BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G16340.1 Length=6338 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg493252 jgi|Araly1|493252|fgenesh2_kg.7__2685__AT4G16340.1 9886 0.0 Ahg887443 jgi|Araly1|887443|Al_scaffold_0727_1 1048 0.0 > Ahg493252 jgi|Araly1|493252|fgenesh2_kg.7__2685__AT4G16340.1 Length=5952 Score = 9886 bits (5353), Expect = 0.0 Identities = 5784/5989 (97%), Gaps = 42/5989 (1%) Strand=Plus/Plus Query 4 GTTGGACTTACAGCTCCAGCTCGACTTTTGCTTTCCTCTTGAGTAATCTTCACTTTTT-C 62 |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | Sbjct 1 GTTGGACTTATGGTTCCAGCTCGACTTTTGC-TTCCTGTCGAGTAATCTTCACTTTTTCC 59 Query 63 ---T-CCCAACTGCTTCCTCTCACGGATCTCTTCCTCTCTGCGTAAAGACAAAGATTCAT 118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60 TTTTCCCCAACTGCTTCCTCTCACGGATCTCTTCCTCTCTGCGTAAAGACAAAGATTCAT 119 Query 119 CCTCCTCTCCTCCTTTAGCTCCCCCACTCAGATCTACTTACTACTCCAACAATGTCCTTT 178 |||||||| |||| || ||||||||||||| | | ||||| ||||||||| Sbjct 120 CCTCCTCT--TCCTCTACCTCCCCCACTCAG----A--T-CTACT------ATGTCCTTT 164 Query 179 TCCCATTTCTAGGTTTTCACAAATCCCCAATTCTCTCTAATGGCGTAGTAGTACCTCACA 238 | || ||||||||||||||||||||||||| | || | | | || ||| Sbjct 165 TTCCTTTTCTAGGTTTTCACAAATCCCCAA---T-TC---T--C-------T--CT-ACA 205 Query 239 TTGTATTAGATCTATCTCAATGGAGAACAACAATCTTGGTCTTCGATTTCGTAAGCTACC 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 206 TTGTATTAGATCTATCTCAATGGAGAACAACAATCTTGGTCTTCGATTTCGTAAGATACC 265 Query 299 TCGTCAGCCTCTTGCTCTCCCTAAGCTCGATCCTTTGCTTGATGAGAATCTGGAACAATG 358 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 266 TCGTCAGCCTGTTGCTCTCCCTAAGCTCGATCCTTTGCTTGATGAGAATCTGGAACAATG 325 Query 359 GCCACATTTGAATCAATTGGTTCAATGTTATGGCACTGAATGGGTTAAAGATGTTAACAA 418 ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 326 GCCGCATTTGAATCAATTGGTTCAATGCTATGGCACTGAATGGGTTAAAGATGTTAATAA 385 Query 419 ATACGGTCACTATGAAAATATTCGACCTGATTCTTTCCAGACTCAGATTTTTGAAGGACC 478 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 386 ATATGGTCACTATGAAAATATTCGACCTGATACTTTCCAGACTCAGATTTTTGAAGGACC 445 Query 479 TGATACTGATACTGAGACTGAGATTCGTCTTGCTAGTGCCAGGAGTGCAACTATTGAGGA 538 |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 446 TGATACTGATACCGAGACTGAAATCCGTCTTGCTAGTGCTAGGAGTGCAACTATTGAGGA 505 Query 539 GGATGTTGCCAGTATTTCCGGGAGGCCGTTTTCTGATCCTGGATCCTCTAAGCATTTTGG 598 |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| Sbjct 506 GGATGTAGCTAGTATATCCGGGAGGCCGTTTTCTGATTCTGGATCCTCCAAGCACTTTGG 565 Query 599 GCAACCTCCTTTACCTGCTTATGAACCAGCTTTTGACTGGGAAAATGAAAGAGCTATGAT 658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 566 GCAACCTCCTTTACCTGCTTATGAACCAGCTTTTGACTGGGAAAATGAAAGAGCTATGAT 625 Query 659 TTTTGGTCAGAGAACTCCTGAATCTCCTGCAGCTAGCTATTCCAGTGGATTGAAGATCTC 718 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 626 ATTTGGCCAGAGAACTCCTGAATCTCCTGCAGCAAGCTATTCCAGTGGATTGAAGATCTC 685 Query 719 TGTCAGAGTTTTGTCTCTAGCTTTTCAGTCTGGCTTAGTTGAACCATTTTTTGGCTCGAT 778 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 686 