgenesh2_kg.7__2806__AT4G15180.1 8179 0.0
> Ahg493373 jgi|Araly1|493373|fgenesh2_kg.7__2806__AT4G15180.1
Length=7785
Score = 8179 bits (4429), Expect = 0.0
Identities = 4784/4957 (97%), Gaps = 18/4957 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2748 AGGAGTTGTTGGGATGTTCCG-CCCCATGAAAAGGGCGATCGAAGAATTTAAGTCAGACG 2806
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2840 AGGAGTTGTTGGGATGTTCCGAGCCCATCAAAAGGGCGATCGAAGAATTTAAGTCAGACG 2899
Query 2807 ATGCTTATGGTTCCGAGAGTGATGAGATAGGCAGCTGGTTTTCAGGTCGTTGGTCTTGCA 2866
||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2900 ATGTTTATGGTTCCGAAAGCGATGAGATAGGCAGCTGGTTTTCAGGTCGTTGGTCTTGCA 2959
Query 2867 AAGGCGGGGATTGGATAAGACAAGATGAAGCTTCTCAAGATAGATATTACAAAAAGAAAA 2926
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960 AAGGCGGGGATTGGATAAGACAAGATGAAACTTCTCAAGATAGATATTACAAAAAGAAAA 3019
Query 2927 TTGTTCTGAATGATGGTTTCCCGTTATGCCTGATGCAGAAATCTGGTCATGAGGATCCTC 2986
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3020 TTGTTCTGAATGATGGTTTCCCATTATGCCTGATGCAGAAATCTGGTTATGAGGATCCTC 3079
Query 2987 GGTGGCATCACAAGGATGACTTGTATTATCCTCTCAGTAGCTCTAGGCTTGAACTTCCTC 3046
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3080 GGAGGCATCACAAGGATGACATGTATTATCCTCTCAGTAGCTCTAGGCTTGAACTTCCCC 3139
Query 3047 TGTGGGCTTTTTCTGTTGTAGATGAGAGAAATCAGACGAGGGGAGTAAAAGCTAGTTTGC 3106
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3140 TGTGGGCTTTTTCTGGTGTAGATGAGAGAAATCAGGCGAGGGGAGTAAAAGCTAATTTGA 3199
Query 3107 TGTCCGTAGTTAGGCTGAACTCTTTGGTTGTTAATGACCAAGTTCCACCAATTCCTGATC 3166
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3200 TGTCCGTAGTTAGGCTGAACTCTTTGGTTGTTAATGACCAAGTTCCACCAGTTCCTGATC 3259
Query 3167 CTCGAGCAAAAGTTCGTAGTAAGGAGAGGTGCCCTTCAAGGCCTGCTCGTCCATCCCCTG 3226
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3260 CTCGAGCAAAAGTTCGTGGTAAGGAGAGGTGCCCTTCAAGGCCTGCTCGTCCATCCCCTG 3319
Query 3227 CATCTAGTGATTCCAAGAGGGAATCAGTAGAAAGTCATTCCCAATCAACAGCTTCCACTG 3286
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3320 CATCTAGTGATTCCAAGAGGGAATCAGTCGAAAGTCATTCCCAATCAACAGCTTCCAATG 3379
Query 3287 GTCAAGATTCACAGGGACTTTGGAAAACCGACACATCTGTAAACACTCCTAGGGATCGTC 3346
||||||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3380 CTCAAGATTCGCATGGACTTTTGAGAACCGACGCATCTGTAAACACTCCTAGGGATCGTC 3439
Query 3347 TGTGTACAGTCGATGATTTGCAATTGCATATAGGTGATTGGTTCTACACGGATGGGGCTG 3406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3440 TGTGTACAGTCGATGATTTGCAATTGCATATAGGTGATTGGTTCTACACGGATGGGGCTG 3499
Query 3407 GACAAGAACAAGGACCTCTGTCATTTTCGGAGCTCCAGAAATTGGTGGAGAAAGGTTTCA 3466
| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3500 GGCAAGAACAAGGACCTCTGCCATTTTGGGAGCTCCAGATATTGGTGGAGAAAGGTTTCA 3559
Query 3467 TTAAGAGCCACAGCAGTGTCTTCAGGAAATCTGATAAAATCTGGGTCCCTGTTACTTCTA 3526
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3560 TAAAGAGCCACAGCAGTGTCTTTAGGAAATCTGATAAAATCTGGGTCCCTGTTACTTCTA 3619
Query 3527 TCACAAAATCTCCTGAAACCATTGCCATGCTTCGGGGGAAAACCCCAGCTCTGCCTTCAG 3586
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 3620 TCACAAAATCTCCTGAAACCATTGCCAAGCTTCGGGGAAAAAACCCAGCTCTGCCTTCAG 3679
Query 3587 CTTGTCAAGGCCTTGTTGTCTCAGAGACTCAAGATTTCAAGTATTCTGAAATGGACACAA 3646
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 3680 ATTGTCAAGACCTTGTTGTCTCAGAGACTCAAGATTTGAAGCGTTCTGAAATGGACACAA 3739
Query 3647 GTCTAAACTCGTTCCATGGTGTGCACCCTCAGTTTCTTGGTTATTTCCGTGGGAAACTTC 3706
