BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G16310.1
Length=5387
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg493254 jgi|Araly1|493254|fgenesh2_kg.7__2687__AT4G16310.1 8770 0.0
> Ahg493254 jgi|Araly1|493254|fgenesh2_kg.7__2687__AT4G16310.1
Length=5373
Score = 8770 bits (4749), Expect = 0.0
Identities = 5175/5380 (96%), Gaps = 32/5380 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATGGTAAGGAGAAGAAATCTGGTTCCAAGAGAGGATCTAAGGTTTTTCAGTTTGAC 60
|||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGGTACGGGGAGGAAATCTGGTTCCAAGAGAGGATCTAAGGTTTTTCAGTTTGAC 60
Query 61 GATGATGCTGATGATGATGAACCTATTGGATCTCTCTTAGAGATTATGAAGCATAAAAGT 120
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GATGATGCTGATGATGATGAACCTATCGGATCTCTCTTAGAGATTATGAAGCATAAAAGT 120
Query 121 TCCAAGAAGGATAAGGTTGAGACAGAAAGTACTGGTAAACAGAGGCAGAAACAGGTTGTG 180
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCAAGAAGGATAAGGTTGAGACGGAAAGTACTGGTAAACAGAGGCAGAAACAGGTTGTG 180
Query 181 GAAAAGAAGCTGAGTGCTTTGGGCAAGGATTCTGAAGATATGGATGACACATTAGCCAGT 240
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 181 GAAAAGAAGCTGAGTGCTTTGGACAAGGATTCTGAAGATATGGATGACACCTTAGCCAGT 240
Query 241 TTTAGGAAGAGGTTGAAGGGTAACAAGAAAGGTGTTGAATCAGGAACCTCAAGAGTTAGG 300
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||
Sbjct 241 TTTAGGAAGAGATTGAAGGGCAACAAGAAAGGTGTTGGATCAGGAACCCCAAGAATTAGG 300
Query 301 AACCACGAGGGTG---------TTGATACTGTAACAAATTCTAATTTGAAACCAATTGAG 351
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AACCACGAGGGTGTTCCTCCTATTGATACTGTAGCAAATTCTAATTTGAAACCAATTGAG 360
Query 352 GAAGCCAACAAAAACGAGGTGCAGAGTGTATTACTTAGGGAAAACGGTGCTTCTAATTCT 411
|||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 361 GAAGGCAACACAAACAAGGTGCAGAGTGTATTACTTAGGGAAAATGGTGCTTCTAATTCT 420
Query 412 ATTCAAAAATGTGCTTCAGAAACTGGAACCCTCTTGCATAAGTTTTCTGGTAAAGATAAG 471
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 421 ATTCAAAAGTGTGCTTCAGAAACTGGAACCCTCCTGCATAAGTTTTATGGTAAAGATGAG 480
Query 472 GCAGCCTCTCCCAGTCATGAAAAAGTAGAAACAGTATCCAGTGAGAAGGAAGCAGATGTC 531
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 481 GCAGCCTCTCCCGGTCATAAAAAAGTAGAAACAGTCTCCAGGGAGAAGGAAGCAGATGTC 540
Query 532 TTTCATCAAATTACAAAGGAGGAATCCGAGATACCAATGTCAGAGAAGGCTGTGGAGCTA 591
||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 541 TTTCATCAAATTACAGAGGAGGAATCCAAGCGACCAATGTCGGAGAAGGCCCTGGAGCTA 600
Query 592 TCCAGGGTGTCTGTCCCCATGCCAGATGTCCATGGCGAAGTTAATTGTACTATTGCTCCT 651
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 601 TCCAGGGTGTCTGTTCCCATGCCAGATGTCCATGGCGAAGTTTATTGTCCTATTGCTCCT 660
Query 652 GATAAGCACATACACTTGGGAGAGCCAACTTCAGAGTCCGGTTATTACCGAGAGAAGAAT 711