CGTCAGAGTTTTGTCTCTAGCTTTTCAGTCTGGCTTAGTTGAACCATTTTTTGGCTCGAT 745 Query 779 TGCATTGTACAATCAAGAGAGGAAGGAGAAACTCTCTGAGGATTTTTATTTCCAGATTCA 838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 746 TGCATTGTACAATCAAGAGAGGAAGGAGAAACTCTCTGAGGATTTTTATTTCCATATTTT 805 Query 839 GCCGACGGAAATGCAGGATGCTAAACTTTCATCTGAAAATCGTGGAGTATTTTATCTAGA 898 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 806 GCCGACGGAAATGCAGGATGCTAAAAATTCATCTGAAAATCGTGGAGTATTTTATCTAGA 865 Query 899 TGCCCCATCAGCATCAGTTTGCCTGCTTATTCAATTAGAAAAAACAGCAACTGAGGAAGG 958 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 866 TGCCCCATCAGCATCAGTTTGCCTGCTTATTCAATTAGAAAAAACAGCAACAGAGGAGGG 925 Query 959 AGGCGTTACATCATCTGTCTATTCCCGTAAAGAGCCTGTGCACTTAACTGAGAGGGAAAA 1018 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 926 AGGCGTTACAACATCTGTCTATTCCCGTAAAGAGCCTGTGCACTTAACTGAGAGGGAAAA 985 Query 1019 GCAAAAGTTGCAGGTCTGGTCTCGCATTATGCCTTACCGAGAGTCTTTTGCTTGGGCAGT 1078 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 986 GCAAAAGTTGCAGGTCTGGTCTCGCATTATGCCTTACCGAGAGTCTTTTGCTTGGGCAGT 1045 Query 1079 TGTTCCGCTTTTTGATAATAATCTCACCACAAACACTGGTGAATCTGCTTCCCCTAGCAG 1138 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1046 TGTTCCGCTTTTTGATAATAATGTCACCACAAACACTGGTGAATCTGCTTCCCCTAGCAG 1105 Query 1139 TCCTCTTGCTCCTAGTATGACTGCGTCAAGTTCCCATGATGGTGTTTATGAACCAATTGC 1198 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1106 TCCTCTTGCTCCTAGTATGACCGCGTCAAGTTCCCATGATGGTGTTTATGAACCCATTGC 1165 Query 1199 AAAGATCACATCAGATGGAAAGCAAGGTTATTCAGGTGGAAGTTCTGTCGTAGTTGAAAT 1258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1166 AAAGATCACATCAGATGGAAAGCAAGGTTATTCAGGTGGAAGTTCTGTCGTAGTTGAAAT 1225 Query 1259 ATCTAATTTAAATAAAGTTAAAGAGAGCTACTCTGAAGAGTCCATTCAGGACCCCAAACG 1318 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1226 ATCTAATTTAAACAAAGTTAAAGAGAGCTACTCTGAAGAGTCAATTCAGGACCCCAAACG 1285 Query 1319 GAAGGTTCACAAACCTGTTAAAGGGGTTCTAAGACTGGAAATTGAGAAACATCGGAATGG 1378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1286 GAAGGTTCACAAACCTGTTAAAGGGGTTCTAAGACTGGAAATTGAGAAACATCGGAATGG 1345 Query 1379 ACATGGAGACTTTGAAGATCTATCTGAGAATGGAAGTATCATAAATGACTCCCTTGATCC 1438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1346 ACATGGAGACTTTGAAGATCTATCTGAGAATGGAAGTATCATAAATGACTCCCTTGATCC 1405 Query 1439 AACTGACCGCCTCAGTGACCTGACTCTTATGAAGTGTCCCAGTTCTAGTTCTGGTGGACC 1498 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1406 GACTGACCGCCTCAGTGACCTGACACTTATGAAGTGTCCCAGTTCTGGTTCTGGTGGACC 1465 Query 1499 CCGTAATGGCTGTTCAAAGTGGAATTCAGAGGATGCAAAGGATGTTTCGAGAAATCTAAC 1558 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1466 CCGTAATGGCTGTTCGAAGTGGAATTCAGAGGATGCAAAGGATGTTTCAAGAAACCTAAC 1525 Query 1559 AAGTTCATGTGGGACTCCTGACTTAAATTGTTATCATGCTTTTGATTTTTGCTCTACGAC 1618 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1526 AAGTTCAAGTGGGACTCCTGACTTAAATTGTTATCATGCTTTTGATTTCTGCTCTACGAC 1585 Query 1619 AAGAAACGAGCCTTTTCTACATCTCTTCCATTGCCTTTATGTGTATCCTGTAGCTGTTAC 1678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1586 