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3740 GTCTAAACTCGTTCCATGGTGTGCACCCTCAGTTTCTTGGTTATTTCCGTGGGAAACTCC 3799
Query 3707 ATCAATTGGTTATGAAAACATTCAAGAGTCGGGATTTTTCTGCTGCCATAAACGATGTTG 3766
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3800 ATCAATTGGTTATGAAAACATTCAAGAGTCGGGATTTTTCTGCTGCCATAAATGATGTTT 3859
Query 3767 TAGACTCTTGGATCCATGCAAGACAGCCTAAGAAAGAGAGTGAAAAGTACATGTACCAAT 3826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3860 TAGACTCTTGGATCCATGCAAGACAGCCTAAGAAAGAGAGTGAAAAGTACATGTACCAAT 3919
Query 3827 CATCAGAATTGAATTCTTGCTATACGAAAAGAGCTCGCTTGATGGCTGGTGAAAGTGGAG 3886
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3920 CTTCAGAATTGGATTCTTGCTATACGAAAAGAGCTCGCTTGATGGCTGGTGAAAGTGGAG 3979
Query 3887 AAGATTCTGAAATGGAAGATACCCAAATGTTTCAGAAGGATGAGTTGACATTTGAGGATT 3946
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3980 AAGATTCTGAAATGGAAGATACACAGATGTTTCAGAAGGATGAGTTGACATTTGAGGATT 4039
Query 3947 TATGTGGGGAC-TTAACCTTCAATATCGAAGGAAATAGATCTGCTGGCACCGTGGGGATT 4005
||||||||||| | |||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4040 TATGTGGGGACGCT-ACCTTCCAGATCGAAGGAAGTGGATCTGCTGGCACCGTGGGGATT 4098
Query 4006 TACTGGGGTCTGTTGGATGGCCATGCATTAGCACGGGTGTTTCATATGTTGAGATATGAT 4065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4099 TACTGGGGTCTGTTGGATGGCCATGCATTAGCACGGGTGTTTCATTTGTTGAGATATGAT 4158
Query 4066 GTAAAATCACTTGCATTTGCTTCCATGACTTGTAGACATTGGAAGGCCACTATTAATTCA 4125
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4159 GTAAAATCACTTGCATTTGCTTCCATGACTTGTAGGCATTGGAAGGCCACTATTAATTCA 4218
Query 4126 TACAAAGATATTTCAAGACAAGTTGACTTATCTTCTTTGGGTCCCAGCTGCACAGATTCT 4185
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4219 TACAAAGAAATTTCAAGACAAGTTGACTTATCTTCATTGGGTCCCAACTGCACAGATTCT 4278
Query 4186 AGGCTCAGGAGTATTATGAACACTTACAACAAGGAGAAGATAGACTCTATAATTCTGGTT 4245
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4279 AGGCTCAGGAGTATCATGAACACTTACAACAAGGAGAAGATAGACTCTATAATTCTGGTT 4338
Query 4246 GGTTGTACAAACGTGACTGCCAGCATGCTTGAGGAAATTCTTCGTTTACATCCCCGTATA 4305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||
Sbjct 4339 GGTTGTACAAACGTGACTGCCAGCATGCTTGAGGAAATTCTTCATATATTTCCCCGTATA 4398
Query 4306 TCTTCTGTAGACATCACAGGCTGCTCCCAGTTTGGAGATTTGACAGTGAACTATAAAAAC 4365
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4399 TCTTCTGTAGACATCACAGGCTGCTCCCAGTTTGGAGATTTGTCAGTGAACTATAAAAAT 4458
Query 4366 GTAAGTTGGCTCAGATGCCAGAATACTCGATCAGGTGAATTACATTCCAGGATAAGGAGT 4425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||
Sbjct 4459 GTAAGTTGGCTCAGATGCCAGAATACTCGATCAGGTGAACTGCATTCTAGGATAAGGAGT 4518
Query 4426 CTGAAACAGACTACAGAT-GTTGCTAAGTCTAAGGGTTTAGGGGGCGATACAGATGATTT 4484
||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4519 CTGAAACAGGCTACAGATGGTT-CTAAGTCTAAGGGTGTAGGGGGCGATACAGATGATTT 4577
Query 4485 TGGTAACCTTAAGGATTACTTTGATCGAGTAGAAAAGCGAGACTCAGCCAATCAGTTATT 4544
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4578 TGGTAACCTTAAGGATTACTTCGATCGAGTAGAAAAGCGAGACTCAGCCAATCAGTTGTT 4637
Query 4545 CCGGAGAAGCTTATACAAACGCTCAAAATTGTACGATGCAAGGAGATCATCTGCCATACT 4604
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4638 CCGAAGAAGCTTATACAAACGCTCCAAATTGTACGATGCAAGGAGATCATCGGCCATACT 4697
Query 4605 ATCCAGGGATGCTCGTATCAGGCGATGGGCAATTAAAAAGTCAGAACATGGGTATAAGCG 4664