||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GATCAGCACATACACCTGGGAGAGCCAGCTTCAGAGTCCGGTTATTACCGAGAGAAGAAT 720
Query 712 TTAGTTATGTGTGATTGTGGTACCCAATTTAATTTTGAGGATCGTTCCTTTGAGTCTAAT 771
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTAGTTATGTGTGATTGTGGTATCCAAGTTAATTTTGAGGATCGTTCCTTTGAGTCTAAT 780
Query 772 ACTCAGGTTACTCTCTGTCAAAAGTGCAAGTATTCTTCACACCATAATGCTTCTAATGGA 831
|| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ACCCATGTTACTCTCTGTCATAAGTGCAAGTATTCTTCACACCATAATGCTTCTAATGGT 840
Query 832 GGTGGTATTCAAGTTAATACTCTAGAAGATGGAACTGCTCAAGCTTCGCCGGTTTCTATA 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 841 GGTGGTATTCAAGTTAATACTCTAGAAGATGGAACTGCTCAAGCTTCCCCGGTTTCTATA 900
Query 892 ATTCCCTGCGAAGATGAAAATTTCCGAGGGGATGCAATTTCACTACCTAATTCTGGGAAG 951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 901 ATTCCCTGCGAAGATGAAAATTTCCGAGGGGATGCAATTTCATTACCTAATTCTAGGAAG 960
Query 952 CCATCGACCTTGCAACGCCCAGAGCGTATTGCTAAAAAGCGTAAGCTTGGAAACATGGTG 1011
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTATCCACCTTGCAACGCCCAGAGCGTATTGCTAAAAAGCGCAAGCTTGGAAACATGGTG 1020
Query 1012 TATGAAGGAGACGTGAAATGGGAGAATGAGCAAGGCTTTCTTGATTGTCAAAGTGACAAG 1071
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TATGAAGGAGACATGAAATGGGAGAATGAGCAAGGCTTTCTTGATTGTCAAAGTGACAAG 1080
Query 1072 TCCTTTAAGGGAAGCGACAAGTGTGGTTTTGTTCCATCTATTTCCAAGGAAATTGAAATT 1131
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1081 TCCTTTAAGGGAAGCGACAAGTGTGATTTTGTTCCATCTATTTCCAAGGACATTGAAATT 1140
Query 1132 GGTAGAGCAGCTGCGGTAACAGCTGGACTTAAAGCCCAGTCAGTAAGTCCAATTGAGAAG 1191
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GGTAGAGCAGCTGCGGTGACAGCTGGACTTAAAGCCCAGTCGGTAAGTCCAATTGAGAAG 1200
Query 1192 ATTATACTTAAAGAGGTGTTGAAGCGCAAAGGTAGCAATCAGGAGTACCTAGTTTGCAGG 1251
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 ATTATACTTAAAGAGGTGTTGAAGCGCAAAGGTAGCCATCAGGAGTACCTAGTTTGCAGG 1260
Query 1252 AACTCTATCTTAGGCCTGTGGAGTAAAAATGTCAGCCGAATCTTACCTGTCACTGAATGT 1311
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1261 AATTCTATCTTAGGCCTGTGGAGTAAAAATGTCAGCCGAATCTTACCTGTCACTGAGTGT 1320
Query 1312 GGTGTTACCGGAGGCCCTTCTGAGAGTGAATTGCCTTCAGCTTCCCTTATCAGAGAAGTC 1371
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GGTGTTACCGGTGGCCCTTCTGAGAATGAATTGCCTTCAGCTTCCCTTATCAGAGAAGTC 1380
Query 1372 TATAAGTTTCTTGATCAGAGAGGTTATATAAATGCTGGAATTTCATCTGTGAATGGAAAG 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1381 TATAAGTTTCTTGATCAGAGAGGTTATATAAATGCTGGAATTTCATCTGTGAAGGGGAAG 1440
Query 1432 GCGGCATCTTCGACTAATCAAGACTATGATCTCCTCCAGGGGAGACAGCTTGAAGAAAGT 1491
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1441 GCGGGATCTTTGACTAATCAAGACTATGATCTCCTCCAGGGGAGAAAGCTTGAAGAAAGT 1500