AAGAAACGAGCCTTTTCTACATCTCTTCCATTGCCTTTATGTGTATCCTGTAGCTGTTAC 1645 Query 1679 TTTAAGTCGGAAGAGGAATCCCTTTATCCGTGTAGAATTGAGAAAGGATGACACAGATAT 1738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct 1646 TTTAAGTCGGAAGAGGAATCCCTTTATCCGTGTAGAATTGAGAAAGGATGACACTGATGT 1705 Query 1739 CCGAAAACAACCACTCGAGGCAATATATCCAAGAGAACCTGGTGTTTCACTCCAGAAATG 1798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 1706 CCGAAAACAACCACTCGAGGCAATATATCCAAGAGAGCCTGGTGTTTCACTCCAGAAGTG 1765 Query 1799 GGTTCATACACAGGTCGCTGTTGGTGCTAGGGCCGCTAGCTACCATGATGAAATTAAGGT 1858 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1766 GGTTCATACACAGGTTGCTGTTGGTGCTAGGGCTGCTAGCTACCATGATGAAATTAAGGT 1825 Query 1859 CTCTCTTCCTGCCACATGGACGCCATCACATCATCTGTTATTCACtttttttCATGTTGA 1918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1826 CTCTCTTCCTGCCACATGGACGCCATCACATCATCTGTTATTCACTTTTTTTCATGTTGA 1885 Query 1919 TCTCCAGACAAAGCTTGAAGCTCCAAGACCAGTAGTTGTTGGATATGCATCACTTCCATT 1978 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1886 TCTCCAGACAAAGCTTGAAGCTCCAAGACCAGTAGTTGTTGGATATGCATCACTTCCATT 1945 Query 1979 ATCTACATATATCCACTCACGGTCTGATATTTCTCTACCAGTAATGAGAGAACTTGTTCC 2038 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1946 ATCTACCTATATCCACTCACGGTCTGATATTTCTCTACCAGTAATGAGAGAACTGGTTCC 2005 Query 2039 CCACTATCTTCAGGAAAGCACCAAGGAGAGGTTGGATTATTTGGAAGATGGCAAAAATAT 2098 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2006 CCACTATCTTCAGGAAACCACCAAGGAGAGGTTGGATTATTTGGAAGATGGCAAGAATAT 2065 Query 2099 TTTTAAGTTGCGACTGAGACTTTGTTCATCTCTTTATCCCACCAACGAACGTGTCAGGGA 2158 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2066 TTTTAAGTTGCGACTGAGACTTTGTTCGTCTCTTTATCCCACCAATGAACGTGTCAGGGA 2125 Query 2159 TTTCTGTCTAGAGTATGATAGACATACCCTCCAGACAAGGCCTCCCTGGGGTTCAGAACT 2218 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2126 TTTCTGTCTAGAGTATGATAGACATACCCTCCGGACAAGCCCTCCCTGGGGTTCAGAACT 2185 Query 2219 GTTGCAGGCAATAAACAGTTTGAAGCACGTTGATTCTACTGCCTTGCTTCAGTTTCTTTA 2278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2186 GTTGCAGGCAATAAACAGTTTGAAGCACGTTGATTCTACTGCCTTGCTTCAGTTTCTTTA 2245 Query 2279 CCCAATTCTTAACATGCTCCTTCATCTTATTGGCAATGGTGGAGAAACCCTTCAGGTTGC 2338 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2246 CCCAATTCTTAATATGCTCCTTCATCTTATTGGCAATGGTGGAGAAACTCTTCAGGTTGC 2305 Query 2339 AGCATTCAGAGCCATGGTGGATATTTTAACTCGGGTGCAGCAGGTGTCGTTTGATGATGC 2398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2306 AGCATTCAGAGCCATGGTGGATATTTTAACTCGGGTGCAGCAGGTGTCGTTTGATGATGC 2365 Query 2399 TGACCGAAATCGATTTCTGGTCACCTATGTTGATTATTCTTTTGATGATTTTGGAGGCAA 2458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2366 TGACCGAAATCGATTTCTGGTCACCTATGTTGATTATTCTTTTGATGATTTTGGAGGCAA 2425 Query 2459 TCAACCACCGGTTTATCCTGGATTAGCAACTGTGTGGGGAAGTTTAGCTAGAAGCAAGGC 2518 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2426 TCAACCACCAGTTTATCCTGGATTAGCAACTGTATGGGGAAGTTTAGCTAGAAGCAAGGC 2485 Query 2519 CAAAGGTTACCGGGTTGGACCTGTATATGACGATGTATTATCAATGGCGTGGTTTTTCCT 