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4698 ATCCAGAGATGCTCGTATCAGGCGATGGGCAATTAAAAAGTCAGAACATGGGTATAAGCG 4757
Query 4665 AGTGGAGGAATTCCTTGCTTCAAGTCTTCGAGGCATAATGAAGCAGAATACTTTTGACTT 4724
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4758 AGTGGAGGAATTCCTTGCTTTAAGTCTTCGGGGCATCATGAAGCTGAATACTTTTGACTT 4817
Query 4725 CTTTGCATTGAAGGTTTCTCAGATCGAGGaaaaaatgaaaaaTGGTTACTACGTTAGTCA 4784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4818 CTTTGCATTGAAGGTTTCTCAGATCGAGGAAAAAATGAAAAATGGTTACTACGTTAGTCA 4877
Query 4785 TGGTTTGAGATCTGTCAAGGAGGATATCAGCCGGATGTGCAGGGAAGCAATTAAAGATGA 4844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4878 TGGTTTGAGATCTGTCAAGGAGGATATCAGCCGGATGTGCAGGGAAGCAATTAAAGATGA 4937
Query 4845 ACTAATGAAATCATGGCAAGATGGCTCTGGGCTCTCATCAGCCACTAAGTACAACAAGAA 4904
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4938 ACTAATGAAGTCATGGCAAGATGGCTCAGGGCTCTCATCAGCTTCTAAGTACAACAAGAA 4997
Query 4905 GTTGAGTAAAACAGTAGCTGAAAAGAAGTACATGAGCAGGACTAGTGACACATTTGGTGT 4964
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4998 GTTGAGTAAAACAGTAACTGAAAAGAAGTATATGAGCAGGACTAGTGACACATTTGGTGT 5057
Query 4965 AAATGGTGCTTCTGACTATGGAGAGTATGCATCTGACCGAGAAATCAAAAGGCGTTTGTC 5024
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5058 AAATGGTACTTCTGACTATGGAGAGTATGCATCTGACCGAGAAATCAAAAGGCGTTTGTC 5117
Query 5025 TAAACTGAATCGTAAATCGTTTAGTTCGGAAAGTGACACATCTTCTGAACTTTCTGACAA 5084
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5118 TAAACTGAATCGTAAATCCTTTAGTTCGGGAAGTGAAACATCTTCTGAACTCTCTGACAA 5177
Query 5085 TGGCAAGAGTGACAACTATAGCTCAGCTTCGGCTTCAGAAAGTGAATCGGACATCCGTTC 5144
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5178 TGGCAAGAGTGACAACTATAGCTCAGCTTCGGCTTCAGAAAGTGAATCAGACATCCGTTC 5237
Query 5145 AGAAGGTCGATCACAAGACTTACGCATC-GAAAAATACTTCACAGCAGACGATTCTTTTG 5203
||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 5238 AGAAGGTCGATCACAGGACTTACGCA-CTGAAAGATACTTCACAGCAGACGAGTCCTTTG 5296
Query 5204 ATTCGGTGACCGAAGAGCGTGAATGGGGTGCACGCATGACCAAAGCTAGTCTTGTGCCAC 5263
|||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5297 ATTCTGTGACAGAAGAGCGTGAATGGGGTGCTCGTATGACCAAAGCTAGTCTTGTGCCAC 5356
Query 5264 CTGTTACTAGGAAATATGAAGTGATTGAAAAGTATGCAATTGTTGCGGATGAGGAGGAAG 5323
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5357 CAGTCACTAGGAAATATGAAGTGATTGAAAAGTATGCAATTGTCGCGGATGAGGAGGAAG 5416
Query 5324 TACAACGAAAGATGCGGGTTTCTTTGCCAGAGGACTATGGTGAGAAGCTTAATGCACAAA 5383
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5417 TACAACGAAAGATGCGGGTTTCTCTGCCAGAGGACTATGGTGAGAAGCTTAATGCACAAA 5476
Query 5384 GAAATGGCATTGAAGAATTAGATATGGAACTGCCTGAAGTCAAGGAGTATAAACCAAGAA 5443
||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 5477 GAAATGGTATTGAAGAGTTAGATATGGAACTCCCTGAAGTAAAGGAGTTTAAACCAAGAA 5536
Query 5444 AGCTTCTTGGCGATGAGGTTTTAGAGCAAGAGGTTTATGGAATCGATCCTTACACCCATA 5503
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5537 AGCTTCTTGGCAATGAGGTTTTAGAGCAAGAGGTTTATGGAATCGATCCTTACACCCATA 5596
Query 5504 ACCTCTTACTTGATTCAATGCCTGGAGAATTGGACTGGTCACTGCAGGATAAACATTCAT 5563
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5597 ACCTCTTACTTGATTCAATGCCCGGAGAATTGGACTGGTCACTACAGGATAAACATTCAT 5656
Query 5564 TTATAGAAGATGTAGTCTTACGGACCCTGAACAGGCAAGTTCGGCTGTTCACTGGATCTG 5623
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5657 TTATAGAAGATGTAGTCTTACGTACCCTGAACAGGCAAGTTCGGCTGTTCACTGGATCTG 5716