Query 1492 TCTATGGCTTCTGTTGCAGATTCTGAAGAGGGAGTTGCTTTTATCCTTGGTCAGGTCAAA 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TCTATGGCTTCTGTTGCAGATTCTGAAGAGGGAGTTGCTTTTATCCTTGGTCAGGTCAAA 1560
Query 1552 GCCGTTGAATCAACTAGTGAGGGTAAGAAATGTGCTCTCCAAAACGATGAAAGGGACTTG 1611
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1561 GCCGTTGAATCAACTAGTGAGGGTAAGAAATGTGCTTTCCAAAATGATGAAAGGGACTTG 1620
Query 1612 GTAGGATGTGCGACCTCGGAAATGTTGGAATCTATCAGCAAAAAATGCGAAGCAAGCATT 1671
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 1621 GTAGGATGTGCGACCTCGGAAATGTTGGAATCTACCAGCAAAACATGTGAAGCAAGCATT 1680
Query 1672 ATTGATGATAACAAACGTTCTGTGAGCATGAATGCTTTACAGGATAGTACTGCATCTAAT 1731
||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1681 ATTGATGATTGCAAACATTCTGTGAGCATAAATGCTTTACAGGATGGTACTGCATCTAAT 1740
Query 1732 GTTGAAAAGCATCCTGAAACATTTTCAGTAGCGAAGCCTGCTTTGTCTAGCACACTCTCC 1791
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GTTGAAAAGCATCCTGAAACTTTTTCAGTAGCTAAGCCTGCTTTGTCTAGCACACTCTCC 1800
Query 1792 TCTGCACATAGTAATCAAATGAGAGGAAGGGACTGTGTTCCATGTGAGGTTATAGATGAG 1851
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1801 TCTGCAAATAGTAATCAAATGAAAGGAAGGGACTGTGTTCCATGTGAGGTTAAAGATGAG 1860
Query 1852 AAGAAAGTTATAGTAATTGGAGCTGGTCCTGCTGGATTAACAGCAGCACGTCATTTACAG 1911
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1861 AAGAAAGTTATAGTTATTGGAGCTGGTCCTGCGGGATTAACTGCAGCACGTCATTTACAG 1920
Query 1912 CGCCAGGGTTTTTCTGTAACCGTTCTTGAGGCAAGGAGTAGAGTAGGTGGTCGTGTATTT 1971
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CGCCAGGGTTTTTCGGTAACCGTTCTTGAGGCAAGGAGTAGAGTAGGTGGTCGTGTATTT 1980
Query 1972 ACAGACCGGTCGTCTCTTTCAGTTCCTGTGGATCTTGGGGCTAGCATAATTACAGGCATT 2031
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1981 ACAGACCGTTCGTCTCTTTCAGTTCCTGTGGATCTTGGGGCTAGCATAATTACTGGCATT 2040
Query 2032 GAGGCTGATGTGCCATCTGAAAGAATGCCAGATCCATCGGTATTGGTCTGTAACCAATTA 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GAGGCTGATGTGCCATCTGAAAGAATGCCAGATCCTTCGGTATTGGTCTGTAACCAATTA 2100
Query 2092 GGTCTGGAGTTGAGCGTGTTACATGGATTCTGTCCTCTTTATGATACTGTAACAGGGAAA 2151
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 GGTCTGGAGTTGAGCGTGTTGCATGGATTCTGTCCTCTTTATGATACTGTAACAGGGAAA 2160
Query 2152 AAGGTTCCTGCAGAATTAGATGATGCTCTACAAGCAGAGTTCAACAGTCTAATTGACGAT 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 AAGGTTCCTGCAGAATTAGATGATGCTCTACAAGCAGAGTTCAACAGTCTAATTGACGAT 2220
Query 2212 GTAGATTTGCTTGTTGAGGAAATAGGCAAGGAAAGAGCAAATAAAATGTCTCTTGAGGAT 2271
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTGGATTTGCTTGTTGAGGAAATAGGCAAGGAAAGAGCAAATAAAATGTCTCTTGAGGAT 2280