2578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2486 CAAAGGTTACCGGGTTGGACCTGTATATGACGATGTATTATCAATGGCGTGGTTTTTCCT 2545 Query 2579 CGAGTTGATTGTTAAATCAATGGCATTGGAGCAAGCACGTCTTTATGATCACAATCTACC 2638 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2546 CGAGTTGATTGTTAAATCGATGGCATTGGAGCAGGCACGTCTTTATGATCACAATCTACC 2605 Query 2639 TACAGGCGAGGATGTTCCACCCATGCAGCTCAAAGAAAGTGTTTTCCGATGTATCATGCA 2698 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2606 TTCAGGCGAGGATGTTCCACCCATGCAGCTCAAAGAAAGTGTTTTCCGATGTATCATGCA 2665 Query 2699 ATTGTTTGATTGTCTTTTAACTGAAGTACATGAACGTTGTAAAAAGGGCTTAAGCTTGGC 2758 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2666 ATTGTTTGATTGTCTTTTAACTGAAGTTCATGAACGTTGTAAAAAGGGCCTAAGCTTGGC 2725 Query 2759 GAAACGTCTGAACAGCAGTTTGGCCTTCTTCTGTTATGATCTTTTATATATCATTGAGCC 2818 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2726 GAAACGTCTGAACAGCAGTTTGGCCTTCTTCTGTTATGATCTTTTATATATAATTGAGCC 2785 Query 2819 CTGCCAGGTCTATGAACTGGTATCGTTATACATGGACAAGTTTTCTGGTGTTTGTCAATC 2878 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2786 CTGCCAGGTTTATGAACTGGTATCGTTATACATGGACAAGTTTTCTGGTGTTTGTCAATC 2845 Query 2879 TGTTCTACACGAATGCAAGCTCACGTTTTTGCAAATTATCTCCGACCATGATCTTTTTGT 2938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2846 TGTTCTACACGAATGCAAGCTCACGTTTTTGCAAATTATCTCCGACCATGATCTTTTTGT 2905 Query 2939 AGAAATGCCTGGTAGAGACCCATCAGACAGGAACTATTTATCATCCATATTAATACAGGA 2998 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2906 AGAAATGCCTGGTAGAGACCCATCAGACAGGAACTATTTATCATCCATATTAATACAGGA 2965 Query 2999 GTTATTTCTCTCACTGGATCATGATGAGCTGCCTCTGCGGGCGAAGGGAGCAAGAATTTT 3058 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2966 GTTATTTCTTTCCCTGGATCATGATGAGCTGCCTCTGCGGGCGAAGGGAGCAAGAATTTT 3025 Query 3059 AGTGATCCTTTTATGCAAGCATGAATTTGATGCGCGGTACCAGAAAGCTGAAGATAAGCT 3118 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3026 AGTGATCCTCTTATGCAAGCATGAATTTGATGCACGGTACCAGAAAGCTGAAGATAAGCT 3085 Query 3119 GTATATTGCACAACTGTATTTTCCTTTTGTCGGGCAGATTTTAGATGAAATGCCTGTTTT 3178 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 3086 GTATATTGCACAACTATATTTTCCATTTGTCGGGCAGATTTTAGATGAAATGCCCGTCTT 3145 Query 3179 TTATAACCTAAATGCTACTGAAAAGCGTGAGGTTTTAATTGGTGTGCTGCAAATTGTTCG 3238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3146 TTATAACCTAAATGCTACTGAAAAGCGTGAGGTTTTAATTGGCGTGCTGCAAATTGTTCG 3205 Query 3239 TAATCTGGATGACACATCACTTGTCAAAGCATGGCAGCAGAGCATCGCTCGTACTCGATT 3298 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3206 TAATCTGGATGACACATCACTTGTCAAGGCATGGCAGCAGAGCATCGCTCGTACTAGATT 3265 Query 3299 ATATTTCAAACTCATGGAAGAATGCCTCATACTTTTCGAGCACAAGAAGGCTGCTGACAG 3358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3266 GTATTTCAAACTCATGGAAGAATGCCTCATACTTTTCGAGCACAAGAAGGCTGCTGACAG 3325 Query 3359 CATCCTCGGGGGCAACAATTCTCGTGGTCCTGTTAGTGAAGGAGCTGGATCACCAAAGTA 3418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3326 CATCCTCGGGGGCAACAATTCTCGTGGTCCTGTTAGTGAAGGAGCTGGATCACCAAAGTA 3385 Query 3419 CTCCGAGCGACTTTCTCCTGCTATCAACAATTATCTGTCAGAGGCTTCTCGCCAAGAAGT 