Query 5624 GAAGCACCCCTATGGTATTCCCTTTAAGGCCTGTGATTGAAGAGCTCAAAGAGAGTGCTC 5683
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5717 GAAACACCCCTATGGTATTCCCTTTAAGGCCTGTGATTGAAGAGCTCAAAGAGAGTGCTC 5776
Query 5684 GTGAAGAGTGTGATATACGAACAATGAAGATGTGTCAAGGCGTCTTAAAGGAAATAGAAA 5743
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5777 GTGAAGAGTGTGATATACGAACACTGAAGATGTGTCAAGTCGTCTTAAAGGAAATAGAAA 5836
Query 5744 GTCGTTCTGATGATAAATATGTTTCTTATCGGAAGGGCCTTGGTGTTGTGTGCAACAAAG 5803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5837 GTCGTTCTGATGATAAATATGTTTCTTATCGGAAGGGCCTTGGTGTTGTGTGCAACAAAG 5896
Query 5804 AAGGTGGTTTTGGAGAAGAAGATTTTGTTGTTGAATTTCTTGGAGAGGTTTATCCTGTTT 5863
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5897 AAGGTGGTTTTGGAGAAGAAGATTTTGTTGTTGAATTTCTTGGAGAGGTTTATCCTGTAT 5956
Query 5864 GGAAGTGGTTTGAGAAGCAAGATGGGATCCGTTCCTTACAGGAAAACAAAACTGATCCTG 5923
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5957 GGAAGTGGTTTGAGAAGCAAGATGGGATTCGTTCCTTACAGGAAAACAAAACTGATCCTG 6016
Query 5924 CACCAGAGTTCTACAATATATATCTTGAGAGACCAAAGGGTGATGCTGATGGATATGATT 5983
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6017 CACCAGAGTTCTACAATATATACCTTGAGAGACCAAAGGGTGACGCTGATGGATATGATC 6076
Query 5984 TAGTCGTTGTTGATGCCATGCACATGGCTAACTACGCAAGTCGAATTTGTCACTCTTGCC 6043
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6077 TAGTCGTTGTTGATGCCATGCACAAGGCTAACTACGCAAGTCGAATTTGTCACTCTTGCC 6136
Query 6044 GACCTAATTGTGAAGCTAAGGTTACTGCGGTGGATGGACACTACCAGATTGGCATCTATT 6103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6137 GACCTAATTGTGAAGCTAAGGTTACTGCGGTGGATGGACACTACCAGATTGGCATATATT 6196
Query 6104 CAGTACGCGCTATTGAATATGGCGAGGAGATAACTTTCGATTATAATTCTGTAACTGAGA 6163
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6197 CAGTACGTGCTATTGAATATGGCGAGGAGATAACTTTCGATTATAATTCTGTAACTGAGA 6256
Query 6164 GTAAGGAAGAATATGAAGCGTCTGTTTGCTTGTGTGGTAGCCAAGTATGTCGAGGCAGCT 6223
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6257 GTAAGGAAGAATATGAAGCGTCTGTTTGCTTGTGTGGTAGCCAAGTATGTCGCGGCAGCT 6316
Query 6224 ACTTGAATCTCACTGGTGAAGGTGCATTTCAGAAGGTGTTGAAGGATTGGCATGGTCTGC 6283
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6317 ACTTGAATCTCACTGGGGAAGGTGCATTTCAGAAGGTGTTGAAGGATTGGCATGGTCTGC 6376
Query 6284 TGGAACGACACAGACTGATGCTGGAAGCTTGTGTATTGAATTCAGTTTCAGAAGAAGATT 6343
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6377 TGGAACGACACAGACTGATGCTGGAAGCTTGTATACTGAATTCAGTTTCAGAAGAAGATT 6436
Query 6344 ATCTTGAGTTGGGAAGAGCTGGACTGGGAAGTTGTTTGCTTGGTGGGTTGCCAGATTGGA 6403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6437 ATCTTGAGTTGGGAAGAGCTGGACTGGGAAGTTGTTTGCTTGGCGGGTTGCCAGATTGGG 6496
Query 6404 TGATTGCTTATTCTGCTCGTCTGGTCCGGTTCATCAATTTCGAGAGAACAAAGCTACCCG 6463
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6497 TGATTGCGTATTCTGCTCGTCTGGTGCGGTTCATCAATTTCGAGAGAACAAAGCTACCCG 6556
Query 6464 AGGAAATTCTTAAGCACAATCTAGAAGAAAAGAGAAAATACTTTTCAGATATACACCTTG 6523
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6557 AGGAAATTCTTAAGCATAATCTAGAAGAAAAGAGAAAATACTTTTCAGATATACACCTTG 6616
Query 6524 ATGTTGAGAAAAGTGATGCTGAGGTTCAGGCTGAGGGTGTCTACAATCAGAGGCTTCAGA 6583
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6617 ATGTTGAGAAAAGTGATGCTGAGGTTCAGGCGGAGGGTGTCTACAATCAGAGGCTTCAGA 6676
Query 6584 ATTTGGCTGTTACACTTGACAAGGTGCGATATGTTATGAGACATGTGTTTGGGGATCCAA 6643