Query 2272 GGTCTAGAATATGGCCTTCAACGGCTGAGAATGCCACATGACAAGGTGAACATTGACAAA 2331
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 GGTTTAGAATATGGCCTTCAACGGTTGAGAATGCCACATGACAAGGTGAACATTGACAAA 2340
Query 2332 TTTGGGCTT-CTCAATTCAAGCTCAAAAACGGGCATCAGAGGTCCCTTTATGCAGGATGA 2390
|||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||
Sbjct 2341 ATTGGGCTTGC-CAATTCAAGCTCAAAAACAGGCATCAGTGGTCCCTTTACGCAAGATGA 2399
Query 2391 AAGCTGGAAAGATGATTTTTTGAATCCTTTGGAGCGAAGAGTTATGAATTGGCATTTTGC 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 AAGCTGGAAAGATGATTTTTTGAATCCTTTGGAGCGAAGAGTTATGAATTGGCATTTTGC 2459
Query 2451 TCACACAGAATATGGTTGTGCTGCTGTCCTCAAGGAAGTTTCGCTTCCTCACTGGAATCA 2510
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 TCACACAGAATATGGTTGCGCTGCTGTCCTCAAGGAAGTTTCGCTTCCTCACTGGAATCA 2519
Query 2511 AGATGAGTTTTATGGCGGGTTTGGAGGGCCTCATGCTATGATTAAGGGTGGTTATAGCCG 2570
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2520 AGATGAGTTTTATGGCGGGTTTGGAGGGCCACATGCTATGATTAAAGGTGGTTATAGCCG 2579
Query 2571 AGTTGTTGAGTCGCTTGCAGAAGGACTGGACATTCACTTAAACAAAATAGTTTCAGATGT 2630
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2580 AGTTGTTGAGTCGCTTGCAGAAGGACTTGACATTCACTTAAACAAAATAGTTTCTGAGGT 2639
Query 2631 ATCTTATGTCTCTGATGTATCTGCCATGGATAACAGCAAGCATAAAGTCAGAGTTAGTAC 2690
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 ATCTTATACCTCTGATGTATCTGCCATGCATAACAGCAAGCATAAAGTCAGAGTTAGTAC 2699
Query 2691 ATCAAATGGCTGTGAGTATCTTGGAGATGCTGTTCTGGTAACTGTTCCACTTGGATGCTT 2750
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2700 ATCAAATGGCTGTGAGTATCTTGGAGATGCTGTTCTGGTAACTGTTCCTCTTGGATGCTT 2759
Query 2751 GAAAGCAGAAACTATTAAGTTTTCACCACCCTTGCCGGACTGGAAATATGCGTCAATCAA 2810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2760 GAAAGCAGAAACTATTAAGTTTTCACCACCCTTGCCGGACTGGAAATATGCGTCAATCAA 2819
Query 2811 ACAACTTGGTTTTGGAGTTCTAAATAAAGTTGTTTTGGAGTTCCCA-ACGGTATTTTGGG 2869
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 2820 ACAACTTGGTTTTGGAGTTCTAAATAAAGTTGTGTTGGAGTTCCCAGA-GGTATTTTGGG 2878
Query 2870 ATGATAGTGTTGATTACTTTGGGGCAACTGCTGAGGAAACAGATCTAAGAGGTGAGTGCT 2929
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 ATGATAGTGTTGATTATTTTGGGGCAACTGCTGAGGAAACAGATCTAAGAGGTGAGTGCT 2938
Query 2930 TTATGTTTTGGAATGTCaaaaaaaCTGTTGGTGCTCCTGTCCTGATAGCTTTGGTGGTTG 2989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 TTATGTTTTGGAATGTCAAAAAAACTGTTGGTGCTCCTGTCCTGATAGCTTTGGTGGTTG 2998
Query 2990 GGAAGGCTGCTTTTGAATATACAAACAAGAGTAAGTCTGAGCACGTGAACCATGCAATGA 3049
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999 GGAAGGCTGCTTTTGAATATACAAACAAGAGTACGTCTGAGCACGTGAACCATGCAATGA 3058