3478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3386 CTCCGAGCGACTTTCTCCTGCTATCAACAATTATCTGTCAGAGGCTTCTCGCCAAGAAGT 3445 Query 3479 CAGGCTAGAGGGAACACCTGATAATGGGTACCTGTGGCAGAGAGTTAATTCTCAGTTGGC 3538 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3446 CAGGCTAGAGGGAACACCTGACAATGGGTACCTGTGGCAGAGAGTTAATTCTCAGTTGGC 3505 Query 3539 CTCCCCTAGCCAACCTTATTCTCTAAGAGAAGCTTTAGCTCAAGCACAATCTTCCCGGAT 3598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3506 CTCCCCTAGCCAACCTTATTCTCTAAGAGAAGCTTTAGCTCAAGCACAATCTTCGCGGAT 3565 Query 3599 TGGAGCTTCAGCCCAGGCACTAAGAGAATCGCTGCACCCAATTTTGAGGCAAAAACTGGA 3658 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3566 TGGAGCTTCAGCTCAGGCACTAAGAGAATCGCTGCACCCTATTTTGAGGCAAAAACTGGA 3625 Query 3659 ACTTTGGGAGGAGAATGTAAGTGCCACTGTTAGCCTCCAGGTTTTGGAGATCACTGAAAA 3718 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3626 ACTTTGGGAAGAGAATGTAAGTGCCACTGTTAGCCTCCAGGTTTTGGAGATCACTGAAAT 3685 Query 3719 TTTTTCATCAATGGCAGCCTCTCACAATATTGCGACCGACTATGGCAAATTGGACTGCAT 3778 |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| Sbjct 3686 TTTTTCATCAATGGTAGCCTCTCACAATATTGCAACGGACTATGGAAAATTGGACTGCAT 3745 Query 3779 TACTACAATACTGACGAGTTTCTTCTCCCGAAACCAGTCATTAGCTTTCTGGAAAGCCTT 3838 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3746 TACTACAATATTGACGAGTTTCTTCTCCCGGAACCAGTCATTAGCCTTCTGGAAAGCCTT 3805 Query 3839 CTTTCCAATTTTCAACAGAATCTTTGATCTTCATGGGGCTACACTGATGGCCAGGGAAAA 3898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3806 CTTTCCAATTTTCAACAGAATCTTTGATCTTCATGGGGCTACACTGATGGCCAGGGAAAA 3865 Query 3899 TGATCGCTTCTTAAAACAGATAGCCTTCCATCTTCTCCGGCTTGCTGTTTACCGCAATGA 3958 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3866 CGATCGCTTCTTAAAACAGATAGCCTTCCATCTTCTCCGGCTTGCTGTTTACCGCAATGA 3925 Query 3959 CAGTGTCAGGAAAAGGGCTGTTATTGGTCTTCAAATACTAGTTAAGAGCTCGCTATACTT 4018 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3926 CAGTGTCAGGAAAAGGGCTGTCATTGGTCTTCAAATACTAGTTAAGAGCTCGCTATACTT 3985 Query 4019 TATGCAGACTGCTAGGCTGAGGGCTTTGCTGACGATTACACTGTCAGAACTCATGTCGGA 4078 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3986 TATGCAGACTGCTAGGCTGAGGGCTTTGCTGACCATTACACTGTCAGAACTCATGTCGGA 4045 Query 4079 TGTCCAAGTGACTCATATGAAGTCAGATAATACATTAGAAGAGAGTGGAGAAGCACGGCG 4138 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4046 TGTCCAAGTGACTCATATGAAAACAGATAATACATTAGAAGAGAGTGGAGAAGCACGTCG 4105 Query 4139 ACTTCAACAGTCATTAAGCGAAATGGCTGATGAAGCTAAGAGTGTCAATTTGTTGAGGGA 4198 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4106 GCTTCAACAGTCATTAAGCGAAATGGCTGATGAAGCTAAGAGTGTCGATTTGTTGAGGGA 4165 Query 4199 GTGTGGTCTTCCTGATGATACACTGTTGATTATTCCCGAGAAATTTACAGAGAACCGCTG 4258 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4166 GTGTGGTCTTCCTGATGATACACTGTTGGTAATTCCCGAGAAATTTACAGAGAATCGCTG 4225 Query 4259 GTCATGGGCTGAAGTCAAACATCTTTCTGACAGCCTTGTTCTTGCTCTTGATGCCAGCCT 4318 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4226 GTCATGGGCTGAAGTCAAACATCTTTCTGATAGCCTTGTTCTTGCTCTTGATGCCAGCCT 4285 Query 