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6677 ATTTGGCTGTTACACTTGACAAGGTACGATATGTTATGAGACATGTGTTTGGGGATCCAA 6736
Query 6644 AGAACGCTCCTCCTCCGCTGGAGAGGCTTACTCCTGAAGAAACAGTGTCTTTTGTTTGGA 6703
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 6737 AGAACGCTCCTCCTCCGCTGGAGAGGCTTACTCCTGAAGAAACAGTCTCTTTTGTATGGA 6796
Query 6704 ACGGGGATGGCTCTTTAGTTGATGAGCTTCTTCAGAGCCTGTCACCGCACCTTGAAGAAG 6763
||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6797 ACGGGGATGGCTCCTTAGTTGATGAGCTTGTTCAGAGCCTGTCACCGCACCTTGAAGAAG 6856
Query 6764 GCCCTCTTAATGAACTCAGATCAAAGATTCATGGCCATGATCCATCTGGATCTGCTGATG 6823
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6857 GCATTCTTAATGAACTCAGATCAAAGATTCATAGCCATGATCCATCTGGATCTGCTGATG 6916
Query 6824 TTTTAAAGGAACTTCAGAGATCGTTACTTTGGTTGAGAGATGAGATCCGAGATCTCCCAT 6883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6917 TTTTAAAGGAACTTCAGAGATCGTTACTTTGGTTGAGAGATGAGATCCGAGATCTCCCAT 6976
Query 6884 GTACATACAAGTGTCGGAATGATGCTGCAGCTGATTTAATTCACATATATGCCTATACCA 6943
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 6977 GTACATACAAATGTCGGAATGATGCTGCAGCTGATTTAATTCACATATATGCCTATACAA 7036
Query 6944 AGTGCTTTTTCAAAGTTCGGGAATACCAGTCCTTTATCTCTTCTCCTGTACACATTAGTC 7003
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 7037 AGTGCTTTTTCAAAGTTCGGGAATACCAGTCCTTTATCTCTTCTCCCGTACACATTAGTC 7096
Query 7004 CGTTAGATTTGGGGGCTAAGTATGCTGACAAGTTAGGTGAGAGTATAAAGGAGTACCGGA 7063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7097 CGTTAGATTTGGGGGCTAAGTATGCTGACAAGTTAGGTGAGAGTATAAAGGAGTACCGGA 7156
Query 7064 AGACTTATGGCGAGAACTATTGTCTCGGGCAGCTAATTTACTGGTATAACCAGACAAATA 7123
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7157 AGATTTATGGCGAGAACTATTGTCTCGGGCAGCTAATTTACTGGTATAACCAGACAAATA 7216
Query 7124 CTGATCCAGATCTTACATTGGTGAAAGCAACCAGAGGTTGCTTGTCTTTACCCGATGTTG 7183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7217 CTGATCCAGATCTTACATTGGTGAAAGCAACCAGAGGTTGCTTGTCTTTACCCGATGTTG 7276
Query 7184 CTTCCTTCTATGCAAAGGCCCAGAAACCATCGAAGCATCGTGTATATGGCCCAAAGACGG 7243
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 7277 CTTCCTTCTATGCAAAGGCCCAGAAACCATCGAAGCATCGTGTATATGGCCCAAAGACAG 7336
Query 7244 TGAAAACTATGGTTTCACAGATGTCTAAGCAACCTCAAAGACCGTGGCCAAAGGATAAAA 7303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7337 TGAAAACTATGGTTTCACAGATGTCTAAGCAACCTCAAAGACCGTGGCCAAAGGATAAAA 7396
Query 7304 TATGGACGTTCAAAAGCACCCCAAGAGTATTTGGAAGCCCGATGTTCGATGCCGTCCTTA 7363
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7397 TATGGACGTTTAAAAGCACCCCAAGAGTATTTGGAAGCCCGATGTTCGATGCCGTCCTTA 7456
Query 7364 ATAACTCATCATCACTAGATAGAGAACTGTTGCAGTGGTTAAGAAATAGACGGCATGTCT 7423
||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 7457 ATAACTCGTCA-C--TAGATAGAGAACTGTTGCAGTGGCTAAGAAATAGAAGGCATGTCT 7513
Query 7424 TCCAAGCGACATGGGATAGTTAGGTAAAAAATCTTCTTTATTAT-TT-AGCAGGTTGCCC 7481
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 7514 TCCAAGCGACATGGGATAGTTAGGTAATAA-TCTTCTTTATTATATTTAGCAGGTTGCCC 7572
Query 7482 TTTTGGGAAAGCGAGAAGTCGGGGCAACACACAGTTACTATAAATAGTCTCATATCCATG 7541
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7573 TTTTGGGAAAGCGAGCAGTCGGGGCAACACACAGTTACTATAAATAGTCTCATATCCATG 7632
Query 7542 AACAAAGCCATTCACTGCAAAGGTCCTCAGCTTTCCCCTCATTCTTGTGTATAGCTCTTT 7601
||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 7633 AACAAT-C-ATTCCCTGCAAAGGTCCTCAGCTTTCCCCTCATTCTTGTGTATAGCT-TT- 7688