Query 3050 TGGTTCTTCGGAAGCTTTTTGGTGGGGATCTGGTTCCTGATCCTGTCGCCTCGGTAGTTA 3109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3059 TGGTTCTTCGGAAGCTTTTTGGTGGGGATCTGGTTCCTGATCCTGTTGCCTCGGTAGTTA 3118
Query 3110 CTGACTGGGGCACTGATCCTTACAGTTATGGTGCCTACTCGTATGTTGCTATTGGTGCTT 3169
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3119 CTGACTGGGGCACTGATCCTTACAGTTATGGTGCCTACTCATATGTTGCTATTGGTGCTT 3178
Query 3170 CTGGTGAAGATTATGATGTATTGGGAAGGCCTGTTCAGAATTGTTTGTTTTTTGCTGGTG 3229
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 CTGGTGAAGATTATGACGTATTGGGAAGGCCTGTTCAGAATTGTTTGTTTTTTGCTGGTG 3238
Query 3230 AGGCAACATGCAAAGAGCATCCTGACACTGTTGGTGGTGCAATGATGACTGGAGTCCGGG 3289
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3239 AGGCAACATGCAAAGAGCATCCTGACACTGTTGGTGGTGCAATGATGACTGGAGTCCGAG 3298
Query 3290 AAGCTGTGCGTATAATTGATATACTTAGAAGTGGAAATGATTACACAGCCGAAATAGAAA 3349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 AAGCTGTGCGTATAATTGATATACTTAGAAGTGGAAATGATTACACAGCCGAAATAGAAA 3358
Query 3350 CACTAGAAAAAGCGCAGAGGAAATCTGTACCTGTAAGGGATGAAGTCAGAGACCTAATAA 3409
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3359 CACTAGAAAAAGCGCAGAGGAAATCTGTACCTGTGAGGGATGAAGTCAGAGACCTAATAA 3418
Query 3410 AGAGGCTGGAAGTTGTTGAGCTGTCTAATGTGCTAGCCAGGCAATCATTGCTACGAAACA 3469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3419 AGAGGCTGGAAGTTGTTGAGCTGTCTAATGTGCTAGCCAGGCAATCATTGCTACGGAACA 3478
Query 3470 TGTTCTTCTCTGCCAAAACAACTGTCGGGCGTTTGCATTTAGCCAAGGAGTTGCTTAACC 3529
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 TGTTCTTTTCTGCTAAAACAACTGTCGGGCGTTTGCATTTAGCCAAGGAGTTGCTTAACC 3538
Query 3530 TACCTGGTGAAACCTTGAAATCCTTTGCAGGTACAAAAGAAGGGCTTGCAGTGCTGAACT 3589
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3539 TACCTGGTGAAACCTTGAAATCCTTTGCAGGCACAAAAGAAGGGCTTGCAGTGCTGAACT 3598
Query 3590 CTTGGATCCTGGATTCGATGGGTAAGAATGGAACCCAGCTTTTACGTCACTGTGTACATA 3649
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3599 CTTGGATCCTGGATTCGATGGGGAAGAATGGAACCCAGCTTTTACGTCACTGTGTACATA 3658
Query 3650 TTCTTGTTCGAGTTACGAGTGACCTCTTTGCCTTGAGGCTATCAGGTATTGGGAAGACTG 3709
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 3659 TTCTTGTTCGAGTTACGAGTGATCTCTTTGCCGTGAGGCTCTCAGGCATTGGGAAGACTG 3718
Query 3710 TGAAAGAAAAGGTTTGTGCACACACGAGCCGTGATATTCGTGCCATTGCAAGTCAGCTTG 3769
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3719 TGAAAGAAAAGGTTTGTGCACACACAAGCCGTGATATCCGTGCCATTGCAAGTCAGCTTG 3778
Query 3770 TTAATGTGTGGCTGGATCTATACCGGAAAGAAAAAGCT-AATAGTGGAAAGAAATCGTTG 3828
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3779 TTAATGTGTGGCTGGAACTATACCGGAAAGAAAAAG-TAAATAGTGGAAAGAAATCATTG 3837
Query 3829 AGACAAGCGAATACTACAAACACCTCTAGAATAAGAAGAAAACTGAATAGTCCGGACACA 3888