4319 CGGGCATGCCCTTTTGGGATCTGTGATGGCTATGGATCGATATGCTGCTGCAGAGAGCTT 4378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4286 CGGGCATGCCCTTTTGGGATCTGTGATGGCTATGGATCGATATGCTGCAGCAGAGAGCTT 4345 Query 4379 CTACAAACTTGGAATGGCGTTTGCTCCTGTTCCGGATCTTCACATAATGTGGTTATTGCA 4438 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4346 CTACAAACTTGGAATGGCATTTGCTCCTGTTCCGGATCTTCACATAATGTGGTTGCTGCA 4405 Query 4439 TCTATGTGATGCCCACCAGGAAATGCAGTCTTGGGCAGAAGCTGCACAGTGTGCTGTGGC 4498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4406 TCTATGTGATGCCCACCAGGAAATGCAGTCTTGGGCTGAAGCTGCACAGTGTGCTGTGGC 4465 Query 4499 GGTTGCAGGTGTGATAATGCAGGCCTTGGTGGCTAGGAATGATGGTGTGTGGAGCAAGGA 4558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4466 GGTTGCAGGTGTGATAATGCAGGCCTTGGTGGCTAGAAATGATGGTGTGTGGAGCAAGGA 4525 Query 4559 TCATGTGTCTGCCTTGCGTAAGATTTGCCCGATGGTAAGTGGCGAGTTTACAACAGAGGC 4618 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4526 TCATGTGTCTGCCTTGCGTAAGATTTGCCCGATGGTAAGTGGCGAGTTTACAACAGAGGC 4585 Query 4619 ATCTGCAGCTGAAGTCGAGGGTTATGGTGCTTCAAAGCTAACAGTTGACTCCGCCGTCAA 4678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4586 ATCTGCAGCTGAAGTCGAGGGTTATGGTGCTTCAAAGCTAACAGTTGACTCCGCCGTCAA 4645 Query 4679 GTATTTACAGCTTGCTAATAAGCTTTTCTCTCAAGCTGAGCTCTACCATTTTTGTGCAAG 4738 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4646 GTACCTACAGCTTGCTAATAAGCTTTTCTCTCAAGCTGAGCTCTACCATTTTTGTGCAAG 4705 Query 4739 CATTTTAGAACTTGTTATTCCAGTTTACAAGAGCAGGAAGGCTTATGGGCAGTTGGCTAA 4798 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4706 CATTTTGGAACTTGTTATTCCAGTTTACAAGAGCAGGAAGGCTTATGGGCAGTTGGCTAA 4765 Query 4799 GTGTCACACTTTACTTACTAATATATACGAGTCCATTCTTGACCAAGAATCAAACCCAAT 4858 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4766 GTGTCACACTTTACTTACTAATATATATGAGTCCATTCTTGACCAAGAATCAAACCCAAT 4825 Query 4859 CCCATTTATTGATGCTACATATTACCGGGTGGGATTTTATGGGGAAAAGTTTGGGAAGTT 4918 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 4826 CCCATTTATTGATGCTACATATTACCGGGTGGGATTTTACGGGGAAAAGTTTGGGAAGTT 4885 Query 4919 GGACAGGAAAGAATATGTATACCGAGAACCACGAGATGTGCGGCTAGGGGATATAATGGA 4978 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4886 GGACAGAAAAGAATATGTATACCGTGAACCACGAGATGTGCGGCTAGGGGATATAATGGA 4945 Query 4979 AAAACTGAGCCATATATATGAGTCAAGAATGGACAGCAACCATATTCTGCACATTATACC 5038 ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4946 AAAGCTGAGCCATATCTATGAATCAAGAATGGACAGCAACCATATTCTGCACATTATACC 5005 Query 5039 AGATTCGAGGCAAGTGAAGGCAGAAGACTTGCAGGCAGGAGTGTGCTATCTGCAAATTAC 5098 ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5006 AGATTCGAGACAAGTGAAAGCAGAAGAATTGCAGGCAGGAGTGTGCTACCTGCAAATTAC 5065 Query 5099 TGCTGTTGATGCAGTGATGGAAGATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGAATATTTTC 5158 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5066 AGCTGTTGATGCAGTGATGGAAGATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGAATATTTTC 5125 Query 5159 TCTTTCAACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGTTTCTTATTTGACACACCATT 5218 