Query 7602 GCCATATATGTGATTTTGGAACTTGGTAATAACTTTGGGTT-AGGACCATTGTTATTCTG 7660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 7689 GCCATATATGTGATTTTGGAACTTGGTAATAACTTTGGGTTTAGGGCCATTGTTATTCTG 7748
Query 7661 GTTAGATTAGGCTTACATAATTTTCAGAGAGGAGAAT 7697
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 7749 GTTAGATTAGGCTCACATAATTTTCAGAGAGGAGAAT 7785
Score = 3973 bits (2151), Expect = 0.0
Identities = 2586/2787 (93%), Gaps = 65/2787 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 aaaaaaaaCATAAACGgagaaagagagagag------aacgatacagaa--gagaagcca 56
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1 AAAAAAAACATTAACGGAGAAAGAGAGAGAGAACACAAACGATACAGAAGCGAGAAGCGA 60
Query 57 aggtcgcagagagaaACAATACACACGGCGACAGATATATTTCCCGGCGAAACGGGAACA 116
|||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |
Sbjct 61 AGGTCGCAGAGAGAAAGAATACACACGGCGACACAAATATTTCCCGGCGAAAC-GG---A 116
Query 117 ATAATATATACagagagagagagagatttagt--gagagagCTTTCTAGGG---TTTTCT 171
|||| || | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 117 ATAAGAT-T---GAGATAGAGAGAGATTTAGTGAGAGAGAGCTTTCTAGGGTTTTTTTCT 172
Query 172 TCTTCTCGATTTATCTTCCTTTGACCTCGATCTATTCCTCTTCCTTCTCCATAAATTTTC 231
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||
Sbjct 173 TCTTCTCGATTTGTCTTCTTTTGACCTCGATCTATTCCTCTTCGTTCTCGAGAAA-TTTC 231
Query 232 CCTTCTTCTCACCTTCATTCATATCTCTCCTAGCTCCATTCTAGGG-TTC-TTGATCCGT 289
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 232 CCTTCTTCTCACGTTCATTCATATCTCTATTAGCTCCATTCTAGGGTTTCTTTGATCCGT 291
Query 290 TTCTCTACCTTTTCGTTTTCTTCCTCCGGGT-T-GTTTAATT-TA-CTCCGGCGGGTGAC 345
|||| || |||||||| ||||||| | ||| | ||| || || | |||| ||||
Sbjct 292 TTCTTTAGGTTTTCGTTATCTTCCT-C-GGTATAATTT-CTTCTAGCGGCGGC-GGTG-G 346
Query 346 CAAAT-TGGCGGTGGCAAAGTATGAGTATTGATTTCCCTGGGAAAGGGGAGAGTTAGGGA 404
| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 347 GGATTCTGAAGCAAAAAAAGTATGAGTATTGATTTCCCTGGGAAAGGGGAGAATTAGGGA 406
Query 405 AGTTTGGGCT-AGAGAG-AAATTGGATTGGGTTTCCATGAGCGATGGGGGTGTCGCATGC 462
|||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407 AGTTTGGG-TAAAAGAGAAAATTGGATTGGGTTTCCATGAGCGATGGGGGTGTCGCATGC 465
Query 463 ATGCCTCTACTGAATATCATGGAAAAGCTTCCAATTGTGGAGAAGACGACTCTTTGTGGA 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 466 ATGCCTCTACTGAATATCATGGAAAAGCTTCCAATTGTGGAGAAGACGACTCTCTGTGGA 525
Query 523 GGCAATGAAAGCAAGACTGCTGCTACTACGGAAAATGGTCACACATCTATCGCAACCAAG 582
||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||
Sbjct 526 GGCAATGAAAGCAAGACTGTTGGTACTACGGATAATGGTCATACATCTATCTCAAGTAAG 585
Query 583 GTTCCGGAGTCTCAGCCAGC---TAATAAACCTTCAGCGTCGTCTCAGCCAGTTAAGAAG 639
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 586 GTTCCGGAGTCTCAGCCAGCTGATAATAAACCTTCAGC-T--TCTCAGCCAGTTAAGAAG 642
Query 640 AAGAGAATTGTTAAGGTAATTCGTAAAGTGGTTAAGAGGAGACCAAAGCAGCCGCAGAAA 699
||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 643 AAGAGGATTGTTAAGGTAATTCGGAAAGTTGTTAAGAGGAGACCTAAGCAGCCGCAGAAA 702
Query 700 CAAGCTGATGAGCAGCTGAAAGACCAGCCACCTTCCCAGGTAGTGCAACTCCCTGCAGAA 759
||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 CAAGCGGAGGAGCAGCTGAAAGATCAGCCACCATCCCAGGTAGTGCAACTCCCTGCAGAA 762
Query 760 TCACAGTTGCA---G-ATTA--A--A-GAGCAGGATAAGAAGAGTG-AGTTTAAAGGAGG 809
||||||||||| | | | | | |||||| |||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 763 TCACAGTTGCAGCCGAAAGAGCAGGAGGAGCAGAATAAGAAGAGTGAAG-TTAAAGGAGG 821