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3838 AGACAAGCGAATACAACAAACACCTCTAGAATAAGAAGAAAACTGAATAGTCCGGACACA 3897
Query 3889 GACAGTAAGGGAAAGCTGAGCAATGGCAACGATGTGAAAACAGATGAAGAGTTTGAGGAC 3948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3898 GACAGTAAGGGAAAGCTGAGCAATGGCAACGATGTGAAAACAGATGAAGAGCTTGAGGAC 3957
Query 3949 AACCAGCTACCTATGTCAGAGGAAGAGAAGGCTGTGTTTGCTGAAGCTGAGGCGGCTCGT 4008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3958 AACCAGCTACCTATGTCAGAGGAAGAGAAGGCTGTGTTTGCTGAAGCTGAGGCGGCTCGT 4017
Query 4009 GCAGCAGCAGAAGCAGCTGCAAAGGCATTTTCTGAGGCCTATCATAATACTTCATTGCAG 4068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4018 GCAGCAGCAGAAGCAGCTGCAAAGGCATTTTCTGAGGCCTATCATAATACTTCATTGCAG 4077
Query 4069 CTTCCTAAGATCCCCTCATTTCATAAGTTTGCCAGGCGAGAGCAGTATGCAAAGATGGAC 4128
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4078 CTTCCTAAGATTCCCTCGTTTCATAAGTTTGCCAGGCGAGAGCAGTATGCAAAGATGGAC 4137
Query 4129 GAATCTGATTTCAGGAAAAAGTTTCCTGGAAATGTCTTAGGAAGACAAGATTGTATGTCA 4188
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4138 GAATCTGATTTCAGGAAAAAGTTTCCTGGCAATGTCTTAGGAAGACAAGATTGTATGTCA 4197
Query 4189 GAGATTGACTCGAGGAACTGCAAAGTTAGGGACTGGTATGATTTTCCTGCCTCGTGCCTT 4248
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4198 GAGATAGACTCGAGGAACTGCAAAGTTCGGGACTGGTATGATTTTCCTGCCTCCTGCCTT 4257
Query 4249 GACCTTGACAGTGCAAGGATTCCAGTTGATAACTATTCACAGCCTAGCCATTCGAATGAG 4308
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 4258 GACCTTGACAATTCAAGGATTCCAGTTGATAACTATTCACAGCGTAGCCATTCAAATGAG 4317
Query 4309 CTTGTATCTCATTCGAAGTTCAGAGAATGTTCTGGAGAAAGTGTGGCTGCGGATACCAGT 4368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4318 CTTGTATCTCATTCGAAGTTCAGAGAATGTTCTGGAGAAAGTGTGGCTGCGGATACCAGT 4377
Query 4369 TTCTTAACTGGGGCATGGGTTGATACTGGTGGTAGTAGCGATGGTTTCAAGGATTCTCAG 4428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4378 TTCTTAACTGGGGCATGGGTTGATACTGGTGGTAGTAGCGATGGTTTCAAGGATTCTCAG 4437
Query 4429 GCTATAGATAGATGGCAATCTCAAGCTGCTGCTGCTGATCCTGAATTTTTCAATCGTACT 4488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4438 GCTATAGATAGATGGCAATCTCAAGCTGCTGCTGCTGATCCTGAATTTTTCAATCGTACT 4497
Query 4489 TTGCATATAAAGGATGAAGAAGATTCGATTGCTTGTTCGACTGGCCCTCCTAGTTGGAAG 4548
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4498 TTGCATATTAAGGATGAAGAAGATTCGATTGCTTGTTCGACAGGCCCTCCTAGTTGGAAG 4557
Query 4549 CATGACCAACGAGCGAATGAATGTTCCGTGTCACAGGTTACAGTGAATAAAGAGCCACAT 4608
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4558 CATGACCAACGAGCGAATGAATGTTCTGTGTCACAGGTTACAGTGAATAAAGAGCCACAT 4617
Query 4609 AAAAATCATATCCGGAGTGCAGATCGTTTGAAACAGGGAGTTGTAGATTTTGTTGCATCG 4668