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 5126 TCTTTCGACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGCTTCTTGTTTGACACACCATT 5185 Query 5219 TACGAAAAATGGTAAAACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGAAGAACAGTGCT 5278 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5186 TACAAAAAATGGTAAGACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGAAGAACAGTGCT 5245 Query 5279 GCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCCCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAGTCTGAATC 5338 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5246 GCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCGCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAGTCTGAATC 5305 Query 5339 CCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGAAACGCGGACAACCGCTCT 5398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5306 CCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGAAACGCGGACAACTGCTCT 5365 Query 5399 GAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCACCTACCACGGCTTCAAAG 5458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5366 GAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCACCTACCACGGCTTCAAAG 5425 Query 5459 TCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAACAGTGGGGTGTTGAGCGT 5518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5426 TCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAACAGTGGGGTGTTGAGCGT 5485 Query 5519 GTGCACAGCTTTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACGAGATTGCGTTCACAGGAACTGCAGCA 5578 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 5486 GTGCACAGCATTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACTAGATTGCGTTCGCAGGAACTGCAGCA 5545 Query 5579 ACTAATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCGAGCCATTAGGGTTCACTT 5638 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5546 ACTGATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCGAGCCATTAGGGTTCACTT 5605 Query 5639 TAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCTTGTCAATGGATTTCAGTC 5698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5606 TAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCTTGTCAATGGATTTCAGTC 5665 Query 5699 TCTCACCGCAGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTATCCGAACTTTAGTGTATCTT 5758 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 5666 TCTCACCGCTGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTGTCCGAACTTTAGTGTATCTT 5725 Query 5759 TGTCAGTTTTTGTTACGAGTTTTGTGCTTTTTTCTTCCACCATTTGGCTTGGCTATATGT 5818 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 5726 TGTCAGTTTTTGCTACAAATTTTGTGCTTTTTTCTTCCACCATTTGGCTTGGGTATATGT 5785 Query 5819 TTATCATTTCTGTAATTCTTAGTTTAATGACAACAAGTGAGaaaaaaaTTATAAATGACA 5878 || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||| Sbjct 5786 TTGTCATTTCTGTAATTCTTAGTTTAATGACAACAAATGAGAGAAATTTTTTTAATGACA 5845 Query 5879 ATTGGTTGACTTCTAATTCAGAAGCTTATGTTATATTCGATCGAGGACATGAGCTCTCTC 5938 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | Sbjct 5846 