Query 810 AACTAGTGGGGTTAAAGAAGTGGAAAACGGTGGAGATTCTGGGTTTAAGGATGAAGTGGA 869
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 AACTAGTGGGGATAAAGAAGTCGAAAACGGTGGAGATTCTGGGTTTAAGGATGAAGTGGA 881
Query 870 AGAGGGTGAATTAGGTACGTTAAAGCTTCATGAGGATTTGGAGAACGGTGAAATCTCTCC 929
|||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 882 AGAGGGTGAATTAGGTACGTTAAAGCCTCCTGGGGATTTGGAGAACGGTGAAATCTCGCC 941
Query 930 AGTAAAGTCATTGCAGAAGAGTGAGATTGAAAAGGGCGAGATTGTTGGGGAGAGTTGGAA 989
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 AGTAAAGTCATTGCAGAAGAGTGAGATCGAAAAGGGCGAGATTGTTGGGGAGAGTTGGAA 1001
Query 990 GAAAGATGAACCTACCAAGGGTGAGTTCAGTCATCTAAAATATCATAAAGGGTATGTGGA 1049
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 GAAAGATGAACCTACCAAGGGTGAGTTCAGTTATCTCAAATATCATAAAGGGTATGTGGA 1061
Query 1050 GAGAAGGGATTTTTCAGCAGATAAGAACTGGAAAGGAGGTAAAGAAGAAAGAGAATTCAG 1109
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1062 GAGAAGGGATTTTTCCGCAGATAAGAACTGGAAAGGAGGTAAAGAAGACAGAGAATTCAG 1121
Query 1110 ATCATGGAGAGATCCCAGTGATGAAATTGAAAAGGGGGAATTCATCCCAGACAGATGGCA 1169
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 ATCATGGAGAGATTCCGGTGATGAAATTGAAAAGGGGGAATTCATCCCAGACAGATGGCA 1181
Query 1170 AAAAATGGATACAGGAAAAGATGATCATAGTTATATCAGATCTCGTAGGAATGGAGTAGA 1229
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1182 AAAAATGGATGGAGTAAAAGATGATCATAGTTATATCAGATCTCGTAGGAATGGAGTTGA 1241
Query 1230 CAGAGAGAAAACGTGGAAATATGAATATGAATATGAACGTACCCCGCCAGGTGGAAGGTT 1289
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1242 CAGAGAGAAAACGTGGAAATATGAATATGAATATGAACGTACCCCGCCCGGTGGAAGGTT 1301
Query 1290 TGTGAATGAGGATATCTACCACCAGAGAGAGTTCAGAAGTGGGCTTGACAGGACTACGAG 1349
|| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1302 TGCGAATGAGGATATCTACCACCAGAGAGACTTCAGAAGTGGGCATGACAGGAGTACGAG 1361
Query 1350 GATCAGTTCTAAAATTGTTATAGAGGAAAATTTACATAAGAATGAATACAACAATTCCAG 1409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1362 GATCAGTTCTAAAATTGTTATAGAGGAAAATTTACATAAGAATGAATACAACAATCCCAG 1421
Query 1410 TAATTTTGTAAAGGAGTACTCTTCTACTGGGAACAGATTGAAGCGACATGGAGCTGAACC 1469
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1422 TAATTTTGTAAAGGAGTACTCTTCCACTGTGAACAGATTGAAGCGACATGGAGCTGAGCC 1481
Query 1470 AGATAGCATTGAGCGCAAACATTCCTATGCTGATTATGGGGATTATGGGAGTTCTAAATG 1529
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 AGATAGCATTGAGCGCAAACACTCCTATGCTGATTATGGGGATTATGGGAGTTCTAAATG 1541
Query 1530 TAGAAAACTTTCAGATGATTGTTCCCGCTCTCTTCACTCGGACCACTACTCACAGCATTC 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||
Sbjct 1542 TAGAAAACTTTCAGATGATTGTTCCCGCTCTCTTCACTCAGATCACTATTCACAGCATTC 1601
Query 1590 TGCTGAGAGACTGTACAGAGATTCATATC-CATCAAAAAATTCATCTCTGGAAAAGTATC 1648
||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 TGCTGAGAGACTGTACAGAGATTCATA-CTCATCGAAAAATTCATCTCTGGAAAAGTATC 1660
Query 1649 CTAGAAAGCATCAAGACGCATCTTTCCCTGCCAAGGCTTTTTCAGACAAACATGGACACA 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 CTAGAAAGCATCAAGACGCATCTTTCCCTGCCAAGGCTTTTTCAGACAAACATGGACACA 1720
Query 1709 GCCCTTCGCGATCTGACTGGTCCCCACATGACCGGTCTAGGTACCATGAAAACAGGGATA 1768
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1721 GCCCTGCACGATCTGACTGGTCCCCACATGACCGGTCTAGGTACCATGAAAATAGGGATA 1780
Query 1769 GAAGTCCATATGCTCGGGAGAGATCACCATACATCTTTGAGAAGTCTTCACATGCTCGTA 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 GAAGTCCATATGCTCGGGAGAGATCACCATACATCTTTGAGAAGTCTTCACATGCTCGTA 1840