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4618 AAAAATCATAACCGAAGTGCAGATCGTTTGAAACAGGGGGTTGTAGATTTTGTTGCATCG 4677
Query 4669 TTGCTTATGGCCCCGTATAGAGCAAAGAAAATTGATAGAGATGTATACAAGTCAATTATG 4728
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4678 TTGCTTATGGCCCCGTATAGAGCAAAAAAAATTGACAGAGATGTATACAAGTCAATTATG 4737
Query 4729 AAGAAGACAGCAACAAAGGTTATGCAACATACAACAGATGTGGAGAAAGCTATGGCTGTT 4788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4738 AAGAAGACAGCAACAAAGGTTATGCAACATACAACAGATGTGGAGAAAGCTATGGCTGTT 4797
Query 4789 ACACAGTTCCTCGACTCAAAGCGGAAAAATAAGATTCGTGACTTTGTGGACAAACAAGTT 4848
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4798 ACACAGTTCCTCGACTCAAAGCGGAAAAACAAGATTCGTGACTTTGTGGACAAACAAGTT 4857
Query 4849 GACAAGTACATGGTGATACCTCAAGTTCCAAAACCTTGATGGTCACTGG-ATCTTTAGTA 4907
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||
Sbjct 4858 GACAAGTACATGGCGATAGCTCAAGTTCCAAAACCTTGATGGTCATTGGGATCTATAGTA 4917
Query 4908 ATGGCCAATGGTAGTTAAGTTGGTATCCGCTGGGATGGCAAAGC-CCATTTGTAGAGACC 4966
| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||
Sbjct 4918 ACGGCCAATGGTTGTTGAGTTGGTATCTGCTGGGATGGCAATGCTCC-TTTGTAGAAACC 4976
Query 4967 ACATATCAGGAAGCTTATGAAGCAGATGGTCTGATGTAAAAGAGACTTT-CCCATGATTT 5025
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 4977 ACATATCAGGAAGCTTATGAAGCAGACGGTCTGATGTAGAAGAGACTTTTCCCATGATTT 5036
Query 5026 GACATACCAAAAG-ATTGGCAGAGACGAGTTTTTGGCATTACCAGATATGATGAAG---- 5080
|||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5037 TACATACCAAA-GCATTGGCAGAGACAAGTTTTTGGCATTACCAGATATGATGGAGAATT 5095
Query 5081 -GGTCTTGCTATATTGCTAGGTATGGGTGAAGCATCTGCTCTCCTCTTCCTGGGGGA-AA 5138
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 5096 TGGTCTTGCTATATTGCTAGGTATGGGTGAAGCATCTTCTCTCCTCTTCCTGGGGGGCAA 5155
Query 5139 TGTT-TAGAGGACTTTCTGATCAAGCTTTTATGTCAAGTGGATATGTCTTTCATGAGTTA 5197
|||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 5156 TGTTCT-GAGGACTTTCTGATCAAGATTTTATGTCAAGTGGATGTGTCTTTCATCAGTTA 5214
Query 5198 TCCCCTCGGATGATGCATGTTCTCAACTTACACTGATTGTTTTTTAGTAATTGTATAGAG 5257
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 5215 TCCCCTCGGATGATGCATGTTCTCAACTTACGCTGATT-TGTTTTAGTAATTGTATAGAG 5273
Query 5258 CTCAAGATTTAGTGTTAACCCCCATTAGA-AACAATTCTATTTTCAGGTATCTGAATTCA 5316
|| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 5274 CTTAAGATTTAGTGTTAACCCCCATTAGACAA-AATTCTACTTTCAGGTATCTTAATTCA 5332
Query 5317 TTTCTTGAGATTCATGTCATTTCTGGAACCCAAGAGAAAA 5356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5333 TTTCTTGAGATTCATGTCATTTCTGGAACCCAAGAGAAAA 5372
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 203988591280
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5