ATTGTTTGACTTCTAATTCAGAAGCTTATGTTATATTCGATCGTGGAAATGAGCTC-C-C 5903 Query 5939 AGCTTCAAACACAAGCCGCTCAACTATTTAGGATGCCTGCGACATCTCA 5987 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 5904 AGCTTCAAACACAAGCCACTCAACTATTTAGGATGCCTCCGACATCTCA 5952 > Ahg887443 jgi|Araly1|887443|Al_scaffold_0727_1 Length=609 Score = 1048 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand=Plus/Plus Query 5141 AAGAGAGAGAATATTTTCTCTTTCAACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGTTT 5200 ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1 AAGAGAGAGAATA-TTTCTCTTTCGACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGCTT 59 Query 5201 CTTATTTGACACACCATTTACGAAAAATGGTAAAACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATG 5260 ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60 CTTGTTTGACACACCATTTACAAAAAATGGTAAGACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATG 119 Query 5261 GAAGAGAAGAACAGTGCTGCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCCCTTGTGAATAGGCTGTT 5320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 120 GAAGAGAAGAACAGTGCTGCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCGCTTGTGAATAGGCTGTT 179 Query 5321 GGTTACCAAGTCTGAATCCCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGA 5380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 GGTTACCAAGTCTGAATCCCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGA 239 Query 5381 AACGCGGACAACCGCTCTGAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCA 5440 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 AACGCGGACAACTGCTCTGAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCA 299 Query 5441 CCTACCACGGCTTCAAAGTCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAA 5500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 CCTACCACGGCTTCAAAGTCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAA 359 Query 5501 CAGTGGGGTGTTGAGCGTGTGCACAGCTTTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACGAGATTGCG 5560 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 360 CAGTGGGGTGTTGAGCGTGTGCACAGCATTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACTAGATTGCG 419 Query 5561 TTCACAGGAACTGCAGCAACTAATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCG 5620 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 TTCGCAGGAACTGCAGCAACTGATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCG 479 Query 5621 AGCCATTAGGGTTCACTTTAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCT 5680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 AGCCATTAGGGTTCACTTTAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCT 539 Query 5681 TGTCAATGGATTTCAGTCTCTCACCGCAGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTATC 5740 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 540 TGTCAATGGATTTCAGTCTCTCACCGCTGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTGTC 599 Query 5741 CGAACTTTAG 5750 |||||||||| Sbjct 600 CGAACTTTAG 609 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 240181343203 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5