Query 1829 AAAGATCTCCTCGTGACCGC--C-GTCACCATGATTATAGAAGAAGTCCAAGTTACTCTG 1885
|||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 AAAGGTCTCCTCGCGACCGCAGCCGTCACCATGACTATAGAAGAAGTCCAAGTTACTCTG 1900
Query 1886 AGTGGTCACCTCATGATCGCTCTAGGCCTAGTGATCGCAGGGACTATATTCCTAACTTTA 1945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1901 AGTGGTCACCTCATGATCGCTCTAGGCCTAGTGATCGCAGGGACTCTATTCCTAACTGTA 1960
Query 1946 TGGAAGATACCCAGAGCGATCGTAACAGGCGCAATGGGCATAGGGAAATAAGCAGGAAAA 2005
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1961 TGGAAGATACCCAGAACGATCGTAACAGGCGCAATGGGCACAGGGAAATAAGCAGGAAAA 2020
Query 2006 GTGGAGTTAGGGAGAGGAGGGATTGTCAGACTGGTACGGAGCTTGAGATTAAGCACAAAT 2065
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 2021 GTGGAGTTAGGGAGAGGAGGTATAGTCAGACTGGTACGGAGCTTGAGAATAAGCACAGAT 2080
Query 2066 ATAAGGAATCTAATGGAAAAGAGTCAACCTCGTCAAGCAAAGAATTGCAAGGTAAAAACA 2125
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 ATAAGGATTCTAATGGAAAAGAGTCAACCTCATCAAGCAAAGAATTGCAAGGTAAAAACA 2140
Query 2126 TTTTGTACAACAATAGTCTGCTGGTTGAGAAAAATTCCGTCTGTGATTCATCCAAGATTC 2185
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2141 TTTTGTACAACAATAATCTGGTGGTTGAGAAAAATTCCGTCTGTGATTCATCCAAGATTC 2200
Query 2186 CAGTTCCGTGTGCAACGGGAAAAGAGCCTGTGCAAGTTGGTGAAGCCCCAACAGAAGAGT 2245
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2201 CAATTCCGTGTGCAACGGGAAAAGAGCCTGTGCAAGTTGGTGAAGCCCCACCAGAAGAGT 2260
Query 2246 TGCCATCAATGGAGGTAGATATGGACATTTGTGACACACCACCTCACGAGCCTATGGCGT 2305
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2261 TGCCATCAATGGAGGTAGATATGGACATTTGTGACACACCGCCTCACGAGCCTATGGCGG 2320
Query 2306 CTGATTCATCCTTGGGGAAGTGGTTTTATCTTGATTACTATGGCACAGAACATGGGCCTG 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2321 CTGATTCATCCTTGGGGAAGTGGTTTTATCTTGATTATTATGGCACAGAACATGGGCCTG 2380
Query 2366 CAAGGTTATCCGATCTCAAAGCTCTTATGGAGCAAGGCATTCTGTTCTCCGATCATATGA 2425
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2381 CAAGGTTATCCGAACTCAAAGCTCTTATGGAGCAAGGCATTCTTTTCTCCGATCATATGA 2440
Query 2426 TAAAGCATTCAGATAATAATAGGTGGCTCGTAAATCCTCCTGAAGCTCCTGGTAATTTAT 2485
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441 TAAAACATTCAGATAATAATAGGTGGCTCGCCAATCCTCCTGAAGCTCCTGGTAATTTAT 2500
Query 2486 TAGAAGACATTGCAGATACTACTGAAGCAGTTTGTATTGAGCAAGGAG-CTGGAGATTCC 2544
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2501 TAGAAGACATTACAGATACTACTGAAGCAGTTTGTATTGAGCAAG-AGGCTGGAGATTCC 2559
Query 2545 TTGCCTGAATTAGTGTCCGTACGGACCCTACCAGATGGTAAAGAAATTTTT-GTAGAGAA 2603
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |
Sbjct 2560 TTGCCTGAATCAGTGTCCGTAATGACCATACCAGATGCTAATGAA-TTTTTAGTAGAGCA 2618
Query 2604 TCGTGAAGATTTCCAGATTGATATGAGGGTCGAAAATCTCTTGGATGGTCGTACTATCAC 2663
|| |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||| ||||||| |
Sbjct 2619 TCTTGAAGATTTCCAGATTGATAAGAGGATTGCAAATCTCTTGGAGGGTTATACTATCGC 2678
Query 2664 TCCTGGCAGAGAATTTGAAACACTTGGAGAAGCTCTGAAGGTTA-ATGTTGAGTTTGAGG 2722
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | |
Sbjct 2679 TCCTGGCAGAGAATTTGAATCACTTGGAGAAGCTCTGAATGTTACA-GTTGAGTTTAAAG 2737
Query 2723 AGACCAGAAGATGTGTGACATCTGAAG 2749
||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 AGACCCGAAGATGTGTGACATCTGAAG 2764
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 297620900127
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5